RNAprotDB

All interfaces > All interologs > Interface groups > group127 > 6S0Z_J_A vs 7O7Y_Ba_B5

Interface analysis


mouse controls

Style

Protein

Cartoon
Licorice
Surface

RNA

Cartoon
Licorice
Surface

Color

Structure
Structure (with hetatm)
Chain
Chainbow

View

Focus on

Interface
RNA
Protein
All

Show chains

Interface

show interface as licorice

Common contacts -

6S0Z_J
6S0Z_A
7O7Y_Ba
7O7Y_B5
Conserved?
J:41 [ARG] A:716 [C] Ba:26 [ARG] B5:1474 [C] ✔
J:41 [ARG] A:850 [G] Ba:26 [ARG] B5:1609 [G] ✔
J:41 [ARG] A:851 [C] Ba:26 [ARG] B5:1610 [C] ✔
J:41 [ARG] A:852 [U] Ba:26 [ARG] B5:1611 [U] ✔
J:113 [GLY] A:672 [A] Ba:114 [LYS] B5:1331 [A] ✔
J:113 [GLY] A:682 [A] Ba:114 [LYS] B5:1342 [A] ✔
J:53 [GLY] A:871 [U] Ba:39 [V5N] B5:1630 [C] ✔
J:69 [ILE] A:247 [A] Ba:63 [LEU] B5:87 [A] ✔
J:66 [PHE] A:676 [A] Ba:58 [MET] B5:1335 [A] ✔
J:66 [PHE] A:677 [A] Ba:58 [MET] B5:1336 [A] ✔
J:66 [PHE] A:2430 [C] Ba:58 [MET] B5:4097 [U] ✔
J:66 [PHE] A:2431 [C] Ba:58 [MET] B5:4098 [U] ✔
J:66 [PHE] A:2441 [G] Ba:58 [MET] B5:4109 [A] ✔
J:66 [PHE] A:2442 [G] Ba:58 [MET] B5:4110 [G] ✔
J:127 [LYS] A:680 [C] Ba:129 [PHE] B5:1340 [G] ✔
J:34 [GLY] A:986 [G] Ba:20 [GLY] B5:1790 [G] ✔
J:34 [GLY] A:987 [U] Ba:20 [GLY] B5:1791 [U] ✔
J:34 [GLY] A:1228 [A] Ba:20 [GLY] B5:2125 [A] ✔
J:34 [GLY] A:1229 [G] Ba:20 [GLY] B5:2126 [G] ✔
J:29 [LYS] A:609 [U] Ba:15 [VAL] B5:1261 [U] ✔
J:29 [LYS] A:855 [U] Ba:15 [VAL] B5:1614 [U] ✔
J:29 [LYS] A:856 [U] Ba:15 [VAL] B5:1615 [U] ✔
J:20 [GLY] A:856 [U] Ba:11 [LEU] B5:1615 [U] ✔
J:31 [SER] A:630 [G] Ba:17 [HIS] B5:1282 [G] ✔
J:31 [SER] A:855 [U] Ba:17 [HIS] B5:1614 [U] ✔
J:31 [SER] A:1229 [G] Ba:17 [HIS] B5:2126 [G] ✔
J:30 [THR] A:630 [G] Ba:16 [SER] B5:1282 [G] ✔
J:30 [THR] A:855 [U] Ba:16 [SER] B5:1614 [U] ✔
J:30 [THR] A:1228 [A] Ba:16 [SER] B5:2125 [A] ✔
J:30 [THR] A:1229 [G] Ba:16 [SER] B5:2126 [G] ✔
J:65 [GLY] A:676 [A] Ba:57 [GLY] B5:1335 [A] ✔
J:65 [GLY] A:2442 [G] Ba:57 [GLY] B5:4110 [G] ✔
J:65 [GLY] A:2443 [C] Ba:57 [GLY] B5:4111 [C] ✔
J:114 [ASN] A:682 [A] Ba:115 [GLY] B5:1342 [A] ✔
J:54 [GLN] A:870 [C] Ba:40 [HIS] B5:1629 [C] ✔
J:54 [GLN] A:871 [U] Ba:40 [HIS] B5:1630 [C] ✔
J:35 [HIS] A:610 [U] Ba:21 [ARG] B5:1262 [C] ✔
J:35 [HIS] A:611 [U] Ba:21 [ARG] B5:1263 [U] ✔
J:35 [HIS] A:986 [G] Ba:21 [ARG] B5:1790 [G] ✔
J:35 [HIS] A:987 [U] Ba:21 [ARG] B5:1791 [U] ✔
J:35 [HIS] A:1228 [A] Ba:21 [ARG] B5:2125 [A] ✔
J:40 [ALA] A:716 [C] Ba:25 [HIS] B5:1474 [C] ✔
J:47 [ARG] A:254 [A] Ba:33 [GLY] B5:94 [A] ✔
J:47 [ARG] A:255 [G] Ba:33 [GLY] B5:95 [G] ✔
J:16 [ARG] A:631 [U] Ba:6 [ARG] B5:1283 [U] ✔
J:16 [ARG] A:632 [U] Ba:6 [ARG] B5:1284 [OMC] ✔
J:16 [ARG] A:707 [G] Ba:6 [ARG] B5:1465 [G] ✔
J:16 [ARG] A:708 [G] Ba:6 [ARG] B5:1466 [U] ✔
J:57 [LEU] A:2386 [C] Ba:46 [ASP] B5:4052 [OMU] ✔
J:64 [ARG] A:676 [A] Ba:56 [VAL] B5:1335 [A] ✔
J:64 [ARG] A:2442 [G] Ba:56 [VAL] B5:4110 [G] ✔
J:64 [ARG] A:2443 [C] Ba:56 [VAL] B5:4111 [C] ✔
J:50 [PHE] A:199 [A] Ba:36 [GLY] B5:39 [A] ✔
J:37 [GLY] A:877 [G] Ba:23 [GLY] B5:1636 [G] ✔
J:15 [GLU] A:707 [G] Ba:5 [LEU] B5:1465 [G] ✔
J:128 [PHE] A:681 [G] Ba:130 [SER] B5:1341 [A] ✔
J:17 [ASN] A:707 [G] Ba:7 [LYS] B5:1465 [G] ✔
J:17 [ASN] A:708 [G] Ba:7 [LYS] B5:1466 [U] ✔
J:46 [VAL] A:199 [A] Ba:30 [GLY] B5:39 [A] ✔
J:46 [VAL] A:877 [G] Ba:30 [GLY] B5:1636 [G] ✔
J:130 [ALA] A:681 [G] Ba:132 [ARG] B5:1341 [A] ✔
J:36 [LYS] A:611 [U] Ba:22 [ILE] B5:1263 [U] ✔
J:36 [LYS] A:987 [U] Ba:22 [ILE] B5:1791 [U] ✔
J:62 [PRO] A:2420 [U] Ba:54 [GLY] B5:4086 [U] ✔
J:62 [PRO] A:2421 [C] Ba:54 [GLY] B5:4087 [C] ✔
J:63 [LYS] A:252 [C] Ba:55 [LYS] B5:92 [C] ✔
J:63 [LYS] A:2420 [U] Ba:55 [LYS] B5:4086 [U] ✔
J:63 [LYS] A:2421 [C] Ba:55 [LYS] B5:4087 [C] ✔
J:63 [LYS] A:2422 [C] Ba:55 [LYS] B5:4088 [C] ✔
J:63 [LYS] A:2443 [C] Ba:55 [LYS] B5:4111 [C] ✔
J:33 [ARG] A:630 [G] Ba:19 [HIS] B5:1282 [G] ✔
J:33 [ARG] A:986 [G] Ba:19 [HIS] B5:1790 [G] ✔
J:33 [ARG] A:987 [U] Ba:19 [HIS] B5:1791 [U] ✔
J:33 [ARG] A:1229 [G] Ba:19 [HIS] B5:2126 [G] ✔
J:61 [LEU] A:2420 [U] Ba:53 [PHE] B5:4086 [U] ✔
J:112 [LEU] A:672 [A] Ba:113 [GLY] B5:1331 [A] ✔
J:112 [LEU] A:681 [G] Ba:113 [GLY] B5:1341 [A] ✔
J:112 [LEU] A:682 [A] Ba:113 [GLY] B5:1342 [A] ✔
J:28 [GLY] A:856 [U] Ba:14 [HIS] B5:1615 [U] ✔
J:32 [GLY] A:985 [A] Ba:18 [GLY] B5:1789 [A] ✔
J:32 [GLY] A:986 [G] Ba:18 [GLY] B5:1790 [G] ✔
J:32 [GLY] A:1229 [G] Ba:18 [GLY] B5:2126 [G] ✔
J:32 [GLY] A:1230 [G] Ba:18 [GLY] B5:2127 [G] ✔
J:21 [ARG] A:630 [G] Ba:12 [ARG] B5:1282 [G] ✔
J:21 [ARG] A:855 [U] Ba:12 [ARG] B5:1614 [U] ✔
J:21 [ARG] A:856 [U] Ba:12 [ARG] B5:1615 [U] ✔
J:21 [ARG] A:857 [C] Ba:12 [ARG] B5:1616 [C] ✔
J:21 [ARG] A:858 [U] Ba:12 [ARG] B5:1617 [C] ✔
J:21 [ARG] A:1287 [U] Ba:12 [ARG] B5:2187 [U] ✔
J:21 [ARG] A:1288 [G] Ba:12 [ARG] B5:2188 [G] ✔
J:67 [THR] A:248 [G] Ba:59 [ARG] B5:88 [A] ✔
J:42 [SER] A:715 [A] Ba:27 [LYS] B5:1473 [A] ✔
J:42 [SER] A:716 [C] Ba:27 [LYS] B5:1474 [C] ✔
J:42 [SER] A:717 [C] Ba:27 [LYS] B5:1475 [C] ✔
J:22 [GLY] A:856 [U] Ba:13 [GLY] B5:1615 [U] ✔
J:22 [GLY] A:857 [C] Ba:13 [GLY] B5:1616 [C] ✔
J:129 [SER] A:681 [G] Ba:131 [ARG] B5:1341 [A] ✔
J:41 [ARG] A:853 [G] Ba:26 [ARG] B5:1612 [G] ❌ 7O7Y_Ba_B5
J:53 [GLY] A:2455 [G] Ba:39 [V5N] B5:4122 [A] ❌ 7O7Y_Ba_B5
J:70 [ASN] A:2431 [C] Ba:67 [GLN] B5:4098 [U] ❌ 7O7Y_Ba_B5
J:70 [ASN] A:2433 [C] Ba:67 [GLN] B5:4100 [U] ❌ 7O7Y_Ba_B5
J:18 [ARG] A:857 [C] Ba:8 [THR] B5:1616 [C] ❌ 7O7Y_Ba_B5
J:18 [ARG] A:1236 [G] Ba:8 [THR] B5:2134 [G] ❌ 7O7Y_Ba_B5
J:18 [ARG] A:1287 [U] Ba:8 [THR] B5:2187 [U] ❌ 7O7Y_Ba_B5
J:18 [ARG] A:1288 [G] Ba:8 [THR] B5:2188 [G] ❌ 7O7Y_Ba_B5
J:51 [GLU] A:870 [C] Ba:37 [GLY] B5:1629 [C] ❌ 7O7Y_Ba_B5
J:51 [GLU] A:877 [G] Ba:37 [GLY] B5:1636 [G] ❌ 7O7Y_Ba_B5
J:51 [GLU] A:878 [C] Ba:37 [GLY] B5:1637 [A] ❌ 7O7Y_Ba_B5
J:29 [LYS] A:610 [U] Ba:15 [VAL] B5:1262 [C] ❌ 7O7Y_Ba_B5
J:55 [LEU] A:2419 [A] Ba:41 [HIS] B5:4085 [A] ❌ 7O7Y_Ba_B5
J:55 [LEU] A:2455 [G] Ba:41 [HIS] B5:4122 [A] ❌ 7O7Y_Ba_B5
J:55 [LEU] A:2456 [G] Ba:41 [HIS] B5:4123 [G] ❌ 7O7Y_Ba_B5
J:20 [GLY] A:630 [G] Ba:11 [LEU] B5:1282 [G] ❌ 7O7Y_Ba_B5
J:20 [GLY] A:855 [U] Ba:11 [LEU] B5:1614 [U] ❌ 7O7Y_Ba_B5
J:19 [VAL] A:630 [G] Ba:9 [ARG] B5:1282 [G] ❌ 7O7Y_Ba_B5
J:44 [GLY] A:716 [C] Ba:28 [HIS] B5:1474 [C] ❌ 7O7Y_Ba_B5
J:114 [ASN] A:672 [A] Ba:115 [GLY] B5:1331 [A] ❌ 7O7Y_Ba_B5
J:54 [GLN] A:2385 [A] Ba:40 [HIS] B5:4050 [A] ❌ 7O7Y_Ba_B5
J:54 [GLN] A:2386 [C] Ba:40 [HIS] B5:4052 [OMU] ❌ 7O7Y_Ba_B5
J:54 [GLN] A:2455 [G] Ba:40 [HIS] B5:4122 [A] ❌ 7O7Y_Ba_B5
J:47 [ARG] A:198 [A] Ba:33 [GLY] B5:38 [A] ❌ 7O7Y_Ba_B5
J:47 [ARG] A:199 [A] Ba:33 [GLY] B5:39 [A] ❌ 7O7Y_Ba_B5
J:111 [ILE] A:682 [A] Ba:112 [LEU] B5:1342 [A] ❌ 7O7Y_Ba_B5
J:60 [ARG] A:2386 [C] Ba:52 [TYR] B5:4052 [OMU] ❌ 7O7Y_Ba_B5
J:60 [ARG] A:2419 [A] Ba:52 [TYR] B5:4085 [A] ❌ 7O7Y_Ba_B5
J:60 [ARG] A:2420 [U] Ba:52 [TYR] B5:4086 [U] ❌ 7O7Y_Ba_B5
J:60 [ARG] A:2455 [G] Ba:52 [TYR] B5:4122 [A] ❌ 7O7Y_Ba_B5
J:60 [ARG] A:2456 [G] Ba:52 [TYR] B5:4123 [G] ❌ 7O7Y_Ba_B5
J:16 [ARG] A:1287 [U] Ba:6 [ARG] B5:2187 [U] ❌ 7O7Y_Ba_B5
J:48 [PRO] A:711 [G] Ba:34 [ASN] B5:1469 [U] ❌ 7O7Y_Ba_B5
J:52 [GLY] A:199 [A] Ba:38 [MET] B5:39 [A] ❌ 7O7Y_Ba_B5
J:52 [GLY] A:871 [U] Ba:38 [MET] B5:1630 [C] ❌ 7O7Y_Ba_B5
J:52 [GLY] A:873 [U] Ba:38 [MET] B5:1632 [PSU] ❌ 7O7Y_Ba_B5
J:52 [GLY] A:876 [G] Ba:38 [MET] B5:1635 [G] ❌ 7O7Y_Ba_B5
J:52 [GLY] A:877 [G] Ba:38 [MET] B5:1636 [G] ❌ 7O7Y_Ba_B5
J:52 [GLY] A:878 [C] Ba:38 [MET] B5:1637 [A] ❌ 7O7Y_Ba_B5
J:50 [PHE] A:877 [G] Ba:36 [GLY] B5:1636 [G] ❌ 7O7Y_Ba_B5
J:50 [PHE] A:878 [C] Ba:36 [GLY] B5:1637 [A] ❌ 7O7Y_Ba_B5
J:37 [GLY] A:850 [G] Ba:23 [GLY] B5:1609 [G] ❌ 7O7Y_Ba_B5
J:37 [GLY] A:851 [C] Ba:23 [GLY] B5:1610 [C] ❌ 7O7Y_Ba_B5
J:37 [GLY] A:876 [G] Ba:23 [GLY] B5:1635 [G] ❌ 7O7Y_Ba_B5
J:15 [GLU] A:1233 [A] Ba:5 [LEU] B5:2130 [G] ❌ 7O7Y_Ba_B5
J:15 [GLU] A:1234 [G] Ba:5 [LEU] B5:2131 [G] ❌ 7O7Y_Ba_B5
J:17 [ASN] A:631 [U] Ba:7 [LYS] B5:1283 [U] ❌ 7O7Y_Ba_B5
J:46 [VAL] A:711 [G] Ba:30 [GLY] B5:1469 [U] ❌ 7O7Y_Ba_B5
J:46 [VAL] A:878 [C] Ba:30 [GLY] B5:1637 [A] ❌ 7O7Y_Ba_B5
J:36 [LYS] A:610 [U] Ba:22 [ILE] B5:1262 [C] ❌ 7O7Y_Ba_B5
J:36 [LYS] A:852 [U] Ba:22 [ILE] B5:1611 [U] ❌ 7O7Y_Ba_B5
J:36 [LYS] A:853 [G] Ba:22 [ILE] B5:1612 [G] ❌ 7O7Y_Ba_B5
J:36 [LYS] A:877 [G] Ba:22 [ILE] B5:1636 [G] ❌ 7O7Y_Ba_B5
J:33 [ARG] A:716 [C] Ba:19 [HIS] B5:1474 [C] ❌ 7O7Y_Ba_B5
J:61 [LEU] A:2421 [C] Ba:53 [PHE] B5:4087 [C] ❌ 7O7Y_Ba_B5
J:68 [ASN] A:677 [A] Ba:60 [HIS] B5:1336 [A] ❌ 7O7Y_Ba_B5
J:68 [ASN] A:2431 [C] Ba:60 [HIS] B5:4098 [U] ❌ 7O7Y_Ba_B5
J:28 [GLY] A:855 [U] Ba:14 [HIS] B5:1614 [U] ❌ 7O7Y_Ba_B5
J:14 [LYS] A:706 [U] Ba:4 [ARG] B5:1464 [C] ❌ 7O7Y_Ba_B5
J:14 [LYS] A:707 [G] Ba:4 [ARG] B5:1465 [G] ❌ 7O7Y_Ba_B5
J:14 [LYS] A:1232 [G] Ba:4 [ARG] B5:2129 [G] ❌ 7O7Y_Ba_B5
J:14 [LYS] A:1233 [A] Ba:4 [ARG] B5:2130 [G] ❌ 7O7Y_Ba_B5
J:39 [LYS] A:877 [G] Ba:24 [LYS] B5:1636 [G] ❌ 7O7Y_Ba_B5
J:39 [LYS] A:878 [C] Ba:24 [LYS] B5:1637 [A] ❌ 7O7Y_Ba_B5
J:39 [LYS] A:986 [G] Ba:24 [LYS] B5:1790 [G] ❌ 7O7Y_Ba_B5
J:67 [THR] A:247 [A] Ba:59 [ARG] B5:87 [A] ❌ 7O7Y_Ba_B5
J:22 [GLY] A:858 [U] Ba:13 [GLY] B5:1617 [C] ❌ 7O7Y_Ba_B5
J:129 [SER] A:682 [A] Ba:131 [ARG] B5:1342 [A] ❌ 7O7Y_Ba_B5
J:20 [GLY] A:1230 [G] Ba:11 [LEU] B5:2127 [G] ❌ 6S0Z_J_A
J:111 [ILE] A:672 [A] Ba:112 [LEU] B5:1331 [A] ❌ 6S0Z_J_A
J:111 [ILE] A:680 [C] Ba:112 [LEU] B5:1340 [G] ❌ 6S0Z_J_A
J:111 [ILE] A:681 [G] Ba:112 [LEU] B5:1341 [A] ❌ 6S0Z_J_A
J:113 [GLY] A:681 [G] Ba:114 [LYS] B5:1341 [A] ❌ 6S0Z_J_A
J:22 [GLY] A:855 [U] Ba:13 [GLY] B5:1614 [U] ❌ 6S0Z_J_A
J:128 [PHE] A:680 [C] Ba:130 [SER] B5:1340 [G] ❌ 6S0Z_J_A
J:129 [SER] A:680 [C] Ba:131 [ARG] B5:1340 [G] ❌ 6S0Z_J_A
J:130 [ALA] A:680 [C] Ba:132 [ARG] B5:1340 [G] ❌ 6S0Z_J_A
J:28 [GLY] A:1228 [A] Ba:14 [HIS] B5:2125 [A] ❌ 6S0Z_J_A
J:28 [GLY] A:858 [U] Ba:14 [HIS] B5:1617 [C] ❌ 6S0Z_J_A
J:28 [GLY] A:1229 [G] Ba:14 [HIS] B5:2126 [G] ❌ 6S0Z_J_A
J:30 [THR] A:610 [U] Ba:16 [SER] B5:1262 [C] ❌ 6S0Z_J_A
J:35 [HIS] A:1229 [G] Ba:21 [ARG] B5:2126 [G] ❌ 6S0Z_J_A
J:35 [HIS] A:609 [U] Ba:21 [ARG] B5:1261 [U] ❌ 6S0Z_J_A
J:37 [GLY] A:987 [U] Ba:23 [GLY] B5:1791 [U] ❌ 6S0Z_J_A
J:37 [GLY] A:986 [G] Ba:23 [GLY] B5:1790 [G] ❌ 6S0Z_J_A
J:39 [LYS] A:611 [U] Ba:24 [LYS] B5:1263 [U] ❌ 6S0Z_J_A
J:39 [LYS] A:987 [U] Ba:24 [LYS] B5:1791 [U] ❌ 6S0Z_J_A
J:39 [LYS] A:852 [U] Ba:24 [LYS] B5:1611 [U] ❌ 6S0Z_J_A
J:39 [LYS] A:610 [U] Ba:24 [LYS] B5:1262 [C] ❌ 6S0Z_J_A
J:39 [LYS] A:853 [G] Ba:24 [LYS] B5:1612 [G] ❌ 6S0Z_J_A
J:40 [ALA] A:717 [C] Ba:25 [HIS] B5:1475 [C] ❌ 6S0Z_J_A
J:40 [ALA] A:630 [G] Ba:25 [HIS] B5:1282 [G] ❌ 6S0Z_J_A
J:42 [SER] A:850 [G] Ba:27 [LYS] B5:1609 [G] ❌ 6S0Z_J_A
J:42 [SER] A:851 [C] Ba:27 [LYS] B5:1610 [C] ❌ 6S0Z_J_A
J:44 [GLY] A:715 [A] Ba:28 [HIS] B5:1473 [A] ❌ 6S0Z_J_A
J:44 [GLY] A:850 [G] Ba:28 [HIS] B5:1609 [G] ❌ 6S0Z_J_A
J:44 [GLY] A:199 [A] Ba:28 [HIS] B5:39 [A] ❌ 6S0Z_J_A
J:46 [VAL] A:876 [G] Ba:30 [GLY] B5:1635 [G] ❌ 6S0Z_J_A
J:47 [ARG] A:711 [G] Ba:33 [GLY] B5:1469 [U] ❌ 6S0Z_J_A
J:48 [PRO] A:254 [A] Ba:34 [ASN] B5:94 [A] ❌ 6S0Z_J_A
J:48 [PRO] A:255 [G] Ba:34 [ASN] B5:95 [G] ❌ 6S0Z_J_A
J:50 [PHE] A:198 [A] Ba:36 [GLY] B5:38 [A] ❌ 6S0Z_J_A
J:51 [GLU] A:199 [A] Ba:37 [GLY] B5:39 [A] ❌ 6S0Z_J_A
J:52 [GLY] A:253 [G] Ba:38 [MET] B5:93 [G] ❌ 6S0Z_J_A
J:52 [GLY] A:2455 [G] Ba:38 [MET] B5:4122 [A] ❌ 6S0Z_J_A
J:52 [GLY] A:2420 [U] Ba:38 [MET] B5:4086 [U] ❌ 6S0Z_J_A
J:52 [GLY] A:2419 [A] Ba:38 [MET] B5:4085 [A] ❌ 6S0Z_J_A
J:53 [GLY] A:870 [C] Ba:39 [V5N] B5:1629 [C] ❌ 6S0Z_J_A
J:53 [GLY] A:199 [A] Ba:39 [V5N] B5:39 [A] ❌ 6S0Z_J_A
J:14 [LYS] A:1287 [U] Ba:4 [ARG] B5:2187 [U] ❌ 6S0Z_J_A
J:14 [LYS] A:1284 [A] Ba:4 [ARG] B5:2184 [A] ❌ 6S0Z_J_A
J:14 [LYS] A:1283 [G] Ba:4 [ARG] B5:2183 [C] ❌ 6S0Z_J_A
J:54 [GLN] A:876 [G] Ba:40 [HIS] B5:1635 [G] ❌ 6S0Z_J_A
J:54 [GLN] A:873 [U] Ba:40 [HIS] B5:1632 [PSU] ❌ 6S0Z_J_A
J:54 [GLN] A:877 [G] Ba:40 [HIS] B5:1636 [G] ❌ 6S0Z_J_A
J:54 [GLN] A:199 [A] Ba:40 [HIS] B5:39 [A] ❌ 6S0Z_J_A
J:54 [GLN] A:878 [C] Ba:40 [HIS] B5:1637 [A] ❌ 6S0Z_J_A
J:55 [LEU] A:877 [G] Ba:41 [HIS] B5:1636 [G] ❌ 6S0Z_J_A
J:55 [LEU] A:878 [C] Ba:41 [HIS] B5:1637 [A] ❌ 6S0Z_J_A
J:15 [GLU] A:708 [G] Ba:5 [LEU] B5:1466 [U] ❌ 6S0Z_J_A
J:15 [GLU] A:706 [U] Ba:5 [LEU] B5:1464 [C] ❌ 6S0Z_J_A
J:60 [ARG] A:253 [G] Ba:52 [TYR] B5:93 [G] ❌ 6S0Z_J_A
J:60 [ARG] A:254 [A] Ba:52 [TYR] B5:94 [A] ❌ 6S0Z_J_A
J:61 [LEU] A:253 [G] Ba:53 [PHE] B5:93 [G] ❌ 6S0Z_J_A
J:61 [LEU] A:254 [A] Ba:53 [PHE] B5:94 [A] ❌ 6S0Z_J_A
J:62 [PRO] A:253 [G] Ba:54 [GLY] B5:93 [G] ❌ 6S0Z_J_A
J:62 [PRO] A:252 [C] Ba:54 [GLY] B5:92 [C] ❌ 6S0Z_J_A
J:66 [PHE] A:248 [G] Ba:58 [MET] B5:88 [A] ❌ 6S0Z_J_A
J:67 [THR] A:2433 [C] Ba:59 [ARG] B5:4100 [U] ❌ 6S0Z_J_A
J:67 [THR] A:2441 [G] Ba:59 [ARG] B5:4109 [A] ❌ 6S0Z_J_A
J:68 [ASN] A:247 [A] Ba:60 [HIS] B5:87 [A] ❌ 6S0Z_J_A
J:68 [ASN] A:2433 [C] Ba:60 [HIS] B5:4100 [U] ❌ 6S0Z_J_A
J:68 [ASN] A:248 [G] Ba:60 [HIS] B5:88 [A] ❌ 6S0Z_J_A
J:17 [ASN] A:1229 [G] Ba:7 [LYS] B5:2126 [G] ❌ 6S0Z_J_A
J:17 [ASN] A:1231 [A] Ba:7 [LYS] B5:2128 [A] ❌ 6S0Z_J_A
J:17 [ASN] A:1230 [G] Ba:7 [LYS] B5:2127 [G] ❌ 6S0Z_J_A
J:18 [ARG] A:630 [G] Ba:8 [THR] B5:1282 [G] ❌ 6S0Z_J_A
J:18 [ARG] A:631 [U] Ba:8 [THR] B5:1283 [U] ❌ 6S0Z_J_A
J:19 [VAL] A:1287 [U] Ba:9 [ARG] B5:2187 [U] ❌ 6S0Z_J_A
J:19 [VAL] A:857 [C] Ba:9 [ARG] B5:1616 [C] ❌ 6S0Z_J_A
J:19 [VAL] A:1288 [G] Ba:9 [ARG] B5:2188 [G] ❌ 6S0Z_J_A
J:19 [VAL] A:1236 [G] Ba:9 [ARG] B5:2134 [G] ❌ 6S0Z_J_A
J:70 [ASN] A:2432 [G] Ba:67 [GLN] B5:4099 [PSU] ❌ 7O7Y_B5:4099 no longer at interface
J:18 [ARG] A:1235 [C] Ba:8 [THR] B5:2133 [C] ❌ 7O7Y_B5:2133 no longer at interface
J:104 [ASN] A:668 [C] Ba:107 [GLY] B5:1327 [G] ❌ 7O7Y_Ba:107, 7O7Y_B5:1327 no longer at interface
J:72 [LYS] A:678 [A] Ba:69 [PHE] B5:1338 [G] ❌ 7O7Y_Ba:69, 7O7Y_B5:1338 no longer at interface
J:84 [LYS] A:647 [G] Ba:84 [GLU] B5:1299 [G] ❌ 7O7Y_Ba:84, 7O7Y_B5:1299 no longer at interface
J:40 [ALA] A:854 [G] Ba:25 [HIS] B5:1613 [G] ❌ 7O7Y_B5:1613 no longer at interface
J:60 [ARG] A:2387 [A] Ba:52 [TYR] B5:4053 [A] ❌ 7O7Y_B5:4053 no longer at interface
J:57 [LEU] A:2387 [A] Ba:46 [ASP] B5:4053 [A] ❌ 7O7Y_B5:4053 no longer at interface
J:64 [ARG] A:2444 [C] Ba:56 [VAL] B5:4112 [A] ❌ 7O7Y_B5:4112 no longer at interface
J:36 [LYS] A:2475 [A] Ba:22 [ILE] B5:4140 [A] ❌ 7O7Y_B5:4140 no longer at interface
J:61 [LEU] A:2387 [A] Ba:53 [PHE] B5:4053 [A] ❌ 7O7Y_B5:4053 no longer at interface
J:68 [ASN] A:678 [A] Ba:60 [HIS] B5:1338 [G] ❌ 7O7Y_B5:1338 no longer at interface
J:68 [ASN] A:2432 [G] Ba:60 [HIS] B5:4099 [PSU] ❌ 7O7Y_B5:4099 no longer at interface
J:71 [ARG] A:673 [G] Ba:68 [SER] B5:1332 [A] ❌ 7O7Y_Ba:68, 7O7Y_B5:1332 no longer at interface
J:71 [ARG] A:674 [C] Ba:68 [SER] B5:1333 [U] ❌ 7O7Y_Ba:68, 7O7Y_B5:1333 no longer at interface
J:71 [ARG] A:675 [G] Ba:68 [SER] B5:1334 [G] ❌ 7O7Y_Ba:68, 7O7Y_B5:1334 no longer at interface
J:71 [ARG] A:678 [A] Ba:68 [SER] B5:1338 [G] ❌ 7O7Y_Ba:68, 7O7Y_B5:1338 no longer at interface
J:113 [GLY] A:698 [U] Ba:114 [LYS] B5:1455 [A] ❌ 6S0Z_A:698 no longer at interface
J:113 [GLY] A:697 [U] Ba:114 [LYS] B5:1454 [C] ❌ 6S0Z_A:697 no longer at interface
J:21 [ARG] A:629 [A] Ba:12 [ARG] B5:1281 [A] ❌ 6S0Z_A:629 no longer at interface
J:129 [SER] A:689 [A] Ba:131 [ARG] B5:1445 [G] ❌ 6S0Z_A:689 no longer at interface
J:129 [SER] A:684 [U] Ba:131 [ARG] B5:1423 [C] ❌ 6S0Z_A:684 no longer at interface
J:130 [ALA] A:683 [G] Ba:132 [ARG] B5:1422 [C] ❌ 6S0Z_A:683 no longer at interface
J:130 [ALA] A:684 [U] Ba:132 [ARG] B5:1423 [C] ❌ 6S0Z_A:684 no longer at interface
J:35 [HIS] A:1227 [U] Ba:21 [ARG] B5:2124 [U] ❌ 6S0Z_A:1227 no longer at interface
J:36 [LYS] A:865 [A] Ba:22 [ILE] B5:1624 [A] ❌ 6S0Z_A:865 no longer at interface
J:36 [LYS] A:864 [A] Ba:22 [ILE] B5:1623 [A] ❌ 6S0Z_A:864 no longer at interface
J:36 [LYS] A:866 [A] Ba:22 [ILE] B5:1625 [G] ❌ 6S0Z_A:866 no longer at interface
J:36 [LYS] A:988 [C] Ba:22 [ILE] B5:1792 [G] ❌ 6S0Z_A:988 no longer at interface
J:37 [GLY] A:988 [C] Ba:23 [GLY] B5:1792 [G] ❌ 6S0Z_A:988 no longer at interface
J:42 [SER] A:714 [G] Ba:27 [LYS] B5:1472 [G] ❌ 6S0Z_A:714 no longer at interface
J:42 [SER] A:719 [G] Ba:27 [LYS] B5:1477 [OMG] ❌ 6S0Z_A:719 no longer at interface
J:42 [SER] A:849 [A] Ba:27 [LYS] B5:1608 [A] ❌ 6S0Z_A:849 no longer at interface
J:44 [GLY] A:712 [U] Ba:28 [HIS] B5:1470 [A] ❌ 6S0Z_A:712 no longer at interface
J:44 [GLY] A:849 [A] Ba:28 [HIS] B5:1608 [A] ❌ 6S0Z_A:849 no longer at interface
J:44 [GLY] A:713 [A] Ba:28 [HIS] B5:1471 [G] ❌ 6S0Z_A:713 no longer at interface
J:47 [ARG] A:712 [U] Ba:33 [GLY] B5:1470 [A] ❌ 6S0Z_A:712 no longer at interface
J:53 [GLY] A:2457 [A] Ba:39 [V5N] B5:4124 [A] ❌ 6S0Z_A:2457 no longer at interface
J:14 [LYS] A:1285 [A] Ba:4 [ARG] B5:2185 [G] ❌ 6S0Z_A:1285 no longer at interface
J:67 [THR] A:249 [C] Ba:59 [ARG] B5:89 [C] ❌ 6S0Z_A:249 no longer at interface
J:67 [THR] A:432 [G] Ba:59 [ARG] B5:294 [G] ❌ 6S0Z_A:432 no longer at interface
J:16 [ARG] A:1285 [A] Ba:6 [ARG] B5:2185 [G] ❌ 6S0Z_A:1285 no longer at interface
J:69 [ILE] A:259 [A] Ba:63 [LEU] B5:99 [A] ❌ 6S0Z_A:259 no longer at interface
J:70 [ASN] A:230 [A] Ba:67 [GLN] B5:70 [A] ❌ 6S0Z_A:230 no longer at interface
J:17 [ASN] A:709 [U] Ba:7 [LYS] B5:1467 [G] ❌ 6S0Z_A:709 no longer at interface
J:80 [ASP] A:646 [A] Ba:77 [LYS] B5:1298 [A] ❌ 6S0Z_J:80, 6S0Z_A:646 no longer at interface
J:80 [ASP] A:699 [U] Ba:77 [LYS] B5:1457 [G] ❌ 6S0Z_J:80, 6S0Z_A:699 no longer at interface
J:81 [GLN] A:671 [U] Ba:78 [LEU] B5:1330 [C] ❌ 7O7Y_Ba:78 no longer at interface
J:78 [ASN] A:672 [A] Ba:75 [LEU] B5:1331 [A] ❌ 7O7Y_Ba:75 no longer at interface
J:74 [TYR] A:681 [G] Ba:71 [PRO] B5:1341 [A] ❌ 7O7Y_Ba:71 no longer at interface
J:58 [PHE] A:253 [G] Ba:50 [PRO] B5:93 [G] ❌ 7O7Y_Ba:50 no longer at interface
J:72 [LYS] A:679 [G] Ba:69 [PHE] B5:1339 [U] ❌ 7O7Y_Ba:69 no longer at interface
J:59 [ARG] A:252 [C] Ba:51 [GLY] B5:92 [C] ❌ 7O7Y_Ba:51 no longer at interface
J:59 [ARG] A:253 [G] Ba:51 [GLY] B5:93 [G] ❌ 7O7Y_Ba:51 no longer at interface
J:59 [ARG] A:2419 [A] Ba:51 [GLY] B5:4085 [A] ❌ 7O7Y_Ba:51 no longer at interface
J:59 [ARG] A:2420 [U] Ba:51 [GLY] B5:4086 [U] ❌ 7O7Y_Ba:51 no longer at interface
J:59 [ARG] A:2421 [C] Ba:51 [GLY] B5:4087 [C] ❌ 7O7Y_Ba:51 no longer at interface
J:110 [LYS] A:680 [C] Ba:111 [VAL] B5:1340 [G] ❌ 7O7Y_Ba:111 no longer at interface
J:110 [LYS] A:681 [G] Ba:111 [VAL] B5:1341 [A] ❌ 7O7Y_Ba:111 no longer at interface
J:76 [ILE] A:672 [A] Ba:73 [VAL] B5:1331 [A] ❌ 7O7Y_Ba:73 no longer at interface
J:76 [ILE] A:681 [G] Ba:73 [VAL] B5:1341 [A] ❌ 7O7Y_Ba:73 no longer at interface
J:71 [ARG] A:677 [A] Ba:68 [SER] B5:1336 [A] ❌ 7O7Y_Ba:68 no longer at interface
J:71 [ARG] A:679 [G] Ba:68 [SER] B5:1339 [U] ❌ 7O7Y_Ba:68 no longer at interface
J:71 [ARG] A:680 [C] Ba:68 [SER] B5:1340 [G] ❌ 7O7Y_Ba:68 no longer at interface
J:109 [ILE] A:679 [G] Ba:110 [LYS] B5:1339 [U] ❌ 6S0Z_J:109 no longer at interface
J:109 [ILE] A:680 [C] Ba:110 [LYS] B5:1340 [G] ❌ 6S0Z_J:109 no longer at interface
J:115 [GLY] A:682 [A] Ba:116 [LYS] B5:1342 [A] ❌ 6S0Z_J:115 no longer at interface
J:132 [ALA] A:681 [G] Ba:133 [ALA] B5:1341 [A] ❌ 6S0Z_J:132 no longer at interface
J:135 [ALA] A:682 [A] Ba:136 [LYS] B5:1342 [A] ❌ 6S0Z_J:135 no longer at interface
J:135 [ALA] A:681 [G] Ba:136 [LYS] B5:1341 [A] ❌ 6S0Z_J:135 no longer at interface
J:45 [GLY] A:877 [G] Ba:29 [PRO] B5:1636 [G] ❌ 6S0Z_J:45 no longer at interface
J:45 [GLY] A:876 [G] Ba:29 [PRO] B5:1635 [G] ❌ 6S0Z_J:45 no longer at interface
J:45 [GLY] A:199 [A] Ba:29 [PRO] B5:39 [A] ❌ 6S0Z_J:45 no longer at interface
J:45 [GLY] A:850 [G] Ba:29 [PRO] B5:1609 [G] ❌ 6S0Z_J:45 no longer at interface
J:49 [GLY] A:254 [A] Ba:35 [ALA] B5:94 [A] ❌ 6S0Z_J:49 no longer at interface
J:49 [GLY] A:255 [G] Ba:35 [ALA] B5:95 [G] ❌ 6S0Z_J:49 no longer at interface
J:49 [GLY] A:198 [A] Ba:35 [ALA] B5:38 [A] ❌ 6S0Z_J:49 no longer at interface
J:49 [GLY] A:199 [A] Ba:35 [ALA] B5:39 [A] ❌ 6S0Z_J:49 no longer at interface
J:56 [PRO] A:2455 [G] Ba:42 [ARG] B5:4122 [A] ❌ 6S0Z_J:56 no longer at interface
J:56 [PRO] A:878 [C] Ba:42 [ARG] B5:1637 [A] ❌ 6S0Z_J:56 no longer at interface
J:56 [PRO] A:2456 [G] Ba:42 [ARG] B5:4123 [G] ❌ 6S0Z_J:56 no longer at interface
J:56 [PRO] A:2419 [A] Ba:42 [ARG] B5:4085 [A] ❌ 6S0Z_J:56 no longer at interface
J:73 [GLU] A:680 [C] Ba:70 [CYS] B5:1340 [G] ❌ 6S0Z_J:73 no longer at interface
J:75 [ALA] A:680 [C] Ba:72 [THR] B5:1340 [G] ❌ 6S0Z_J:75 no longer at interface
J:77 [VAL] A:672 [A] Ba:74 [ASN] B5:1331 [A] ❌ 6S0Z_J:77 no longer at interface
J:77 [VAL] A:681 [G] Ba:74 [ASN] B5:1341 [A] ❌ 6S0Z_J:77 no longer at interface
J:80 [ASP] A:671 [U] Ba:77 [LYS] B5:1330 [C] ❌ 6S0Z_J:80 no longer at interface

logo_download Export the table of contacts

Properties of this pair

Common ECOD label(s)
 Common RFAM label(s)
 Interface TM-score
 Interface RMSD
 Percentage identity
 Protein TM-score
 RNA TM-score
 Protein coverage
 RNA coverage
 Percentage conservation
 Apolar conservation
 H-bond conservation
 Percentage switching out
Ribosomal proteins L15p and L18e 0.88 4.38 0.11 0.62 0.89 0.61 0.71 0.38 0.33 0.13 0.38


Other pairs involving 6S0Z_J_A or 7O7Y_Ba_B5

Total number of entries: 13

Interface 1 Interface 2 Percentage conservation
 		Interface TM-score
 		Interface RMSD
 		Percentage identity
 		Common ECOD label(s)
 		Common RFAM label(s)
 		Explore both interfaces
1VQ8_L_0 7O7Y_Ba_B5 0.62 0.93 2.45 0.36 Ribosomal proteins L15p and L18e compare
1VQ8_L_0 6S0Z_J_A 0.41 0.93 4.07 0.15 Ribosomal proteins L15p and L18e compare
1YHQ_L_0 6S0Z_J_A 0.41 0.93 4.03 0.15 Ribosomal proteins L15p and L18e compare
1YHQ_L_0 7O7Y_Ba_B5 0.62 0.93 2.36 0.35 Ribosomal proteins L15p and L18e compare
4Y4O_1P_1A 6S0Z_J_A 0.72 0.96 2.46 0.46 Ribosomal proteins L15p and L18e Bacterial large subunit ribosomal RNA compare
6AZ3_L_1 7O7Y_Ba_B5 0.86 0.92 0.75 0.6 Ribosomal proteins L15p and L18e Eukaryotic large subunit ribosomal RNA compare
6AZ3_L_1 6S0Z_J_A 0.36 0.72 4.24 0.11 Ribosomal proteins L15p and L18e compare
6AZ3_L_2 7O7Y_Ba_B5 0.97 0.91 0.6 0.67 Ribosomal proteins L15p and L18e Eukaryotic large subunit ribosomal RNA compare
6AZ3_L_2 6S0Z_J_A 0.29 0.81 5.35 0.13 Ribosomal proteins L15p and L18e compare
6S0Z_J_A 7RYG_K_A 0.78 0.97 1.41 0.47 Ribosomal proteins L15p and L18e Bacterial large subunit ribosomal RNA compare
6S0Z_J_A 7O7Y_Ba_B5 0.38 0.88 4.38 0.11 Ribosomal proteins L15p and L18e compare
6S0Z_J_A 7OF0_M_A 0.78 0.88 2.04 0.38 Ribosomal proteins L15p and L18e Bacterial large subunit ribosomal RNA compare
6S0Z_J_A 7K00_k_a 0.81 0.97 1.67 0.52 Ribosomal proteins L15p and L18e Bacterial large subunit ribosomal RNA compare