Interface analysis
Style
Protein
CartoonLicorice
Surface
RNA
CartoonLicorice
Surface
Color
ChainChain (with hetatm)
Chainbow
Hydrophobicity Electrostatics (surface only) Conservation*
View
Focus on
InterfaceRNA
Protein
All
Show chains
Interface
show as licoriceshow Accessibility
Rim - Core
Contacts -
| 7RYG_K
|
7RYG_A
|
Distance
|
Base Pair
|
Hbond nuc:res
|
Base Stacking
|
Residue conservation
|
|---|---|---|---|---|---|---|
| K:5 [LEU] | A:1197 [G] | 3.29 | A:1238 [C] | base:BB | 77.82 | |
| K:5 [LEU] | A:1198 [U] | 4.04 | A:1237 [U] | 77.82 | ||
| K:5 [LEU] | A:1238 [C] | 4.2 | A:1197 [G] | 77.82 | ||
| K:6 [ASN] | A:1197 [G] | 3.88 | A:1238 [C] | 66.63 | ||
| K:6 [ASN] | A:1198 [U] | 3.52 | A:1237 [U] | 66.63 | ||
| K:6 [ASN] | A:1236 [A] | 4.56 | A:1199 [A] | 66.63 | ||
| K:6 [ASN] | A:1237 [U] | 3.24 | A:1198 [U] | base:SC | 66.63 | |
| K:6 [ASN] | A:1238 [C] | 3.34 | A:1197 [G] | 66.63 | ||
| K:7 [GLU] | A:1238 [C] | 4.27 | A:1197 [G] | 49.04 | ||
| K:8 [LEU] | A:1238 [C] | 3.57 | A:1197 [G] | 77.7 | ||
| K:8 [LEU] | A:1239 [A] | 3.7 | A:1196 [U] | 77.7 | ||
| K:9 [ALA] | A:1238 [C] | 4.9 | A:1197 [G] | 41.78 | ||
| K:9 [ALA] | A:1239 [A] | 4.15 | A:1196 [U] | 41.78 | ||
| K:10 [PRO] | A:1239 [A] | 4.05 | A:1196 [U] | 50.34 | ||
| K:10 [PRO] | A:1240 [G] | 4.04 | A:1195 [C] | 50.34 | ||
| K:11 [ALA] | A:596 [U] | 3.65 | A:657 [G] | 36.79 | ||
| K:11 [ALA] | A:597 [A] | 4.4 | A:656 [U] | 36.79 | ||
| K:12 [GLU] | A:595 [G] | 4.86 | A:658 [C] | 6.55 | ||
| K:12 [GLU] | A:596 [U] | 3.33 | A:657 [G] | 6.55 | ||
| K:13 [GLY] | A:595 [G] | 2.6 | A:658 [C] | sugar:BB | 49.03 | |
| K:13 [GLY] | A:596 [U] | 3.74 | A:657 [G] | 49.03 | ||
| K:14 [ALA] | A:595 [G] | 3.27 | A:658 [C] | base:BB | 68.88 | |
| K:14 [ALA] | A:596 [U] | 3.87 | A:657 [G] | 68.88 | ||
| K:14 [ALA] | A:658 [C] | 4.61 | A:595 [G] | 68.88 | ||
| K:14 [ALA] | A:659 [U] | 3.56 | A:594 [A] | sugar:BB | 68.88 | |
| K:15 [LYS] | A:658 [C] | 3.85 | A:595 [G] | 52.23 | ||
| K:15 [LYS] | A:659 [U] | 3.64 | A:594 [A] | 52.23 | ||
| K:15 [LYS] | A:1240 [G] | 3.09 | A:1195 [C] | 52.23 | ||
| K:16 [ARG] | A:659 [U] | 3.17 | A:594 [A] | sugar:BB | 55.14 | |
| K:16 [ARG] | A:660 [G] | 3.12 | A:593 [C] | 55.14 | ||
| K:16 [ARG] | A:1188 [G] | 3.26 | A:812 [C] | 55.14 | ||
| K:16 [ARG] | A:1189 [A] | 3.0 | A:811 [U] | 55.14 | ||
| K:17 [GLU] | A:660 [G] | 3.99 | A:593 [C] | 42.56 | ||
| K:17 [GLU] | A:661 [G] | 4.76 | A:592 [U] | 42.56 | ||
| K:18 [HIS] | A:660 [G] | 3.49 | A:593 [C] | 59.81 | ||
| K:18 [HIS] | A:661 [G] | 3.35 | A:592 [U] | 59.81 | ||
| K:18 [HIS] | A:1244 [U] | 3.38 | A:1192 [G] | base:SC | 59.81 | |
| K:19 [ARG] | A:586 [U] | 4.43 | A:668 [A] | 79.38 | ||
| K:19 [ARG] | A:660 [G] | 4.12 | A:593 [C] | 79.38 | ||
| K:19 [ARG] | A:661 [G] | 2.51 | A:592 [U] | 79.38 | ||
| K:19 [ARG] | A:662 [G] | 2.88 | A:591 [U] | 79.38 | ||
| K:19 [ARG] | A:1186 [G] | 4.04 | A:814 [C] | 79.38 | ||
| K:20 [ARG] | A:810 [C] | 3.41 | A:1190 [G] | 92.69 | ||
| K:20 [ARG] | A:1191 [C] | 4.72 | A:1245 [G] | 92.69 | ||
| K:20 [ARG] | A:1244 [U] | 3.39 | A:1192 [G] | base/AA stacks | 92.69 | |
| K:20 [ARG] | A:1245 [G] | 2.89 | A:1191 [C] | base:SC, base:SC | 92.69 | |
| K:21 [LEU] | A:585 [C] | 3.6 | A:808 [U] | 70.51 | ||
| K:22 [GLY] | A:808 [U] | 3.18 | A:585 [C] | sugar:BB | 95.62 | |
| K:22 [GLY] | A:809 [U] | 3.07 | 95.62 | |||
| K:23 [ARG] | A:585 [C] | 3.07 | A:808 [U] | 98.7 | ||
| K:23 [ARG] | A:808 [U] | 4.82 | A:585 [C] | 98.7 | ||
| K:23 [ARG] | A:809 [U] | 3.43 | base/AA stacks | 98.7 | ||
| K:23 [ARG] | A:810 [C] | 3.6 | A:1190 [G] | 98.7 | ||
| K:23 [ARG] | A:811 [U] | 4.99 | A:1189 [A] | 98.7 | ||
| K:23 [ARG] | A:1244 [U] | 4.57 | A:1192 [G] | 98.7 | ||
| K:23 [ARG] | A:1245 [G] | 3.43 | A:1191 [C] | 98.7 | ||
| K:24 [GLY] | A:809 [U] | 3.32 | 98.62 | |||
| K:24 [GLY] | A:810 [C] | 3.85 | A:1190 [G] | 98.62 | ||
| K:24 [GLY] | A:811 [U] | 3.96 | A:1189 [A] | 98.62 | ||
| K:25 [ILE] | A:811 [U] | 3.53 | A:1189 [A] | 46.24 | ||
| K:26 [GLY] | A:811 [U] | 2.7 | A:1189 [A] | 78.7 | ||
| K:26 [GLY] | A:812 [C] | 3.18 | A:1188 [G] | base:BB | 78.7 | |
| K:27 [SER] | A:810 [C] | 4.99 | A:1190 [G] | 93.79 | ||
| K:27 [SER] | A:811 [U] | 3.61 | A:1189 [A] | 93.79 | ||
| K:27 [SER] | A:812 [C] | 4.32 | A:1188 [G] | 93.79 | ||
| K:27 [SER] | A:1188 [G] | 4.72 | A:812 [C] | 93.79 | ||
| K:29 [VAL] | A:1186 [G] | 4.25 | A:814 [C] | 52.33 | ||
| K:30 [GLY] | A:809 [U] | 3.71 | 98.7 | |||
| K:31 [LYS] | A:564 [U] | 3.05 | A:573 [A] | 74.94 | ||
| K:31 [LYS] | A:565 [U] | 3.05 | 74.94 | |||
| K:31 [LYS] | A:585 [C] | 4.81 | A:808 [U] | 74.94 | ||
| K:31 [LYS] | A:808 [U] | 3.18 | A:585 [C] | 74.94 | ||
| K:31 [LYS] | A:809 [U] | 2.95 | 74.94 | |||
| K:32 [THR] | A:585 [C] | 4.04 | A:808 [U] | 88.38 | ||
| K:32 [THR] | A:808 [U] | 3.9 | A:585 [C] | 88.38 | ||
| K:32 [THR] | A:1184 [A] | 4.26 | A:816 [G] | 88.38 | ||
| K:32 [THR] | A:1185 [G] | 2.89 | A:815 [C] | 88.38 | ||
| K:33 [GLY] | A:1185 [G] | 4.21 | A:815 [C] | 81.54 | ||
| K:34 [GLY] | A:938 [A] | 4.38 | 89.88 | |||
| K:34 [GLY] | A:939 [G] | 3.84 | A:835 [C] | 89.88 | ||
| K:34 [GLY] | A:1185 [G] | 2.93 | A:815 [C] | 89.88 | ||
| K:34 [GLY] | A:1186 [G] | 4.27 | A:814 [C] | 89.88 | ||
| K:35 [ARG] | A:585 [C] | 3.36 | A:808 [U] | base:SC, base:SC | 93.32 | |
| K:35 [ARG] | A:669 [C] | 3.35 | A:807 [G] | base/AA stacks | 93.32 | |
| K:35 [ARG] | A:939 [G] | 3.88 | A:835 [C] | 93.32 | ||
| K:35 [ARG] | A:940 [A] | 4.53 | 93.32 | |||
| K:35 [ARG] | A:1185 [G] | 3.54 | A:815 [C] | 93.32 | ||
| K:36 [GLY] | A:939 [G] | 3.76 | A:835 [C] | 98.97 | ||
| K:36 [GLY] | A:940 [A] | 3.85 | 98.97 | |||
| K:36 [GLY] | A:1184 [A] | 3.95 | A:816 [G] | 98.97 | ||
| K:36 [GLY] | A:1185 [G] | 3.43 | A:815 [C] | 98.97 | ||
| K:37 [ILE] | A:565 [U] | 4.72 | 56.15 | |||
| K:37 [ILE] | A:566 [U] | 4.11 | A:2026 [6MZ] | 56.15 | ||
| K:37 [ILE] | A:939 [G] | 4.57 | A:835 [C] | 56.15 | ||
| K:37 [ILE] | A:940 [A] | 3.15 | 56.15 | |||
| K:37 [ILE] | A:1184 [A] | 4.74 | A:816 [G] | 56.15 | ||
| K:38 [LYS] | A:565 [U] | 3.51 | 93.57 | |||
| K:38 [LYS] | A:566 [U] | 3.36 | A:2026 [6MZ] | 93.57 | ||
| K:38 [LYS] | A:805 [U] | 2.95 | A:671 [C] | 93.57 | ||
| K:38 [LYS] | A:806 [G] | 3.55 | A:670 [C] | 93.57 | ||
| K:38 [LYS] | A:2444 [A] | 4.41 | 93.57 | |||
| K:39 [GLY] | A:803 [G] | 4.76 | 98.81 | |||
| K:39 [GLY] | A:804 [C] | 3.31 | A:672 [G] | 98.81 | ||
| K:39 [GLY] | A:829 [G] | 4.17 | A:824 [U] | 98.81 | ||
| K:39 [GLY] | A:830 [U] | 4.24 | A:823 [A] | 98.81 | ||
| K:40 [GLN] | A:203 [A] | 3.73 | base:SC, base:SC | 91.33 | ||
| K:40 [GLN] | A:803 [G] | 3.49 | 91.33 | |||
| K:40 [GLN] | A:804 [C] | 3.74 | A:672 [G] | 91.33 | ||
| K:40 [GLN] | A:829 [G] | 2.77 | A:824 [U] | sugar:SC | 91.33 | |
| K:40 [GLN] | A:830 [U] | 3.46 | A:823 [A] | 91.33 | ||
| K:41 [LYS] | A:829 [G] | 4.79 | A:824 [U] | 72.01 | ||
| K:41 [LYS] | A:830 [U] | 3.42 | A:823 [A] | 72.01 | ||
| K:41 [LYS] | A:831 [A] | 3.91 | A:822 [U] | 72.01 | ||
| K:41 [LYS] | A:939 [G] | 3.71 | A:835 [C] | 72.01 | ||
| K:42 [SER] | A:669 [C] | 3.2 | A:807 [G] | base:BB | 85.58 | |
| K:43 [ARG] | A:669 [C] | 4.33 | A:807 [G] | 99.0 | ||
| K:43 [ARG] | A:803 [G] | 3.45 | 99.0 | |||
| K:43 [ARG] | A:804 [C] | 2.96 | A:672 [G] | base/AA stacks | 99.0 | |
| K:43 [ARG] | A:805 [U] | 2.57 | A:671 [C] | 99.0 | ||
| K:43 [ARG] | A:806 [G] | 4.75 | A:670 [C] | 99.0 | ||
| K:44 [LYS] | A:667 [G] | 4.17 | 84.66 | |||
| K:44 [LYS] | A:668 [A] | 3.19 | A:586 [U] | 84.66 | ||
| K:44 [LYS] | A:669 [C] | 3.46 | A:807 [G] | 84.66 | ||
| K:44 [LYS] | A:670 [C] | 3.63 | A:806 [G] | 84.66 | ||
| K:44 [LYS] | A:802 [A] | 4.84 | 84.66 | |||
| K:45 [SER] | A:668 [A] | 3.47 | A:586 [U] | 91.47 | ||
| K:45 [SER] | A:669 [C] | 2.62 | A:807 [G] | 91.47 | ||
| K:46 [GLY] | A:669 [C] | 4.8 | A:807 [G] | 39.43 | ||
| K:47 [GLY] | A:664 [A] | 4.49 | A:589 [U] | 51.28 | ||
| K:48 [VAL] | A:664 [A] | 4.05 | A:589 [U] | 44.64 | ||
| K:48 [VAL] | A:830 [U] | 3.67 | A:823 [A] | 44.64 | ||
| K:48 [VAL] | A:831 [A] | 4.03 | A:822 [U] | 44.64 | ||
| K:49 [ARG] | A:202 [A] | 4.56 | 50.49 | |||
| K:49 [ARG] | A:203 [A] | 4.53 | 50.49 | |||
| K:49 [ARG] | A:258 [A] | 3.43 | A:254 [G] | 50.49 | ||
| K:49 [ARG] | A:259 [G] | 3.67 | A:253 [C] | 50.49 | ||
| K:50 [PRO] | A:664 [A] | 4.24 | A:589 [U] | 44.87 | ||
| K:52 [PHE] | A:203 [A] | 3.25 | 79.22 | |||
| K:52 [PHE] | A:829 [G] | 4.5 | A:824 [U] | 79.22 | ||
| K:52 [PHE] | A:830 [U] | 3.62 | A:823 [A] | 79.22 | ||
| K:52 [PHE] | A:831 [A] | 3.75 | A:822 [U] | 79.22 | ||
| K:53 [GLU] | A:823 [A] | 4.45 | A:830 [U] | 88.71 | ||
| K:53 [GLU] | A:830 [U] | 4.21 | A:823 [A] | 88.71 | ||
| K:53 [GLU] | A:831 [A] | 3.7 | A:822 [U] | 88.71 | ||
| K:54 [GLY] | A:203 [A] | 4.79 | 94.5 | |||
| K:54 [GLY] | A:823 [A] | 4.82 | A:830 [U] | 94.5 | ||
| K:54 [GLY] | A:824 [U] | 3.07 | A:829 [G] | sugar:BB | 94.5 | |
| K:54 [GLY] | A:826 [U] | 4.57 | 94.5 | |||
| K:54 [GLY] | A:829 [G] | 3.28 | A:824 [U] | base:BB | 94.5 | |
| K:54 [GLY] | A:830 [U] | 3.28 | A:823 [A] | 94.5 | ||
| K:54 [GLY] | A:831 [A] | 4.26 | A:822 [U] | 94.5 | ||
| K:55 [GLY] | A:824 [U] | 3.25 | A:829 [G] | 90.07 | ||
| K:55 [GLY] | A:829 [G] | 5.0 | A:824 [U] | 90.07 | ||
| K:55 [GLY] | A:2424 [G] | 4.85 | 90.07 | |||
| K:56 [GLN] | A:823 [A] | 3.24 | A:830 [U] | sugar:SC | 87.54 | |
| K:56 [GLN] | A:824 [U] | 4.03 | A:829 [G] | 87.54 | ||
| K:56 [GLN] | A:2354 [A] | 3.35 | base:SC, base:SC | 87.54 | ||
| K:56 [GLN] | A:2355 [C] | 4.27 | 87.54 | |||
| K:56 [GLN] | A:2424 [G] | 3.31 | base/AA stacks | 87.54 | ||
| K:57 [THR] | A:2388 [A] | 4.25 | A:2420 [C] | 73.31 | ||
| K:57 [THR] | A:2424 [G] | 3.37 | sugar:BB | 73.31 | ||
| K:57 [THR] | A:2425 [G] | 2.81 | A:2387 [G] | base:SC | 73.31 | |
| K:59 [ILE] | A:2355 [C] | 4.11 | 66.19 | |||
| K:59 [ILE] | A:2356 [A] | 4.37 | 66.19 | |||
| K:60 [TYR] | A:257 [G] | 4.03 | A:207 [U] | 33.59 | ||
| K:60 [TYR] | A:258 [A] | 2.52 | A:254 [G] | 33.59 | ||
| K:61 [ARG] | A:257 [G] | 3.98 | A:207 [U] | 75.27 | ||
| K:61 [ARG] | A:2389 [U] | 2.66 | A:2418 [C] | sugar:BB | 75.27 | |
| K:61 [ARG] | A:2427 [U] | 3.87 | 75.27 | |||
| K:62 [ARG] | A:2355 [C] | 2.98 | base:SC, sugar:SC | 84.9 | ||
| K:62 [ARG] | A:2356 [A] | 3.22 | sugar:SC | 84.9 | ||
| K:62 [ARG] | A:2388 [A] | 2.96 | A:2420 [C] | sugar:BB | 84.9 | |
| K:62 [ARG] | A:2389 [U] | 4.0 | A:2418 [C] | 84.9 | ||
| K:62 [ARG] | A:2424 [G] | 3.66 | 84.9 | |||
| K:63 [LEU] | A:2356 [A] | 4.1 | 60.68 | |||
| K:63 [LEU] | A:2357 [A] | 4.45 | A:2352 [C] | 60.68 | ||
| K:63 [LEU] | A:2388 [A] | 4.95 | A:2420 [C] | 60.68 | ||
| K:63 [LEU] | A:2389 [U] | 3.53 | A:2418 [C] | 60.68 | ||
| K:63 [LEU] | A:2390 [C] | 4.55 | v:77 [A] | 60.68 | ||
| K:64 [PRO] | A:2389 [U] | 3.81 | A:2418 [C] | 89.86 | ||
| K:64 [PRO] | A:2390 [C] | 3.68 | v:77 [A] | 89.86 | ||
| K:65 [LYS] | A:256 [C] | 3.14 | sugar:SC | 82.79 | ||
| K:65 [LYS] | A:2389 [U] | 4.45 | A:2418 [C] | 82.79 | ||
| K:65 [LYS] | A:2390 [C] | 3.0 | v:77 [A] | 82.79 | ||
| K:65 [LYS] | A:2391 [C] | 3.54 | A:2417 [G] | 82.79 | ||
| K:65 [LYS] | A:2412 [C] | 4.38 | A:2396 [G] | 82.79 | ||
| K:66 [PHE] | A:629 [A] | 4.07 | 52.4 | |||
| K:66 [PHE] | A:2411 [G] | 4.55 | A:2397 [U] | 52.4 | ||
| K:66 [PHE] | A:2412 [C] | 3.39 | A:2396 [G] | 52.4 | ||
| K:67 [GLY] | A:629 [A] | 3.62 | 84.9 | |||
| K:67 [GLY] | A:2411 [G] | 3.47 | A:2397 [U] | 84.9 | ||
| K:67 [GLY] | A:2412 [C] | 3.29 | A:2396 [G] | 84.9 | ||
| K:68 [PHE] | A:629 [A] | 3.17 | sugar:BB, sugar:BB | 73.78 | ||
| K:68 [PHE] | A:630 [A] | 3.53 | 73.78 | |||
| K:68 [PHE] | A:2399 [C] | 4.57 | A:2410 [G] | 73.78 | ||
| K:68 [PHE] | A:2400 [U] | 4.11 | A:2409 [G] | 73.78 | ||
| K:68 [PHE] | A:2410 [G] | 3.78 | A:2399 [C] | 73.78 | ||
| K:68 [PHE] | A:2411 [G] | 3.54 | A:2397 [U] | 73.78 | ||
| K:69 [THR] | A:251 [A] | 4.07 | A:261 [G] | 52.68 | ||
| K:69 [THR] | A:252 [G] | 3.7 | A:260 [C] | 52.68 | ||
| K:70 [SER] | A:630 [A] | 3.57 | 69.98 | |||
| K:70 [SER] | A:631 [A] | 3.21 | A:628 [G] | 69.98 | ||
| K:71 [GLN] | A:251 [A] | 3.73 | A:261 [G] | sugar:SC | 5.13 | |
| K:71 [GLN] | A:252 [G] | 4.01 | A:260 [C] | 5.13 | ||
| K:72 [ILE] | A:631 [A] | 3.83 | A:628 [G] | 0.0 | ||
| K:72 [ILE] | A:632 [U] | 4.72 | A:627 [A] | 0.0 | ||
| K:73 [ALA] | A:631 [A] | 3.97 | A:628 [G] | 33.66 | ||
| K:74 [LEU] | A:250 [U] | 4.52 | A:262 [A] | 1.99 | ||
| K:74 [LEU] | A:251 [A] | 4.7 | A:261 [G] | 1.99 | ||
| K:75 [LYS] | A:264 [C] | 4.22 | A:247 [C] | 12.69 | ||
| K:78 [GLU] | A:625 [A] | 2.87 | sugar:SC | 49.12 | ||
| K:78 [GLU] | A:626 [G] | 4.24 | A:633 [C] | 49.12 | ||
| K:78 [GLU] | A:634 [G] | 3.21 | base:SC | 49.12 | ||
| K:80 [ARG] | A:624 [U] | 3.29 | base/AA stacks | 76.72 | ||
| K:80 [ARG] | A:625 [A] | 2.88 | 76.72 | |||
| K:83 [GLU] | A:623 [G] | 4.73 | A:601 [A] | 2.54 | ||
| K:83 [GLU] | A:624 [U] | 3.33 | base:SC | 2.54 | ||
| K:86 [LYS] | A:602 [G] | 2.98 | A:622 [C] | base:SC | 33.71 | |
| K:98 [LYS] | A:619 [A] | 4.68 | A:605 [U] | 1.47 | ||
| K:99 [ALA] | A:619 [A] | 4.89 | A:605 [U] | 35.22 | ||
| K:101 [ASN] | A:618 [G] | 3.42 | sugar:SC | 63.19 | ||
| K:101 [ASN] | A:619 [A] | 3.13 | A:605 [U] | 63.19 | ||
| K:101 [ASN] | A:620 [G] | 3.61 | A:604 [U] | 63.19 | ||
| K:104 [ARG] | A:247 [C] | 3.11 | A:264 [C] | 43.84 | ||
| K:104 [ARG] | A:248 [A] | 4.03 | A:263 [A] | 43.84 | ||
| K:104 [ARG] | A:620 [G] | 3.24 | A:604 [U] | 43.84 | ||
| K:104 [ARG] | A:621 [C] | 3.01 | A:603 [G] | 43.84 | ||
| K:105 [ARG] | A:266 [G] | 2.91 | A:245 [C] | 37.16 | ||
| K:105 [ARG] | A:267 [G] | 3.66 | A:244 [C] | 37.16 | ||
| K:105 [ARG] | A:619 [A] | 3.33 | A:605 [U] | 37.16 | ||
| K:105 [ARG] | A:620 [G] | 3.31 | A:604 [U] | 37.16 | ||
| K:106 [ASP] | A:247 [C] | 4.75 | A:264 [C] | 1.17 | ||
| K:106 [ASP] | A:265 [G] | 4.69 | A:246 [U] | 1.17 | ||
| K:109 [ARG] | A:632 [U] | 3.1 | A:627 [A] | 12.15 | ||
| K:111 [ARG] | A:633 [C] | 3.21 | A:626 [G] | base/AA stacks | 89.23 | |
| K:111 [ARG] | A:634 [G] | 2.78 | base:SC, base:SC | 89.23 | ||
| K:113 [VAL] | A:625 [A] | 3.36 | 75.86 | |||
| K:113 [VAL] | A:634 [G] | 4.0 | 75.86 | |||
| K:113 [VAL] | A:635 [A] | 3.04 | A:649 [G] | 75.86 | ||
| K:114 [LEU] | A:625 [A] | 2.94 | base:BB | 55.86 | ||
| K:114 [LEU] | A:635 [A] | 3.39 | A:649 [G] | 55.86 | ||
| K:115 [SER] | A:624 [U] | 4.57 | 50.22 | |||
| K:115 [SER] | A:625 [A] | 2.99 | 50.22 | |||
| K:129 [LEU] | A:634 [G] | 4.35 | 54.78 | |||
| K:130 [THR] | A:634 [G] | 3.7 | 94.93 | |||
| K:130 [THR] | A:635 [A] | 3.28 | A:649 [G] | 94.93 | ||
| K:131 [LYS] | A:634 [G] | 3.71 | 59.16 | |||
| K:131 [LYS] | A:635 [A] | 4.8 | A:649 [G] | 59.16 | ||
| K:132 [GLY] | A:635 [A] | 3.52 | A:649 [G] | 63.74 | ||
| K:133 [ALA] | A:635 [A] | 4.6 | A:649 [G] | 93.49 |
Export the table of contacts
*Conservation was calculated using Rate4Site
NB: conservation is missing (completly white) for a very small minority of cases in which no homologous sequences were found (e.g. synthetic proteins 7D3J_A & 7EU9_A)
Properties of this interface
| Interolog group ID | Structure ID |
Structure description |
UniProt ID |
ECOD label(s) |
RFAM label(s) |
Is ribosome? | RCSB PDB link |
|---|---|---|---|---|---|---|---|
| group127 | 7RYG_K_A | K: 50s ribosomal protein l15, Acinetobacter baumannii (strain ab0057) (natural) A: 23s ribosomal RNA, Acinetobacter baumannii ab0057 (natural) | B7IA20 | Ribosomal proteins L15p and L18e | Bacterial large subunit ribosomal RNA | ✔ |
|
Interologs
Total number of interologs for this interface: 4
| Interface 1 | Interface 2 |
Percentage conservation |
Interface TM-score |
Interface RMSD |
Percentage identity |
Common ECOD label(s) |
Common RFAM label(s) |
Explore both interfaces |
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| 6S0Z_J_A | 7RYG_K_A | 0.78 | 0.97 | 1.41 | 0.47 | Ribosomal proteins L15p and L18e | Bacterial large subunit ribosomal RNA | compare |
| 4Y4O_1P_1A | 7RYG_K_A | 0.71 | 0.96 | 2.76 | 0.39 | Ribosomal proteins L15p and L18e | Bacterial large subunit ribosomal RNA | compare |
| 7OF0_M_A | 7RYG_K_A | 0.68 | 0.85 | 2.79 | 0.38 | Ribosomal proteins L15p and L18e | Bacterial large subunit ribosomal RNA | compare |
| 1YHQ_L_0 | 7RYG_K_A | 0.38 | 0.91 | 4.41 | 0.15 | Ribosomal proteins L15p and L18e | compare |