Interface analysis
Style
Protein
CartoonLicorice
Surface
RNA
CartoonLicorice
Surface
Color
StructureStructure (with hetatm)
Chain
Chainbow
View
Focus on
InterfaceRNA
Protein
All
Show chains
Interface
show interface as licoriceCommon contacts -
6AZ3_L
|
6AZ3_1
|
7O7Y_Ba
|
7O7Y_B5
|
Conserved?
|
---|---|---|---|---|
L:32 [ARG] | 1:36 [U] | Ba:32 [ARG] | B5:37 [U] | ✔ |
L:32 [ARG] | 1:37 [A] | Ba:32 [ARG] | B5:38 [A] | ✔ |
L:32 [ARG] | 1:94 [A] | Ba:32 [ARG] | B5:94 [A] | ✔ |
L:32 [ARG] | 1:95 [G] | Ba:32 [ARG] | B5:95 [G] | ✔ |
L:32 [ARG] | 1:848 [U] | Ba:32 [ARG] | B5:1469 [U] | ✔ |
L:32 [ARG] | 1:849 [U] | Ba:32 [ARG] | B5:1470 [A] | ✔ |
L:32 [ARG] | 1:850 [G] | Ba:32 [ARG] | B5:1471 [G] | ✔ |
L:32 [ARG] | 1:852 [A] | Ba:32 [ARG] | B5:1473 [A] | ✔ |
L:32 [ARG] | 1:986 [U] | Ba:32 [ARG] | B5:1607 [U] | ✔ |
L:32 [ARG] | 1:987 [A] | Ba:32 [ARG] | B5:1608 [A] | ✔ |
L:53 [PHE] | 1:93 [G] | Ba:53 [PHE] | B5:93 [G] | ✔ |
L:53 [PHE] | 1:94 [A] | Ba:53 [PHE] | B5:94 [A] | ✔ |
L:27 [LYS] | 1:852 [A] | Ba:27 [LYS] | B5:1473 [A] | ✔ |
L:27 [LYS] | 1:853 [C] | Ba:27 [LYS] | B5:1474 [C] | ✔ |
L:27 [LYS] | 1:856 [OMG] | Ba:27 [LYS] | B5:1477 [OMG] | ✔ |
L:27 [LYS] | 1:987 [A] | Ba:27 [LYS] | B5:1608 [A] | ✔ |
L:27 [LYS] | 1:988 [G] | Ba:27 [LYS] | B5:1609 [G] | ✔ |
L:27 [LYS] | 1:989 [C] | Ba:27 [LYS] | B5:1610 [C] | ✔ |
L:4 [ARG] | 1:1518 [C] | Ba:4 [ARG] | B5:2183 [C] | ✔ |
L:4 [ARG] | 1:1519 [U] | Ba:4 [ARG] | B5:2184 [A] | ✔ |
L:4 [ARG] | 1:1520 [A] | Ba:4 [ARG] | B5:2185 [G] | ✔ |
L:4 [ARG] | 1:1522 [U] | Ba:4 [ARG] | B5:2187 [U] | ✔ |
L:128 [LYS] | 1:752 [G] | Ba:131 [ARG] | B5:1340 [G] | ✔ |
L:113 [GLY] | 1:754 [G] | Ba:115 [GLY] | B5:1342 [A] | ✔ |
L:22 [VAL] | 1:674 [U] | Ba:22 [ILE] | B5:1263 [U] | ✔ |
L:22 [VAL] | 1:1004 [G] | Ba:22 [ILE] | B5:1625 [G] | ✔ |
L:22 [VAL] | 1:1171 [U] | Ba:22 [ILE] | B5:1791 [U] | ✔ |
L:22 [VAL] | 1:1172 [G] | Ba:22 [ILE] | B5:1792 [G] | ✔ |
L:48 [TYR] | 1:1017 [U] | Ba:48 [TYR] | B5:1638 [PSU] | ✔ |
L:48 [TYR] | 1:1018 [A] | Ba:48 [TYR] | B5:1639 [A] | ✔ |
L:28 [HIS] | 1:38 [A] | Ba:28 [HIS] | B5:39 [A] | ✔ |
L:28 [HIS] | 1:849 [U] | Ba:28 [HIS] | B5:1470 [A] | ✔ |
L:28 [HIS] | 1:850 [G] | Ba:28 [HIS] | B5:1471 [G] | ✔ |
L:28 [HIS] | 1:852 [A] | Ba:28 [HIS] | B5:1473 [A] | ✔ |
L:28 [HIS] | 1:987 [A] | Ba:28 [HIS] | B5:1608 [A] | ✔ |
L:28 [HIS] | 1:988 [G] | Ba:28 [HIS] | B5:1609 [G] | ✔ |
L:8 [CYS] | 1:693 [G] | Ba:8 [THR] | B5:1282 [G] | ✔ |
L:8 [CYS] | 1:694 [U] | Ba:8 [THR] | B5:1283 [U] | ✔ |
L:74 [ASN] | 1:743 [A] | Ba:74 [ASN] | B5:1331 [A] | ✔ |
L:13 [GLY] | 1:993 [U] | Ba:13 [GLY] | B5:1614 [U] | ✔ |
L:13 [GLY] | 1:994 [U] | Ba:13 [GLY] | B5:1615 [U] | ✔ |
L:13 [GLY] | 1:995 [C] | Ba:13 [GLY] | B5:1616 [C] | ✔ |
L:36 [GLY] | 1:37 [A] | Ba:36 [GLY] | B5:38 [A] | ✔ |
L:36 [GLY] | 1:38 [A] | Ba:36 [GLY] | B5:39 [A] | ✔ |
L:47 [LYS] | 1:1017 [U] | Ba:47 [LYS] | B5:1638 [PSU] | ✔ |
L:47 [LYS] | 1:1018 [A] | Ba:47 [LYS] | B5:1639 [A] | ✔ |
L:23 [GLY] | 1:1170 [G] | Ba:23 [GLY] | B5:1790 [G] | ✔ |
L:23 [GLY] | 1:1171 [U] | Ba:23 [GLY] | B5:1791 [U] | ✔ |
L:23 [GLY] | 1:1172 [G] | Ba:23 [GLY] | B5:1792 [G] | ✔ |
L:111 [GLY] | 1:743 [A] | Ba:113 [GLY] | B5:1331 [A] | ✔ |
L:111 [GLY] | 1:753 [A] | Ba:113 [GLY] | B5:1341 [A] | ✔ |
L:111 [GLY] | 1:754 [G] | Ba:113 [GLY] | B5:1342 [A] | ✔ |
L:62 [HIS] | 1:68 [A] | Ba:62 [HIS] | B5:69 [A] | ✔ |
L:62 [HIS] | 1:87 [A] | Ba:62 [HIS] | B5:87 [A] | ✔ |
L:62 [HIS] | 1:99 [A] | Ba:62 [HIS] | B5:99 [A] | ✔ |
L:62 [HIS] | 1:342 [G] | Ba:62 [HIS] | B5:315 [G] | ✔ |
L:67 [PRO] | 1:69 [A2M] | Ba:67 [GLN] | B5:70 [A] | ✔ |
L:110 [LEU] | 1:743 [A] | Ba:112 [LEU] | B5:1331 [A] | ✔ |
L:110 [LEU] | 1:752 [G] | Ba:112 [LEU] | B5:1340 [G] | ✔ |
L:110 [LEU] | 1:753 [A] | Ba:112 [LEU] | B5:1341 [A] | ✔ |
L:63 [ARG] | 1:87 [A] | Ba:63 [LEU] | B5:87 [A] | ✔ |
L:63 [ARG] | 1:99 [A] | Ba:63 [LEU] | B5:99 [A] | ✔ |
L:58 [MET] | 1:88 [G] | Ba:58 [MET] | B5:88 [A] | ✔ |
L:58 [MET] | 1:747 [A] | Ba:58 [MET] | B5:1335 [A] | ✔ |
L:58 [MET] | 1:748 [A] | Ba:58 [MET] | B5:1336 [A] | ✔ |
L:20 [GLY] | 1:1170 [G] | Ba:20 [GLY] | B5:1790 [G] | ✔ |
L:20 [GLY] | 1:1171 [U] | Ba:20 [GLY] | B5:1791 [U] | ✔ |
L:20 [GLY] | 1:1460 [A] | Ba:20 [GLY] | B5:2125 [A] | ✔ |
L:20 [GLY] | 1:1461 [G] | Ba:20 [GLY] | B5:2126 [G] | ✔ |
L:43 [ILE] | 1:1007 [U] | Ba:43 [ILE] | B5:1628 [U] | ✔ |
L:43 [ILE] | 1:1008 [C] | Ba:43 [ILE] | B5:1629 [C] | ✔ |
L:43 [ILE] | 1:1016 [A] | Ba:43 [ILE] | B5:1637 [A] | ✔ |
L:43 [ILE] | 1:1017 [U] | Ba:43 [ILE] | B5:1638 [PSU] | ✔ |
L:61 [TYR] | 1:87 [A] | Ba:61 [TYR] | B5:87 [A] | ✔ |
L:61 [TYR] | 1:88 [G] | Ba:61 [TYR] | B5:88 [A] | ✔ |
L:61 [TYR] | 1:89 [C] | Ba:61 [TYR] | B5:89 [C] | ✔ |
L:61 [TYR] | 1:320 [G] | Ba:61 [TYR] | B5:294 [G] | ✔ |
L:61 [TYR] | 1:321 [A] | Ba:61 [TYR] | B5:295 [A] | ✔ |
L:61 [TYR] | 1:342 [G] | Ba:61 [TYR] | B5:315 [G] | ✔ |
L:61 [TYR] | 1:343 [U] | Ba:61 [TYR] | B5:316 [U] | ✔ |
L:11 [GLN] | 1:994 [U] | Ba:11 [LEU] | B5:1615 [U] | ✔ |
L:11 [GLN] | 1:1462 [A] | Ba:11 [LEU] | B5:2127 [G] | ✔ |
L:54 [GLY] | 1:92 [C] | Ba:54 [GLY] | B5:92 [C] | ✔ |
L:54 [GLY] | 1:93 [G] | Ba:54 [GLY] | B5:93 [G] | ✔ |
L:10 [HIS] | 1:995 [C] | Ba:10 [LYS] | B5:1616 [C] | ✔ |
L:10 [HIS] | 1:996 [A] | Ba:10 [LYS] | B5:1617 [C] | ✔ |
L:10 [HIS] | 1:1464 [G] | Ba:10 [LYS] | B5:2129 [G] | ✔ |
L:10 [HIS] | 1:1465 [U] | Ba:10 [LYS] | B5:2130 [G] | ✔ |
L:6 [LYS] | 1:694 [U] | Ba:6 [ARG] | B5:1283 [U] | ✔ |
L:6 [LYS] | 1:695 [OMC] | Ba:6 [ARG] | B5:1284 [OMC] | ✔ |
L:6 [LYS] | 1:844 [C] | Ba:6 [ARG] | B5:1465 [G] | ✔ |
L:6 [LYS] | 1:845 [OMU] | Ba:6 [ARG] | B5:1466 [U] | ✔ |
L:127 [SER] | 1:752 [G] | Ba:130 [SER] | B5:1340 [G] | ✔ |
L:127 [SER] | 1:753 [A] | Ba:130 [SER] | B5:1341 [A] | ✔ |
L:64 [LYS] | 1:68 [A] | Ba:64 [LYS] | B5:69 [A] | ✔ |
L:64 [LYS] | 1:69 [A2M] | Ba:64 [LYS] | B5:70 [A] | ✔ |
L:26 [ARG] | 1:853 [C] | Ba:26 [ARG] | B5:1474 [C] | ✔ |
L:26 [ARG] | 1:988 [G] | Ba:26 [ARG] | B5:1609 [G] | ✔ |
L:26 [ARG] | 1:989 [C] | Ba:26 [ARG] | B5:1610 [C] | ✔ |
L:26 [ARG] | 1:990 [U] | Ba:26 [ARG] | B5:1611 [U] | ✔ |
L:41 [HIS] | 1:1015 [G] | Ba:41 [HIS] | B5:1636 [G] | ✔ |
L:41 [HIS] | 1:1016 [A] | Ba:41 [HIS] | B5:1637 [A] | ✔ |
L:56 [LEU] | 1:747 [A] | Ba:56 [VAL] | B5:1335 [A] | ✔ |
L:5 [PHE] | 1:843 [C] | Ba:5 [LEU] | B5:1464 [C] | ✔ |
L:5 [PHE] | 1:844 [C] | Ba:5 [LEU] | B5:1465 [G] | ✔ |
L:34 [ASN] | 1:94 [A] | Ba:34 [ASN] | B5:94 [A] | ✔ |
L:34 [ASN] | 1:95 [G] | Ba:34 [ASN] | B5:95 [G] | ✔ |
L:29 [GLU] | 1:38 [A] | Ba:29 [PRO] | B5:39 [A] | ✔ |
L:29 [GLU] | 1:988 [G] | Ba:29 [PRO] | B5:1609 [G] | ✔ |
L:29 [GLU] | 1:1014 [G] | Ba:29 [PRO] | B5:1635 [G] | ✔ |
L:29 [GLU] | 1:1015 [G] | Ba:29 [PRO] | B5:1636 [G] | ✔ |
L:15 [THR] | 1:672 [U] | Ba:15 [VAL] | B5:1261 [U] | ✔ |
L:15 [THR] | 1:993 [U] | Ba:15 [VAL] | B5:1614 [U] | ✔ |
L:15 [THR] | 1:994 [U] | Ba:15 [VAL] | B5:1615 [U] | ✔ |
L:42 [ARG] | 1:1016 [A] | Ba:42 [ARG] | B5:1637 [A] | ✔ |
L:3 [THR] | 1:695 [OMC] | Ba:3 [SER] | B5:1284 [OMC] | ✔ |
L:3 [THR] | 1:844 [C] | Ba:3 [SER] | B5:1465 [G] | ✔ |
L:3 [THR] | 1:1520 [A] | Ba:3 [SER] | B5:2185 [G] | ✔ |
L:3 [THR] | 1:1522 [U] | Ba:3 [SER] | B5:2187 [U] | ✔ |
L:18 [GLY] | 1:1169 [A] | Ba:18 [GLY] | B5:1789 [A] | ✔ |
L:18 [GLY] | 1:1170 [G] | Ba:18 [GLY] | B5:1790 [G] | ✔ |
L:18 [GLY] | 1:1461 [G] | Ba:18 [GLY] | B5:2126 [G] | ✔ |
L:18 [GLY] | 1:1462 [A] | Ba:18 [GLY] | B5:2127 [G] | ✔ |
L:77 [ASN] | 1:709 [A] | Ba:77 [LYS] | B5:1298 [A] | ✔ |
L:77 [ASN] | 1:836 [G] | Ba:77 [LYS] | B5:1457 [G] | ✔ |
L:44 [ASN] | 1:1016 [A] | Ba:44 [ASN] | B5:1637 [A] | ✔ |
L:44 [ASN] | 1:1017 [U] | Ba:44 [ASN] | B5:1638 [PSU] | ✔ |
L:17 [CYS] | 1:693 [G] | Ba:17 [HIS] | B5:1282 [G] | ✔ |
L:17 [CYS] | 1:993 [U] | Ba:17 [HIS] | B5:1614 [U] | ✔ |
L:17 [CYS] | 1:1461 [G] | Ba:17 [HIS] | B5:2126 [G] | ✔ |
L:14 [SER] | 1:994 [U] | Ba:14 [HIS] | B5:1615 [U] | ✔ |
L:65 [LYS] | 1:82 [C] | Ba:65 [ARG] | B5:83 [C] | ✔ |
L:65 [LYS] | 1:83 [A] | Ba:65 [ARG] | B5:84 [A] | ✔ |
L:60 [HIS] | 1:87 [A] | Ba:60 [HIS] | B5:87 [A] | ✔ |
L:60 [HIS] | 1:88 [G] | Ba:60 [HIS] | B5:88 [A] | ✔ |
L:129 [LEU] | 1:753 [A] | Ba:132 [ARG] | B5:1341 [A] | ✔ |
L:66 [ASN] | 1:100 [G] | Ba:66 [ASN] | B5:100 [C] | ✔ |
L:66 [ASN] | 1:101 [A] | Ba:66 [ASN] | B5:101 [A] | ✔ |
L:16 [PHE] | 1:673 [C] | Ba:16 [SER] | B5:1262 [C] | ✔ |
L:16 [PHE] | 1:693 [G] | Ba:16 [SER] | B5:1282 [G] | ✔ |
L:16 [PHE] | 1:993 [U] | Ba:16 [SER] | B5:1614 [U] | ✔ |
L:16 [PHE] | 1:1460 [A] | Ba:16 [SER] | B5:2125 [A] | ✔ |
L:16 [PHE] | 1:1461 [G] | Ba:16 [SER] | B5:2126 [G] | ✔ |
L:33 [GLY] | 1:94 [A] | Ba:33 [GLY] | B5:94 [A] | ✔ |
L:33 [GLY] | 1:95 [G] | Ba:33 [GLY] | B5:95 [G] | ✔ |
L:33 [GLY] | 1:848 [U] | Ba:33 [GLY] | B5:1469 [U] | ✔ |
L:33 [GLY] | 1:849 [U] | Ba:33 [GLY] | B5:1470 [A] | ✔ |
L:112 [ASN] | 1:743 [A] | Ba:114 [LYS] | B5:1331 [A] | ✔ |
L:112 [ASN] | 1:753 [A] | Ba:114 [LYS] | B5:1341 [A] | ✔ |
L:112 [ASN] | 1:754 [G] | Ba:114 [LYS] | B5:1342 [A] | ✔ |
L:112 [ASN] | 1:833 [U] | Ba:114 [LYS] | B5:1454 [C] | ✔ |
L:9 [ARG] | 1:995 [C] | Ba:9 [ARG] | B5:1616 [C] | ✔ |
L:9 [ARG] | 1:1522 [U] | Ba:9 [ARG] | B5:2187 [U] | ✔ |
L:9 [ARG] | 1:1523 [G] | Ba:9 [ARG] | B5:2188 [G] | ✔ |
L:55 [LYS] | 1:92 [C] | Ba:55 [LYS] | B5:92 [C] | ✔ |
L:2 [PRO] | 1:843 [C] | Ba:2 [PRO] | B5:1464 [C] | ✔ |
L:2 [PRO] | 1:844 [C] | Ba:2 [PRO] | B5:1465 [G] | ✔ |
L:2 [PRO] | 1:1519 [U] | Ba:2 [PRO] | B5:2184 [A] | ✔ |
L:2 [PRO] | 1:1520 [A] | Ba:2 [PRO] | B5:2185 [G] | ✔ |
L:57 [GLY] | 1:747 [A] | Ba:57 [GLY] | B5:1335 [A] | ✔ |
L:37 [GLY] | 1:38 [A] | Ba:37 [GLY] | B5:39 [A] | ✔ |
L:72 [THR] | 1:752 [G] | Ba:72 [THR] | B5:1340 [G] | ✔ |
L:52 [TYR] | 1:94 [A] | Ba:52 [TYR] | B5:94 [A] | ✔ |
L:133 [LYS] | 1:754 [G] | Ba:136 [LYS] | B5:1342 [A] | ✔ |
L:12 [ARG] | 1:693 [G] | Ba:12 [ARG] | B5:1282 [G] | ✔ |
L:12 [ARG] | 1:993 [U] | Ba:12 [ARG] | B5:1614 [U] | ✔ |
L:12 [ARG] | 1:994 [U] | Ba:12 [ARG] | B5:1615 [U] | ✔ |
L:12 [ARG] | 1:995 [C] | Ba:12 [ARG] | B5:1616 [C] | ✔ |
L:12 [ARG] | 1:996 [A] | Ba:12 [ARG] | B5:1617 [C] | ✔ |
L:12 [ARG] | 1:1523 [G] | Ba:12 [ARG] | B5:2188 [G] | ✔ |
L:114 [HIS] | 1:754 [G] | Ba:116 [LYS] | B5:1342 [A] | ✔ |
L:130 [ALA] | 1:753 [A] | Ba:133 [ALA] | B5:1341 [A] | ✔ |
L:45 [PHE] | 1:94 [A] | Ba:45 [PHE] | B5:94 [A] | ✔ |
L:19 [TYR] | 1:693 [G] | Ba:19 [HIS] | B5:1282 [G] | ✔ |
L:19 [TYR] | 1:1170 [G] | Ba:19 [HIS] | B5:1790 [G] | ✔ |
L:19 [TYR] | 1:1171 [U] | Ba:19 [HIS] | B5:1791 [U] | ✔ |
L:19 [TYR] | 1:1461 [G] | Ba:19 [HIS] | B5:2126 [G] | ✔ |
L:40 [HIS] | 1:38 [A] | Ba:40 [HIS] | B5:39 [A] | ✔ |
L:40 [HIS] | 1:1009 [C] | Ba:40 [HIS] | B5:1630 [C] | ✔ |
L:40 [HIS] | 1:1014 [G] | Ba:40 [HIS] | B5:1635 [G] | ✔ |
L:40 [HIS] | 1:1015 [G] | Ba:40 [HIS] | B5:1636 [G] | ✔ |
L:40 [HIS] | 1:1016 [A] | Ba:40 [HIS] | B5:1637 [A] | ✔ |
L:24 [LYS] | 1:673 [C] | Ba:24 [LYS] | B5:1262 [C] | ✔ |
L:24 [LYS] | 1:990 [U] | Ba:24 [LYS] | B5:1611 [U] | ✔ |
L:24 [LYS] | 1:991 [G] | Ba:24 [LYS] | B5:1612 [G] | ✔ |
L:24 [LYS] | 1:1171 [U] | Ba:24 [LYS] | B5:1791 [U] | ✔ |
L:39 [HIS] | 1:38 [A] | Ba:39 [V5N] | B5:39 [A] | ✔ |
L:39 [HIS] | 1:1009 [C] | Ba:39 [V5N] | B5:1630 [C] | ✔ |
L:7 [LYS] | 1:844 [C] | Ba:7 [LYS] | B5:1465 [G] | ✔ |
L:7 [LYS] | 1:845 [OMU] | Ba:7 [LYS] | B5:1466 [U] | ✔ |
L:7 [LYS] | 1:846 [G] | Ba:7 [LYS] | B5:1467 [G] | ✔ |
L:7 [LYS] | 1:1462 [A] | Ba:7 [LYS] | B5:2127 [G] | ✔ |
L:7 [LYS] | 1:1463 [U] | Ba:7 [LYS] | B5:2128 [A] | ✔ |
L:59 [ASP] | 1:88 [G] | Ba:59 [ARG] | B5:88 [A] | ✔ |
L:59 [ASP] | 1:89 [C] | Ba:59 [ARG] | B5:89 [C] | ✔ |
L:25 [HIS] | 1:693 [G] | Ba:25 [HIS] | B5:1282 [G] | ✔ |
L:25 [HIS] | 1:853 [C] | Ba:25 [HIS] | B5:1474 [C] | ✔ |
L:25 [HIS] | 1:854 [C] | Ba:25 [HIS] | B5:1475 [C] | ✔ |
L:145 [ALA] | 1:71 [C] | Ba:148 [ALA] | B5:72 [C] | ✔ |
L:108 [LYS] | 1:751 [G] | Ba:110 [LYS] | B5:1339 [U] | ✔ |
L:108 [LYS] | 1:752 [G] | Ba:110 [LYS] | B5:1340 [G] | ✔ |
L:31 [GLY] | 1:37 [A] | Ba:31 [GLY] | B5:38 [A] | ✔ |
L:31 [GLY] | 1:38 [A] | Ba:31 [GLY] | B5:39 [A] | ✔ |
L:31 [GLY] | 1:849 [U] | Ba:31 [GLY] | B5:1470 [A] | ✔ |
L:35 [ALA] | 1:37 [A] | Ba:35 [ALA] | B5:38 [A] | ✔ |
L:35 [ALA] | 1:38 [A] | Ba:35 [ALA] | B5:39 [A] | ✔ |
L:35 [ALA] | 1:94 [A] | Ba:35 [ALA] | B5:94 [A] | ✔ |
L:35 [ALA] | 1:95 [G] | Ba:35 [ALA] | B5:95 [G] | ✔ |
L:30 [SER] | 1:38 [A] | Ba:30 [GLY] | B5:39 [A] | ✔ |
L:30 [SER] | 1:1014 [G] | Ba:30 [GLY] | B5:1635 [G] | ✔ |
L:30 [SER] | 1:1015 [G] | Ba:30 [GLY] | B5:1636 [G] | ✔ |
L:21 [ARG] | 1:672 [U] | Ba:21 [ARG] | B5:1261 [U] | ✔ |
L:21 [ARG] | 1:673 [C] | Ba:21 [ARG] | B5:1262 [C] | ✔ |
L:21 [ARG] | 1:674 [U] | Ba:21 [ARG] | B5:1263 [U] | ✔ |
L:21 [ARG] | 1:1171 [U] | Ba:21 [ARG] | B5:1791 [U] | ✔ |
L:21 [ARG] | 1:1459 [U] | Ba:21 [ARG] | B5:2124 [U] | ✔ |
L:21 [ARG] | 1:1460 [A] | Ba:21 [ARG] | B5:2125 [A] | ✔ |
L:126 [VAL] | 1:752 [G] | Ba:129 [PHE] | B5:1340 [G] | ✔ |
L:70 [LYS] | 1:752 [G] | Ba:70 [CYS] | B5:1340 [G] | ✔ |
L:128 [LYS] | 1:751 [G] | Ba:131 [ARG] | B5:1339 [U] | ❌ 7O7Y_Ba_B5 |
L:22 [VAL] | 1:673 [C] | Ba:22 [ILE] | B5:1262 [C] | ❌ 7O7Y_Ba_B5 |
L:8 [CYS] | 1:845 [OMU] | Ba:8 [THR] | B5:1466 [U] | ❌ 7O7Y_Ba_B5 |
L:13 [GLY] | 1:996 [A] | Ba:13 [GLY] | B5:1617 [C] | ❌ 7O7Y_Ba_B5 |
L:63 [ARG] | 1:83 [A] | Ba:63 [LEU] | B5:84 [A] | ❌ 7O7Y_Ba_B5 |
L:63 [ARG] | 1:85 [U] | Ba:63 [LEU] | B5:86 [U] | ❌ 7O7Y_Ba_B5 |
L:11 [GLN] | 1:693 [G] | Ba:11 [LEU] | B5:1282 [G] | ❌ 7O7Y_Ba_B5 |
L:10 [HIS] | 1:1463 [U] | Ba:10 [LYS] | B5:2128 [A] | ❌ 7O7Y_Ba_B5 |
L:26 [ARG] | 1:991 [G] | Ba:26 [ARG] | B5:1612 [G] | ❌ 7O7Y_Ba_B5 |
L:5 [PHE] | 1:1518 [C] | Ba:5 [LEU] | B5:2183 [C] | ❌ 7O7Y_Ba_B5 |
L:5 [PHE] | 1:1519 [U] | Ba:5 [LEU] | B5:2184 [A] | ❌ 7O7Y_Ba_B5 |
L:29 [GLU] | 1:1016 [A] | Ba:29 [PRO] | B5:1637 [A] | ❌ 7O7Y_Ba_B5 |
L:42 [ARG] | 1:1008 [C] | Ba:42 [ARG] | B5:1629 [C] | ❌ 7O7Y_Ba_B5 |
L:3 [THR] | 1:694 [U] | Ba:3 [SER] | B5:1283 [U] | ❌ 7O7Y_Ba_B5 |
L:17 [CYS] | 1:1462 [A] | Ba:17 [HIS] | B5:2127 [G] | ❌ 7O7Y_Ba_B5 |
L:129 [LEU] | 1:754 [G] | Ba:132 [ARG] | B5:1342 [A] | ❌ 7O7Y_Ba_B5 |
L:66 [ASN] | 1:69 [A2M] | Ba:66 [ASN] | B5:70 [A] | ❌ 7O7Y_Ba_B5 |
L:16 [PHE] | 1:672 [U] | Ba:16 [SER] | B5:1261 [U] | ❌ 7O7Y_Ba_B5 |
L:72 [THR] | 1:742 [U] | Ba:72 [THR] | B5:1330 [C] | ❌ 7O7Y_Ba_B5 |
L:72 [THR] | 1:743 [A] | Ba:72 [THR] | B5:1331 [A] | ❌ 7O7Y_Ba_B5 |
L:114 [HIS] | 1:768 [C] | Ba:116 [LYS] | B5:1372 [C] | ❌ 7O7Y_Ba_B5 |
L:114 [HIS] | 1:769 [U] | Ba:116 [LYS] | B5:1373 [C] | ❌ 7O7Y_Ba_B5 |
L:19 [TYR] | 1:1460 [A] | Ba:19 [HIS] | B5:2125 [A] | ❌ 7O7Y_Ba_B5 |
L:59 [ASP] | 1:343 [U] | Ba:59 [ARG] | B5:316 [U] | ❌ 7O7Y_Ba_B5 |
L:30 [SER] | 1:848 [U] | Ba:30 [GLY] | B5:1469 [U] | ❌ 7O7Y_Ba_B5 |
L:30 [SER] | 1:1016 [A] | Ba:30 [GLY] | B5:1637 [A] | ❌ 7O7Y_Ba_B5 |
L:70 [LYS] | 1:751 [G] | Ba:70 [CYS] | B5:1339 [U] | ❌ 7O7Y_Ba_B5 |
L:12 [ARG] | 1:1522 [U] | Ba:12 [ARG] | B5:2187 [U] | ❌ 6AZ3_L_1 |
L:128 [LYS] | 1:753 [A] | Ba:131 [ARG] | B5:1341 [A] | ❌ 6AZ3_L_1 |
L:129 [LEU] | 1:752 [G] | Ba:132 [ARG] | B5:1340 [G] | ❌ 6AZ3_L_1 |
L:133 [LYS] | 1:753 [A] | Ba:136 [LYS] | B5:1341 [A] | ❌ 6AZ3_L_1 |
L:14 [SER] | 1:1460 [A] | Ba:14 [HIS] | B5:2125 [A] | ❌ 6AZ3_L_1 |
L:14 [SER] | 1:996 [A] | Ba:14 [HIS] | B5:1617 [C] | ❌ 6AZ3_L_1 |
L:14 [SER] | 1:1461 [G] | Ba:14 [HIS] | B5:2126 [G] | ❌ 6AZ3_L_1 |
L:21 [ARG] | 1:1461 [G] | Ba:21 [ARG] | B5:2126 [G] | ❌ 6AZ3_L_1 |
L:21 [ARG] | 1:1170 [G] | Ba:21 [ARG] | B5:1790 [G] | ❌ 6AZ3_L_1 |
L:23 [GLY] | 1:1015 [G] | Ba:23 [GLY] | B5:1636 [G] | ❌ 6AZ3_L_1 |
L:24 [LYS] | 1:674 [U] | Ba:24 [LYS] | B5:1263 [U] | ❌ 6AZ3_L_1 |
L:27 [LYS] | 1:854 [C] | Ba:27 [LYS] | B5:1475 [C] | ❌ 6AZ3_L_1 |
L:39 [HIS] | 1:1008 [C] | Ba:39 [V5N] | B5:1629 [C] | ❌ 6AZ3_L_1 |
L:40 [HIS] | 1:1008 [C] | Ba:40 [HIS] | B5:1629 [C] | ❌ 6AZ3_L_1 |
L:5 [PHE] | 1:845 [OMU] | Ba:5 [LEU] | B5:1466 [U] | ❌ 6AZ3_L_1 |
L:52 [TYR] | 1:93 [G] | Ba:52 [TYR] | B5:93 [G] | ❌ 6AZ3_L_1 |
L:59 [ASP] | 1:320 [G] | Ba:59 [ARG] | B5:294 [G] | ❌ 6AZ3_L_1 |
L:6 [LYS] | 1:1520 [A] | Ba:6 [ARG] | B5:2185 [G] | ❌ 6AZ3_L_1 |
L:64 [LYS] | 1:100 [G] | Ba:64 [LYS] | B5:100 [C] | ❌ 6AZ3_L_1 |
L:65 [LYS] | 1:87 [A] | Ba:65 [ARG] | B5:87 [A] | ❌ 6AZ3_L_1 |
L:65 [LYS] | 1:85 [U] | Ba:65 [ARG] | B5:86 [U] | ❌ 6AZ3_L_1 |
L:7 [LYS] | 1:1461 [G] | Ba:7 [LYS] | B5:2126 [G] | ❌ 6AZ3_L_1 |
L:74 [ASN] | 1:753 [A] | Ba:74 [ASN] | B5:1341 [A] | ❌ 6AZ3_L_1 |
L:77 [ASN] | 1:742 [U] | Ba:77 [LYS] | B5:1330 [C] | ❌ 6AZ3_L_1 |
L:32 [ARG] | 1:35 [U] | Ba:32 [ARG] | B5:36 [U] | ❌ 7O7Y_B5:36 no longer at interface |
L:27 [LYS] | 1:855 [C] | Ba:27 [LYS] | B5:1476 [C] | ❌ 7O7Y_B5:1476 no longer at interface |
L:128 [LYS] | 1:763 [U] | Ba:131 [ARG] | B5:1367 [G] | ❌ 7O7Y_B5:1367 no longer at interface |
L:63 [ARG] | 1:98 [A] | Ba:63 [LEU] | B5:98 [A] | ❌ 7O7Y_B5:98 no longer at interface |
L:106 [TYR] | 1:741 [G] | Ba:108 [TYR] | B5:1329 [G] | ❌ 7O7Y_Ba:108, 7O7Y_B5:1329 no longer at interface |
L:136 [LYS] | 1:765 [C] | Ba:139 [GLY] | B5:1369 [C] | ❌ 7O7Y_Ba:139, 7O7Y_B5:1369 no longer at interface |
L:136 [LYS] | 1:766 [A] | Ba:139 [GLY] | B5:1370 [G] | ❌ 7O7Y_Ba:139, 7O7Y_B5:1370 no longer at interface |
L:92 [LYS] | 1:767 [U] | Ba:92 [LYS] | B5:1371 [G] | ❌ 7O7Y_Ba:92, 7O7Y_B5:1371 no longer at interface |
L:10 [HIS] | 1:997 [C] | Ba:10 [LYS] | B5:1618 [C] | ❌ 7O7Y_B5:1618 no longer at interface |
L:10 [HIS] | 1:998 [A] | Ba:10 [LYS] | B5:1619 [U] | ❌ 7O7Y_B5:1619 no longer at interface |
L:80 [ARG] | 1:710 [G] | Ba:80 [THR] | B5:1299 [G] | ❌ 7O7Y_Ba:80, 7O7Y_B5:1299 no longer at interface |
L:25 [HIS] | 1:992 [G] | Ba:25 [HIS] | B5:1613 [G] | ❌ 7O7Y_B5:1613 no longer at interface |
L:132 [LYS] | 1:763 [U] | Ba:135 [GLU] | B5:1367 [G] | ❌ 7O7Y_Ba:135, 7O7Y_B5:1367 no longer at interface |
L:132 [LYS] | 1:764 [G] | Ba:135 [GLU] | B5:1368 [U] | ❌ 7O7Y_Ba:135, 7O7Y_B5:1368 no longer at interface |
L:132 [LYS] | 1:765 [C] | Ba:135 [GLU] | B5:1369 [C] | ❌ 7O7Y_Ba:135, 7O7Y_B5:1369 no longer at interface |
L:10 [HIS] | 1:1466 [G] | Ba:10 [LYS] | B5:2131 [G] | ❌ 6AZ3_1:1466 no longer at interface |
L:112 [ASN] | 1:834 [U] | Ba:114 [LYS] | B5:1455 [A] | ❌ 6AZ3_1:834 no longer at interface |
L:112 [ASN] | 1:771 [U] | Ba:114 [LYS] | B5:1375 [A] | ❌ 6AZ3_1:771 no longer at interface |
L:113 [GLY] | 1:771 [U] | Ba:115 [GLY] | B5:1375 [A] | ❌ 6AZ3_1:771 no longer at interface |
L:114 [HIS] | 1:770 [G] | Ba:116 [LYS] | B5:1374 [G] | ❌ 6AZ3_1:770 no longer at interface |
L:114 [HIS] | 1:835 [G] | Ba:116 [LYS] | B5:1456 [C] | ❌ 6AZ3_1:835 no longer at interface |
L:114 [HIS] | 1:771 [U] | Ba:116 [LYS] | B5:1375 [A] | ❌ 6AZ3_1:771 no longer at interface |
L:12 [ARG] | 1:692 [A] | Ba:12 [ARG] | B5:1281 [A] | ❌ 6AZ3_1:692 no longer at interface |
L:128 [LYS] | 1:823 [G] | Ba:131 [ARG] | B5:1444 [G] | ❌ 6AZ3_1:823 no longer at interface |
L:128 [LYS] | 1:824 [U] | Ba:131 [ARG] | B5:1445 [G] | ❌ 6AZ3_1:824 no longer at interface |
L:128 [LYS] | 1:814 [C] | Ba:131 [ARG] | B5:1423 [C] | ❌ 6AZ3_1:814 no longer at interface |
L:129 [LEU] | 1:815 [G] | Ba:132 [ARG] | B5:1424 [C] | ❌ 6AZ3_1:815 no longer at interface |
L:129 [LEU] | 1:813 [C] | Ba:132 [ARG] | B5:1422 [C] | ❌ 6AZ3_1:813 no longer at interface |
L:129 [LEU] | 1:814 [C] | Ba:132 [ARG] | B5:1423 [C] | ❌ 6AZ3_1:814 no longer at interface |
L:22 [VAL] | 1:1003 [A] | Ba:22 [ILE] | B5:1624 [A] | ❌ 6AZ3_1:1003 no longer at interface |
L:22 [VAL] | 1:1002 [A] | Ba:22 [ILE] | B5:1623 [A] | ❌ 6AZ3_1:1002 no longer at interface |
L:27 [LYS] | 1:851 [G] | Ba:27 [LYS] | B5:1472 [G] | ❌ 6AZ3_1:851 no longer at interface |
L:40 [HIS] | 1:1011 [U] | Ba:40 [HIS] | B5:1632 [PSU] | ❌ 6AZ3_1:1011 no longer at interface |
L:9 [ARG] | 1:1469 [C] | Ba:9 [ARG] | B5:2134 [G] | ❌ 6AZ3_1:1469 no longer at interface |
L:106 [TYR] | 1:742 [U] | Ba:108 [TYR] | B5:1330 [C] | ❌ 7O7Y_Ba:108 no longer at interface |
L:116 [GLN] | 1:769 [U] | Ba:118 [PRO] | B5:1373 [C] | ❌ 7O7Y_Ba:118 no longer at interface |
L:80 [ARG] | 1:709 [A] | Ba:80 [THR] | B5:1298 [A] | ❌ 7O7Y_Ba:80 no longer at interface |
L:80 [ARG] | 1:742 [U] | Ba:80 [THR] | B5:1330 [C] | ❌ 7O7Y_Ba:80 no longer at interface |
L:102 [GLN] | 1:71 [C] | Ba:104 [VAL] | B5:72 [C] | ❌ 7O7Y_Ba:104 no longer at interface |
L:38 [MET] | 1:93 [G] | Ba:38 [MET] | B5:93 [G] | ❌ 6AZ3_L:38 no longer at interface |
Properties of this pair
Common ECOD label(s) |
Common RFAM label(s) |
Interface TM-score |
Interface RMSD |
Percentage identity |
Protein TM-score |
RNA TM-score |
Protein coverage |
RNA coverage |
Percentage conservation |
Apolar conservation |
H-bond conservation |
Percentage switching out |
---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
Ribosomal proteins L15p and L18e | Eukaryotic large subunit ribosomal RNA | 0.92 | 0.75 | 0.60 | 0.93 | 0.91 | 0.92 | 0.86 | 0.86 | 0.84 | 0.55 | 0.44 |
Other pairs involving 6AZ3_L_1 or 7O7Y_Ba_B5
Total number of entries: 9
Interface 1 | Interface 2 |
Percentage conservation |
Interface TM-score |
Interface RMSD |
Percentage identity |
Common ECOD label(s) |
Common RFAM label(s) |
Explore both interfaces |
---|---|---|---|---|---|---|---|---|
6AZ3_L_1 | 7O7Y_Ba_B5 | 0.86 | 0.92 | 0.75 | 0.6 | Ribosomal proteins L15p and L18e | Eukaryotic large subunit ribosomal RNA | compare |
6AZ3_L_1 | 6S0Z_J_A | 0.36 | 0.72 | 4.24 | 0.11 | Ribosomal proteins L15p and L18e | compare | |
1YHQ_L_0 | 6AZ3_L_1 | 0.63 | 0.77 | 2.67 | 0.34 | Ribosomal proteins L15p and L18e | compare | |
1YHQ_L_0 | 7O7Y_Ba_B5 | 0.62 | 0.93 | 2.36 | 0.35 | Ribosomal proteins L15p and L18e | compare | |
1VQ8_L_0 | 7O7Y_Ba_B5 | 0.62 | 0.93 | 2.45 | 0.36 | Ribosomal proteins L15p and L18e | compare | |
1VQ8_L_0 | 6AZ3_L_1 | 0.63 | 0.77 | 2.74 | 0.34 | Ribosomal proteins L15p and L18e | compare | |
4Y4O_1P_1A | 6AZ3_L_1 | 0.43 | 0.71 | 3.9 | 0.19 | Ribosomal proteins L15p and L18e | compare | |
6S0Z_J_A | 7O7Y_Ba_B5 | 0.38 | 0.88 | 4.38 | 0.11 | Ribosomal proteins L15p and L18e | compare | |
6AZ3_L_2 | 7O7Y_Ba_B5 | 0.97 | 0.91 | 0.6 | 0.67 | Ribosomal proteins L15p and L18e | Eukaryotic large subunit ribosomal RNA | compare |