Interface analysis
Style
Protein
CartoonLicorice
Surface
RNA
CartoonLicorice
Surface
Color
StructureStructure (with hetatm)
Chain
Chainbow
View
Focus on
InterfaceRNA
Protein
All
Show chains
Interface
show interface as licoriceCommon contacts -
4Y4O_1P
|
4Y4O_1A
|
6AZ3_L
|
6AZ3_1
|
Conserved?
|
---|---|---|---|---|
1P:50 [ARG] | 1A:240 [A] | L:35 [ALA] | 1:94 [A] | ✔ |
1P:50 [ARG] | 1A:241 [G] | L:35 [ALA] | 1:95 [G] | ✔ |
1P:69 [GLY] | 1A:234 [G] | L:59 [ASP] | 1:88 [G] | ✔ |
1P:69 [GLY] | 1A:235 [C] | L:59 [ASP] | 1:89 [C] | ✔ |
1P:51 [PHE] | 1A:185 [A] | L:36 [GLY] | 1:38 [A] | ✔ |
1P:43 [GLY] | 1A:717 [A] | L:28 [HIS] | 1:852 [A] | ✔ |
1P:41 [ARG] | 1A:718 [C] | L:26 [ARG] | 1:853 [C] | ✔ |
1P:41 [ARG] | 1A:852 [G] | L:26 [ARG] | 1:988 [G] | ✔ |
1P:41 [ARG] | 1A:853 [C] | L:26 [ARG] | 1:989 [C] | ✔ |
1P:41 [ARG] | 1A:854 [U] | L:26 [ARG] | 1:990 [U] | ✔ |
1P:41 [ARG] | 1A:855 [G] | L:26 [ARG] | 1:991 [G] | ✔ |
1P:73 [GLY] | 1A:233 [A] | L:62 [HIS] | 1:87 [A] | ✔ |
1P:133 [SER] | 1A:662 [A] | L:129 [LEU] | 1:753 [A] | ✔ |
1P:17 [LYS] | 1A:709 [G] | L:7 [LYS] | 1:844 [C] | ✔ |
1P:17 [LYS] | 1A:710 [G] | L:7 [LYS] | 1:845 [OMU] | ✔ |
1P:17 [LYS] | 1A:711 [C] | L:7 [LYS] | 1:846 [G] | ✔ |
1P:17 [LYS] | 1A:1236 [G] | L:7 [LYS] | 1:1462 [A] | ✔ |
1P:17 [LYS] | 1A:1237 [G] | L:7 [LYS] | 1:1463 [U] | ✔ |
1P:74 [GLU] | 1A:233 [A] | L:63 [ARG] | 1:87 [A] | ✔ |
1P:134 [ALA] | 1A:662 [A] | L:130 [ALA] | 1:753 [A] | ✔ |
1P:34 [GLY] | 1A:987 [G] | L:20 [GLY] | 1:1170 [G] | ✔ |
1P:34 [GLY] | 1A:988 [U] | L:20 [GLY] | 1:1171 [U] | ✔ |
1P:34 [GLY] | 1A:1234 [A] | L:20 [GLY] | 1:1460 [A] | ✔ |
1P:34 [GLY] | 1A:1235 [G] | L:20 [GLY] | 1:1461 [G] | ✔ |
1P:29 [LYS] | 1A:589 [U] | L:15 [THR] | 1:672 [U] | ✔ |
1P:29 [LYS] | 1A:857 [U] | L:15 [THR] | 1:993 [U] | ✔ |
1P:29 [LYS] | 1A:858 [U] | L:15 [THR] | 1:994 [U] | ✔ |
1P:82 [GLY] | 1A:661 [G] | L:72 [THR] | 1:752 [G] | ✔ |
1P:20 [GLY] | 1A:858 [U] | L:11 [GLN] | 1:994 [U] | ✔ |
1P:67 [MET] | 1A:656 [A] | L:57 [GLY] | 1:747 [A] | ✔ |
1P:84 [ASN] | 1A:652 [A] | L:74 [ASN] | 1:743 [A] | ✔ |
1P:30 [THR] | 1A:610 [C] | L:16 [PHE] | 1:693 [G] | ✔ |
1P:30 [THR] | 1A:857 [U] | L:16 [PHE] | 1:993 [U] | ✔ |
1P:30 [THR] | 1A:1234 [A] | L:16 [PHE] | 1:1460 [A] | ✔ |
1P:30 [THR] | 1A:1235 [G] | L:16 [PHE] | 1:1461 [G] | ✔ |
1P:54 [GLY] | 1A:185 [A] | L:39 [HIS] | 1:38 [A] | ✔ |
1P:54 [GLY] | 1A:873 [U] | L:39 [HIS] | 1:1009 [C] | ✔ |
1P:80 [TYR] | 1A:661 [G] | L:70 [LYS] | 1:752 [G] | ✔ |
1P:55 [ARG] | 1A:873 [U] | L:40 [HIS] | 1:1009 [C] | ✔ |
1P:55 [ARG] | 1A:879 [G] | L:40 [HIS] | 1:1015 [G] | ✔ |
1P:55 [ARG] | 1A:880 [U] | L:40 [HIS] | 1:1016 [A] | ✔ |
1P:64 [LYS] | 1A:238 [C] | L:54 [GLY] | 1:92 [C] | ✔ |
1P:115 [LEU] | 1A:652 [A] | L:110 [LEU] | 1:743 [A] | ✔ |
1P:115 [LEU] | 1A:661 [G] | L:110 [LEU] | 1:752 [G] | ✔ |
1P:115 [LEU] | 1A:662 [A] | L:110 [LEU] | 1:753 [A] | ✔ |
1P:70 [GLN] | 1A:234 [G] | L:60 [HIS] | 1:88 [G] | ✔ |
1P:106 [LEU] | 1A:651 [U] | L:106 [TYR] | 1:742 [U] | ✔ |
1P:35 [HIS] | 1A:590 [A] | L:21 [ARG] | 1:673 [C] | ✔ |
1P:35 [HIS] | 1A:591 [U] | L:21 [ARG] | 1:674 [U] | ✔ |
1P:35 [HIS] | 1A:988 [U] | L:21 [ARG] | 1:1171 [U] | ✔ |
1P:35 [HIS] | 1A:1234 [A] | L:21 [ARG] | 1:1460 [A] | ✔ |
1P:31 [ALA] | 1A:610 [C] | L:17 [CYS] | 1:693 [G] | ✔ |
1P:31 [ALA] | 1A:857 [U] | L:17 [CYS] | 1:993 [U] | ✔ |
1P:31 [ALA] | 1A:1235 [G] | L:17 [CYS] | 1:1461 [G] | ✔ |
1P:45 [LEU] | 1A:713 [G] | L:30 [SER] | 1:848 [U] | ✔ |
1P:45 [LEU] | 1A:879 [G] | L:30 [SER] | 1:1015 [G] | ✔ |
1P:45 [LEU] | 1A:880 [U] | L:30 [SER] | 1:1016 [A] | ✔ |
1P:90 [ARG] | 1A:626 [A] | L:80 [ARG] | 1:709 [A] | ✔ |
1P:90 [ARG] | 1A:627 [G] | L:80 [ARG] | 1:710 [G] | ✔ |
1P:46 [LYS] | 1A:184 [A] | L:31 [GLY] | 1:37 [A] | ✔ |
1P:46 [LYS] | 1A:185 [A] | L:31 [GLY] | 1:38 [A] | ✔ |
1P:40 [SER] | 1A:718 [C] | L:25 [HIS] | 1:853 [C] | ✔ |
1P:113 [LYS] | 1A:660 [C] | L:108 [LYS] | 1:751 [G] | ✔ |
1P:113 [LYS] | 1A:661 [G] | L:108 [LYS] | 1:752 [G] | ✔ |
1P:16 [ARG] | 1A:611 [U] | L:6 [LYS] | 1:694 [U] | ✔ |
1P:16 [ARG] | 1A:612 [C] | L:6 [LYS] | 1:695 [OMC] | ✔ |
1P:16 [ARG] | 1A:709 [G] | L:6 [LYS] | 1:844 [C] | ✔ |
1P:16 [ARG] | 1A:710 [G] | L:6 [LYS] | 1:845 [OMU] | ✔ |
1P:117 [GLU] | 1A:652 [A] | L:112 [ASN] | 1:743 [A] | ✔ |
1P:117 [GLU] | 1A:662 [A] | L:112 [ASN] | 1:753 [A] | ✔ |
1P:117 [GLU] | 1A:677 [C] | L:112 [ASN] | 1:833 [U] | ✔ |
1P:48 [PRO] | 1A:713 [G] | L:33 [GLY] | 1:848 [U] | ✔ |
1P:47 [ASP] | 1A:713 [G] | L:32 [ARG] | 1:848 [U] | ✔ |
1P:47 [ASP] | 1A:714 [U] | L:32 [ARG] | 1:849 [U] | ✔ |
1P:72 [PRO] | 1A:233 [A] | L:61 [TYR] | 1:87 [A] | ✔ |
1P:72 [PRO] | 1A:416 [G] | L:61 [TYR] | 1:321 [A] | ✔ |
1P:72 [PRO] | 1A:438 [G] | L:61 [TYR] | 1:342 [G] | ✔ |
1P:131 [SER] | 1A:661 [G] | L:127 [SER] | 1:752 [G] | ✔ |
1P:131 [SER] | 1A:662 [A] | L:127 [SER] | 1:753 [A] | ✔ |
1P:116 [GLY] | 1A:652 [A] | L:111 [GLY] | 1:743 [A] | ✔ |
1P:116 [GLY] | 1A:662 [A] | L:111 [GLY] | 1:753 [A] | ✔ |
1P:15 [ARG] | 1A:709 [G] | L:5 [PHE] | 1:844 [C] | ✔ |
1P:36 [LYS] | 1A:590 [A] | L:22 [VAL] | 1:673 [C] | ✔ |
1P:36 [LYS] | 1A:591 [U] | L:22 [VAL] | 1:674 [U] | ✔ |
1P:130 [PHE] | 1A:661 [G] | L:126 [VAL] | 1:752 [G] | ✔ |
1P:68 [GLN] | 1A:234 [G] | L:58 [MET] | 1:88 [G] | ✔ |
1P:33 [ARG] | 1A:610 [C] | L:19 [TYR] | 1:693 [G] | ✔ |
1P:33 [ARG] | 1A:987 [G] | L:19 [TYR] | 1:1170 [G] | ✔ |
1P:33 [ARG] | 1A:988 [U] | L:19 [TYR] | 1:1171 [U] | ✔ |
1P:33 [ARG] | 1A:1234 [A] | L:19 [TYR] | 1:1460 [A] | ✔ |
1P:33 [ARG] | 1A:1235 [G] | L:19 [TYR] | 1:1461 [G] | ✔ |
1P:66 [GLY] | 1A:656 [A] | L:56 [LEU] | 1:747 [A] | ✔ |
1P:32 [THR] | 1A:986 [A] | L:18 [GLY] | 1:1169 [A] | ✔ |
1P:32 [THR] | 1A:987 [G] | L:18 [GLY] | 1:1170 [G] | ✔ |
1P:32 [THR] | 1A:1235 [G] | L:18 [GLY] | 1:1461 [G] | ✔ |
1P:32 [THR] | 1A:1236 [G] | L:18 [GLY] | 1:1462 [A] | ✔ |
1P:28 [GLY] | 1A:858 [U] | L:14 [SER] | 1:994 [U] | ✔ |
1P:132 [LYS] | 1A:660 [C] | L:128 [LYS] | 1:751 [G] | ✔ |
1P:132 [LYS] | 1A:661 [G] | L:128 [LYS] | 1:752 [G] | ✔ |
1P:21 [ARG] | 1A:610 [C] | L:12 [ARG] | 1:693 [G] | ✔ |
1P:21 [ARG] | 1A:857 [U] | L:12 [ARG] | 1:993 [U] | ✔ |
1P:21 [ARG] | 1A:858 [U] | L:12 [ARG] | 1:994 [U] | ✔ |
1P:21 [ARG] | 1A:859 [C] | L:12 [ARG] | 1:995 [C] | ✔ |
1P:21 [ARG] | 1A:860 [U] | L:12 [ARG] | 1:996 [A] | ✔ |
1P:21 [ARG] | 1A:1296 [G] | L:12 [ARG] | 1:1523 [G] | ✔ |
1P:42 [SER] | 1A:717 [A] | L:27 [LYS] | 1:852 [A] | ✔ |
1P:42 [SER] | 1A:718 [C] | L:27 [LYS] | 1:853 [C] | ✔ |
1P:42 [SER] | 1A:852 [G] | L:27 [LYS] | 1:988 [G] | ✔ |
1P:87 [ASP] | 1A:626 [A] | L:77 [ASN] | 1:709 [A] | ✔ |
1P:22 [GLY] | 1A:857 [U] | L:13 [GLY] | 1:993 [U] | ✔ |
1P:22 [GLY] | 1A:858 [U] | L:13 [GLY] | 1:994 [U] | ✔ |
1P:22 [GLY] | 1A:859 [C] | L:13 [GLY] | 1:995 [C] | ✔ |
1P:22 [GLY] | 1A:860 [U] | L:13 [GLY] | 1:996 [A] | ✔ |
1P:77 [ARG] | 1A:657 [A] | L:67 [PRO] | 1:748 [A] | ❌ 6AZ3_L_1 |
1P:51 [PHE] | 1A:879 [G] | L:36 [GLY] | 1:1015 [G] | ❌ 6AZ3_L_1 |
1P:51 [PHE] | 1A:880 [U] | L:36 [GLY] | 1:1016 [A] | ❌ 6AZ3_L_1 |
1P:43 [GLY] | 1A:718 [C] | L:28 [HIS] | 1:853 [C] | ❌ 6AZ3_L_1 |
1P:73 [GLY] | 1A:234 [G] | L:62 [HIS] | 1:88 [G] | ❌ 6AZ3_L_1 |
1P:133 [SER] | 1A:661 [G] | L:129 [LEU] | 1:752 [G] | ❌ 6AZ3_L_1 |
1P:17 [LYS] | 1A:611 [U] | L:7 [LYS] | 1:694 [U] | ❌ 6AZ3_L_1 |
1P:18 [ARG] | 1A:859 [C] | L:8 [CYS] | 1:995 [C] | ❌ 6AZ3_L_1 |
1P:18 [ARG] | 1A:1295 [U] | L:8 [CYS] | 1:1522 [U] | ❌ 6AZ3_L_1 |
1P:18 [ARG] | 1A:1296 [G] | L:8 [CYS] | 1:1523 [G] | ❌ 6AZ3_L_1 |
1P:74 [GLU] | 1A:234 [G] | L:63 [ARG] | 1:88 [G] | ❌ 6AZ3_L_1 |
1P:29 [LYS] | 1A:590 [A] | L:15 [THR] | 1:673 [C] | ❌ 6AZ3_L_1 |
1P:29 [LYS] | 1A:610 [C] | L:15 [THR] | 1:693 [G] | ❌ 6AZ3_L_1 |
1P:20 [GLY] | 1A:857 [U] | L:11 [GLN] | 1:993 [U] | ❌ 6AZ3_L_1 |
1P:67 [MET] | 1A:657 [A] | L:57 [GLY] | 1:748 [A] | ❌ 6AZ3_L_1 |
1P:84 [ASN] | 1A:662 [A] | L:74 [ASN] | 1:753 [A] | ❌ 6AZ3_L_1 |
1P:54 [GLY] | 1A:878 [G] | L:39 [HIS] | 1:1014 [G] | ❌ 6AZ3_L_1 |
1P:19 [VAL] | 1A:610 [C] | L:9 [ARG] | 1:693 [G] | ❌ 6AZ3_L_1 |
1P:44 [GLY] | 1A:718 [C] | L:29 [GLU] | 1:853 [C] | ❌ 6AZ3_L_1 |
1P:55 [ARG] | 1A:871 [A] | L:40 [HIS] | 1:1007 [U] | ❌ 6AZ3_L_1 |
1P:55 [ARG] | 1A:872 [C] | L:40 [HIS] | 1:1008 [C] | ❌ 6AZ3_L_1 |
1P:70 [GLN] | 1A:235 [C] | L:60 [HIS] | 1:89 [C] | ❌ 6AZ3_L_1 |
1P:70 [GLN] | 1A:416 [G] | L:60 [HIS] | 1:321 [A] | ❌ 6AZ3_L_1 |
1P:35 [HIS] | 1A:987 [G] | L:21 [ARG] | 1:1170 [G] | ❌ 6AZ3_L_1 |
1P:76 [LYS] | 1A:216 [A] | L:65 [LYS] | 1:69 [A2M] | ❌ 6AZ3_L_1 |
1P:46 [LYS] | 1A:183 [G] | L:31 [GLY] | 1:36 [U] | ❌ 6AZ3_L_1 |
1P:46 [LYS] | 1A:713 [G] | L:31 [GLY] | 1:848 [U] | ❌ 6AZ3_L_1 |
1P:46 [LYS] | 1A:880 [U] | L:31 [GLY] | 1:1016 [A] | ❌ 6AZ3_L_1 |
1P:40 [SER] | 1A:879 [G] | L:25 [HIS] | 1:1015 [G] | ❌ 6AZ3_L_1 |
1P:16 [ARG] | 1A:1293 [A] | L:6 [LYS] | 1:1520 [A] | ❌ 6AZ3_L_1 |
1P:48 [PRO] | 1A:880 [U] | L:33 [GLY] | 1:1016 [A] | ❌ 6AZ3_L_1 |
1P:48 [PRO] | 1A:881 [C] | L:33 [GLY] | 1:1017 [U] | ❌ 6AZ3_L_1 |
1P:37 [GLY] | 1A:852 [G] | L:23 [GLY] | 1:988 [G] | ❌ 6AZ3_L_1 |
1P:37 [GLY] | 1A:853 [C] | L:23 [GLY] | 1:989 [C] | ❌ 6AZ3_L_1 |
1P:37 [GLY] | 1A:854 [U] | L:23 [GLY] | 1:990 [U] | ❌ 6AZ3_L_1 |
1P:37 [GLY] | 1A:878 [G] | L:23 [GLY] | 1:1014 [G] | ❌ 6AZ3_L_1 |
1P:37 [GLY] | 1A:879 [G] | L:23 [GLY] | 1:1015 [G] | ❌ 6AZ3_L_1 |
1P:116 [GLY] | 1A:661 [G] | L:111 [GLY] | 1:752 [G] | ❌ 6AZ3_L_1 |
1P:36 [LYS] | 1A:853 [C] | L:22 [VAL] | 1:989 [C] | ❌ 6AZ3_L_1 |
1P:36 [LYS] | 1A:854 [U] | L:22 [VAL] | 1:990 [U] | ❌ 6AZ3_L_1 |
1P:36 [LYS] | 1A:855 [G] | L:22 [VAL] | 1:991 [G] | ❌ 6AZ3_L_1 |
1P:36 [LYS] | 1A:879 [G] | L:22 [VAL] | 1:1015 [G] | ❌ 6AZ3_L_1 |
1P:65 [ARG] | 1A:656 [A] | L:55 [LYS] | 1:747 [A] | ❌ 6AZ3_L_1 |
1P:33 [ARG] | 1A:718 [C] | L:19 [TYR] | 1:853 [C] | ❌ 6AZ3_L_1 |
1P:28 [GLY] | 1A:1235 [G] | L:14 [SER] | 1:1461 [G] | ❌ 6AZ3_L_1 |
1P:14 [LYS] | 1A:708 [C] | L:4 [ARG] | 1:843 [C] | ❌ 6AZ3_L_1 |
1P:14 [LYS] | 1A:709 [G] | L:4 [ARG] | 1:844 [C] | ❌ 6AZ3_L_1 |
1P:14 [LYS] | 1A:1238 [G] | L:4 [ARG] | 1:1464 [G] | ❌ 6AZ3_L_1 |
1P:14 [LYS] | 1A:1239 [A] | L:4 [ARG] | 1:1465 [U] | ❌ 6AZ3_L_1 |
1P:52 [GLU] | 1A:872 [C] | L:37 [GLY] | 1:1008 [C] | ❌ 6AZ3_L_1 |
1P:52 [GLU] | 1A:879 [G] | L:37 [GLY] | 1:1015 [G] | ❌ 6AZ3_L_1 |
1P:52 [GLU] | 1A:880 [U] | L:37 [GLY] | 1:1016 [A] | ❌ 6AZ3_L_1 |
1P:39 [LYS] | 1A:878 [G] | L:24 [LYS] | 1:1014 [G] | ❌ 6AZ3_L_1 |
1P:39 [LYS] | 1A:879 [G] | L:24 [LYS] | 1:1015 [G] | ❌ 6AZ3_L_1 |
1P:39 [LYS] | 1A:986 [A] | L:24 [LYS] | 1:1169 [A] | ❌ 6AZ3_L_1 |
1P:39 [LYS] | 1A:987 [G] | L:24 [LYS] | 1:1170 [G] | ❌ 6AZ3_L_1 |
1P:42 [SER] | 1A:719 [C] | L:27 [LYS] | 1:854 [C] | ❌ 6AZ3_L_1 |
1P:49 [ARG] | 1A:713 [G] | L:34 [ASN] | 1:848 [U] | ❌ 6AZ3_L_1 |
1P:87 [ASP] | 1A:651 [U] | L:77 [ASN] | 1:742 [U] | ❌ 6AZ3_L_1 |
1P:87 [ASP] | 1A:652 [A] | L:77 [ASN] | 1:743 [A] | ❌ 6AZ3_L_1 |
1P:106 [LEU] | 1A:650 [G] | L:106 [TYR] | 1:741 [G] | ❌ 4Y4O_1P_1A |
1P:20 [GLY] | 1A:1236 [G] | L:11 [GLN] | 1:1462 [A] | ❌ 4Y4O_1P_1A |
1P:20 [GLY] | 1A:610 [C] | L:11 [GLN] | 1:693 [G] | ❌ 4Y4O_1P_1A |
1P:30 [THR] | 1A:590 [A] | L:16 [PHE] | 1:673 [C] | ❌ 4Y4O_1P_1A |
1P:30 [THR] | 1A:589 [U] | L:16 [PHE] | 1:672 [U] | ❌ 4Y4O_1P_1A |
1P:31 [ALA] | 1A:1236 [G] | L:17 [CYS] | 1:1462 [A] | ❌ 4Y4O_1P_1A |
1P:35 [HIS] | 1A:589 [U] | L:21 [ARG] | 1:672 [U] | ❌ 4Y4O_1P_1A |
1P:36 [LYS] | 1A:988 [U] | L:22 [VAL] | 1:1171 [U] | ❌ 4Y4O_1P_1A |
1P:37 [GLY] | 1A:988 [U] | L:23 [GLY] | 1:1171 [U] | ❌ 4Y4O_1P_1A |
1P:37 [GLY] | 1A:987 [G] | L:23 [GLY] | 1:1170 [G] | ❌ 4Y4O_1P_1A |
1P:39 [LYS] | 1A:854 [U] | L:24 [LYS] | 1:990 [U] | ❌ 4Y4O_1P_1A |
1P:39 [LYS] | 1A:590 [A] | L:24 [LYS] | 1:673 [C] | ❌ 4Y4O_1P_1A |
1P:39 [LYS] | 1A:988 [U] | L:24 [LYS] | 1:1171 [U] | ❌ 4Y4O_1P_1A |
1P:39 [LYS] | 1A:855 [G] | L:24 [LYS] | 1:991 [G] | ❌ 4Y4O_1P_1A |
1P:40 [SER] | 1A:610 [C] | L:25 [HIS] | 1:693 [G] | ❌ 4Y4O_1P_1A |
1P:40 [SER] | 1A:719 [C] | L:25 [HIS] | 1:854 [C] | ❌ 4Y4O_1P_1A |
1P:42 [SER] | 1A:853 [C] | L:27 [LYS] | 1:989 [C] | ❌ 4Y4O_1P_1A |
1P:43 [GLY] | 1A:852 [G] | L:28 [HIS] | 1:988 [G] | ❌ 4Y4O_1P_1A |
1P:43 [GLY] | 1A:185 [A] | L:28 [HIS] | 1:38 [A] | ❌ 4Y4O_1P_1A |
1P:43 [GLY] | 1A:714 [U] | L:28 [HIS] | 1:849 [U] | ❌ 4Y4O_1P_1A |
1P:44 [GLY] | 1A:879 [G] | L:29 [GLU] | 1:1015 [G] | ❌ 4Y4O_1P_1A |
1P:44 [GLY] | 1A:852 [G] | L:29 [GLU] | 1:988 [G] | ❌ 4Y4O_1P_1A |
1P:44 [GLY] | 1A:878 [G] | L:29 [GLU] | 1:1014 [G] | ❌ 4Y4O_1P_1A |
1P:44 [GLY] | 1A:880 [U] | L:29 [GLU] | 1:1016 [A] | ❌ 4Y4O_1P_1A |
1P:44 [GLY] | 1A:185 [A] | L:29 [GLU] | 1:38 [A] | ❌ 4Y4O_1P_1A |
1P:45 [LEU] | 1A:878 [G] | L:30 [SER] | 1:1014 [G] | ❌ 4Y4O_1P_1A |
1P:45 [LEU] | 1A:185 [A] | L:30 [SER] | 1:38 [A] | ❌ 4Y4O_1P_1A |
1P:46 [LYS] | 1A:714 [U] | L:31 [GLY] | 1:849 [U] | ❌ 4Y4O_1P_1A |
1P:47 [ASP] | 1A:184 [A] | L:32 [ARG] | 1:37 [A] | ❌ 4Y4O_1P_1A |
1P:47 [ASP] | 1A:240 [A] | L:32 [ARG] | 1:94 [A] | ❌ 4Y4O_1P_1A |
1P:47 [ASP] | 1A:241 [G] | L:32 [ARG] | 1:95 [G] | ❌ 4Y4O_1P_1A |
1P:47 [ASP] | 1A:183 [G] | L:32 [ARG] | 1:36 [U] | ❌ 4Y4O_1P_1A |
1P:47 [ASP] | 1A:717 [A] | L:32 [ARG] | 1:852 [A] | ❌ 4Y4O_1P_1A |
1P:48 [PRO] | 1A:714 [U] | L:33 [GLY] | 1:849 [U] | ❌ 4Y4O_1P_1A |
1P:48 [PRO] | 1A:240 [A] | L:33 [GLY] | 1:94 [A] | ❌ 4Y4O_1P_1A |
1P:48 [PRO] | 1A:241 [G] | L:33 [GLY] | 1:95 [G] | ❌ 4Y4O_1P_1A |
1P:49 [ARG] | 1A:240 [A] | L:34 [ASN] | 1:94 [A] | ❌ 4Y4O_1P_1A |
1P:49 [ARG] | 1A:241 [G] | L:34 [ASN] | 1:95 [G] | ❌ 4Y4O_1P_1A |
1P:50 [ARG] | 1A:185 [A] | L:35 [ALA] | 1:38 [A] | ❌ 4Y4O_1P_1A |
1P:50 [ARG] | 1A:184 [A] | L:35 [ALA] | 1:37 [A] | ❌ 4Y4O_1P_1A |
1P:51 [PHE] | 1A:184 [A] | L:36 [GLY] | 1:37 [A] | ❌ 4Y4O_1P_1A |
1P:52 [GLU] | 1A:185 [A] | L:37 [GLY] | 1:38 [A] | ❌ 4Y4O_1P_1A |
1P:14 [LYS] | 1A:1292 [A] | L:4 [ARG] | 1:1519 [U] | ❌ 4Y4O_1P_1A |
1P:14 [LYS] | 1A:1295 [U] | L:4 [ARG] | 1:1522 [U] | ❌ 4Y4O_1P_1A |
1P:14 [LYS] | 1A:1293 [A] | L:4 [ARG] | 1:1520 [A] | ❌ 4Y4O_1P_1A |
1P:14 [LYS] | 1A:1291 [G] | L:4 [ARG] | 1:1518 [C] | ❌ 4Y4O_1P_1A |
1P:55 [ARG] | 1A:878 [G] | L:40 [HIS] | 1:1014 [G] | ❌ 4Y4O_1P_1A |
1P:55 [ARG] | 1A:185 [A] | L:40 [HIS] | 1:38 [A] | ❌ 4Y4O_1P_1A |
1P:56 [SER] | 1A:880 [U] | L:41 [HIS] | 1:1016 [A] | ❌ 4Y4O_1P_1A |
1P:56 [SER] | 1A:879 [G] | L:41 [HIS] | 1:1015 [G] | ❌ 4Y4O_1P_1A |
1P:58 [THR] | 1A:881 [C] | L:43 [ILE] | 1:1017 [U] | ❌ 4Y4O_1P_1A |
1P:58 [THR] | 1A:880 [U] | L:43 [ILE] | 1:1016 [A] | ❌ 4Y4O_1P_1A |
1P:58 [THR] | 1A:872 [C] | L:43 [ILE] | 1:1008 [C] | ❌ 4Y4O_1P_1A |
1P:58 [THR] | 1A:871 [A] | L:43 [ILE] | 1:1007 [U] | ❌ 4Y4O_1P_1A |
1P:15 [ARG] | 1A:1291 [G] | L:5 [PHE] | 1:1518 [C] | ❌ 4Y4O_1P_1A |
1P:15 [ARG] | 1A:1292 [A] | L:5 [PHE] | 1:1519 [U] | ❌ 4Y4O_1P_1A |
1P:15 [ARG] | 1A:708 [C] | L:5 [PHE] | 1:843 [C] | ❌ 4Y4O_1P_1A |
1P:63 [PRO] | 1A:240 [A] | L:53 [PHE] | 1:94 [A] | ❌ 4Y4O_1P_1A |
1P:63 [PRO] | 1A:239 [G] | L:53 [PHE] | 1:93 [G] | ❌ 4Y4O_1P_1A |
1P:64 [LYS] | 1A:239 [G] | L:54 [GLY] | 1:93 [G] | ❌ 4Y4O_1P_1A |
1P:65 [ARG] | 1A:238 [C] | L:55 [LYS] | 1:92 [C] | ❌ 4Y4O_1P_1A |
1P:68 [GLN] | 1A:656 [A] | L:58 [MET] | 1:747 [A] | ❌ 4Y4O_1P_1A |
1P:68 [GLN] | 1A:657 [A] | L:58 [MET] | 1:748 [A] | ❌ 4Y4O_1P_1A |
1P:70 [GLN] | 1A:233 [A] | L:60 [HIS] | 1:87 [A] | ❌ 4Y4O_1P_1A |
1P:72 [PRO] | 1A:235 [C] | L:61 [TYR] | 1:89 [C] | ❌ 4Y4O_1P_1A |
1P:72 [PRO] | 1A:234 [G] | L:61 [TYR] | 1:88 [G] | ❌ 4Y4O_1P_1A |
1P:73 [GLY] | 1A:438 [G] | L:62 [HIS] | 1:342 [G] | ❌ 4Y4O_1P_1A |
1P:75 [ILE] | 1A:216 [A] | L:64 [LYS] | 1:69 [A2M] | ❌ 4Y4O_1P_1A |
1P:77 [ARG] | 1A:216 [A] | L:67 [PRO] | 1:69 [A2M] | ❌ 4Y4O_1P_1A |
1P:80 [TYR] | 1A:660 [C] | L:70 [LYS] | 1:751 [G] | ❌ 4Y4O_1P_1A |
1P:82 [GLY] | 1A:652 [A] | L:72 [THR] | 1:743 [A] | ❌ 4Y4O_1P_1A |
1P:82 [GLY] | 1A:651 [U] | L:72 [THR] | 1:742 [U] | ❌ 4Y4O_1P_1A |
1P:18 [ARG] | 1A:611 [U] | L:8 [CYS] | 1:694 [U] | ❌ 4Y4O_1P_1A |
1P:18 [ARG] | 1A:610 [C] | L:8 [CYS] | 1:693 [G] | ❌ 4Y4O_1P_1A |
1P:18 [ARG] | 1A:710 [G] | L:8 [CYS] | 1:845 [OMU] | ❌ 4Y4O_1P_1A |
1P:90 [ARG] | 1A:651 [U] | L:80 [ARG] | 1:742 [U] | ❌ 4Y4O_1P_1A |
1P:19 [VAL] | 1A:1296 [G] | L:9 [ARG] | 1:1523 [G] | ❌ 4Y4O_1P_1A |
1P:19 [VAL] | 1A:1295 [U] | L:9 [ARG] | 1:1522 [U] | ❌ 4Y4O_1P_1A |
1P:19 [VAL] | 1A:859 [C] | L:9 [ARG] | 1:995 [C] | ❌ 4Y4O_1P_1A |
1P:77 [ARG] | 1A:658 [A] | L:67 [PRO] | 1:749 [A] | ❌ 6AZ3_1:749 no longer at interface |
1P:77 [ARG] | 1A:659 [C] | L:67 [PRO] | 1:750 [G] | ❌ 6AZ3_1:750 no longer at interface |
1P:53 [GLY] | 1A:875 [U] | L:38 [MET] | 1:1011 [U] | ❌ 6AZ3_L:38, 6AZ3_1:1011 no longer at interface |
1P:17 [LYS] | 1A:985 [G] | L:7 [LYS] | 1:1168 [A] | ❌ 6AZ3_1:1168 no longer at interface |
1P:54 [GLY] | 1A:875 [U] | L:39 [HIS] | 1:1011 [U] | ❌ 6AZ3_1:1011 no longer at interface |
1P:76 [LYS] | 1A:217 [A] | L:65 [LYS] | 1:70 [C] | ❌ 6AZ3_1:70 no longer at interface |
1P:79 [ARG] | 1A:658 [A] | L:69 [TRP] | 1:749 [A] | ❌ 6AZ3_L:69, 6AZ3_1:749 no longer at interface |
1P:48 [PRO] | 1A:712 [C] | L:33 [GLY] | 1:847 [OMU] | ❌ 6AZ3_1:847 no longer at interface |
1P:36 [LYS] | 1A:990 [A] | L:22 [VAL] | 1:1173 [G] | ❌ 6AZ3_1:1173 no longer at interface |
1P:65 [ARG] | 1A:655 [G] | L:55 [LYS] | 1:746 [G] | ❌ 6AZ3_1:746 no longer at interface |
1P:132 [LYS] | 1A:664 [U] | L:128 [LYS] | 1:815 [G] | ❌ 6AZ3_1:815 no longer at interface |
1P:21 [ARG] | 1A:609 [A] | L:12 [ARG] | 1:692 [A] | ❌ 6AZ3_1:692 no longer at interface |
1P:49 [ARG] | 1A:712 [C] | L:34 [ASN] | 1:847 [OMU] | ❌ 6AZ3_1:847 no longer at interface |
1P:98 [GLU] | 1A:218 [A] | L:102 [GLN] | 1:71 [C] | ❌ 4Y4O_1P:98, 4Y4O_1A:218 no longer at interface |
1P:149 [GLU] | 1A:218 [A] | L:145 [ALA] | 1:71 [C] | ❌ 4Y4O_1P:149, 4Y4O_1A:218 no longer at interface |
1P:35 [HIS] | 1A:1233 [U] | L:21 [ARG] | 1:1459 [U] | ❌ 4Y4O_1A:1233 no longer at interface |
1P:36 [LYS] | 1A:868 [A] | L:22 [VAL] | 1:1004 [G] | ❌ 4Y4O_1A:868 no longer at interface |
1P:36 [LYS] | 1A:989 [G] | L:22 [VAL] | 1:1172 [G] | ❌ 4Y4O_1A:989 no longer at interface |
1P:37 [GLY] | 1A:989 [G] | L:23 [GLY] | 1:1172 [G] | ❌ 4Y4O_1A:989 no longer at interface |
1P:40 [SER] | 1A:856 [G] | L:25 [HIS] | 1:992 [G] | ❌ 4Y4O_1A:856 no longer at interface |
1P:42 [SER] | 1A:851 [A] | L:27 [LYS] | 1:987 [A] | ❌ 4Y4O_1A:851 no longer at interface |
1P:42 [SER] | 1A:720 [C] | L:27 [LYS] | 1:855 [C] | ❌ 4Y4O_1A:720 no longer at interface |
1P:42 [SER] | 1A:721 [G] | L:27 [LYS] | 1:856 [OMG] | ❌ 4Y4O_1A:721 no longer at interface |
1P:43 [GLY] | 1A:851 [A] | L:28 [HIS] | 1:987 [A] | ❌ 4Y4O_1A:851 no longer at interface |
1P:43 [GLY] | 1A:715 [G] | L:28 [HIS] | 1:850 [G] | ❌ 4Y4O_1A:715 no longer at interface |
1P:47 [ASP] | 1A:851 [A] | L:32 [ARG] | 1:987 [A] | ❌ 4Y4O_1A:851 no longer at interface |
1P:47 [ASP] | 1A:715 [G] | L:32 [ARG] | 1:850 [G] | ❌ 4Y4O_1A:715 no longer at interface |
1P:47 [ASP] | 1A:182 [U] | L:32 [ARG] | 1:35 [U] | ❌ 4Y4O_1A:182 no longer at interface |
1P:47 [ASP] | 1A:850 [U] | L:32 [ARG] | 1:986 [U] | ❌ 4Y4O_1A:850 no longer at interface |
1P:72 [PRO] | 1A:415 [G] | L:61 [TYR] | 1:320 [G] | ❌ 4Y4O_1A:415 no longer at interface |
1P:73 [GLY] | 1A:215 [G] | L:62 [HIS] | 1:68 [A] | ❌ 4Y4O_1A:215 no longer at interface |
1P:73 [GLY] | 1A:245 [A] | L:62 [HIS] | 1:99 [A] | ❌ 4Y4O_1A:245 no longer at interface |
1P:74 [GLU] | 1A:232 [U] | L:63 [ARG] | 1:85 [U] | ❌ 4Y4O_1A:232 no longer at interface |
1P:74 [GLU] | 1A:244 [A] | L:63 [ARG] | 1:98 [A] | ❌ 4Y4O_1A:244 no longer at interface |
1P:74 [GLU] | 1A:230 [A] | L:63 [ARG] | 1:83 [A] | ❌ 4Y4O_1A:230 no longer at interface |
1P:74 [GLU] | 1A:245 [A] | L:63 [ARG] | 1:99 [A] | ❌ 4Y4O_1A:245 no longer at interface |
1P:75 [ILE] | 1A:215 [G] | L:64 [LYS] | 1:68 [A] | ❌ 4Y4O_1A:215 no longer at interface |
1P:76 [LYS] | 1A:229 [G] | L:65 [LYS] | 1:82 [C] | ❌ 4Y4O_1A:229 no longer at interface |
1P:76 [LYS] | 1A:230 [A] | L:65 [LYS] | 1:83 [A] | ❌ 4Y4O_1A:230 no longer at interface |
1P:87 [ASP] | 1A:701 [A] | L:77 [ASN] | 1:836 [G] | ❌ 4Y4O_1A:701 no longer at interface |
1P:81 [GLN] | 1A:651 [U] | L:71 [PRO] | 1:742 [U] | ❌ 6AZ3_L:71 no longer at interface |
1P:81 [GLN] | 1A:661 [G] | L:71 [PRO] | 1:752 [G] | ❌ 6AZ3_L:71 no longer at interface |
1P:53 [GLY] | 1A:185 [A] | L:38 [MET] | 1:38 [A] | ❌ 6AZ3_L:38 no longer at interface |
1P:53 [GLY] | 1A:873 [U] | L:38 [MET] | 1:1009 [C] | ❌ 6AZ3_L:38 no longer at interface |
1P:53 [GLY] | 1A:878 [G] | L:38 [MET] | 1:1014 [G] | ❌ 6AZ3_L:38 no longer at interface |
1P:53 [GLY] | 1A:879 [G] | L:38 [MET] | 1:1015 [G] | ❌ 6AZ3_L:38 no longer at interface |
1P:53 [GLY] | 1A:880 [U] | L:38 [MET] | 1:1016 [A] | ❌ 6AZ3_L:38 no longer at interface |
1P:86 [LYS] | 1A:651 [U] | L:76 [ASN] | 1:742 [U] | ❌ 6AZ3_L:76 no longer at interface |
1P:86 [LYS] | 1A:652 [A] | L:76 [ASN] | 1:743 [A] | ❌ 6AZ3_L:76 no longer at interface |
1P:60 [MET] | 1A:239 [G] | L:46 [ASP] | 1:93 [G] | ❌ 6AZ3_L:46 no longer at interface |
1P:60 [MET] | 1A:240 [A] | L:46 [ASP] | 1:94 [A] | ❌ 6AZ3_L:46 no longer at interface |
1P:57 [THR] | 1A:880 [U] | L:42 [ARG] | 1:1016 [A] | ❌ 4Y4O_1P:57 no longer at interface |
1P:57 [THR] | 1A:872 [C] | L:42 [ARG] | 1:1008 [C] | ❌ 4Y4O_1P:57 no longer at interface |
1P:59 [LEU] | 1A:240 [A] | L:45 [PHE] | 1:94 [A] | ❌ 4Y4O_1P:59 no longer at interface |
Properties of this pair
Common ECOD label(s) |
Common RFAM label(s) |
Interface TM-score |
Interface RMSD |
Percentage identity |
Protein TM-score |
RNA TM-score |
Protein coverage |
RNA coverage |
Percentage conservation |
Apolar conservation |
H-bond conservation |
Percentage switching out |
---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
Ribosomal proteins L15p and L18e | 0.71 | 3.9 | 0.19 | 0.63 | 0.7 | 0.78 | 0.69 | 0.43 | 0.40 | 0.19 | 0.28 |
Other pairs involving 4Y4O_1P_1A or 6AZ3_L_1
Total number of entries: 12