RNAprotDB

All interfaces > All interologs > Interface groups > group127 > 4Y4O_1P_1A vs 7K00_k_a

Interface analysis


mouse controls

Style

Protein

Cartoon
Licorice
Surface

RNA

Cartoon
Licorice
Surface

Color

Structure
Structure (with hetatm)
Chain
Chainbow

View

Focus on

Interface
RNA
Protein
All

Show chains

Interface

show interface as licorice

Common contacts -

4Y4O_1P
4Y4O_1A
7K00_k
7K00_a
Conserved?
1P:77 [ARG] 1A:658 [A] k:71 [ALA] a:633 [A] ✔
1P:51 [PHE] 1A:185 [A] k:50 [PHE] a:196 [A] ✔
1P:51 [PHE] 1A:879 [G] k:50 [PHE] a:832 [U] ✔
1P:51 [PHE] 1A:880 [U] k:50 [PHE] a:833 [A] ✔
1P:43 [GLY] 1A:717 [A] k:43 [GLY] a:670 [A] ✔
1P:43 [GLY] 1A:718 [C] k:43 [GLY] a:671 [C] ✔
1P:41 [ARG] 1A:718 [C] k:41 [ARG] a:671 [C] ✔
1P:41 [ARG] 1A:852 [G] k:41 [ARG] a:805 [G] ✔
1P:41 [ARG] 1A:853 [C] k:41 [ARG] a:806 [C] ✔
1P:41 [ARG] 1A:854 [U] k:41 [ARG] a:807 [U] ✔
1P:41 [ARG] 1A:855 [G] k:41 [ARG] a:808 [G] ✔
1P:81 [GLN] 1A:661 [G] k:75 [ALA] a:636 [G] ✔
1P:53 [GLY] 1A:185 [A] k:52 [GLY] a:196 [A] ✔
1P:53 [GLY] 1A:873 [U] k:52 [GLY] a:826 [U] ✔
1P:53 [GLY] 1A:875 [U] k:52 [GLY] a:828 [U] ✔
1P:53 [GLY] 1A:878 [G] k:52 [GLY] a:831 [G] ✔
1P:53 [GLY] 1A:879 [G] k:52 [GLY] a:832 [U] ✔
1P:53 [GLY] 1A:880 [U] k:52 [GLY] a:833 [A] ✔
1P:133 [SER] 1A:662 [A] k:130 [GLY] a:637 [A] ✔
1P:17 [LYS] 1A:611 [U] k:17 [LYS] a:588 [U] ✔
1P:17 [LYS] 1A:709 [G] k:17 [LYS] a:662 [G] ✔
1P:17 [LYS] 1A:710 [G] k:17 [LYS] a:663 [G] ✔
1P:17 [LYS] 1A:711 [C] k:17 [LYS] a:664 [G] ✔
1P:17 [LYS] 1A:985 [G] k:17 [LYS] a:940 [G] ✔
1P:17 [LYS] 1A:1236 [G] k:17 [LYS] a:1191 [G] ✔
1P:17 [LYS] 1A:1237 [G] k:17 [LYS] a:1192 [G] ✔
1P:3 [LEU] 1A:1247 [C] k:3 [LEU] a:1202 [G] ✔
1P:3 [LEU] 1A:1248 [G] k:3 [LEU] a:1203 [U] ✔
1P:3 [LEU] 1A:1289 [G] k:3 [LEU] a:1243 [C] ✔
1P:18 [ARG] 1A:859 [C] k:18 [ARG] a:812 [C] ✔
1P:18 [ARG] 1A:1295 [U] k:18 [ARG] a:1249 [U] ✔
1P:18 [ARG] 1A:1296 [G] k:18 [ARG] a:1250 [G] ✔
1P:134 [ALA] 1A:662 [A] k:131 [ALA] a:637 [A] ✔
1P:9 [ASN] 1A:621 [G] k:9 [ALA] a:598 [U] ✔
1P:9 [ASN] 1A:622 [G] k:9 [ALA] a:599 [A] ✔
1P:34 [GLY] 1A:987 [G] k:34 [GLY] a:942 [G] ✔
1P:34 [GLY] 1A:988 [U] k:34 [GLY] a:943 [A] ✔
1P:34 [GLY] 1A:1234 [A] k:34 [GLY] a:1189 [A] ✔
1P:34 [GLY] 1A:1235 [G] k:34 [GLY] a:1190 [G] ✔
1P:56 [SER] 1A:2404 [A] k:55 [MET] a:2392 [A] ✔
1P:56 [SER] 1A:2440 [G] k:55 [MET] a:2428 [G] ✔
1P:56 [SER] 1A:2441 [G] k:55 [MET] a:2429 [G] ✔
1P:29 [LYS] 1A:589 [U] k:29 [LYS] a:566 [U] ✔
1P:29 [LYS] 1A:590 [A] k:29 [LYS] a:567 [U] ✔
1P:29 [LYS] 1A:610 [C] k:29 [LYS] a:587 [C] ✔
1P:29 [LYS] 1A:857 [U] k:29 [LYS] a:810 [U] ✔
1P:29 [LYS] 1A:858 [U] k:29 [LYS] a:811 [U] ✔
1P:82 [GLY] 1A:661 [G] k:76 [GLU] a:636 [G] ✔
1P:20 [GLY] 1A:857 [U] k:20 [GLY] a:810 [U] ✔
1P:20 [GLY] 1A:858 [U] k:20 [GLY] a:811 [U] ✔
1P:67 [MET] 1A:656 [A] k:66 [PHE] a:631 [A] ✔
1P:67 [MET] 1A:657 [A] k:66 [PHE] a:632 [A] ✔
1P:67 [MET] 1A:2415 [C] k:66 [PHE] a:2403 [C] ✔
1P:67 [MET] 1A:2416 [C] k:66 [PHE] a:2404 [U] ✔
1P:67 [MET] 1A:2426 [G] k:66 [PHE] a:2414 [G] ✔
1P:67 [MET] 1A:2427 [G] k:66 [PHE] a:2415 [G] ✔
1P:84 [ASN] 1A:652 [A] k:78 [ARG] a:627 [A] ✔
1P:30 [THR] 1A:610 [C] k:30 [THR] a:587 [C] ✔
1P:30 [THR] 1A:857 [U] k:30 [THR] a:810 [U] ✔
1P:30 [THR] 1A:1234 [A] k:30 [THR] a:1189 [A] ✔
1P:30 [THR] 1A:1235 [G] k:30 [THR] a:1190 [G] ✔
1P:27 [HIS] 1A:1236 [G] k:27 [LEU] a:1191 [G] ✔
1P:54 [GLY] 1A:873 [U] k:53 [GLY] a:826 [U] ✔
1P:54 [GLY] 1A:878 [G] k:53 [GLY] a:831 [G] ✔
1P:19 [VAL] 1A:610 [C] k:19 [LEU] a:587 [C] ✔
1P:44 [GLY] 1A:718 [C] k:44 [GLY] a:671 [C] ✔
1P:55 [ARG] 1A:872 [C] k:54 [GLN] a:825 [A] ✔
1P:55 [ARG] 1A:873 [U] k:54 [GLN] a:826 [U] ✔
1P:55 [ARG] 1A:2370 [G] k:54 [GLN] a:2358 [A] ✔
1P:55 [ARG] 1A:2440 [G] k:54 [GLN] a:2428 [G] ✔
1P:10 [PRO] 1A:621 [G] k:10 [GLU] a:598 [U] ✔
1P:13 [ASN] 1A:707 [G] k:13 [LYS] a:660 [C] ✔
1P:13 [ASN] 1A:708 [C] k:13 [LYS] a:661 [A] ✔
1P:13 [ASN] 1A:1291 [G] k:13 [LYS] a:1245 [G] ✔
1P:13 [ASN] 1A:1292 [A] k:13 [LYS] a:1246 [A] ✔
1P:64 [LYS] 1A:238 [C] k:63 [LYS] a:249 [C] ✔
1P:64 [LYS] 1A:2405 [A] k:63 [LYS] a:2393 [U] ✔
1P:64 [LYS] 1A:2406 [C] k:63 [LYS] a:2394 [C] ✔
1P:64 [LYS] 1A:2407 [C] k:63 [LYS] a:2395 [C] ✔
1P:64 [LYS] 1A:2428 [C] k:63 [LYS] a:2416 [C] ✔
1P:115 [LEU] 1A:652 [A] k:111 [ILE] a:627 [A] ✔
1P:115 [LEU] 1A:661 [G] k:111 [ILE] a:636 [G] ✔
1P:115 [LEU] 1A:662 [A] k:111 [ILE] a:637 [A] ✔
1P:63 [PRO] 1A:2405 [A] k:62 [PRO] a:2393 [U] ✔
1P:63 [PRO] 1A:2406 [C] k:62 [PRO] a:2394 [C] ✔
1P:35 [HIS] 1A:590 [A] k:35 [HIS] a:567 [U] ✔
1P:35 [HIS] 1A:591 [U] k:35 [HIS] a:568 [U] ✔
1P:35 [HIS] 1A:987 [G] k:35 [HIS] a:942 [G] ✔
1P:35 [HIS] 1A:988 [U] k:35 [HIS] a:943 [A] ✔
1P:35 [HIS] 1A:1234 [A] k:35 [HIS] a:1189 [A] ✔
1P:31 [ALA] 1A:610 [C] k:31 [GLY] a:587 [C] ✔
1P:31 [ALA] 1A:1235 [G] k:31 [GLY] a:1190 [G] ✔
1P:90 [ARG] 1A:627 [G] k:84 [LYS] a:604 [G] ✔
1P:46 [LYS] 1A:185 [A] k:46 [VAL] a:196 [A] ✔
1P:46 [LYS] 1A:713 [G] k:46 [VAL] a:666 [A] ✔
1P:46 [LYS] 1A:880 [U] k:46 [VAL] a:833 [A] ✔
1P:8 [PRO] 1A:1290 [G] k:8 [PRO] a:1244 [A] ✔
1P:8 [PRO] 1A:1291 [G] k:8 [PRO] a:1245 [G] ✔
1P:5 [ASP] 1A:1289 [G] k:5 [THR] a:1243 [C] ✔
1P:61 [ARG] 1A:2372 [A] k:60 [ARG] a:2360 [G] ✔
1P:61 [ARG] 1A:2404 [A] k:60 [ARG] a:2392 [A] ✔
1P:61 [ARG] 1A:2405 [A] k:60 [ARG] a:2393 [U] ✔
1P:61 [ARG] 1A:2440 [G] k:60 [ARG] a:2428 [G] ✔
1P:61 [ARG] 1A:2441 [G] k:60 [ARG] a:2429 [G] ✔
1P:58 [THR] 1A:2371 [C] k:57 [LEU] a:2359 [C] ✔
1P:58 [THR] 1A:2372 [A] k:57 [LEU] a:2360 [G] ✔
1P:40 [SER] 1A:718 [C] k:40 [SER] a:671 [C] ✔
1P:24 [GLY] 1A:860 [U] k:24 [GLY] a:813 [U] ✔
1P:24 [GLY] 1A:861 [C] k:24 [GLY] a:814 [C] ✔
1P:113 [LYS] 1A:660 [C] k:109 [LYS] a:635 [C] ✔
1P:113 [LYS] 1A:661 [G] k:109 [LYS] a:636 [G] ✔
1P:16 [ARG] 1A:709 [G] k:16 [GLY] a:662 [G] ✔
1P:16 [ARG] 1A:710 [G] k:16 [GLY] a:663 [G] ✔
1P:117 [GLU] 1A:652 [A] k:113 [ALA] a:627 [A] ✔
1P:6 [LEU] 1A:1289 [G] k:6 [LEU] a:1243 [C] ✔
1P:6 [LEU] 1A:1290 [G] k:6 [LEU] a:1244 [A] ✔
1P:25 [SER] 1A:859 [C] k:25 [SER] a:812 [C] ✔
1P:25 [SER] 1A:860 [U] k:25 [SER] a:813 [U] ✔
1P:25 [SER] 1A:861 [C] k:25 [SER] a:814 [C] ✔
1P:25 [SER] 1A:1238 [G] k:25 [SER] a:1193 [G] ✔
1P:4 [SER] 1A:1248 [G] k:4 [ASN] a:1203 [U] ✔
1P:4 [SER] 1A:1288 [A] k:4 [ASN] a:1242 [U] ✔
1P:4 [SER] 1A:1289 [G] k:4 [ASN] a:1243 [C] ✔
1P:23 [PRO] 1A:860 [U] k:23 [ILE] a:813 [U] ✔
1P:38 [GLN] 1A:185 [A] k:38 [GLN] a:196 [A] ✔
1P:38 [GLN] 1A:852 [G] k:38 [GLN] a:805 [G] ✔
1P:38 [GLN] 1A:853 [C] k:38 [GLN] a:806 [C] ✔
1P:38 [GLN] 1A:878 [G] k:38 [GLN] a:831 [G] ✔
1P:38 [GLN] 1A:879 [G] k:38 [GLN] a:832 [U] ✔
1P:37 [GLY] 1A:852 [G] k:37 [GLY] a:805 [G] ✔
1P:37 [GLY] 1A:853 [C] k:37 [GLY] a:806 [C] ✔
1P:37 [GLY] 1A:854 [U] k:37 [GLY] a:807 [U] ✔
1P:37 [GLY] 1A:878 [G] k:37 [GLY] a:831 [G] ✔
1P:37 [GLY] 1A:879 [G] k:37 [GLY] a:832 [U] ✔
1P:26 [GLY] 1A:1236 [G] k:26 [GLY] a:1191 [G] ✔
1P:131 [SER] 1A:661 [G] k:128 [THR] a:636 [G] ✔
1P:131 [SER] 1A:662 [A] k:128 [THR] a:637 [A] ✔
1P:60 [MET] 1A:239 [G] k:59 [ARG] a:250 [G] ✔
1P:60 [MET] 1A:2404 [A] k:59 [ARG] a:2392 [A] ✔
1P:60 [MET] 1A:2405 [A] k:59 [ARG] a:2393 [U] ✔
1P:116 [GLY] 1A:652 [A] k:112 [LEU] a:627 [A] ✔
1P:116 [GLY] 1A:662 [A] k:112 [LEU] a:637 [A] ✔
1P:15 [ARG] 1A:709 [G] k:15 [ALA] a:662 [G] ✔
1P:62 [LEU] 1A:2372 [A] k:61 [LEU] a:2360 [G] ✔
1P:62 [LEU] 1A:2404 [A] k:61 [LEU] a:2392 [A] ✔
1P:62 [LEU] 1A:2405 [A] k:61 [LEU] a:2393 [U] ✔
1P:62 [LEU] 1A:2406 [C] k:61 [LEU] a:2394 [C] ✔
1P:12 [ALA] 1A:621 [G] k:12 [SER] a:598 [U] ✔
1P:12 [ALA] 1A:707 [G] k:12 [SER] a:660 [C] ✔
1P:12 [ALA] 1A:708 [C] k:12 [SER] a:661 [A] ✔
1P:36 [LYS] 1A:590 [A] k:36 [LYS] a:567 [U] ✔
1P:36 [LYS] 1A:591 [U] k:36 [LYS] a:568 [U] ✔
1P:36 [LYS] 1A:853 [C] k:36 [LYS] a:806 [C] ✔
1P:36 [LYS] 1A:854 [U] k:36 [LYS] a:807 [U] ✔
1P:36 [LYS] 1A:855 [G] k:36 [LYS] a:808 [G] ✔
1P:36 [LYS] 1A:990 [A] k:36 [LYS] a:945 [A] ✔
1P:36 [LYS] 1A:2460 [A] k:36 [LYS] a:2448 [A] ✔
1P:130 [PHE] 1A:661 [G] k:127 [VAL] a:636 [G] ✔
1P:65 [ARG] 1A:656 [A] k:64 [PHE] a:631 [A] ✔
1P:65 [ARG] 1A:2427 [G] k:64 [PHE] a:2415 [G] ✔
1P:65 [ARG] 1A:2428 [C] k:64 [PHE] a:2416 [C] ✔
1P:68 [GLN] 1A:234 [G] k:67 [THR] a:245 [G] ✔
1P:33 [ARG] 1A:610 [C] k:33 [ARG] a:587 [C] ✔
1P:33 [ARG] 1A:718 [C] k:33 [ARG] a:671 [C] ✔
1P:33 [ARG] 1A:987 [G] k:33 [ARG] a:942 [G] ✔
1P:33 [ARG] 1A:988 [U] k:33 [ARG] a:943 [A] ✔
1P:33 [ARG] 1A:1234 [A] k:33 [ARG] a:1189 [A] ✔
1P:33 [ARG] 1A:1235 [G] k:33 [ARG] a:1190 [G] ✔
1P:75 [ILE] 1A:2418 [U] k:69 [ARG] a:2406 [A] ✔
1P:11 [GLY] 1A:620 [U] k:11 [GLY] a:597 [G] ✔
1P:11 [GLY] 1A:621 [G] k:11 [GLY] a:598 [U] ✔
1P:66 [GLY] 1A:656 [A] k:65 [GLY] a:631 [A] ✔
1P:66 [GLY] 1A:2427 [G] k:65 [GLY] a:2415 [G] ✔
1P:66 [GLY] 1A:2428 [C] k:65 [GLY] a:2416 [C] ✔
1P:32 [THR] 1A:986 [A] k:32 [GLY] a:941 [A] ✔
1P:32 [THR] 1A:987 [G] k:32 [GLY] a:942 [G] ✔
1P:32 [THR] 1A:1235 [G] k:32 [GLY] a:1190 [G] ✔
1P:32 [THR] 1A:1236 [G] k:32 [GLY] a:1191 [G] ✔
1P:28 [GLY] 1A:858 [U] k:28 [GLY] a:811 [U] ✔
1P:108 [LYS] 1A:647 [G] k:103 [ILE] a:622 [G] ✔
1P:132 [LYS] 1A:660 [C] k:129 [LYS] a:635 [C] ✔
1P:132 [LYS] 1A:661 [G] k:129 [LYS] a:636 [G] ✔
1P:14 [LYS] 1A:708 [C] k:14 [LYS] a:661 [A] ✔
1P:14 [LYS] 1A:709 [G] k:14 [LYS] a:662 [G] ✔
1P:14 [LYS] 1A:1238 [G] k:14 [LYS] a:1193 [G] ✔
1P:14 [LYS] 1A:1239 [A] k:14 [LYS] a:1194 [A] ✔
1P:52 [GLU] 1A:872 [C] k:51 [GLU] a:825 [A] ✔
1P:52 [GLU] 1A:879 [G] k:51 [GLU] a:832 [U] ✔
1P:52 [GLU] 1A:880 [U] k:51 [GLU] a:833 [A] ✔
1P:39 [LYS] 1A:878 [G] k:39 [LYS] a:831 [G] ✔
1P:39 [LYS] 1A:879 [G] k:39 [LYS] a:832 [U] ✔
1P:39 [LYS] 1A:987 [G] k:39 [LYS] a:942 [G] ✔
1P:21 [ARG] 1A:609 [A] k:21 [ARG] a:586 [A] ✔
1P:21 [ARG] 1A:610 [C] k:21 [ARG] a:587 [C] ✔
1P:21 [ARG] 1A:857 [U] k:21 [ARG] a:810 [U] ✔
1P:21 [ARG] 1A:858 [U] k:21 [ARG] a:811 [U] ✔
1P:21 [ARG] 1A:859 [C] k:21 [ARG] a:812 [C] ✔
1P:21 [ARG] 1A:860 [U] k:21 [ARG] a:813 [U] ✔
1P:21 [ARG] 1A:1296 [G] k:21 [ARG] a:1250 [G] ✔
1P:42 [SER] 1A:717 [A] k:42 [SER] a:670 [A] ✔
1P:42 [SER] 1A:718 [C] k:42 [SER] a:671 [C] ✔
1P:42 [SER] 1A:719 [C] k:42 [SER] a:672 [C] ✔
1P:49 [ARG] 1A:712 [C] k:48 [ARG] a:665 [U] ✔
1P:49 [ARG] 1A:713 [G] k:48 [ARG] a:666 [A] ✔
1P:7 [ARG] 1A:1289 [G] k:7 [SER] a:1243 [C] ✔
1P:7 [ARG] 1A:1290 [G] k:7 [SER] a:1244 [A] ✔
1P:87 [ASP] 1A:651 [U] k:81 [ASP] a:626 [A] ✔
1P:22 [GLY] 1A:857 [U] k:22 [GLY] a:810 [U] ✔
1P:22 [GLY] 1A:858 [U] k:22 [GLY] a:811 [U] ✔
1P:22 [GLY] 1A:859 [C] k:22 [GLY] a:812 [C] ✔
1P:22 [GLY] 1A:860 [U] k:22 [GLY] a:813 [U] ✔
1P:77 [ARG] 1A:657 [A] k:71 [ALA] a:632 [A] ❌ 7K00_k_a
1P:77 [ARG] 1A:659 [C] k:71 [ALA] a:634 [C] ❌ 7K00_k_a
1P:77 [ARG] 1A:2416 [C] k:71 [ALA] a:2404 [U] ❌ 7K00_k_a
1P:77 [ARG] 1A:2417 [G] k:71 [ALA] a:2405 [G] ❌ 7K00_k_a
1P:81 [GLN] 1A:651 [U] k:75 [ALA] a:626 [A] ❌ 7K00_k_a
1P:133 [SER] 1A:661 [G] k:130 [GLY] a:636 [G] ❌ 7K00_k_a
1P:74 [GLU] 1A:233 [A] k:68 [SER] a:244 [A] ❌ 7K00_k_a
1P:74 [GLU] 1A:234 [G] k:68 [SER] a:245 [G] ❌ 7K00_k_a
1P:74 [GLU] 1A:2418 [U] k:68 [SER] a:2406 [A] ❌ 7K00_k_a
1P:84 [ASN] 1A:662 [A] k:78 [ARG] a:637 [A] ❌ 7K00_k_a
1P:27 [HIS] 1A:858 [U] k:27 [LEU] a:811 [U] ❌ 7K00_k_a
1P:27 [HIS] 1A:1237 [G] k:27 [LEU] a:1192 [G] ❌ 7K00_k_a
1P:54 [GLY] 1A:185 [A] k:53 [GLY] a:196 [A] ❌ 7K00_k_a
1P:54 [GLY] 1A:875 [U] k:53 [GLY] a:828 [U] ❌ 7K00_k_a
1P:80 [TYR] 1A:661 [G] k:74 [THR] a:636 [G] ❌ 7K00_k_a
1P:55 [ARG] 1A:879 [G] k:54 [GLN] a:832 [U] ❌ 7K00_k_a
1P:55 [ARG] 1A:880 [U] k:54 [GLN] a:833 [A] ❌ 7K00_k_a
1P:13 [ASN] 1A:709 [G] k:13 [LYS] a:662 [G] ❌ 7K00_k_a
1P:31 [ALA] 1A:857 [U] k:31 [GLY] a:810 [U] ❌ 7K00_k_a
1P:76 [LYS] 1A:216 [A] k:70 [LYS] a:227 [A] ❌ 7K00_k_a
1P:46 [LYS] 1A:184 [A] k:46 [VAL] a:195 [A] ❌ 7K00_k_a
1P:40 [SER] 1A:879 [G] k:40 [SER] a:832 [U] ❌ 7K00_k_a
1P:16 [ARG] 1A:611 [U] k:16 [GLY] a:588 [U] ❌ 7K00_k_a
1P:117 [GLU] 1A:662 [A] k:113 [ALA] a:637 [A] ❌ 7K00_k_a
1P:47 [ASP] 1A:713 [G] k:47 [ARG] a:666 [A] ❌ 7K00_k_a
1P:25 [SER] 1A:1237 [G] k:25 [SER] a:1192 [G] ❌ 7K00_k_a
1P:23 [PRO] 1A:859 [C] k:23 [ILE] a:812 [C] ❌ 7K00_k_a
1P:26 [GLY] 1A:861 [C] k:26 [GLY] a:814 [C] ❌ 7K00_k_a
1P:60 [MET] 1A:240 [A] k:59 [ARG] a:251 [A] ❌ 7K00_k_a
1P:116 [GLY] 1A:661 [G] k:112 [LEU] a:636 [G] ❌ 7K00_k_a
1P:104 [GLY] 1A:627 [G] k:99 [ASN] a:604 [G] ❌ 7K00_k_a
1P:104 [GLY] 1A:651 [U] k:99 [ASN] a:626 [A] ❌ 7K00_k_a
1P:36 [LYS] 1A:879 [G] k:36 [LYS] a:832 [U] ❌ 7K00_k_a
1P:75 [ILE] 1A:2416 [C] k:69 [ARG] a:2404 [U] ❌ 7K00_k_a
1P:75 [ILE] 1A:2417 [G] k:69 [ARG] a:2405 [G] ❌ 7K00_k_a
1P:11 [GLY] 1A:707 [G] k:11 [GLY] a:660 [C] ❌ 7K00_k_a
1P:28 [GLY] 1A:1235 [G] k:28 [GLY] a:1190 [G] ❌ 7K00_k_a
1P:108 [LYS] 1A:645 [G] k:103 [ILE] a:620 [G] ❌ 7K00_k_a
1P:108 [LYS] 1A:646 [A] k:103 [ILE] a:621 [A] ❌ 7K00_k_a
1P:52 [GLU] 1A:2370 [G] k:51 [GLU] a:2358 [A] ❌ 7K00_k_a
1P:39 [LYS] 1A:986 [A] k:39 [LYS] a:941 [A] ❌ 7K00_k_a
1P:42 [SER] 1A:852 [G] k:42 [SER] a:805 [G] ❌ 7K00_k_a
1P:87 [ASP] 1A:652 [A] k:81 [ASP] a:627 [A] ❌ 7K00_k_a
1P:10 [PRO] 1A:620 [U] k:10 [GLU] a:597 [G] ❌ 4Y4O_1P_1A
1P:113 [LYS] 1A:659 [C] k:109 [LYS] a:634 [C] ❌ 4Y4O_1P_1A
1P:12 [ALA] 1A:620 [U] k:12 [SER] a:597 [G] ❌ 4Y4O_1P_1A
1P:132 [LYS] 1A:662 [A] k:129 [LYS] a:637 [A] ❌ 4Y4O_1P_1A
1P:15 [ARG] 1A:708 [C] k:15 [ALA] a:661 [A] ❌ 4Y4O_1P_1A
1P:21 [ARG] 1A:1295 [U] k:21 [ARG] a:1249 [U] ❌ 4Y4O_1P_1A
1P:32 [THR] 1A:1234 [A] k:32 [GLY] a:1189 [A] ❌ 4Y4O_1P_1A
1P:33 [ARG] 1A:717 [A] k:33 [ARG] a:670 [A] ❌ 4Y4O_1P_1A
1P:39 [LYS] 1A:880 [U] k:39 [LYS] a:833 [A] ❌ 4Y4O_1P_1A
1P:4 [SER] 1A:1247 [C] k:4 [ASN] a:1202 [G] ❌ 4Y4O_1P_1A
1P:46 [LYS] 1A:879 [G] k:46 [VAL] a:832 [U] ❌ 4Y4O_1P_1A
1P:47 [ASP] 1A:241 [G] k:47 [ARG] a:252 [G] ❌ 4Y4O_1P_1A
1P:47 [ASP] 1A:240 [A] k:47 [ARG] a:251 [A] ❌ 4Y4O_1P_1A
1P:47 [ASP] 1A:239 [G] k:47 [ARG] a:250 [G] ❌ 4Y4O_1P_1A
1P:47 [ASP] 1A:185 [A] k:47 [ARG] a:196 [A] ❌ 4Y4O_1P_1A
1P:47 [ASP] 1A:184 [A] k:47 [ARG] a:195 [A] ❌ 4Y4O_1P_1A
1P:51 [PHE] 1A:878 [G] k:50 [PHE] a:831 [G] ❌ 4Y4O_1P_1A
1P:53 [GLY] 1A:872 [C] k:52 [GLY] a:825 [A] ❌ 4Y4O_1P_1A
1P:54 [GLY] 1A:2440 [G] k:53 [GLY] a:2428 [G] ❌ 4Y4O_1P_1A
1P:55 [ARG] 1A:2371 [C] k:54 [GLN] a:2359 [C] ❌ 4Y4O_1P_1A
1P:61 [ARG] 1A:2370 [G] k:60 [ARG] a:2358 [A] ❌ 4Y4O_1P_1A
1P:61 [ARG] 1A:2371 [C] k:60 [ARG] a:2359 [C] ❌ 4Y4O_1P_1A
1P:68 [GLN] 1A:233 [A] k:67 [THR] a:244 [A] ❌ 4Y4O_1P_1A
1P:74 [GLU] 1A:657 [A] k:68 [SER] a:632 [A] ❌ 4Y4O_1P_1A
1P:74 [GLU] 1A:658 [A] k:68 [SER] a:633 [A] ❌ 4Y4O_1P_1A
1P:76 [LYS] 1A:2417 [G] k:70 [LYS] a:2405 [G] ❌ 4Y4O_1P_1A
1P:76 [LYS] 1A:658 [A] k:70 [LYS] a:633 [A] ❌ 4Y4O_1P_1A
1P:76 [LYS] 1A:659 [C] k:70 [LYS] a:634 [C] ❌ 4Y4O_1P_1A
1P:80 [TYR] 1A:659 [C] k:74 [THR] a:634 [C] ❌ 4Y4O_1P_1A
1P:82 [GLY] 1A:652 [A] k:76 [GLU] a:627 [A] ❌ 4Y4O_1P_1A
1P:84 [ASN] 1A:651 [U] k:78 [ARG] a:626 [A] ❌ 4Y4O_1P_1A
1P:90 [ARG] 1A:651 [U] k:84 [LYS] a:626 [A] ❌ 4Y4O_1P_1A
1P:104 [GLY] 1A:645 [G] k:99 [ASN] a:620 [G] ❌ 4Y4O_1P_1A
1P:104 [GLY] 1A:646 [A] k:99 [ASN] a:621 [A] ❌ 4Y4O_1P_1A
1P:104 [GLY] 1A:647 [G] k:99 [ASN] a:622 [G] ❌ 4Y4O_1P_1A
1P:55 [ARG] 1A:871 [A] k:54 [GLN] a:824 [U] ❌ 7K00_a:824 no longer at interface
1P:90 [ARG] 1A:626 [A] k:84 [LYS] a:603 [A] ❌ 7K00_a:603 no longer at interface
1P:76 [LYS] 1A:217 [A] k:70 [LYS] a:228 [C] ❌ 7K00_a:228 no longer at interface
1P:46 [LYS] 1A:183 [G] k:46 [VAL] a:194 [G] ❌ 7K00_a:194 no longer at interface
1P:24 [GLY] 1A:862 [C] k:24 [GLY] a:815 [C] ❌ 7K00_a:815 no longer at interface
1P:16 [ARG] 1A:612 [C] k:16 [GLY] a:589 [U] ❌ 7K00_a:589 no longer at interface
1P:16 [ARG] 1A:1293 [A] k:16 [GLY] a:1247 [A] ❌ 7K00_a:1247 no longer at interface
1P:117 [GLU] 1A:677 [C] k:113 [ALA] a:652 [U] ❌ 7K00_a:652 no longer at interface
1P:47 [ASP] 1A:714 [U] k:47 [ARG] a:667 [U] ❌ 7K00_a:667 no longer at interface
1P:104 [GLY] 1A:650 [G] k:99 [ASN] a:625 [G] ❌ 7K00_a:625 no longer at interface
1P:65 [ARG] 1A:655 [G] k:64 [PHE] a:630 [G] ❌ 7K00_a:630 no longer at interface
1P:65 [ARG] 1A:2429 [C] k:64 [PHE] a:2417 [C] ❌ 7K00_a:2417 no longer at interface
1P:132 [LYS] 1A:664 [U] k:129 [LYS] a:639 [U] ❌ 7K00_a:639 no longer at interface
1P:105 [LEU] 1A:626 [A] k:100 [ILE] a:603 [A] ❌ 7K00_k:100, 7K00_a:603 no longer at interface
1P:105 [LEU] 1A:650 [G] k:100 [ILE] a:625 [G] ❌ 7K00_k:100, 7K00_a:625 no longer at interface
1P:107 [LYS] 1A:649 [C] k:102 [GLY] a:624 [C] ❌ 7K00_k:102, 7K00_a:624 no longer at interface
1P:107 [LYS] 1A:650 [G] k:102 [GLY] a:625 [G] ❌ 7K00_k:102, 7K00_a:625 no longer at interface
1P:87 [ASP] 1A:626 [A] k:81 [ASP] a:603 [A] ❌ 7K00_a:603 no longer at interface
1P:108 [LYS] 1A:247 [G] k:103 [ILE] a:258 [G] ❌ 4Y4O_1A:247 no longer at interface
1P:108 [LYS] 1A:248 [G] k:103 [ILE] a:259 [G] ❌ 4Y4O_1A:248 no longer at interface
1P:109 [GLY] 1A:247 [G] k:104 [GLN] a:258 [G] ❌ 4Y4O_1P:109, 4Y4O_1A:247 no longer at interface
1P:109 [GLY] 1A:246 [A] k:104 [GLN] a:257 [C] ❌ 4Y4O_1P:109, 4Y4O_1A:246 no longer at interface
1P:4 [SER] 1A:1287 [A] k:4 [ASN] a:1241 [A] ❌ 4Y4O_1A:1287 no longer at interface
1P:60 [MET] 1A:2443 [U] k:59 [ARG] a:2431 [U] ❌ 4Y4O_1A:2443 no longer at interface
1P:62 [LEU] 1A:2373 [A] k:61 [LEU] a:2361 [G] ❌ 4Y4O_1A:2373 no longer at interface
1P:82 [GLY] 1A:653 [G] k:76 [GLU] a:628 [G] ❌ 4Y4O_1A:653 no longer at interface
1P:50 [ARG] 1A:240 [A] k:49 [GLY] a:251 [A] ❌ 7K00_k:49 no longer at interface
1P:50 [ARG] 1A:241 [G] k:49 [GLY] a:252 [G] ❌ 7K00_k:49 no longer at interface
1P:103 [ALA] 1A:627 [G] k:98 [ALA] a:604 [G] ❌ 7K00_k:98 no longer at interface
1P:86 [LYS] 1A:651 [U] k:80 [SER] a:626 [A] ❌ 7K00_k:80 no longer at interface
1P:86 [LYS] 1A:652 [A] k:80 [SER] a:627 [A] ❌ 7K00_k:80 no longer at interface
1P:106 [LEU] 1A:651 [U] k:101 [ILE] a:626 [A] ❌ 7K00_k:101 no longer at interface
1P:45 [LEU] 1A:713 [G] k:45 [GLY] a:666 [A] ❌ 7K00_k:45 no longer at interface
1P:45 [LEU] 1A:879 [G] k:45 [GLY] a:832 [U] ❌ 7K00_k:45 no longer at interface
1P:45 [LEU] 1A:880 [U] k:45 [GLY] a:833 [A] ❌ 7K00_k:45 no longer at interface
1P:79 [ARG] 1A:658 [A] k:73 [ILE] a:633 [A] ❌ 7K00_k:73 no longer at interface
1P:2 [LYS] 1A:1248 [G] k:2 [ARG] a:1203 [U] ❌ 7K00_k:2 no longer at interface
1P:2 [LYS] 1A:1288 [A] k:2 [ARG] a:1242 [U] ❌ 7K00_k:2 no longer at interface
1P:105 [LEU] 1A:651 [U] k:100 [ILE] a:626 [A] ❌ 7K00_k:100 no longer at interface
1P:107 [LYS] 1A:651 [U] k:102 [GLY] a:626 [A] ❌ 7K00_k:102 no longer at interface
1P:109 [GLY] 1A:216 [A] k:104 [GLN] a:227 [A] ❌ 4Y4O_1P:109 no longer at interface
1P:129 [ALA] 1A:660 [C] k:126 [ARG] a:635 [C] ❌ 4Y4O_1P:129 no longer at interface
1P:129 [ALA] 1A:659 [C] k:126 [ARG] a:634 [C] ❌ 4Y4O_1P:129 no longer at interface
1P:59 [LEU] 1A:239 [G] k:58 [TYR] a:250 [G] ❌ 4Y4O_1P:59 no longer at interface
1P:59 [LEU] 1A:240 [A] k:58 [TYR] a:251 [A] ❌ 4Y4O_1P:59 no longer at interface

logo_download Export the table of contacts

Properties of this pair

Common ECOD label(s)
 Common RFAM label(s)
 Interface TM-score
 Interface RMSD
 Percentage identity
 Protein TM-score
 RNA TM-score
 Protein coverage
 RNA coverage
 Percentage conservation
 Apolar conservation
 H-bond conservation
 Percentage switching out
Ribosomal proteins L15p and L18e Bacterial large subunit ribosomal RNA 0.96 2.47 0.50 0.77 0.96 0.95 0.93 0.76 0.75 0.45 0.37


Other pairs involving 4Y4O_1P_1A or 7K00_k_a

Total number of entries: 9

Interface 1 Interface 2 Percentage conservation
 		Interface TM-score
 		Interface RMSD
 		Percentage identity
 		Common ECOD label(s)
 		Common RFAM label(s)
 		Explore both interfaces
1YHQ_L_0 4Y4O_1P_1A 0.38 0.93 4.07 0.15 Ribosomal proteins L15p and L18e compare
1VQ8_L_0 4Y4O_1P_1A 0.38 0.93 4.18 0.15 Ribosomal proteins L15p and L18e compare
4Y4O_1P_1A 6AZ3_L_1 0.43 0.71 3.9 0.19 Ribosomal proteins L15p and L18e compare
4Y4O_1P_1A 7OF0_M_A 0.69 0.89 2.15 0.33 Ribosomal proteins L15p and L18e Bacterial large subunit ribosomal RNA compare
4Y4O_1P_1A 7RYG_K_A 0.71 0.96 2.76 0.39 Ribosomal proteins L15p and L18e Bacterial large subunit ribosomal RNA compare
4Y4O_1P_1A 7K00_k_a 0.76 0.96 2.47 0.5 Ribosomal proteins L15p and L18e Bacterial large subunit ribosomal RNA compare
4Y4O_1P_1A 6AZ3_L_2 0.29 0.83 5.19 0.0 Ribosomal proteins L15p and L18e compare
4Y4O_1P_1A 6S0Z_J_A 0.72 0.96 2.46 0.46 Ribosomal proteins L15p and L18e Bacterial large subunit ribosomal RNA compare
6S0Z_J_A 7K00_k_a 0.81 0.97 1.67 0.52 Ribosomal proteins L15p and L18e Bacterial large subunit ribosomal RNA compare