Interface analysis
Style
Protein
CartoonLicorice
Surface
RNA
CartoonLicorice
Surface
Color
StructureStructure (with hetatm)
Chain
Chainbow
View
Focus on
InterfaceRNA
Protein
All
Show chains
Interface
show interface as licoriceCommon contacts -
4Y4O_1E
|
4Y4O_1A
|
7OF0_E
|
7OF0_A
|
Conserved?
|
---|---|---|---|---|
1E:191 [PRO] | 1A:2693 [C] | E:292 [HIS] | A:3149 [C] | ✔ |
1E:191 [PRO] | 1A:2830 [A] | E:292 [HIS] | A:3217 [A] | ✔ |
1E:191 [PRO] | 1A:2831 [A] | E:292 [HIS] | A:3218 [A] | ✔ |
1E:164 [ARG] | 1A:2786 [C] | E:265 [TYR] | A:3204 [C] | ✔ |
1E:164 [ARG] | 1A:2787 [C] | E:265 [TYR] | A:3205 [C] | ✔ |
1E:169 [ASN] | 1A:2743 [C] | E:270 [GLY] | A:3166 [U] | ✔ |
1E:169 [ASN] | 1A:2744 [G] | E:270 [GLY] | A:3167 [U] | ✔ |
1E:121 [ASN] | 1A:2524 [C] | E:223 [GLY] | A:2999 [C] | ✔ |
1E:117 [MET] | 1A:2019 [G] | E:219 [MET] | A:2660 [U] | ✔ |
1E:117 [MET] | 1A:2020 [G] | E:219 [MET] | A:2661 [U] | ✔ |
1E:105 [THR] | 1A:2786 [C] | E:207 [THR] | A:3204 [C] | ✔ |
1E:110 [GLY] | 1A:2830 [A] | E:212 [GLY] | A:3217 [A] | ✔ |
1E:110 [GLY] | 1A:2831 [A] | E:212 [GLY] | A:3218 [A] | ✔ |
1E:110 [GLY] | 1A:2832 [G] | E:212 [GLY] | A:3219 [G] | ✔ |
1E:11 [MET] | 1A:2692 [C] | E:106 [MET] | A:3148 [C] | ✔ |
1E:11 [MET] | 1A:2693 [C] | E:106 [MET] | A:3149 [C] | ✔ |
1E:11 [MET] | 1A:2694 [U] | E:106 [MET] | A:3150 [U] | ✔ |
1E:188 [VAL] | 1A:2691 [A] | E:289 [VAL] | A:3147 [G] | ✔ |
1E:188 [VAL] | 1A:2692 [C] | E:289 [VAL] | A:3148 [C] | ✔ |
1E:132 [HIS] | 1A:790 [G] | E:234 [THR] | A:1953 [A] | ✔ |
1E:132 [HIS] | 1A:791 [G] | E:234 [THR] | A:1954 [U] | ✔ |
1E:132 [HIS] | 1A:2591 [C] | E:234 [THR] | A:3066 [C] | ✔ |
1E:132 [HIS] | 1A:2592 [U] | E:234 [THR] | A:3067 [U] | ✔ |
1E:111 [ARG] | 1A:1701 [A] | E:213 [LYS] | A:2458 [A] | ✔ |
1E:111 [ARG] | 1A:2692 [C] | E:213 [LYS] | A:3148 [C] | ✔ |
1E:111 [ARG] | 1A:2737 [C] | E:213 [LYS] | A:3160 [A] | ✔ |
1E:111 [ARG] | 1A:2831 [A] | E:213 [LYS] | A:3218 [A] | ✔ |
1E:111 [ARG] | 1A:2832 [G] | E:213 [LYS] | A:3219 [G] | ✔ |
1E:143 [ASN] | 1A:2074 [G] | E:245 [THR] | A:2715 [A] | ✔ |
1E:143 [ASN] | 1A:2525 [G] | E:245 [THR] | A:3000 [A] | ✔ |
1E:143 [ASN] | 1A:2583 [C] | E:245 [THR] | A:3058 [U] | ✔ |
1E:143 [ASN] | 1A:2584 [A] | E:245 [THR] | A:3059 [A] | ✔ |
1E:143 [ASN] | 1A:2586 [G] | E:245 [THR] | A:3061 [G] | ✔ |
1E:143 [ASN] | 1A:2587 [C] | E:245 [THR] | A:3062 [U] | ✔ |
1E:189 [PRO] | 1A:2691 [A] | E:290 [PRO] | A:3147 [G] | ✔ |
1E:189 [PRO] | 1A:2692 [C] | E:290 [PRO] | A:3148 [C] | ✔ |
1E:107 [THR] | 1A:2692 [C] | E:209 [LYS] | A:3148 [C] | ✔ |
1E:115 [GLY] | 1A:1702 [A] | E:217 [GLY] | A:2459 [A] | ✔ |
1E:115 [GLY] | 1A:1703 [C] | E:217 [GLY] | A:2460 [A] | ✔ |
1E:126 [PRO] | 1A:2016 [C] | E:228 [PRO] | A:2657 [C] | ✔ |
1E:126 [PRO] | 1A:2522 [C] | E:228 [PRO] | A:2997 [A] | ✔ |
1E:151 [TYR] | 1A:2526 [U] | E:252 [TRP] | A:3001 [G] | ✔ |
1E:151 [TYR] | 1A:2631 [C] | E:252 [TRP] | A:3106 [C] | ✔ |
1E:141 [ILE] | 1A:2072 [C] | E:243 [VAL] | A:2713 [C] | ✔ |
1E:141 [ILE] | 1A:2073 [A] | E:243 [VAL] | A:2714 [A] | ✔ |
1E:141 [ILE] | 1A:2074 [G] | E:243 [VAL] | A:2715 [A] | ✔ |
1E:141 [ILE] | 1A:2524 [C] | E:243 [VAL] | A:2999 [C] | ✔ |
1E:131 [ALA] | 1A:790 [G] | E:233 [GLN] | A:1953 [A] | ✔ |
1E:131 [ALA] | 1A:791 [G] | E:233 [GLN] | A:1954 [U] | ✔ |
1E:131 [ALA] | 1A:2591 [C] | E:233 [GLN] | A:3066 [C] | ✔ |
1E:131 [ALA] | 1A:2592 [U] | E:233 [GLN] | A:3067 [U] | ✔ |
1E:161 [GLY] | 1A:2832 [G] | E:262 [GLY] | A:3219 [G] | ✔ |
1E:156 [MET] | 1A:2071 [G] | E:257 [MET] | A:2712 [G] | ✔ |
1E:156 [MET] | 1A:2072 [C] | E:257 [MET] | A:2713 [C] | ✔ |
1E:156 [MET] | 1A:2630 [G] | E:257 [MET] | A:3105 [A] | ✔ |
1E:156 [MET] | 1A:2631 [C] | E:257 [MET] | A:3106 [C] | ✔ |
1E:156 [MET] | 1A:2632 [C] | E:257 [MET] | A:3107 [U] | ✔ |
1E:66 [HIS] | 1A:2798 [C] | E:164 [PHE] | A:3207 [A] | ✔ |
1E:154 [LYS] | 1A:2631 [C] | E:255 [THR] | A:3106 [C] | ✔ |
1E:154 [LYS] | 1A:2632 [C] | E:255 [THR] | A:3107 [U] | ✔ |
1E:157 [ALA] | 1A:1702 [A] | E:258 [PRO] | A:2459 [A] | ✔ |
1E:157 [ALA] | 1A:2071 [G] | E:258 [PRO] | A:2712 [G] | ✔ |
1E:157 [ALA] | 1A:2632 [C] | E:258 [PRO] | A:3107 [U] | ✔ |
1E:129 [HIS] | 1A:1717 [C] | E:231 [HIS] | A:2474 [C] | ✔ |
1E:129 [HIS] | 1A:1718 [U] | E:231 [HIS] | A:2475 [U] | ✔ |
1E:129 [HIS] | 1A:1720 [U] | E:231 [HIS] | A:2477 [G] | ✔ |
1E:129 [HIS] | 1A:1722 [C] | E:231 [HIS] | A:2479 [C] | ✔ |
1E:129 [HIS] | 1A:2015 [U] | E:231 [HIS] | A:2656 [U] | ✔ |
1E:129 [HIS] | 1A:2592 [U] | E:231 [HIS] | A:3067 [U] | ✔ |
1E:108 [SER] | 1A:2691 [A] | E:210 [THR] | A:3147 [G] | ✔ |
1E:108 [SER] | 1A:2692 [C] | E:210 [THR] | A:3148 [C] | ✔ |
1E:108 [SER] | 1A:2831 [A] | E:210 [THR] | A:3218 [A] | ✔ |
1E:152 [LYS] | 1A:2631 [C] | E:253 [PRO] | A:3106 [C] | ✔ |
1E:152 [LYS] | 1A:2632 [C] | E:253 [PRO] | A:3107 [U] | ✔ |
1E:139 [GLY] | 1A:2073 [A] | E:241 [GLY] | A:2714 [A] | ✔ |
1E:139 [GLY] | 1A:2074 [G] | E:241 [GLY] | A:2715 [A] | ✔ |
1E:139 [GLY] | 1A:2523 [U] | E:241 [GLY] | A:2998 [U] | ✔ |
1E:139 [GLY] | 1A:2524 [C] | E:241 [GLY] | A:2999 [C] | ✔ |
1E:139 [GLY] | 1A:2590 [G] | E:241 [GLY] | A:3065 [U] | ✔ |
1E:138 [PRO] | 1A:2072 [C] | E:240 [PRO] | A:2713 [C] | ✔ |
1E:138 [PRO] | 1A:2073 [A] | E:240 [PRO] | A:2714 [A] | ✔ |
1E:138 [PRO] | 1A:2523 [U] | E:240 [PRO] | A:2998 [U] | ✔ |
1E:203 [LYS] | 1A:2744 [G] | E:304 [LEU] | A:3167 [U] | ✔ |
1E:203 [LYS] | 1A:2746 [A] | E:304 [LEU] | A:3168 [C] | ✔ |
1E:54 [GLN] | 1A:2840 [G] | E:152 [VAL] | A:3227 [U] | ✔ |
1E:148 [GLY] | 1A:2074 [G] | E:249 [GLY] | A:2715 [A] | ✔ |
1E:148 [GLY] | 1A:2075 [G] | E:249 [GLY] | A:2716 [G] | ✔ |
1E:109 [LYS] | 1A:2691 [A] | E:211 [ILE] | A:3147 [G] | ✔ |
1E:109 [LYS] | 1A:2692 [C] | E:211 [ILE] | A:3148 [C] | ✔ |
1E:109 [LYS] | 1A:2693 [C] | E:211 [ILE] | A:3149 [C] | ✔ |
1E:109 [LYS] | 1A:2736 [C] | E:211 [ILE] | A:3159 [A] | ✔ |
1E:109 [LYS] | 1A:2830 [A] | E:211 [ILE] | A:3217 [A] | ✔ |
1E:109 [LYS] | 1A:2831 [A] | E:211 [ILE] | A:3218 [A] | ✔ |
1E:120 [TRP] | 1A:2633 [A] | E:222 [TRP] | A:3108 [U] | ✔ |
1E:120 [TRP] | 1A:2690 [C] | E:222 [TRP] | A:3146 [G] | ✔ |
1E:170 [LEU] | 1A:2742 [G] | E:271 [LEU] | A:3165 [C] | ✔ |
1E:170 [LEU] | 1A:2743 [C] | E:271 [LEU] | A:3166 [U] | ✔ |
1E:186 [GLY] | 1A:2742 [G] | E:287 [GLY] | A:3165 [C] | ✔ |
1E:58 [ARG] | 1A:2840 [G] | E:156 [ARG] | A:3227 [U] | ✔ |
1E:58 [ARG] | 1A:2844 [G] | E:156 [ARG] | A:3228 [U] | ✔ |
1E:199 [ARG] | 1A:2785 [C] | E:300 [LYS] | A:3203 [A] | ✔ |
1E:112 [GLY] | 1A:1701 [A] | E:214 [GLY] | A:2458 [A] | ✔ |
1E:112 [GLY] | 1A:2832 [G] | E:214 [GLY] | A:3219 [G] | ✔ |
1E:112 [GLY] | 1A:2833 [A] | E:214 [GLY] | A:3220 [A] | ✔ |
1E:136 [ARG] | 1A:1703 [C] | E:238 [ARG] | A:2460 [A] | ✔ |
1E:136 [ARG] | 1A:1704 [C] | E:238 [ARG] | A:2461 [A] | ✔ |
1E:136 [ARG] | 1A:2020 [G] | E:238 [ARG] | A:2661 [U] | ✔ |
1E:155 [LYS] | 1A:2525 [G] | E:256 [LYS] | A:3000 [A] | ✔ |
1E:130 [GLY] | 1A:790 [G] | E:232 [GLY] | A:1953 [A] | ✔ |
1E:130 [GLY] | 1A:2591 [C] | E:232 [GLY] | A:3066 [C] | ✔ |
1E:130 [GLY] | 1A:2592 [U] | E:232 [GLY] | A:3067 [U] | ✔ |
1E:125 [GLY] | 1A:2016 [C] | E:227 [GLN] | A:2657 [C] | ✔ |
1E:158 [GLY] | 1A:2632 [C] | E:259 [GLY] | A:3107 [U] | ✔ |
1E:158 [GLY] | 1A:2633 [A] | E:259 [GLY] | A:3108 [U] | ✔ |
1E:166 [THR] | 1A:2785 [C] | E:267 [THR] | A:3203 [A] | ✔ |
1E:166 [THR] | 1A:2786 [C] | E:267 [THR] | A:3204 [C] | ✔ |
1E:116 [VAL] | 1A:1702 [A] | E:218 [VAL] | A:2459 [A] | ✔ |
1E:116 [VAL] | 1A:1703 [C] | E:218 [VAL] | A:2460 [A] | ✔ |
1E:8 [LYS] | 1A:2692 [C] | E:103 [LYS] | A:3148 [C] | ✔ |
1E:8 [LYS] | 1A:2693 [C] | E:103 [LYS] | A:3149 [C] | ✔ |
1E:168 [MET] | 1A:2743 [C] | E:269 [TYR] | A:3166 [U] | ✔ |
1E:168 [MET] | 1A:2744 [G] | E:269 [TYR] | A:3167 [U] | ✔ |
1E:168 [MET] | 1A:2785 [C] | E:269 [TYR] | A:3203 [A] | ✔ |
1E:149 [ARG] | 1A:1176 [U] | E:250 [ARG] | A:2233 [U] | ✔ |
1E:149 [ARG] | 1A:2046 [G] | E:250 [ARG] | A:2687 [C] | ✔ |
1E:149 [ARG] | 1A:2047 [C] | E:250 [ARG] | A:2688 [C] | ✔ |
1E:149 [ARG] | 1A:2074 [G] | E:250 [ARG] | A:2715 [A] | ✔ |
1E:149 [ARG] | 1A:2075 [G] | E:250 [ARG] | A:2716 [G] | ✔ |
1E:149 [ARG] | 1A:2630 [G] | E:250 [ARG] | A:3105 [A] | ✔ |
1E:146 [THR] | 1A:1176 [U] | E:247 [ASP] | A:2233 [U] | ✔ |
1E:146 [THR] | 1A:2583 [C] | E:247 [ASP] | A:3058 [U] | ✔ |
1E:146 [THR] | 1A:2584 [A] | E:247 [ASP] | A:3059 [A] | ✔ |
1E:118 [LYS] | 1A:2020 [G] | E:220 [LYS] | A:2661 [U] | ✔ |
1E:118 [LYS] | 1A:2021 [C] | E:220 [LYS] | A:2662 [A] | ✔ |
1E:118 [LYS] | 1A:2736 [C] | E:220 [LYS] | A:3159 [A] | ✔ |
1E:118 [LYS] | 1A:2737 [C] | E:220 [LYS] | A:3160 [A] | ✔ |
1E:127 [ASP] | 1A:2015 [U] | E:229 [ALA] | A:2656 [U] | ✔ |
1E:127 [ASP] | 1A:2016 [C] | E:229 [ALA] | A:2657 [C] | ✔ |
1E:137 [HIS] | 1A:1703 [C] | E:239 [ARG] | A:2460 [A] | ✔ |
1E:137 [HIS] | 1A:1704 [C] | E:239 [ARG] | A:2461 [A] | ✔ |
1E:137 [HIS] | 1A:2073 [A] | E:239 [ARG] | A:2714 [A] | ✔ |
1E:137 [HIS] | 1A:2523 [U] | E:239 [ARG] | A:2998 [U] | ✔ |
1E:133 [LYS] | 1A:791 [G] | E:235 [LYS] | A:1954 [U] | ✔ |
1E:133 [LYS] | 1A:792 [G] | E:235 [LYS] | A:1955 [G] | ✔ |
1E:133 [LYS] | 1A:793 [A] | E:235 [LYS] | A:1956 [U] | ✔ |
1E:133 [LYS] | 1A:1704 [C] | E:235 [LYS] | A:2461 [A] | ✔ |
1E:133 [LYS] | 1A:1705 [C] | E:235 [LYS] | A:2462 [A] | ✔ |
1E:133 [LYS] | 1A:2624 [C] | E:235 [LYS] | A:3099 [C] | ✔ |
1E:122 [PHE] | 1A:2019 [G] | E:224 [PHE] | A:2660 [U] | ✔ |
1E:122 [PHE] | 1A:2524 [C] | E:224 [PHE] | A:2999 [C] | ✔ |
1E:122 [PHE] | 1A:2525 [G] | E:224 [PHE] | A:3000 [A] | ✔ |
1E:185 [LYS] | 1A:2742 [G] | E:286 [ASN] | A:3165 [C] | ✔ |
1E:185 [LYS] | 1A:2743 [C] | E:286 [ASN] | A:3166 [U] | ✔ |
1E:153 [GLY] | 1A:2631 [C] | E:254 [GLY] | A:3106 [C] | ✔ |
1E:153 [GLY] | 1A:2632 [C] | E:254 [GLY] | A:3107 [U] | ✔ |
1E:134 [ILE] | 1A:1704 [C] | E:236 [THR] | A:2461 [A] | ✔ |
1E:134 [ILE] | 1A:2590 [G] | E:236 [THR] | A:3065 [U] | ✔ |
1E:134 [ILE] | 1A:2591 [C] | E:236 [THR] | A:3066 [C] | ✔ |
1E:167 [VAL] | 1A:2691 [A] | E:268 [GLU] | A:3147 [G] | ✔ |
1E:167 [VAL] | 1A:2742 [G] | E:268 [GLU] | A:3165 [C] | ✔ |
1E:167 [VAL] | 1A:2743 [C] | E:268 [GLU] | A:3166 [U] | ✔ |
1E:190 [GLY] | 1A:2691 [A] | E:291 [GLY] | A:3147 [G] | ✔ |
1E:190 [GLY] | 1A:2692 [C] | E:291 [GLY] | A:3148 [C] | ✔ |
1E:190 [GLY] | 1A:2693 [C] | E:291 [GLY] | A:3149 [C] | ✔ |
1E:159 [HIS] | 1A:2633 [A] | E:260 [LYS] | A:3108 [U] | ✔ |
1E:159 [HIS] | 1A:2832 [G] | E:260 [LYS] | A:3219 [G] | ✔ |
1E:159 [HIS] | 1A:2833 [A] | E:260 [LYS] | A:3220 [A] | ✔ |
1E:159 [HIS] | 1A:2835 [C] | E:260 [LYS] | A:3222 [C] | ✔ |
1E:162 [ALA] | 1A:2831 [A] | E:263 [ASN] | A:3218 [A] | ✔ |
1E:162 [ALA] | 1A:2832 [G] | E:263 [ASN] | A:3219 [G] | ✔ |
1E:62 [PRO] | 1A:2821 [G] | E:160 [SER] | A:3208 [C] | ✔ |
1E:142 [GLY] | 1A:2074 [G] | E:244 [ALA] | A:2715 [A] | ✔ |
1E:142 [GLY] | 1A:2586 [G] | E:244 [ALA] | A:3061 [G] | ✔ |
1E:142 [GLY] | 1A:2587 [C] | E:244 [ALA] | A:3062 [U] | ✔ |
1E:124 [GLY] | 1A:2523 [U] | E:226 [GLY] | A:2998 [U] | ✔ |
1E:124 [GLY] | 1A:2524 [C] | E:226 [GLY] | A:2999 [C] | ✔ |
1E:147 [PRO] | 1A:1176 [U] | E:248 [ILE] | A:2233 [U] | ✔ |
1E:147 [PRO] | 1A:2047 [C] | E:248 [ILE] | A:2688 [C] | ✔ |
1E:147 [PRO] | 1A:2074 [G] | E:248 [ILE] | A:2715 [A] | ✔ |
1E:140 [SER] | 1A:2074 [G] | E:242 [ALA] | A:2715 [A] | ✔ |
1E:140 [SER] | 1A:2523 [U] | E:242 [ALA] | A:2998 [U] | ✔ |
1E:140 [SER] | 1A:2524 [C] | E:242 [ALA] | A:2999 [C] | ✔ |
1E:140 [SER] | 1A:2586 [G] | E:242 [ALA] | A:3061 [G] | ✔ |
1E:140 [SER] | 1A:2587 [C] | E:242 [ALA] | A:3062 [U] | ✔ |
1E:140 [SER] | 1A:2590 [G] | E:242 [ALA] | A:3065 [U] | ✔ |
1E:113 [PHE] | 1A:1701 [A] | E:215 [PHE] | A:2458 [A] | ✔ |
1E:113 [PHE] | 1A:1702 [A] | E:215 [PHE] | A:2459 [A] | ✔ |
1E:113 [PHE] | 1A:2070 [G] | E:215 [PHE] | A:2711 [A] | ✔ |
1E:113 [PHE] | 1A:2071 [G] | E:215 [PHE] | A:2712 [G] | ✔ |
1E:113 [PHE] | 1A:2832 [G] | E:215 [PHE] | A:3219 [G] | ✔ |
1E:113 [PHE] | 1A:2833 [A] | E:215 [PHE] | A:3220 [A] | ✔ |
1E:135 [HIS] | 1A:1704 [C] | E:237 [HIS] | A:2461 [A] | ✔ |
1E:135 [HIS] | 1A:1705 [C] | E:237 [HIS] | A:2462 [A] | ✔ |
1E:22 [PRO] | 1A:2694 [U] | E:118 [VAL] | A:3150 [U] | ✔ |
1E:22 [PRO] | 1A:2741 [U] | E:118 [VAL] | A:3164 [C] | ✔ |
1E:13 [ARG] | 1A:2694 [U] | E:108 [PRO] | A:3150 [U] | ✔ |
1E:12 [THR] | 1A:2694 [U] | E:107 [MET] | A:3150 [U] | ✔ |
1E:150 [VAL] | 1A:2074 [G] | E:251 [VAL] | A:2715 [A] | ✔ |
1E:150 [VAL] | 1A:2630 [G] | E:251 [VAL] | A:3105 [A] | ✔ |
1E:150 [VAL] | 1A:2631 [C] | E:251 [VAL] | A:3106 [C] | ✔ |
1E:192 [ASN] | 1A:2693 [C] | E:293 [LYS] | A:3149 [C] | ✔ |
1E:192 [ASN] | 1A:2830 [A] | E:293 [LYS] | A:3217 [A] | ✔ |
1E:187 [ALA] | 1A:2691 [A] | E:288 [SER] | A:3147 [G] | ✔ |
1E:187 [ALA] | 1A:2692 [C] | E:288 [SER] | A:3148 [C] | ✔ |
1E:187 [ALA] | 1A:2741 [U] | E:288 [SER] | A:3164 [C] | ✔ |
1E:187 [ALA] | 1A:2742 [G] | E:288 [SER] | A:3165 [C] | ✔ |
1E:123 [ALA] | 1A:2019 [G] | E:225 [LYS] | A:2660 [U] | ✔ |
1E:123 [ALA] | 1A:2523 [U] | E:225 [LYS] | A:2998 [U] | ✔ |
1E:123 [ALA] | 1A:2524 [C] | E:225 [LYS] | A:2999 [C] | ✔ |
1E:202 [LYS] | 1A:2746 [A] | E:303 [LYS] | A:3168 [C] | ✔ |
1E:202 [LYS] | 1A:2784 [C] | E:303 [LYS] | A:3202 [U] | ✔ |
1E:202 [LYS] | 1A:2785 [C] | E:303 [LYS] | A:3203 [A] | ✔ |
1E:119 [ARG] | 1A:2632 [C] | E:221 [ARG] | A:3107 [U] | ✔ |
1E:119 [ARG] | 1A:2633 [A] | E:221 [ARG] | A:3108 [U] | ✔ |
1E:160 [TYR] | 1A:2832 [G] | E:261 [MET] | A:3219 [G] | ✔ |
1E:144 [ARG] | 1A:2074 [G] | E:246 [GLY] | A:2715 [A] | ✔ |
1E:144 [ARG] | 1A:2075 [G] | E:246 [GLY] | A:2716 [G] | ✔ |
1E:144 [ARG] | 1A:2584 [A] | E:246 [GLY] | A:3059 [A] | ✔ |
1E:144 [ARG] | 1A:2586 [G] | E:246 [GLY] | A:3061 [G] | ✔ |
1E:144 [ARG] | 1A:2587 [C] | E:246 [GLY] | A:3062 [U] | ✔ |
1E:128 [SER] | 1A:1722 [C] | E:230 [THR] | A:2479 [C] | ✔ |
1E:128 [SER] | 1A:1723 [A] | E:230 [THR] | A:2480 [A] | ✔ |
1E:128 [SER] | 1A:2015 [U] | E:230 [THR] | A:2656 [U] | ✔ |
1E:128 [SER] | 1A:2016 [C] | E:230 [THR] | A:2657 [C] | ✔ |
1E:165 [VAL] | 1A:2690 [C] | E:266 [ARG] | A:3146 [G] | ✔ |
1E:165 [VAL] | 1A:2691 [A] | E:266 [ARG] | A:3147 [G] | ✔ |
1E:60 [ASN] | 1A:2822 [G] | E:158 [ALA] | A:3209 [A] | ✔ |
1E:114 [ALA] | 1A:1701 [A] | E:216 [GLN] | A:2458 [A] | ✔ |
1E:114 [ALA] | 1A:1702 [A] | E:216 [GLN] | A:2459 [A] | ✔ |
1E:55 [ASN] | 1A:2844 [G] | E:153 [SER] | A:3228 [U] | ✔ |
1E:76 [ARG] | 1A:2839 [C] | E:173 [LYS] | A:3226 [G] | ❌ 7OF0_E_A |
1E:76 [ARG] | 1A:2840 [G] | E:173 [LYS] | A:3227 [U] | ❌ 7OF0_E_A |
1E:121 [ASN] | 1A:2689 [G] | E:223 [GLY] | A:3145 [A] | ❌ 7OF0_E_A |
1E:121 [ASN] | 1A:2690 [C] | E:223 [GLY] | A:3146 [G] | ❌ 7OF0_E_A |
1E:117 [MET] | 1A:1703 [C] | E:219 [MET] | A:2460 [A] | ❌ 7OF0_E_A |
1E:132 [HIS] | 1A:792 [G] | E:234 [THR] | A:1955 [G] | ❌ 7OF0_E_A |
1E:132 [HIS] | 1A:2624 [C] | E:234 [THR] | A:3099 [C] | ❌ 7OF0_E_A |
1E:111 [ARG] | 1A:2691 [A] | E:213 [LYS] | A:3147 [G] | ❌ 7OF0_E_A |
1E:143 [ASN] | 1A:2075 [G] | E:245 [THR] | A:2716 [G] | ❌ 7OF0_E_A |
1E:151 [TYR] | 1A:2525 [G] | E:252 [TRP] | A:3000 [A] | ❌ 7OF0_E_A |
1E:151 [TYR] | 1A:2632 [C] | E:252 [TRP] | A:3107 [U] | ❌ 7OF0_E_A |
1E:141 [ILE] | 1A:2630 [G] | E:243 [VAL] | A:3105 [A] | ❌ 7OF0_E_A |
1E:154 [LYS] | 1A:2524 [C] | E:255 [THR] | A:2999 [C] | ❌ 7OF0_E_A |
1E:154 [LYS] | 1A:2525 [G] | E:255 [THR] | A:3000 [A] | ❌ 7OF0_E_A |
1E:157 [ALA] | 1A:2070 [G] | E:258 [PRO] | A:2711 [A] | ❌ 7OF0_E_A |
1E:157 [ALA] | 1A:2633 [A] | E:258 [PRO] | A:3108 [U] | ❌ 7OF0_E_A |
1E:129 [HIS] | 1A:790 [G] | E:231 [HIS] | A:1953 [A] | ❌ 7OF0_E_A |
1E:163 [GLU] | 1A:2787 [C] | E:264 [ILE] | A:3205 [C] | ❌ 7OF0_E_A |
1E:138 [PRO] | 1A:2524 [C] | E:240 [PRO] | A:2999 [C] | ❌ 7OF0_E_A |
1E:203 [LYS] | 1A:2784 [C] | E:304 [LEU] | A:3202 [U] | ❌ 7OF0_E_A |
1E:186 [GLY] | 1A:2741 [U] | E:287 [GLY] | A:3164 [C] | ❌ 7OF0_E_A |
1E:130 [GLY] | 1A:1722 [C] | E:232 [GLY] | A:2479 [C] | ❌ 7OF0_E_A |
1E:158 [GLY] | 1A:2070 [G] | E:259 [GLY] | A:2711 [A] | ❌ 7OF0_E_A |
1E:168 [MET] | 1A:2784 [C] | E:269 [TYR] | A:3202 [U] | ❌ 7OF0_E_A |
1E:137 [HIS] | 1A:2072 [C] | E:239 [ARG] | A:2713 [C] | ❌ 7OF0_E_A |
1E:142 [GLY] | 1A:2524 [C] | E:244 [ALA] | A:2999 [C] | ❌ 7OF0_E_A |
1E:147 [PRO] | 1A:2583 [C] | E:248 [ILE] | A:3058 [U] | ❌ 7OF0_E_A |
1E:22 [PRO] | 1A:2742 [G] | E:118 [VAL] | A:3165 [C] | ❌ 7OF0_E_A |
1E:13 [ARG] | 1A:2695 [C] | E:108 [PRO] | A:3151 [A] | ❌ 7OF0_E_A |
1E:119 [ARG] | 1A:2690 [C] | E:221 [ARG] | A:3146 [G] | ❌ 7OF0_E_A |
1E:160 [TYR] | 1A:2690 [C] | E:261 [MET] | A:3146 [G] | ❌ 7OF0_E_A |
1E:160 [TYR] | 1A:2691 [A] | E:261 [MET] | A:3147 [G] | ❌ 7OF0_E_A |
1E:165 [VAL] | 1A:2786 [C] | E:266 [ARG] | A:3204 [C] | ❌ 7OF0_E_A |
1E:60 [ASN] | 1A:2821 [G] | E:158 [ALA] | A:3208 [C] | ❌ 7OF0_E_A |
1E:44 [TYR] | 1A:2785 [C] | E:142 [MET] | A:3203 [A] | ❌ 4Y4O_1E_1A |
1E:44 [TYR] | 1A:2784 [C] | E:142 [MET] | A:3202 [U] | ❌ 4Y4O_1E_1A |
1E:54 [GLN] | 1A:2839 [C] | E:152 [VAL] | A:3226 [G] | ❌ 4Y4O_1E_1A |
1E:54 [GLN] | 1A:2844 [G] | E:152 [VAL] | A:3228 [U] | ❌ 4Y4O_1E_1A |
1E:55 [ASN] | 1A:2840 [G] | E:153 [SER] | A:3227 [U] | ❌ 4Y4O_1E_1A |
1E:55 [ASN] | 1A:2839 [C] | E:153 [SER] | A:3226 [G] | ❌ 4Y4O_1E_1A |
1E:57 [LYS] | 1A:2844 [G] | E:155 [PHE] | A:3228 [U] | ❌ 4Y4O_1E_1A |
1E:62 [PRO] | 1A:2822 [G] | E:160 [SER] | A:3209 [A] | ❌ 4Y4O_1E_1A |
1E:62 [PRO] | 1A:2798 [C] | E:160 [SER] | A:3207 [A] | ❌ 4Y4O_1E_1A |
1E:63 [LEU] | 1A:2822 [G] | E:161 [ILE] | A:3209 [A] | ❌ 4Y4O_1E_1A |
1E:63 [LEU] | 1A:2798 [C] | E:161 [ILE] | A:3207 [A] | ❌ 4Y4O_1E_1A |
1E:76 [ARG] | 1A:2798 [C] | E:173 [LYS] | A:3207 [A] | ❌ 4Y4O_1E_1A |
1E:78 [LEU] | 1A:2798 [C] | E:176 [VAL] | A:3207 [A] | ❌ 4Y4O_1E_1A |
1E:79 [ARG] | 1A:2787 [C] | E:177 [LYS] | A:3205 [C] | ❌ 4Y4O_1E_1A |
1E:80 [GLU] | 1A:2786 [C] | E:178 [ILE] | A:3204 [C] | ❌ 4Y4O_1E_1A |
1E:80 [GLU] | 1A:2787 [C] | E:178 [ILE] | A:3205 [C] | ❌ 4Y4O_1E_1A |
1E:82 [ARG] | 1A:2786 [C] | E:180 [ASN] | A:3204 [C] | ❌ 4Y4O_1E_1A |
1E:82 [ARG] | 1A:2785 [C] | E:180 [ASN] | A:3203 [A] | ❌ 4Y4O_1E_1A |
1E:105 [THR] | 1A:2787 [C] | E:207 [THR] | A:3205 [C] | ❌ 4Y4O_1E_1A |
1E:113 [PHE] | 1A:2632 [C] | E:215 [PHE] | A:3107 [U] | ❌ 4Y4O_1E_1A |
1E:120 [TRP] | 1A:2689 [G] | E:222 [TRP] | A:3145 [A] | ❌ 4Y4O_1E_1A |
1E:122 [PHE] | 1A:2523 [U] | E:224 [PHE] | A:2998 [U] | ❌ 4Y4O_1E_1A |
1E:124 [GLY] | 1A:2522 [C] | E:226 [GLY] | A:2997 [A] | ❌ 4Y4O_1E_1A |
1E:125 [GLY] | 1A:2523 [U] | E:227 [GLN] | A:2998 [U] | ❌ 4Y4O_1E_1A |
1E:125 [GLY] | 1A:2590 [G] | E:227 [GLN] | A:3065 [U] | ❌ 4Y4O_1E_1A |
1E:125 [GLY] | 1A:2522 [C] | E:227 [GLN] | A:2997 [A] | ❌ 4Y4O_1E_1A |
1E:126 [PRO] | 1A:2015 [U] | E:228 [PRO] | A:2656 [U] | ❌ 4Y4O_1E_1A |
1E:130 [GLY] | 1A:1720 [U] | E:232 [GLY] | A:2477 [G] | ❌ 4Y4O_1E_1A |
1E:132 [HIS] | 1A:1705 [C] | E:234 [THR] | A:2462 [A] | ❌ 4Y4O_1E_1A |
1E:134 [ILE] | 1A:1705 [C] | E:236 [THR] | A:2462 [A] | ❌ 4Y4O_1E_1A |
1E:135 [HIS] | 1A:1703 [C] | E:237 [HIS] | A:2460 [A] | ❌ 4Y4O_1E_1A |
1E:136 [ARG] | 1A:2019 [G] | E:238 [ARG] | A:2660 [U] | ❌ 4Y4O_1E_1A |
1E:137 [HIS] | 1A:2590 [G] | E:239 [ARG] | A:3065 [U] | ❌ 4Y4O_1E_1A |
1E:138 [PRO] | 1A:2590 [G] | E:240 [PRO] | A:3065 [U] | ❌ 4Y4O_1E_1A |
1E:143 [ASN] | 1A:2526 [U] | E:245 [THR] | A:3001 [G] | ❌ 4Y4O_1E_1A |
1E:146 [THR] | 1A:2586 [G] | E:247 [ASP] | A:3061 [G] | ❌ 4Y4O_1E_1A |
1E:148 [GLY] | 1A:2046 [G] | E:249 [GLY] | A:2687 [C] | ❌ 4Y4O_1E_1A |
1E:151 [TYR] | 1A:2630 [G] | E:252 [TRP] | A:3105 [A] | ❌ 4Y4O_1E_1A |
1E:151 [TYR] | 1A:1176 [U] | E:252 [TRP] | A:2233 [U] | ❌ 4Y4O_1E_1A |
1E:155 [LYS] | 1A:2690 [C] | E:256 [LYS] | A:3146 [G] | ❌ 4Y4O_1E_1A |
1E:157 [ALA] | 1A:2072 [C] | E:258 [PRO] | A:2713 [C] | ❌ 4Y4O_1E_1A |
1E:160 [TYR] | 1A:2633 [A] | E:261 [MET] | A:3108 [U] | ❌ 4Y4O_1E_1A |
1E:161 [GLY] | 1A:2633 [A] | E:262 [GLY] | A:3108 [U] | ❌ 4Y4O_1E_1A |
1E:163 [GLU] | 1A:2691 [A] | E:264 [ILE] | A:3147 [G] | ❌ 4Y4O_1E_1A |
1E:163 [GLU] | 1A:2633 [A] | E:264 [ILE] | A:3108 [U] | ❌ 4Y4O_1E_1A |
1E:165 [VAL] | 1A:2633 [A] | E:266 [ARG] | A:3108 [U] | ❌ 4Y4O_1E_1A |
1E:167 [VAL] | 1A:2690 [C] | E:268 [GLU] | A:3146 [G] | ❌ 4Y4O_1E_1A |
1E:168 [MET] | 1A:2746 [A] | E:269 [TYR] | A:3168 [C] | ❌ 4Y4O_1E_1A |
1E:191 [PRO] | 1A:2692 [C] | E:292 [HIS] | A:3148 [C] | ❌ 4Y4O_1E_1A |
1E:192 [ASN] | 1A:2694 [U] | E:293 [LYS] | A:3150 [U] | ❌ 4Y4O_1E_1A |
1E:199 [ARG] | 1A:2786 [C] | E:300 [LYS] | A:3204 [C] | ❌ 4Y4O_1E_1A |
1E:132 [HIS] | 1A:2623 [U] | E:234 [THR] | A:3098 [U] | ❌ 7OF0_A:3098 no longer at interface |
1E:129 [HIS] | 1A:2593 [G] | E:231 [HIS] | A:3068 [G] | ❌ 7OF0_A:3068 no longer at interface |
1E:109 [LYS] | 1A:2735 [G] | E:211 [ILE] | A:3158 [A] | ❌ 7OF0_A:3158 no longer at interface |
1E:155 [LYS] | 1A:2656 [G] | E:256 [LYS] | A:3112 [A] | ❌ 7OF0_A:3112 no longer at interface |
1E:130 [GLY] | 1A:2593 [G] | E:232 [GLY] | A:3068 [G] | ❌ 7OF0_A:3068 no longer at interface |
1E:146 [THR] | 1A:2054 [G] | E:247 [ASP] | A:2695 [G] | ❌ 7OF0_A:2695 no longer at interface |
1E:144 [ARG] | 1A:2518 [U] | E:246 [GLY] | A:2993 [U] | ❌ 7OF0_A:2993 no longer at interface |
1E:19 [ARG] | 1A:2684 [G] | E:115 [GLN] | A:3140 [A] | ❌ 4Y4O_1E:19, 4Y4O_1A:2684 no longer at interface |
1E:58 [ARG] | 1A:2825 [C] | E:156 [ARG] | A:3212 [C] | ❌ 4Y4O_1A:2825 no longer at interface |
1E:58 [ARG] | 1A:2826 [C] | E:156 [ARG] | A:3213 [A] | ❌ 4Y4O_1A:2826 no longer at interface |
1E:78 [LEU] | 1A:2788 [A] | E:176 [VAL] | A:3206 [C] | ❌ 4Y4O_1A:2788 no longer at interface |
1E:79 [ARG] | 1A:2788 [A] | E:177 [LYS] | A:3206 [C] | ❌ 4Y4O_1A:2788 no longer at interface |
1E:80 [GLU] | 1A:2788 [A] | E:178 [ILE] | A:3206 [C] | ❌ 4Y4O_1A:2788 no longer at interface |
1E:107 [THR] | 1A:2837 [C] | E:209 [LYS] | A:3224 [G] | ❌ 4Y4O_1A:2837 no longer at interface |
1E:123 [ALA] | 1A:2018 [C] | E:225 [LYS] | A:2659 [C] | ❌ 4Y4O_1A:2018 no longer at interface |
1E:123 [ALA] | 1A:2017 [U] | E:225 [LYS] | A:2658 [U] | ❌ 4Y4O_1A:2017 no longer at interface |
1E:131 [ALA] | 1A:2521 [G] | E:233 [GLN] | A:2996 [G] | ❌ 4Y4O_1A:2521 no longer at interface |
1E:137 [HIS] | 1A:2589 [A] | E:239 [ARG] | A:3064 [A] | ❌ 4Y4O_1A:2589 no longer at interface |
1E:148 [GLY] | 1A:2629 [C] | E:249 [GLY] | A:3104 [U] | ❌ 4Y4O_1A:2629 no longer at interface |
1E:149 [ARG] | 1A:1177 [G] | E:250 [ARG] | A:2234 [C] | ❌ 4Y4O_1A:1177 no longer at interface |
1E:151 [TYR] | 1A:1177 [G] | E:252 [TRP] | A:2234 [C] | ❌ 4Y4O_1A:1177 no longer at interface |
1E:152 [LYS] | 1A:2654 [G] | E:253 [PRO] | A:3109 [U] | ❌ 4Y4O_1A:2654 no longer at interface |
1E:153 [GLY] | 1A:2654 [G] | E:254 [GLY] | A:3109 [U] | ❌ 4Y4O_1A:2654 no longer at interface |
1E:159 [HIS] | 1A:2834 [C] | E:260 [LYS] | A:3221 [A] | ❌ 4Y4O_1A:2834 no longer at interface |
1E:164 [ARG] | 1A:2788 [A] | E:265 [TYR] | A:3206 [C] | ❌ 4Y4O_1A:2788 no longer at interface |
1E:202 [LYS] | 1A:2783 [G] | E:303 [LYS] | A:3201 [A] | ❌ 4Y4O_1A:2783 no longer at interface |
1E:35 [GLN] | 1A:2798 [C] | E:131 [LYS] | A:3207 [A] | ❌ 7OF0_E:131 no longer at interface |
1E:61 [ARG] | 1A:2821 [G] | E:159 [THR] | A:3208 [C] | ❌ 7OF0_E:159 no longer at interface |
1E:204 [ALA] | 1A:2746 [A] | E:306 [ALA] | A:3168 [C] | ❌ 7OF0_E:306 no longer at interface |
1E:204 [ALA] | 1A:2747 [A] | E:306 [ALA] | A:3169 [C] | ❌ 7OF0_E:306 no longer at interface |
1E:103 [ASP] | 1A:2785 [C] | E:205 [ASP] | A:3203 [A] | ❌ 7OF0_E:205 no longer at interface |
1E:69 [LYS] | 1A:2798 [C] | E:167 [GLU] | A:3207 [A] | ❌ 7OF0_E:167 no longer at interface |
1E:101 [ARG] | 1A:2743 [C] | E:203 [TYR] | A:3166 [U] | ❌ 7OF0_E:203 no longer at interface |
1E:37 [ARG] | 1A:2798 [C] | E:133 [THR] | A:3207 [A] | ❌ 7OF0_E:133 no longer at interface |
1E:41 [LYS] | 1A:2798 [C] | E:137 [ASN] | A:3207 [A] | ❌ 7OF0_E:137 no longer at interface |
1E:10 [GLY] | 1A:2694 [U] | E:105 [GLY] | A:3150 [U] | ❌ 4Y4O_1E:10 no longer at interface |
1E:20 [ALA] | 1A:2695 [C] | E:116 [LYS] | A:3151 [A] | ❌ 4Y4O_1E:20 no longer at interface |
1E:20 [ALA] | 1A:2694 [U] | E:116 [LYS] | A:3150 [U] | ❌ 4Y4O_1E:20 no longer at interface |
1E:56 [PRO] | 1A:2844 [G] | E:154 [ARG] | A:3228 [U] | ❌ 4Y4O_1E:56 no longer at interface |
1E:59 [VAL] | 1A:2839 [C] | E:157 [LYS] | A:3226 [G] | ❌ 4Y4O_1E:59 no longer at interface |
1E:59 [VAL] | 1A:2798 [C] | E:157 [LYS] | A:3207 [A] | ❌ 4Y4O_1E:59 no longer at interface |
1E:67 [PHE] | 1A:2798 [C] | E:165 [TYR] | A:3207 [A] | ❌ 4Y4O_1E:67 no longer at interface |
1E:77 [ILE] | 1A:2798 [C] | E:175 [THR] | A:3207 [A] | ❌ 4Y4O_1E:77 no longer at interface |
1E:193 [GLY] | 1A:2830 [A] | E:294 [ASN] | A:3217 [A] | ❌ 4Y4O_1E:193 no longer at interface |
1E:197 [ILE] | 1A:2786 [C] | E:298 [LYS] | A:3204 [C] | ❌ 4Y4O_1E:197 no longer at interface |
1E:197 [ILE] | 1A:2787 [C] | E:298 [LYS] | A:3205 [C] | ❌ 4Y4O_1E:197 no longer at interface |
Properties of this pair
Common ECOD label(s) |
Common RFAM label(s) |
Interface TM-score |
Interface RMSD |
Percentage identity |
Protein TM-score |
RNA TM-score |
Protein coverage |
RNA coverage |
Percentage conservation |
Apolar conservation |
H-bond conservation |
Percentage switching out |
---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
Alanine racemase-C | Bacterial large subunit ribosomal RNA | 0.91 | 1.65 | 0.36 | 0.9 | 0.97 | 0.88 | 0.83 | 0.76 | 0.64 | 0.33 | 0.35 |
Other pairs involving 4Y4O_1E_1A or 7OF0_E_A
Total number of entries: 12