RNAprotDB

All interfaces > All interologs > Interface groups > group127 > 4Y4O_1P_1A vs 7OF0_M_A

Interface analysis


mouse controls

Style

Protein

Cartoon
Licorice
Surface

RNA

Cartoon
Licorice
Surface

Color

Structure
Structure (with hetatm)
Chain
Chainbow

View

Focus on

Interface
RNA
Protein
All

Show chains

Interface

show interface as licorice

Common contacts -

4Y4O_1P
4Y4O_1A
7OF0_M
7OF0_A
Conserved?
1P:51 [PHE] 1A:185 [A] M:67 [PHE] A:1724 [A] ✔
1P:51 [PHE] 1A:879 [G] M:67 [PHE] A:2041 [U] ✔
1P:51 [PHE] 1A:880 [U] M:67 [PHE] A:2042 [U] ✔
1P:41 [ARG] 1A:718 [C] M:59 [ARG] A:1903 [C] ✔
1P:41 [ARG] 1A:852 [G] M:59 [ARG] A:2015 [G] ✔
1P:41 [ARG] 1A:853 [C] M:59 [ARG] A:2016 [C] ✔
1P:41 [ARG] 1A:854 [U] M:59 [ARG] A:2017 [U] ✔
1P:41 [ARG] 1A:855 [G] M:59 [ARG] A:2018 [G] ✔
1P:53 [GLY] 1A:185 [A] M:69 [GLY] A:1724 [A] ✔
1P:53 [GLY] 1A:873 [U] M:69 [GLY] A:2035 [U] ✔
1P:53 [GLY] 1A:875 [U] M:69 [GLY] A:2037 [U] ✔
1P:53 [GLY] 1A:878 [G] M:69 [GLY] A:2040 [G] ✔
1P:53 [GLY] 1A:879 [G] M:69 [GLY] A:2041 [U] ✔
1P:53 [GLY] 1A:880 [U] M:69 [GLY] A:2042 [U] ✔
1P:17 [LYS] 1A:709 [G] M:38 [ARG] A:1900 [A] ✔
1P:17 [LYS] 1A:710 [G] M:38 [ARG] A:1901 [C] ✔
1P:3 [LEU] 1A:1247 [C] M:24 [LEU] A:2278 [A] ✔
1P:3 [LEU] 1A:1248 [G] M:24 [LEU] A:2279 [U] ✔
1P:3 [LEU] 1A:1289 [G] M:24 [LEU] A:2287 [U] ✔
1P:18 [ARG] 1A:1295 [U] M:39 [ARG] A:2293 [A] ✔
1P:18 [ARG] 1A:1296 [G] M:39 [ARG] A:2294 [A] ✔
1P:9 [ASN] 1A:621 [G] M:30 [ASN] A:1877 [U] ✔
1P:9 [ASN] 1A:622 [G] M:30 [ASN] A:1878 [U] ✔
1P:34 [GLY] 1A:987 [G] M:52 [GLY] A:2094 [G] ✔
1P:34 [GLY] 1A:988 [U] M:52 [GLY] A:2095 [U] ✔
1P:34 [GLY] 1A:1234 [A] M:52 [GLY] A:2265 [A] ✔
1P:34 [GLY] 1A:1235 [G] M:52 [GLY] A:2266 [U] ✔
1P:56 [SER] 1A:2404 [A] M:72 [THR] A:2897 [A] ✔
1P:56 [SER] 1A:2440 [G] M:72 [THR] A:2916 [G] ✔
1P:56 [SER] 1A:2441 [G] M:72 [THR] A:2917 [G] ✔
1P:29 [LYS] 1A:589 [U] M:47 [ARG] A:1847 [U] ✔
1P:29 [LYS] 1A:857 [U] M:47 [ARG] A:2020 [U] ✔
1P:29 [LYS] 1A:858 [U] M:47 [ARG] A:2021 [U] ✔
1P:103 [ALA] 1A:627 [G] M:125 [ARG] A:1883 [G] ✔
1P:30 [THR] 1A:610 [C] M:48 [LYS] A:1868 [G] ✔
1P:30 [THR] 1A:857 [U] M:48 [LYS] A:2020 [U] ✔
1P:30 [THR] 1A:1234 [A] M:48 [LYS] A:2265 [A] ✔
1P:30 [THR] 1A:1235 [G] M:48 [LYS] A:2266 [U] ✔
1P:27 [HIS] 1A:1237 [G] M:45 [ARG] A:2268 [G] ✔
1P:54 [GLY] 1A:185 [A] M:70 [GLY] A:1724 [A] ✔
1P:54 [GLY] 1A:873 [U] M:70 [GLY] A:2035 [U] ✔
1P:54 [GLY] 1A:878 [G] M:70 [GLY] A:2040 [G] ✔
1P:19 [VAL] 1A:610 [C] M:40 [PRO] A:1868 [G] ✔
1P:55 [ARG] 1A:872 [C] M:71 [GLN] A:2034 [A] ✔
1P:55 [ARG] 1A:873 [U] M:71 [GLN] A:2035 [U] ✔
1P:55 [ARG] 1A:2370 [G] M:71 [GLN] A:2866 [A] ✔
1P:55 [ARG] 1A:2440 [G] M:71 [GLN] A:2916 [G] ✔
1P:10 [PRO] 1A:621 [G] M:31 [PRO] A:1877 [U] ✔
1P:13 [ASN] 1A:707 [G] M:34 [LYS] A:1898 [A] ✔
1P:13 [ASN] 1A:708 [C] M:34 [LYS] A:1899 [G] ✔
1P:13 [ASN] 1A:1291 [G] M:34 [LYS] A:2289 [G] ✔
1P:64 [LYS] 1A:238 [C] M:80 [LYS] A:1749 [C] ✔
1P:64 [LYS] 1A:2405 [A] M:80 [LYS] A:2898 [U] ✔
1P:64 [LYS] 1A:2406 [C] M:80 [LYS] A:2899 [C] ✔
1P:64 [LYS] 1A:2407 [C] M:80 [LYS] A:2900 [C] ✔
1P:63 [PRO] 1A:2405 [A] M:79 [PRO] A:2898 [U] ✔
1P:63 [PRO] 1A:2406 [C] M:79 [PRO] A:2899 [C] ✔
1P:35 [HIS] 1A:590 [A] M:53 [HIS] A:1848 [U] ✔
1P:35 [HIS] 1A:987 [G] M:53 [HIS] A:2094 [G] ✔
1P:35 [HIS] 1A:988 [U] M:53 [HIS] A:2095 [U] ✔
1P:35 [HIS] 1A:1234 [A] M:53 [HIS] A:2265 [A] ✔
1P:31 [ALA] 1A:610 [C] M:49 [CYS] A:1868 [G] ✔
1P:31 [ALA] 1A:857 [U] M:49 [CYS] A:2020 [U] ✔
1P:31 [ALA] 1A:1235 [G] M:49 [CYS] A:2266 [U] ✔
1P:45 [LEU] 1A:879 [G] M:62 [ARG] A:2041 [U] ✔
1P:45 [LEU] 1A:880 [U] M:62 [ARG] A:2042 [U] ✔
1P:90 [ARG] 1A:627 [G] M:104 [LEU] A:1883 [G] ✔
1P:46 [LYS] 1A:185 [A] M:63 [PRO] A:1724 [A] ✔
1P:8 [PRO] 1A:1290 [G] M:29 [PRO] A:2288 [A] ✔
1P:8 [PRO] 1A:1291 [G] M:29 [PRO] A:2289 [G] ✔
1P:5 [ASP] 1A:1289 [G] M:26 [ASN] A:2287 [U] ✔
1P:61 [ARG] 1A:2372 [A] M:77 [ARG] A:2868 [C] ✔
1P:61 [ARG] 1A:2404 [A] M:77 [ARG] A:2897 [A] ✔
1P:61 [ARG] 1A:2405 [A] M:77 [ARG] A:2898 [U] ✔
1P:61 [ARG] 1A:2440 [G] M:77 [ARG] A:2916 [G] ✔
1P:61 [ARG] 1A:2441 [G] M:77 [ARG] A:2917 [G] ✔
1P:58 [THR] 1A:2371 [C] M:74 [PHE] A:2867 [C] ✔
1P:58 [THR] 1A:2372 [A] M:74 [PHE] A:2868 [C] ✔
1P:40 [SER] 1A:718 [C] M:58 [GLN] A:1903 [C] ✔
1P:16 [ARG] 1A:611 [U] M:37 [GLU] A:1869 [A] ✔
1P:16 [ARG] 1A:709 [G] M:37 [GLU] A:1900 [A] ✔
1P:16 [ARG] 1A:710 [G] M:37 [GLU] A:1901 [C] ✔
1P:2 [LYS] 1A:1248 [G] M:23 [SER] A:2279 [U] ✔
1P:6 [LEU] 1A:1289 [G] M:27 [LEU] A:2287 [U] ✔
1P:6 [LEU] 1A:1290 [G] M:27 [LEU] A:2288 [A] ✔
1P:4 [SER] 1A:1248 [G] M:25 [ALA] A:2279 [U] ✔
1P:4 [SER] 1A:1288 [A] M:25 [ALA] A:2286 [A] ✔
1P:4 [SER] 1A:1289 [G] M:25 [ALA] A:2287 [U] ✔
1P:23 [PRO] 1A:860 [U] M:43 [ARG] A:2023 [U] ✔
1P:38 [GLN] 1A:185 [A] M:56 [GLU] A:1724 [A] ✔
1P:38 [GLN] 1A:852 [G] M:56 [GLU] A:2015 [G] ✔
1P:38 [GLN] 1A:853 [C] M:56 [GLU] A:2016 [C] ✔
1P:38 [GLN] 1A:878 [G] M:56 [GLU] A:2040 [G] ✔
1P:38 [GLN] 1A:879 [G] M:56 [GLU] A:2041 [U] ✔
1P:37 [GLY] 1A:852 [G] M:55 [GLY] A:2015 [G] ✔
1P:37 [GLY] 1A:853 [C] M:55 [GLY] A:2016 [C] ✔
1P:37 [GLY] 1A:878 [G] M:55 [GLY] A:2040 [G] ✔
1P:37 [GLY] 1A:879 [G] M:55 [GLY] A:2041 [U] ✔
1P:26 [GLY] 1A:861 [C] M:44 [ARG] A:2024 [C] ✔
1P:26 [GLY] 1A:1236 [G] M:44 [ARG] A:2267 [U] ✔
1P:60 [MET] 1A:239 [G] M:76 [ILE] A:1750 [G] ✔
1P:60 [MET] 1A:240 [A] M:76 [ILE] A:1751 [A] ✔
1P:60 [MET] 1A:2405 [A] M:76 [ILE] A:2898 [U] ✔
1P:15 [ARG] 1A:709 [G] M:36 [PRO] A:1900 [A] ✔
1P:62 [LEU] 1A:2372 [A] M:78 [ILE] A:2868 [C] ✔
1P:62 [LEU] 1A:2404 [A] M:78 [ILE] A:2897 [A] ✔
1P:62 [LEU] 1A:2405 [A] M:78 [ILE] A:2898 [U] ✔
1P:62 [LEU] 1A:2406 [C] M:78 [ILE] A:2899 [C] ✔
1P:12 [ALA] 1A:621 [G] M:33 [SER] A:1877 [U] ✔
1P:12 [ALA] 1A:707 [G] M:33 [SER] A:1898 [A] ✔
1P:12 [ALA] 1A:708 [C] M:33 [SER] A:1899 [G] ✔
1P:36 [LYS] 1A:590 [A] M:54 [LYS] A:1848 [U] ✔
1P:36 [LYS] 1A:591 [U] M:54 [LYS] A:1849 [C] ✔
1P:36 [LYS] 1A:853 [C] M:54 [LYS] A:2016 [C] ✔
1P:36 [LYS] 1A:854 [U] M:54 [LYS] A:2017 [U] ✔
1P:36 [LYS] 1A:855 [G] M:54 [LYS] A:2018 [G] ✔
1P:33 [ARG] 1A:610 [C] M:51 [ARG] A:1868 [G] ✔
1P:33 [ARG] 1A:718 [C] M:51 [ARG] A:1903 [C] ✔
1P:33 [ARG] 1A:987 [G] M:51 [ARG] A:2094 [G] ✔
1P:33 [ARG] 1A:1234 [A] M:51 [ARG] A:2265 [A] ✔
1P:33 [ARG] 1A:1235 [G] M:51 [ARG] A:2266 [U] ✔
1P:11 [GLY] 1A:620 [U] M:32 [GLY] A:1876 [U] ✔
1P:11 [GLY] 1A:621 [G] M:32 [GLY] A:1877 [U] ✔
1P:32 [THR] 1A:986 [A] M:50 [GLY] A:2093 [U] ✔
1P:32 [THR] 1A:987 [G] M:50 [GLY] A:2094 [G] ✔
1P:32 [THR] 1A:1235 [G] M:50 [GLY] A:2266 [U] ✔
1P:32 [THR] 1A:1236 [G] M:50 [GLY] A:2267 [U] ✔
1P:28 [GLY] 1A:858 [U] M:46 [GLY] A:2021 [U] ✔
1P:14 [LYS] 1A:708 [C] M:35 [LYS] A:1899 [G] ✔
1P:14 [LYS] 1A:709 [G] M:35 [LYS] A:1900 [A] ✔
1P:14 [LYS] 1A:1238 [G] M:35 [LYS] A:2269 [G] ✔
1P:52 [GLU] 1A:872 [C] M:68 [GLU] A:2034 [A] ✔
1P:52 [GLU] 1A:879 [G] M:68 [GLU] A:2041 [U] ✔
1P:52 [GLU] 1A:880 [U] M:68 [GLU] A:2042 [U] ✔
1P:105 [LEU] 1A:650 [G] M:128 [THR] A:1891 [A] ✔
1P:39 [LYS] 1A:878 [G] M:57 [ARG] A:2040 [G] ✔
1P:39 [LYS] 1A:879 [G] M:57 [ARG] A:2041 [U] ✔
1P:39 [LYS] 1A:987 [G] M:57 [ARG] A:2094 [G] ✔
1P:21 [ARG] 1A:609 [A] M:41 [ARG] A:1867 [A] ✔
1P:21 [ARG] 1A:610 [C] M:41 [ARG] A:1868 [G] ✔
1P:21 [ARG] 1A:858 [U] M:41 [ARG] A:2021 [U] ✔
1P:21 [ARG] 1A:859 [C] M:41 [ARG] A:2022 [G] ✔
1P:21 [ARG] 1A:1296 [G] M:41 [ARG] A:2294 [A] ✔
1P:7 [ARG] 1A:1289 [G] M:28 [LYS] A:2287 [U] ✔
1P:7 [ARG] 1A:1290 [G] M:28 [LYS] A:2288 [A] ✔
1P:107 [LYS] 1A:649 [C] M:130 [GLN] A:1890 [C] ✔
1P:87 [ASP] 1A:626 [A] M:100 [ARG] A:1882 [A] ✔
1P:22 [GLY] 1A:858 [U] M:42 [GLY] A:2021 [U] ✔
1P:22 [GLY] 1A:859 [C] M:42 [GLY] A:2022 [G] ✔
1P:22 [GLY] 1A:860 [U] M:42 [GLY] A:2023 [U] ✔
1P:17 [LYS] 1A:611 [U] M:38 [ARG] A:1869 [A] ❌ 7OF0_M_A
1P:17 [LYS] 1A:1236 [G] M:38 [ARG] A:2267 [U] ❌ 7OF0_M_A
1P:17 [LYS] 1A:1237 [G] M:38 [ARG] A:2268 [G] ❌ 7OF0_M_A
1P:18 [ARG] 1A:859 [C] M:39 [ARG] A:2022 [G] ❌ 7OF0_M_A
1P:29 [LYS] 1A:590 [A] M:47 [ARG] A:1848 [U] ❌ 7OF0_M_A
1P:29 [LYS] 1A:610 [C] M:47 [ARG] A:1868 [G] ❌ 7OF0_M_A
1P:27 [HIS] 1A:858 [U] M:45 [ARG] A:2021 [U] ❌ 7OF0_M_A
1P:27 [HIS] 1A:1236 [G] M:45 [ARG] A:2267 [U] ❌ 7OF0_M_A
1P:54 [GLY] 1A:875 [U] M:70 [GLY] A:2037 [U] ❌ 7OF0_M_A
1P:44 [GLY] 1A:718 [C] M:61 [THR] A:1903 [C] ❌ 7OF0_M_A
1P:55 [ARG] 1A:879 [G] M:71 [GLN] A:2041 [U] ❌ 7OF0_M_A
1P:55 [ARG] 1A:880 [U] M:71 [GLN] A:2042 [U] ❌ 7OF0_M_A
1P:13 [ASN] 1A:709 [G] M:34 [LYS] A:1900 [A] ❌ 7OF0_M_A
1P:35 [HIS] 1A:591 [U] M:53 [HIS] A:1849 [C] ❌ 7OF0_M_A
1P:90 [ARG] 1A:626 [A] M:104 [LEU] A:1882 [A] ❌ 7OF0_M_A
1P:46 [LYS] 1A:184 [A] M:63 [PRO] A:1723 [A] ❌ 7OF0_M_A
1P:46 [LYS] 1A:880 [U] M:63 [PRO] A:2042 [U] ❌ 7OF0_M_A
1P:40 [SER] 1A:879 [G] M:58 [GLN] A:2041 [U] ❌ 7OF0_M_A
1P:2 [LYS] 1A:1288 [A] M:23 [SER] A:2286 [A] ❌ 7OF0_M_A
1P:23 [PRO] 1A:859 [C] M:43 [ARG] A:2022 [G] ❌ 7OF0_M_A
1P:37 [GLY] 1A:854 [U] M:55 [GLY] A:2017 [U] ❌ 7OF0_M_A
1P:60 [MET] 1A:2404 [A] M:76 [ILE] A:2897 [A] ❌ 7OF0_M_A
1P:36 [LYS] 1A:879 [G] M:54 [LYS] A:2041 [U] ❌ 7OF0_M_A
1P:33 [ARG] 1A:988 [U] M:51 [ARG] A:2095 [U] ❌ 7OF0_M_A
1P:11 [GLY] 1A:707 [G] M:32 [GLY] A:1898 [A] ❌ 7OF0_M_A
1P:28 [GLY] 1A:1235 [G] M:46 [GLY] A:2266 [U] ❌ 7OF0_M_A
1P:14 [LYS] 1A:1239 [A] M:35 [LYS] A:2270 [A] ❌ 7OF0_M_A
1P:52 [GLU] 1A:2370 [G] M:68 [GLU] A:2866 [A] ❌ 7OF0_M_A
1P:105 [LEU] 1A:626 [A] M:128 [THR] A:1882 [A] ❌ 7OF0_M_A
1P:39 [LYS] 1A:986 [A] M:57 [ARG] A:2093 [U] ❌ 7OF0_M_A
1P:21 [ARG] 1A:857 [U] M:41 [ARG] A:2020 [U] ❌ 7OF0_M_A
1P:21 [ARG] 1A:860 [U] M:41 [ARG] A:2023 [U] ❌ 7OF0_M_A
1P:107 [LYS] 1A:650 [G] M:130 [GLN] A:1891 [A] ❌ 7OF0_M_A
1P:22 [GLY] 1A:857 [U] M:42 [GLY] A:2020 [U] ❌ 7OF0_M_A
1P:87 [ASP] 1A:627 [G] M:100 [ARG] A:1883 [G] ❌ 4Y4O_1P_1A
1P:105 [LEU] 1A:649 [C] M:128 [THR] A:1890 [C] ❌ 4Y4O_1P_1A
1P:105 [LEU] 1A:627 [G] M:128 [THR] A:1883 [G] ❌ 4Y4O_1P_1A
1P:12 [ALA] 1A:620 [U] M:33 [SER] A:1876 [U] ❌ 4Y4O_1P_1A
1P:13 [ASN] 1A:1290 [G] M:34 [LYS] A:2288 [A] ❌ 4Y4O_1P_1A
1P:15 [ARG] 1A:1239 [A] M:36 [PRO] A:2270 [A] ❌ 4Y4O_1P_1A
1P:16 [ARG] 1A:1295 [U] M:37 [GLU] A:2293 [A] ❌ 4Y4O_1P_1A
1P:17 [LYS] 1A:1238 [G] M:38 [ARG] A:2269 [G] ❌ 4Y4O_1P_1A
1P:17 [LYS] 1A:1239 [A] M:38 [ARG] A:2270 [A] ❌ 4Y4O_1P_1A
1P:17 [LYS] 1A:717 [A] M:38 [ARG] A:1902 [C] ❌ 4Y4O_1P_1A
1P:18 [ARG] 1A:710 [G] M:39 [ARG] A:1901 [C] ❌ 4Y4O_1P_1A
1P:19 [VAL] 1A:717 [A] M:40 [PRO] A:1902 [C] ❌ 4Y4O_1P_1A
1P:19 [VAL] 1A:858 [U] M:40 [PRO] A:2021 [U] ❌ 4Y4O_1P_1A
1P:21 [ARG] 1A:1295 [U] M:41 [ARG] A:2293 [A] ❌ 4Y4O_1P_1A
1P:23 [PRO] 1A:861 [C] M:43 [ARG] A:2024 [C] ❌ 4Y4O_1P_1A
1P:23 [PRO] 1A:862 [C] M:43 [ARG] A:2025 [C] ❌ 4Y4O_1P_1A
1P:26 [GLY] 1A:1238 [G] M:44 [ARG] A:2269 [G] ❌ 4Y4O_1P_1A
1P:26 [GLY] 1A:862 [C] M:44 [ARG] A:2025 [C] ❌ 4Y4O_1P_1A
1P:26 [GLY] 1A:1237 [G] M:44 [ARG] A:2268 [G] ❌ 4Y4O_1P_1A
1P:27 [HIS] 1A:1238 [G] M:45 [ARG] A:2269 [G] ❌ 4Y4O_1P_1A
1P:27 [HIS] 1A:1239 [A] M:45 [ARG] A:2270 [A] ❌ 4Y4O_1P_1A
1P:27 [HIS] 1A:861 [C] M:45 [ARG] A:2024 [C] ❌ 4Y4O_1P_1A
1P:27 [HIS] 1A:860 [U] M:45 [ARG] A:2023 [U] ❌ 4Y4O_1P_1A
1P:29 [LYS] 1A:1234 [A] M:47 [ARG] A:2265 [A] ❌ 4Y4O_1P_1A
1P:30 [THR] 1A:589 [U] M:48 [LYS] A:1847 [U] ❌ 4Y4O_1P_1A
1P:30 [THR] 1A:590 [A] M:48 [LYS] A:1848 [U] ❌ 4Y4O_1P_1A
1P:33 [ARG] 1A:717 [A] M:51 [ARG] A:1902 [C] ❌ 4Y4O_1P_1A
1P:36 [LYS] 1A:878 [G] M:54 [LYS] A:2040 [G] ❌ 4Y4O_1P_1A
1P:39 [LYS] 1A:880 [U] M:57 [ARG] A:2042 [U] ❌ 4Y4O_1P_1A
1P:39 [LYS] 1A:988 [U] M:57 [ARG] A:2095 [U] ❌ 4Y4O_1P_1A
1P:40 [SER] 1A:610 [C] M:58 [GLN] A:1868 [G] ❌ 4Y4O_1P_1A
1P:40 [SER] 1A:857 [U] M:58 [GLN] A:2020 [U] ❌ 4Y4O_1P_1A
1P:44 [GLY] 1A:852 [G] M:61 [THR] A:2015 [G] ❌ 4Y4O_1P_1A
1P:45 [LEU] 1A:987 [G] M:62 [ARG] A:2094 [G] ❌ 4Y4O_1P_1A
1P:45 [LEU] 1A:986 [A] M:62 [ARG] A:2093 [U] ❌ 4Y4O_1P_1A
1P:46 [LYS] 1A:879 [G] M:63 [PRO] A:2041 [U] ❌ 4Y4O_1P_1A
1P:47 [ASP] 1A:241 [G] M:64 [ARG] A:1752 [U] ❌ 4Y4O_1P_1A
1P:47 [ASP] 1A:185 [A] M:64 [ARG] A:1724 [A] ❌ 4Y4O_1P_1A
1P:47 [ASP] 1A:184 [A] M:64 [ARG] A:1723 [A] ❌ 4Y4O_1P_1A
1P:47 [ASP] 1A:240 [A] M:64 [ARG] A:1751 [A] ❌ 4Y4O_1P_1A
1P:53 [GLY] 1A:872 [C] M:69 [GLY] A:2034 [A] ❌ 4Y4O_1P_1A
1P:54 [GLY] 1A:2440 [G] M:70 [GLY] A:2916 [G] ❌ 4Y4O_1P_1A
1P:55 [ARG] 1A:2371 [C] M:71 [GLN] A:2867 [C] ❌ 4Y4O_1P_1A
1P:64 [LYS] 1A:239 [G] M:80 [LYS] A:1750 [G] ❌ 4Y4O_1P_1A
1P:76 [LYS] 1A:233 [A] M:88 [SER] A:1744 [A] ❌ 4Y4O_1P_1A
1P:77 [ARG] 1A:234 [G] M:89 [PHE] A:1745 [U] ❌ 4Y4O_1P_1A
1P:77 [ARG] 1A:233 [A] M:89 [PHE] A:1744 [A] ❌ 4Y4O_1P_1A
1P:82 [GLY] 1A:650 [G] M:94 [LYS] A:1891 [A] ❌ 4Y4O_1P_1A
1P:69 [GLY] 1A:235 [C] M:85 [GLU] A:1746 [A] ❌ 7OF0_M:85, 7OF0_A:1746 no longer at interface
1P:81 [GLN] 1A:651 [U] M:93 [TYR] A:1892 [A] ❌ 7OF0_M:93, 7OF0_A:1892 no longer at interface
1P:17 [LYS] 1A:985 [G] M:38 [ARG] A:2092 [C] ❌ 7OF0_A:2092 no longer at interface
1P:55 [ARG] 1A:871 [A] M:71 [GLN] A:2033 [A] ❌ 7OF0_A:2033 no longer at interface
1P:13 [ASN] 1A:1292 [A] M:34 [LYS] A:2290 [A] ❌ 7OF0_A:2290 no longer at interface
1P:86 [LYS] 1A:651 [U] M:99 [ASN] A:1892 [A] ❌ 7OF0_M:99, 7OF0_A:1892 no longer at interface
1P:64 [LYS] 1A:2428 [C] M:80 [LYS] A:2905 [A] ❌ 7OF0_A:2905 no longer at interface
1P:106 [LEU] 1A:651 [U] M:129 [ILE] A:1892 [A] ❌ 7OF0_M:129, 7OF0_A:1892 no longer at interface
1P:46 [LYS] 1A:183 [G] M:63 [PRO] A:1722 [A] ❌ 7OF0_A:1722 no longer at interface
1P:16 [ARG] 1A:612 [C] M:37 [GLU] A:1870 [A] ❌ 7OF0_A:1870 no longer at interface
1P:16 [ARG] 1A:1293 [A] M:37 [GLU] A:2291 [A] ❌ 7OF0_A:2291 no longer at interface
1P:104 [GLY] 1A:651 [U] M:127 [VAL] A:1892 [A] ❌ 7OF0_M:127, 7OF0_A:1892 no longer at interface
1P:36 [LYS] 1A:990 [A] M:54 [LYS] A:2097 [A] ❌ 7OF0_A:2097 no longer at interface
1P:65 [ARG] 1A:2428 [C] M:81 [TYR] A:2905 [A] ❌ 7OF0_M:81, 7OF0_A:2905 no longer at interface
1P:65 [ARG] 1A:2429 [C] M:81 [TYR] A:2906 [C] ❌ 7OF0_M:81, 7OF0_A:2906 no longer at interface
1P:66 [GLY] 1A:2428 [C] M:82 [GLY] A:2905 [A] ❌ 7OF0_M:82, 7OF0_A:2905 no longer at interface
1P:105 [LEU] 1A:651 [U] M:128 [THR] A:1892 [A] ❌ 7OF0_A:1892 no longer at interface
1P:107 [LYS] 1A:651 [U] M:130 [GLN] A:1892 [A] ❌ 7OF0_A:1892 no longer at interface
1P:87 [ASP] 1A:651 [U] M:100 [ARG] A:1892 [A] ❌ 7OF0_A:1892 no longer at interface
1P:105 [LEU] 1A:628 [C] M:128 [THR] A:1884 [G] ❌ 4Y4O_1A:628 no longer at interface
1P:105 [LEU] 1A:648 [G] M:128 [THR] A:1889 [C] ❌ 4Y4O_1A:648 no longer at interface
1P:107 [LYS] 1A:648 [G] M:130 [GLN] A:1889 [C] ❌ 4Y4O_1A:648 no longer at interface
1P:4 [SER] 1A:1251 [G] M:25 [ALA] A:2280 [C] ❌ 4Y4O_1A:1251 no longer at interface
1P:17 [LYS] 1A:1240 [G] M:38 [ARG] A:2271 [C] ❌ 4Y4O_1A:1240 no longer at interface
1P:23 [PRO] 1A:1233 [U] M:43 [ARG] A:2264 [A] ❌ 4Y4O_1A:1233 no longer at interface
1P:26 [GLY] 1A:863 [C] M:44 [ARG] A:2026 [A] ❌ 4Y4O_1A:863 no longer at interface
1P:29 [LYS] 1A:1233 [U] M:47 [ARG] A:2264 [A] ❌ 4Y4O_1A:1233 no longer at interface
1P:35 [HIS] 1A:1233 [U] M:53 [HIS] A:2264 [A] ❌ 4Y4O_1A:1233 no longer at interface
1P:39 [LYS] 1A:989 [G] M:57 [ARG] A:2096 [U] ❌ 4Y4O_1A:989 no longer at interface
1P:40 [SER] 1A:856 [G] M:58 [GLN] A:2019 [G] ❌ 4Y4O_1A:856 no longer at interface
1P:44 [GLY] 1A:851 [A] M:61 [THR] A:2014 [A] ❌ 4Y4O_1A:851 no longer at interface
1P:62 [LEU] 1A:2373 [A] M:78 [ILE] A:2869 [A] ❌ 4Y4O_1A:2373 no longer at interface
1P:64 [LYS] 1A:236 [G] M:80 [LYS] A:1747 [G] ❌ 4Y4O_1A:236 no longer at interface
1P:76 [LYS] 1A:232 [U] M:88 [SER] A:1743 [U] ❌ 4Y4O_1A:232 no longer at interface
1P:50 [ARG] 1A:240 [A] M:66 [GLY] A:1751 [A] ❌ 7OF0_M:66 no longer at interface
1P:50 [ARG] 1A:241 [G] M:66 [GLY] A:1752 [U] ❌ 7OF0_M:66 no longer at interface
1P:69 [GLY] 1A:234 [G] M:85 [GLU] A:1745 [U] ❌ 7OF0_M:85 no longer at interface
1P:43 [GLY] 1A:717 [A] M:60 [GLY] A:1902 [C] ❌ 7OF0_M:60 no longer at interface
1P:43 [GLY] 1A:718 [C] M:60 [GLY] A:1903 [C] ❌ 7OF0_M:60 no longer at interface
1P:74 [GLU] 1A:233 [A] M:86 [GLY] A:1744 [A] ❌ 7OF0_M:86 no longer at interface
1P:74 [GLU] 1A:234 [G] M:86 [GLY] A:1745 [U] ❌ 7OF0_M:86 no longer at interface
1P:104 [GLY] 1A:627 [G] M:127 [VAL] A:1883 [G] ❌ 7OF0_M:127 no longer at interface
1P:104 [GLY] 1A:650 [G] M:127 [VAL] A:1891 [A] ❌ 7OF0_M:127 no longer at interface
1P:68 [GLN] 1A:234 [G] M:84 [ASN] A:1745 [U] ❌ 7OF0_M:84 no longer at interface
1P:108 [LYS] 1A:645 [G] M:131 [PRO] A:1887 [A] ❌ 7OF0_M:131 no longer at interface
1P:108 [LYS] 1A:647 [G] M:131 [PRO] A:1888 [G] ❌ 7OF0_M:131 no longer at interface
1P:59 [LEU] 1A:239 [G] M:75 [TYR] A:1750 [G] ❌ 4Y4O_1P:59 no longer at interface
1P:59 [LEU] 1A:240 [A] M:75 [TYR] A:1751 [A] ❌ 4Y4O_1P:59 no longer at interface

logo_download Export the table of contacts

Properties of this pair

Common ECOD label(s)
 Common RFAM label(s)
 Interface TM-score
 Interface RMSD
 Percentage identity
 Protein TM-score
 RNA TM-score
 Protein coverage
 RNA coverage
 Percentage conservation
 Apolar conservation
 H-bond conservation
 Percentage switching out
Ribosomal proteins L15p and L18e Bacterial large subunit ribosomal RNA 0.89 2.15 0.33 0.79 0.97 0.85 0.8 0.69 0.72 0.35 0.37


Other pairs involving 4Y4O_1P_1A or 7OF0_M_A

Total number of entries: 10

Interface 1 Interface 2 Percentage conservation
 		Interface TM-score
 		Interface RMSD
 		Percentage identity
 		Common ECOD label(s)
 		Common RFAM label(s)
 		Explore both interfaces
1VQ8_L_0 4Y4O_1P_1A 0.38 0.93 4.18 0.15 Ribosomal proteins L15p and L18e compare
1YHQ_L_0 4Y4O_1P_1A 0.38 0.93 4.07 0.15 Ribosomal proteins L15p and L18e compare
4Y4O_1P_1A 6AZ3_L_1 0.43 0.71 3.9 0.19 Ribosomal proteins L15p and L18e compare
4Y4O_1P_1A 7OF0_M_A 0.69 0.89 2.15 0.33 Ribosomal proteins L15p and L18e Bacterial large subunit ribosomal RNA compare
4Y4O_1P_1A 7RYG_K_A 0.71 0.96 2.76 0.39 Ribosomal proteins L15p and L18e Bacterial large subunit ribosomal RNA compare
4Y4O_1P_1A 7K00_k_a 0.76 0.96 2.47 0.5 Ribosomal proteins L15p and L18e Bacterial large subunit ribosomal RNA compare
4Y4O_1P_1A 6AZ3_L_2 0.29 0.83 5.19 0.0 Ribosomal proteins L15p and L18e compare
4Y4O_1P_1A 6S0Z_J_A 0.72 0.96 2.46 0.46 Ribosomal proteins L15p and L18e Bacterial large subunit ribosomal RNA compare
6S0Z_J_A 7OF0_M_A 0.78 0.88 2.04 0.38 Ribosomal proteins L15p and L18e Bacterial large subunit ribosomal RNA compare
7OF0_M_A 7RYG_K_A 0.68 0.85 2.79 0.38 Ribosomal proteins L15p and L18e Bacterial large subunit ribosomal RNA compare