Interface analysis
Style
Protein
CartoonLicorice
Surface
RNA
CartoonLicorice
Surface
Color
StructureStructure (with hetatm)
Chain
Chainbow
View
Focus on
InterfaceRNA
Protein
All
Show chains
Interface
show interface as licoriceCommon contacts -
1VQ8_B
|
1VQ8_0
|
7RYG_D
|
7RYG_A
|
Conserved?
|
---|---|---|---|---|
B:247 [VAL] | 0:2093 [G] | D:158 [VAL] | A:2048 [A] | ✔ |
B:247 [VAL] | 0:2653 [A] | D:158 [VAL] | A:2614 [A] | ✔ |
B:247 [VAL] | 0:2654 [C] | D:158 [VAL] | A:2615 [C] | ✔ |
B:217 [ARG] | 0:2655 [U] | D:127 [ARG] | A:2616 [C] | ✔ |
B:217 [ARG] | 0:2656 [G] | D:127 [ARG] | A:2617 [G] | ✔ |
B:243 [ASN] | 0:1234 [U] | D:154 [THR] | A:1127 [U] | ✔ |
B:243 [ASN] | 0:2073 [G] | D:154 [THR] | A:2028 [G] | ✔ |
B:243 [ASN] | 0:2606 [G] | D:154 [THR] | A:2567 [U] | ✔ |
B:243 [ASN] | 0:2607 [U] | D:154 [THR] | A:2568 [A] | ✔ |
B:239 [LEU] | 0:2091 [G] | D:149 [THR] | A:2046 [C] | ✔ |
B:239 [LEU] | 0:2092 [G] | D:149 [THR] | A:2047 [U] | ✔ |
B:239 [LEU] | 0:2093 [G] | D:149 [THR] | A:2048 [A] | ✔ |
B:255 [GLY] | 0:2655 [U] | D:166 [GLY] | A:2616 [C] | ✔ |
B:255 [GLY] | 0:2656 [G] | D:166 [GLY] | A:2617 [G] | ✔ |
B:113 [LEU] | 0:2669 [U] | D:64 [ALA] | A:2629 [A] | ✔ |
B:229 [ARG] | 0:836 [G] | D:139 [ASN] | A:741 [U] | ✔ |
B:229 [ARG] | 0:837 [U] | D:139 [ASN] | A:742 [C] | ✔ |
B:209 [LYS] | 0:1732 [A] | D:119 [LYS] | A:1652 [A] | ✔ |
B:209 [LYS] | 0:2717 [C] | D:119 [LYS] | A:2676 [C] | ✔ |
B:209 [LYS] | 0:2759 [C] | D:119 [LYS] | A:2719 [C] | ✔ |
B:209 [LYS] | 0:2760 [C] | D:119 [LYS] | A:2720 [U] | ✔ |
B:209 [LYS] | 0:2839 [C] | D:119 [LYS] | A:2818 [G] | ✔ |
B:246 [ARG] | 0:1234 [U] | D:157 [ARG] | A:1127 [U] | ✔ |
B:246 [ARG] | 0:2065 [C] | D:157 [ARG] | A:2020 [G] | ✔ |
B:246 [ARG] | 0:2066 [C] | D:157 [ARG] | A:2021 [C] | ✔ |
B:246 [ARG] | 0:2093 [G] | D:157 [ARG] | A:2048 [A] | ✔ |
B:246 [ARG] | 0:2094 [G] | D:157 [ARG] | A:2049 [G] | ✔ |
B:246 [ARG] | 0:2653 [A] | D:157 [ARG] | A:2614 [A] | ✔ |
B:226 [LYS] | 0:1753 [C] | D:136 [THR] | A:1673 [C] | ✔ |
B:264 [GLU] | 0:2716 [G] | D:175 [VAL] | A:2675 [A] | ✔ |
B:264 [GLU] | 0:2766 [A] | D:175 [VAL] | A:2726 [C] | ✔ |
B:254 [GLN] | 0:1733 [A] | D:165 [ALA] | A:1653 [A] | ✔ |
B:254 [GLN] | 0:2089 [A] | D:165 [ALA] | A:2044 [G] | ✔ |
B:254 [GLN] | 0:2090 [G] | D:165 [ALA] | A:2045 [G] | ✔ |
B:254 [GLN] | 0:2655 [U] | D:165 [ALA] | A:2616 [C] | ✔ |
B:254 [GLN] | 0:2656 [G] | D:165 [ALA] | A:2617 [G] | ✔ |
B:49 [THR] | 0:2719 [A] | D:13 [THR] | A:2678 [U] | ✔ |
B:251 [VAL] | 0:2547 [C] | D:162 [LYS] | A:2508 [C] | ✔ |
B:251 [VAL] | 0:2548 [C] | D:162 [LYS] | A:2509 [A] | ✔ |
B:233 [ARG] | 0:1735 [C] | D:143 [HIS] | A:1655 [U] | ✔ |
B:233 [ARG] | 0:1736 [A] | D:143 [HIS] | A:1656 [C] | ✔ |
B:208 [GLY] | 0:2838 [A] | D:118 [GLY] | A:2817 [A] | ✔ |
B:208 [GLY] | 0:2839 [C] | D:118 [GLY] | A:2818 [G] | ✔ |
B:249 [SER] | 0:2654 [C] | D:160 [LYS] | A:2615 [C] | ✔ |
B:249 [SER] | 0:2655 [U] | D:160 [LYS] | A:2616 [C] | ✔ |
B:120 [ASP] | 0:2821 [C] | D:71 [LYS] | A:2782 [U] | ✔ |
B:231 [GLY] | 0:837 [U] | D:141 [VAL] | A:742 [C] | ✔ |
B:231 [GLY] | 0:1735 [C] | D:141 [VAL] | A:1655 [U] | ✔ |
B:231 [GLY] | 0:1736 [A] | D:141 [VAL] | A:1656 [C] | ✔ |
B:240 [GLY] | 0:2093 [G] | D:150 [GLY] | A:2048 [A] | ✔ |
B:240 [GLY] | 0:2609 [G] | D:150 [GLY] | A:2570 [G] | ✔ |
B:240 [GLY] | 0:2610 [U] | D:150 [GLY] | A:2571 [C] | ✔ |
B:237 [GLY] | 0:2093 [G] | D:147 [GLY] | A:2048 [A] | ✔ |
B:237 [GLY] | 0:2546 [U] | D:147 [GLY] | A:2507 [U] | ✔ |
B:237 [GLY] | 0:2613 [G] | D:147 [GLY] | A:2574 [G] | ✔ |
B:216 [LYS] | 0:2759 [C] | D:126 [LYS] | A:2719 [C] | ✔ |
B:216 [LYS] | 0:2760 [C] | D:126 [LYS] | A:2720 [U] | ✔ |
B:262 [ARG] | 0:2715 [G] | D:173 [VAL] | A:2674 [A] | ✔ |
B:262 [ARG] | 0:2716 [G] | D:173 [VAL] | A:2675 [A] | ✔ |
B:262 [ARG] | 0:2808 [U] | D:173 [VAL] | A:2769 [U] | ✔ |
B:303 [GLY] | 0:2716 [G] | D:198 [GLY] | A:2675 [A] | ✔ |
B:303 [GLY] | 0:2717 [C] | D:198 [GLY] | A:2676 [C] | ✔ |
B:303 [GLY] | 0:2718 [C] | D:198 [GLY] | A:2677 [C] | ✔ |
B:315 [VAL] | 0:2806 [C] | D:210 [ILE] | A:2767 [C] | ✔ |
B:315 [VAL] | 0:2807 [U] | D:210 [ILE] | A:2768 [C] | ✔ |
B:301 [VAL] | 0:2716 [G] | D:196 [ILE] | A:2675 [A] | ✔ |
B:301 [VAL] | 0:2717 [C] | D:196 [ILE] | A:2676 [C] | ✔ |
B:253 [GLN] | 0:2090 [G] | D:164 [MET] | A:2045 [G] | ✔ |
B:253 [GLN] | 0:2091 [G] | D:164 [MET] | A:2046 [C] | ✔ |
B:253 [GLN] | 0:2654 [C] | D:164 [MET] | A:2615 [C] | ✔ |
B:253 [GLN] | 0:2655 [U] | D:164 [MET] | A:2616 [C] | ✔ |
B:299 [GLY] | 0:2765 [C] | D:194 [GLY] | A:2725 [U] | ✔ |
B:236 [ILE] | 0:2091 [G] | D:146 [LEU] | A:2046 [C] | ✔ |
B:236 [ILE] | 0:2546 [U] | D:146 [LEU] | A:2507 [U] | ✔ |
B:236 [ILE] | 0:2547 [C] | D:146 [LEU] | A:2508 [C] | ✔ |
B:210 [GLY] | 0:1732 [A] | D:120 [GLY] | A:1652 [A] | ✔ |
B:210 [GLY] | 0:2839 [C] | D:120 [GLY] | A:2818 [G] | ✔ |
B:210 [GLY] | 0:2840 [A] | D:120 [GLY] | A:2819 [A] | ✔ |
B:267 [LYS] | 0:2765 [C] | D:178 [LEU] | A:2725 [U] | ✔ |
B:267 [LYS] | 0:2766 [A] | D:178 [LEU] | A:2726 [C] | ✔ |
B:263 [THR] | 0:2807 [U] | D:174 [THR] | A:2768 [C] | ✔ |
B:263 [THR] | 0:2808 [U] | D:174 [THR] | A:2769 [U] | ✔ |
B:241 [PRO] | 0:2093 [G] | D:151 [GLN] | A:2048 [A] | ✔ |
B:241 [PRO] | 0:2094 [G] | D:151 [GLN] | A:2049 [G] | ✔ |
B:241 [PRO] | 0:2548 [C] | D:151 [GLN] | A:2509 [A] | ✔ |
B:241 [PRO] | 0:2606 [G] | D:151 [GLN] | A:2567 [U] | ✔ |
B:241 [PRO] | 0:2607 [U] | D:151 [GLN] | A:2568 [A] | ✔ |
B:241 [PRO] | 0:2609 [G] | D:151 [GLN] | A:2570 [G] | ✔ |
B:241 [PRO] | 0:2610 [U] | D:151 [GLN] | A:2571 [C] | ✔ |
B:213 [GLY] | 0:1733 [A] | D:123 [GLY] | A:1653 [A] | ✔ |
B:213 [GLY] | 0:1734 [C] | D:123 [GLY] | A:1654 [C] | ✔ |
B:230 [GLN] | 0:836 [G] | D:140 [SER] | A:741 [U] | ✔ |
B:230 [GLN] | 0:837 [U] | D:140 [SER] | A:742 [C] | ✔ |
B:230 [GLN] | 0:1736 [A] | D:140 [SER] | A:1656 [C] | ✔ |
B:230 [GLN] | 0:2614 [C] | D:140 [SER] | A:2575 [C] | ✔ |
B:230 [GLN] | 0:2615 [U] | D:140 [SER] | A:2576 [PSU] | ✔ |
B:163 [GLU] | 0:2671 [U] | D:82 [GLU] | A:2631 [U] | ✔ |
B:163 [GLU] | 0:2672 [C] | D:82 [GLU] | A:2632 [U] | ✔ |
B:212 [GLN] | 0:1732 [A] | D:122 [GLN] | A:1652 [A] | ✔ |
B:212 [GLN] | 0:1733 [A] | D:122 [GLN] | A:1653 [A] | ✔ |
B:70 [PRO] | 0:2719 [A] | D:24 [PRO] | A:2678 [U] | ✔ |
B:70 [PRO] | 0:2764 [C] | D:24 [PRO] | A:2724 [U] | ✔ |
B:70 [PRO] | 0:2765 [C] | D:24 [PRO] | A:2725 [U] | ✔ |
B:96 [PRO] | 0:2818 [A] | D:44 [ASP] | A:2779 [A] | ✔ |
B:96 [PRO] | 0:2819 [C] | D:44 [ASP] | A:2780 [U] | ✔ |
B:215 [VAL] | 0:2038 [A] | D:125 [VAL] | A:1993 [C] | ✔ |
B:215 [VAL] | 0:2039 [A] | D:125 [VAL] | A:1994 [A] | ✔ |
B:48 [MET] | 0:2717 [C] | D:12 [MET] | A:2676 [C] | ✔ |
B:48 [MET] | 0:2718 [C] | D:12 [MET] | A:2677 [C] | ✔ |
B:48 [MET] | 0:2719 [A] | D:12 [MET] | A:2678 [U] | ✔ |
B:242 [TRP] | 0:2093 [G] | D:152 [ASN] | A:2048 [A] | ✔ |
B:242 [TRP] | 0:2094 [G] | D:152 [ASN] | A:2049 [G] | ✔ |
B:242 [TRP] | 0:2607 [U] | D:152 [ASN] | A:2568 [A] | ✔ |
B:242 [TRP] | 0:2609 [G] | D:152 [ASN] | A:2570 [G] | ✔ |
B:242 [TRP] | 0:2610 [U] | D:152 [ASN] | A:2571 [C] | ✔ |
B:207 [LYS] | 0:2717 [C] | D:117 [LYS] | A:2676 [C] | ✔ |
B:207 [LYS] | 0:2718 [C] | D:117 [LYS] | A:2677 [C] | ✔ |
B:207 [LYS] | 0:2758 [G] | D:117 [LYS] | A:2718 [G] | ✔ |
B:207 [LYS] | 0:2759 [C] | D:117 [LYS] | A:2719 [C] | ✔ |
B:207 [LYS] | 0:2838 [A] | D:117 [LYS] | A:2817 [A] | ✔ |
B:220 [VAL] | 0:2038 [A] | D:130 [PHE] | A:1993 [C] | ✔ |
B:220 [VAL] | 0:2547 [C] | D:130 [PHE] | A:2508 [C] | ✔ |
B:227 [HIS] | 0:2615 [U] | D:137 [HIS] | A:2576 [PSU] | ✔ |
B:161 [VAL] | 0:2670 [G] | D:80 [VAL] | A:2630 [A] | ✔ |
B:161 [VAL] | 0:2671 [U] | D:80 [VAL] | A:2631 [U] | ✔ |
B:161 [VAL] | 0:2672 [C] | D:80 [VAL] | A:2632 [U] | ✔ |
B:211 [THR] | 0:1732 [A] | D:121 [PHE] | A:1652 [A] | ✔ |
B:211 [THR] | 0:1733 [A] | D:121 [PHE] | A:1653 [A] | ✔ |
B:211 [THR] | 0:2839 [C] | D:121 [PHE] | A:2818 [G] | ✔ |
B:211 [THR] | 0:2840 [A] | D:121 [PHE] | A:2819 [A] | ✔ |
B:221 [GLN] | 0:2038 [A] | D:131 [ARG] | A:1993 [C] | ✔ |
B:221 [GLN] | 0:2546 [U] | D:131 [ARG] | A:2507 [U] | ✔ |
B:221 [GLN] | 0:2547 [C] | D:131 [ARG] | A:2508 [C] | ✔ |
B:162 [MET] | 0:2671 [U] | D:81 [LYS] | A:2631 [U] | ✔ |
B:162 [MET] | 0:2672 [C] | D:81 [LYS] | A:2632 [U] | ✔ |
B:117 [GLU] | 0:2821 [C] | D:68 [HIS] | A:2782 [U] | ✔ |
B:300 [SER] | 0:2716 [G] | D:195 [ALA] | A:2675 [A] | ✔ |
B:300 [SER] | 0:2717 [C] | D:195 [ALA] | A:2676 [C] | ✔ |
B:300 [SER] | 0:2765 [C] | D:195 [ALA] | A:2725 [U] | ✔ |
B:238 [ASN] | 0:2093 [G] | D:148 [SER] | A:2048 [A] | ✔ |
B:238 [ASN] | 0:2546 [U] | D:148 [SER] | A:2507 [U] | ✔ |
B:238 [ASN] | 0:2547 [C] | D:148 [SER] | A:2508 [C] | ✔ |
B:238 [ASN] | 0:2609 [G] | D:148 [SER] | A:2570 [G] | ✔ |
B:238 [ASN] | 0:2610 [U] | D:148 [SER] | A:2571 [C] | ✔ |
B:238 [ASN] | 0:2613 [G] | D:148 [SER] | A:2574 [G] | ✔ |
B:298 [LYS] | 0:2765 [C] | D:193 [LYS] | A:2725 [U] | ✔ |
B:298 [LYS] | 0:2766 [A] | D:193 [LYS] | A:2726 [C] | ✔ |
B:206 [THR] | 0:2716 [G] | D:116 [SER] | A:2675 [A] | ✔ |
B:206 [THR] | 0:2717 [C] | D:116 [SER] | A:2676 [C] | ✔ |
B:305 [ASP] | 0:2837 [U] | D:200 [THR] | A:2816 [G] | ✔ |
B:85 [ARG] | 0:2671 [U] | D:39 [LYS] | A:2631 [U] | ✔ |
B:85 [ARG] | 0:2672 [C] | D:39 [LYS] | A:2632 [U] | ✔ |
B:85 [ARG] | 0:2819 [C] | D:39 [LYS] | A:2780 [U] | ✔ |
B:302 [PRO] | 0:2716 [G] | D:197 [PRO] | A:2675 [A] | ✔ |
B:302 [PRO] | 0:2717 [C] | D:197 [PRO] | A:2676 [C] | ✔ |
B:259 [TYR] | 0:2838 [A] | D:170 [ASP] | A:2817 [A] | ✔ |
B:259 [TYR] | 0:2839 [C] | D:170 [ASP] | A:2818 [G] | ✔ |
B:50 [HIS] | 0:2719 [A] | D:14 [ARG] | A:2678 [U] | ✔ |
B:50 [HIS] | 0:2720 [C] | D:14 [ARG] | A:2679 [C] | ✔ |
B:316 [ARG] | 0:2767 [C] | D:211 [LYS] | A:2727 [G] | ✔ |
B:316 [ARG] | 0:2768 [A] | D:211 [LYS] | A:2729 [A] | ✔ |
B:316 [ARG] | 0:2806 [C] | D:211 [LYS] | A:2767 [C] | ✔ |
B:266 [ASN] | 0:2766 [A] | D:177 [GLY] | A:2726 [C] | ✔ |
B:266 [ASN] | 0:2767 [C] | D:177 [GLY] | A:2727 [G] | ✔ |
B:112 [THR] | 0:2669 [U] | D:62 [THR] | A:2629 [A] | ✔ |
B:235 [ARG] | 0:1734 [C] | D:145 [VAL] | A:1654 [C] | ✔ |
B:235 [ARG] | 0:1735 [C] | D:145 [VAL] | A:1655 [U] | ✔ |
B:235 [ARG] | 0:2092 [G] | D:145 [VAL] | A:2047 [U] | ✔ |
B:235 [ARG] | 0:2546 [U] | D:145 [VAL] | A:2507 [U] | ✔ |
B:306 [LYS] | 0:2837 [U] | D:201 [GLY] | A:2816 [G] | ✔ |
B:114 [ASP] | 0:2669 [U] | D:65 [GLN] | A:2629 [A] | ✔ |
B:114 [ASP] | 0:2821 [C] | D:65 [GLN] | A:2782 [U] | ✔ |
B:234 [ARG] | 0:1734 [C] | D:144 [ARG] | A:1654 [C] | ✔ |
B:234 [ARG] | 0:1735 [C] | D:144 [ARG] | A:1655 [U] | ✔ |
B:234 [ARG] | 0:2039 [A] | D:144 [ARG] | A:1994 [A] | ✔ |
B:232 [TRP] | 0:1735 [C] | D:142 [SER] | A:1655 [U] | ✔ |
B:232 [TRP] | 0:2613 [G] | D:142 [SER] | A:2574 [G] | ✔ |
B:232 [TRP] | 0:2614 [C] | D:142 [SER] | A:2575 [C] | ✔ |
B:116 [PRO] | 0:2821 [C] | D:67 [GLY] | A:2782 [U] | ✔ |
B:116 [PRO] | 0:2822 [C] | D:67 [GLY] | A:2783 [C] | ✔ |
B:95 [ARG] | 0:2818 [A] | D:43 [THR] | A:2779 [A] | ✔ |
B:261 [GLN] | 0:2808 [U] | D:172 [ARG] | A:2769 [U] | ✔ |
B:261 [GLN] | 0:2809 [G] | D:172 [ARG] | A:2770 [C] | ✔ |
B:45 [LYS] | 0:2717 [C] | D:9 [LYS] | A:2676 [C] | ✔ |
B:45 [LYS] | 0:2718 [C] | D:9 [LYS] | A:2677 [C] | ✔ |
B:224 [LYS] | 0:2034 [U] | D:134 [ASP] | A:1989 [U] | ✔ |
B:224 [LYS] | 0:2035 [C] | D:134 [ASP] | A:1990 [C] | ✔ |
B:222 [LYS] | 0:2038 [A] | D:132 [THR] | A:1993 [C] | ✔ |
B:245 [SER] | 0:2093 [G] | D:156 [GLY] | A:2048 [A] | ✔ |
B:245 [SER] | 0:2094 [G] | D:156 [GLY] | A:2049 [G] | ✔ |
B:248 [ARG] | 0:1234 [U] | D:159 [PHE] | A:1127 [U] | ✔ |
B:248 [ARG] | 0:2549 [C] | D:159 [PHE] | A:2510 [U] | ✔ |
B:248 [ARG] | 0:2654 [C] | D:159 [PHE] | A:2615 [C] | ✔ |
B:252 [PRO] | 0:2548 [C] | D:163 [LYS] | A:2509 [A] | ✔ |
B:257 [THR] | 0:2839 [C] | D:168 [LEU] | A:2818 [G] | ✔ |
B:256 [GLN] | 0:2656 [G] | D:167 [HIS] | A:2617 [G] | ✔ |
B:256 [GLN] | 0:2657 [G] | D:167 [HIS] | A:2618 [U] | ✔ |
B:256 [GLN] | 0:2838 [A] | D:167 [HIS] | A:2817 [A] | ✔ |
B:256 [GLN] | 0:2839 [C] | D:167 [HIS] | A:2818 [G] | ✔ |
B:223 [ARG] | 0:2035 [C] | D:133 [GLN] | A:1990 [C] | ✔ |
B:223 [ARG] | 0:2613 [G] | D:133 [GLN] | A:2574 [G] | ✔ |
B:223 [ARG] | 0:2614 [C] | D:133 [GLN] | A:2575 [C] | ✔ |
B:225 [GLY] | 0:2034 [U] | D:135 [ALA] | A:1989 [U] | ✔ |
B:225 [GLY] | 0:2035 [C] | D:135 [ALA] | A:1990 [C] | ✔ |
B:244 [PRO] | 0:1234 [U] | D:155 [PRO] | A:1127 [U] | ✔ |
B:244 [PRO] | 0:2066 [C] | D:155 [PRO] | A:2021 [C] | ✔ |
B:244 [PRO] | 0:2606 [G] | D:155 [PRO] | A:2567 [U] | ✔ |
B:265 [LEU] | 0:2766 [A] | D:176 [GLN] | A:2726 [C] | ✔ |
B:265 [LEU] | 0:2767 [C] | D:176 [GLN] | A:2727 [G] | ✔ |
B:265 [LEU] | 0:2806 [C] | D:176 [GLN] | A:2767 [C] | ✔ |
B:265 [LEU] | 0:2807 [U] | D:176 [GLN] | A:2768 [C] | ✔ |
B:304 [PRO] | 0:2837 [U] | D:199 [ALA] | A:2816 [G] | ✔ |
B:304 [PRO] | 0:2838 [A] | D:199 [ALA] | A:2817 [A] | ✔ |
B:247 [VAL] | 0:2091 [G] | D:158 [VAL] | A:2046 [C] | ❌ 7RYG_D_A |
B:243 [ASN] | 0:2093 [G] | D:154 [THR] | A:2048 [A] | ❌ 7RYG_D_A |
B:243 [ASN] | 0:2609 [G] | D:154 [THR] | A:2570 [G] | ❌ 7RYG_D_A |
B:98 [THR] | 0:2819 [C] | D:46 [TYR] | A:2780 [U] | ❌ 7RYG_D_A |
B:98 [THR] | 0:2820 [A] | D:46 [TYR] | A:2781 [U] | ❌ 7RYG_D_A |
B:239 [LEU] | 0:2653 [A] | D:149 [THR] | A:2614 [A] | ❌ 7RYG_D_A |
B:113 [LEU] | 0:2670 [G] | D:64 [ALA] | A:2630 [A] | ❌ 7RYG_D_A |
B:229 [ARG] | 0:1736 [A] | D:139 [ASN] | A:1656 [C] | ❌ 7RYG_D_A |
B:229 [ARG] | 0:1753 [C] | D:139 [ASN] | A:1673 [C] | ❌ 7RYG_D_A |
B:229 [ARG] | 0:1754 [A] | D:139 [ASN] | A:1674 [A] | ❌ 7RYG_D_A |
B:226 [LYS] | 0:1751 [G] | D:136 [THR] | A:1671 [G] | ❌ 7RYG_D_A |
B:226 [LYS] | 0:2615 [U] | D:136 [THR] | A:2576 [PSU] | ❌ 7RYG_D_A |
B:226 [LYS] | 0:2616 [G] | D:136 [THR] | A:2577 [G] | ❌ 7RYG_D_A |
B:264 [GLU] | 0:2715 [G] | D:175 [VAL] | A:2674 [A] | ❌ 7RYG_D_A |
B:264 [GLU] | 0:2765 [C] | D:175 [VAL] | A:2725 [U] | ❌ 7RYG_D_A |
B:111 [ARG] | 0:2847 [G] | D:61 [VAL] | A:2826 [C] | ❌ 7RYG_D_A |
B:111 [ARG] | 0:2848 [G] | D:61 [VAL] | A:2827 [G] | ❌ 7RYG_D_A |
B:240 [GLY] | 0:2547 [C] | D:150 [GLY] | A:2508 [C] | ❌ 7RYG_D_A |
B:240 [GLY] | 0:2548 [C] | D:150 [GLY] | A:2509 [A] | ❌ 7RYG_D_A |
B:237 [GLY] | 0:2547 [C] | D:147 [GLY] | A:2508 [C] | ❌ 7RYG_D_A |
B:216 [LYS] | 0:2039 [A] | D:126 [LYS] | A:1994 [A] | ❌ 7RYG_D_A |
B:262 [ARG] | 0:2807 [U] | D:173 [VAL] | A:2768 [C] | ❌ 7RYG_D_A |
B:267 [LYS] | 0:2715 [G] | D:178 [LEU] | A:2674 [A] | ❌ 7RYG_D_A |
B:230 [GLN] | 0:2616 [G] | D:140 [SER] | A:2577 [G] | ❌ 7RYG_D_A |
B:96 [PRO] | 0:2672 [C] | D:44 [ASP] | A:2632 [U] | ❌ 7RYG_D_A |
B:96 [PRO] | 0:2673 [U] | D:44 [ASP] | A:2633 [U] | ❌ 7RYG_D_A |
B:228 [ALA] | 0:1736 [A] | D:138 [GLY] | A:1656 [C] | ❌ 7RYG_D_A |
B:207 [LYS] | 0:2716 [G] | D:117 [LYS] | A:2675 [A] | ❌ 7RYG_D_A |
B:250 [THR] | 0:2548 [C] | D:161 [GLY] | A:2509 [A] | ❌ 7RYG_D_A |
B:250 [THR] | 0:2549 [C] | D:161 [GLY] | A:2510 [U] | ❌ 7RYG_D_A |
B:227 [HIS] | 0:2545 [U] | D:137 [HIS] | A:2506 [C] | ❌ 7RYG_D_A |
B:227 [HIS] | 0:2614 [C] | D:137 [HIS] | A:2575 [C] | ❌ 7RYG_D_A |
B:117 [GLU] | 0:2822 [C] | D:68 [HIS] | A:2783 [C] | ❌ 7RYG_D_A |
B:117 [GLU] | 0:2823 [G] | D:68 [HIS] | A:2784 [C] | ❌ 7RYG_D_A |
B:300 [SER] | 0:2764 [C] | D:195 [ALA] | A:2724 [U] | ❌ 7RYG_D_A |
B:206 [THR] | 0:2838 [A] | D:116 [SER] | A:2817 [A] | ❌ 7RYG_D_A |
B:305 [ASP] | 0:2718 [C] | D:200 [THR] | A:2677 [C] | ❌ 7RYG_D_A |
B:85 [ARG] | 0:2670 [G] | D:39 [LYS] | A:2630 [A] | ❌ 7RYG_D_A |
B:85 [ARG] | 0:2818 [A] | D:39 [LYS] | A:2779 [A] | ❌ 7RYG_D_A |
B:112 [THR] | 0:2670 [G] | D:62 [THR] | A:2630 [A] | ❌ 7RYG_D_A |
B:235 [ARG] | 0:2091 [G] | D:145 [VAL] | A:2046 [C] | ❌ 7RYG_D_A |
B:114 [ASP] | 0:2668 [G] | D:65 [GLN] | A:2628 [A] | ❌ 7RYG_D_A |
B:114 [ASP] | 0:2822 [C] | D:65 [GLN] | A:2783 [C] | ❌ 7RYG_D_A |
B:114 [ASP] | 0:2827 [A] | D:65 [GLN] | A:2806 [A] | ❌ 7RYG_D_A |
B:114 [ASP] | 0:2828 [G] | D:65 [GLN] | A:2807 [G] | ❌ 7RYG_D_A |
B:234 [ARG] | 0:1733 [A] | D:144 [ARG] | A:1653 [A] | ❌ 7RYG_D_A |
B:234 [ARG] | 0:2038 [A] | D:144 [ARG] | A:1993 [C] | ❌ 7RYG_D_A |
B:232 [TRP] | 0:1736 [A] | D:142 [SER] | A:1656 [C] | ❌ 7RYG_D_A |
B:232 [TRP] | 0:2092 [G] | D:142 [SER] | A:2047 [U] | ❌ 7RYG_D_A |
B:116 [PRO] | 0:2820 [A] | D:67 [GLY] | A:2781 [U] | ❌ 7RYG_D_A |
B:95 [ARG] | 0:2673 [U] | D:43 [THR] | A:2633 [U] | ❌ 7RYG_D_A |
B:224 [LYS] | 0:2037 [C] | D:134 [ASP] | A:1992 [C] | ❌ 7RYG_D_A |
B:224 [LYS] | 0:2038 [A] | D:134 [ASP] | A:1993 [C] | ❌ 7RYG_D_A |
B:222 [LYS] | 0:2039 [A] | D:132 [THR] | A:1994 [A] | ❌ 7RYG_D_A |
B:245 [SER] | 0:1234 [U] | D:156 [GLY] | A:1127 [U] | ❌ 7RYG_D_A |
B:245 [SER] | 0:2065 [C] | D:156 [GLY] | A:2020 [G] | ❌ 7RYG_D_A |
B:248 [ARG] | 0:2548 [C] | D:159 [PHE] | A:2509 [A] | ❌ 7RYG_D_A |
B:248 [ARG] | 0:2606 [G] | D:159 [PHE] | A:2567 [U] | ❌ 7RYG_D_A |
B:252 [PRO] | 0:2547 [C] | D:163 [LYS] | A:2508 [C] | ❌ 7RYG_D_A |
B:244 [PRO] | 0:2093 [G] | D:155 [PRO] | A:2048 [A] | ❌ 7RYG_D_A |
B:304 [PRO] | 0:2717 [C] | D:199 [ALA] | A:2676 [C] | ❌ 7RYG_D_A |
B:304 [PRO] | 0:2718 [C] | D:199 [ALA] | A:2677 [C] | ❌ 7RYG_D_A |
B:207 [LYS] | 0:2837 [U] | D:117 [LYS] | A:2816 [G] | ❌ 1VQ8_B_0 |
B:211 [THR] | 0:2090 [G] | D:121 [PHE] | A:2045 [G] | ❌ 1VQ8_B_0 |
B:211 [THR] | 0:2089 [A] | D:121 [PHE] | A:2044 [G] | ❌ 1VQ8_B_0 |
B:215 [VAL] | 0:1734 [C] | D:125 [VAL] | A:1654 [C] | ❌ 1VQ8_B_0 |
B:217 [ARG] | 0:2715 [G] | D:127 [ARG] | A:2674 [A] | ❌ 1VQ8_B_0 |
B:220 [VAL] | 0:2548 [C] | D:130 [PHE] | A:2509 [A] | ❌ 1VQ8_B_0 |
B:222 [LYS] | 0:2037 [C] | D:132 [THR] | A:1992 [C] | ❌ 1VQ8_B_0 |
B:222 [LYS] | 0:2546 [U] | D:132 [THR] | A:2507 [U] | ❌ 1VQ8_B_0 |
B:223 [ARG] | 0:2545 [U] | D:133 [GLN] | A:2506 [C] | ❌ 1VQ8_B_0 |
B:223 [ARG] | 0:2546 [U] | D:133 [GLN] | A:2507 [U] | ❌ 1VQ8_B_0 |
B:226 [LYS] | 0:1754 [A] | D:136 [THR] | A:1674 [A] | ❌ 1VQ8_B_0 |
B:226 [LYS] | 0:2035 [C] | D:136 [THR] | A:1990 [C] | ❌ 1VQ8_B_0 |
B:226 [LYS] | 0:2034 [U] | D:136 [THR] | A:1989 [U] | ❌ 1VQ8_B_0 |
B:227 [HIS] | 0:2034 [U] | D:137 [HIS] | A:1989 [U] | ❌ 1VQ8_B_0 |
B:227 [HIS] | 0:2616 [G] | D:137 [HIS] | A:2577 [G] | ❌ 1VQ8_B_0 |
B:227 [HIS] | 0:1751 [G] | D:137 [HIS] | A:1671 [G] | ❌ 1VQ8_B_0 |
B:227 [HIS] | 0:1753 [C] | D:137 [HIS] | A:1673 [C] | ❌ 1VQ8_B_0 |
B:228 [ALA] | 0:2616 [G] | D:138 [GLY] | A:2577 [G] | ❌ 1VQ8_B_0 |
B:228 [ALA] | 0:836 [G] | D:138 [GLY] | A:741 [U] | ❌ 1VQ8_B_0 |
B:228 [ALA] | 0:2615 [U] | D:138 [GLY] | A:2576 [PSU] | ❌ 1VQ8_B_0 |
B:228 [ALA] | 0:2614 [C] | D:138 [GLY] | A:2575 [C] | ❌ 1VQ8_B_0 |
B:229 [ARG] | 0:2615 [U] | D:139 [ASN] | A:2576 [PSU] | ❌ 1VQ8_B_0 |
B:229 [ARG] | 0:2614 [C] | D:139 [ASN] | A:2575 [C] | ❌ 1VQ8_B_0 |
B:230 [GLN] | 0:1735 [C] | D:140 [SER] | A:1655 [U] | ❌ 1VQ8_B_0 |
B:235 [ARG] | 0:2613 [G] | D:145 [VAL] | A:2574 [G] | ❌ 1VQ8_B_0 |
B:237 [GLY] | 0:2092 [G] | D:147 [GLY] | A:2047 [U] | ❌ 1VQ8_B_0 |
B:239 [LEU] | 0:2547 [C] | D:149 [THR] | A:2508 [C] | ❌ 1VQ8_B_0 |
B:241 [PRO] | 0:2549 [C] | D:151 [GLN] | A:2510 [U] | ❌ 1VQ8_B_0 |
B:248 [ARG] | 0:2653 [A] | D:159 [PHE] | A:2614 [A] | ❌ 1VQ8_B_0 |
B:250 [THR] | 0:2654 [C] | D:161 [GLY] | A:2615 [C] | ❌ 1VQ8_B_0 |
B:250 [THR] | 0:2655 [U] | D:161 [GLY] | A:2616 [C] | ❌ 1VQ8_B_0 |
B:251 [VAL] | 0:2654 [C] | D:162 [LYS] | A:2615 [C] | ❌ 1VQ8_B_0 |
B:251 [VAL] | 0:2655 [U] | D:162 [LYS] | A:2616 [C] | ❌ 1VQ8_B_0 |
B:257 [THR] | 0:2716 [G] | D:168 [LEU] | A:2675 [A] | ❌ 1VQ8_B_0 |
B:261 [GLN] | 0:2807 [U] | D:172 [ARG] | A:2768 [C] | ❌ 1VQ8_B_0 |
B:95 [ARG] | 0:2820 [A] | D:43 [THR] | A:2781 [U] | ❌ 1VQ8_B_0 |
B:95 [ARG] | 0:2819 [C] | D:43 [THR] | A:2780 [U] | ❌ 1VQ8_B_0 |
B:98 [THR] | 0:2673 [U] | D:46 [TYR] | A:2633 [U] | ❌ 1VQ8_B_0 |
B:98 [THR] | 0:2672 [C] | D:46 [TYR] | A:2632 [U] | ❌ 1VQ8_B_0 |
B:111 [ARG] | 0:2828 [G] | D:61 [VAL] | A:2807 [G] | ❌ 1VQ8_B_0 |
B:112 [THR] | 0:2828 [G] | D:62 [THR] | A:2807 [G] | ❌ 1VQ8_B_0 |
B:113 [LEU] | 0:2821 [C] | D:64 [ALA] | A:2782 [U] | ❌ 1VQ8_B_0 |
B:113 [LEU] | 0:2822 [C] | D:64 [ALA] | A:2783 [C] | ❌ 1VQ8_B_0 |
B:113 [LEU] | 0:2668 [G] | D:64 [ALA] | A:2628 [A] | ❌ 1VQ8_B_0 |
B:114 [ASP] | 0:2670 [G] | D:65 [GLN] | A:2630 [A] | ❌ 1VQ8_B_0 |
B:117 [GLU] | 0:2820 [A] | D:68 [HIS] | A:2781 [U] | ❌ 1VQ8_B_0 |
B:120 [ASP] | 0:2820 [A] | D:71 [LYS] | A:2781 [U] | ❌ 1VQ8_B_0 |
B:229 [ARG] | 0:834 [G] | D:139 [ASN] | A:740 [G] | ❌ 7RYG_A:740 no longer at interface |
B:226 [LYS] | 0:1750 [C] | D:136 [THR] | A:1670 [A] | ❌ 7RYG_A:1670 no longer at interface |
B:233 [ARG] | 0:1737 [A] | D:143 [HIS] | A:1657 [U] | ❌ 7RYG_A:1657 no longer at interface |
B:216 [LYS] | 0:2040 [C] | D:126 [LYS] | A:1995 [G] | ❌ 7RYG_A:1995 no longer at interface |
B:230 [GLN] | 0:834 [G] | D:140 [SER] | A:740 [G] | ❌ 7RYG_A:740 no longer at interface |
B:242 [TRP] | 0:2095 [A] | D:152 [ASN] | A:2050 [A] | ❌ 7RYG_A:2050 no longer at interface |
B:242 [TRP] | 0:2096 [A] | D:152 [ASN] | A:2051 [C] | ❌ 7RYG_A:2051 no longer at interface |
B:242 [TRP] | 0:2539 [U] | D:152 [ASN] | A:2500 [PSU] | ❌ 7RYG_A:2500 no longer at interface |
B:227 [HIS] | 0:2544 [G] | D:137 [HIS] | A:2505 [G] | ❌ 7RYG_A:2505 no longer at interface |
B:221 [GLN] | 0:2036 [C] | D:131 [ARG] | A:1991 [U] | ❌ 7RYG_A:1991 no longer at interface |
B:259 [TYR] | 0:2844 [C] | D:170 [ASP] | A:2823 [G] | ❌ 7RYG_A:2823 no longer at interface |
B:316 [ARG] | 0:2681 [A] | D:211 [LYS] | A:2640 [A] | ❌ 7RYG_A:2640 no longer at interface |
B:316 [ARG] | 0:2682 [C] | D:211 [LYS] | A:2641 [U] | ❌ 7RYG_A:2641 no longer at interface |
B:95 [ARG] | 0:2817 [G] | D:43 [THR] | A:2778 [G] | ❌ 7RYG_A:2778 no longer at interface |
B:224 [LYS] | 0:2036 [C] | D:134 [ASP] | A:1991 [U] | ❌ 7RYG_A:1991 no longer at interface |
B:224 [LYS] | 0:1749 [U] | D:134 [ASP] | A:1669 [U] | ❌ 1VQ8_0:1749 no longer at interface |
B:224 [LYS] | 0:1748 [U] | D:134 [ASP] | A:1668 [C] | ❌ 1VQ8_0:1748 no longer at interface |
B:227 [HIS] | 0:1749 [U] | D:137 [HIS] | A:1669 [U] | ❌ 1VQ8_0:1749 no longer at interface |
B:227 [HIS] | 0:1748 [U] | D:137 [HIS] | A:1668 [C] | ❌ 1VQ8_0:1748 no longer at interface |
B:246 [ARG] | 0:1235 [G] | D:157 [ARG] | A:1128 [G] | ❌ 1VQ8_0:1235 no longer at interface |
B:317 [PRO] | 0:2769 [C] | D:212 [ALA] | A:2730 [A] | ❌ 1VQ8_B:317, 1VQ8_0:2769 no longer at interface |
B:112 [THR] | 0:2829 [G] | D:62 [THR] | A:2808 [A] | ❌ 1VQ8_0:2829 no longer at interface |
B:119 [HIS] | 0:2820 [A] | D:70 [ALA] | A:2781 [U] | ❌ 7RYG_D:70 no longer at interface |
B:119 [HIS] | 0:2821 [C] | D:70 [ALA] | A:2782 [U] | ❌ 7RYG_D:70 no longer at interface |
B:214 [PRO] | 0:1734 [C] | D:124 [GLY] | A:1654 [C] | ❌ 7RYG_D:124 no longer at interface |
B:115 [VAL] | 0:2821 [C] | D:66 [LYS] | A:2782 [U] | ❌ 7RYG_D:66 no longer at interface |
B:115 [VAL] | 0:2822 [C] | D:66 [LYS] | A:2783 [C] | ❌ 7RYG_D:66 no longer at interface |
B:87 [TYR] | 0:2672 [C] | D:41 [LEU] | A:2632 [U] | ❌ 7RYG_D:41 no longer at interface |
B:87 [TYR] | 0:2673 [U] | D:41 [LEU] | A:2633 [U] | ❌ 7RYG_D:41 no longer at interface |
B:307 [ARG] | 0:2837 [U] | D:202 [GLY] | A:2816 [G] | ❌ 7RYG_D:202 no longer at interface |
B:307 [ARG] | 0:2838 [A] | D:202 [GLY] | A:2817 [A] | ❌ 7RYG_D:202 no longer at interface |
B:218 [TRP] | 0:2656 [G] | D:128 [TRP] | A:2617 [G] | ❌ 7RYG_D:128 no longer at interface |
B:218 [TRP] | 0:2714 [U] | D:128 [TRP] | A:2673 [G] | ❌ 7RYG_D:128 no longer at interface |
B:157 [LYS] | 0:2846 [C] | D:76 [ALA] | A:2825 [A] | ❌ 7RYG_D:76 no longer at interface |
B:157 [LYS] | 0:2847 [G] | D:76 [ALA] | A:2826 [C] | ❌ 7RYG_D:76 no longer at interface |
B:157 [LYS] | 0:2848 [G] | D:76 [ALA] | A:2827 [G] | ❌ 7RYG_D:76 no longer at interface |
B:157 [LYS] | 0:2851 [G] | D:76 [ALA] | A:2830 [G] | ❌ 7RYG_D:76 no longer at interface |
B:157 [LYS] | 0:2852 [A] | D:76 [ALA] | A:2831 [A] | ❌ 7RYG_D:76 no longer at interface |
B:260 [HIS] | 0:2716 [G] | D:171 [GLU] | A:2675 [A] | ❌ 7RYG_D:171 no longer at interface |
B:308 [LEU] | 0:2837 [U] | D:203 [ASP] | A:2816 [G] | ❌ 7RYG_D:203 no longer at interface |
B:160 [ASP] | 0:2846 [C] | D:79 [LEU] | A:2825 [A] | ❌ 7RYG_D:79 no longer at interface |
B:158 [LYS] | 0:2670 [G] | D:77 [GLY] | A:2630 [A] | ❌ 7RYG_D:77 no longer at interface |
B:158 [LYS] | 0:2846 [C] | D:77 [GLY] | A:2825 [A] | ❌ 7RYG_D:77 no longer at interface |
B:158 [LYS] | 0:2847 [G] | D:77 [GLY] | A:2826 [C] | ❌ 7RYG_D:77 no longer at interface |
B:101 [TRP] | 0:2820 [A] | D:49 [VAL] | A:2781 [U] | ❌ 7RYG_D:49 no longer at interface |
B:312 [ARG] | 0:2806 [C] | D:207 [ARG] | A:2767 [C] | ❌ 7RYG_D:207 no longer at interface |
B:312 [ARG] | 0:2807 [U] | D:207 [ARG] | A:2768 [C] | ❌ 7RYG_D:207 no longer at interface |
B:118 [ASP] | 0:2821 [C] | D:69 [PHE] | A:2782 [U] | ❌ 7RYG_D:69 no longer at interface |
B:118 [ASP] | 0:2822 [C] | D:69 [PHE] | A:2783 [C] | ❌ 7RYG_D:69 no longer at interface |
B:99 [GLU] | 0:2670 [G] | D:47 [GLN] | A:2630 [A] | ❌ 7RYG_D:47 no longer at interface |
B:99 [GLU] | 0:2819 [C] | D:47 [GLN] | A:2780 [U] | ❌ 7RYG_D:47 no longer at interface |
B:99 [GLU] | 0:2820 [A] | D:47 [GLN] | A:2781 [U] | ❌ 7RYG_D:47 no longer at interface |
B:310 [ARG] | 0:2672 [C] | D:205 [ILE] | A:2632 [U] | ❌ 7RYG_D:205 no longer at interface |
B:97 [LEU] | 0:2818 [A] | D:45 [GLY] | A:2779 [A] | ❌ 7RYG_D:45 no longer at interface |
B:97 [LEU] | 0:2819 [C] | D:45 [GLY] | A:2780 [U] | ❌ 7RYG_D:45 no longer at interface |
B:97 [LEU] | 0:2820 [A] | D:45 [GLY] | A:2781 [U] | ❌ 7RYG_D:45 no longer at interface |
B:203 [ALA] | 0:2808 [U] | D:113 [THR] | A:2769 [U] | ❌ 1VQ8_B:203 no longer at interface |
B:205 [VAL] | 0:2717 [C] | D:115 [GLN] | A:2676 [C] | ❌ 1VQ8_B:205 no longer at interface |
B:219 [GLY] | 0:2547 [C] | D:129 [ASN] | A:2508 [C] | ❌ 1VQ8_B:219 no longer at interface |
B:219 [GLY] | 0:2715 [G] | D:129 [ASN] | A:2674 [A] | ❌ 1VQ8_B:219 no longer at interface |
B:219 [GLY] | 0:2714 [U] | D:129 [ASN] | A:2673 [G] | ❌ 1VQ8_B:219 no longer at interface |
B:317 [PRO] | 0:2768 [A] | D:212 [ALA] | A:2729 [A] | ❌ 1VQ8_B:317 no longer at interface |
B:83 [ALA] | 0:2820 [A] | D:37 [GLN] | A:2781 [U] | ❌ 1VQ8_B:83 no longer at interface |
B:83 [ALA] | 0:2819 [C] | D:37 [GLN] | A:2780 [U] | ❌ 1VQ8_B:83 no longer at interface |
B:102 [THR] | 0:2671 [U] | D:50 [GLN] | A:2631 [U] | ❌ 1VQ8_B:102 no longer at interface |
B:108 [GLU] | 0:2847 [G] | D:56 [ARG] | A:2826 [C] | ❌ 1VQ8_B:108 no longer at interface |
B:108 [GLU] | 0:2846 [C] | D:56 [ARG] | A:2825 [A] | ❌ 1VQ8_B:108 no longer at interface |
B:109 [LEU] | 0:2848 [G] | D:57 [ARG] | A:2827 [G] | ❌ 1VQ8_B:109 no longer at interface |
B:109 [LEU] | 0:2851 [G] | D:57 [ARG] | A:2830 [G] | ❌ 1VQ8_B:109 no longer at interface |
B:109 [LEU] | 0:2852 [A] | D:57 [ARG] | A:2831 [A] | ❌ 1VQ8_B:109 no longer at interface |
B:109 [LEU] | 0:2847 [G] | D:57 [ARG] | A:2826 [C] | ❌ 1VQ8_B:109 no longer at interface |
B:165 [ARG] | 0:2673 [U] | D:84 [ARG] | A:2633 [U] | ❌ 1VQ8_B:165 no longer at interface |
B:165 [ARG] | 0:2674 [G] | D:84 [ARG] | A:2634 [G] | ❌ 1VQ8_B:165 no longer at interface |
B:165 [ARG] | 0:2672 [C] | D:84 [ARG] | A:2632 [U] | ❌ 1VQ8_B:165 no longer at interface |
Properties of this pair
Common ECOD label(s) |
Common RFAM label(s) |
Interface TM-score |
Interface RMSD |
Percentage identity |
Protein TM-score |
RNA TM-score |
Protein coverage |
RNA coverage |
Percentage conservation |
Apolar conservation |
H-bond conservation |
Percentage switching out |
---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
Alanine racemase-C | 0.92 | 2.83 | 0.29 | 0.81 | 0.92 | 0.87 | 0.92 | 0.64 | 0.57 | 0.28 | 0.40 |
Other pairs involving 1VQ8_B_0 or 7RYG_D_A
Total number of entries: 16