RNAprotDB

All interfaces > All interologs > Interface groups > group127 > 6S0Z_J_A vs 7OF0_M_A

Interface analysis


mouse controls

Style

Protein

Cartoon
Licorice
Surface

RNA

Cartoon
Licorice
Surface

Color

Structure
Structure (with hetatm)
Chain
Chainbow

View

Focus on

Interface
RNA
Protein
All

Show chains

Interface

show interface as licorice

Common contacts -

6S0Z_J
6S0Z_A
7OF0_M
7OF0_A
Conserved?
J:41 [ARG] A:716 [C] M:59 [ARG] A:1903 [C] ✔
J:41 [ARG] A:850 [G] M:59 [ARG] A:2015 [G] ✔
J:41 [ARG] A:851 [C] M:59 [ARG] A:2016 [C] ✔
J:41 [ARG] A:852 [U] M:59 [ARG] A:2017 [U] ✔
J:41 [ARG] A:853 [G] M:59 [ARG] A:2018 [G] ✔
J:53 [GLY] A:871 [U] M:70 [GLY] A:2035 [U] ✔
J:53 [GLY] A:2455 [G] M:70 [GLY] A:2916 [G] ✔
J:69 [ILE] A:247 [A] M:88 [SER] A:1744 [A] ✔
J:9 [ALA] A:641 [A] M:30 [ASN] A:1877 [U] ✔
J:9 [ALA] A:642 [U] M:30 [ASN] A:1878 [U] ✔
J:3 [LEU] A:1241 [A] M:24 [LEU] A:2278 [A] ✔
J:3 [LEU] A:1242 [A] M:24 [LEU] A:2279 [U] ✔
J:3 [LEU] A:1281 [U] M:24 [LEU] A:2287 [U] ✔
J:18 [ARG] A:1287 [U] M:39 [ARG] A:2293 [A] ✔
J:18 [ARG] A:1288 [G] M:39 [ARG] A:2294 [A] ✔
J:51 [GLU] A:870 [C] M:68 [GLU] A:2034 [A] ✔
J:51 [GLU] A:877 [G] M:68 [GLU] A:2041 [U] ✔
J:51 [GLU] A:878 [C] M:68 [GLU] A:2042 [U] ✔
J:34 [GLY] A:986 [G] M:52 [GLY] A:2094 [G] ✔
J:34 [GLY] A:987 [U] M:52 [GLY] A:2095 [U] ✔
J:34 [GLY] A:1228 [A] M:52 [GLY] A:2265 [A] ✔
J:34 [GLY] A:1229 [G] M:52 [GLY] A:2266 [U] ✔
J:29 [LYS] A:609 [U] M:47 [ARG] A:1847 [U] ✔
J:29 [LYS] A:855 [U] M:47 [ARG] A:2020 [U] ✔
J:29 [LYS] A:856 [U] M:47 [ARG] A:2021 [U] ✔
J:58 [PHE] A:253 [G] M:75 [TYR] A:1750 [G] ✔
J:55 [LEU] A:2419 [A] M:72 [THR] A:2897 [A] ✔
J:55 [LEU] A:2455 [G] M:72 [THR] A:2916 [G] ✔
J:55 [LEU] A:2456 [G] M:72 [THR] A:2917 [G] ✔
J:31 [SER] A:630 [G] M:49 [CYS] A:1868 [G] ✔
J:31 [SER] A:855 [U] M:49 [CYS] A:2020 [U] ✔
J:31 [SER] A:1229 [G] M:49 [CYS] A:2266 [U] ✔
J:30 [THR] A:630 [G] M:48 [LYS] A:1868 [G] ✔
J:30 [THR] A:855 [U] M:48 [LYS] A:2020 [U] ✔
J:30 [THR] A:1228 [A] M:48 [LYS] A:2265 [A] ✔
J:30 [THR] A:1229 [G] M:48 [LYS] A:2266 [U] ✔
J:19 [VAL] A:630 [G] M:40 [PRO] A:1868 [G] ✔
J:59 [ARG] A:253 [G] M:76 [ILE] A:1750 [G] ✔
J:59 [ARG] A:2420 [U] M:76 [ILE] A:2898 [U] ✔
J:84 [LYS] A:647 [G] M:103 [TYR] A:1883 [G] ✔
J:54 [GLN] A:870 [C] M:71 [GLN] A:2034 [A] ✔
J:54 [GLN] A:871 [U] M:71 [GLN] A:2035 [U] ✔
J:54 [GLN] A:2385 [A] M:71 [GLN] A:2866 [A] ✔
J:54 [GLN] A:2386 [C] M:71 [GLN] A:2867 [C] ✔
J:54 [GLN] A:2455 [G] M:71 [GLN] A:2916 [G] ✔
J:35 [HIS] A:610 [U] M:53 [HIS] A:1848 [U] ✔
J:35 [HIS] A:986 [G] M:53 [HIS] A:2094 [G] ✔
J:35 [HIS] A:987 [U] M:53 [HIS] A:2095 [U] ✔
J:35 [HIS] A:1228 [A] M:53 [HIS] A:2265 [A] ✔
J:40 [ALA] A:716 [C] M:58 [GLN] A:1903 [C] ✔
J:40 [ALA] A:854 [G] M:58 [GLN] A:2019 [G] ✔
J:8 [PRO] A:1282 [A] M:29 [PRO] A:2288 [A] ✔
J:8 [PRO] A:1283 [G] M:29 [PRO] A:2289 [G] ✔
J:47 [ARG] A:198 [A] M:64 [ARG] A:1723 [A] ✔
J:47 [ARG] A:199 [A] M:64 [ARG] A:1724 [A] ✔
J:47 [ARG] A:254 [A] M:64 [ARG] A:1751 [A] ✔
J:47 [ARG] A:255 [G] M:64 [ARG] A:1752 [U] ✔
J:60 [ARG] A:2387 [A] M:77 [ARG] A:2868 [C] ✔
J:60 [ARG] A:2419 [A] M:77 [ARG] A:2897 [A] ✔
J:60 [ARG] A:2420 [U] M:77 [ARG] A:2898 [U] ✔
J:60 [ARG] A:2455 [G] M:77 [ARG] A:2916 [G] ✔
J:60 [ARG] A:2456 [G] M:77 [ARG] A:2917 [G] ✔
J:16 [ARG] A:631 [U] M:37 [GLU] A:1869 [A] ✔
J:16 [ARG] A:707 [G] M:37 [GLU] A:1900 [A] ✔
J:16 [ARG] A:708 [G] M:37 [GLU] A:1901 [C] ✔
J:16 [ARG] A:1287 [U] M:37 [GLU] A:2293 [A] ✔
J:57 [LEU] A:2386 [C] M:74 [PHE] A:2867 [C] ✔
J:57 [LEU] A:2387 [A] M:74 [PHE] A:2868 [C] ✔
J:6 [LEU] A:1281 [U] M:27 [LEU] A:2287 [U] ✔
J:6 [LEU] A:1282 [A] M:27 [LEU] A:2288 [A] ✔
J:52 [GLY] A:199 [A] M:69 [GLY] A:1724 [A] ✔
J:52 [GLY] A:871 [U] M:69 [GLY] A:2035 [U] ✔
J:52 [GLY] A:873 [U] M:69 [GLY] A:2037 [U] ✔
J:52 [GLY] A:876 [G] M:69 [GLY] A:2040 [G] ✔
J:52 [GLY] A:877 [G] M:69 [GLY] A:2041 [U] ✔
J:52 [GLY] A:878 [C] M:69 [GLY] A:2042 [U] ✔
J:38 [GLN] A:199 [A] M:56 [GLU] A:1724 [A] ✔
J:38 [GLN] A:850 [G] M:56 [GLU] A:2015 [G] ✔
J:38 [GLN] A:851 [C] M:56 [GLU] A:2016 [C] ✔
J:38 [GLN] A:876 [G] M:56 [GLU] A:2040 [G] ✔
J:38 [GLN] A:877 [G] M:56 [GLU] A:2041 [U] ✔
J:50 [PHE] A:199 [A] M:67 [PHE] A:1724 [A] ✔
J:50 [PHE] A:877 [G] M:67 [PHE] A:2041 [U] ✔
J:50 [PHE] A:878 [C] M:67 [PHE] A:2042 [U] ✔
J:100 [GLY] A:647 [G] M:125 [ARG] A:1883 [G] ✔
J:37 [GLY] A:850 [G] M:55 [GLY] A:2015 [G] ✔
J:37 [GLY] A:851 [C] M:55 [GLY] A:2016 [C] ✔
J:37 [GLY] A:876 [G] M:55 [GLY] A:2040 [G] ✔
J:37 [GLY] A:877 [G] M:55 [GLY] A:2041 [U] ✔
J:26 [GLY] A:1230 [G] M:44 [ARG] A:2267 [U] ✔
J:15 [GLU] A:707 [G] M:36 [PRO] A:1900 [A] ✔
J:15 [GLU] A:1233 [A] M:36 [PRO] A:2270 [A] ✔
J:4 [HIS] A:1242 [A] M:25 [ALA] A:2279 [U] ✔
J:4 [HIS] A:1243 [G] M:25 [ALA] A:2280 [C] ✔
J:4 [HIS] A:1280 [U] M:25 [ALA] A:2286 [A] ✔
J:4 [HIS] A:1281 [U] M:25 [ALA] A:2287 [U] ✔
J:17 [ASN] A:707 [G] M:38 [ARG] A:1900 [A] ✔
J:17 [ASN] A:708 [G] M:38 [ARG] A:1901 [C] ✔
J:46 [VAL] A:199 [A] M:63 [PRO] A:1724 [A] ✔
J:46 [VAL] A:877 [G] M:63 [PRO] A:2041 [U] ✔
J:5 [GLU] A:1281 [U] M:26 [ASN] A:2287 [U] ✔
J:36 [LYS] A:610 [U] M:54 [LYS] A:1848 [U] ✔
J:36 [LYS] A:611 [U] M:54 [LYS] A:1849 [C] ✔
J:36 [LYS] A:852 [U] M:54 [LYS] A:2017 [U] ✔
J:36 [LYS] A:853 [G] M:54 [LYS] A:2018 [G] ✔
J:62 [PRO] A:2420 [U] M:79 [PRO] A:2898 [U] ✔
J:62 [PRO] A:2421 [C] M:79 [PRO] A:2899 [C] ✔
J:63 [LYS] A:252 [C] M:80 [LYS] A:1749 [C] ✔
J:63 [LYS] A:2420 [U] M:80 [LYS] A:2898 [U] ✔
J:63 [LYS] A:2421 [C] M:80 [LYS] A:2899 [C] ✔
J:63 [LYS] A:2422 [C] M:80 [LYS] A:2900 [C] ✔
J:7 [LYS] A:1281 [U] M:28 [LYS] A:2287 [U] ✔
J:7 [LYS] A:1282 [A] M:28 [LYS] A:2288 [A] ✔
J:12 [SER] A:640 [G] M:33 [SER] A:1876 [U] ✔
J:12 [SER] A:641 [A] M:33 [SER] A:1877 [U] ✔
J:12 [SER] A:706 [U] M:33 [SER] A:1899 [G] ✔
J:33 [ARG] A:630 [G] M:51 [ARG] A:1868 [G] ✔
J:33 [ARG] A:716 [C] M:51 [ARG] A:1903 [C] ✔
J:33 [ARG] A:986 [G] M:51 [ARG] A:2094 [G] ✔
J:33 [ARG] A:1229 [G] M:51 [ARG] A:2266 [U] ✔
J:11 [GLY] A:640 [G] M:32 [GLY] A:1876 [U] ✔
J:11 [GLY] A:641 [A] M:32 [GLY] A:1877 [U] ✔
J:61 [LEU] A:2387 [A] M:78 [ILE] A:2868 [C] ✔
J:61 [LEU] A:2420 [U] M:78 [ILE] A:2898 [U] ✔
J:61 [LEU] A:2421 [C] M:78 [ILE] A:2899 [C] ✔
J:13 [ARG] A:705 [U] M:34 [LYS] A:1898 [A] ✔
J:13 [ARG] A:706 [U] M:34 [LYS] A:1899 [G] ✔
J:13 [ARG] A:1283 [G] M:34 [LYS] A:2289 [G] ✔
J:103 [LYS] A:647 [G] M:128 [THR] A:1883 [G] ✔
J:103 [LYS] A:648 [G] M:128 [THR] A:1884 [G] ✔
J:103 [LYS] A:668 [C] M:128 [THR] A:1889 [C] ✔
J:103 [LYS] A:669 [C] M:128 [THR] A:1890 [C] ✔
J:103 [LYS] A:670 [G] M:128 [THR] A:1891 [A] ✔
J:28 [GLY] A:856 [U] M:46 [GLY] A:2021 [U] ✔
J:14 [LYS] A:706 [U] M:35 [LYS] A:1899 [G] ✔
J:14 [LYS] A:707 [G] M:35 [LYS] A:1900 [A] ✔
J:14 [LYS] A:1232 [G] M:35 [LYS] A:2269 [G] ✔
J:32 [GLY] A:985 [A] M:50 [GLY] A:2093 [U] ✔
J:32 [GLY] A:986 [G] M:50 [GLY] A:2094 [G] ✔
J:32 [GLY] A:1229 [G] M:50 [GLY] A:2266 [U] ✔
J:32 [GLY] A:1230 [G] M:50 [GLY] A:2267 [U] ✔
J:39 [LYS] A:877 [G] M:57 [ARG] A:2041 [U] ✔
J:39 [LYS] A:878 [C] M:57 [ARG] A:2042 [U] ✔
J:39 [LYS] A:986 [G] M:57 [ARG] A:2094 [G] ✔
J:21 [ARG] A:630 [G] M:41 [ARG] A:1868 [G] ✔
J:21 [ARG] A:856 [U] M:41 [ARG] A:2021 [U] ✔
J:21 [ARG] A:857 [C] M:41 [ARG] A:2022 [G] ✔
J:21 [ARG] A:1287 [U] M:41 [ARG] A:2293 [A] ✔
J:21 [ARG] A:1288 [G] M:41 [ARG] A:2294 [A] ✔
J:23 [VAL] A:858 [U] M:43 [ARG] A:2023 [U] ✔
J:22 [GLY] A:856 [U] M:42 [GLY] A:2021 [U] ✔
J:22 [GLY] A:857 [C] M:42 [GLY] A:2022 [G] ✔
J:22 [GLY] A:858 [U] M:42 [GLY] A:2023 [U] ✔
J:10 [GLU] A:641 [A] M:31 [PRO] A:1877 [U] ✔
J:18 [ARG] A:857 [C] M:39 [ARG] A:2022 [G] ❌ 7OF0_M_A
J:29 [LYS] A:610 [U] M:47 [ARG] A:1848 [U] ❌ 7OF0_M_A
J:44 [GLY] A:716 [C] M:61 [THR] A:1903 [C] ❌ 7OF0_M_A
J:59 [ARG] A:252 [C] M:76 [ILE] A:1749 [C] ❌ 7OF0_M_A
J:59 [ARG] A:2419 [A] M:76 [ILE] A:2897 [A] ❌ 7OF0_M_A
J:59 [ARG] A:2421 [C] M:76 [ILE] A:2899 [C] ❌ 7OF0_M_A
J:35 [HIS] A:611 [U] M:53 [HIS] A:1849 [C] ❌ 7OF0_M_A
J:27 [ASN] A:1230 [G] M:45 [ARG] A:2267 [U] ❌ 7OF0_M_A
J:60 [ARG] A:2386 [C] M:77 [ARG] A:2867 [C] ❌ 7OF0_M_A
J:26 [GLY] A:1229 [G] M:44 [ARG] A:2266 [U] ❌ 7OF0_M_A
J:15 [GLU] A:1234 [G] M:36 [PRO] A:2271 [C] ❌ 7OF0_M_A
J:17 [ASN] A:631 [U] M:38 [ARG] A:1869 [A] ❌ 7OF0_M_A
J:46 [VAL] A:878 [C] M:63 [PRO] A:2042 [U] ❌ 7OF0_M_A
J:36 [LYS] A:877 [G] M:54 [LYS] A:2041 [U] ❌ 7OF0_M_A
J:36 [LYS] A:987 [U] M:54 [LYS] A:2095 [U] ❌ 7OF0_M_A
J:33 [ARG] A:987 [U] M:51 [ARG] A:2095 [U] ❌ 7OF0_M_A
J:28 [GLY] A:855 [U] M:46 [GLY] A:2020 [U] ❌ 7OF0_M_A
J:14 [LYS] A:1233 [A] M:35 [LYS] A:2270 [A] ❌ 7OF0_M_A
J:21 [ARG] A:855 [U] M:41 [ARG] A:2020 [U] ❌ 7OF0_M_A
J:21 [ARG] A:858 [U] M:41 [ARG] A:2023 [U] ❌ 7OF0_M_A
J:23 [VAL] A:857 [C] M:43 [ARG] A:2022 [G] ❌ 7OF0_M_A
J:81 [GLN] A:647 [G] M:100 [ARG] A:1883 [G] ❌ 6S0Z_J_A
J:12 [SER] A:705 [U] M:33 [SER] A:1898 [A] ❌ 6S0Z_J_A
J:13 [ARG] A:1282 [A] M:34 [LYS] A:2288 [A] ❌ 6S0Z_J_A
J:17 [ASN] A:1232 [G] M:38 [ARG] A:2269 [G] ❌ 6S0Z_J_A
J:17 [ASN] A:1233 [A] M:38 [ARG] A:2270 [A] ❌ 6S0Z_J_A
J:17 [ASN] A:715 [A] M:38 [ARG] A:1902 [C] ❌ 6S0Z_J_A
J:17 [ASN] A:1234 [G] M:38 [ARG] A:2271 [C] ❌ 6S0Z_J_A
J:18 [ARG] A:708 [G] M:39 [ARG] A:1901 [C] ❌ 6S0Z_J_A
J:19 [VAL] A:715 [A] M:40 [PRO] A:1902 [C] ❌ 6S0Z_J_A
J:19 [VAL] A:856 [U] M:40 [PRO] A:2021 [U] ❌ 6S0Z_J_A
J:23 [VAL] A:859 [C] M:43 [ARG] A:2024 [C] ❌ 6S0Z_J_A
J:23 [VAL] A:860 [U] M:43 [ARG] A:2025 [C] ❌ 6S0Z_J_A
J:26 [GLY] A:1232 [G] M:44 [ARG] A:2269 [G] ❌ 6S0Z_J_A
J:26 [GLY] A:859 [C] M:44 [ARG] A:2024 [C] ❌ 6S0Z_J_A
J:26 [GLY] A:860 [U] M:44 [ARG] A:2025 [C] ❌ 6S0Z_J_A
J:26 [GLY] A:1231 [A] M:44 [ARG] A:2268 [G] ❌ 6S0Z_J_A
J:27 [ASN] A:1232 [G] M:45 [ARG] A:2269 [G] ❌ 6S0Z_J_A
J:27 [ASN] A:1233 [A] M:45 [ARG] A:2270 [A] ❌ 6S0Z_J_A
J:27 [ASN] A:859 [C] M:45 [ARG] A:2024 [C] ❌ 6S0Z_J_A
J:27 [ASN] A:858 [U] M:45 [ARG] A:2023 [U] ❌ 6S0Z_J_A
J:27 [ASN] A:1231 [A] M:45 [ARG] A:2268 [G] ❌ 6S0Z_J_A
J:29 [LYS] A:1228 [A] M:47 [ARG] A:2265 [A] ❌ 6S0Z_J_A
J:30 [THR] A:609 [U] M:48 [LYS] A:1847 [U] ❌ 6S0Z_J_A
J:30 [THR] A:610 [U] M:48 [LYS] A:1848 [U] ❌ 6S0Z_J_A
J:33 [ARG] A:715 [A] M:51 [ARG] A:1902 [C] ❌ 6S0Z_J_A
J:33 [ARG] A:1228 [A] M:51 [ARG] A:2265 [A] ❌ 6S0Z_J_A
J:36 [LYS] A:851 [C] M:54 [LYS] A:2016 [C] ❌ 6S0Z_J_A
J:36 [LYS] A:876 [G] M:54 [LYS] A:2040 [G] ❌ 6S0Z_J_A
J:39 [LYS] A:876 [G] M:57 [ARG] A:2040 [G] ❌ 6S0Z_J_A
J:39 [LYS] A:987 [U] M:57 [ARG] A:2095 [U] ❌ 6S0Z_J_A
J:40 [ALA] A:630 [G] M:58 [GLN] A:1868 [G] ❌ 6S0Z_J_A
J:40 [ALA] A:855 [U] M:58 [GLN] A:2020 [U] ❌ 6S0Z_J_A
J:44 [GLY] A:850 [G] M:61 [THR] A:2015 [G] ❌ 6S0Z_J_A
J:52 [GLY] A:870 [C] M:69 [GLY] A:2034 [A] ❌ 6S0Z_J_A
J:53 [GLY] A:876 [G] M:70 [GLY] A:2040 [G] ❌ 6S0Z_J_A
J:53 [GLY] A:199 [A] M:70 [GLY] A:1724 [A] ❌ 6S0Z_J_A
J:58 [PHE] A:254 [A] M:75 [TYR] A:1751 [A] ❌ 6S0Z_J_A
J:59 [ARG] A:254 [A] M:76 [ILE] A:1751 [A] ❌ 6S0Z_J_A
J:61 [LEU] A:2419 [A] M:78 [ILE] A:2897 [A] ❌ 6S0Z_J_A
J:63 [LYS] A:253 [G] M:80 [LYS] A:1750 [G] ❌ 6S0Z_J_A
J:68 [ASN] A:247 [A] M:87 [HIS] A:1744 [A] ❌ 6S0Z_J_A
J:70 [ASN] A:248 [G] M:89 [PHE] A:1745 [U] ❌ 6S0Z_J_A
J:70 [ASN] A:247 [A] M:89 [PHE] A:1744 [A] ❌ 6S0Z_J_A
J:18 [ARG] A:1235 [C] M:39 [ARG] A:2272 [C] ❌ 7OF0_A:2272 no longer at interface
J:18 [ARG] A:1236 [G] M:39 [ARG] A:2273 [A] ❌ 7OF0_A:2273 no longer at interface
J:16 [ARG] A:632 [U] M:37 [GLU] A:1870 [A] ❌ 7OF0_A:1870 no longer at interface
J:64 [ARG] A:2444 [C] M:81 [TYR] A:2905 [A] ❌ 7OF0_M:81, 7OF0_A:2905 no longer at interface
J:13 [ARG] A:1284 [A] M:34 [LYS] A:2290 [A] ❌ 7OF0_A:2290 no longer at interface
J:103 [LYS] A:649 [U] M:128 [THR] A:1885 [A] ❌ 7OF0_A:1885 no longer at interface
J:42 [SER] A:717 [C] M:60 [GLY] A:1904 [C] ❌ 7OF0_M:60, 7OF0_A:1904 no longer at interface
J:81 [GLN] A:646 [A] M:100 [ARG] A:1882 [A] ❌ 6S0Z_A:646 no longer at interface
J:84 [LYS] A:646 [A] M:103 [TYR] A:1882 [A] ❌ 6S0Z_A:646 no longer at interface
J:21 [ARG] A:629 [A] M:41 [ARG] A:1867 [A] ❌ 6S0Z_A:629 no longer at interface
J:23 [VAL] A:1227 [U] M:43 [ARG] A:2264 [A] ❌ 6S0Z_A:1227 no longer at interface
J:26 [GLY] A:861 [C] M:44 [ARG] A:2026 [A] ❌ 6S0Z_A:861 no longer at interface
J:29 [LYS] A:1227 [U] M:47 [ARG] A:2264 [A] ❌ 6S0Z_A:1227 no longer at interface
J:35 [HIS] A:1227 [U] M:53 [HIS] A:2264 [A] ❌ 6S0Z_A:1227 no longer at interface
J:39 [LYS] A:988 [C] M:57 [ARG] A:2096 [U] ❌ 6S0Z_A:988 no longer at interface
J:44 [GLY] A:849 [A] M:61 [THR] A:2014 [A] ❌ 6S0Z_A:849 no longer at interface
J:61 [LEU] A:2388 [A] M:78 [ILE] A:2869 [A] ❌ 6S0Z_A:2388 no longer at interface
J:63 [LYS] A:250 [G] M:80 [LYS] A:1747 [G] ❌ 6S0Z_A:250 no longer at interface
J:68 [ASN] A:246 [U] M:87 [HIS] A:1743 [U] ❌ 6S0Z_A:246 no longer at interface
J:69 [ILE] A:246 [U] M:88 [SER] A:1743 [U] ❌ 6S0Z_A:246 no longer at interface
J:104 [ASN] A:668 [C] M:129 [ILE] A:1889 [C] ❌ 7OF0_M:129 no longer at interface
J:99 [SER] A:647 [G] M:124 [GLY] A:1883 [G] ❌ 7OF0_M:124 no longer at interface
J:67 [THR] A:247 [A] M:86 [GLY] A:1744 [A] ❌ 7OF0_M:86 no longer at interface
J:67 [THR] A:248 [G] M:86 [GLY] A:1745 [U] ❌ 7OF0_M:86 no longer at interface
J:42 [SER] A:715 [A] M:60 [GLY] A:1902 [C] ❌ 7OF0_M:60 no longer at interface
J:42 [SER] A:716 [C] M:60 [GLY] A:1903 [C] ❌ 7OF0_M:60 no longer at interface
J:2 [LYS] A:1242 [A] M:23 [SER] A:2279 [U] ❌ 6S0Z_J:2 no longer at interface
J:45 [GLY] A:986 [G] M:62 [ARG] A:2094 [G] ❌ 6S0Z_J:45 no longer at interface
J:45 [GLY] A:878 [C] M:62 [ARG] A:2042 [U] ❌ 6S0Z_J:45 no longer at interface
J:45 [GLY] A:985 [A] M:62 [ARG] A:2093 [U] ❌ 6S0Z_J:45 no longer at interface
J:45 [GLY] A:877 [G] M:62 [ARG] A:2041 [U] ❌ 6S0Z_J:45 no longer at interface
J:75 [ALA] A:670 [G] M:94 [LYS] A:1891 [A] ❌ 6S0Z_J:75 no longer at interface

logo_download Export the table of contacts

Properties of this pair

Common ECOD label(s)
 Common RFAM label(s)
 Interface TM-score
 Interface RMSD
 Percentage identity
 Protein TM-score
 RNA TM-score
 Protein coverage
 RNA coverage
 Percentage conservation
 Apolar conservation
 H-bond conservation
 Percentage switching out
Ribosomal proteins L15p and L18e Bacterial large subunit ribosomal RNA 0.88 2.04 0.38 0.83 0.96 0.82 0.81 0.78 0.76 0.37 0.33


Other pairs involving 6S0Z_J_A or 7OF0_M_A

Total number of entries: 11

Interface 1 Interface 2 Percentage conservation
 		Interface TM-score
 		Interface RMSD
 		Percentage identity
 		Common ECOD label(s)
 		Common RFAM label(s)
 		Explore both interfaces
1VQ8_L_0 6S0Z_J_A 0.41 0.93 4.07 0.15 Ribosomal proteins L15p and L18e compare
1YHQ_L_0 6S0Z_J_A 0.41 0.93 4.03 0.15 Ribosomal proteins L15p and L18e compare
4Y4O_1P_1A 7OF0_M_A 0.69 0.89 2.15 0.33 Ribosomal proteins L15p and L18e Bacterial large subunit ribosomal RNA compare
4Y4O_1P_1A 6S0Z_J_A 0.72 0.96 2.46 0.46 Ribosomal proteins L15p and L18e Bacterial large subunit ribosomal RNA compare
6AZ3_L_1 6S0Z_J_A 0.36 0.72 4.24 0.11 Ribosomal proteins L15p and L18e compare
6AZ3_L_2 6S0Z_J_A 0.29 0.81 5.35 0.13 Ribosomal proteins L15p and L18e compare
6S0Z_J_A 7RYG_K_A 0.78 0.97 1.41 0.47 Ribosomal proteins L15p and L18e Bacterial large subunit ribosomal RNA compare
6S0Z_J_A 7O7Y_Ba_B5 0.38 0.88 4.38 0.11 Ribosomal proteins L15p and L18e compare
6S0Z_J_A 7OF0_M_A 0.78 0.88 2.04 0.38 Ribosomal proteins L15p and L18e Bacterial large subunit ribosomal RNA compare
6S0Z_J_A 7K00_k_a 0.81 0.97 1.67 0.52 Ribosomal proteins L15p and L18e Bacterial large subunit ribosomal RNA compare
7OF0_M_A 7RYG_K_A 0.68 0.85 2.79 0.38 Ribosomal proteins L15p and L18e Bacterial large subunit ribosomal RNA compare