RNAprotDB

All interfaces > All interologs > Interface groups > group129 > 4Y4O_1E_1A vs 7K00_d_a

Interface analysis


mouse controls

Style

Protein

Cartoon
Licorice
Surface

RNA

Cartoon
Licorice
Surface

Color

Structure
Structure (with hetatm)
Chain
Chainbow

View

Focus on

Interface
RNA
Protein
All

Show chains

Interface

show interface as licorice

Common contacts -

4Y4O_1E
4Y4O_1A
7K00_d
7K00_a
Conserved?
1E:191 [PRO] 1A:2693 [C] d:196 [ALA] a:2681 [C] ✔
1E:191 [PRO] 1A:2830 [A] d:196 [ALA] a:2820 [A] ✔
1E:164 [ARG] 1A:2786 [C] d:169 [ARG] a:2773 [C] ✔
1E:164 [ARG] 1A:2787 [C] d:169 [ARG] a:2774 [C] ✔
1E:169 [ASN] 1A:2743 [C] d:174 [SER] a:2730 [C] ✔
1E:169 [ASN] 1A:2744 [G] d:174 [SER] a:2731 [G] ✔
1E:121 [ASN] 1A:2524 [C] d:126 [ASN] a:2512 [C] ✔
1E:121 [ASN] 1A:2689 [G] d:126 [ASN] a:2677 [G] ✔
1E:121 [ASN] 1A:2690 [C] d:126 [ASN] a:2678 [C] ✔
1E:117 [MET] 1A:1703 [C] d:122 [VAL] a:1656 [C] ✔
1E:117 [MET] 1A:2019 [G] d:122 [VAL] a:1997 [C] ✔
1E:117 [MET] 1A:2020 [G] d:122 [VAL] a:1998 [A] ✔
1E:105 [THR] 1A:2786 [C] d:110 [THR] a:2773 [C] ✔
1E:110 [GLY] 1A:2830 [A] d:115 [GLY] a:2820 [A] ✔
1E:110 [GLY] 1A:2831 [A] d:115 [GLY] a:2821 [A] ✔
1E:110 [GLY] 1A:2832 [G] d:115 [GLY] a:2822 [G] ✔
1E:11 [MET] 1A:2692 [C] d:11 [MET] a:2680 [U] ✔
1E:11 [MET] 1A:2693 [C] d:11 [MET] a:2681 [C] ✔
1E:11 [MET] 1A:2694 [U] d:11 [MET] a:2682 [A] ✔
1E:188 [VAL] 1A:2691 [A] d:193 [VAL] a:2679 [A] ✔
1E:188 [VAL] 1A:2692 [C] d:193 [VAL] a:2680 [U] ✔
1E:132 [HIS] 1A:791 [G] d:137 [SER] a:744 [U] ✔
1E:132 [HIS] 1A:2591 [C] d:137 [SER] a:2579 [C] ✔
1E:132 [HIS] 1A:2592 [U] d:137 [SER] a:2580 [PSU] ✔
1E:111 [ARG] 1A:1701 [A] d:116 [LYS] a:1654 [A] ✔
1E:111 [ARG] 1A:2692 [C] d:116 [LYS] a:2680 [U] ✔
1E:111 [ARG] 1A:2737 [C] d:116 [LYS] a:2724 [U] ✔
1E:111 [ARG] 1A:2831 [A] d:116 [LYS] a:2821 [A] ✔
1E:111 [ARG] 1A:2832 [G] d:116 [LYS] a:2822 [G] ✔
1E:143 [ASN] 1A:2074 [G] d:148 [GLN] a:2052 [A] ✔
1E:143 [ASN] 1A:2075 [G] d:148 [GLN] a:2053 [G] ✔
1E:143 [ASN] 1A:2525 [G] d:148 [GLN] a:2513 [A] ✔
1E:143 [ASN] 1A:2583 [C] d:148 [GLN] a:2571 [U] ✔
1E:143 [ASN] 1A:2584 [A] d:148 [GLN] a:2572 [A] ✔
1E:143 [ASN] 1A:2586 [G] d:148 [GLN] a:2574 [G] ✔
1E:143 [ASN] 1A:2587 [C] d:148 [GLN] a:2575 [C] ✔
1E:42 [ASP] 1A:2796 [G] d:43 [ASP] a:2783 [U] ✔
1E:42 [ASP] 1A:2797 [C] d:43 [ASP] a:2784 [U] ✔
1E:189 [PRO] 1A:2691 [A] d:194 [PRO] a:2679 [A] ✔
1E:189 [PRO] 1A:2692 [C] d:194 [PRO] a:2680 [U] ✔
1E:35 [GLN] 1A:2797 [C] d:36 [GLN] a:2784 [U] ✔
1E:35 [GLN] 1A:2798 [C] d:36 [GLN] a:2785 [C] ✔
1E:107 [THR] 1A:2692 [C] d:112 [THR] a:2680 [U] ✔
1E:115 [GLY] 1A:1702 [A] d:120 [GLY] a:1655 [A] ✔
1E:115 [GLY] 1A:1703 [C] d:120 [GLY] a:1656 [C] ✔
1E:126 [PRO] 1A:2016 [C] d:131 [ASP] a:1994 [C] ✔
1E:126 [PRO] 1A:2522 [C] d:131 [ASP] a:2510 [C] ✔
1E:151 [TYR] 1A:2526 [U] d:156 [PHE] a:2514 [U] ✔
1E:151 [TYR] 1A:2631 [C] d:156 [PHE] a:2619 [C] ✔
1E:141 [ILE] 1A:2072 [C] d:146 [ILE] a:2050 [C] ✔
1E:141 [ILE] 1A:2073 [A] d:146 [ILE] a:2051 [A] ✔
1E:141 [ILE] 1A:2074 [G] d:146 [ILE] a:2052 [A] ✔
1E:141 [ILE] 1A:2524 [C] d:146 [ILE] a:2512 [C] ✔
1E:141 [ILE] 1A:2630 [G] d:146 [ILE] a:2618 [G] ✔
1E:131 [ALA] 1A:790 [G] d:136 [ASN] a:743 [A] ✔
1E:131 [ALA] 1A:791 [G] d:136 [ASN] a:744 [U] ✔
1E:131 [ALA] 1A:2591 [C] d:136 [ASN] a:2579 [C] ✔
1E:131 [ALA] 1A:2592 [U] d:136 [ASN] a:2580 [PSU] ✔
1E:161 [GLY] 1A:2832 [G] d:166 [GLY] a:2822 [G] ✔
1E:156 [MET] 1A:2071 [G] d:161 [MET] a:2049 [G] ✔
1E:156 [MET] 1A:2072 [C] d:161 [MET] a:2050 [C] ✔
1E:156 [MET] 1A:2630 [G] d:161 [MET] a:2618 [G] ✔
1E:156 [MET] 1A:2631 [C] d:161 [MET] a:2619 [C] ✔
1E:156 [MET] 1A:2632 [C] d:161 [MET] a:2620 [C] ✔
1E:66 [HIS] 1A:2645 [G] d:67 [HIS] a:2633 [G] ✔
1E:66 [HIS] 1A:2798 [C] d:67 [HIS] a:2785 [C] ✔
1E:66 [HIS] 1A:2799 [U] d:67 [HIS] a:2786 [U] ✔
1E:154 [LYS] 1A:2524 [C] d:159 [LYS] a:2512 [C] ✔
1E:154 [LYS] 1A:2525 [G] d:159 [LYS] a:2513 [A] ✔
1E:154 [LYS] 1A:2631 [C] d:159 [LYS] a:2619 [C] ✔
1E:154 [LYS] 1A:2632 [C] d:159 [LYS] a:2620 [C] ✔
1E:65 [GLY] 1A:2799 [U] d:66 [GLY] a:2786 [U] ✔
1E:65 [GLY] 1A:2800 [C] d:66 [GLY] a:2787 [C] ✔
1E:157 [ALA] 1A:1702 [A] d:162 [ALA] a:1655 [A] ✔
1E:157 [ALA] 1A:2070 [G] d:162 [ALA] a:2048 [G] ✔
1E:157 [ALA] 1A:2071 [G] d:162 [ALA] a:2049 [G] ✔
1E:157 [ALA] 1A:2632 [C] d:162 [ALA] a:2620 [C] ✔
1E:157 [ALA] 1A:2633 [A] d:162 [ALA] a:2621 [G] ✔
1E:129 [HIS] 1A:1717 [C] d:134 [HIS] a:1670 [C] ✔
1E:129 [HIS] 1A:1718 [U] d:134 [HIS] a:1671 [U] ✔
1E:129 [HIS] 1A:1720 [U] d:134 [HIS] a:1673 [G] ✔
1E:129 [HIS] 1A:1722 [C] d:134 [HIS] a:1675 [C] ✔
1E:129 [HIS] 1A:2015 [U] d:134 [HIS] a:1993 [U] ✔
1E:129 [HIS] 1A:2592 [U] d:134 [HIS] a:2580 [PSU] ✔
1E:129 [HIS] 1A:2593 [G] d:134 [HIS] a:2581 [G] ✔
1E:108 [SER] 1A:2691 [A] d:113 [SER] a:2679 [A] ✔
1E:108 [SER] 1A:2692 [C] d:113 [SER] a:2680 [U] ✔
1E:108 [SER] 1A:2831 [A] d:113 [SER] a:2821 [A] ✔
1E:152 [LYS] 1A:2631 [C] d:157 [LYS] a:2619 [C] ✔
1E:152 [LYS] 1A:2632 [C] d:157 [LYS] a:2620 [C] ✔
1E:139 [GLY] 1A:2073 [A] d:144 [GLY] a:2051 [A] ✔
1E:139 [GLY] 1A:2074 [G] d:144 [GLY] a:2052 [A] ✔
1E:139 [GLY] 1A:2523 [U] d:144 [GLY] a:2511 [U] ✔
1E:139 [GLY] 1A:2524 [C] d:144 [GLY] a:2512 [C] ✔
1E:139 [GLY] 1A:2590 [G] d:144 [GLY] a:2578 [G] ✔
1E:138 [PRO] 1A:2072 [C] d:143 [PRO] a:2050 [C] ✔
1E:138 [PRO] 1A:2073 [A] d:143 [PRO] a:2051 [A] ✔
1E:138 [PRO] 1A:2523 [U] d:143 [PRO] a:2511 [U] ✔
1E:138 [PRO] 1A:2524 [C] d:143 [PRO] a:2512 [C] ✔
1E:203 [LYS] 1A:2744 [G] d:208 [LYS] a:2731 [G] ✔
1E:203 [LYS] 1A:2745 [G] d:208 [LYS] a:2732 [G] ✔
1E:203 [LYS] 1A:2746 [A] d:208 [LYS] a:2733 [A] ✔
1E:203 [LYS] 1A:2784 [C] d:208 [LYS] a:2771 [C] ✔
1E:48 [GLN] 1A:2647 [C] d:49 [GLN] a:2635 [A] ✔
1E:148 [GLY] 1A:2074 [G] d:153 [GLY] a:2052 [A] ✔
1E:148 [GLY] 1A:2075 [G] d:153 [GLY] a:2053 [G] ✔
1E:109 [LYS] 1A:2691 [A] d:114 [LYS] a:2679 [A] ✔
1E:109 [LYS] 1A:2692 [C] d:114 [LYS] a:2680 [U] ✔
1E:109 [LYS] 1A:2693 [C] d:114 [LYS] a:2681 [C] ✔
1E:109 [LYS] 1A:2735 [G] d:114 [LYS] a:2722 [G] ✔
1E:109 [LYS] 1A:2736 [C] d:114 [LYS] a:2723 [C] ✔
1E:109 [LYS] 1A:2830 [A] d:114 [LYS] a:2820 [A] ✔
1E:109 [LYS] 1A:2831 [A] d:114 [LYS] a:2821 [A] ✔
1E:120 [TRP] 1A:2633 [A] d:125 [TRP] a:2621 [G] ✔
1E:170 [LEU] 1A:2742 [G] d:175 [LEU] a:2729 [G] ✔
1E:170 [LEU] 1A:2743 [C] d:175 [LEU] a:2730 [C] ✔
1E:63 [LEU] 1A:2645 [G] d:64 [GLU] a:2633 [G] ✔
1E:63 [LEU] 1A:2799 [U] d:64 [GLU] a:2786 [U] ✔
1E:145 [LYS] 1A:597 [C] d:150 [MEQ] a:574 [A] ✔
1E:145 [LYS] 1A:2054 [G] d:150 [MEQ] a:2032 [G] ✔
1E:145 [LYS] 1A:2055 [A] d:150 [MEQ] a:2033 [A] ✔
1E:145 [LYS] 1A:2075 [G] d:150 [MEQ] a:2053 [G] ✔
1E:145 [LYS] 1A:2077 [C] d:150 [MEQ] a:2055 [C] ✔
1E:145 [LYS] 1A:2584 [A] d:150 [MEQ] a:2572 [A] ✔
1E:186 [GLY] 1A:2742 [G] d:191 [GLY] a:2729 [G] ✔
1E:58 [ARG] 1A:2840 [G] d:59 [ARG] a:2830 [C] ✔
1E:58 [ARG] 1A:2841 [G] d:59 [ARG] a:2831 [G] ✔
1E:61 [ARG] 1A:2799 [U] d:62 [LYS] a:2786 [U] ✔
1E:61 [ARG] 1A:2800 [C] d:62 [LYS] a:2787 [C] ✔
1E:61 [ARG] 1A:2801 [C] d:62 [LYS] a:2788 [C] ✔
1E:61 [ARG] 1A:2820 [A] d:62 [LYS] a:2810 [A] ✔
1E:61 [ARG] 1A:2821 [G] d:62 [LYS] a:2811 [G] ✔
1E:112 [GLY] 1A:1701 [A] d:117 [GLY] a:1654 [A] ✔
1E:112 [GLY] 1A:2832 [G] d:117 [GLY] a:2822 [G] ✔
1E:112 [GLY] 1A:2833 [A] d:117 [GLY] a:2823 [A] ✔
1E:136 [ARG] 1A:1703 [C] d:141 [ARG] a:1656 [C] ✔
1E:136 [ARG] 1A:1704 [C] d:141 [ARG] a:1657 [U] ✔
1E:136 [ARG] 1A:2020 [G] d:141 [ARG] a:1998 [A] ✔
1E:155 [LYS] 1A:2525 [G] d:160 [LYS] a:2513 [A] ✔
1E:130 [GLY] 1A:790 [G] d:135 [GLY] a:743 [A] ✔
1E:130 [GLY] 1A:1722 [C] d:135 [GLY] a:1675 [C] ✔
1E:130 [GLY] 1A:2591 [C] d:135 [GLY] a:2579 [C] ✔
1E:130 [GLY] 1A:2592 [U] d:135 [GLY] a:2580 [PSU] ✔
1E:130 [GLY] 1A:2593 [G] d:135 [GLY] a:2581 [G] ✔
1E:125 [GLY] 1A:2016 [C] d:130 [GLN] a:1994 [C] ✔
1E:158 [GLY] 1A:2632 [C] d:163 [GLY] a:2620 [C] ✔
1E:158 [GLY] 1A:2633 [A] d:163 [GLY] a:2621 [G] ✔
1E:79 [ARG] 1A:2647 [C] d:80 [TRP] a:2635 [A] ✔
1E:79 [ARG] 1A:2648 [U] d:80 [TRP] a:2636 [C] ✔
1E:204 [ALA] 1A:2746 [A] d:209 [ALA] a:2733 [A] ✔
1E:166 [THR] 1A:2785 [C] d:171 [THR] a:2772 [C] ✔
1E:166 [THR] 1A:2786 [C] d:171 [THR] a:2773 [C] ✔
1E:116 [VAL] 1A:1702 [A] d:121 [THR] a:1655 [A] ✔
1E:116 [VAL] 1A:1703 [C] d:121 [THR] a:1656 [C] ✔
1E:8 [LYS] 1A:2692 [C] d:8 [LYS] a:2680 [U] ✔
1E:8 [LYS] 1A:2693 [C] d:8 [LYS] a:2681 [C] ✔
1E:168 [MET] 1A:2743 [C] d:173 [GLN] a:2730 [C] ✔
1E:168 [MET] 1A:2744 [G] d:173 [GLN] a:2731 [G] ✔
1E:168 [MET] 1A:2784 [C] d:173 [GLN] a:2771 [C] ✔
1E:168 [MET] 1A:2785 [C] d:173 [GLN] a:2772 [C] ✔
1E:149 [ARG] 1A:1176 [U] d:154 [LYS] a:1130 [U] ✔
1E:149 [ARG] 1A:2046 [G] d:154 [LYS] a:2024 [G] ✔
1E:149 [ARG] 1A:2047 [C] d:154 [LYS] a:2025 [C] ✔
1E:149 [ARG] 1A:2074 [G] d:154 [LYS] a:2052 [A] ✔
1E:149 [ARG] 1A:2075 [G] d:154 [LYS] a:2053 [G] ✔
1E:149 [ARG] 1A:2630 [G] d:154 [LYS] a:2618 [G] ✔
1E:146 [THR] 1A:1176 [U] d:151 [THR] a:1130 [U] ✔
1E:146 [THR] 1A:2054 [G] d:151 [THR] a:2032 [G] ✔
1E:146 [THR] 1A:2583 [C] d:151 [THR] a:2571 [U] ✔
1E:146 [THR] 1A:2584 [A] d:151 [THR] a:2572 [A] ✔
1E:118 [LYS] 1A:2020 [G] d:123 [LYS] a:1998 [A] ✔
1E:118 [LYS] 1A:2021 [C] d:123 [LYS] a:1999 [C] ✔
1E:118 [LYS] 1A:2736 [C] d:123 [LYS] a:2723 [C] ✔
1E:118 [LYS] 1A:2737 [C] d:123 [LYS] a:2724 [U] ✔
1E:127 [ASP] 1A:2015 [U] d:132 [ALA] a:1993 [U] ✔
1E:127 [ASP] 1A:2016 [C] d:132 [ALA] a:1994 [C] ✔
1E:137 [HIS] 1A:1703 [C] d:142 [VAL] a:1656 [C] ✔
1E:137 [HIS] 1A:1704 [C] d:142 [VAL] a:1657 [U] ✔
1E:137 [HIS] 1A:2073 [A] d:142 [VAL] a:2051 [A] ✔
1E:137 [HIS] 1A:2523 [U] d:142 [VAL] a:2511 [U] ✔
1E:133 [LYS] 1A:791 [G] d:138 [LEU] a:744 [U] ✔
1E:133 [LYS] 1A:792 [G] d:138 [LEU] a:745 [1MG] ✔
1E:133 [LYS] 1A:1704 [C] d:138 [LEU] a:1657 [U] ✔
1E:133 [LYS] 1A:1705 [C] d:138 [LEU] a:1658 [C] ✔
1E:122 [PHE] 1A:2019 [G] d:127 [PHE] a:1997 [C] ✔
1E:122 [PHE] 1A:2524 [C] d:127 [PHE] a:2512 [C] ✔
1E:122 [PHE] 1A:2525 [G] d:127 [PHE] a:2513 [A] ✔
1E:78 [LEU] 1A:2646 [G] d:79 [LEU] a:2634 [A] ✔
1E:78 [LEU] 1A:2647 [C] d:79 [LEU] a:2635 [A] ✔
1E:78 [LEU] 1A:2648 [U] d:79 [LEU] a:2636 [C] ✔
1E:185 [LYS] 1A:2742 [G] d:190 [LYS] a:2729 [G] ✔
1E:185 [LYS] 1A:2743 [C] d:190 [LYS] a:2730 [C] ✔
1E:44 [TYR] 1A:2648 [U] d:45 [TYR] a:2636 [C] ✔
1E:44 [TYR] 1A:2649 [U] d:45 [TYR] a:2637 [U] ✔
1E:153 [GLY] 1A:2631 [C] d:158 [GLY] a:2619 [C] ✔
1E:153 [GLY] 1A:2632 [C] d:158 [GLY] a:2620 [C] ✔
1E:134 [ILE] 1A:1704 [C] d:139 [SER] a:1657 [U] ✔
1E:134 [ILE] 1A:2590 [G] d:139 [SER] a:2578 [G] ✔
1E:134 [ILE] 1A:2591 [C] d:139 [SER] a:2579 [C] ✔
1E:167 [VAL] 1A:2691 [A] d:172 [VAL] a:2679 [A] ✔
1E:167 [VAL] 1A:2742 [G] d:172 [VAL] a:2729 [G] ✔
1E:167 [VAL] 1A:2743 [C] d:172 [VAL] a:2730 [C] ✔
1E:190 [GLY] 1A:2691 [A] d:195 [GLY] a:2679 [A] ✔
1E:190 [GLY] 1A:2692 [C] d:195 [GLY] a:2680 [U] ✔
1E:190 [GLY] 1A:2693 [C] d:195 [GLY] a:2681 [C] ✔
1E:57 [LYS] 1A:2843 [G] d:58 [ASN] a:2833 [U] ✔
1E:159 [HIS] 1A:2633 [A] d:164 [GLN] a:2621 [G] ✔
1E:159 [HIS] 1A:2634 [C] d:164 [GLN] a:2622 [U] ✔
1E:159 [HIS] 1A:2832 [G] d:164 [GLN] a:2822 [G] ✔
1E:159 [HIS] 1A:2833 [A] d:164 [GLN] a:2823 [A] ✔
1E:162 [ALA] 1A:2831 [A] d:167 [ASN] a:2821 [A] ✔
1E:162 [ALA] 1A:2832 [G] d:167 [ASN] a:2822 [G] ✔
1E:62 [PRO] 1A:2644 [A] d:63 [PRO] a:2632 [A] ✔
1E:62 [PRO] 1A:2645 [G] d:63 [PRO] a:2633 [G] ✔
1E:62 [PRO] 1A:2799 [U] d:63 [PRO] a:2786 [U] ✔
1E:62 [PRO] 1A:2800 [C] d:63 [PRO] a:2787 [C] ✔
1E:62 [PRO] 1A:2820 [A] d:63 [PRO] a:2810 [A] ✔
1E:62 [PRO] 1A:2821 [G] d:63 [PRO] a:2811 [G] ✔
1E:142 [GLY] 1A:2074 [G] d:147 [GLY] a:2052 [A] ✔
1E:142 [GLY] 1A:2524 [C] d:147 [GLY] a:2512 [C] ✔
1E:142 [GLY] 1A:2586 [G] d:147 [GLY] a:2574 [G] ✔
1E:142 [GLY] 1A:2587 [C] d:147 [GLY] a:2575 [C] ✔
1E:69 [LYS] 1A:2798 [C] d:70 [LYS] a:2785 [C] ✔
1E:69 [LYS] 1A:2799 [U] d:70 [LYS] a:2786 [U] ✔
1E:124 [GLY] 1A:2523 [U] d:129 [THR] a:2511 [U] ✔
1E:147 [PRO] 1A:1176 [U] d:152 [PRO] a:1130 [U] ✔
1E:147 [PRO] 1A:2047 [C] d:152 [PRO] a:2025 [C] ✔
1E:147 [PRO] 1A:2074 [G] d:152 [PRO] a:2052 [A] ✔
1E:147 [PRO] 1A:2583 [C] d:152 [PRO] a:2571 [U] ✔
1E:140 [SER] 1A:2074 [G] d:145 [SER] a:2052 [A] ✔
1E:140 [SER] 1A:2523 [U] d:145 [SER] a:2511 [U] ✔
1E:140 [SER] 1A:2524 [C] d:145 [SER] a:2512 [C] ✔
1E:140 [SER] 1A:2586 [G] d:145 [SER] a:2574 [G] ✔
1E:140 [SER] 1A:2587 [C] d:145 [SER] a:2575 [C] ✔
1E:140 [SER] 1A:2590 [G] d:145 [SER] a:2578 [G] ✔
1E:113 [PHE] 1A:1701 [A] d:118 [PHE] a:1654 [A] ✔
1E:113 [PHE] 1A:1702 [A] d:118 [PHE] a:1655 [A] ✔
1E:113 [PHE] 1A:2070 [G] d:118 [PHE] a:2048 [G] ✔
1E:113 [PHE] 1A:2071 [G] d:118 [PHE] a:2049 [G] ✔
1E:113 [PHE] 1A:2832 [G] d:118 [PHE] a:2822 [G] ✔
1E:113 [PHE] 1A:2833 [A] d:118 [PHE] a:2823 [A] ✔
1E:135 [HIS] 1A:1704 [C] d:140 [HIS] a:1657 [U] ✔
1E:135 [HIS] 1A:1705 [C] d:140 [HIS] a:1658 [C] ✔
1E:22 [PRO] 1A:2694 [U] d:23 [PRO] a:2682 [A] ✔
1E:22 [PRO] 1A:2741 [U] d:23 [PRO] a:2728 [U] ✔
1E:22 [PRO] 1A:2742 [G] d:23 [PRO] a:2729 [G] ✔
1E:13 [ARG] 1A:2694 [U] d:13 [ARG] a:2682 [A] ✔
1E:13 [ARG] 1A:2695 [C] d:13 [ARG] a:2683 [C] ✔
1E:12 [THR] 1A:2694 [U] d:12 [THR] a:2682 [A] ✔
1E:37 [ARG] 1A:2647 [C] d:38 [LYS] a:2635 [A] ✔
1E:37 [ARG] 1A:2797 [C] d:38 [LYS] a:2784 [U] ✔
1E:150 [VAL] 1A:2074 [G] d:155 [VAL] a:2052 [A] ✔
1E:150 [VAL] 1A:2630 [G] d:155 [VAL] a:2618 [G] ✔
1E:150 [VAL] 1A:2631 [C] d:155 [VAL] a:2619 [C] ✔
1E:192 [ASN] 1A:2693 [C] d:197 [THR] a:2681 [C] ✔
1E:192 [ASN] 1A:2830 [A] d:197 [THR] a:2820 [A] ✔
1E:187 [ALA] 1A:2691 [A] d:192 [ALA] a:2679 [A] ✔
1E:187 [ALA] 1A:2692 [C] d:192 [ALA] a:2680 [U] ✔
1E:187 [ALA] 1A:2742 [G] d:192 [ALA] a:2729 [G] ✔
1E:123 [ALA] 1A:2019 [G] d:128 [ARG] a:1997 [C] ✔
1E:123 [ALA] 1A:2523 [U] d:128 [ARG] a:2511 [U] ✔
1E:123 [ALA] 1A:2524 [C] d:128 [ARG] a:2512 [C] ✔
1E:202 [LYS] 1A:2784 [C] d:207 [VAL] a:2771 [C] ✔
1E:202 [LYS] 1A:2785 [C] d:207 [VAL] a:2772 [C] ✔
1E:82 [ARG] 1A:2649 [U] d:83 [ARG] a:2637 [U] ✔
1E:82 [ARG] 1A:2650 [G] d:83 [ARG] a:2638 [G] ✔
1E:119 [ARG] 1A:2632 [C] d:124 [ARG] a:2620 [C] ✔
1E:119 [ARG] 1A:2633 [A] d:124 [ARG] a:2621 [G] ✔
1E:119 [ARG] 1A:2690 [C] d:124 [ARG] a:2678 [C] ✔
1E:160 [TYR] 1A:2691 [A] d:165 [MET] a:2679 [A] ✔
1E:160 [TYR] 1A:2832 [G] d:165 [MET] a:2822 [G] ✔
1E:144 [ARG] 1A:2074 [G] d:149 [ASN] a:2052 [A] ✔
1E:144 [ARG] 1A:2075 [G] d:149 [ASN] a:2053 [G] ✔
1E:144 [ARG] 1A:2584 [A] d:149 [ASN] a:2572 [A] ✔
1E:144 [ARG] 1A:2586 [G] d:149 [ASN] a:2574 [G] ✔
1E:144 [ARG] 1A:2587 [C] d:149 [ASN] a:2575 [C] ✔
1E:80 [GLU] 1A:2647 [C] d:81 [GLU] a:2635 [A] ✔
1E:80 [GLU] 1A:2648 [U] d:81 [GLU] a:2636 [C] ✔
1E:80 [GLU] 1A:2649 [U] d:81 [GLU] a:2637 [U] ✔
1E:128 [SER] 1A:1722 [C] d:133 [THR] a:1675 [C] ✔
1E:128 [SER] 1A:1723 [A] d:133 [THR] a:1676 [A] ✔
1E:128 [SER] 1A:2015 [U] d:133 [THR] a:1993 [U] ✔
1E:128 [SER] 1A:2016 [C] d:133 [THR] a:1994 [C] ✔
1E:165 [VAL] 1A:2690 [C] d:170 [VAL] a:2678 [C] ✔
1E:165 [VAL] 1A:2691 [A] d:170 [VAL] a:2679 [A] ✔
1E:165 [VAL] 1A:2786 [C] d:170 [VAL] a:2773 [C] ✔
1E:41 [LYS] 1A:2796 [G] d:42 [ASN] a:2783 [U] ✔
1E:41 [LYS] 1A:2797 [C] d:42 [ASN] a:2784 [U] ✔
1E:41 [LYS] 1A:2798 [C] d:42 [ASN] a:2785 [C] ✔
1E:60 [ASN] 1A:2645 [G] d:61 [THR] a:2633 [G] ✔
1E:60 [ASN] 1A:2821 [G] d:61 [THR] a:2811 [G] ✔
1E:60 [ASN] 1A:2822 [G] d:61 [THR] a:2812 [G] ✔
1E:114 [ALA] 1A:1701 [A] d:119 [ALA] a:1654 [A] ✔
1E:114 [ALA] 1A:1702 [A] d:119 [ALA] a:1655 [A] ✔
1E:55 [ASN] 1A:2844 [G] d:56 [LYS] a:2834 [G] ✔
1E:191 [PRO] 1A:2831 [A] d:196 [ALA] a:2821 [A] ❌ 7K00_d_a
1E:132 [HIS] 1A:790 [G] d:137 [SER] a:743 [A] ❌ 7K00_d_a
1E:132 [HIS] 1A:792 [G] d:137 [SER] a:745 [1MG] ❌ 7K00_d_a
1E:111 [ARG] 1A:2691 [A] d:116 [LYS] a:2679 [A] ❌ 7K00_d_a
1E:35 [GLN] 1A:2646 [G] d:36 [GLN] a:2634 [A] ❌ 7K00_d_a
1E:151 [TYR] 1A:2525 [G] d:156 [PHE] a:2513 [A] ❌ 7K00_d_a
1E:151 [TYR] 1A:2632 [C] d:156 [PHE] a:2620 [C] ❌ 7K00_d_a
1E:129 [HIS] 1A:790 [G] d:134 [HIS] a:743 [A] ❌ 7K00_d_a
1E:163 [GLU] 1A:2634 [C] d:168 [GLU] a:2622 [U] ❌ 7K00_d_a
1E:163 [GLU] 1A:2787 [C] d:168 [GLU] a:2774 [C] ❌ 7K00_d_a
1E:120 [TRP] 1A:2690 [C] d:125 [TRP] a:2678 [C] ❌ 7K00_d_a
1E:63 [LEU] 1A:2646 [G] d:64 [GLU] a:2634 [A] ❌ 7K00_d_a
1E:186 [GLY] 1A:2741 [U] d:191 [GLY] a:2728 [U] ❌ 7K00_d_a
1E:58 [ARG] 1A:2844 [G] d:59 [ARG] a:2834 [G] ❌ 7K00_d_a
1E:58 [ARG] 1A:2845 [A] d:59 [ARG] a:2835 [A] ❌ 7K00_d_a
1E:158 [GLY] 1A:2070 [G] d:163 [GLY] a:2048 [G] ❌ 7K00_d_a
1E:137 [HIS] 1A:2072 [C] d:142 [VAL] a:2050 [C] ❌ 7K00_d_a
1E:124 [GLY] 1A:2524 [C] d:129 [THR] a:2512 [C] ❌ 7K00_d_a
1E:37 [ARG] 1A:2646 [G] d:38 [LYS] a:2634 [A] ❌ 7K00_d_a
1E:37 [ARG] 1A:2796 [G] d:38 [LYS] a:2783 [U] ❌ 7K00_d_a
1E:37 [ARG] 1A:2798 [C] d:38 [LYS] a:2785 [C] ❌ 7K00_d_a
1E:187 [ALA] 1A:2741 [U] d:192 [ALA] a:2728 [U] ❌ 7K00_d_a
1E:202 [LYS] 1A:2746 [A] d:207 [VAL] a:2733 [A] ❌ 7K00_d_a
1E:160 [TYR] 1A:2690 [C] d:165 [MET] a:2678 [C] ❌ 7K00_d_a
1E:55 [ASN] 1A:2843 [G] d:56 [LYS] a:2833 [U] ❌ 7K00_d_a
1E:111 [ARG] 1A:2736 [C] d:116 [LYS] a:2723 [C] ❌ 4Y4O_1E_1A
1E:113 [PHE] 1A:2633 [A] d:118 [PHE] a:2621 [G] ❌ 4Y4O_1E_1A
1E:122 [PHE] 1A:2523 [U] d:127 [PHE] a:2511 [U] ❌ 4Y4O_1E_1A
1E:124 [GLY] 1A:2019 [G] d:129 [THR] a:1997 [C] ❌ 4Y4O_1E_1A
1E:125 [GLY] 1A:2523 [U] d:130 [GLN] a:2511 [U] ❌ 4Y4O_1E_1A
1E:125 [GLY] 1A:2522 [C] d:130 [GLN] a:2510 [C] ❌ 4Y4O_1E_1A
1E:125 [GLY] 1A:2590 [G] d:130 [GLN] a:2578 [G] ❌ 4Y4O_1E_1A
1E:125 [GLY] 1A:2591 [C] d:130 [GLN] a:2579 [C] ❌ 4Y4O_1E_1A
1E:126 [PRO] 1A:1717 [C] d:131 [ASP] a:1670 [C] ❌ 4Y4O_1E_1A
1E:136 [ARG] 1A:2019 [G] d:141 [ARG] a:1997 [C] ❌ 4Y4O_1E_1A
1E:137 [HIS] 1A:2590 [G] d:142 [VAL] a:2578 [G] ❌ 4Y4O_1E_1A
1E:143 [ASN] 1A:2526 [U] d:148 [GLN] a:2514 [U] ❌ 4Y4O_1E_1A
1E:145 [LYS] 1A:2074 [G] d:150 [MEQ] a:2052 [A] ❌ 4Y4O_1E_1A
1E:146 [THR] 1A:2586 [G] d:151 [THR] a:2574 [G] ❌ 4Y4O_1E_1A
1E:151 [TYR] 1A:1176 [U] d:156 [PHE] a:1130 [U] ❌ 4Y4O_1E_1A
1E:151 [TYR] 1A:2630 [G] d:156 [PHE] a:2618 [G] ❌ 4Y4O_1E_1A
1E:152 [LYS] 1A:2630 [G] d:157 [LYS] a:2618 [G] ❌ 4Y4O_1E_1A
1E:159 [HIS] 1A:2831 [A] d:164 [GLN] a:2821 [A] ❌ 4Y4O_1E_1A
1E:163 [GLU] 1A:2786 [C] d:168 [GLU] a:2773 [C] ❌ 4Y4O_1E_1A
1E:163 [GLU] 1A:2691 [A] d:168 [GLU] a:2679 [A] ❌ 4Y4O_1E_1A
1E:37 [ARG] 1A:2648 [U] d:38 [LYS] a:2636 [C] ❌ 4Y4O_1E_1A
1E:55 [ASN] 1A:2841 [G] d:56 [LYS] a:2831 [G] ❌ 4Y4O_1E_1A
1E:55 [ASN] 1A:2840 [G] d:56 [LYS] a:2830 [C] ❌ 4Y4O_1E_1A
1E:55 [ASN] 1A:2845 [A] d:56 [LYS] a:2835 [A] ❌ 4Y4O_1E_1A
1E:57 [LYS] 1A:2841 [G] d:58 [ASN] a:2831 [G] ❌ 4Y4O_1E_1A
1E:76 [ARG] 1A:2839 [C] d:77 [ARG] a:2829 [A] ❌ 7K00_d:77, 7K00_a:2829 no longer at interface
1E:132 [HIS] 1A:2623 [U] d:137 [SER] a:2611 [C] ❌ 7K00_a:2611 no longer at interface
1E:132 [HIS] 1A:2624 [C] d:137 [SER] a:2612 [C] ❌ 7K00_a:2612 no longer at interface
1E:145 [LYS] 1A:2076 [A] d:150 [MEQ] a:2054 [A] ❌ 7K00_a:2054 no longer at interface
1E:155 [LYS] 1A:2656 [G] d:160 [LYS] a:2644 [G] ❌ 7K00_a:2644 no longer at interface
1E:204 [ALA] 1A:2747 [A] d:209 [ALA] a:2734 [A] ❌ 7K00_a:2734 no longer at interface
1E:133 [LYS] 1A:793 [A] d:138 [LEU] a:746 [PSU] ❌ 7K00_a:746 no longer at interface
1E:133 [LYS] 1A:2624 [C] d:138 [LEU] a:2612 [C] ❌ 7K00_a:2612 no longer at interface
1E:159 [HIS] 1A:2835 [C] d:164 [GLN] a:2825 [G] ❌ 7K00_a:2825 no longer at interface
1E:144 [ARG] 1A:2516 [U] d:149 [ASN] a:2504 [PSU] ❌ 7K00_a:2504 no longer at interface
1E:144 [ARG] 1A:2518 [U] d:149 [ASN] a:2506 [U] ❌ 7K00_a:2506 no longer at interface
1E:124 [GLY] 1A:2018 [C] d:129 [THR] a:1996 [C] ❌ 4Y4O_1A:2018 no longer at interface
1E:130 [GLY] 1A:789 [G] d:135 [GLY] a:742 [A] ❌ 4Y4O_1A:789 no longer at interface
1E:148 [GLY] 1A:2629 [C] d:153 [GLY] a:2617 [U] ❌ 4Y4O_1A:2629 no longer at interface
1E:149 [ARG] 1A:1177 [G] d:154 [LYS] a:1131 [G] ❌ 4Y4O_1A:1177 no longer at interface
1E:76 [ARG] 1A:2840 [G] d:77 [ARG] a:2830 [C] ❌ 7K00_d:77 no longer at interface
1E:64 [LYS] 1A:2799 [U] d:65 [ALA] a:2786 [U] ❌ 7K00_d:65 no longer at interface
1E:54 [GLN] 1A:2840 [G] d:55 [LYS] a:2830 [C] ❌ 7K00_d:55 no longer at interface
1E:199 [ARG] 1A:2785 [C] d:204 [LYS] a:2772 [C] ❌ 7K00_d:204 no longer at interface
1E:103 [ASP] 1A:2785 [C] d:108 [ASP] a:2772 [C] ❌ 7K00_d:108 no longer at interface
1E:101 [ARG] 1A:2743 [C] d:106 [LYS] a:2730 [C] ❌ 7K00_d:106 no longer at interface
1E:171 [GLU] 1A:2743 [C] d:176 [ASP] a:2730 [C] ❌ 4Y4O_1E:171 no longer at interface
1E:20 [ALA] 1A:2742 [G] d:21 [SER] a:2729 [G] ❌ 4Y4O_1E:20 no longer at interface

logo_download Export the table of contacts

Properties of this pair

Common ECOD label(s)
 Common RFAM label(s)
 Interface TM-score
 Interface RMSD
 Percentage identity
 Protein TM-score
 RNA TM-score
 Protein coverage
 RNA coverage
 Percentage conservation
 Apolar conservation
 H-bond conservation
 Percentage switching out
Alanine racemase-C Bacterial large subunit ribosomal RNA 0.97 0.69 0.64 0.96 0.96 0.98 0.96 0.92 0.91 0.52 0.32


Other pairs involving 4Y4O_1E_1A or 7K00_d_a

Total number of entries: 17

Interface 1 Interface 2 Percentage conservation
 		Interface TM-score
 		Interface RMSD
 		Percentage identity
 		Common ECOD label(s)
 		Common RFAM label(s)
 		Explore both interfaces
1YHQ_B_0 4Y4O_1E_1A 0.64 0.9 2.2 0.29 Alanine racemase-C compare
1VQ8_B_0 4Y4O_1E_1A 0.64 0.9 2.32 0.29 Alanine racemase-C compare
4Y4O_1E_1A 6AZ3_B_1 0.61 0.66 1.78 0.17 Alanine racemase-C compare
4Y4O_1E_1A 6AZ3_B_4 0.55 0.58 2.75 0.17 Alanine racemase-C compare
4Y4O_1E_1A 6S0Z_D_A 0.88 0.97 1.32 0.54 Alanine racemase-C Bacterial large subunit ribosomal RNA compare
1YHQ_B_0 7K00_d_a 0.63 0.91 2.07 0.29 Alanine racemase-C compare
6AZ3_B_1 7K00_d_a 0.61 0.66 1.8 0.14 Alanine racemase-C compare
1VQ8_B_0 7K00_d_a 0.63 0.91 2.21 0.29 Alanine racemase-C compare
6S0Z_D_A 7K00_d_a 0.88 0.97 1.25 0.51 Alanine racemase-C Bacterial large subunit ribosomal RNA compare
6AZ3_B_4 7K00_d_a 0.48 0.59 3.5 0.14 Alanine racemase-C compare
4Y4O_1E_1A 7K00_d_a 0.92 0.97 0.69 0.64 Alanine racemase-C Bacterial large subunit ribosomal RNA compare
7K00_d_a 7O7Y_BB_B5 0.58 0.9 2.87 0.27 Alanine racemase-C compare
4Y4O_1E_1A 7O7Y_BB_B5 0.62 0.9 2.62 0.26 Alanine racemase-C compare
7K00_d_a 7OF0_E_A 0.78 0.89 1.59 0.36 Alanine racemase-C Bacterial large subunit ribosomal RNA compare
4Y4O_1E_1A 7OF0_E_A 0.76 0.91 1.65 0.36 Alanine racemase-C Bacterial large subunit ribosomal RNA compare
7K00_d_a 7RYG_D_A 0.95 0.99 1.46 0.76 Alanine racemase-C Bacterial large subunit ribosomal RNA compare
4Y4O_1E_1A 7RYG_D_A 0.89 0.96 1.71 0.58 Alanine racemase-C Bacterial large subunit ribosomal RNA compare