Interface analysis
Style
Protein
CartoonLicorice
Surface
RNA
CartoonLicorice
Surface
Color
StructureStructure (with hetatm)
Chain
Chainbow
View
Focus on
InterfaceRNA
Protein
All
Show chains
Interface
show interface as licoriceCommon contacts -
7OF0_M
|
7OF0_A
|
7RYG_K
|
7RYG_A
|
Conserved?
|
---|---|---|---|---|
M:55 [GLY] | A:2015 [G] | K:39 [GLY] | A:803 [G] | ✔ |
M:55 [GLY] | A:2016 [C] | K:39 [GLY] | A:804 [C] | ✔ |
M:55 [GLY] | A:2040 [G] | K:39 [GLY] | A:829 [G] | ✔ |
M:55 [GLY] | A:2041 [U] | K:39 [GLY] | A:830 [U] | ✔ |
M:58 [GLN] | A:1903 [C] | K:42 [SER] | A:669 [C] | ✔ |
M:87 [HIS] | A:1744 [A] | K:71 [GLN] | A:251 [A] | ✔ |
M:69 [GLY] | A:1724 [A] | K:54 [GLY] | A:203 [A] | ✔ |
M:69 [GLY] | A:2034 [A] | K:54 [GLY] | A:823 [A] | ✔ |
M:69 [GLY] | A:2035 [U] | K:54 [GLY] | A:824 [U] | ✔ |
M:69 [GLY] | A:2037 [U] | K:54 [GLY] | A:826 [U] | ✔ |
M:69 [GLY] | A:2040 [G] | K:54 [GLY] | A:829 [G] | ✔ |
M:69 [GLY] | A:2041 [U] | K:54 [GLY] | A:830 [U] | ✔ |
M:69 [GLY] | A:2042 [U] | K:54 [GLY] | A:831 [A] | ✔ |
M:37 [GLU] | A:1900 [A] | K:18 [HIS] | A:660 [G] | ✔ |
M:37 [GLU] | A:1901 [C] | K:18 [HIS] | A:661 [G] | ✔ |
M:37 [GLU] | A:2293 [A] | K:18 [HIS] | A:1244 [U] | ✔ |
M:77 [ARG] | A:2868 [C] | K:62 [ARG] | A:2356 [A] | ✔ |
M:77 [ARG] | A:2897 [A] | K:62 [ARG] | A:2388 [A] | ✔ |
M:77 [ARG] | A:2898 [U] | K:62 [ARG] | A:2389 [U] | ✔ |
M:77 [ARG] | A:2916 [G] | K:62 [ARG] | A:2424 [G] | ✔ |
M:75 [TYR] | A:1750 [G] | K:60 [TYR] | A:257 [G] | ✔ |
M:75 [TYR] | A:1751 [A] | K:60 [TYR] | A:258 [A] | ✔ |
M:79 [PRO] | A:2898 [U] | K:64 [PRO] | A:2389 [U] | ✔ |
M:79 [PRO] | A:2899 [C] | K:64 [PRO] | A:2390 [C] | ✔ |
M:41 [ARG] | A:1868 [G] | K:23 [ARG] | A:585 [C] | ✔ |
M:41 [ARG] | A:2021 [U] | K:23 [ARG] | A:809 [U] | ✔ |
M:41 [ARG] | A:2022 [G] | K:23 [ARG] | A:810 [C] | ✔ |
M:41 [ARG] | A:2293 [A] | K:23 [ARG] | A:1244 [U] | ✔ |
M:41 [ARG] | A:2294 [A] | K:23 [ARG] | A:1245 [G] | ✔ |
M:25 [ALA] | A:2279 [U] | K:6 [ASN] | A:1198 [U] | ✔ |
M:25 [ALA] | A:2286 [A] | K:6 [ASN] | A:1237 [U] | ✔ |
M:25 [ALA] | A:2287 [U] | K:6 [ASN] | A:1238 [C] | ✔ |
M:74 [PHE] | A:2867 [C] | K:59 [ILE] | A:2355 [C] | ✔ |
M:74 [PHE] | A:2868 [C] | K:59 [ILE] | A:2356 [A] | ✔ |
M:35 [LYS] | A:1899 [G] | K:16 [ARG] | A:659 [U] | ✔ |
M:35 [LYS] | A:1900 [A] | K:16 [ARG] | A:660 [G] | ✔ |
M:35 [LYS] | A:2269 [G] | K:16 [ARG] | A:1188 [G] | ✔ |
M:68 [GLU] | A:2034 [A] | K:53 [GLU] | A:823 [A] | ✔ |
M:68 [GLU] | A:2041 [U] | K:53 [GLU] | A:830 [U] | ✔ |
M:68 [GLU] | A:2042 [U] | K:53 [GLU] | A:831 [A] | ✔ |
M:71 [GLN] | A:2034 [A] | K:56 [GLN] | A:823 [A] | ✔ |
M:71 [GLN] | A:2035 [U] | K:56 [GLN] | A:824 [U] | ✔ |
M:71 [GLN] | A:2866 [A] | K:56 [GLN] | A:2354 [A] | ✔ |
M:71 [GLN] | A:2867 [C] | K:56 [GLN] | A:2355 [C] | ✔ |
M:71 [GLN] | A:2916 [G] | K:56 [GLN] | A:2424 [G] | ✔ |
M:130 [GLN] | A:1889 [C] | K:104 [ARG] | A:621 [C] | ✔ |
M:51 [ARG] | A:1868 [G] | K:35 [ARG] | A:585 [C] | ✔ |
M:51 [ARG] | A:1903 [C] | K:35 [ARG] | A:669 [C] | ✔ |
M:51 [ARG] | A:2094 [G] | K:35 [ARG] | A:939 [G] | ✔ |
M:51 [ARG] | A:2266 [U] | K:35 [ARG] | A:1185 [G] | ✔ |
M:109 [ARG] | A:1883 [G] | K:86 [LYS] | A:602 [G] | ✔ |
M:70 [GLY] | A:2035 [U] | K:55 [GLY] | A:824 [U] | ✔ |
M:70 [GLY] | A:2040 [G] | K:55 [GLY] | A:829 [G] | ✔ |
M:70 [GLY] | A:2916 [G] | K:55 [GLY] | A:2424 [G] | ✔ |
M:46 [GLY] | A:2021 [U] | K:30 [GLY] | A:809 [U] | ✔ |
M:56 [GLU] | A:1724 [A] | K:40 [GLN] | A:203 [A] | ✔ |
M:56 [GLU] | A:2015 [G] | K:40 [GLN] | A:803 [G] | ✔ |
M:56 [GLU] | A:2016 [C] | K:40 [GLN] | A:804 [C] | ✔ |
M:56 [GLU] | A:2040 [G] | K:40 [GLN] | A:829 [G] | ✔ |
M:56 [GLU] | A:2041 [U] | K:40 [GLN] | A:830 [U] | ✔ |
M:134 [ARG] | A:1740 [A] | K:106 [ASP] | A:247 [C] | ✔ |
M:29 [PRO] | A:2288 [A] | K:10 [PRO] | A:1239 [A] | ✔ |
M:29 [PRO] | A:2289 [G] | K:10 [PRO] | A:1240 [G] | ✔ |
M:64 [ARG] | A:1723 [A] | K:49 [ARG] | A:202 [A] | ✔ |
M:64 [ARG] | A:1724 [A] | K:49 [ARG] | A:203 [A] | ✔ |
M:64 [ARG] | A:1751 [A] | K:49 [ARG] | A:258 [A] | ✔ |
M:64 [ARG] | A:1752 [U] | K:49 [ARG] | A:259 [G] | ✔ |
M:52 [GLY] | A:2094 [G] | K:36 [GLY] | A:939 [G] | ✔ |
M:52 [GLY] | A:2095 [U] | K:36 [GLY] | A:940 [A] | ✔ |
M:52 [GLY] | A:2265 [A] | K:36 [GLY] | A:1184 [A] | ✔ |
M:52 [GLY] | A:2266 [U] | K:36 [GLY] | A:1185 [G] | ✔ |
M:63 [PRO] | A:2041 [U] | K:48 [VAL] | A:830 [U] | ✔ |
M:59 [ARG] | A:1903 [C] | K:43 [ARG] | A:669 [C] | ✔ |
M:59 [ARG] | A:2015 [G] | K:43 [ARG] | A:803 [G] | ✔ |
M:59 [ARG] | A:2016 [C] | K:43 [ARG] | A:804 [C] | ✔ |
M:59 [ARG] | A:2017 [U] | K:43 [ARG] | A:805 [U] | ✔ |
M:59 [ARG] | A:2018 [G] | K:43 [ARG] | A:806 [G] | ✔ |
M:57 [ARG] | A:2040 [G] | K:41 [LYS] | A:829 [G] | ✔ |
M:57 [ARG] | A:2041 [U] | K:41 [LYS] | A:830 [U] | ✔ |
M:57 [ARG] | A:2042 [U] | K:41 [LYS] | A:831 [A] | ✔ |
M:57 [ARG] | A:2094 [G] | K:41 [LYS] | A:939 [G] | ✔ |
M:42 [GLY] | A:2021 [U] | K:24 [GLY] | A:809 [U] | ✔ |
M:42 [GLY] | A:2022 [G] | K:24 [GLY] | A:810 [C] | ✔ |
M:42 [GLY] | A:2023 [U] | K:24 [GLY] | A:811 [U] | ✔ |
M:36 [PRO] | A:1900 [A] | K:17 [GLU] | A:660 [G] | ✔ |
M:26 [ASN] | A:2287 [U] | K:7 [GLU] | A:1238 [C] | ✔ |
M:54 [LYS] | A:1848 [U] | K:38 [LYS] | A:565 [U] | ✔ |
M:54 [LYS] | A:1849 [C] | K:38 [LYS] | A:566 [U] | ✔ |
M:54 [LYS] | A:2017 [U] | K:38 [LYS] | A:805 [U] | ✔ |
M:54 [LYS] | A:2018 [G] | K:38 [LYS] | A:806 [G] | ✔ |
M:78 [ILE] | A:2868 [C] | K:63 [LEU] | A:2356 [A] | ✔ |
M:78 [ILE] | A:2869 [A] | K:63 [LEU] | A:2357 [A] | ✔ |
M:78 [ILE] | A:2897 [A] | K:63 [LEU] | A:2388 [A] | ✔ |
M:78 [ILE] | A:2898 [U] | K:63 [LEU] | A:2389 [U] | ✔ |
M:78 [ILE] | A:2899 [C] | K:63 [LEU] | A:2390 [C] | ✔ |
M:72 [THR] | A:2897 [A] | K:57 [THR] | A:2388 [A] | ✔ |
M:72 [THR] | A:2916 [G] | K:57 [THR] | A:2424 [G] | ✔ |
M:72 [THR] | A:2917 [G] | K:57 [THR] | A:2425 [G] | ✔ |
M:32 [GLY] | A:1876 [U] | K:13 [GLY] | A:595 [G] | ✔ |
M:32 [GLY] | A:1877 [U] | K:13 [GLY] | A:596 [U] | ✔ |
M:48 [LYS] | A:1868 [G] | K:32 [THR] | A:585 [C] | ✔ |
M:48 [LYS] | A:2020 [U] | K:32 [THR] | A:808 [U] | ✔ |
M:48 [LYS] | A:2265 [A] | K:32 [THR] | A:1184 [A] | ✔ |
M:48 [LYS] | A:2266 [U] | K:32 [THR] | A:1185 [G] | ✔ |
M:80 [LYS] | A:1749 [C] | K:65 [LYS] | A:256 [C] | ✔ |
M:80 [LYS] | A:2898 [U] | K:65 [LYS] | A:2389 [U] | ✔ |
M:80 [LYS] | A:2899 [C] | K:65 [LYS] | A:2390 [C] | ✔ |
M:80 [LYS] | A:2900 [C] | K:65 [LYS] | A:2391 [C] | ✔ |
M:50 [GLY] | A:2093 [U] | K:34 [GLY] | A:938 [A] | ✔ |
M:50 [GLY] | A:2094 [G] | K:34 [GLY] | A:939 [G] | ✔ |
M:50 [GLY] | A:2266 [U] | K:34 [GLY] | A:1185 [G] | ✔ |
M:50 [GLY] | A:2267 [U] | K:34 [GLY] | A:1186 [G] | ✔ |
M:27 [LEU] | A:2287 [U] | K:8 [LEU] | A:1238 [C] | ✔ |
M:27 [LEU] | A:2288 [A] | K:8 [LEU] | A:1239 [A] | ✔ |
M:39 [ARG] | A:2293 [A] | K:20 [ARG] | A:1244 [U] | ✔ |
M:39 [ARG] | A:2294 [A] | K:20 [ARG] | A:1245 [G] | ✔ |
M:67 [PHE] | A:1724 [A] | K:52 [PHE] | A:203 [A] | ✔ |
M:67 [PHE] | A:2041 [U] | K:52 [PHE] | A:830 [U] | ✔ |
M:67 [PHE] | A:2042 [U] | K:52 [PHE] | A:831 [A] | ✔ |
M:33 [SER] | A:1876 [U] | K:14 [ALA] | A:595 [G] | ✔ |
M:33 [SER] | A:1877 [U] | K:14 [ALA] | A:596 [U] | ✔ |
M:33 [SER] | A:1898 [A] | K:14 [ALA] | A:658 [C] | ✔ |
M:33 [SER] | A:1899 [G] | K:14 [ALA] | A:659 [U] | ✔ |
M:53 [HIS] | A:1848 [U] | K:37 [ILE] | A:565 [U] | ✔ |
M:53 [HIS] | A:2094 [G] | K:37 [ILE] | A:939 [G] | ✔ |
M:53 [HIS] | A:2095 [U] | K:37 [ILE] | A:940 [A] | ✔ |
M:53 [HIS] | A:2265 [A] | K:37 [ILE] | A:1184 [A] | ✔ |
M:38 [ARG] | A:1900 [A] | K:19 [ARG] | A:660 [G] | ✔ |
M:38 [ARG] | A:1901 [C] | K:19 [ARG] | A:661 [G] | ✔ |
M:31 [PRO] | A:1877 [U] | K:12 [GLU] | A:596 [U] | ✔ |
M:28 [LYS] | A:2287 [U] | K:9 [ALA] | A:1238 [C] | ✔ |
M:28 [LYS] | A:2288 [A] | K:9 [ALA] | A:1239 [A] | ✔ |
M:76 [ILE] | A:1750 [G] | K:61 [ARG] | A:257 [G] | ✔ |
M:76 [ILE] | A:2898 [U] | K:61 [ARG] | A:2389 [U] | ✔ |
M:47 [ARG] | A:1847 [U] | K:31 [LYS] | A:564 [U] | ✔ |
M:47 [ARG] | A:2020 [U] | K:31 [LYS] | A:808 [U] | ✔ |
M:47 [ARG] | A:2021 [U] | K:31 [LYS] | A:809 [U] | ✔ |
M:30 [ASN] | A:1877 [U] | K:11 [ALA] | A:596 [U] | ✔ |
M:30 [ASN] | A:1878 [U] | K:11 [ALA] | A:597 [A] | ✔ |
M:24 [LEU] | A:2278 [A] | K:5 [LEU] | A:1197 [G] | ✔ |
M:24 [LEU] | A:2279 [U] | K:5 [LEU] | A:1198 [U] | ✔ |
M:24 [LEU] | A:2287 [U] | K:5 [LEU] | A:1238 [C] | ✔ |
M:49 [CYS] | A:2266 [U] | K:33 [GLY] | A:1185 [G] | ✔ |
M:34 [LYS] | A:1898 [A] | K:15 [LYS] | A:658 [C] | ✔ |
M:34 [LYS] | A:1899 [G] | K:15 [LYS] | A:659 [U] | ✔ |
M:34 [LYS] | A:2289 [G] | K:15 [LYS] | A:1240 [G] | ✔ |
M:40 [PRO] | A:1868 [G] | K:21 [LEU] | A:585 [C] | ✔ |
M:43 [ARG] | A:2023 [U] | K:25 [ILE] | A:811 [U] | ✔ |
M:58 [GLN] | A:1868 [G] | K:42 [SER] | A:585 [C] | ❌ 7RYG_K_A |
M:58 [GLN] | A:2020 [U] | K:42 [SER] | A:808 [U] | ❌ 7RYG_K_A |
M:89 [PHE] | A:1744 [A] | K:73 [ALA] | A:251 [A] | ❌ 7RYG_K_A |
M:89 [PHE] | A:1745 [U] | K:73 [ALA] | A:252 [G] | ❌ 7RYG_K_A |
M:87 [HIS] | A:1743 [U] | K:71 [GLN] | A:250 [U] | ❌ 7RYG_K_A |
M:37 [GLU] | A:1869 [A] | K:18 [HIS] | A:586 [U] | ❌ 7RYG_K_A |
M:45 [ARG] | A:2023 [U] | K:29 [VAL] | A:811 [U] | ❌ 7RYG_K_A |
M:45 [ARG] | A:2024 [C] | K:29 [VAL] | A:812 [C] | ❌ 7RYG_K_A |
M:45 [ARG] | A:2269 [G] | K:29 [VAL] | A:1188 [G] | ❌ 7RYG_K_A |
M:45 [ARG] | A:2270 [A] | K:29 [VAL] | A:1189 [A] | ❌ 7RYG_K_A |
M:77 [ARG] | A:2917 [G] | K:62 [ARG] | A:2425 [G] | ❌ 7RYG_K_A |
M:51 [ARG] | A:1902 [C] | K:35 [ARG] | A:668 [A] | ❌ 7RYG_K_A |
M:51 [ARG] | A:2265 [A] | K:35 [ARG] | A:1184 [A] | ❌ 7RYG_K_A |
M:70 [GLY] | A:1724 [A] | K:55 [GLY] | A:203 [A] | ❌ 7RYG_K_A |
M:134 [ARG] | A:1741 [A] | K:106 [ASP] | A:248 [A] | ❌ 7RYG_K_A |
M:134 [ARG] | A:1743 [U] | K:106 [ASP] | A:250 [U] | ❌ 7RYG_K_A |
M:63 [PRO] | A:1724 [A] | K:48 [VAL] | A:203 [A] | ❌ 7RYG_K_A |
M:57 [ARG] | A:2095 [U] | K:41 [LYS] | A:940 [A] | ❌ 7RYG_K_A |
M:36 [PRO] | A:2270 [A] | K:17 [GLU] | A:1189 [A] | ❌ 7RYG_K_A |
M:54 [LYS] | A:2016 [C] | K:38 [LYS] | A:804 [C] | ❌ 7RYG_K_A |
M:54 [LYS] | A:2040 [G] | K:38 [LYS] | A:829 [G] | ❌ 7RYG_K_A |
M:48 [LYS] | A:1847 [U] | K:32 [THR] | A:564 [U] | ❌ 7RYG_K_A |
M:48 [LYS] | A:1848 [U] | K:32 [THR] | A:565 [U] | ❌ 7RYG_K_A |
M:80 [LYS] | A:1750 [G] | K:65 [LYS] | A:257 [G] | ❌ 7RYG_K_A |
M:39 [ARG] | A:1901 [C] | K:20 [ARG] | A:661 [G] | ❌ 7RYG_K_A |
M:38 [ARG] | A:1902 [C] | K:19 [ARG] | A:668 [A] | ❌ 7RYG_K_A |
M:38 [ARG] | A:2269 [G] | K:19 [ARG] | A:1188 [G] | ❌ 7RYG_K_A |
M:38 [ARG] | A:2270 [A] | K:19 [ARG] | A:1189 [A] | ❌ 7RYG_K_A |
M:94 [LYS] | A:1891 [A] | K:78 [GLU] | A:623 [G] | ❌ 7RYG_K_A |
M:76 [ILE] | A:1751 [A] | K:61 [ARG] | A:258 [A] | ❌ 7RYG_K_A |
M:88 [SER] | A:1743 [U] | K:72 [ILE] | A:250 [U] | ❌ 7RYG_K_A |
M:88 [SER] | A:1744 [A] | K:72 [ILE] | A:251 [A] | ❌ 7RYG_K_A |
M:61 [THR] | A:2014 [A] | K:46 [GLY] | A:802 [A] | ❌ 7RYG_K_A |
M:61 [THR] | A:2015 [G] | K:46 [GLY] | A:803 [G] | ❌ 7RYG_K_A |
M:47 [ARG] | A:2265 [A] | K:31 [LYS] | A:1184 [A] | ❌ 7RYG_K_A |
M:49 [CYS] | A:1868 [G] | K:33 [GLY] | A:585 [C] | ❌ 7RYG_K_A |
M:49 [CYS] | A:2020 [U] | K:33 [GLY] | A:808 [U] | ❌ 7RYG_K_A |
M:62 [ARG] | A:2041 [U] | K:47 [GLY] | A:830 [U] | ❌ 7RYG_K_A |
M:62 [ARG] | A:2042 [U] | K:47 [GLY] | A:831 [A] | ❌ 7RYG_K_A |
M:62 [ARG] | A:2093 [U] | K:47 [GLY] | A:938 [A] | ❌ 7RYG_K_A |
M:62 [ARG] | A:2094 [G] | K:47 [GLY] | A:939 [G] | ❌ 7RYG_K_A |
M:34 [LYS] | A:2288 [A] | K:15 [LYS] | A:1239 [A] | ❌ 7RYG_K_A |
M:40 [PRO] | A:1902 [C] | K:21 [LEU] | A:668 [A] | ❌ 7RYG_K_A |
M:40 [PRO] | A:2021 [U] | K:21 [LEU] | A:809 [U] | ❌ 7RYG_K_A |
M:43 [ARG] | A:2024 [C] | K:25 [ILE] | A:812 [C] | ❌ 7RYG_K_A |
M:130 [GLN] | A:1740 [A] | K:104 [ARG] | A:247 [C] | ❌ 7OF0_M_A |
M:130 [GLN] | A:1741 [A] | K:104 [ARG] | A:248 [A] | ❌ 7OF0_M_A |
M:130 [GLN] | A:1888 [G] | K:104 [ARG] | A:620 [G] | ❌ 7OF0_M_A |
M:31 [PRO] | A:1876 [U] | K:12 [GLU] | A:595 [G] | ❌ 7OF0_M_A |
M:35 [LYS] | A:2270 [A] | K:16 [ARG] | A:1189 [A] | ❌ 7OF0_M_A |
M:36 [PRO] | A:1901 [C] | K:17 [GLU] | A:661 [G] | ❌ 7OF0_M_A |
M:38 [ARG] | A:2267 [U] | K:19 [ARG] | A:1186 [G] | ❌ 7OF0_M_A |
M:38 [ARG] | A:1869 [A] | K:19 [ARG] | A:586 [U] | ❌ 7OF0_M_A |
M:39 [ARG] | A:2022 [G] | K:20 [ARG] | A:810 [C] | ❌ 7OF0_M_A |
M:41 [ARG] | A:2023 [U] | K:23 [ARG] | A:811 [U] | ❌ 7OF0_M_A |
M:41 [ARG] | A:2020 [U] | K:23 [ARG] | A:808 [U] | ❌ 7OF0_M_A |
M:45 [ARG] | A:2267 [U] | K:29 [VAL] | A:1186 [G] | ❌ 7OF0_M_A |
M:47 [ARG] | A:1868 [G] | K:31 [LYS] | A:585 [C] | ❌ 7OF0_M_A |
M:47 [ARG] | A:1848 [U] | K:31 [LYS] | A:565 [U] | ❌ 7OF0_M_A |
M:51 [ARG] | A:2095 [U] | K:35 [ARG] | A:940 [A] | ❌ 7OF0_M_A |
M:53 [HIS] | A:1849 [C] | K:37 [ILE] | A:566 [U] | ❌ 7OF0_M_A |
M:61 [THR] | A:1903 [C] | K:46 [GLY] | A:669 [C] | ❌ 7OF0_M_A |
M:63 [PRO] | A:2042 [U] | K:48 [VAL] | A:831 [A] | ❌ 7OF0_M_A |
M:67 [PHE] | A:2040 [G] | K:52 [PHE] | A:829 [G] | ❌ 7OF0_M_A |
M:25 [ALA] | A:2278 [A] | K:6 [ASN] | A:1197 [G] | ❌ 7OF0_M_A |
M:77 [ARG] | A:2867 [C] | K:62 [ARG] | A:2355 [C] | ❌ 7OF0_M_A |
M:87 [HIS] | A:1745 [U] | K:71 [GLN] | A:252 [G] | ❌ 7OF0_M_A |
M:58 [GLN] | A:2019 [G] | K:42 [SER] | A:807 [G] | ❌ 7RYG_A:807 no longer at interface |
M:45 [ARG] | A:2268 [G] | K:29 [VAL] | A:1187 [G] | ❌ 7RYG_A:1187 no longer at interface |
M:41 [ARG] | A:1867 [A] | K:23 [ARG] | A:584 [A] | ❌ 7RYG_A:584 no longer at interface |
M:25 [ALA] | A:2280 [C] | K:6 [ASN] | A:1201 [G] | ❌ 7RYG_A:1201 no longer at interface |
M:130 [GLN] | A:1890 [C] | K:104 [ARG] | A:622 [C] | ❌ 7RYG_A:622 no longer at interface |
M:109 [ARG] | A:1882 [A] | K:86 [LYS] | A:601 [A] | ❌ 7RYG_A:601 no longer at interface |
M:100 [ARG] | A:1882 [A] | K:82 [SER] | A:601 [A] | ❌ 7RYG_K:82, 7RYG_A:601 no longer at interface |
M:57 [ARG] | A:2096 [U] | K:41 [LYS] | A:941 [C] | ❌ 7RYG_A:941 no longer at interface |
M:80 [LYS] | A:1747 [G] | K:65 [LYS] | A:254 [G] | ❌ 7RYG_A:254 no longer at interface |
M:53 [HIS] | A:2264 [A] | K:37 [ILE] | A:1183 [U] | ❌ 7RYG_A:1183 no longer at interface |
M:38 [ARG] | A:2271 [C] | K:19 [ARG] | A:1190 [G] | ❌ 7RYG_A:1190 no longer at interface |
M:47 [ARG] | A:2264 [A] | K:31 [LYS] | A:1183 [U] | ❌ 7RYG_A:1183 no longer at interface |
M:44 [ARG] | A:2025 [C] | K:28 [GLY] | A:813 [C] | ❌ 7RYG_K:28, 7RYG_A:813 no longer at interface |
M:44 [ARG] | A:2026 [A] | K:28 [GLY] | A:814 [C] | ❌ 7RYG_K:28, 7RYG_A:814 no longer at interface |
M:44 [ARG] | A:2268 [G] | K:28 [GLY] | A:1187 [G] | ❌ 7RYG_K:28, 7RYG_A:1187 no longer at interface |
M:43 [ARG] | A:2025 [C] | K:25 [ILE] | A:813 [C] | ❌ 7RYG_A:813 no longer at interface |
M:43 [ARG] | A:2264 [A] | K:25 [ILE] | A:1183 [U] | ❌ 7RYG_A:1183 no longer at interface |
M:131 [PRO] | A:1758 [U] | K:105 [ARG] | A:266 [G] | ❌ 7OF0_M:131, 7OF0_A:1758 no longer at interface |
M:143 [GLU] | A:1892 [A] | K:115 [SER] | A:624 [U] | ❌ 7OF0_M:143, 7OF0_A:1892 no longer at interface |
M:39 [ARG] | A:2272 [C] | K:20 [ARG] | A:1191 [C] | ❌ 7OF0_A:2272 no longer at interface |
M:60 [GLY] | A:1904 [C] | K:44 [LYS] | A:670 [C] | ❌ 7OF0_M:60, 7OF0_A:1904 no longer at interface |
M:25 [ALA] | A:2285 [U] | K:6 [ASN] | A:1236 [A] | ❌ 7OF0_A:2285 no longer at interface |
M:76 [ILE] | A:2919 [A] | K:61 [ARG] | A:2427 [U] | ❌ 7OF0_A:2919 no longer at interface |
M:81 [TYR] | A:2905 [A] | K:66 [PHE] | A:2411 [G] | ❌ 7OF0_M:81, 7OF0_A:2905 no longer at interface |
M:82 [GLY] | A:2905 [A] | K:67 [GLY] | A:2411 [G] | ❌ 7OF0_M:82, 7OF0_A:2905 no longer at interface |
M:83 [PHE] | A:2905 [A] | K:68 [PHE] | A:2411 [G] | ❌ 7OF0_M:83, 7OF0_A:2905 no longer at interface |
M:96 [LEU] | A:1892 [A] | K:80 [ARG] | A:624 [U] | ❌ 7OF0_M:96, 7OF0_A:1892 no longer at interface |
M:101 [LEU] | A:1892 [A] | K:83 [GLU] | A:624 [U] | ❌ 7OF0_M:101, 7OF0_A:1892 no longer at interface |
M:23 [SER] | A:2279 [U] | K:4 [ARG] | A:1198 [U] | ❌ 7RYG_K:4 no longer at interface |
M:100 [ARG] | A:1883 [G] | K:82 [SER] | A:602 [G] | ❌ 7RYG_K:82 no longer at interface |
M:104 [LEU] | A:1883 [G] | K:85 [SER] | A:602 [G] | ❌ 7RYG_K:85 no longer at interface |
M:44 [ARG] | A:2024 [C] | K:28 [GLY] | A:812 [C] | ❌ 7RYG_K:28 no longer at interface |
M:44 [ARG] | A:2267 [U] | K:28 [GLY] | A:1186 [G] | ❌ 7RYG_K:28 no longer at interface |
M:44 [ARG] | A:2269 [G] | K:28 [GLY] | A:1188 [G] | ❌ 7RYG_K:28 no longer at interface |
M:122 [VAL] | A:1887 [A] | K:101 [ASN] | A:619 [A] | ❌ 7OF0_M:122 no longer at interface |
M:122 [VAL] | A:1888 [G] | K:101 [ASN] | A:620 [G] | ❌ 7OF0_M:122 no longer at interface |
M:131 [PRO] | A:1759 [U] | K:105 [ARG] | A:267 [G] | ❌ 7OF0_M:131 no longer at interface |
M:131 [PRO] | A:1887 [A] | K:105 [ARG] | A:619 [A] | ❌ 7OF0_M:131 no longer at interface |
M:131 [PRO] | A:1888 [G] | K:105 [ARG] | A:620 [G] | ❌ 7OF0_M:131 no longer at interface |
M:60 [GLY] | A:1902 [C] | K:44 [LYS] | A:668 [A] | ❌ 7OF0_M:60 no longer at interface |
M:60 [GLY] | A:2014 [A] | K:44 [LYS] | A:802 [A] | ❌ 7OF0_M:60 no longer at interface |
M:60 [GLY] | A:1903 [C] | K:44 [LYS] | A:669 [C] | ❌ 7OF0_M:60 no longer at interface |
M:85 [GLU] | A:1744 [A] | K:69 [THR] | A:251 [A] | ❌ 7OF0_M:85 no longer at interface |
M:85 [GLU] | A:1745 [U] | K:69 [THR] | A:252 [G] | ❌ 7OF0_M:85 no longer at interface |
M:90 [ARG] | A:1743 [U] | K:74 [LEU] | A:250 [U] | ❌ 7OF0_M:90 no longer at interface |
M:90 [ARG] | A:1744 [A] | K:74 [LEU] | A:251 [A] | ❌ 7OF0_M:90 no longer at interface |
M:91 [ARG] | A:1757 [A] | K:75 [LYS] | A:264 [C] | ❌ 7OF0_M:91 no longer at interface |
M:101 [LEU] | A:1891 [A] | K:83 [GLU] | A:623 [G] | ❌ 7OF0_M:101 no longer at interface |
M:119 [THR] | A:1887 [A] | K:98 [LYS] | A:619 [A] | ❌ 7OF0_M:119 no longer at interface |
M:120 [GLN] | A:1887 [A] | K:99 [ALA] | A:619 [A] | ❌ 7OF0_M:120 no longer at interface |
Properties of this pair
Common ECOD label(s) |
Common RFAM label(s) |
Interface TM-score |
Interface RMSD |
Percentage identity |
Protein TM-score |
RNA TM-score |
Protein coverage |
RNA coverage |
Percentage conservation |
Apolar conservation |
H-bond conservation |
Percentage switching out |
---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
Ribosomal proteins L15p and L18e | Bacterial large subunit ribosomal RNA | 0.85 | 2.79 | 0.38 | 0.72 | 0.93 | 0.82 | 0.83 | 0.68 | 0.66 | 0.42 | 0.43 |
Other pairs involving 7OF0_M_A or 7RYG_K_A
Total number of entries: 6
Interface 1 | Interface 2 |
Percentage conservation |
Interface TM-score |
Interface RMSD |
Percentage identity |
Common ECOD label(s) |
Common RFAM label(s) |
Explore both interfaces |
---|---|---|---|---|---|---|---|---|
7OF0_M_A | 7RYG_K_A | 0.68 | 0.85 | 2.79 | 0.38 | Ribosomal proteins L15p and L18e | Bacterial large subunit ribosomal RNA | compare |
1YHQ_L_0 | 7RYG_K_A | 0.38 | 0.91 | 4.41 | 0.15 | Ribosomal proteins L15p and L18e | compare | |
4Y4O_1P_1A | 7OF0_M_A | 0.69 | 0.89 | 2.15 | 0.33 | Ribosomal proteins L15p and L18e | Bacterial large subunit ribosomal RNA | compare |
4Y4O_1P_1A | 7RYG_K_A | 0.71 | 0.96 | 2.76 | 0.39 | Ribosomal proteins L15p and L18e | Bacterial large subunit ribosomal RNA | compare |
6S0Z_J_A | 7RYG_K_A | 0.78 | 0.97 | 1.41 | 0.47 | Ribosomal proteins L15p and L18e | Bacterial large subunit ribosomal RNA | compare |
6S0Z_J_A | 7OF0_M_A | 0.78 | 0.88 | 2.04 | 0.38 | Ribosomal proteins L15p and L18e | Bacterial large subunit ribosomal RNA | compare |