Interface analysis
Style
Protein
CartoonLicorice
Surface
RNA
CartoonLicorice
Surface
Color
ChainChain (with hetatm)
Chainbow
Hydrophobicity Electrostatics (surface only) Conservation*
View
Focus on
InterfaceRNA
Protein
All
Show chains
Interface
show as licoriceshow Accessibility
Rim - Core
Contacts -
| 7OF0_M
|
7OF0_A
|
Distance
|
Base Pair
|
Hbond nuc:res
|
Base Stacking
|
Residue conservation
|
|---|---|---|---|---|---|---|
| M:23 [SER] | A:2279 [U] | 4.09 | A:2286 [A] | 45.78 | ||
| M:24 [LEU] | A:2278 [A] | 3.71 | A:2287 [U] | 65.23 | ||
| M:24 [LEU] | A:2279 [U] | 3.46 | A:2286 [A] | 65.23 | ||
| M:24 [LEU] | A:2287 [U] | 3.95 | A:2278 [A] | 65.23 | ||
| M:25 [ALA] | A:2279 [U] | 3.16 | A:2286 [A] | 33.81 | ||
| M:25 [ALA] | A:2280 [C] | 4.41 | A:2285 [U] | 33.81 | ||
| M:25 [ALA] | A:2286 [A] | 4.37 | A:2279 [U] | 33.81 | ||
| M:25 [ALA] | A:2287 [U] | 3.36 | A:2278 [A] | 33.81 | ||
| M:26 [ASN] | A:2287 [U] | 3.9 | A:2278 [A] | 92.83 | ||
| M:27 [LEU] | A:2287 [U] | 2.64 | A:2278 [A] | sugar:BB | 68.36 | |
| M:27 [LEU] | A:2288 [A] | 3.54 | A:2277 [U] | 68.36 | ||
| M:28 [LYS] | A:2287 [U] | 4.44 | A:2278 [A] | 42.67 | ||
| M:28 [LYS] | A:2288 [A] | 3.55 | A:2277 [U] | 42.67 | ||
| M:29 [PRO] | A:2288 [A] | 3.49 | A:2277 [U] | 49.12 | ||
| M:29 [PRO] | A:2289 [G] | 3.54 | A:2276 [C] | 49.12 | ||
| M:30 [ASN] | A:1877 [U] | 2.54 | A:1897 [A] | sugar:SC | 65.02 | |
| M:30 [ASN] | A:1878 [U] | 3.23 | A:1896 [U] | 65.02 | ||
| M:31 [PRO] | A:1877 [U] | 3.73 | A:1897 [A] | 66.1 | ||
| M:32 [GLY] | A:1876 [U] | 2.44 | A:1898 [A] | sugar:BB | 43.38 | |
| M:32 [GLY] | A:1877 [U] | 3.38 | A:1897 [A] | 43.38 | ||
| M:33 [SER] | A:1876 [U] | 4.41 | A:1898 [A] | 67.09 | ||
| M:33 [SER] | A:1877 [U] | 3.53 | A:1897 [A] | 67.09 | ||
| M:33 [SER] | A:1898 [A] | 4.37 | A:1876 [U] | 67.09 | ||
| M:33 [SER] | A:1899 [G] | 3.46 | A:1875 [C] | 67.09 | ||
| M:34 [LYS] | A:1898 [A] | 3.81 | A:1876 [U] | 30.11 | ||
| M:34 [LYS] | A:1899 [G] | 3.22 | A:1875 [C] | 30.11 | ||
| M:34 [LYS] | A:2288 [A] | 4.83 | A:2277 [U] | 30.11 | ||
| M:34 [LYS] | A:2289 [G] | 2.6 | A:2276 [C] | 30.11 | ||
| M:35 [LYS] | A:1899 [G] | 2.68 | A:1875 [C] | sugar:BB | 50.35 | |
| M:35 [LYS] | A:1900 [A] | 3.52 | A:1873 [A] | 50.35 | ||
| M:35 [LYS] | A:2269 [G] | 3.95 | A:2024 [C] | 50.35 | ||
| M:36 [PRO] | A:1900 [A] | 3.66 | A:1873 [A] | 0.81 | ||
| M:36 [PRO] | A:2270 [A] | 3.63 | A:2023 [U] | 0.81 | ||
| M:37 [GLU] | A:1869 [A] | 4.12 | 21.08 | |||
| M:37 [GLU] | A:1900 [A] | 3.71 | A:1873 [A] | 21.08 | ||
| M:37 [GLU] | A:1901 [C] | 3.32 | A:1871 [A] | 21.08 | ||
| M:37 [GLU] | A:2293 [A] | 3.39 | A:2273 [A] | 21.08 | ||
| M:38 [ARG] | A:1900 [A] | 3.85 | A:1873 [A] | 40.59 | ||
| M:38 [ARG] | A:1901 [C] | 2.85 | A:1871 [A] | 40.59 | ||
| M:38 [ARG] | A:1902 [C] | 4.07 | 40.59 | |||
| M:38 [ARG] | A:2269 [G] | 3.41 | A:2024 [C] | base/AA stacks | 40.59 | |
| M:38 [ARG] | A:2270 [A] | 3.61 | A:2023 [U] | 40.59 | ||
| M:38 [ARG] | A:2271 [C] | 4.79 | A:2022 [G] | 40.59 | ||
| M:39 [ARG] | A:1901 [C] | 4.78 | A:1871 [A] | 72.2 | ||
| M:39 [ARG] | A:2293 [A] | 3.39 | A:2273 [A] | base/AA stacks | 72.2 | |
| M:39 [ARG] | A:2294 [A] | 2.87 | A:2272 [C] | base:SC | 72.2 | |
| M:40 [PRO] | A:1868 [G] | 3.41 | A:2020 [U] | 28.25 | ||
| M:40 [PRO] | A:1902 [C] | 4.95 | 28.25 | |||
| M:40 [PRO] | A:2021 [U] | 4.24 | 28.25 | |||
| M:41 [ARG] | A:1867 [A] | 4.97 | A:2295 [C] | 86.24 | ||
| M:41 [ARG] | A:1868 [G] | 2.84 | A:2020 [U] | 86.24 | ||
| M:41 [ARG] | A:2021 [U] | 2.74 | base/AA stacks | 86.24 | ||
| M:41 [ARG] | A:2022 [G] | 3.94 | A:2271 [C] | 86.24 | ||
| M:41 [ARG] | A:2293 [A] | 4.47 | A:2273 [A] | 86.24 | ||
| M:41 [ARG] | A:2294 [A] | 2.56 | A:2272 [C] | 86.24 | ||
| M:42 [GLY] | A:2021 [U] | 4.56 | 71.78 | |||
| M:42 [GLY] | A:2022 [G] | 3.54 | A:2271 [C] | 71.78 | ||
| M:42 [GLY] | A:2023 [U] | 3.14 | A:2270 [A] | 71.78 | ||
| M:43 [ARG] | A:2023 [U] | 3.11 | A:2270 [A] | 51.84 | ||
| M:43 [ARG] | A:2024 [C] | 4.7 | A:2269 [G] | 51.84 | ||
| M:43 [ARG] | A:2025 [C] | 4.29 | A:2268 [G] | 51.84 | ||
| M:43 [ARG] | A:2264 [A] | 3.79 | 51.84 | |||
| M:44 [ARG] | A:2024 [C] | 3.83 | A:2269 [G] | 55.13 | ||
| M:44 [ARG] | A:2025 [C] | 3.61 | A:2268 [G] | 55.13 | ||
| M:44 [ARG] | A:2026 [A] | 4.24 | A:2267 [U] | 55.13 | ||
| M:44 [ARG] | A:2267 [U] | 3.05 | A:2026 [A] | base/AA stacks | 55.13 | |
| M:44 [ARG] | A:2268 [G] | 2.72 | A:2025 [C] | base:SC, base:SC | 55.13 | |
| M:44 [ARG] | A:2269 [G] | 3.75 | A:2024 [C] | 55.13 | ||
| M:45 [ARG] | A:2023 [U] | 4.68 | A:2270 [A] | 50.37 | ||
| M:45 [ARG] | A:2024 [C] | 4.33 | A:2269 [G] | 50.37 | ||
| M:45 [ARG] | A:2268 [G] | 4.13 | A:2025 [C] | 50.37 | ||
| M:45 [ARG] | A:2269 [G] | 2.67 | A:2024 [C] | base:SC, base:SC | 50.37 | |
| M:45 [ARG] | A:2270 [A] | 4.1 | A:2023 [U] | 50.37 | ||
| M:46 [GLY] | A:2021 [U] | 3.9 | 81.88 | |||
| M:47 [ARG] | A:1847 [U] | 2.84 | A:1856 [A] | 52.95 | ||
| M:47 [ARG] | A:2020 [U] | 3.22 | A:1868 [G] | 52.95 | ||
| M:47 [ARG] | A:2021 [U] | 3.23 | 52.95 | |||
| M:47 [ARG] | A:2264 [A] | 2.99 | 52.95 | |||
| M:47 [ARG] | A:2265 [A] | 2.8 | A:2028 [G] | 52.95 | ||
| M:48 [LYS] | A:1847 [U] | 4.24 | A:1856 [A] | 70.72 | ||
| M:48 [LYS] | A:1848 [U] | 3.47 | A:1855 [A] | 70.72 | ||
| M:48 [LYS] | A:1868 [G] | 4.02 | A:2020 [U] | 70.72 | ||
| M:48 [LYS] | A:2020 [U] | 3.72 | A:1868 [G] | 70.72 | ||
| M:48 [LYS] | A:2265 [A] | 3.96 | A:2028 [G] | 70.72 | ||
| M:48 [LYS] | A:2266 [U] | 3.17 | A:2027 [A] | 70.72 | ||
| M:49 [CYS] | A:1868 [G] | 3.34 | A:2020 [U] | 74.16 | ||
| M:49 [CYS] | A:2020 [U] | 3.52 | A:1868 [G] | 74.16 | ||
| M:49 [CYS] | A:2266 [U] | 3.8 | A:2027 [A] | 74.16 | ||
| M:50 [GLY] | A:2093 [U] | 4.04 | 70.3 | |||
| M:50 [GLY] | A:2094 [G] | 4.38 | A:2046 [C] | 70.3 | ||
| M:50 [GLY] | A:2266 [U] | 2.8 | A:2027 [A] | 70.3 | ||
| M:50 [GLY] | A:2267 [U] | 3.32 | A:2026 [A] | 70.3 | ||
| M:51 [ARG] | A:1868 [G] | 2.94 | A:2020 [U] | base:SC | 49.83 | |
| M:51 [ARG] | A:1902 [C] | 3.79 | 49.83 | |||
| M:51 [ARG] | A:1903 [C] | 3.55 | A:2019 [G] | 49.83 | ||
| M:51 [ARG] | A:2094 [G] | 3.7 | A:2046 [C] | 49.83 | ||
| M:51 [ARG] | A:2265 [A] | 4.89 | A:2028 [G] | 49.83 | ||
| M:51 [ARG] | A:2266 [U] | 3.08 | A:2027 [A] | 49.83 | ||
| M:52 [GLY] | A:2094 [G] | 3.66 | A:2046 [C] | 79.55 | ||
| M:52 [GLY] | A:2095 [U] | 4.03 | A:2045 [A] | 79.55 | ||
| M:52 [GLY] | A:2265 [A] | 3.29 | A:2028 [G] | 79.55 | ||
| M:52 [GLY] | A:2266 [U] | 3.14 | A:2027 [A] | 79.55 | ||
| M:53 [HIS] | A:1848 [U] | 4.8 | A:1855 [A] | 64.15 | ||
| M:53 [HIS] | A:2094 [G] | 4.25 | A:2046 [C] | 64.15 | ||
| M:53 [HIS] | A:2095 [U] | 3.09 | A:2045 [A] | 64.15 | ||
| M:53 [HIS] | A:2264 [A] | 4.05 | 64.15 | |||
| M:53 [HIS] | A:2265 [A] | 3.1 | A:2028 [G] | sugar:SC | 64.15 | |
| M:54 [LYS] | A:1848 [U] | 3.12 | A:1855 [A] | 79.08 | ||
| M:54 [LYS] | A:1849 [C] | 4.02 | A:1852 [C] | 79.08 | ||
| M:54 [LYS] | A:2016 [C] | 4.61 | A:1906 [G] | 79.08 | ||
| M:54 [LYS] | A:2017 [U] | 2.89 | A:1905 [C] | 79.08 | ||
| M:54 [LYS] | A:2018 [G] | 3.29 | A:1904 [C] | 79.08 | ||
| M:54 [LYS] | A:2040 [G] | 4.75 | A:2035 [U] | 79.08 | ||
| M:55 [GLY] | A:2015 [G] | 4.29 | 80.31 | |||
| M:55 [GLY] | A:2016 [C] | 3.52 | A:1906 [G] | 80.31 | ||
| M:55 [GLY] | A:2040 [G] | 4.21 | A:2035 [U] | 80.31 | ||
| M:55 [GLY] | A:2041 [U] | 4.1 | A:2034 [A] | 80.31 | ||
| M:56 [GLU] | A:1724 [A] | 2.69 | base:SC | 62.34 | ||
| M:56 [GLU] | A:2015 [G] | 3.05 | base/AA stacks | 62.34 | ||
| M:56 [GLU] | A:2016 [C] | 4.45 | A:1906 [G] | 62.34 | ||
| M:56 [GLU] | A:2040 [G] | 2.7 | A:2035 [U] | sugar:SC | 62.34 | |
| M:56 [GLU] | A:2041 [U] | 3.39 | A:2034 [A] | 62.34 | ||
| M:57 [ARG] | A:2040 [G] | 4.6 | A:2035 [U] | 41.05 | ||
| M:57 [ARG] | A:2041 [U] | 3.04 | A:2034 [A] | 41.05 | ||
| M:57 [ARG] | A:2042 [U] | 3.07 | A:2033 [A] | 41.05 | ||
| M:57 [ARG] | A:2094 [G] | 3.4 | A:2046 [C] | 41.05 | ||
| M:57 [ARG] | A:2095 [U] | 3.29 | A:2045 [A] | 41.05 | ||
| M:57 [ARG] | A:2096 [U] | 4.04 | A:2044 [A] | 41.05 | ||
| M:58 [GLN] | A:1868 [G] | 4.55 | A:2020 [U] | 72.84 | ||
| M:58 [GLN] | A:1903 [C] | 3.04 | A:2019 [G] | base:BB | 72.84 | |
| M:58 [GLN] | A:2019 [G] | 3.04 | A:1903 [C] | base:SC | 72.84 | |
| M:58 [GLN] | A:2020 [U] | 3.5 | A:1868 [G] | 72.84 | ||
| M:59 [ARG] | A:1903 [C] | 4.47 | A:2019 [G] | 80.21 | ||
| M:59 [ARG] | A:2015 [G] | 3.35 | 80.21 | |||
| M:59 [ARG] | A:2016 [C] | 2.51 | A:1906 [G] | base/AA stacks | 80.21 | |
| M:59 [ARG] | A:2017 [U] | 3.06 | A:1905 [C] | 80.21 | ||
| M:59 [ARG] | A:2018 [G] | 4.74 | A:1904 [C] | 80.21 | ||
| M:61 [THR] | A:2014 [A] | 3.44 | 54.26 | |||
| M:61 [THR] | A:2015 [G] | 2.97 | 54.26 | |||
| M:62 [ARG] | A:2041 [U] | 4.5 | A:2034 [A] | 6.41 | ||
| M:62 [ARG] | A:2042 [U] | 3.03 | A:2033 [A] | 6.41 | ||
| M:62 [ARG] | A:2093 [U] | 4.56 | 6.41 | |||
| M:62 [ARG] | A:2094 [G] | 3.03 | A:2046 [C] | 6.41 | ||
| M:63 [PRO] | A:1724 [A] | 3.86 | 60.51 | |||
| M:63 [PRO] | A:2041 [U] | 3.8 | A:2034 [A] | 60.51 | ||
| M:64 [ARG] | A:1723 [A] | 3.08 | 67.66 | |||
| M:64 [ARG] | A:1724 [A] | 3.14 | 67.66 | |||
| M:64 [ARG] | A:1751 [A] | 3.23 | A:1747 [G] | 67.66 | ||
| M:64 [ARG] | A:1752 [U] | 4.02 | A:1746 [A] | 67.66 | ||
| M:67 [PHE] | A:1724 [A] | 3.38 | 64.75 | |||
| M:67 [PHE] | A:2041 [U] | 4.11 | A:2034 [A] | 64.75 | ||
| M:67 [PHE] | A:2042 [U] | 3.3 | A:2033 [A] | 64.75 | ||
| M:68 [GLU] | A:2034 [A] | 4.11 | A:2041 [U] | 85.88 | ||
| M:68 [GLU] | A:2041 [U] | 4.06 | A:2034 [A] | 85.88 | ||
| M:68 [GLU] | A:2042 [U] | 3.61 | A:2033 [A] | 85.88 | ||
| M:69 [GLY] | A:1724 [A] | 4.16 | 55.89 | |||
| M:69 [GLY] | A:2034 [A] | 4.94 | A:2041 [U] | 55.89 | ||
| M:69 [GLY] | A:2035 [U] | 2.83 | A:2040 [G] | sugar:BB | 55.89 | |
| M:69 [GLY] | A:2037 [U] | 4.18 | 55.89 | |||
| M:69 [GLY] | A:2040 [G] | 2.85 | A:2035 [U] | base:BB | 55.89 | |
| M:69 [GLY] | A:2041 [U] | 3.18 | A:2034 [A] | 55.89 | ||
| M:69 [GLY] | A:2042 [U] | 4.17 | A:2033 [A] | 55.89 | ||
| M:70 [GLY] | A:1724 [A] | 4.91 | 82.08 | |||
| M:70 [GLY] | A:2035 [U] | 3.15 | A:2040 [G] | 82.08 | ||
| M:70 [GLY] | A:2040 [G] | 4.84 | A:2035 [U] | 82.08 | ||
| M:70 [GLY] | A:2916 [G] | 4.32 | 82.08 | |||
| M:71 [GLN] | A:2034 [A] | 2.84 | A:2041 [U] | sugar:SC | 72.47 | |
| M:71 [GLN] | A:2035 [U] | 3.85 | A:2040 [G] | 72.47 | ||
| M:71 [GLN] | A:2866 [A] | 3.06 | base:SC, base:SC | 72.47 | ||
| M:71 [GLN] | A:2867 [C] | 3.87 | 72.47 | |||
| M:71 [GLN] | A:2916 [G] | 3.22 | base/AA stacks | 72.47 | ||
| M:72 [THR] | A:2897 [A] | 4.04 | A:2912 [C] | 75.8 | ||
| M:72 [THR] | A:2916 [G] | 3.15 | sugar:BB | 75.8 | ||
| M:72 [THR] | A:2917 [G] | 2.47 | A:2896 [G] | base:SC | 75.8 | |
| M:74 [PHE] | A:2867 [C] | 3.73 | 73.34 | |||
| M:74 [PHE] | A:2868 [C] | 3.85 | 73.34 | |||
| M:75 [TYR] | A:1750 [G] | 3.96 | A:1728 [U] | 56.58 | ||
| M:75 [TYR] | A:1751 [A] | 2.27 | A:1747 [G] | 56.58 | ||
| M:76 [ILE] | A:1750 [G] | 3.68 | A:1728 [U] | 62.02 | ||
| M:76 [ILE] | A:1751 [A] | 4.29 | A:1747 [G] | 62.02 | ||
| M:76 [ILE] | A:2898 [U] | 2.71 | sugar:BB | 62.02 | ||
| M:77 [ARG] | A:2868 [C] | 2.63 | sugar:SC | 54.67 | ||
| M:77 [ARG] | A:2897 [A] | 2.64 | A:2912 [C] | sugar:BB | 54.67 | |
| M:77 [ARG] | A:2898 [U] | 3.18 | 54.67 | |||
| M:77 [ARG] | A:2916 [G] | 3.36 | 54.67 | |||
| M:77 [ARG] | A:2917 [G] | 2.62 | A:2896 [G] | base:SC, base:SC | 54.67 | |
| M:78 [ILE] | A:2868 [C] | 3.99 | 54.2 | |||
| M:78 [ILE] | A:2869 [A] | 4.43 | A:2863 [U] | 54.2 | ||
| M:78 [ILE] | A:2897 [A] | 4.82 | A:2912 [C] | 54.2 | ||
| M:78 [ILE] | A:2898 [U] | 3.93 | 54.2 | |||
| M:78 [ILE] | A:2899 [C] | 4.97 | A:2910 [A] | 54.2 | ||
| M:79 [PRO] | A:2898 [U] | 3.55 | 89.71 | |||
| M:79 [PRO] | A:2899 [C] | 3.56 | A:2910 [A] | 89.71 | ||
| M:80 [LYS] | A:1747 [G] | 4.5 | A:1751 [A] | 54.09 | ||
| M:80 [LYS] | A:1749 [C] | 2.67 | base:SC, sugar:SC | 54.09 | ||
| M:80 [LYS] | A:1750 [G] | 3.75 | A:1728 [U] | 54.09 | ||
| M:80 [LYS] | A:2898 [U] | 3.8 | 54.09 | |||
| M:80 [LYS] | A:2899 [C] | 2.62 | A:2910 [A] | 54.09 | ||
| M:80 [LYS] | A:2900 [C] | 4.92 | A:2909 [G] | 54.09 | ||
| M:87 [HIS] | A:1743 [U] | 3.2 | A:1755 [A] | 49.12 | ||
| M:87 [HIS] | A:1744 [A] | 2.67 | A:1754 [G] | 49.12 | ||
| M:88 [SER] | A:1743 [U] | 3.99 | A:1755 [A] | 50.16 | ||
| M:88 [SER] | A:1744 [A] | 3.12 | A:1754 [G] | 50.16 | ||
| M:89 [PHE] | A:1744 [A] | 3.57 | A:1754 [G] | 18.3 | ||
| M:89 [PHE] | A:1745 [U] | 3.93 | A:1753 [A] | 18.3 | ||
| M:94 [LYS] | A:1891 [A] | 3.8 | 41.13 | |||
| M:100 [ARG] | A:1882 [A] | 3.04 | 58.92 | |||
| M:100 [ARG] | A:1883 [G] | 2.55 | A:1890 [C] | 58.92 | ||
| M:103 [TYR] | A:1882 [A] | 4.44 | 64.01 | |||
| M:103 [TYR] | A:1883 [G] | 3.04 | A:1890 [C] | 64.01 | ||
| M:104 [LEU] | A:1883 [G] | 4.93 | A:1890 [C] | 63.43 | ||
| M:109 [ARG] | A:1882 [A] | 4.9 | 86.52 | |||
| M:109 [ARG] | A:1883 [G] | 2.99 | A:1890 [C] | 86.52 | ||
| M:125 [ARG] | A:1883 [G] | 4.1 | A:1890 [C] | 54.86 | ||
| M:128 [THR] | A:1883 [G] | 2.96 | A:1890 [C] | base:SC | 7.25 | |
| M:128 [THR] | A:1884 [G] | 4.47 | A:1889 [C] | 7.25 | ||
| M:128 [THR] | A:1889 [C] | 3.83 | A:1884 [G] | 7.25 | ||
| M:128 [THR] | A:1890 [C] | 3.45 | A:1883 [G] | 7.25 | ||
| M:128 [THR] | A:1891 [A] | 3.48 | 7.25 | |||
| M:130 [GLN] | A:1889 [C] | 3.13 | A:1884 [G] | 37.79 | ||
| M:130 [GLN] | A:1890 [C] | 2.88 | A:1883 [G] | 37.79 | ||
| M:132 [LEU] | A:1739 [A] | 4.31 | A:1758 [U] | 0.03 | ||
| M:132 [LEU] | A:1740 [A] | 3.63 | A:1757 [A] | 0.03 | ||
| M:132 [LEU] | A:1741 [A] | 3.9 | A:1756 [A] | 0.03 | ||
| M:132 [LEU] | A:1757 [A] | 4.61 | A:1740 [A] | 0.03 | ||
| M:132 [LEU] | A:1888 [G] | 3.74 | 0.03 | |||
| M:132 [LEU] | A:1889 [C] | 3.54 | A:1884 [G] | 0.03 | ||
| M:133 [LYS] | A:1740 [A] | 3.28 | A:1757 [A] | 9.79 | ||
| M:133 [LYS] | A:1741 [A] | 2.97 | A:1756 [A] | 9.79 | ||
| M:133 [LYS] | A:1888 [G] | 4.78 | 9.79 | |||
| M:133 [LYS] | A:1889 [C] | 2.4 | A:1884 [G] | 9.79 | ||
| M:133 [LYS] | A:1890 [C] | 3.63 | A:1883 [G] | 9.79 | ||
| M:134 [ARG] | A:1740 [A] | 4.4 | A:1757 [A] | 51.49 | ||
| M:134 [ARG] | A:1741 [A] | 3.04 | A:1756 [A] | 51.49 | ||
| M:134 [ARG] | A:1743 [U] | 4.24 | A:1755 [A] | 51.49 | ||
| M:189 [LYS] | A:1887 [A] | 4.54 | 60.79 | |||
| M:189 [LYS] | A:1888 [G] | 4.03 | 60.79 | |||
| M:192 [PRO] | A:1760 [G] | 4.54 | A:1737 [A] | 37.84 | ||
| M:192 [PRO] | A:1887 [A] | 3.58 | 37.84 | |||
| M:196 [ARG] | A:1759 [U] | 3.62 | A:1738 [U] | 30.45 | ||
| M:196 [ARG] | A:1760 [G] | 3.31 | A:1737 [A] | 30.45 | ||
| M:198 [GLN] | A:1759 [U] | 3.64 | A:1738 [U] | 0.45 |
Export the table of contacts
*Conservation was calculated using Rate4Site
NB: conservation is missing (completly white) for a very small minority of cases in which no homologous sequences were found (e.g. synthetic proteins 7D3J_A & 7EU9_A)
Properties of this interface
| Interolog group ID | Structure ID |
Structure description |
UniProt ID |
ECOD label(s) |
RFAM label(s) |
Is ribosome? | RCSB PDB link |
|---|---|---|---|---|---|---|---|
| group127 | 7OF0_M_A | M: 39s ribosomal protein l15, mitochondrial, Homo sapiens (natural) A: 16s ribosomal RNA, Homo sapiens (natural) | Q9P015 | Ribosomal proteins L15p and L18e | Bacterial large subunit ribosomal RNA | ✔ |
|
Interologs
Total number of interologs for this interface: 3
| Interface 1 | Interface 2 |
Percentage conservation |
Interface TM-score |
Interface RMSD |
Percentage identity |
Common ECOD label(s) |
Common RFAM label(s) |
Explore both interfaces |
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| 7OF0_M_A | 7RYG_K_A | 0.68 | 0.85 | 2.79 | 0.38 | Ribosomal proteins L15p and L18e | Bacterial large subunit ribosomal RNA | compare |
| 4Y4O_1P_1A | 7OF0_M_A | 0.69 | 0.89 | 2.15 | 0.33 | Ribosomal proteins L15p and L18e | Bacterial large subunit ribosomal RNA | compare |
| 6S0Z_J_A | 7OF0_M_A | 0.78 | 0.88 | 2.04 | 0.38 | Ribosomal proteins L15p and L18e | Bacterial large subunit ribosomal RNA | compare |