RNAprotDB

All interfaces > All interologs > Interface groups > group127 > 6S0Z_J_A vs 7RYG_K_A

Interface analysis


mouse controls

Style

Protein

Cartoon
Licorice
Surface

RNA

Cartoon
Licorice
Surface

Color

Structure
Structure (with hetatm)
Chain
Chainbow

View

Focus on

Interface
RNA
Protein
All

Show chains

Interface

show interface as licorice

Common contacts -

6S0Z_J
6S0Z_A
7RYG_K
7RYG_A
Conserved?
J:43 [GLY] A:715 [A] K:45 [SER] A:668 [A] ✔
J:43 [GLY] A:716 [C] K:45 [SER] A:669 [C] ✔
J:41 [ARG] A:716 [C] K:43 [ARG] A:669 [C] ✔
J:41 [ARG] A:850 [G] K:43 [ARG] A:803 [G] ✔
J:41 [ARG] A:851 [C] K:43 [ARG] A:804 [C] ✔
J:41 [ARG] A:852 [U] K:43 [ARG] A:805 [U] ✔
J:41 [ARG] A:853 [G] K:43 [ARG] A:806 [G] ✔
J:113 [GLY] A:672 [A] K:114 [LEU] A:625 [A] ✔
J:113 [GLY] A:682 [A] K:114 [LEU] A:635 [A] ✔
J:53 [GLY] A:871 [U] K:55 [GLY] A:824 [U] ✔
J:53 [GLY] A:2455 [G] K:55 [GLY] A:2424 [G] ✔
J:69 [ILE] A:247 [A] K:71 [GLN] A:251 [A] ✔
J:9 [ALA] A:641 [A] K:11 [ALA] A:596 [U] ✔
J:9 [ALA] A:642 [U] K:11 [ALA] A:597 [A] ✔
J:3 [LEU] A:1241 [A] K:5 [LEU] A:1197 [G] ✔
J:3 [LEU] A:1242 [A] K:5 [LEU] A:1198 [U] ✔
J:3 [LEU] A:1281 [U] K:5 [LEU] A:1238 [C] ✔
J:18 [ARG] A:857 [C] K:20 [ARG] A:810 [C] ✔
J:18 [ARG] A:1235 [C] K:20 [ARG] A:1191 [C] ✔
J:18 [ARG] A:1287 [U] K:20 [ARG] A:1244 [U] ✔
J:18 [ARG] A:1288 [G] K:20 [ARG] A:1245 [G] ✔
J:66 [PHE] A:676 [A] K:68 [PHE] A:629 [A] ✔
J:66 [PHE] A:677 [A] K:68 [PHE] A:630 [A] ✔
J:66 [PHE] A:2430 [C] K:68 [PHE] A:2399 [C] ✔
J:66 [PHE] A:2431 [C] K:68 [PHE] A:2400 [U] ✔
J:66 [PHE] A:2441 [G] K:68 [PHE] A:2410 [G] ✔
J:66 [PHE] A:2442 [G] K:68 [PHE] A:2411 [G] ✔
J:51 [GLU] A:870 [C] K:53 [GLU] A:823 [A] ✔
J:51 [GLU] A:877 [G] K:53 [GLU] A:830 [U] ✔
J:51 [GLU] A:878 [C] K:53 [GLU] A:831 [A] ✔
J:34 [GLY] A:986 [G] K:36 [GLY] A:939 [G] ✔
J:34 [GLY] A:987 [U] K:36 [GLY] A:940 [A] ✔
J:34 [GLY] A:1228 [A] K:36 [GLY] A:1184 [A] ✔
J:34 [GLY] A:1229 [G] K:36 [GLY] A:1185 [G] ✔
J:29 [LYS] A:609 [U] K:31 [LYS] A:564 [U] ✔
J:29 [LYS] A:610 [U] K:31 [LYS] A:565 [U] ✔
J:29 [LYS] A:855 [U] K:31 [LYS] A:808 [U] ✔
J:29 [LYS] A:856 [U] K:31 [LYS] A:809 [U] ✔
J:58 [PHE] A:253 [G] K:60 [TYR] A:257 [G] ✔
J:55 [LEU] A:2419 [A] K:57 [THR] A:2388 [A] ✔
J:55 [LEU] A:2455 [G] K:57 [THR] A:2424 [G] ✔
J:55 [LEU] A:2456 [G] K:57 [THR] A:2425 [G] ✔
J:20 [GLY] A:855 [U] K:22 [GLY] A:808 [U] ✔
J:20 [GLY] A:856 [U] K:22 [GLY] A:809 [U] ✔
J:31 [SER] A:1229 [G] K:33 [GLY] A:1185 [G] ✔
J:30 [THR] A:630 [G] K:32 [THR] A:585 [C] ✔
J:30 [THR] A:855 [U] K:32 [THR] A:808 [U] ✔
J:30 [THR] A:1228 [A] K:32 [THR] A:1184 [A] ✔
J:30 [THR] A:1229 [G] K:32 [THR] A:1185 [G] ✔
J:65 [GLY] A:676 [A] K:67 [GLY] A:629 [A] ✔
J:65 [GLY] A:2442 [G] K:67 [GLY] A:2411 [G] ✔
J:65 [GLY] A:2443 [C] K:67 [GLY] A:2412 [C] ✔
J:19 [VAL] A:630 [G] K:21 [LEU] A:585 [C] ✔
J:44 [GLY] A:716 [C] K:46 [GLY] A:669 [C] ✔
J:114 [ASN] A:672 [A] K:115 [SER] A:625 [A] ✔
J:59 [ARG] A:253 [G] K:61 [ARG] A:257 [G] ✔
J:59 [ARG] A:2420 [U] K:61 [ARG] A:2389 [U] ✔
J:59 [ARG] A:2458 [U] K:61 [ARG] A:2427 [U] ✔
J:54 [GLN] A:870 [C] K:56 [GLN] A:823 [A] ✔
J:54 [GLN] A:871 [U] K:56 [GLN] A:824 [U] ✔
J:54 [GLN] A:2385 [A] K:56 [GLN] A:2354 [A] ✔
J:54 [GLN] A:2386 [C] K:56 [GLN] A:2355 [C] ✔
J:54 [GLN] A:2455 [G] K:56 [GLN] A:2424 [G] ✔
J:35 [HIS] A:610 [U] K:37 [ILE] A:565 [U] ✔
J:35 [HIS] A:611 [U] K:37 [ILE] A:566 [U] ✔
J:35 [HIS] A:986 [G] K:37 [ILE] A:939 [G] ✔
J:35 [HIS] A:987 [U] K:37 [ILE] A:940 [A] ✔
J:35 [HIS] A:1228 [A] K:37 [ILE] A:1184 [A] ✔
J:27 [ASN] A:1230 [G] K:29 [VAL] A:1186 [G] ✔
J:40 [ALA] A:716 [C] K:42 [SER] A:669 [C] ✔
J:8 [PRO] A:1282 [A] K:10 [PRO] A:1239 [A] ✔
J:8 [PRO] A:1283 [G] K:10 [PRO] A:1240 [G] ✔
J:110 [LYS] A:680 [C] K:111 [ARG] A:633 [C] ✔
J:110 [LYS] A:681 [G] K:111 [ARG] A:634 [G] ✔
J:47 [ARG] A:198 [A] K:49 [ARG] A:202 [A] ✔
J:47 [ARG] A:199 [A] K:49 [ARG] A:203 [A] ✔
J:47 [ARG] A:254 [A] K:49 [ARG] A:258 [A] ✔
J:47 [ARG] A:255 [G] K:49 [ARG] A:259 [G] ✔
J:25 [THR] A:857 [C] K:27 [SER] A:810 [C] ✔
J:25 [THR] A:858 [U] K:27 [SER] A:811 [U] ✔
J:25 [THR] A:859 [C] K:27 [SER] A:812 [C] ✔
J:25 [THR] A:1232 [G] K:27 [SER] A:1188 [G] ✔
J:60 [ARG] A:2386 [C] K:62 [ARG] A:2355 [C] ✔
J:60 [ARG] A:2387 [A] K:62 [ARG] A:2356 [A] ✔
J:60 [ARG] A:2419 [A] K:62 [ARG] A:2388 [A] ✔
J:60 [ARG] A:2420 [U] K:62 [ARG] A:2389 [U] ✔
J:60 [ARG] A:2455 [G] K:62 [ARG] A:2424 [G] ✔
J:16 [ARG] A:707 [G] K:18 [HIS] A:660 [G] ✔
J:16 [ARG] A:708 [G] K:18 [HIS] A:661 [G] ✔
J:16 [ARG] A:1287 [U] K:18 [HIS] A:1244 [U] ✔
J:57 [LEU] A:2386 [C] K:59 [ILE] A:2355 [C] ✔
J:57 [LEU] A:2387 [A] K:59 [ILE] A:2356 [A] ✔
J:48 [PRO] A:711 [G] K:50 [PRO] A:664 [A] ✔
J:6 [LEU] A:1281 [U] K:8 [LEU] A:1238 [C] ✔
J:6 [LEU] A:1282 [A] K:8 [LEU] A:1239 [A] ✔
J:64 [ARG] A:676 [A] K:66 [PHE] A:629 [A] ✔
J:64 [ARG] A:2442 [G] K:66 [PHE] A:2411 [G] ✔
J:64 [ARG] A:2443 [C] K:66 [PHE] A:2412 [C] ✔
J:52 [GLY] A:199 [A] K:54 [GLY] A:203 [A] ✔
J:52 [GLY] A:871 [U] K:54 [GLY] A:824 [U] ✔
J:52 [GLY] A:873 [U] K:54 [GLY] A:826 [U] ✔
J:52 [GLY] A:876 [G] K:54 [GLY] A:829 [G] ✔
J:52 [GLY] A:877 [G] K:54 [GLY] A:830 [U] ✔
J:52 [GLY] A:878 [C] K:54 [GLY] A:831 [A] ✔
J:38 [GLN] A:199 [A] K:40 [GLN] A:203 [A] ✔
J:38 [GLN] A:850 [G] K:40 [GLN] A:803 [G] ✔
J:38 [GLN] A:851 [C] K:40 [GLN] A:804 [C] ✔
J:38 [GLN] A:876 [G] K:40 [GLN] A:829 [G] ✔
J:38 [GLN] A:877 [G] K:40 [GLN] A:830 [U] ✔
J:50 [PHE] A:199 [A] K:52 [PHE] A:203 [A] ✔
J:50 [PHE] A:877 [G] K:52 [PHE] A:830 [U] ✔
J:50 [PHE] A:878 [C] K:52 [PHE] A:831 [A] ✔
J:37 [GLY] A:850 [G] K:39 [GLY] A:803 [G] ✔
J:37 [GLY] A:851 [C] K:39 [GLY] A:804 [C] ✔
J:37 [GLY] A:876 [G] K:39 [GLY] A:829 [G] ✔
J:37 [GLY] A:877 [G] K:39 [GLY] A:830 [U] ✔
J:15 [GLU] A:707 [G] K:17 [GLU] A:660 [G] ✔
J:131 [SER] A:682 [A] K:132 [GLY] A:635 [A] ✔
J:128 [PHE] A:681 [G] K:129 [LEU] A:634 [G] ✔
J:4 [HIS] A:1242 [A] K:6 [ASN] A:1198 [U] ✔
J:4 [HIS] A:1280 [U] K:6 [ASN] A:1237 [U] ✔
J:4 [HIS] A:1281 [U] K:6 [ASN] A:1238 [C] ✔
J:17 [ASN] A:631 [U] K:19 [ARG] A:586 [U] ✔
J:17 [ASN] A:707 [G] K:19 [ARG] A:660 [G] ✔
J:17 [ASN] A:708 [G] K:19 [ARG] A:661 [G] ✔
J:46 [VAL] A:711 [G] K:48 [VAL] A:664 [A] ✔
J:46 [VAL] A:877 [G] K:48 [VAL] A:830 [U] ✔
J:46 [VAL] A:878 [C] K:48 [VAL] A:831 [A] ✔
J:130 [ALA] A:681 [G] K:131 [LYS] A:634 [G] ✔
J:5 [GLU] A:1281 [U] K:7 [GLU] A:1238 [C] ✔
J:36 [LYS] A:610 [U] K:38 [LYS] A:565 [U] ✔
J:36 [LYS] A:611 [U] K:38 [LYS] A:566 [U] ✔
J:36 [LYS] A:852 [U] K:38 [LYS] A:805 [U] ✔
J:36 [LYS] A:853 [G] K:38 [LYS] A:806 [G] ✔
J:36 [LYS] A:2475 [A] K:38 [LYS] A:2444 [A] ✔
J:62 [PRO] A:2420 [U] K:64 [PRO] A:2389 [U] ✔
J:62 [PRO] A:2421 [C] K:64 [PRO] A:2390 [C] ✔
J:63 [LYS] A:252 [C] K:65 [LYS] A:256 [C] ✔
J:63 [LYS] A:2420 [U] K:65 [LYS] A:2389 [U] ✔
J:63 [LYS] A:2421 [C] K:65 [LYS] A:2390 [C] ✔
J:63 [LYS] A:2422 [C] K:65 [LYS] A:2391 [C] ✔
J:63 [LYS] A:2443 [C] K:65 [LYS] A:2412 [C] ✔
J:7 [LYS] A:1281 [U] K:9 [ALA] A:1238 [C] ✔
J:7 [LYS] A:1282 [A] K:9 [ALA] A:1239 [A] ✔
J:12 [SER] A:640 [G] K:14 [ALA] A:595 [G] ✔
J:12 [SER] A:641 [A] K:14 [ALA] A:596 [U] ✔
J:12 [SER] A:706 [U] K:14 [ALA] A:659 [U] ✔
J:33 [ARG] A:630 [G] K:35 [ARG] A:585 [C] ✔
J:33 [ARG] A:716 [C] K:35 [ARG] A:669 [C] ✔
J:33 [ARG] A:986 [G] K:35 [ARG] A:939 [G] ✔
J:33 [ARG] A:987 [U] K:35 [ARG] A:940 [A] ✔
J:33 [ARG] A:1229 [G] K:35 [ARG] A:1185 [G] ✔
J:11 [GLY] A:640 [G] K:13 [GLY] A:595 [G] ✔
J:11 [GLY] A:641 [A] K:13 [GLY] A:596 [U] ✔
J:61 [LEU] A:2387 [A] K:63 [LEU] A:2356 [A] ✔
J:61 [LEU] A:2420 [U] K:63 [LEU] A:2389 [U] ✔
J:61 [LEU] A:2421 [C] K:63 [LEU] A:2390 [C] ✔
J:24 [ALA] A:858 [U] K:26 [GLY] A:811 [U] ✔
J:24 [ALA] A:859 [C] K:26 [GLY] A:812 [C] ✔
J:13 [ARG] A:705 [U] K:15 [LYS] A:658 [C] ✔
J:13 [ARG] A:706 [U] K:15 [LYS] A:659 [U] ✔
J:13 [ARG] A:1283 [G] K:15 [LYS] A:1240 [G] ✔
J:68 [ASN] A:677 [A] K:70 [SER] A:630 [A] ✔
J:68 [ASN] A:678 [A] K:70 [SER] A:631 [A] ✔
J:112 [LEU] A:672 [A] K:113 [VAL] A:625 [A] ✔
J:112 [LEU] A:681 [G] K:113 [VAL] A:634 [G] ✔
J:112 [LEU] A:682 [A] K:113 [VAL] A:635 [A] ✔
J:28 [GLY] A:856 [U] K:30 [GLY] A:809 [U] ✔
J:14 [LYS] A:706 [U] K:16 [ARG] A:659 [U] ✔
J:14 [LYS] A:707 [G] K:16 [ARG] A:660 [G] ✔
J:14 [LYS] A:1232 [G] K:16 [ARG] A:1188 [G] ✔
J:14 [LYS] A:1233 [A] K:16 [ARG] A:1189 [A] ✔
J:71 [ARG] A:678 [A] K:73 [ALA] A:631 [A] ✔
J:32 [GLY] A:985 [A] K:34 [GLY] A:938 [A] ✔
J:32 [GLY] A:986 [G] K:34 [GLY] A:939 [G] ✔
J:32 [GLY] A:1229 [G] K:34 [GLY] A:1185 [G] ✔
J:32 [GLY] A:1230 [G] K:34 [GLY] A:1186 [G] ✔
J:39 [LYS] A:877 [G] K:41 [LYS] A:830 [U] ✔
J:39 [LYS] A:878 [C] K:41 [LYS] A:831 [A] ✔
J:39 [LYS] A:986 [G] K:41 [LYS] A:939 [G] ✔
J:21 [ARG] A:630 [G] K:23 [ARG] A:585 [C] ✔
J:21 [ARG] A:855 [U] K:23 [ARG] A:808 [U] ✔
J:21 [ARG] A:856 [U] K:23 [ARG] A:809 [U] ✔
J:21 [ARG] A:857 [C] K:23 [ARG] A:810 [C] ✔
J:21 [ARG] A:858 [U] K:23 [ARG] A:811 [U] ✔
J:21 [ARG] A:1287 [U] K:23 [ARG] A:1244 [U] ✔
J:21 [ARG] A:1288 [G] K:23 [ARG] A:1245 [G] ✔
J:67 [THR] A:247 [A] K:69 [THR] A:251 [A] ✔
J:67 [THR] A:248 [G] K:69 [THR] A:252 [G] ✔
J:42 [SER] A:715 [A] K:44 [LYS] A:668 [A] ✔
J:42 [SER] A:716 [C] K:44 [LYS] A:669 [C] ✔
J:42 [SER] A:717 [C] K:44 [LYS] A:670 [C] ✔
J:23 [VAL] A:858 [U] K:25 [ILE] A:811 [U] ✔
J:22 [GLY] A:856 [U] K:24 [GLY] A:809 [U] ✔
J:22 [GLY] A:857 [C] K:24 [GLY] A:810 [C] ✔
J:22 [GLY] A:858 [U] K:24 [GLY] A:811 [U] ✔
J:129 [SER] A:681 [G] K:130 [THR] A:634 [G] ✔
J:129 [SER] A:682 [A] K:130 [THR] A:635 [A] ✔
J:10 [GLU] A:641 [A] K:12 [GLU] A:596 [U] ✔
J:70 [ASN] A:2431 [C] K:72 [ILE] A:2400 [U] ❌ 7RYG_K_A
J:20 [GLY] A:630 [G] K:22 [GLY] A:585 [C] ❌ 7RYG_K_A
J:31 [SER] A:630 [G] K:33 [GLY] A:585 [C] ❌ 7RYG_K_A
J:31 [SER] A:855 [U] K:33 [GLY] A:808 [U] ❌ 7RYG_K_A
J:72 [LYS] A:678 [A] K:75 [LYS] A:631 [A] ❌ 7RYG_K_A
J:72 [LYS] A:679 [G] K:75 [LYS] A:632 [U] ❌ 7RYG_K_A
J:114 [ASN] A:682 [A] K:115 [SER] A:635 [A] ❌ 7RYG_K_A
J:59 [ARG] A:252 [C] K:61 [ARG] A:256 [C] ❌ 7RYG_K_A
J:59 [ARG] A:2419 [A] K:61 [ARG] A:2388 [A] ❌ 7RYG_K_A
J:59 [ARG] A:2421 [C] K:61 [ARG] A:2390 [C] ❌ 7RYG_K_A
J:60 [ARG] A:2456 [G] K:62 [ARG] A:2425 [G] ❌ 7RYG_K_A
J:16 [ARG] A:631 [U] K:18 [HIS] A:586 [U] ❌ 7RYG_K_A
J:15 [GLU] A:1233 [A] K:17 [GLU] A:1189 [A] ❌ 7RYG_K_A
J:46 [VAL] A:199 [A] K:48 [VAL] A:203 [A] ❌ 7RYG_K_A
J:36 [LYS] A:877 [G] K:38 [LYS] A:830 [U] ❌ 7RYG_K_A
J:36 [LYS] A:987 [U] K:38 [LYS] A:940 [A] ❌ 7RYG_K_A
J:24 [ALA] A:1232 [G] K:26 [GLY] A:1188 [G] ❌ 7RYG_K_A
J:68 [ASN] A:2431 [C] K:70 [SER] A:2400 [U] ❌ 7RYG_K_A
J:28 [GLY] A:855 [U] K:30 [GLY] A:808 [U] ❌ 7RYG_K_A
J:71 [ARG] A:673 [G] K:73 [ALA] A:626 [G] ❌ 7RYG_K_A
J:71 [ARG] A:677 [A] K:73 [ALA] A:630 [A] ❌ 7RYG_K_A
J:71 [ARG] A:679 [G] K:73 [ALA] A:632 [U] ❌ 7RYG_K_A
J:71 [ARG] A:680 [C] K:73 [ALA] A:633 [C] ❌ 7RYG_K_A
J:23 [VAL] A:857 [C] K:25 [ILE] A:810 [C] ❌ 7RYG_K_A
J:114 [ASN] A:671 [U] K:115 [SER] A:624 [U] ❌ 6S0Z_J_A
J:10 [GLU] A:640 [G] K:12 [GLU] A:595 [G] ❌ 6S0Z_J_A
J:130 [ALA] A:682 [A] K:131 [LYS] A:635 [A] ❌ 6S0Z_J_A
J:12 [SER] A:705 [U] K:14 [ALA] A:658 [C] ❌ 6S0Z_J_A
J:15 [GLU] A:708 [G] K:17 [GLU] A:661 [G] ❌ 6S0Z_J_A
J:17 [ASN] A:1230 [G] K:19 [ARG] A:1186 [G] ❌ 6S0Z_J_A
J:29 [LYS] A:630 [G] K:31 [LYS] A:585 [C] ❌ 6S0Z_J_A
J:39 [LYS] A:876 [G] K:41 [LYS] A:829 [G] ❌ 6S0Z_J_A
J:50 [PHE] A:876 [G] K:52 [PHE] A:829 [G] ❌ 6S0Z_J_A
J:52 [GLY] A:870 [C] K:54 [GLY] A:823 [A] ❌ 6S0Z_J_A
J:53 [GLY] A:876 [G] K:55 [GLY] A:829 [G] ❌ 6S0Z_J_A
J:4 [HIS] A:1241 [A] K:6 [ASN] A:1197 [G] ❌ 6S0Z_J_A
J:58 [PHE] A:254 [A] K:60 [TYR] A:258 [A] ❌ 6S0Z_J_A
J:61 [LEU] A:2419 [A] K:63 [LEU] A:2388 [A] ❌ 6S0Z_J_A
J:69 [ILE] A:248 [G] K:71 [GLN] A:252 [G] ❌ 6S0Z_J_A
J:70 [ASN] A:679 [G] K:72 [ILE] A:632 [U] ❌ 6S0Z_J_A
J:70 [ASN] A:678 [A] K:72 [ILE] A:631 [A] ❌ 6S0Z_J_A
J:70 [ASN] A:2432 [G] K:72 [ILE] A:2401 [G] ❌ 7RYG_A:2401 no longer at interface
J:70 [ASN] A:2433 [C] K:72 [ILE] A:2402 [U] ❌ 7RYG_A:2402 no longer at interface
J:18 [ARG] A:1236 [G] K:20 [ARG] A:1192 [G] ❌ 7RYG_A:1192 no longer at interface
J:40 [ALA] A:854 [G] K:42 [SER] A:807 [G] ❌ 7RYG_A:807 no longer at interface
J:25 [THR] A:1231 [A] K:27 [SER] A:1187 [G] ❌ 7RYG_A:1187 no longer at interface
J:16 [ARG] A:632 [U] K:18 [HIS] A:587 [U] ❌ 7RYG_A:587 no longer at interface
J:64 [ARG] A:2444 [C] K:66 [PHE] A:2413 [C] ❌ 7RYG_A:2413 no longer at interface
J:15 [GLU] A:1234 [G] K:17 [GLU] A:1190 [G] ❌ 7RYG_A:1190 no longer at interface
J:4 [HIS] A:1243 [G] K:6 [ASN] A:1199 [A] ❌ 7RYG_A:1199 no longer at interface
J:24 [ALA] A:860 [U] K:26 [GLY] A:813 [C] ❌ 7RYG_A:813 no longer at interface
J:13 [ARG] A:1284 [A] K:15 [LYS] A:1241 [A] ❌ 7RYG_A:1241 no longer at interface
J:103 [LYS] A:648 [G] K:102 [VAL] A:603 [G] ❌ 7RYG_K:102, 7RYG_A:603 no longer at interface
J:103 [LYS] A:649 [U] K:102 [VAL] A:604 [U] ❌ 7RYG_K:102, 7RYG_A:604 no longer at interface
J:103 [LYS] A:669 [C] K:102 [VAL] A:622 [C] ❌ 7RYG_K:102, 7RYG_A:622 no longer at interface
J:68 [ASN] A:2432 [G] K:70 [SER] A:2401 [G] ❌ 7RYG_A:2401 no longer at interface
J:71 [ARG] A:674 [C] K:73 [ALA] A:627 [A] ❌ 7RYG_A:627 no longer at interface
J:71 [ARG] A:675 [G] K:73 [ALA] A:628 [G] ❌ 7RYG_A:628 no longer at interface
J:102 [VAL] A:665 [G] K:101 [ASN] A:618 [G] ❌ 6S0Z_J:102, 6S0Z_A:665 no longer at interface
J:102 [VAL] A:666 [A] K:101 [ASN] A:619 [A] ❌ 6S0Z_J:102, 6S0Z_A:666 no longer at interface
J:102 [VAL] A:667 [G] K:101 [ASN] A:620 [G] ❌ 6S0Z_J:102, 6S0Z_A:667 no longer at interface
J:105 [GLU] A:243 [U] K:104 [ARG] A:247 [C] ❌ 6S0Z_J:105, 6S0Z_A:243 no longer at interface
J:105 [GLU] A:244 [A] K:104 [ARG] A:248 [A] ❌ 6S0Z_J:105, 6S0Z_A:244 no longer at interface
J:105 [GLU] A:667 [G] K:104 [ARG] A:620 [G] ❌ 6S0Z_J:105, 6S0Z_A:667 no longer at interface
J:17 [ASN] A:709 [U] K:19 [ARG] A:662 [G] ❌ 6S0Z_A:709 no longer at interface
J:42 [SER] A:714 [G] K:44 [LYS] A:667 [G] ❌ 6S0Z_A:714 no longer at interface
J:42 [SER] A:849 [A] K:44 [LYS] A:802 [A] ❌ 6S0Z_A:849 no longer at interface
J:4 [HIS] A:1279 [C] K:6 [ASN] A:1236 [A] ❌ 6S0Z_A:1279 no longer at interface
J:61 [LEU] A:2388 [A] K:63 [LEU] A:2357 [A] ❌ 6S0Z_A:2388 no longer at interface
J:72 [LYS] A:260 [A] K:75 [LYS] A:264 [C] ❌ 6S0Z_A:260 no longer at interface
J:97 [VAL] A:666 [A] K:98 [LYS] A:619 [A] ❌ 6S0Z_J:97, 6S0Z_A:666 no longer at interface
J:98 [GLU] A:666 [A] K:99 [ALA] A:619 [A] ❌ 6S0Z_J:98, 6S0Z_A:666 no longer at interface
J:81 [GLN] A:671 [U] K:82 [SER] A:624 [U] ❌ 7RYG_K:82 no longer at interface
J:78 [ASN] A:672 [A] K:81 [LEU] A:625 [A] ❌ 7RYG_K:81 no longer at interface
J:74 [TYR] A:681 [G] K:77 [ALA] A:634 [G] ❌ 7RYG_K:77 no longer at interface
J:127 [LYS] A:680 [C] K:128 [ALA] A:633 [C] ❌ 7RYG_K:128 no longer at interface
J:104 [ASN] A:668 [C] K:103 [VAL] A:621 [C] ❌ 7RYG_K:103 no longer at interface
J:84 [LYS] A:647 [G] K:85 [SER] A:602 [G] ❌ 7RYG_K:85 no longer at interface
J:111 [ILE] A:682 [A] K:112 [ILE] A:635 [A] ❌ 7RYG_K:112 no longer at interface
J:100 [GLY] A:647 [G] K:100 [ALA] A:602 [G] ❌ 7RYG_K:100 no longer at interface
J:26 [GLY] A:1229 [G] K:28 [GLY] A:1185 [G] ❌ 7RYG_K:28 no longer at interface
J:26 [GLY] A:1230 [G] K:28 [GLY] A:1186 [G] ❌ 7RYG_K:28 no longer at interface
J:76 [ILE] A:672 [A] K:79 [VAL] A:625 [A] ❌ 7RYG_K:79 no longer at interface
J:76 [ILE] A:681 [G] K:79 [VAL] A:634 [G] ❌ 7RYG_K:79 no longer at interface
J:103 [LYS] A:647 [G] K:102 [VAL] A:602 [G] ❌ 7RYG_K:102 no longer at interface
J:103 [LYS] A:668 [C] K:102 [VAL] A:621 [C] ❌ 7RYG_K:102 no longer at interface
J:103 [LYS] A:670 [G] K:102 [VAL] A:623 [G] ❌ 7RYG_K:102 no longer at interface
J:105 [GLU] A:668 [C] K:104 [ARG] A:621 [C] ❌ 6S0Z_J:105 no longer at interface
J:108 [GLY] A:679 [G] K:109 [ARG] A:632 [U] ❌ 6S0Z_J:108 no longer at interface
J:132 [ALA] A:682 [A] K:133 [ALA] A:635 [A] ❌ 6S0Z_J:132 no longer at interface
J:45 [GLY] A:711 [G] K:47 [GLY] A:664 [A] ❌ 6S0Z_J:45 no longer at interface
J:75 [ALA] A:672 [A] K:78 [GLU] A:625 [A] ❌ 6S0Z_J:75 no longer at interface
J:75 [ALA] A:681 [G] K:78 [GLU] A:634 [G] ❌ 6S0Z_J:75 no longer at interface
J:75 [ALA] A:673 [G] K:78 [GLU] A:626 [G] ❌ 6S0Z_J:75 no longer at interface
J:77 [VAL] A:672 [A] K:80 [ARG] A:625 [A] ❌ 6S0Z_J:77 no longer at interface
J:77 [VAL] A:671 [U] K:80 [ARG] A:624 [U] ❌ 6S0Z_J:77 no longer at interface
J:82 [LEU] A:670 [G] K:83 [GLU] A:623 [G] ❌ 6S0Z_J:82 no longer at interface
J:82 [LEU] A:671 [U] K:83 [GLU] A:624 [U] ❌ 6S0Z_J:82 no longer at interface

logo_download Export the table of contacts

Properties of this pair

Common ECOD label(s)
 Common RFAM label(s)
 Interface TM-score
 Interface RMSD
 Percentage identity
 Protein TM-score
 RNA TM-score
 Protein coverage
 RNA coverage
 Percentage conservation
 Apolar conservation
 H-bond conservation
 Percentage switching out
Ribosomal proteins L15p and L18e Bacterial large subunit ribosomal RNA 0.97 1.41 0.47 0.76 0.98 0.85 0.85 0.78 0.79 0.47 0.58


Other pairs involving 6S0Z_J_A or 7RYG_K_A

Total number of entries: 12

Interface 1 Interface 2 Percentage conservation
 		Interface TM-score
 		Interface RMSD
 		Percentage identity
 		Common ECOD label(s)
 		Common RFAM label(s)
 		Explore both interfaces
1VQ8_L_0 6S0Z_J_A 0.41 0.93 4.07 0.15 Ribosomal proteins L15p and L18e compare
1YHQ_L_0 6S0Z_J_A 0.41 0.93 4.03 0.15 Ribosomal proteins L15p and L18e compare
1YHQ_L_0 7RYG_K_A 0.38 0.91 4.41 0.15 Ribosomal proteins L15p and L18e compare
4Y4O_1P_1A 7RYG_K_A 0.71 0.96 2.76 0.39 Ribosomal proteins L15p and L18e Bacterial large subunit ribosomal RNA compare
4Y4O_1P_1A 6S0Z_J_A 0.72 0.96 2.46 0.46 Ribosomal proteins L15p and L18e Bacterial large subunit ribosomal RNA compare
6AZ3_L_1 6S0Z_J_A 0.36 0.72 4.24 0.11 Ribosomal proteins L15p and L18e compare
6AZ3_L_2 6S0Z_J_A 0.29 0.81 5.35 0.13 Ribosomal proteins L15p and L18e compare
6S0Z_J_A 7RYG_K_A 0.78 0.97 1.41 0.47 Ribosomal proteins L15p and L18e Bacterial large subunit ribosomal RNA compare
6S0Z_J_A 7O7Y_Ba_B5 0.38 0.88 4.38 0.11 Ribosomal proteins L15p and L18e compare
6S0Z_J_A 7OF0_M_A 0.78 0.88 2.04 0.38 Ribosomal proteins L15p and L18e Bacterial large subunit ribosomal RNA compare
6S0Z_J_A 7K00_k_a 0.81 0.97 1.67 0.52 Ribosomal proteins L15p and L18e Bacterial large subunit ribosomal RNA compare
7OF0_M_A 7RYG_K_A 0.68 0.85 2.79 0.38 Ribosomal proteins L15p and L18e Bacterial large subunit ribosomal RNA compare