RNAprotDB

All interfaces > All interologs > Interface groups > group127 > 4Y4O_1P_1A vs 6S0Z_J_A

Interface analysis


mouse controls

Style

Protein

Cartoon
Licorice
Surface

RNA

Cartoon
Licorice
Surface

Color

Structure
Structure (with hetatm)
Chain
Chainbow

View

Focus on

Interface
RNA
Protein
All

Show chains

Interface

show interface as licorice

Common contacts -

4Y4O_1P
4Y4O_1A
6S0Z_J
6S0Z_A
Conserved?
1P:77 [ARG] 1A:2416 [C] J:70 [ASN] A:2431 [C] ✔
1P:77 [ARG] 1A:2417 [G] J:70 [ASN] A:2432 [G] ✔
1P:51 [PHE] 1A:185 [A] J:50 [PHE] A:199 [A] ✔
1P:51 [PHE] 1A:879 [G] J:50 [PHE] A:877 [G] ✔
1P:51 [PHE] 1A:880 [U] J:50 [PHE] A:878 [C] ✔
1P:43 [GLY] 1A:717 [A] J:43 [GLY] A:715 [A] ✔
1P:43 [GLY] 1A:718 [C] J:43 [GLY] A:716 [C] ✔
1P:41 [ARG] 1A:718 [C] J:41 [ARG] A:716 [C] ✔
1P:41 [ARG] 1A:852 [G] J:41 [ARG] A:850 [G] ✔
1P:41 [ARG] 1A:853 [C] J:41 [ARG] A:851 [C] ✔
1P:41 [ARG] 1A:854 [U] J:41 [ARG] A:852 [U] ✔
1P:41 [ARG] 1A:855 [G] J:41 [ARG] A:853 [G] ✔
1P:81 [GLN] 1A:661 [G] J:74 [TYR] A:681 [G] ✔
1P:53 [GLY] 1A:185 [A] J:52 [GLY] A:199 [A] ✔
1P:53 [GLY] 1A:873 [U] J:52 [GLY] A:871 [U] ✔
1P:53 [GLY] 1A:875 [U] J:52 [GLY] A:873 [U] ✔
1P:53 [GLY] 1A:878 [G] J:52 [GLY] A:876 [G] ✔
1P:53 [GLY] 1A:879 [G] J:52 [GLY] A:877 [G] ✔
1P:53 [GLY] 1A:880 [U] J:52 [GLY] A:878 [C] ✔
1P:133 [SER] 1A:662 [A] J:131 [SER] A:682 [A] ✔
1P:17 [LYS] 1A:611 [U] J:17 [ASN] A:631 [U] ✔
1P:17 [LYS] 1A:709 [G] J:17 [ASN] A:707 [G] ✔
1P:17 [LYS] 1A:710 [G] J:17 [ASN] A:708 [G] ✔
1P:3 [LEU] 1A:1247 [C] J:3 [LEU] A:1241 [A] ✔
1P:3 [LEU] 1A:1248 [G] J:3 [LEU] A:1242 [A] ✔
1P:3 [LEU] 1A:1289 [G] J:3 [LEU] A:1281 [U] ✔
1P:18 [ARG] 1A:859 [C] J:18 [ARG] A:857 [C] ✔
1P:18 [ARG] 1A:1295 [U] J:18 [ARG] A:1287 [U] ✔
1P:18 [ARG] 1A:1296 [G] J:18 [ARG] A:1288 [G] ✔
1P:9 [ASN] 1A:621 [G] J:9 [ALA] A:641 [A] ✔
1P:9 [ASN] 1A:622 [G] J:9 [ALA] A:642 [U] ✔
1P:34 [GLY] 1A:987 [G] J:34 [GLY] A:986 [G] ✔
1P:34 [GLY] 1A:988 [U] J:34 [GLY] A:987 [U] ✔
1P:34 [GLY] 1A:1234 [A] J:34 [GLY] A:1228 [A] ✔
1P:34 [GLY] 1A:1235 [G] J:34 [GLY] A:1229 [G] ✔
1P:56 [SER] 1A:2404 [A] J:55 [LEU] A:2419 [A] ✔
1P:56 [SER] 1A:2440 [G] J:55 [LEU] A:2455 [G] ✔
1P:56 [SER] 1A:2441 [G] J:55 [LEU] A:2456 [G] ✔
1P:29 [LYS] 1A:589 [U] J:29 [LYS] A:609 [U] ✔
1P:29 [LYS] 1A:590 [A] J:29 [LYS] A:610 [U] ✔
1P:29 [LYS] 1A:857 [U] J:29 [LYS] A:855 [U] ✔
1P:29 [LYS] 1A:858 [U] J:29 [LYS] A:856 [U] ✔
1P:103 [ALA] 1A:627 [G] J:100 [GLY] A:647 [G] ✔
1P:20 [GLY] 1A:857 [U] J:20 [GLY] A:855 [U] ✔
1P:20 [GLY] 1A:858 [U] J:20 [GLY] A:856 [U] ✔
1P:67 [MET] 1A:656 [A] J:66 [PHE] A:676 [A] ✔
1P:67 [MET] 1A:657 [A] J:66 [PHE] A:677 [A] ✔
1P:67 [MET] 1A:2415 [C] J:66 [PHE] A:2430 [C] ✔
1P:67 [MET] 1A:2416 [C] J:66 [PHE] A:2431 [C] ✔
1P:67 [MET] 1A:2426 [G] J:66 [PHE] A:2441 [G] ✔
1P:67 [MET] 1A:2427 [G] J:66 [PHE] A:2442 [G] ✔
1P:30 [THR] 1A:610 [C] J:30 [THR] A:630 [G] ✔
1P:30 [THR] 1A:857 [U] J:30 [THR] A:855 [U] ✔
1P:30 [THR] 1A:1234 [A] J:30 [THR] A:1228 [A] ✔
1P:30 [THR] 1A:1235 [G] J:30 [THR] A:1229 [G] ✔
1P:27 [HIS] 1A:1236 [G] J:27 [ASN] A:1230 [G] ✔
1P:54 [GLY] 1A:873 [U] J:53 [GLY] A:871 [U] ✔
1P:19 [VAL] 1A:610 [C] J:19 [VAL] A:630 [G] ✔
1P:44 [GLY] 1A:718 [C] J:44 [GLY] A:716 [C] ✔
1P:55 [ARG] 1A:872 [C] J:54 [GLN] A:870 [C] ✔
1P:55 [ARG] 1A:873 [U] J:54 [GLN] A:871 [U] ✔
1P:55 [ARG] 1A:2370 [G] J:54 [GLN] A:2385 [A] ✔
1P:55 [ARG] 1A:2440 [G] J:54 [GLN] A:2455 [G] ✔
1P:10 [PRO] 1A:621 [G] J:10 [GLU] A:641 [A] ✔
1P:13 [ASN] 1A:707 [G] J:13 [ARG] A:705 [U] ✔
1P:13 [ASN] 1A:708 [C] J:13 [ARG] A:706 [U] ✔
1P:13 [ASN] 1A:1291 [G] J:13 [ARG] A:1283 [G] ✔
1P:13 [ASN] 1A:1292 [A] J:13 [ARG] A:1284 [A] ✔
1P:64 [LYS] 1A:238 [C] J:63 [LYS] A:252 [C] ✔
1P:64 [LYS] 1A:2405 [A] J:63 [LYS] A:2420 [U] ✔
1P:64 [LYS] 1A:2406 [C] J:63 [LYS] A:2421 [C] ✔
1P:64 [LYS] 1A:2407 [C] J:63 [LYS] A:2422 [C] ✔
1P:64 [LYS] 1A:2428 [C] J:63 [LYS] A:2443 [C] ✔
1P:115 [LEU] 1A:662 [A] J:111 [ILE] A:682 [A] ✔
1P:63 [PRO] 1A:2405 [A] J:62 [PRO] A:2420 [U] ✔
1P:63 [PRO] 1A:2406 [C] J:62 [PRO] A:2421 [C] ✔
1P:35 [HIS] 1A:590 [A] J:35 [HIS] A:610 [U] ✔
1P:35 [HIS] 1A:591 [U] J:35 [HIS] A:611 [U] ✔
1P:35 [HIS] 1A:987 [G] J:35 [HIS] A:986 [G] ✔
1P:35 [HIS] 1A:988 [U] J:35 [HIS] A:987 [U] ✔
1P:35 [HIS] 1A:1234 [A] J:35 [HIS] A:1228 [A] ✔
1P:31 [ALA] 1A:610 [C] J:31 [SER] A:630 [G] ✔
1P:31 [ALA] 1A:857 [U] J:31 [SER] A:855 [U] ✔
1P:31 [ALA] 1A:1235 [G] J:31 [SER] A:1229 [G] ✔
1P:90 [ARG] 1A:627 [G] J:84 [LYS] A:647 [G] ✔
1P:46 [LYS] 1A:185 [A] J:46 [VAL] A:199 [A] ✔
1P:46 [LYS] 1A:713 [G] J:46 [VAL] A:711 [G] ✔
1P:46 [LYS] 1A:880 [U] J:46 [VAL] A:878 [C] ✔
1P:8 [PRO] 1A:1290 [G] J:8 [PRO] A:1282 [A] ✔
1P:8 [PRO] 1A:1291 [G] J:8 [PRO] A:1283 [G] ✔
1P:5 [ASP] 1A:1289 [G] J:5 [GLU] A:1281 [U] ✔
1P:61 [ARG] 1A:2372 [A] J:60 [ARG] A:2387 [A] ✔
1P:61 [ARG] 1A:2404 [A] J:60 [ARG] A:2419 [A] ✔
1P:61 [ARG] 1A:2405 [A] J:60 [ARG] A:2420 [U] ✔
1P:61 [ARG] 1A:2440 [G] J:60 [ARG] A:2455 [G] ✔
1P:61 [ARG] 1A:2441 [G] J:60 [ARG] A:2456 [G] ✔
1P:58 [THR] 1A:2371 [C] J:57 [LEU] A:2386 [C] ✔
1P:58 [THR] 1A:2372 [A] J:57 [LEU] A:2387 [A] ✔
1P:40 [SER] 1A:718 [C] J:40 [ALA] A:716 [C] ✔
1P:24 [GLY] 1A:860 [U] J:24 [ALA] A:858 [U] ✔
1P:24 [GLY] 1A:861 [C] J:24 [ALA] A:859 [C] ✔
1P:24 [GLY] 1A:862 [C] J:24 [ALA] A:860 [U] ✔
1P:16 [ARG] 1A:611 [U] J:16 [ARG] A:631 [U] ✔
1P:16 [ARG] 1A:612 [C] J:16 [ARG] A:632 [U] ✔
1P:16 [ARG] 1A:709 [G] J:16 [ARG] A:707 [G] ✔
1P:16 [ARG] 1A:710 [G] J:16 [ARG] A:708 [G] ✔
1P:79 [ARG] 1A:658 [A] J:72 [LYS] A:678 [A] ✔
1P:117 [GLU] 1A:652 [A] J:114 [ASN] A:672 [A] ✔
1P:117 [GLU] 1A:662 [A] J:114 [ASN] A:682 [A] ✔
1P:6 [LEU] 1A:1289 [G] J:6 [LEU] A:1281 [U] ✔
1P:6 [LEU] 1A:1290 [G] J:6 [LEU] A:1282 [A] ✔
1P:25 [SER] 1A:859 [C] J:25 [THR] A:857 [C] ✔
1P:25 [SER] 1A:860 [U] J:25 [THR] A:858 [U] ✔
1P:25 [SER] 1A:861 [C] J:25 [THR] A:859 [C] ✔
1P:25 [SER] 1A:1237 [G] J:25 [THR] A:1231 [A] ✔
1P:25 [SER] 1A:1238 [G] J:25 [THR] A:1232 [G] ✔
1P:4 [SER] 1A:1248 [G] J:4 [HIS] A:1242 [A] ✔
1P:4 [SER] 1A:1288 [A] J:4 [HIS] A:1280 [U] ✔
1P:4 [SER] 1A:1289 [G] J:4 [HIS] A:1281 [U] ✔
1P:23 [PRO] 1A:859 [C] J:23 [VAL] A:857 [C] ✔
1P:23 [PRO] 1A:860 [U] J:23 [VAL] A:858 [U] ✔
1P:38 [GLN] 1A:185 [A] J:38 [GLN] A:199 [A] ✔
1P:38 [GLN] 1A:852 [G] J:38 [GLN] A:850 [G] ✔
1P:38 [GLN] 1A:853 [C] J:38 [GLN] A:851 [C] ✔
1P:38 [GLN] 1A:878 [G] J:38 [GLN] A:876 [G] ✔
1P:38 [GLN] 1A:879 [G] J:38 [GLN] A:877 [G] ✔
1P:37 [GLY] 1A:852 [G] J:37 [GLY] A:850 [G] ✔
1P:37 [GLY] 1A:853 [C] J:37 [GLY] A:851 [C] ✔
1P:37 [GLY] 1A:878 [G] J:37 [GLY] A:876 [G] ✔
1P:37 [GLY] 1A:879 [G] J:37 [GLY] A:877 [G] ✔
1P:26 [GLY] 1A:1236 [G] J:26 [GLY] A:1230 [G] ✔
1P:131 [SER] 1A:661 [G] J:129 [SER] A:681 [G] ✔
1P:131 [SER] 1A:662 [A] J:129 [SER] A:682 [A] ✔
1P:60 [MET] 1A:239 [G] J:59 [ARG] A:253 [G] ✔
1P:60 [MET] 1A:2404 [A] J:59 [ARG] A:2419 [A] ✔
1P:60 [MET] 1A:2405 [A] J:59 [ARG] A:2420 [U] ✔
1P:116 [GLY] 1A:652 [A] J:112 [LEU] A:672 [A] ✔
1P:116 [GLY] 1A:661 [G] J:112 [LEU] A:681 [G] ✔
1P:116 [GLY] 1A:662 [A] J:112 [LEU] A:682 [A] ✔
1P:15 [ARG] 1A:709 [G] J:15 [GLU] A:707 [G] ✔
1P:62 [LEU] 1A:2372 [A] J:61 [LEU] A:2387 [A] ✔
1P:62 [LEU] 1A:2405 [A] J:61 [LEU] A:2420 [U] ✔
1P:62 [LEU] 1A:2406 [C] J:61 [LEU] A:2421 [C] ✔
1P:104 [GLY] 1A:651 [U] J:101 [VAL] A:671 [U] ✔
1P:12 [ALA] 1A:621 [G] J:12 [SER] A:641 [A] ✔
1P:12 [ALA] 1A:708 [C] J:12 [SER] A:706 [U] ✔
1P:36 [LYS] 1A:590 [A] J:36 [LYS] A:610 [U] ✔
1P:36 [LYS] 1A:591 [U] J:36 [LYS] A:611 [U] ✔
1P:36 [LYS] 1A:854 [U] J:36 [LYS] A:852 [U] ✔
1P:36 [LYS] 1A:855 [G] J:36 [LYS] A:853 [G] ✔
1P:36 [LYS] 1A:879 [G] J:36 [LYS] A:877 [G] ✔
1P:36 [LYS] 1A:2460 [A] J:36 [LYS] A:2475 [A] ✔
1P:130 [PHE] 1A:661 [G] J:128 [PHE] A:681 [G] ✔
1P:65 [ARG] 1A:656 [A] J:64 [ARG] A:676 [A] ✔
1P:65 [ARG] 1A:2427 [G] J:64 [ARG] A:2442 [G] ✔
1P:65 [ARG] 1A:2428 [C] J:64 [ARG] A:2443 [C] ✔
1P:65 [ARG] 1A:2429 [C] J:64 [ARG] A:2444 [C] ✔
1P:68 [GLN] 1A:234 [G] J:67 [THR] A:248 [G] ✔
1P:33 [ARG] 1A:610 [C] J:33 [ARG] A:630 [G] ✔
1P:33 [ARG] 1A:718 [C] J:33 [ARG] A:716 [C] ✔
1P:33 [ARG] 1A:987 [G] J:33 [ARG] A:986 [G] ✔
1P:33 [ARG] 1A:988 [U] J:33 [ARG] A:987 [U] ✔
1P:33 [ARG] 1A:1235 [G] J:33 [ARG] A:1229 [G] ✔
1P:11 [GLY] 1A:620 [U] J:11 [GLY] A:640 [G] ✔
1P:11 [GLY] 1A:621 [G] J:11 [GLY] A:641 [A] ✔
1P:66 [GLY] 1A:656 [A] J:65 [GLY] A:676 [A] ✔
1P:66 [GLY] 1A:2427 [G] J:65 [GLY] A:2442 [G] ✔
1P:66 [GLY] 1A:2428 [C] J:65 [GLY] A:2443 [C] ✔
1P:32 [THR] 1A:986 [A] J:32 [GLY] A:985 [A] ✔
1P:32 [THR] 1A:987 [G] J:32 [GLY] A:986 [G] ✔
1P:32 [THR] 1A:1235 [G] J:32 [GLY] A:1229 [G] ✔
1P:32 [THR] 1A:1236 [G] J:32 [GLY] A:1230 [G] ✔
1P:28 [GLY] 1A:858 [U] J:28 [GLY] A:856 [U] ✔
1P:132 [LYS] 1A:661 [G] J:130 [ALA] A:681 [G] ✔
1P:14 [LYS] 1A:708 [C] J:14 [LYS] A:706 [U] ✔
1P:14 [LYS] 1A:709 [G] J:14 [LYS] A:707 [G] ✔
1P:14 [LYS] 1A:1238 [G] J:14 [LYS] A:1232 [G] ✔
1P:14 [LYS] 1A:1239 [A] J:14 [LYS] A:1233 [A] ✔
1P:52 [GLU] 1A:872 [C] J:51 [GLU] A:870 [C] ✔
1P:52 [GLU] 1A:879 [G] J:51 [GLU] A:877 [G] ✔
1P:52 [GLU] 1A:880 [U] J:51 [GLU] A:878 [C] ✔
1P:39 [LYS] 1A:879 [G] J:39 [LYS] A:877 [G] ✔
1P:39 [LYS] 1A:987 [G] J:39 [LYS] A:986 [G] ✔
1P:21 [ARG] 1A:610 [C] J:21 [ARG] A:630 [G] ✔
1P:21 [ARG] 1A:857 [U] J:21 [ARG] A:855 [U] ✔
1P:21 [ARG] 1A:858 [U] J:21 [ARG] A:856 [U] ✔
1P:21 [ARG] 1A:859 [C] J:21 [ARG] A:857 [C] ✔
1P:21 [ARG] 1A:860 [U] J:21 [ARG] A:858 [U] ✔
1P:21 [ARG] 1A:1296 [G] J:21 [ARG] A:1288 [G] ✔
1P:42 [SER] 1A:717 [A] J:42 [SER] A:715 [A] ✔
1P:42 [SER] 1A:718 [C] J:42 [SER] A:716 [C] ✔
1P:42 [SER] 1A:719 [C] J:42 [SER] A:717 [C] ✔
1P:49 [ARG] 1A:713 [G] J:48 [PRO] A:711 [G] ✔
1P:7 [ARG] 1A:1289 [G] J:7 [LYS] A:1281 [U] ✔
1P:7 [ARG] 1A:1290 [G] J:7 [LYS] A:1282 [A] ✔
1P:22 [GLY] 1A:858 [U] J:22 [GLY] A:856 [U] ✔
1P:22 [GLY] 1A:859 [C] J:22 [GLY] A:857 [C] ✔
1P:22 [GLY] 1A:860 [U] J:22 [GLY] A:858 [U] ✔
1P:77 [ARG] 1A:657 [A] J:70 [ASN] A:677 [A] ❌ 6S0Z_J_A
1P:77 [ARG] 1A:658 [A] J:70 [ASN] A:678 [A] ❌ 6S0Z_J_A
1P:77 [ARG] 1A:659 [C] J:70 [ASN] A:679 [G] ❌ 6S0Z_J_A
1P:81 [GLN] 1A:651 [U] J:74 [TYR] A:671 [U] ❌ 6S0Z_J_A
1P:133 [SER] 1A:661 [G] J:131 [SER] A:681 [G] ❌ 6S0Z_J_A
1P:17 [LYS] 1A:1236 [G] J:17 [ASN] A:1230 [G] ❌ 6S0Z_J_A
1P:17 [LYS] 1A:1237 [G] J:17 [ASN] A:1231 [A] ❌ 6S0Z_J_A
1P:74 [GLU] 1A:233 [A] J:68 [ASN] A:247 [A] ❌ 6S0Z_J_A
1P:74 [GLU] 1A:234 [G] J:68 [ASN] A:248 [G] ❌ 6S0Z_J_A
1P:74 [GLU] 1A:2418 [U] J:68 [ASN] A:2433 [C] ❌ 6S0Z_J_A
1P:29 [LYS] 1A:610 [C] J:29 [LYS] A:630 [G] ❌ 6S0Z_J_A
1P:27 [HIS] 1A:858 [U] J:27 [ASN] A:856 [U] ❌ 6S0Z_J_A
1P:27 [HIS] 1A:1237 [G] J:27 [ASN] A:1231 [A] ❌ 6S0Z_J_A
1P:54 [GLY] 1A:185 [A] J:53 [GLY] A:199 [A] ❌ 6S0Z_J_A
1P:54 [GLY] 1A:875 [U] J:53 [GLY] A:873 [U] ❌ 6S0Z_J_A
1P:54 [GLY] 1A:878 [G] J:53 [GLY] A:876 [G] ❌ 6S0Z_J_A
1P:55 [ARG] 1A:879 [G] J:54 [GLN] A:877 [G] ❌ 6S0Z_J_A
1P:55 [ARG] 1A:880 [U] J:54 [GLN] A:878 [C] ❌ 6S0Z_J_A
1P:13 [ASN] 1A:709 [G] J:13 [ARG] A:707 [G] ❌ 6S0Z_J_A
1P:115 [LEU] 1A:652 [A] J:111 [ILE] A:672 [A] ❌ 6S0Z_J_A
1P:115 [LEU] 1A:661 [G] J:111 [ILE] A:681 [G] ❌ 6S0Z_J_A
1P:106 [LEU] 1A:651 [U] J:103 [LYS] A:671 [U] ❌ 6S0Z_J_A
1P:46 [LYS] 1A:184 [A] J:46 [VAL] A:198 [A] ❌ 6S0Z_J_A
1P:40 [SER] 1A:879 [G] J:40 [ALA] A:877 [G] ❌ 6S0Z_J_A
1P:47 [ASP] 1A:713 [G] J:47 [ARG] A:711 [G] ❌ 6S0Z_J_A
1P:37 [GLY] 1A:854 [U] J:37 [GLY] A:852 [U] ❌ 6S0Z_J_A
1P:26 [GLY] 1A:861 [C] J:26 [GLY] A:859 [C] ❌ 6S0Z_J_A
1P:60 [MET] 1A:240 [A] J:59 [ARG] A:254 [A] ❌ 6S0Z_J_A
1P:62 [LEU] 1A:2404 [A] J:61 [LEU] A:2419 [A] ❌ 6S0Z_J_A
1P:104 [GLY] 1A:627 [G] J:101 [VAL] A:647 [G] ❌ 6S0Z_J_A
1P:104 [GLY] 1A:650 [G] J:101 [VAL] A:670 [G] ❌ 6S0Z_J_A
1P:12 [ALA] 1A:707 [G] J:12 [SER] A:705 [U] ❌ 6S0Z_J_A
1P:36 [LYS] 1A:853 [C] J:36 [LYS] A:851 [C] ❌ 6S0Z_J_A
1P:65 [ARG] 1A:655 [G] J:64 [ARG] A:675 [G] ❌ 6S0Z_J_A
1P:33 [ARG] 1A:1234 [A] J:33 [ARG] A:1228 [A] ❌ 6S0Z_J_A
1P:75 [ILE] 1A:2416 [C] J:69 [ILE] A:2431 [C] ❌ 6S0Z_J_A
1P:75 [ILE] 1A:2417 [G] J:69 [ILE] A:2432 [G] ❌ 6S0Z_J_A
1P:75 [ILE] 1A:2418 [U] J:69 [ILE] A:2433 [C] ❌ 6S0Z_J_A
1P:11 [GLY] 1A:707 [G] J:11 [GLY] A:705 [U] ❌ 6S0Z_J_A
1P:28 [GLY] 1A:1235 [G] J:28 [GLY] A:1229 [G] ❌ 6S0Z_J_A
1P:132 [LYS] 1A:660 [C] J:130 [ALA] A:680 [C] ❌ 6S0Z_J_A
1P:52 [GLU] 1A:2370 [G] J:51 [GLU] A:2385 [A] ❌ 6S0Z_J_A
1P:39 [LYS] 1A:878 [G] J:39 [LYS] A:876 [G] ❌ 6S0Z_J_A
1P:39 [LYS] 1A:986 [A] J:39 [LYS] A:985 [A] ❌ 6S0Z_J_A
1P:42 [SER] 1A:852 [G] J:42 [SER] A:850 [G] ❌ 6S0Z_J_A
1P:107 [LYS] 1A:649 [C] J:104 [ASN] A:669 [C] ❌ 6S0Z_J_A
1P:107 [LYS] 1A:650 [G] J:104 [ASN] A:670 [G] ❌ 6S0Z_J_A
1P:107 [LYS] 1A:651 [U] J:104 [ASN] A:671 [U] ❌ 6S0Z_J_A
1P:22 [GLY] 1A:857 [U] J:22 [GLY] A:855 [U] ❌ 6S0Z_J_A
1P:106 [LEU] 1A:650 [G] J:103 [LYS] A:670 [G] ❌ 4Y4O_1P_1A
1P:106 [LEU] 1A:649 [C] J:103 [LYS] A:669 [C] ❌ 4Y4O_1P_1A
1P:106 [LEU] 1A:627 [G] J:103 [LYS] A:647 [G] ❌ 4Y4O_1P_1A
1P:12 [ALA] 1A:620 [U] J:12 [SER] A:640 [G] ❌ 4Y4O_1P_1A
1P:15 [ARG] 1A:1239 [A] J:15 [GLU] A:1233 [A] ❌ 4Y4O_1P_1A
1P:16 [ARG] 1A:1295 [U] J:16 [ARG] A:1287 [U] ❌ 4Y4O_1P_1A
1P:20 [GLY] 1A:610 [C] J:20 [GLY] A:630 [G] ❌ 4Y4O_1P_1A
1P:21 [ARG] 1A:1295 [U] J:21 [ARG] A:1287 [U] ❌ 4Y4O_1P_1A
1P:24 [GLY] 1A:1238 [G] J:24 [ALA] A:1232 [G] ❌ 4Y4O_1P_1A
1P:26 [GLY] 1A:1235 [G] J:26 [GLY] A:1229 [G] ❌ 4Y4O_1P_1A
1P:28 [GLY] 1A:857 [U] J:28 [GLY] A:855 [U] ❌ 4Y4O_1P_1A
1P:36 [LYS] 1A:988 [U] J:36 [LYS] A:987 [U] ❌ 4Y4O_1P_1A
1P:39 [LYS] 1A:880 [U] J:39 [LYS] A:878 [C] ❌ 4Y4O_1P_1A
1P:46 [LYS] 1A:879 [G] J:46 [VAL] A:877 [G] ❌ 4Y4O_1P_1A
1P:47 [ASP] 1A:241 [G] J:47 [ARG] A:255 [G] ❌ 4Y4O_1P_1A
1P:47 [ASP] 1A:184 [A] J:47 [ARG] A:198 [A] ❌ 4Y4O_1P_1A
1P:47 [ASP] 1A:240 [A] J:47 [ARG] A:254 [A] ❌ 4Y4O_1P_1A
1P:47 [ASP] 1A:185 [A] J:47 [ARG] A:199 [A] ❌ 4Y4O_1P_1A
1P:54 [GLY] 1A:2440 [G] J:53 [GLY] A:2455 [G] ❌ 4Y4O_1P_1A
1P:55 [ARG] 1A:2371 [C] J:54 [GLN] A:2386 [C] ❌ 4Y4O_1P_1A
1P:60 [MET] 1A:2406 [C] J:59 [ARG] A:2421 [C] ❌ 4Y4O_1P_1A
1P:60 [MET] 1A:238 [C] J:59 [ARG] A:252 [C] ❌ 4Y4O_1P_1A
1P:61 [ARG] 1A:2371 [C] J:60 [ARG] A:2386 [C] ❌ 4Y4O_1P_1A
1P:68 [GLN] 1A:233 [A] J:67 [THR] A:247 [A] ❌ 4Y4O_1P_1A
1P:74 [GLU] 1A:2416 [C] J:68 [ASN] A:2431 [C] ❌ 4Y4O_1P_1A
1P:74 [GLU] 1A:658 [A] J:68 [ASN] A:678 [A] ❌ 4Y4O_1P_1A
1P:74 [GLU] 1A:2417 [G] J:68 [ASN] A:2432 [G] ❌ 4Y4O_1P_1A
1P:74 [GLU] 1A:657 [A] J:68 [ASN] A:677 [A] ❌ 4Y4O_1P_1A
1P:75 [ILE] 1A:233 [A] J:69 [ILE] A:247 [A] ❌ 4Y4O_1P_1A
1P:77 [ARG] 1A:2418 [U] J:70 [ASN] A:2433 [C] ❌ 4Y4O_1P_1A
1P:79 [ARG] 1A:659 [C] J:72 [LYS] A:679 [G] ❌ 4Y4O_1P_1A
1P:17 [LYS] 1A:711 [C] J:17 [ASN] A:709 [U] ❌ 6S0Z_A:709 no longer at interface
1P:17 [LYS] 1A:985 [G] J:17 [ASN] A:984 [G] ❌ 6S0Z_A:984 no longer at interface
1P:55 [ARG] 1A:871 [A] J:54 [GLN] A:869 [G] ❌ 6S0Z_A:869 no longer at interface
1P:90 [ARG] 1A:626 [A] J:84 [LYS] A:646 [A] ❌ 6S0Z_A:646 no longer at interface
1P:46 [LYS] 1A:183 [G] J:46 [VAL] A:197 [G] ❌ 6S0Z_A:197 no longer at interface
1P:16 [ARG] 1A:1293 [A] J:16 [ARG] A:1285 [A] ❌ 6S0Z_A:1285 no longer at interface
1P:117 [GLU] 1A:677 [C] J:114 [ASN] A:697 [U] ❌ 6S0Z_A:697 no longer at interface
1P:47 [ASP] 1A:714 [U] J:47 [ARG] A:712 [U] ❌ 6S0Z_A:712 no longer at interface
1P:36 [LYS] 1A:990 [A] J:36 [LYS] A:989 [A] ❌ 6S0Z_A:989 no longer at interface
1P:108 [LYS] 1A:645 [G] J:105 [GLU] A:665 [G] ❌ 6S0Z_J:105, 6S0Z_A:665 no longer at interface
1P:108 [LYS] 1A:646 [A] J:105 [GLU] A:666 [A] ❌ 6S0Z_J:105, 6S0Z_A:666 no longer at interface
1P:108 [LYS] 1A:647 [G] J:105 [GLU] A:667 [G] ❌ 6S0Z_J:105, 6S0Z_A:667 no longer at interface
1P:132 [LYS] 1A:664 [U] J:130 [ALA] A:684 [U] ❌ 6S0Z_A:684 no longer at interface
1P:105 [LEU] 1A:626 [A] J:102 [VAL] A:646 [A] ❌ 6S0Z_J:102, 6S0Z_A:646 no longer at interface
1P:21 [ARG] 1A:609 [A] J:21 [ARG] A:629 [A] ❌ 6S0Z_A:629 no longer at interface
1P:49 [ARG] 1A:712 [C] J:48 [PRO] A:710 [C] ❌ 6S0Z_A:710 no longer at interface
1P:87 [ASP] 1A:626 [A] J:80 [ASP] A:646 [A] ❌ 6S0Z_J:80, 6S0Z_A:646 no longer at interface
1P:106 [LEU] 1A:628 [C] J:103 [LYS] A:648 [G] ❌ 4Y4O_1A:628 no longer at interface
1P:106 [LEU] 1A:629 [U] J:103 [LYS] A:649 [U] ❌ 4Y4O_1A:629 no longer at interface
1P:106 [LEU] 1A:648 [G] J:103 [LYS] A:668 [C] ❌ 4Y4O_1A:648 no longer at interface
1P:107 [LYS] 1A:648 [G] J:104 [ASN] A:668 [C] ❌ 4Y4O_1A:648 no longer at interface
1P:15 [ARG] 1A:1240 [G] J:15 [GLU] A:1234 [G] ❌ 4Y4O_1A:1240 no longer at interface
1P:18 [ARG] 1A:1242 [G] J:18 [ARG] A:1236 [G] ❌ 4Y4O_1A:1242 no longer at interface
1P:18 [ARG] 1A:1241 [C] J:18 [ARG] A:1235 [C] ❌ 4Y4O_1A:1241 no longer at interface
1P:4 [SER] 1A:1249 [A] J:4 [HIS] A:1243 [G] ❌ 4Y4O_1A:1249 no longer at interface
1P:40 [SER] 1A:856 [G] J:40 [ALA] A:854 [G] ❌ 4Y4O_1A:856 no longer at interface
1P:60 [MET] 1A:2443 [U] J:59 [ARG] A:2458 [U] ❌ 4Y4O_1A:2443 no longer at interface
1P:78 [PRO] 1A:654 [G] J:71 [ARG] A:674 [C] ❌ 4Y4O_1P:78, 4Y4O_1A:654 no longer at interface
1P:78 [PRO] 1A:653 [G] J:71 [ARG] A:673 [G] ❌ 4Y4O_1P:78, 4Y4O_1A:653 no longer at interface
1P:50 [ARG] 1A:240 [A] J:49 [GLY] A:254 [A] ❌ 6S0Z_J:49 no longer at interface
1P:50 [ARG] 1A:241 [G] J:49 [GLY] A:255 [G] ❌ 6S0Z_J:49 no longer at interface
1P:134 [ALA] 1A:662 [A] J:132 [ALA] A:682 [A] ❌ 6S0Z_J:132 no longer at interface
1P:82 [GLY] 1A:661 [G] J:75 [ALA] A:681 [G] ❌ 6S0Z_J:75 no longer at interface
1P:84 [ASN] 1A:652 [A] J:77 [VAL] A:672 [A] ❌ 6S0Z_J:77 no longer at interface
1P:84 [ASN] 1A:662 [A] J:77 [VAL] A:682 [A] ❌ 6S0Z_J:77 no longer at interface
1P:80 [TYR] 1A:661 [G] J:73 [GLU] A:681 [G] ❌ 6S0Z_J:73 no longer at interface
1P:86 [LYS] 1A:651 [U] J:79 [LEU] A:671 [U] ❌ 6S0Z_J:79 no longer at interface
1P:86 [LYS] 1A:652 [A] J:79 [LEU] A:672 [A] ❌ 6S0Z_J:79 no longer at interface
1P:45 [LEU] 1A:713 [G] J:45 [GLY] A:711 [G] ❌ 6S0Z_J:45 no longer at interface
1P:45 [LEU] 1A:879 [G] J:45 [GLY] A:877 [G] ❌ 6S0Z_J:45 no longer at interface
1P:45 [LEU] 1A:880 [U] J:45 [GLY] A:878 [C] ❌ 6S0Z_J:45 no longer at interface
1P:113 [LYS] 1A:660 [C] J:109 [ILE] A:680 [C] ❌ 6S0Z_J:109 no longer at interface
1P:113 [LYS] 1A:661 [G] J:109 [ILE] A:681 [G] ❌ 6S0Z_J:109 no longer at interface
1P:2 [LYS] 1A:1248 [G] J:2 [LYS] A:1242 [A] ❌ 6S0Z_J:2 no longer at interface
1P:2 [LYS] 1A:1288 [A] J:2 [LYS] A:1280 [U] ❌ 6S0Z_J:2 no longer at interface
1P:105 [LEU] 1A:650 [G] J:102 [VAL] A:670 [G] ❌ 6S0Z_J:102 no longer at interface
1P:105 [LEU] 1A:651 [U] J:102 [VAL] A:671 [U] ❌ 6S0Z_J:102 no longer at interface
1P:87 [ASP] 1A:651 [U] J:80 [ASP] A:671 [U] ❌ 6S0Z_J:80 no longer at interface
1P:87 [ASP] 1A:652 [A] J:80 [ASP] A:672 [A] ❌ 6S0Z_J:80 no longer at interface
1P:114 [ILE] 1A:660 [C] J:110 [LYS] A:680 [C] ❌ 4Y4O_1P:114 no longer at interface
1P:114 [ILE] 1A:661 [G] J:110 [LYS] A:681 [G] ❌ 4Y4O_1P:114 no longer at interface
1P:129 [ALA] 1A:660 [C] J:127 [LYS] A:680 [C] ❌ 4Y4O_1P:129 no longer at interface
1P:59 [LEU] 1A:239 [G] J:58 [PHE] A:253 [G] ❌ 4Y4O_1P:59 no longer at interface
1P:78 [PRO] 1A:655 [G] J:71 [ARG] A:675 [G] ❌ 4Y4O_1P:78 no longer at interface
1P:78 [PRO] 1A:660 [C] J:71 [ARG] A:680 [C] ❌ 4Y4O_1P:78 no longer at interface
1P:78 [PRO] 1A:658 [A] J:71 [ARG] A:678 [A] ❌ 4Y4O_1P:78 no longer at interface
1P:78 [PRO] 1A:659 [C] J:71 [ARG] A:679 [G] ❌ 4Y4O_1P:78 no longer at interface
1P:78 [PRO] 1A:657 [A] J:71 [ARG] A:677 [A] ❌ 4Y4O_1P:78 no longer at interface
1P:83 [VAL] 1A:652 [A] J:76 [ILE] A:672 [A] ❌ 4Y4O_1P:83 no longer at interface
1P:83 [VAL] 1A:661 [G] J:76 [ILE] A:681 [G] ❌ 4Y4O_1P:83 no longer at interface
1P:85 [LEU] 1A:652 [A] J:78 [ASN] A:672 [A] ❌ 4Y4O_1P:85 no longer at interface
1P:88 [LEU] 1A:651 [U] J:81 [GLN] A:671 [U] ❌ 4Y4O_1P:88 no longer at interface
1P:102 [ARG] 1A:627 [G] J:99 [SER] A:647 [G] ❌ 4Y4O_1P:102 no longer at interface

logo_download Export the table of contacts

Properties of this pair

Common ECOD label(s)
 Common RFAM label(s)
 Interface TM-score
 Interface RMSD
 Percentage identity
 Protein TM-score
 RNA TM-score
 Protein coverage
 RNA coverage
 Percentage conservation
 Apolar conservation
 H-bond conservation
 Percentage switching out
Ribosomal proteins L15p and L18e Bacterial large subunit ribosomal RNA 0.96 2.46 0.46 0.85 0.97 0.9 0.89 0.72 0.65 0.41 0.44


Other pairs involving 4Y4O_1P_1A or 6S0Z_J_A

Total number of entries: 16

Interface 1 Interface 2 Percentage conservation
 		Interface TM-score
 		Interface RMSD
 		Percentage identity
 		Common ECOD label(s)
 		Common RFAM label(s)
 		Explore both interfaces
6AZ3_L_1 6S0Z_J_A 0.36 0.72 4.24 0.11 Ribosomal proteins L15p and L18e compare
1YHQ_L_0 4Y4O_1P_1A 0.38 0.93 4.07 0.15 Ribosomal proteins L15p and L18e compare
1YHQ_L_0 6S0Z_J_A 0.41 0.93 4.03 0.15 Ribosomal proteins L15p and L18e compare
1VQ8_L_0 4Y4O_1P_1A 0.38 0.93 4.18 0.15 Ribosomal proteins L15p and L18e compare
1VQ8_L_0 6S0Z_J_A 0.41 0.93 4.07 0.15 Ribosomal proteins L15p and L18e compare
4Y4O_1P_1A 6AZ3_L_1 0.43 0.71 3.9 0.19 Ribosomal proteins L15p and L18e compare
4Y4O_1P_1A 7OF0_M_A 0.69 0.89 2.15 0.33 Ribosomal proteins L15p and L18e Bacterial large subunit ribosomal RNA compare
4Y4O_1P_1A 7RYG_K_A 0.71 0.96 2.76 0.39 Ribosomal proteins L15p and L18e Bacterial large subunit ribosomal RNA compare
4Y4O_1P_1A 7K00_k_a 0.76 0.96 2.47 0.5 Ribosomal proteins L15p and L18e Bacterial large subunit ribosomal RNA compare
4Y4O_1P_1A 6AZ3_L_2 0.29 0.83 5.19 0.0 Ribosomal proteins L15p and L18e compare
4Y4O_1P_1A 6S0Z_J_A 0.72 0.96 2.46 0.46 Ribosomal proteins L15p and L18e Bacterial large subunit ribosomal RNA compare
6S0Z_J_A 7RYG_K_A 0.78 0.97 1.41 0.47 Ribosomal proteins L15p and L18e Bacterial large subunit ribosomal RNA compare
6S0Z_J_A 7O7Y_Ba_B5 0.38 0.88 4.38 0.11 Ribosomal proteins L15p and L18e compare
6S0Z_J_A 7OF0_M_A 0.78 0.88 2.04 0.38 Ribosomal proteins L15p and L18e Bacterial large subunit ribosomal RNA compare
6S0Z_J_A 7K00_k_a 0.81 0.97 1.67 0.52 Ribosomal proteins L15p and L18e Bacterial large subunit ribosomal RNA compare
6AZ3_L_2 6S0Z_J_A 0.29 0.81 5.35 0.13 Ribosomal proteins L15p and L18e compare