RNAprotDB

All interfaces > All interologs > Interface groups > group127 > 1VQ8_L_0 vs 7O7Y_Ba_B5

Interface analysis


mouse controls

Style

Protein

Cartoon
Licorice
Surface

RNA

Cartoon
Licorice
Surface

Color

Structure
Structure (with hetatm)
Chain
Chainbow

View

Focus on

Interface
RNA
Protein
All

Show chains

Interface

show interface as licorice

Common contacts -

1VQ8_L
1VQ8_0
7O7Y_Ba
7O7Y_B5
Conserved?
L:55 [GLN] 0:215 [A] Ba:63 [LEU] B5:87 [A] ✔
L:51 [PHE] 0:692 [A] Ba:58 [MET] B5:1335 [A] ✔
L:51 [PHE] 0:693 [A] Ba:58 [MET] B5:1336 [A] ✔
L:51 [PHE] 0:2440 [C] Ba:58 [MET] B5:4097 [U] ✔
L:51 [PHE] 0:2441 [U] Ba:58 [MET] B5:4098 [U] ✔
L:51 [PHE] 0:2452 [G] Ba:58 [MET] B5:4109 [A] ✔
L:51 [PHE] 0:2453 [G] Ba:58 [MET] B5:4110 [G] ✔
L:61 [ALA] 0:697 [G] Ba:70 [CYS] B5:1340 [G] ✔
L:22 [ARG] 0:762 [C] Ba:26 [ARG] B5:1474 [C] ✔
L:22 [ARG] 0:898 [G] Ba:26 [ARG] B5:1609 [G] ✔
L:22 [ARG] 0:899 [C] Ba:26 [ARG] B5:1610 [C] ✔
L:22 [ARG] 0:900 [U] Ba:26 [ARG] B5:1611 [U] ✔
L:110 [GLY] 0:688 [A] Ba:113 [GLY] B5:1331 [A] ✔
L:110 [GLY] 0:698 [A] Ba:113 [GLY] B5:1341 [A] ✔
L:110 [GLY] 0:699 [C] Ba:113 [GLY] B5:1342 [A] ✔
L:56 [LYS] 0:196 [G] Ba:64 [LYS] B5:69 [A] ✔
L:56 [LYS] 0:2444 [U] Ba:64 [LYS] B5:4101 [G] ✔
L:11 [ARG] 0:623 [U] Ba:15 [VAL] B5:1261 [U] ✔
L:11 [ARG] 0:903 [U] Ba:15 [VAL] B5:1614 [U] ✔
L:11 [ARG] 0:904 [U] Ba:15 [VAL] B5:1615 [U] ✔
L:4 [LYS] 0:644 [G] Ba:8 [THR] B5:1282 [G] ✔
L:4 [LYS] 0:645 [U] Ba:8 [THR] B5:1283 [U] ✔
L:48 [LYS] 0:220 [C] Ba:55 [LYS] B5:92 [C] ✔
L:48 [LYS] 0:2430 [A] Ba:55 [LYS] B5:4086 [U] ✔
L:48 [LYS] 0:2431 [C] Ba:55 [LYS] B5:4087 [C] ✔
L:48 [LYS] 0:2432 [C] Ba:55 [LYS] B5:4088 [C] ✔
L:48 [LYS] 0:2454 [C] Ba:55 [LYS] B5:4111 [C] ✔
L:50 [GLY] 0:692 [A] Ba:57 [GLY] B5:1335 [A] ✔
L:50 [GLY] 0:2453 [G] Ba:57 [GLY] B5:4110 [G] ✔
L:50 [GLY] 0:2454 [C] Ba:57 [GLY] B5:4111 [C] ✔
L:30 [ARG] 0:164 [G] Ba:32 [ARG] B5:37 [U] ✔
L:30 [ARG] 0:165 [A] Ba:32 [ARG] B5:38 [A] ✔
L:30 [ARG] 0:222 [A] Ba:32 [ARG] B5:94 [A] ✔
L:30 [ARG] 0:223 [G] Ba:32 [ARG] B5:95 [G] ✔
L:30 [ARG] 0:757 [C] Ba:32 [ARG] B5:1469 [U] ✔
L:30 [ARG] 0:758 [A] Ba:32 [ARG] B5:1470 [A] ✔
L:30 [ARG] 0:759 [C] Ba:32 [ARG] B5:1471 [G] ✔
L:30 [ARG] 0:761 [A] Ba:32 [ARG] B5:1473 [A] ✔
L:30 [ARG] 0:896 [C] Ba:32 [ARG] B5:1607 [U] ✔
L:30 [ARG] 0:897 [A] Ba:32 [ARG] B5:1608 [A] ✔
L:15 [GLY] 0:1041 [U] Ba:19 [HIS] B5:1790 [G] ✔
L:15 [GLY] 0:1042 [U] Ba:19 [HIS] B5:1791 [U] ✔
L:15 [GLY] 0:1295 [G] Ba:19 [HIS] B5:2126 [G] ✔
L:23 [GLY] 0:897 [A] Ba:27 [LYS] B5:1608 [A] ✔
L:23 [GLY] 0:898 [G] Ba:27 [LYS] B5:1609 [G] ✔
L:5 [LYS] 0:905 [C] Ba:9 [ARG] B5:1616 [C] ✔
L:5 [LYS] 0:1302 [G] Ba:9 [ARG] B5:2134 [G] ✔
L:5 [LYS] 0:1353 [C] Ba:9 [ARG] B5:2187 [U] ✔
L:5 [LYS] 0:1354 [G] Ba:9 [ARG] B5:2188 [G] ✔
L:40 [PHE] 0:926 [A] Ba:42 [ARG] B5:1637 [A] ✔
L:40 [PHE] 0:2465 [A] Ba:42 [ARG] B5:4122 [A] ✔
L:34 [GLY] 0:165 [A] Ba:36 [GLY] B5:38 [A] ✔
L:34 [GLY] 0:166 [A] Ba:36 [GLY] B5:39 [A] ✔
L:9 [GLY] 0:903 [U] Ba:13 [GLY] B5:1614 [U] ✔
L:9 [GLY] 0:904 [U] Ba:13 [GLY] B5:1615 [U] ✔
L:9 [GLY] 0:905 [C] Ba:13 [GLY] B5:1616 [C] ✔
L:3 [LYS] 0:753 [U] Ba:7 [LYS] B5:1465 [G] ✔
L:3 [LYS] 0:754 [G] Ba:7 [LYS] B5:1466 [U] ✔
L:3 [LYS] 0:755 [G] Ba:7 [LYS] B5:1467 [G] ✔
L:3 [LYS] 0:1296 [A] Ba:7 [LYS] B5:2127 [G] ✔
L:3 [LYS] 0:1297 [U] Ba:7 [LYS] B5:2128 [A] ✔
L:37 [LYS] 0:918 [G] Ba:39 [V5N] B5:1629 [C] ✔
L:37 [LYS] 0:919 [U] Ba:39 [V5N] B5:1630 [C] ✔
L:37 [LYS] 0:2467 [A] Ba:39 [V5N] B5:4124 [A] ✔
L:32 [ASP] 0:222 [A] Ba:34 [ASN] B5:94 [A] ✔
L:32 [ASP] 0:223 [G] Ba:34 [ASN] B5:95 [G] ✔
L:129 [ALA] 0:698 [A] Ba:133 [ALA] B5:1341 [A] ✔
L:125 [PHE] 0:697 [G] Ba:129 [PHE] B5:1340 [G] ✔
L:41 [HIS] 0:917 [U] Ba:43 [ILE] B5:1628 [U] ✔
L:41 [HIS] 0:918 [G] Ba:43 [ILE] B5:1629 [C] ✔
L:41 [HIS] 0:926 [A] Ba:43 [ILE] B5:1637 [A] ✔
L:41 [HIS] 0:927 [U] Ba:43 [ILE] B5:1638 [PSU] ✔
L:35 [ARG] 0:166 [A] Ba:37 [GLY] B5:39 [A] ✔
L:49 [SER] 0:2453 [G] Ba:56 [VAL] B5:4110 [G] ✔
L:49 [SER] 0:2454 [C] Ba:56 [VAL] B5:4111 [C] ✔
L:46 [LEU] 0:221 [G] Ba:53 [PHE] B5:93 [G] ✔
L:46 [LEU] 0:2430 [A] Ba:53 [PHE] B5:4086 [U] ✔
L:6 [ARG] 0:905 [C] Ba:10 [LYS] B5:1616 [C] ✔
L:6 [ARG] 0:906 [C] Ba:10 [LYS] B5:1617 [C] ✔
L:6 [ARG] 0:1298 [U] Ba:10 [LYS] B5:2129 [G] ✔
L:6 [ARG] 0:1299 [G] Ba:10 [LYS] B5:2130 [G] ✔
L:6 [ARG] 0:1300 [G] Ba:10 [LYS] B5:2131 [G] ✔
L:126 [SER] 0:697 [G] Ba:130 [SER] B5:1340 [G] ✔
L:126 [SER] 0:698 [A] Ba:130 [SER] B5:1341 [A] ✔
L:112 [GLY] 0:699 [C] Ba:115 [GLY] B5:1342 [A] ✔
L:14 [GLY] 0:1040 [A] Ba:18 [GLY] B5:1789 [A] ✔
L:14 [GLY] 0:1041 [U] Ba:18 [GLY] B5:1790 [G] ✔
L:14 [GLY] 0:1295 [G] Ba:18 [GLY] B5:2126 [G] ✔
L:14 [GLY] 0:1296 [A] Ba:18 [GLY] B5:2127 [G] ✔
L:127 [GLU] 0:697 [G] Ba:131 [ARG] B5:1340 [G] ✔
L:43 [HIS] 0:222 [A] Ba:45 [PHE] B5:94 [A] ✔
L:2 [SER] 0:753 [U] Ba:6 [ARG] B5:1465 [G] ✔
L:2 [SER] 0:754 [G] Ba:6 [ARG] B5:1466 [U] ✔
L:29 [GLY] 0:165 [A] Ba:31 [GLY] B5:38 [A] ✔
L:29 [GLY] 0:166 [A] Ba:31 [GLY] B5:39 [A] ✔
L:29 [GLY] 0:758 [A] Ba:31 [GLY] B5:1470 [A] ✔
L:65 [ASP] 0:688 [A] Ba:74 [ASN] B5:1331 [A] ✔
L:65 [ASP] 0:698 [A] Ba:74 [ASN] B5:1341 [A] ✔
L:8 [ARG] 0:643 [A] Ba:12 [ARG] B5:1281 [A] ✔
L:8 [ARG] 0:644 [G] Ba:12 [ARG] B5:1282 [G] ✔
L:8 [ARG] 0:903 [U] Ba:12 [ARG] B5:1614 [U] ✔
L:8 [ARG] 0:904 [U] Ba:12 [ARG] B5:1615 [U] ✔
L:8 [ARG] 0:905 [C] Ba:12 [ARG] B5:1616 [C] ✔
L:8 [ARG] 0:906 [C] Ba:12 [ARG] B5:1617 [C] ✔
L:8 [ARG] 0:1354 [G] Ba:12 [ARG] B5:2188 [G] ✔
L:26 [HIS] 0:898 [G] Ba:29 [PRO] B5:1609 [G] ✔
L:26 [HIS] 0:924 [G] Ba:29 [PRO] B5:1635 [G] ✔
L:26 [HIS] 0:925 [C] Ba:29 [PRO] B5:1636 [G] ✔
L:63 [THR] 0:697 [G] Ba:72 [THR] B5:1340 [G] ✔
L:54 [PRO] 0:2443 [C] Ba:61 [TYR] B5:4100 [U] ✔
L:33 [ALA] 0:165 [A] Ba:35 [ALA] B5:38 [A] ✔
L:33 [ALA] 0:166 [A] Ba:35 [ALA] B5:39 [A] ✔
L:33 [ALA] 0:222 [A] Ba:35 [ALA] B5:94 [A] ✔
L:39 [GLU] 0:925 [C] Ba:41 [HIS] B5:1636 [G] ✔
L:39 [GLU] 0:926 [A] Ba:41 [HIS] B5:1637 [A] ✔
L:47 [GLY] 0:220 [C] Ba:54 [GLY] B5:92 [C] ✔
L:47 [GLY] 0:221 [G] Ba:54 [GLY] B5:93 [G] ✔
L:47 [GLY] 0:2430 [A] Ba:54 [GLY] B5:4086 [U] ✔
L:47 [GLY] 0:2431 [C] Ba:54 [GLY] B5:4087 [C] ✔
L:10 [SER] 0:904 [U] Ba:14 [HIS] B5:1615 [U] ✔
L:17 [SER] 0:624 [U] Ba:21 [ARG] B5:1262 [C] ✔
L:17 [SER] 0:625 [U] Ba:21 [ARG] B5:1263 [U] ✔
L:17 [SER] 0:1041 [U] Ba:21 [ARG] B5:1790 [G] ✔
L:17 [SER] 0:1042 [U] Ba:21 [ARG] B5:1791 [U] ✔
L:17 [SER] 0:1294 [A] Ba:21 [ARG] B5:2125 [A] ✔
L:24 [ALA] 0:166 [A] Ba:28 [HIS] B5:39 [A] ✔
L:24 [ALA] 0:897 [A] Ba:28 [HIS] B5:1608 [A] ✔
L:24 [ALA] 0:898 [G] Ba:28 [HIS] B5:1609 [G] ✔
L:16 [GLY] 0:1041 [U] Ba:20 [GLY] B5:1790 [G] ✔
L:16 [GLY] 0:1042 [U] Ba:20 [GLY] B5:1791 [U] ✔
L:16 [GLY] 0:1294 [A] Ba:20 [GLY] B5:2125 [A] ✔
L:16 [GLY] 0:1295 [G] Ba:20 [GLY] B5:2126 [G] ✔
L:20 [ASN] 0:1042 [U] Ba:24 [LYS] B5:1791 [U] ✔
L:128 [GLY] 0:697 [G] Ba:132 [ARG] B5:1340 [G] ✔
L:128 [GLY] 0:698 [A] Ba:132 [ARG] B5:1341 [A] ✔
L:109 [LEU] 0:688 [A] Ba:112 [LEU] B5:1331 [A] ✔
L:109 [LEU] 0:697 [G] Ba:112 [LEU] B5:1340 [G] ✔
L:109 [LEU] 0:698 [A] Ba:112 [LEU] B5:1341 [A] ✔
L:28 [GLY] 0:166 [A] Ba:30 [GLY] B5:39 [A] ✔
L:28 [GLY] 0:925 [C] Ba:30 [GLY] B5:1636 [G] ✔
L:12 [THR] 0:644 [G] Ba:16 [SER] B5:1282 [G] ✔
L:12 [THR] 0:903 [U] Ba:16 [SER] B5:1614 [U] ✔
L:12 [THR] 0:1294 [A] Ba:16 [SER] B5:2125 [A] ✔
L:12 [THR] 0:1295 [G] Ba:16 [SER] B5:2126 [G] ✔
L:132 [LYS] 0:698 [A] Ba:136 [LYS] B5:1341 [A] ✔
L:132 [LYS] 0:699 [C] Ba:136 [LYS] B5:1342 [A] ✔
L:113 [GLN] 0:699 [C] Ba:116 [LYS] B5:1342 [A] ✔
L:113 [GLN] 0:700 [A] Ba:116 [LYS] B5:1374 [G] ✔
L:113 [GLN] 0:701 [U] Ba:116 [LYS] B5:1375 [A] ✔
L:31 [GLY] 0:222 [A] Ba:33 [GLY] B5:94 [A] ✔
L:31 [GLY] 0:223 [G] Ba:33 [GLY] B5:95 [G] ✔
L:31 [GLY] 0:757 [C] Ba:33 [GLY] B5:1469 [U] ✔
L:31 [GLY] 0:758 [A] Ba:33 [GLY] B5:1470 [A] ✔
L:21 [ARG] 0:644 [G] Ba:25 [HIS] B5:1282 [G] ✔
L:21 [ARG] 0:762 [C] Ba:25 [HIS] B5:1474 [C] ✔
L:21 [ARG] 0:763 [C] Ba:25 [HIS] B5:1475 [C] ✔
L:13 [HIS] 0:644 [G] Ba:17 [HIS] B5:1282 [G] ✔
L:13 [HIS] 0:903 [U] Ba:17 [HIS] B5:1614 [U] ✔
L:13 [HIS] 0:1295 [G] Ba:17 [HIS] B5:2126 [G] ✔
L:7 [GLN] 0:904 [U] Ba:11 [LEU] B5:1615 [U] ✔
L:107 [LYS] 0:696 [C] Ba:110 [LYS] B5:1339 [U] ✔
L:107 [LYS] 0:697 [G] Ba:110 [LYS] B5:1340 [G] ✔
L:52 [LYS] 0:216 [A] Ba:59 [ARG] B5:88 [A] ✔
L:42 [ASN] 0:927 [U] Ba:44 [ASN] B5:1638 [PSU] ✔
L:38 [HIS] 0:166 [A] Ba:40 [HIS] B5:39 [A] ✔
L:38 [HIS] 0:918 [G] Ba:40 [HIS] B5:1629 [C] ✔
L:38 [HIS] 0:919 [U] Ba:40 [HIS] B5:1630 [C] ✔
L:38 [HIS] 0:921 [G] Ba:40 [HIS] B5:1632 [PSU] ✔
L:38 [HIS] 0:924 [G] Ba:40 [HIS] B5:1635 [G] ✔
L:38 [HIS] 0:925 [C] Ba:40 [HIS] B5:1636 [G] ✔
L:38 [HIS] 0:926 [A] Ba:40 [HIS] B5:1637 [A] ✔
L:111 [ALA] 0:688 [A] Ba:114 [LYS] B5:1331 [A] ✔
L:111 [ALA] 0:698 [A] Ba:114 [LYS] B5:1341 [A] ✔
L:111 [ALA] 0:699 [C] Ba:114 [LYS] B5:1342 [A] ✔
L:55 [GLN] 0:214 [U] Ba:63 [LEU] B5:86 [U] ❌ 7O7Y_Ba_B5
L:18 [HIS] 0:623 [U] Ba:22 [ILE] B5:1261 [U] ❌ 7O7Y_Ba_B5
L:18 [HIS] 0:624 [U] Ba:22 [ILE] B5:1262 [C] ❌ 7O7Y_Ba_B5
L:18 [HIS] 0:901 [G] Ba:22 [ILE] B5:1612 [G] ❌ 7O7Y_Ba_B5
L:18 [HIS] 0:903 [U] Ba:22 [ILE] B5:1614 [U] ❌ 7O7Y_Ba_B5
L:22 [ARG] 0:901 [G] Ba:26 [ARG] B5:1612 [G] ❌ 7O7Y_Ba_B5
L:56 [LYS] 0:417 [G] Ba:64 [LYS] B5:315 [G] ❌ 7O7Y_Ba_B5
L:56 [LYS] 0:2443 [C] Ba:64 [LYS] B5:4100 [U] ❌ 7O7Y_Ba_B5
L:19 [LYS] 0:624 [U] Ba:23 [GLY] B5:1262 [C] ❌ 7O7Y_Ba_B5
L:19 [LYS] 0:625 [U] Ba:23 [GLY] B5:1263 [U] ❌ 7O7Y_Ba_B5
L:19 [LYS] 0:899 [C] Ba:23 [GLY] B5:1610 [C] ❌ 7O7Y_Ba_B5
L:19 [LYS] 0:900 [U] Ba:23 [GLY] B5:1611 [U] ❌ 7O7Y_Ba_B5
L:19 [LYS] 0:901 [G] Ba:23 [GLY] B5:1612 [G] ❌ 7O7Y_Ba_B5
L:11 [ARG] 0:624 [U] Ba:15 [VAL] B5:1262 [C] ❌ 7O7Y_Ba_B5
L:4 [LYS] 0:754 [G] Ba:8 [THR] B5:1466 [U] ❌ 7O7Y_Ba_B5
L:4 [LYS] 0:755 [G] Ba:8 [THR] B5:1467 [G] ❌ 7O7Y_Ba_B5
L:48 [LYS] 0:2453 [G] Ba:55 [LYS] B5:4110 [G] ❌ 7O7Y_Ba_B5
L:50 [GLY] 0:2452 [G] Ba:57 [GLY] B5:4109 [A] ❌ 7O7Y_Ba_B5
L:5 [LYS] 0:1300 [G] Ba:9 [ARG] B5:2131 [G] ❌ 7O7Y_Ba_B5
L:1 [THR] 0:905 [C] Ba:5 [LEU] B5:1616 [C] ❌ 7O7Y_Ba_B5
L:1 [THR] 0:1299 [G] Ba:5 [LEU] B5:2130 [G] ❌ 7O7Y_Ba_B5
L:1 [THR] 0:1300 [G] Ba:5 [LEU] B5:2131 [G] ❌ 7O7Y_Ba_B5
L:40 [PHE] 0:918 [G] Ba:42 [ARG] B5:1629 [C] ❌ 7O7Y_Ba_B5
L:40 [PHE] 0:2396 [C] Ba:42 [ARG] B5:4052 [OMU] ❌ 7O7Y_Ba_B5
L:37 [LYS] 0:2466 [G] Ba:39 [V5N] B5:4123 [G] ❌ 7O7Y_Ba_B5
L:53 [ARG] 0:693 [A] Ba:60 [HIS] B5:1336 [A] ❌ 7O7Y_Ba_B5
L:53 [ARG] 0:2441 [U] Ba:60 [HIS] B5:4098 [U] ❌ 7O7Y_Ba_B5
L:41 [HIS] 0:2396 [C] Ba:43 [ILE] B5:4052 [OMU] ❌ 7O7Y_Ba_B5
L:35 [ARG] 0:221 [G] Ba:37 [GLY] B5:93 [G] ❌ 7O7Y_Ba_B5
L:35 [ARG] 0:222 [A] Ba:37 [GLY] B5:94 [A] ❌ 7O7Y_Ba_B5
L:46 [LEU] 0:2429 [A] Ba:53 [PHE] B5:4085 [A] ❌ 7O7Y_Ba_B5
L:112 [GLY] 0:700 [A] Ba:115 [GLY] B5:1374 [G] ❌ 7O7Y_Ba_B5
L:36 [ASP] 0:166 [A] Ba:38 [MET] B5:39 [A] ❌ 7O7Y_Ba_B5
L:36 [ASP] 0:2466 [G] Ba:38 [MET] B5:4123 [G] ❌ 7O7Y_Ba_B5
L:26 [HIS] 0:926 [A] Ba:29 [PRO] B5:1637 [A] ❌ 7O7Y_Ba_B5
L:26 [HIS] 0:1041 [U] Ba:29 [PRO] B5:1790 [G] ❌ 7O7Y_Ba_B5
L:57 [VAL] 0:2443 [C] Ba:65 [ARG] B5:4100 [U] ❌ 7O7Y_Ba_B5
L:39 [GLU] 0:918 [G] Ba:41 [HIS] B5:1629 [C] ❌ 7O7Y_Ba_B5
L:20 [ASN] 0:925 [C] Ba:24 [LYS] B5:1636 [G] ❌ 7O7Y_Ba_B5
L:20 [ASN] 0:1041 [U] Ba:24 [LYS] B5:1790 [G] ❌ 7O7Y_Ba_B5
L:21 [ARG] 0:1041 [U] Ba:25 [HIS] B5:1790 [G] ❌ 7O7Y_Ba_B5
L:13 [HIS] 0:904 [U] Ba:17 [HIS] B5:1615 [U] ❌ 7O7Y_Ba_B5
L:52 [LYS] 0:214 [U] Ba:59 [ARG] B5:86 [U] ❌ 7O7Y_Ba_B5
L:52 [LYS] 0:215 [A] Ba:59 [ARG] B5:87 [A] ❌ 7O7Y_Ba_B5
L:42 [ASN] 0:928 [G] Ba:44 [ASN] B5:1639 [A] ❌ 7O7Y_Ba_B5
L:7 [GLN] 0:1296 [A] Ba:11 [LEU] B5:2127 [G] ❌ 1VQ8_L_0
L:111 [ALA] 0:701 [U] Ba:114 [LYS] B5:1375 [A] ❌ 1VQ8_L_0
L:112 [GLY] 0:701 [U] Ba:115 [GLY] B5:1375 [A] ❌ 1VQ8_L_0
L:8 [ARG] 0:1353 [C] Ba:12 [ARG] B5:2187 [U] ❌ 1VQ8_L_0
L:127 [GLU] 0:698 [A] Ba:131 [ARG] B5:1341 [A] ❌ 1VQ8_L_0
L:10 [SER] 0:1294 [A] Ba:14 [HIS] B5:2125 [A] ❌ 1VQ8_L_0
L:10 [SER] 0:906 [C] Ba:14 [HIS] B5:1617 [C] ❌ 1VQ8_L_0
L:10 [SER] 0:1295 [G] Ba:14 [HIS] B5:2126 [G] ❌ 1VQ8_L_0
L:12 [THR] 0:624 [U] Ba:16 [SER] B5:1262 [C] ❌ 1VQ8_L_0
L:15 [GLY] 0:644 [G] Ba:19 [HIS] B5:1282 [G] ❌ 1VQ8_L_0
L:17 [SER] 0:1295 [G] Ba:21 [ARG] B5:2126 [G] ❌ 1VQ8_L_0
L:17 [SER] 0:623 [U] Ba:21 [ARG] B5:1261 [U] ❌ 1VQ8_L_0
L:18 [HIS] 0:625 [U] Ba:22 [ILE] B5:1263 [U] ❌ 1VQ8_L_0
L:18 [HIS] 0:1042 [U] Ba:22 [ILE] B5:1791 [U] ❌ 1VQ8_L_0
L:19 [LYS] 0:1042 [U] Ba:23 [GLY] B5:1791 [U] ❌ 1VQ8_L_0
L:19 [LYS] 0:925 [C] Ba:23 [GLY] B5:1636 [G] ❌ 1VQ8_L_0
L:19 [LYS] 0:1041 [U] Ba:23 [GLY] B5:1790 [G] ❌ 1VQ8_L_0
L:20 [ASN] 0:625 [U] Ba:24 [LYS] B5:1263 [U] ❌ 1VQ8_L_0
L:20 [ASN] 0:900 [U] Ba:24 [LYS] B5:1611 [U] ❌ 1VQ8_L_0
L:20 [ASN] 0:624 [U] Ba:24 [LYS] B5:1262 [C] ❌ 1VQ8_L_0
L:20 [ASN] 0:901 [G] Ba:24 [LYS] B5:1612 [G] ❌ 1VQ8_L_0
L:23 [GLY] 0:762 [C] Ba:27 [LYS] B5:1474 [C] ❌ 1VQ8_L_0
L:23 [GLY] 0:761 [A] Ba:27 [LYS] B5:1473 [A] ❌ 1VQ8_L_0
L:23 [GLY] 0:763 [C] Ba:27 [LYS] B5:1475 [C] ❌ 1VQ8_L_0
L:23 [GLY] 0:899 [C] Ba:27 [LYS] B5:1610 [C] ❌ 1VQ8_L_0
L:24 [ALA] 0:758 [A] Ba:28 [HIS] B5:1470 [A] ❌ 1VQ8_L_0
L:24 [ALA] 0:761 [A] Ba:28 [HIS] B5:1473 [A] ❌ 1VQ8_L_0
L:24 [ALA] 0:759 [C] Ba:28 [HIS] B5:1471 [G] ❌ 1VQ8_L_0
L:26 [HIS] 0:166 [A] Ba:29 [PRO] B5:39 [A] ❌ 1VQ8_L_0
L:28 [GLY] 0:924 [G] Ba:30 [GLY] B5:1635 [G] ❌ 1VQ8_L_0
L:33 [ALA] 0:223 [G] Ba:35 [ALA] B5:95 [G] ❌ 1VQ8_L_0
L:36 [ASP] 0:221 [G] Ba:38 [MET] B5:93 [G] ❌ 1VQ8_L_0
L:36 [ASP] 0:2465 [A] Ba:38 [MET] B5:4122 [A] ❌ 1VQ8_L_0
L:36 [ASP] 0:2430 [A] Ba:38 [MET] B5:4086 [U] ❌ 1VQ8_L_0
L:36 [ASP] 0:2429 [A] Ba:38 [MET] B5:4085 [A] ❌ 1VQ8_L_0
L:37 [LYS] 0:166 [A] Ba:39 [V5N] B5:39 [A] ❌ 1VQ8_L_0
L:40 [PHE] 0:2466 [G] Ba:42 [ARG] B5:4123 [G] ❌ 1VQ8_L_0
L:40 [PHE] 0:2429 [A] Ba:42 [ARG] B5:4085 [A] ❌ 1VQ8_L_0
L:42 [ASN] 0:926 [A] Ba:44 [ASN] B5:1637 [A] ❌ 1VQ8_L_0
L:1 [THR] 0:754 [G] Ba:5 [LEU] B5:1466 [U] ❌ 1VQ8_L_0
L:1 [THR] 0:753 [U] Ba:5 [LEU] B5:1465 [G] ❌ 1VQ8_L_0
L:46 [LEU] 0:222 [A] Ba:53 [PHE] B5:94 [A] ❌ 1VQ8_L_0
L:49 [SER] 0:692 [A] Ba:56 [VAL] B5:1335 [A] ❌ 1VQ8_L_0
L:51 [PHE] 0:216 [A] Ba:58 [MET] B5:88 [A] ❌ 1VQ8_L_0
L:52 [LYS] 0:2443 [C] Ba:59 [ARG] B5:4100 [U] ❌ 1VQ8_L_0
L:52 [LYS] 0:2452 [G] Ba:59 [ARG] B5:4109 [A] ❌ 1VQ8_L_0
L:2 [SER] 0:645 [U] Ba:6 [ARG] B5:1283 [U] ❌ 1VQ8_L_0
L:53 [ARG] 0:215 [A] Ba:60 [HIS] B5:87 [A] ❌ 1VQ8_L_0
L:53 [ARG] 0:2443 [C] Ba:60 [HIS] B5:4100 [U] ❌ 1VQ8_L_0
L:53 [ARG] 0:216 [A] Ba:60 [HIS] B5:88 [A] ❌ 1VQ8_L_0
L:54 [PRO] 0:216 [A] Ba:61 [TYR] B5:88 [A] ❌ 1VQ8_L_0
L:54 [PRO] 0:417 [G] Ba:61 [TYR] B5:315 [G] ❌ 1VQ8_L_0
L:54 [PRO] 0:215 [A] Ba:61 [TYR] B5:87 [A] ❌ 1VQ8_L_0
L:56 [LYS] 0:198 [A] Ba:64 [LYS] B5:70 [A] ❌ 1VQ8_L_0
L:57 [VAL] 0:215 [A] Ba:65 [ARG] B5:87 [A] ❌ 1VQ8_L_0
L:57 [VAL] 0:214 [U] Ba:65 [ARG] B5:86 [U] ❌ 1VQ8_L_0
L:58 [GLN] 0:198 [A] Ba:67 [GLN] B5:70 [A] ❌ 1VQ8_L_0
L:3 [LYS] 0:1295 [G] Ba:7 [LYS] B5:2126 [G] ❌ 1VQ8_L_0
L:55 [GLN] 0:226 [A] Ba:63 [LEU] B5:98 [A] ❌ 7O7Y_B5:98 no longer at interface
L:18 [HIS] 0:902 [G] Ba:22 [ILE] B5:1613 [G] ❌ 7O7Y_B5:1613 no longer at interface
L:56 [LYS] 0:416 [G] Ba:64 [LYS] B5:314 [G] ❌ 7O7Y_B5:314 no longer at interface
L:19 [LYS] 0:2483 [A] Ba:23 [GLY] B5:4140 [A] ❌ 7O7Y_B5:4140 no longer at interface
L:11 [ARG] 0:622 [G] Ba:15 [VAL] B5:1260 [OMG] ❌ 7O7Y_B5:1260 no longer at interface
L:11 [ARG] 0:902 [G] Ba:15 [VAL] B5:1613 [G] ❌ 7O7Y_B5:1613 no longer at interface
L:5 [LYS] 0:1301 [C] Ba:9 [ARG] B5:2133 [C] ❌ 7O7Y_B5:2133 no longer at interface
L:3 [LYS] 0:1039 [G] Ba:7 [LYS] B5:1788 [U] ❌ 7O7Y_B5:1788 no longer at interface
L:37 [LYS] 0:920 [C] Ba:39 [V5N] B5:1631 [C] ❌ 7O7Y_B5:1631 no longer at interface
L:53 [ARG] 0:694 [A] Ba:60 [HIS] B5:1337 [G] ❌ 7O7Y_B5:1337 no longer at interface
L:53 [ARG] 0:695 [C] Ba:60 [HIS] B5:1338 [G] ❌ 7O7Y_B5:1338 no longer at interface
L:53 [ARG] 0:2442 [G] Ba:60 [HIS] B5:4099 [PSU] ❌ 7O7Y_B5:4099 no longer at interface
L:41 [HIS] 0:2395 [A] Ba:43 [ILE] B5:4051 [G] ❌ 7O7Y_B5:4051 no longer at interface
L:6 [ARG] 0:907 [A] Ba:10 [LYS] B5:1618 [C] ❌ 7O7Y_B5:1618 no longer at interface
L:59 [GLU] 0:695 [C] Ba:68 [SER] B5:1338 [G] ❌ 7O7Y_Ba:68, 7O7Y_B5:1338 no longer at interface
L:57 [VAL] 0:2442 [G] Ba:65 [ARG] B5:4099 [PSU] ❌ 7O7Y_B5:4099 no longer at interface
L:54 [PRO] 0:2442 [G] Ba:61 [TYR] B5:4099 [PSU] ❌ 7O7Y_B5:4099 no longer at interface
L:58 [GLN] 0:694 [A] Ba:67 [GLN] B5:1337 [G] ❌ 7O7Y_B5:1337 no longer at interface
L:111 [ALA] 0:744 [G] Ba:114 [LYS] B5:1455 [A] ❌ 1VQ8_0:744 no longer at interface
L:111 [ALA] 0:743 [G] Ba:114 [LYS] B5:1454 [C] ❌ 1VQ8_0:743 no longer at interface
L:127 [GLU] 0:730 [G] Ba:131 [ARG] B5:1423 [C] ❌ 1VQ8_0:730 no longer at interface
L:128 [GLY] 0:731 [U] Ba:132 [ARG] B5:1424 [C] ❌ 1VQ8_0:731 no longer at interface
L:128 [GLY] 0:729 [C] Ba:132 [ARG] B5:1422 [C] ❌ 1VQ8_0:729 no longer at interface
L:128 [GLY] 0:730 [G] Ba:132 [ARG] B5:1423 [C] ❌ 1VQ8_0:730 no longer at interface
L:145 [LEU] 0:200 [U] Ba:148 [ALA] B5:72 [C] ❌ 1VQ8_L:145, 1VQ8_0:200 no longer at interface
L:17 [SER] 0:1293 [U] Ba:21 [ARG] B5:2124 [U] ❌ 1VQ8_0:1293 no longer at interface
L:18 [HIS] 0:913 [A] Ba:22 [ILE] B5:1624 [A] ❌ 1VQ8_0:913 no longer at interface
L:18 [HIS] 0:912 [A] Ba:22 [ILE] B5:1623 [A] ❌ 1VQ8_0:912 no longer at interface
L:18 [HIS] 0:914 [A] Ba:22 [ILE] B5:1625 [G] ❌ 1VQ8_0:914 no longer at interface
L:18 [HIS] 0:1043 [C] Ba:22 [ILE] B5:1792 [G] ❌ 1VQ8_0:1043 no longer at interface
L:19 [LYS] 0:1043 [C] Ba:23 [GLY] B5:1792 [G] ❌ 1VQ8_0:1043 no longer at interface
L:23 [GLY] 0:760 [G] Ba:27 [LYS] B5:1472 [G] ❌ 1VQ8_0:760 no longer at interface
L:23 [GLY] 0:765 [G] Ba:27 [LYS] B5:1477 [OMG] ❌ 1VQ8_0:765 no longer at interface
L:41 [HIS] 0:2394 [A] Ba:43 [ILE] B5:4050 [A] ❌ 1VQ8_0:2394 no longer at interface
L:1 [THR] 0:752 [G] Ba:5 [LEU] B5:1464 [C] ❌ 1VQ8_0:752 no longer at interface
L:52 [LYS] 0:217 [C] Ba:59 [ARG] B5:89 [C] ❌ 1VQ8_0:217 no longer at interface
L:52 [LYS] 0:395 [A] Ba:59 [ARG] B5:294 [G] ❌ 1VQ8_0:395 no longer at interface
L:2 [SER] 0:646 [G] Ba:6 [ARG] B5:1284 [OMC] ❌ 1VQ8_0:646 no longer at interface
L:2 [SER] 0:1351 [G] Ba:6 [ARG] B5:2185 [G] ❌ 1VQ8_0:1351 no longer at interface
L:54 [PRO] 0:418 [C] Ba:61 [TYR] B5:316 [U] ❌ 1VQ8_0:418 no longer at interface
L:54 [PRO] 0:217 [C] Ba:61 [TYR] B5:89 [C] ❌ 1VQ8_0:217 no longer at interface
L:54 [PRO] 0:395 [A] Ba:61 [TYR] B5:294 [G] ❌ 1VQ8_0:395 no longer at interface
L:54 [PRO] 0:396 [U] Ba:61 [TYR] B5:295 [A] ❌ 1VQ8_0:396 no longer at interface
L:55 [GLN] 0:227 [A] Ba:63 [LEU] B5:99 [A] ❌ 1VQ8_0:227 no longer at interface
L:56 [LYS] 0:228 [C] Ba:64 [LYS] B5:100 [C] ❌ 1VQ8_0:228 no longer at interface
L:57 [VAL] 0:212 [A] Ba:65 [ARG] B5:84 [A] ❌ 1VQ8_0:212 no longer at interface
L:57 [VAL] 0:211 [U] Ba:65 [ARG] B5:83 [C] ❌ 1VQ8_0:211 no longer at interface
L:68 [GLU] 0:660 [A] Ba:77 [LYS] B5:1298 [A] ❌ 1VQ8_L:68, 1VQ8_0:660 no longer at interface
L:71 [GLU] 0:700 [A] Ba:80 [THR] B5:1374 [G] ❌ 7O7Y_Ba:80 no longer at interface
L:71 [GLU] 0:745 [G] Ba:80 [THR] B5:1457 [G] ❌ 7O7Y_Ba:80 no longer at interface
L:114 [VAL] 0:700 [A] Ba:117 [LEU] B5:1374 [G] ❌ 7O7Y_Ba:117 no longer at interface
L:70 [ASP] 0:700 [A] Ba:79 [TRP] B5:1374 [G] ❌ 7O7Y_Ba:79 no longer at interface
L:115 [ARG] 0:700 [A] Ba:118 [PRO] B5:1374 [G] ❌ 7O7Y_Ba:118 no longer at interface
L:115 [ARG] 0:701 [U] Ba:118 [PRO] B5:1375 [A] ❌ 7O7Y_Ba:118 no longer at interface
L:67 [ARG] 0:688 [A] Ba:76 [ASP] B5:1331 [A] ❌ 7O7Y_Ba:76 no longer at interface
L:67 [ARG] 0:700 [A] Ba:76 [ASP] B5:1374 [G] ❌ 7O7Y_Ba:76 no longer at interface
L:67 [ARG] 0:745 [G] Ba:76 [ASP] B5:1457 [G] ❌ 7O7Y_Ba:76 no longer at interface
L:116 [HIS] 0:700 [A] Ba:119 [LYS] B5:1374 [G] ❌ 1VQ8_L:116 no longer at interface
L:45 [PRO] 0:221 [G] Ba:52 [TYR] B5:93 [G] ❌ 1VQ8_L:45 no longer at interface
L:45 [PRO] 0:222 [A] Ba:52 [TYR] B5:94 [A] ❌ 1VQ8_L:45 no longer at interface
L:68 [GLU] 0:687 [C] Ba:77 [LYS] B5:1330 [C] ❌ 1VQ8_L:68 no longer at interface
L:68 [GLU] 0:745 [G] Ba:77 [LYS] B5:1457 [G] ❌ 1VQ8_L:68 no longer at interface

logo_download Export the table of contacts

Properties of this pair

Common ECOD label(s)
 Common RFAM label(s)
 Interface TM-score
 Interface RMSD
 Percentage identity
 Protein TM-score
 RNA TM-score
 Protein coverage
 RNA coverage
 Percentage conservation
 Apolar conservation
 H-bond conservation
 Percentage switching out
Ribosomal proteins L15p and L18e 0.93 2.45 0.36 0.75 0.94 0.86 0.85 0.62 0.57 0.33 0.38


Other pairs involving 1VQ8_L_0 or 7O7Y_Ba_B5

Total number of entries: 10

Interface 1 Interface 2 Percentage conservation
 		Interface TM-score
 		Interface RMSD
 		Percentage identity
 		Common ECOD label(s)
 		Common RFAM label(s)
 		Explore both interfaces
6AZ3_L_1 7O7Y_Ba_B5 0.86 0.92 0.75 0.6 Ribosomal proteins L15p and L18e Eukaryotic large subunit ribosomal RNA compare
1YHQ_L_0 7O7Y_Ba_B5 0.62 0.93 2.36 0.35 Ribosomal proteins L15p and L18e compare
1VQ8_L_0 7O7Y_Ba_B5 0.62 0.93 2.45 0.36 Ribosomal proteins L15p and L18e compare
1VQ8_L_0 6AZ3_L_2 0.48 0.82 2.4 0.27 Ribosomal proteins L15p and L18e compare
1VQ8_L_0 4Y4O_1P_1A 0.38 0.93 4.18 0.15 Ribosomal proteins L15p and L18e compare
1VQ8_L_0 6AZ3_L_1 0.63 0.77 2.74 0.34 Ribosomal proteins L15p and L18e compare
1VQ8_L_0 6S0Z_J_A 0.41 0.93 4.07 0.15 Ribosomal proteins L15p and L18e compare
1VQ8_L_0 1YHQ_L_0 0.99 1.0 0.24 0.98 Ribosomal proteins L15p and L18e Archaeal large subunit ribosomal RNA compare
6S0Z_J_A 7O7Y_Ba_B5 0.38 0.88 4.38 0.11 Ribosomal proteins L15p and L18e compare
6AZ3_L_2 7O7Y_Ba_B5 0.97 0.91 0.6 0.67 Ribosomal proteins L15p and L18e Eukaryotic large subunit ribosomal RNA compare