RNAprotDB

All interfaces > All interologs > Interface groups > group127 > 4Y4O_1P_1A vs 7RYG_K_A

Interface analysis


mouse controls

Style

Protein

Cartoon
Licorice
Surface

RNA

Cartoon
Licorice
Surface

Color

Structure
Structure (with hetatm)
Chain
Chainbow

View

Focus on

Interface
RNA
Protein
All

Show chains

Interface

show interface as licorice

Common contacts -

4Y4O_1P
4Y4O_1A
7RYG_K
7RYG_A
Conserved?
1P:77 [ARG] 1A:658 [A] K:73 [ALA] A:631 [A] ✔
1P:51 [PHE] 1A:185 [A] K:52 [PHE] A:203 [A] ✔
1P:51 [PHE] 1A:879 [G] K:52 [PHE] A:830 [U] ✔
1P:51 [PHE] 1A:880 [U] K:52 [PHE] A:831 [A] ✔
1P:43 [GLY] 1A:717 [A] K:45 [SER] A:668 [A] ✔
1P:43 [GLY] 1A:718 [C] K:45 [SER] A:669 [C] ✔
1P:41 [ARG] 1A:718 [C] K:43 [ARG] A:669 [C] ✔
1P:41 [ARG] 1A:852 [G] K:43 [ARG] A:803 [G] ✔
1P:41 [ARG] 1A:853 [C] K:43 [ARG] A:804 [C] ✔
1P:41 [ARG] 1A:854 [U] K:43 [ARG] A:805 [U] ✔
1P:41 [ARG] 1A:855 [G] K:43 [ARG] A:806 [G] ✔
1P:53 [GLY] 1A:185 [A] K:54 [GLY] A:203 [A] ✔
1P:53 [GLY] 1A:873 [U] K:54 [GLY] A:824 [U] ✔
1P:53 [GLY] 1A:875 [U] K:54 [GLY] A:826 [U] ✔
1P:53 [GLY] 1A:878 [G] K:54 [GLY] A:829 [G] ✔
1P:53 [GLY] 1A:879 [G] K:54 [GLY] A:830 [U] ✔
1P:53 [GLY] 1A:880 [U] K:54 [GLY] A:831 [A] ✔
1P:133 [SER] 1A:662 [A] K:132 [GLY] A:635 [A] ✔
1P:17 [LYS] 1A:611 [U] K:19 [ARG] A:586 [U] ✔
1P:17 [LYS] 1A:709 [G] K:19 [ARG] A:660 [G] ✔
1P:17 [LYS] 1A:710 [G] K:19 [ARG] A:661 [G] ✔
1P:17 [LYS] 1A:711 [C] K:19 [ARG] A:662 [G] ✔
1P:17 [LYS] 1A:1236 [G] K:19 [ARG] A:1186 [G] ✔
1P:3 [LEU] 1A:1247 [C] K:5 [LEU] A:1197 [G] ✔
1P:3 [LEU] 1A:1248 [G] K:5 [LEU] A:1198 [U] ✔
1P:3 [LEU] 1A:1289 [G] K:5 [LEU] A:1238 [C] ✔
1P:18 [ARG] 1A:859 [C] K:20 [ARG] A:810 [C] ✔
1P:18 [ARG] 1A:1295 [U] K:20 [ARG] A:1244 [U] ✔
1P:18 [ARG] 1A:1296 [G] K:20 [ARG] A:1245 [G] ✔
1P:134 [ALA] 1A:662 [A] K:133 [ALA] A:635 [A] ✔
1P:9 [ASN] 1A:621 [G] K:11 [ALA] A:596 [U] ✔
1P:9 [ASN] 1A:622 [G] K:11 [ALA] A:597 [A] ✔
1P:34 [GLY] 1A:987 [G] K:36 [GLY] A:939 [G] ✔
1P:34 [GLY] 1A:988 [U] K:36 [GLY] A:940 [A] ✔
1P:34 [GLY] 1A:1234 [A] K:36 [GLY] A:1184 [A] ✔
1P:34 [GLY] 1A:1235 [G] K:36 [GLY] A:1185 [G] ✔
1P:56 [SER] 1A:2404 [A] K:57 [THR] A:2388 [A] ✔
1P:56 [SER] 1A:2440 [G] K:57 [THR] A:2424 [G] ✔
1P:56 [SER] 1A:2441 [G] K:57 [THR] A:2425 [G] ✔
1P:29 [LYS] 1A:589 [U] K:31 [LYS] A:564 [U] ✔
1P:29 [LYS] 1A:590 [A] K:31 [LYS] A:565 [U] ✔
1P:29 [LYS] 1A:610 [C] K:31 [LYS] A:585 [C] ✔
1P:29 [LYS] 1A:857 [U] K:31 [LYS] A:808 [U] ✔
1P:29 [LYS] 1A:858 [U] K:31 [LYS] A:809 [U] ✔
1P:82 [GLY] 1A:661 [G] K:78 [GLU] A:634 [G] ✔
1P:20 [GLY] 1A:857 [U] K:22 [GLY] A:808 [U] ✔
1P:20 [GLY] 1A:858 [U] K:22 [GLY] A:809 [U] ✔
1P:67 [MET] 1A:656 [A] K:68 [PHE] A:629 [A] ✔
1P:67 [MET] 1A:657 [A] K:68 [PHE] A:630 [A] ✔
1P:67 [MET] 1A:2415 [C] K:68 [PHE] A:2399 [C] ✔
1P:67 [MET] 1A:2416 [C] K:68 [PHE] A:2400 [U] ✔
1P:67 [MET] 1A:2426 [G] K:68 [PHE] A:2410 [G] ✔
1P:67 [MET] 1A:2427 [G] K:68 [PHE] A:2411 [G] ✔
1P:84 [ASN] 1A:652 [A] K:80 [ARG] A:625 [A] ✔
1P:30 [THR] 1A:610 [C] K:32 [THR] A:585 [C] ✔
1P:30 [THR] 1A:857 [U] K:32 [THR] A:808 [U] ✔
1P:30 [THR] 1A:1234 [A] K:32 [THR] A:1184 [A] ✔
1P:30 [THR] 1A:1235 [G] K:32 [THR] A:1185 [G] ✔
1P:27 [HIS] 1A:1236 [G] K:29 [VAL] A:1186 [G] ✔
1P:54 [GLY] 1A:873 [U] K:55 [GLY] A:824 [U] ✔
1P:54 [GLY] 1A:878 [G] K:55 [GLY] A:829 [G] ✔
1P:19 [VAL] 1A:610 [C] K:21 [LEU] A:585 [C] ✔
1P:44 [GLY] 1A:718 [C] K:46 [GLY] A:669 [C] ✔
1P:55 [ARG] 1A:872 [C] K:56 [GLN] A:823 [A] ✔
1P:55 [ARG] 1A:873 [U] K:56 [GLN] A:824 [U] ✔
1P:55 [ARG] 1A:2370 [G] K:56 [GLN] A:2354 [A] ✔
1P:55 [ARG] 1A:2440 [G] K:56 [GLN] A:2424 [G] ✔
1P:10 [PRO] 1A:621 [G] K:12 [GLU] A:596 [U] ✔
1P:13 [ASN] 1A:707 [G] K:15 [LYS] A:658 [C] ✔
1P:13 [ASN] 1A:708 [C] K:15 [LYS] A:659 [U] ✔
1P:13 [ASN] 1A:1291 [G] K:15 [LYS] A:1240 [G] ✔
1P:64 [LYS] 1A:238 [C] K:65 [LYS] A:256 [C] ✔
1P:64 [LYS] 1A:2405 [A] K:65 [LYS] A:2389 [U] ✔
1P:64 [LYS] 1A:2406 [C] K:65 [LYS] A:2390 [C] ✔
1P:64 [LYS] 1A:2407 [C] K:65 [LYS] A:2391 [C] ✔
1P:64 [LYS] 1A:2428 [C] K:65 [LYS] A:2412 [C] ✔
1P:115 [LEU] 1A:652 [A] K:113 [VAL] A:625 [A] ✔
1P:115 [LEU] 1A:661 [G] K:113 [VAL] A:634 [G] ✔
1P:115 [LEU] 1A:662 [A] K:113 [VAL] A:635 [A] ✔
1P:63 [PRO] 1A:2405 [A] K:64 [PRO] A:2389 [U] ✔
1P:63 [PRO] 1A:2406 [C] K:64 [PRO] A:2390 [C] ✔
1P:35 [HIS] 1A:590 [A] K:37 [ILE] A:565 [U] ✔
1P:35 [HIS] 1A:591 [U] K:37 [ILE] A:566 [U] ✔
1P:35 [HIS] 1A:987 [G] K:37 [ILE] A:939 [G] ✔
1P:35 [HIS] 1A:988 [U] K:37 [ILE] A:940 [A] ✔
1P:35 [HIS] 1A:1234 [A] K:37 [ILE] A:1184 [A] ✔
1P:31 [ALA] 1A:1235 [G] K:33 [GLY] A:1185 [G] ✔
1P:45 [LEU] 1A:713 [G] K:47 [GLY] A:664 [A] ✔
1P:90 [ARG] 1A:627 [G] K:86 [LYS] A:602 [G] ✔
1P:46 [LYS] 1A:713 [G] K:48 [VAL] A:664 [A] ✔
1P:46 [LYS] 1A:880 [U] K:48 [VAL] A:831 [A] ✔
1P:8 [PRO] 1A:1290 [G] K:10 [PRO] A:1239 [A] ✔
1P:8 [PRO] 1A:1291 [G] K:10 [PRO] A:1240 [G] ✔
1P:5 [ASP] 1A:1289 [G] K:7 [GLU] A:1238 [C] ✔
1P:61 [ARG] 1A:2372 [A] K:62 [ARG] A:2356 [A] ✔
1P:61 [ARG] 1A:2404 [A] K:62 [ARG] A:2388 [A] ✔
1P:61 [ARG] 1A:2405 [A] K:62 [ARG] A:2389 [U] ✔
1P:61 [ARG] 1A:2440 [G] K:62 [ARG] A:2424 [G] ✔
1P:58 [THR] 1A:2371 [C] K:59 [ILE] A:2355 [C] ✔
1P:58 [THR] 1A:2372 [A] K:59 [ILE] A:2356 [A] ✔
1P:40 [SER] 1A:718 [C] K:42 [SER] A:669 [C] ✔
1P:24 [GLY] 1A:860 [U] K:26 [GLY] A:811 [U] ✔
1P:24 [GLY] 1A:861 [C] K:26 [GLY] A:812 [C] ✔
1P:113 [LYS] 1A:660 [C] K:111 [ARG] A:633 [C] ✔
1P:113 [LYS] 1A:661 [G] K:111 [ARG] A:634 [G] ✔
1P:16 [ARG] 1A:709 [G] K:18 [HIS] A:660 [G] ✔
1P:16 [ARG] 1A:710 [G] K:18 [HIS] A:661 [G] ✔
1P:117 [GLU] 1A:652 [A] K:115 [SER] A:625 [A] ✔
1P:6 [LEU] 1A:1289 [G] K:8 [LEU] A:1238 [C] ✔
1P:6 [LEU] 1A:1290 [G] K:8 [LEU] A:1239 [A] ✔
1P:25 [SER] 1A:859 [C] K:27 [SER] A:810 [C] ✔
1P:25 [SER] 1A:860 [U] K:27 [SER] A:811 [U] ✔
1P:25 [SER] 1A:861 [C] K:27 [SER] A:812 [C] ✔
1P:25 [SER] 1A:1238 [G] K:27 [SER] A:1188 [G] ✔
1P:4 [SER] 1A:1248 [G] K:6 [ASN] A:1198 [U] ✔
1P:4 [SER] 1A:1288 [A] K:6 [ASN] A:1237 [U] ✔
1P:4 [SER] 1A:1289 [G] K:6 [ASN] A:1238 [C] ✔
1P:23 [PRO] 1A:860 [U] K:25 [ILE] A:811 [U] ✔
1P:38 [GLN] 1A:185 [A] K:40 [GLN] A:203 [A] ✔
1P:38 [GLN] 1A:852 [G] K:40 [GLN] A:803 [G] ✔
1P:38 [GLN] 1A:853 [C] K:40 [GLN] A:804 [C] ✔
1P:38 [GLN] 1A:878 [G] K:40 [GLN] A:829 [G] ✔
1P:38 [GLN] 1A:879 [G] K:40 [GLN] A:830 [U] ✔
1P:37 [GLY] 1A:852 [G] K:39 [GLY] A:803 [G] ✔
1P:37 [GLY] 1A:853 [C] K:39 [GLY] A:804 [C] ✔
1P:37 [GLY] 1A:878 [G] K:39 [GLY] A:829 [G] ✔
1P:37 [GLY] 1A:879 [G] K:39 [GLY] A:830 [U] ✔
1P:131 [SER] 1A:661 [G] K:130 [THR] A:634 [G] ✔
1P:131 [SER] 1A:662 [A] K:130 [THR] A:635 [A] ✔
1P:60 [MET] 1A:239 [G] K:61 [ARG] A:257 [G] ✔
1P:60 [MET] 1A:2405 [A] K:61 [ARG] A:2389 [U] ✔
1P:116 [GLY] 1A:652 [A] K:114 [LEU] A:625 [A] ✔
1P:116 [GLY] 1A:662 [A] K:114 [LEU] A:635 [A] ✔
1P:15 [ARG] 1A:709 [G] K:17 [GLU] A:660 [G] ✔
1P:62 [LEU] 1A:2372 [A] K:63 [LEU] A:2356 [A] ✔
1P:62 [LEU] 1A:2404 [A] K:63 [LEU] A:2388 [A] ✔
1P:62 [LEU] 1A:2405 [A] K:63 [LEU] A:2389 [U] ✔
1P:62 [LEU] 1A:2406 [C] K:63 [LEU] A:2390 [C] ✔
1P:12 [ALA] 1A:621 [G] K:14 [ALA] A:596 [U] ✔
1P:12 [ALA] 1A:707 [G] K:14 [ALA] A:658 [C] ✔
1P:12 [ALA] 1A:708 [C] K:14 [ALA] A:659 [U] ✔
1P:36 [LYS] 1A:590 [A] K:38 [LYS] A:565 [U] ✔
1P:36 [LYS] 1A:591 [U] K:38 [LYS] A:566 [U] ✔
1P:36 [LYS] 1A:854 [U] K:38 [LYS] A:805 [U] ✔
1P:36 [LYS] 1A:855 [G] K:38 [LYS] A:806 [G] ✔
1P:36 [LYS] 1A:2460 [A] K:38 [LYS] A:2444 [A] ✔
1P:130 [PHE] 1A:661 [G] K:129 [LEU] A:634 [G] ✔
1P:65 [ARG] 1A:656 [A] K:66 [PHE] A:629 [A] ✔
1P:65 [ARG] 1A:2427 [G] K:66 [PHE] A:2411 [G] ✔
1P:65 [ARG] 1A:2428 [C] K:66 [PHE] A:2412 [C] ✔
1P:68 [GLN] 1A:234 [G] K:69 [THR] A:252 [G] ✔
1P:33 [ARG] 1A:610 [C] K:35 [ARG] A:585 [C] ✔
1P:33 [ARG] 1A:718 [C] K:35 [ARG] A:669 [C] ✔
1P:33 [ARG] 1A:987 [G] K:35 [ARG] A:939 [G] ✔
1P:33 [ARG] 1A:988 [U] K:35 [ARG] A:940 [A] ✔
1P:33 [ARG] 1A:1235 [G] K:35 [ARG] A:1185 [G] ✔
1P:11 [GLY] 1A:620 [U] K:13 [GLY] A:595 [G] ✔
1P:11 [GLY] 1A:621 [G] K:13 [GLY] A:596 [U] ✔
1P:66 [GLY] 1A:656 [A] K:67 [GLY] A:629 [A] ✔
1P:66 [GLY] 1A:2427 [G] K:67 [GLY] A:2411 [G] ✔
1P:66 [GLY] 1A:2428 [C] K:67 [GLY] A:2412 [C] ✔
1P:32 [THR] 1A:986 [A] K:34 [GLY] A:938 [A] ✔
1P:32 [THR] 1A:987 [G] K:34 [GLY] A:939 [G] ✔
1P:32 [THR] 1A:1235 [G] K:34 [GLY] A:1185 [G] ✔
1P:32 [THR] 1A:1236 [G] K:34 [GLY] A:1186 [G] ✔
1P:28 [GLY] 1A:858 [U] K:30 [GLY] A:809 [U] ✔
1P:108 [LYS] 1A:646 [A] K:105 [ARG] A:619 [A] ✔
1P:108 [LYS] 1A:647 [G] K:105 [ARG] A:620 [G] ✔
1P:132 [LYS] 1A:661 [G] K:131 [LYS] A:634 [G] ✔
1P:14 [LYS] 1A:708 [C] K:16 [ARG] A:659 [U] ✔
1P:14 [LYS] 1A:709 [G] K:16 [ARG] A:660 [G] ✔
1P:14 [LYS] 1A:1238 [G] K:16 [ARG] A:1188 [G] ✔
1P:14 [LYS] 1A:1239 [A] K:16 [ARG] A:1189 [A] ✔
1P:52 [GLU] 1A:872 [C] K:53 [GLU] A:823 [A] ✔
1P:52 [GLU] 1A:879 [G] K:53 [GLU] A:830 [U] ✔
1P:52 [GLU] 1A:880 [U] K:53 [GLU] A:831 [A] ✔
1P:39 [LYS] 1A:878 [G] K:41 [LYS] A:829 [G] ✔
1P:39 [LYS] 1A:879 [G] K:41 [LYS] A:830 [U] ✔
1P:39 [LYS] 1A:987 [G] K:41 [LYS] A:939 [G] ✔
1P:21 [ARG] 1A:610 [C] K:23 [ARG] A:585 [C] ✔
1P:21 [ARG] 1A:857 [U] K:23 [ARG] A:808 [U] ✔
1P:21 [ARG] 1A:858 [U] K:23 [ARG] A:809 [U] ✔
1P:21 [ARG] 1A:859 [C] K:23 [ARG] A:810 [C] ✔
1P:21 [ARG] 1A:860 [U] K:23 [ARG] A:811 [U] ✔
1P:21 [ARG] 1A:1296 [G] K:23 [ARG] A:1245 [G] ✔
1P:42 [SER] 1A:717 [A] K:44 [LYS] A:668 [A] ✔
1P:42 [SER] 1A:718 [C] K:44 [LYS] A:669 [C] ✔
1P:42 [SER] 1A:719 [C] K:44 [LYS] A:670 [C] ✔
1P:49 [ARG] 1A:713 [G] K:50 [PRO] A:664 [A] ✔
1P:7 [ARG] 1A:1289 [G] K:9 [ALA] A:1238 [C] ✔
1P:7 [ARG] 1A:1290 [G] K:9 [ALA] A:1239 [A] ✔
1P:87 [ASP] 1A:651 [U] K:83 [GLU] A:624 [U] ✔
1P:22 [GLY] 1A:858 [U] K:24 [GLY] A:809 [U] ✔
1P:22 [GLY] 1A:859 [C] K:24 [GLY] A:810 [C] ✔
1P:22 [GLY] 1A:860 [U] K:24 [GLY] A:811 [U] ✔
1P:77 [ARG] 1A:657 [A] K:73 [ALA] A:630 [A] ❌ 7RYG_K_A
1P:77 [ARG] 1A:659 [C] K:73 [ALA] A:632 [U] ❌ 7RYG_K_A
1P:77 [ARG] 1A:2416 [C] K:73 [ALA] A:2400 [U] ❌ 7RYG_K_A
1P:133 [SER] 1A:661 [G] K:132 [GLY] A:634 [G] ❌ 7RYG_K_A
1P:74 [GLU] 1A:233 [A] K:70 [SER] A:251 [A] ❌ 7RYG_K_A
1P:74 [GLU] 1A:234 [G] K:70 [SER] A:252 [G] ❌ 7RYG_K_A
1P:84 [ASN] 1A:662 [A] K:80 [ARG] A:635 [A] ❌ 7RYG_K_A
1P:27 [HIS] 1A:858 [U] K:29 [VAL] A:809 [U] ❌ 7RYG_K_A
1P:54 [GLY] 1A:185 [A] K:55 [GLY] A:203 [A] ❌ 7RYG_K_A
1P:54 [GLY] 1A:875 [U] K:55 [GLY] A:826 [U] ❌ 7RYG_K_A
1P:55 [ARG] 1A:879 [G] K:56 [GLN] A:830 [U] ❌ 7RYG_K_A
1P:55 [ARG] 1A:880 [U] K:56 [GLN] A:831 [A] ❌ 7RYG_K_A
1P:13 [ASN] 1A:709 [G] K:15 [LYS] A:660 [G] ❌ 7RYG_K_A
1P:31 [ALA] 1A:610 [C] K:33 [GLY] A:585 [C] ❌ 7RYG_K_A
1P:31 [ALA] 1A:857 [U] K:33 [GLY] A:808 [U] ❌ 7RYG_K_A
1P:45 [LEU] 1A:879 [G] K:47 [GLY] A:830 [U] ❌ 7RYG_K_A
1P:45 [LEU] 1A:880 [U] K:47 [GLY] A:831 [A] ❌ 7RYG_K_A
1P:46 [LYS] 1A:184 [A] K:48 [VAL] A:202 [A] ❌ 7RYG_K_A
1P:46 [LYS] 1A:185 [A] K:48 [VAL] A:203 [A] ❌ 7RYG_K_A
1P:61 [ARG] 1A:2441 [G] K:62 [ARG] A:2425 [G] ❌ 7RYG_K_A
1P:40 [SER] 1A:879 [G] K:42 [SER] A:830 [U] ❌ 7RYG_K_A
1P:16 [ARG] 1A:611 [U] K:18 [HIS] A:586 [U] ❌ 7RYG_K_A
1P:79 [ARG] 1A:658 [A] K:75 [LYS] A:631 [A] ❌ 7RYG_K_A
1P:117 [GLU] 1A:662 [A] K:115 [SER] A:635 [A] ❌ 7RYG_K_A
1P:47 [ASP] 1A:713 [G] K:49 [ARG] A:664 [A] ❌ 7RYG_K_A
1P:23 [PRO] 1A:859 [C] K:25 [ILE] A:810 [C] ❌ 7RYG_K_A
1P:37 [GLY] 1A:854 [U] K:39 [GLY] A:805 [U] ❌ 7RYG_K_A
1P:60 [MET] 1A:240 [A] K:61 [ARG] A:258 [A] ❌ 7RYG_K_A
1P:60 [MET] 1A:2404 [A] K:61 [ARG] A:2388 [A] ❌ 7RYG_K_A
1P:116 [GLY] 1A:661 [G] K:114 [LEU] A:634 [G] ❌ 7RYG_K_A
1P:104 [GLY] 1A:627 [G] K:101 [ASN] A:602 [G] ❌ 7RYG_K_A
1P:104 [GLY] 1A:650 [G] K:101 [ASN] A:623 [G] ❌ 7RYG_K_A
1P:104 [GLY] 1A:651 [U] K:101 [ASN] A:624 [U] ❌ 7RYG_K_A
1P:36 [LYS] 1A:853 [C] K:38 [LYS] A:804 [C] ❌ 7RYG_K_A
1P:36 [LYS] 1A:879 [G] K:38 [LYS] A:830 [U] ❌ 7RYG_K_A
1P:33 [ARG] 1A:1234 [A] K:35 [ARG] A:1184 [A] ❌ 7RYG_K_A
1P:75 [ILE] 1A:2416 [C] K:71 [GLN] A:2400 [U] ❌ 7RYG_K_A
1P:11 [GLY] 1A:707 [G] K:13 [GLY] A:658 [C] ❌ 7RYG_K_A
1P:28 [GLY] 1A:1235 [G] K:30 [GLY] A:1185 [G] ❌ 7RYG_K_A
1P:108 [LYS] 1A:645 [G] K:105 [ARG] A:618 [G] ❌ 7RYG_K_A
1P:132 [LYS] 1A:660 [C] K:131 [LYS] A:633 [C] ❌ 7RYG_K_A
1P:52 [GLU] 1A:2370 [G] K:53 [GLU] A:2354 [A] ❌ 7RYG_K_A
1P:39 [LYS] 1A:986 [A] K:41 [LYS] A:938 [A] ❌ 7RYG_K_A
1P:42 [SER] 1A:852 [G] K:44 [LYS] A:803 [G] ❌ 7RYG_K_A
1P:107 [LYS] 1A:650 [G] K:104 [ARG] A:623 [G] ❌ 7RYG_K_A
1P:107 [LYS] 1A:651 [U] K:104 [ARG] A:624 [U] ❌ 7RYG_K_A
1P:87 [ASP] 1A:652 [A] K:83 [GLU] A:625 [A] ❌ 7RYG_K_A
1P:22 [GLY] 1A:857 [U] K:24 [GLY] A:808 [U] ❌ 7RYG_K_A
1P:104 [GLY] 1A:645 [G] K:101 [ASN] A:618 [G] ❌ 4Y4O_1P_1A
1P:104 [GLY] 1A:646 [A] K:101 [ASN] A:619 [A] ❌ 4Y4O_1P_1A
1P:104 [GLY] 1A:647 [G] K:101 [ASN] A:620 [G] ❌ 4Y4O_1P_1A
1P:107 [LYS] 1A:647 [G] K:104 [ARG] A:620 [G] ❌ 4Y4O_1P_1A
1P:117 [GLU] 1A:651 [U] K:115 [SER] A:624 [U] ❌ 4Y4O_1P_1A
1P:10 [PRO] 1A:620 [U] K:12 [GLU] A:595 [G] ❌ 4Y4O_1P_1A
1P:132 [LYS] 1A:662 [A] K:131 [LYS] A:635 [A] ❌ 4Y4O_1P_1A
1P:12 [ALA] 1A:620 [U] K:14 [ALA] A:595 [G] ❌ 4Y4O_1P_1A
1P:15 [ARG] 1A:710 [G] K:17 [GLU] A:661 [G] ❌ 4Y4O_1P_1A
1P:16 [ARG] 1A:1295 [U] K:18 [HIS] A:1244 [U] ❌ 4Y4O_1P_1A
1P:21 [ARG] 1A:1295 [U] K:23 [ARG] A:1244 [U] ❌ 4Y4O_1P_1A
1P:39 [LYS] 1A:880 [U] K:41 [LYS] A:831 [A] ❌ 4Y4O_1P_1A
1P:46 [LYS] 1A:879 [G] K:48 [VAL] A:830 [U] ❌ 4Y4O_1P_1A
1P:47 [ASP] 1A:240 [A] K:49 [ARG] A:258 [A] ❌ 4Y4O_1P_1A
1P:47 [ASP] 1A:241 [G] K:49 [ARG] A:259 [G] ❌ 4Y4O_1P_1A
1P:47 [ASP] 1A:185 [A] K:49 [ARG] A:203 [A] ❌ 4Y4O_1P_1A
1P:47 [ASP] 1A:184 [A] K:49 [ARG] A:202 [A] ❌ 4Y4O_1P_1A
1P:51 [PHE] 1A:878 [G] K:52 [PHE] A:829 [G] ❌ 4Y4O_1P_1A
1P:53 [GLY] 1A:872 [C] K:54 [GLY] A:823 [A] ❌ 4Y4O_1P_1A
1P:54 [GLY] 1A:2440 [G] K:55 [GLY] A:2424 [G] ❌ 4Y4O_1P_1A
1P:55 [ARG] 1A:2371 [C] K:56 [GLN] A:2355 [C] ❌ 4Y4O_1P_1A
1P:4 [SER] 1A:1247 [C] K:6 [ASN] A:1197 [G] ❌ 4Y4O_1P_1A
1P:61 [ARG] 1A:2371 [C] K:62 [ARG] A:2355 [C] ❌ 4Y4O_1P_1A
1P:68 [GLN] 1A:233 [A] K:69 [THR] A:251 [A] ❌ 4Y4O_1P_1A
1P:74 [GLU] 1A:657 [A] K:70 [SER] A:630 [A] ❌ 4Y4O_1P_1A
1P:74 [GLU] 1A:658 [A] K:70 [SER] A:631 [A] ❌ 4Y4O_1P_1A
1P:75 [ILE] 1A:233 [A] K:71 [GLN] A:251 [A] ❌ 4Y4O_1P_1A
1P:75 [ILE] 1A:234 [G] K:71 [GLN] A:252 [G] ❌ 4Y4O_1P_1A
1P:76 [LYS] 1A:659 [C] K:72 [ILE] A:632 [U] ❌ 4Y4O_1P_1A
1P:76 [LYS] 1A:658 [A] K:72 [ILE] A:631 [A] ❌ 4Y4O_1P_1A
1P:82 [GLY] 1A:652 [A] K:78 [GLU] A:625 [A] ❌ 4Y4O_1P_1A
1P:84 [ASN] 1A:651 [U] K:80 [ARG] A:624 [U] ❌ 4Y4O_1P_1A
1P:87 [ASP] 1A:650 [G] K:83 [GLU] A:623 [G] ❌ 4Y4O_1P_1A
1P:77 [ARG] 1A:2417 [G] K:73 [ALA] A:2401 [G] ❌ 7RYG_A:2401 no longer at interface
1P:17 [LYS] 1A:985 [G] K:19 [ARG] A:937 [G] ❌ 7RYG_A:937 no longer at interface
1P:17 [LYS] 1A:1237 [G] K:19 [ARG] A:1187 [G] ❌ 7RYG_A:1187 no longer at interface
1P:74 [GLU] 1A:2418 [U] K:70 [SER] A:2402 [U] ❌ 7RYG_A:2402 no longer at interface
1P:27 [HIS] 1A:1237 [G] K:29 [VAL] A:1187 [G] ❌ 7RYG_A:1187 no longer at interface
1P:55 [ARG] 1A:871 [A] K:56 [GLN] A:822 [U] ❌ 7RYG_A:822 no longer at interface
1P:13 [ASN] 1A:1292 [A] K:15 [LYS] A:1241 [A] ❌ 7RYG_A:1241 no longer at interface
1P:90 [ARG] 1A:626 [A] K:86 [LYS] A:601 [A] ❌ 7RYG_A:601 no longer at interface
1P:76 [LYS] 1A:216 [A] K:72 [ILE] A:234 [A] ❌ 7RYG_A:234 no longer at interface
1P:76 [LYS] 1A:217 [A] K:72 [ILE] A:235 [U] ❌ 7RYG_A:235 no longer at interface
1P:46 [LYS] 1A:183 [G] K:48 [VAL] A:201 [G] ❌ 7RYG_A:201 no longer at interface
1P:24 [GLY] 1A:862 [C] K:26 [GLY] A:813 [C] ❌ 7RYG_A:813 no longer at interface
1P:16 [ARG] 1A:612 [C] K:18 [HIS] A:587 [U] ❌ 7RYG_A:587 no longer at interface
1P:16 [ARG] 1A:1293 [A] K:18 [HIS] A:1242 [A] ❌ 7RYG_A:1242 no longer at interface
1P:117 [GLU] 1A:677 [C] K:115 [SER] A:650 [U] ❌ 7RYG_A:650 no longer at interface
1P:47 [ASP] 1A:714 [U] K:49 [ARG] A:665 [U] ❌ 7RYG_A:665 no longer at interface
1P:25 [SER] 1A:1237 [G] K:27 [SER] A:1187 [G] ❌ 7RYG_A:1187 no longer at interface
1P:36 [LYS] 1A:990 [A] K:38 [LYS] A:942 [A] ❌ 7RYG_A:942 no longer at interface
1P:65 [ARG] 1A:655 [G] K:66 [PHE] A:628 [G] ❌ 7RYG_A:628 no longer at interface
1P:65 [ARG] 1A:2429 [C] K:66 [PHE] A:2413 [C] ❌ 7RYG_A:2413 no longer at interface
1P:75 [ILE] 1A:2417 [G] K:71 [GLN] A:2401 [G] ❌ 7RYG_A:2401 no longer at interface
1P:75 [ILE] 1A:2418 [U] K:71 [GLN] A:2402 [U] ❌ 7RYG_A:2402 no longer at interface
1P:132 [LYS] 1A:664 [U] K:131 [LYS] A:637 [U] ❌ 7RYG_A:637 no longer at interface
1P:105 [LEU] 1A:626 [A] K:102 [VAL] A:601 [A] ❌ 7RYG_K:102, 7RYG_A:601 no longer at interface
1P:21 [ARG] 1A:609 [A] K:23 [ARG] A:584 [A] ❌ 7RYG_A:584 no longer at interface
1P:49 [ARG] 1A:712 [C] K:50 [PRO] A:663 [U] ❌ 7RYG_A:663 no longer at interface
1P:107 [LYS] 1A:649 [C] K:104 [ARG] A:622 [C] ❌ 7RYG_A:622 no longer at interface
1P:87 [ASP] 1A:626 [A] K:83 [GLU] A:601 [A] ❌ 7RYG_A:601 no longer at interface
1P:107 [LYS] 1A:648 [G] K:104 [ARG] A:621 [C] ❌ 4Y4O_1A:648 no longer at interface
1P:107 [LYS] 1A:229 [G] K:104 [ARG] A:247 [C] ❌ 4Y4O_1A:229 no longer at interface
1P:107 [LYS] 1A:230 [A] K:104 [ARG] A:248 [A] ❌ 4Y4O_1A:230 no longer at interface
1P:108 [LYS] 1A:249 [G] K:105 [ARG] A:267 [G] ❌ 4Y4O_1A:249 no longer at interface
1P:108 [LYS] 1A:248 [G] K:105 [ARG] A:266 [G] ❌ 4Y4O_1A:248 no longer at interface
1P:109 [GLY] 1A:229 [G] K:106 [ASP] A:247 [C] ❌ 4Y4O_1P:109, 4Y4O_1A:229 no longer at interface
1P:109 [GLY] 1A:247 [G] K:106 [ASP] A:265 [G] ❌ 4Y4O_1P:109, 4Y4O_1A:247 no longer at interface
1P:18 [ARG] 1A:1241 [C] K:20 [ARG] A:1191 [C] ❌ 4Y4O_1A:1241 no longer at interface
1P:42 [SER] 1A:716 [G] K:44 [LYS] A:667 [G] ❌ 4Y4O_1A:716 no longer at interface
1P:42 [SER] 1A:851 [A] K:44 [LYS] A:802 [A] ❌ 4Y4O_1A:851 no longer at interface
1P:4 [SER] 1A:1287 [A] K:6 [ASN] A:1236 [A] ❌ 4Y4O_1A:1287 no longer at interface
1P:60 [MET] 1A:2443 [U] K:61 [ARG] A:2427 [U] ❌ 4Y4O_1A:2443 no longer at interface
1P:62 [LEU] 1A:2373 [A] K:63 [LEU] A:2357 [A] ❌ 4Y4O_1A:2373 no longer at interface
1P:78 [PRO] 1A:232 [U] K:74 [LEU] A:250 [U] ❌ 4Y4O_1P:78, 4Y4O_1A:232 no longer at interface
1P:79 [ARG] 1A:246 [A] K:75 [LYS] A:264 [C] ❌ 4Y4O_1A:246 no longer at interface
1P:82 [GLY] 1A:653 [G] K:78 [GLU] A:626 [G] ❌ 4Y4O_1A:653 no longer at interface
1P:50 [ARG] 1A:240 [A] K:51 [GLY] A:258 [A] ❌ 7RYG_K:51 no longer at interface
1P:50 [ARG] 1A:241 [G] K:51 [GLY] A:259 [G] ❌ 7RYG_K:51 no longer at interface
1P:81 [GLN] 1A:651 [U] K:77 [ALA] A:624 [U] ❌ 7RYG_K:77 no longer at interface
1P:81 [GLN] 1A:661 [G] K:77 [ALA] A:634 [G] ❌ 7RYG_K:77 no longer at interface
1P:103 [ALA] 1A:627 [G] K:100 [ALA] A:602 [G] ❌ 7RYG_K:100 no longer at interface
1P:80 [TYR] 1A:661 [G] K:76 [THR] A:634 [G] ❌ 7RYG_K:76 no longer at interface
1P:86 [LYS] 1A:651 [U] K:82 [SER] A:624 [U] ❌ 7RYG_K:82 no longer at interface
1P:86 [LYS] 1A:652 [A] K:82 [SER] A:625 [A] ❌ 7RYG_K:82 no longer at interface
1P:106 [LEU] 1A:651 [U] K:103 [VAL] A:624 [U] ❌ 7RYG_K:103 no longer at interface
1P:2 [LYS] 1A:1248 [G] K:4 [ARG] A:1198 [U] ❌ 7RYG_K:4 no longer at interface
1P:2 [LYS] 1A:1288 [A] K:4 [ARG] A:1237 [U] ❌ 7RYG_K:4 no longer at interface
1P:26 [GLY] 1A:861 [C] K:28 [GLY] A:812 [C] ❌ 7RYG_K:28 no longer at interface
1P:26 [GLY] 1A:1236 [G] K:28 [GLY] A:1186 [G] ❌ 7RYG_K:28 no longer at interface
1P:105 [LEU] 1A:650 [G] K:102 [VAL] A:623 [G] ❌ 7RYG_K:102 no longer at interface
1P:105 [LEU] 1A:651 [U] K:102 [VAL] A:624 [U] ❌ 7RYG_K:102 no longer at interface
1P:111 [ARG] 1A:659 [C] K:109 [ARG] A:632 [U] ❌ 4Y4O_1P:111 no longer at interface
1P:59 [LEU] 1A:240 [A] K:60 [TYR] A:258 [A] ❌ 4Y4O_1P:59 no longer at interface
1P:59 [LEU] 1A:239 [G] K:60 [TYR] A:257 [G] ❌ 4Y4O_1P:59 no longer at interface
1P:78 [PRO] 1A:233 [A] K:74 [LEU] A:251 [A] ❌ 4Y4O_1P:78 no longer at interface
1P:101 [VAL] 1A:646 [A] K:98 [LYS] A:619 [A] ❌ 4Y4O_1P:101 no longer at interface
1P:102 [ARG] 1A:646 [A] K:99 [ALA] A:619 [A] ❌ 4Y4O_1P:102 no longer at interface

logo_download Export the table of contacts

Properties of this pair

Common ECOD label(s)
 Common RFAM label(s)
 Interface TM-score
 Interface RMSD
 Percentage identity
 Protein TM-score
 RNA TM-score
 Protein coverage
 RNA coverage
 Percentage conservation
 Apolar conservation
 H-bond conservation
 Percentage switching out
Ribosomal proteins L15p and L18e Bacterial large subunit ribosomal RNA 0.96 2.76 0.39 0.78 0.96 0.93 0.85 0.71 0.67 0.42 0.45


Other pairs involving 4Y4O_1P_1A or 7RYG_K_A

Total number of entries: 11

Interface 1 Interface 2 Percentage conservation
 		Interface TM-score
 		Interface RMSD
 		Percentage identity
 		Common ECOD label(s)
 		Common RFAM label(s)
 		Explore both interfaces
7OF0_M_A 7RYG_K_A 0.68 0.85 2.79 0.38 Ribosomal proteins L15p and L18e Bacterial large subunit ribosomal RNA compare
1YHQ_L_0 4Y4O_1P_1A 0.38 0.93 4.07 0.15 Ribosomal proteins L15p and L18e compare
1YHQ_L_0 7RYG_K_A 0.38 0.91 4.41 0.15 Ribosomal proteins L15p and L18e compare
1VQ8_L_0 4Y4O_1P_1A 0.38 0.93 4.18 0.15 Ribosomal proteins L15p and L18e compare
4Y4O_1P_1A 6AZ3_L_1 0.43 0.71 3.9 0.19 Ribosomal proteins L15p and L18e compare
4Y4O_1P_1A 7OF0_M_A 0.69 0.89 2.15 0.33 Ribosomal proteins L15p and L18e Bacterial large subunit ribosomal RNA compare
4Y4O_1P_1A 7RYG_K_A 0.71 0.96 2.76 0.39 Ribosomal proteins L15p and L18e Bacterial large subunit ribosomal RNA compare
4Y4O_1P_1A 7K00_k_a 0.76 0.96 2.47 0.5 Ribosomal proteins L15p and L18e Bacterial large subunit ribosomal RNA compare
4Y4O_1P_1A 6AZ3_L_2 0.29 0.83 5.19 0.0 Ribosomal proteins L15p and L18e compare
4Y4O_1P_1A 6S0Z_J_A 0.72 0.96 2.46 0.46 Ribosomal proteins L15p and L18e Bacterial large subunit ribosomal RNA compare
6S0Z_J_A 7RYG_K_A 0.78 0.97 1.41 0.47 Ribosomal proteins L15p and L18e Bacterial large subunit ribosomal RNA compare