RNAprotDB

All interfaces > All interologs > Interface groups > group129 > 4Y4O_1E_1A vs 7RYG_D_A

Interface analysis


mouse controls

Style

Protein

Cartoon
Licorice
Surface

RNA

Cartoon
Licorice
Surface

Color

Structure
Structure (with hetatm)
Chain
Chainbow

View

Focus on

Interface
RNA
Protein
All

Show chains

Interface

show interface as licorice

Common contacts -

4Y4O_1E
4Y4O_1A
7RYG_D
7RYG_A
Conserved?
1E:191 [PRO] 1A:2830 [A] D:199 [ALA] A:2816 [G] ✔
1E:191 [PRO] 1A:2831 [A] D:199 [ALA] A:2817 [A] ✔
1E:164 [ARG] 1A:2786 [C] D:172 [ARG] A:2769 [U] ✔
1E:164 [ARG] 1A:2787 [C] D:172 [ARG] A:2770 [C] ✔
1E:169 [ASN] 1A:2743 [C] D:177 [GLY] A:2726 [C] ✔
1E:169 [ASN] 1A:2744 [G] D:177 [GLY] A:2727 [G] ✔
1E:121 [ASN] 1A:2524 [C] D:129 [ASN] A:2508 [C] ✔
1E:121 [ASN] 1A:2689 [G] D:129 [ASN] A:2673 [G] ✔
1E:121 [ASN] 1A:2690 [C] D:129 [ASN] A:2674 [A] ✔
1E:117 [MET] 1A:1703 [C] D:125 [VAL] A:1654 [C] ✔
1E:117 [MET] 1A:2019 [G] D:125 [VAL] A:1993 [C] ✔
1E:117 [MET] 1A:2020 [G] D:125 [VAL] A:1994 [A] ✔
1E:105 [THR] 1A:2786 [C] D:113 [THR] A:2769 [U] ✔
1E:110 [GLY] 1A:2831 [A] D:118 [GLY] A:2817 [A] ✔
1E:110 [GLY] 1A:2832 [G] D:118 [GLY] A:2818 [G] ✔
1E:11 [MET] 1A:2692 [C] D:12 [MET] A:2676 [C] ✔
1E:11 [MET] 1A:2693 [C] D:12 [MET] A:2677 [C] ✔
1E:11 [MET] 1A:2694 [U] D:12 [MET] A:2678 [U] ✔
1E:188 [VAL] 1A:2691 [A] D:196 [ILE] A:2675 [A] ✔
1E:188 [VAL] 1A:2692 [C] D:196 [ILE] A:2676 [C] ✔
1E:132 [HIS] 1A:790 [G] D:140 [SER] A:741 [U] ✔
1E:132 [HIS] 1A:791 [G] D:140 [SER] A:742 [C] ✔
1E:132 [HIS] 1A:2591 [C] D:140 [SER] A:2575 [C] ✔
1E:132 [HIS] 1A:2592 [U] D:140 [SER] A:2576 [PSU] ✔
1E:111 [ARG] 1A:1701 [A] D:119 [LYS] A:1652 [A] ✔
1E:111 [ARG] 1A:2692 [C] D:119 [LYS] A:2676 [C] ✔
1E:111 [ARG] 1A:2737 [C] D:119 [LYS] A:2720 [U] ✔
1E:111 [ARG] 1A:2832 [G] D:119 [LYS] A:2818 [G] ✔
1E:143 [ASN] 1A:2074 [G] D:151 [GLN] A:2048 [A] ✔
1E:143 [ASN] 1A:2075 [G] D:151 [GLN] A:2049 [G] ✔
1E:143 [ASN] 1A:2525 [G] D:151 [GLN] A:2509 [A] ✔
1E:143 [ASN] 1A:2583 [C] D:151 [GLN] A:2567 [U] ✔
1E:143 [ASN] 1A:2584 [A] D:151 [GLN] A:2568 [A] ✔
1E:143 [ASN] 1A:2586 [G] D:151 [GLN] A:2570 [G] ✔
1E:143 [ASN] 1A:2587 [C] D:151 [GLN] A:2571 [C] ✔
1E:42 [ASP] 1A:2796 [G] D:44 [ASP] A:2779 [A] ✔
1E:42 [ASP] 1A:2797 [C] D:44 [ASP] A:2780 [U] ✔
1E:189 [PRO] 1A:2691 [A] D:197 [PRO] A:2675 [A] ✔
1E:189 [PRO] 1A:2692 [C] D:197 [PRO] A:2676 [C] ✔
1E:35 [GLN] 1A:2797 [C] D:37 [GLN] A:2780 [U] ✔
1E:35 [GLN] 1A:2798 [C] D:37 [GLN] A:2781 [U] ✔
1E:107 [THR] 1A:2692 [C] D:115 [GLN] A:2676 [C] ✔
1E:115 [GLY] 1A:1702 [A] D:123 [GLY] A:1653 [A] ✔
1E:115 [GLY] 1A:1703 [C] D:123 [GLY] A:1654 [C] ✔
1E:126 [PRO] 1A:2016 [C] D:134 [ASP] A:1990 [C] ✔
1E:151 [TYR] 1A:2526 [U] D:159 [PHE] A:2510 [U] ✔
1E:151 [TYR] 1A:2631 [C] D:159 [PHE] A:2615 [C] ✔
1E:141 [ILE] 1A:2072 [C] D:149 [THR] A:2046 [C] ✔
1E:141 [ILE] 1A:2073 [A] D:149 [THR] A:2047 [U] ✔
1E:141 [ILE] 1A:2074 [G] D:149 [THR] A:2048 [A] ✔
1E:141 [ILE] 1A:2524 [C] D:149 [THR] A:2508 [C] ✔
1E:131 [ALA] 1A:790 [G] D:139 [ASN] A:741 [U] ✔
1E:131 [ALA] 1A:791 [G] D:139 [ASN] A:742 [C] ✔
1E:131 [ALA] 1A:2591 [C] D:139 [ASN] A:2575 [C] ✔
1E:131 [ALA] 1A:2592 [U] D:139 [ASN] A:2576 [PSU] ✔
1E:156 [MET] 1A:2071 [G] D:164 [MET] A:2045 [G] ✔
1E:156 [MET] 1A:2072 [C] D:164 [MET] A:2046 [C] ✔
1E:156 [MET] 1A:2631 [C] D:164 [MET] A:2615 [C] ✔
1E:156 [MET] 1A:2632 [C] D:164 [MET] A:2616 [C] ✔
1E:66 [HIS] 1A:2798 [C] D:68 [HIS] A:2781 [U] ✔
1E:66 [HIS] 1A:2799 [U] D:68 [HIS] A:2782 [U] ✔
1E:154 [LYS] 1A:2524 [C] D:162 [LYS] A:2508 [C] ✔
1E:154 [LYS] 1A:2525 [G] D:162 [LYS] A:2509 [A] ✔
1E:154 [LYS] 1A:2631 [C] D:162 [LYS] A:2615 [C] ✔
1E:154 [LYS] 1A:2632 [C] D:162 [LYS] A:2616 [C] ✔
1E:65 [GLY] 1A:2799 [U] D:67 [GLY] A:2782 [U] ✔
1E:65 [GLY] 1A:2800 [C] D:67 [GLY] A:2783 [C] ✔
1E:157 [ALA] 1A:1702 [A] D:165 [ALA] A:1653 [A] ✔
1E:157 [ALA] 1A:2070 [G] D:165 [ALA] A:2044 [G] ✔
1E:157 [ALA] 1A:2071 [G] D:165 [ALA] A:2045 [G] ✔
1E:157 [ALA] 1A:2632 [C] D:165 [ALA] A:2616 [C] ✔
1E:157 [ALA] 1A:2633 [A] D:165 [ALA] A:2617 [G] ✔
1E:129 [HIS] 1A:1717 [C] D:137 [HIS] A:1668 [C] ✔
1E:129 [HIS] 1A:1718 [U] D:137 [HIS] A:1669 [U] ✔
1E:129 [HIS] 1A:1720 [U] D:137 [HIS] A:1671 [G] ✔
1E:129 [HIS] 1A:1722 [C] D:137 [HIS] A:1673 [C] ✔
1E:129 [HIS] 1A:2015 [U] D:137 [HIS] A:1989 [U] ✔
1E:129 [HIS] 1A:2592 [U] D:137 [HIS] A:2576 [PSU] ✔
1E:129 [HIS] 1A:2593 [G] D:137 [HIS] A:2577 [G] ✔
1E:108 [SER] 1A:2691 [A] D:116 [SER] A:2675 [A] ✔
1E:108 [SER] 1A:2692 [C] D:116 [SER] A:2676 [C] ✔
1E:152 [LYS] 1A:2631 [C] D:160 [LYS] A:2615 [C] ✔
1E:152 [LYS] 1A:2632 [C] D:160 [LYS] A:2616 [C] ✔
1E:139 [GLY] 1A:2073 [A] D:147 [GLY] A:2047 [U] ✔
1E:139 [GLY] 1A:2074 [G] D:147 [GLY] A:2048 [A] ✔
1E:139 [GLY] 1A:2523 [U] D:147 [GLY] A:2507 [U] ✔
1E:139 [GLY] 1A:2590 [G] D:147 [GLY] A:2574 [G] ✔
1E:138 [PRO] 1A:2072 [C] D:146 [LEU] A:2046 [C] ✔
1E:138 [PRO] 1A:2523 [U] D:146 [LEU] A:2507 [U] ✔
1E:138 [PRO] 1A:2524 [C] D:146 [LEU] A:2508 [C] ✔
1E:203 [LYS] 1A:2744 [G] D:211 [LYS] A:2727 [G] ✔
1E:203 [LYS] 1A:2745 [G] D:211 [LYS] A:2728 [G] ✔
1E:203 [LYS] 1A:2746 [A] D:211 [LYS] A:2729 [A] ✔
1E:203 [LYS] 1A:2784 [C] D:211 [LYS] A:2767 [C] ✔
1E:48 [GLN] 1A:2647 [C] D:50 [GLN] A:2631 [U] ✔
1E:54 [GLN] 1A:2840 [G] D:56 [ARG] A:2826 [C] ✔
1E:148 [GLY] 1A:2074 [G] D:156 [GLY] A:2048 [A] ✔
1E:148 [GLY] 1A:2075 [G] D:156 [GLY] A:2049 [G] ✔
1E:109 [LYS] 1A:2692 [C] D:117 [LYS] A:2676 [C] ✔
1E:109 [LYS] 1A:2693 [C] D:117 [LYS] A:2677 [C] ✔
1E:109 [LYS] 1A:2735 [G] D:117 [LYS] A:2718 [G] ✔
1E:109 [LYS] 1A:2736 [C] D:117 [LYS] A:2719 [C] ✔
1E:109 [LYS] 1A:2830 [A] D:117 [LYS] A:2816 [G] ✔
1E:109 [LYS] 1A:2831 [A] D:117 [LYS] A:2817 [A] ✔
1E:170 [LEU] 1A:2742 [G] D:178 [LEU] A:2725 [U] ✔
1E:170 [LEU] 1A:2743 [C] D:178 [LEU] A:2726 [C] ✔
1E:63 [LEU] 1A:2645 [G] D:65 [GLN] A:2629 [A] ✔
1E:63 [LEU] 1A:2646 [G] D:65 [GLN] A:2630 [A] ✔
1E:63 [LEU] 1A:2799 [U] D:65 [GLN] A:2782 [U] ✔
1E:145 [LYS] 1A:597 [C] D:153 [GLN] A:572 [A] ✔
1E:145 [LYS] 1A:2054 [G] D:153 [GLN] A:2028 [G] ✔
1E:145 [LYS] 1A:2075 [G] D:153 [GLN] A:2049 [G] ✔
1E:145 [LYS] 1A:2584 [A] D:153 [GLN] A:2568 [A] ✔
1E:186 [GLY] 1A:2742 [G] D:194 [GLY] A:2725 [U] ✔
1E:58 [ARG] 1A:2840 [G] D:60 [ARG] A:2826 [C] ✔
1E:58 [ARG] 1A:2841 [G] D:60 [ARG] A:2827 [G] ✔
1E:61 [ARG] 1A:2799 [U] D:63 [ASN] A:2782 [U] ✔
1E:61 [ARG] 1A:2800 [C] D:63 [ASN] A:2783 [C] ✔
1E:61 [ARG] 1A:2801 [C] D:63 [ASN] A:2784 [C] ✔
1E:61 [ARG] 1A:2820 [A] D:63 [ASN] A:2806 [A] ✔
1E:61 [ARG] 1A:2821 [G] D:63 [ASN] A:2807 [G] ✔
1E:112 [GLY] 1A:1701 [A] D:120 [GLY] A:1652 [A] ✔
1E:112 [GLY] 1A:2832 [G] D:120 [GLY] A:2818 [G] ✔
1E:112 [GLY] 1A:2833 [A] D:120 [GLY] A:2819 [A] ✔
1E:136 [ARG] 1A:1703 [C] D:144 [ARG] A:1654 [C] ✔
1E:136 [ARG] 1A:1704 [C] D:144 [ARG] A:1655 [U] ✔
1E:136 [ARG] 1A:2020 [G] D:144 [ARG] A:1994 [A] ✔
1E:155 [LYS] 1A:2525 [G] D:163 [LYS] A:2509 [A] ✔
1E:130 [GLY] 1A:790 [G] D:138 [GLY] A:741 [U] ✔
1E:130 [GLY] 1A:2591 [C] D:138 [GLY] A:2575 [C] ✔
1E:130 [GLY] 1A:2592 [U] D:138 [GLY] A:2576 [PSU] ✔
1E:130 [GLY] 1A:2593 [G] D:138 [GLY] A:2577 [G] ✔
1E:125 [GLY] 1A:2016 [C] D:133 [GLN] A:1990 [C] ✔
1E:158 [GLY] 1A:2632 [C] D:166 [GLY] A:2616 [C] ✔
1E:158 [GLY] 1A:2633 [A] D:166 [GLY] A:2617 [G] ✔
1E:79 [ARG] 1A:2647 [C] D:81 [LYS] A:2631 [U] ✔
1E:79 [ARG] 1A:2648 [U] D:81 [LYS] A:2632 [U] ✔
1E:204 [ALA] 1A:2746 [A] D:212 [ALA] A:2729 [A] ✔
1E:204 [ALA] 1A:2747 [A] D:212 [ALA] A:2730 [A] ✔
1E:166 [THR] 1A:2785 [C] D:174 [THR] A:2768 [C] ✔
1E:166 [THR] 1A:2786 [C] D:174 [THR] A:2769 [U] ✔
1E:8 [LYS] 1A:2692 [C] D:9 [LYS] A:2676 [C] ✔
1E:8 [LYS] 1A:2693 [C] D:9 [LYS] A:2677 [C] ✔
1E:168 [MET] 1A:2743 [C] D:176 [GLN] A:2726 [C] ✔
1E:168 [MET] 1A:2744 [G] D:176 [GLN] A:2727 [G] ✔
1E:168 [MET] 1A:2784 [C] D:176 [GLN] A:2767 [C] ✔
1E:168 [MET] 1A:2785 [C] D:176 [GLN] A:2768 [C] ✔
1E:149 [ARG] 1A:1176 [U] D:157 [ARG] A:1127 [U] ✔
1E:149 [ARG] 1A:2046 [G] D:157 [ARG] A:2020 [G] ✔
1E:149 [ARG] 1A:2047 [C] D:157 [ARG] A:2021 [C] ✔
1E:149 [ARG] 1A:2074 [G] D:157 [ARG] A:2048 [A] ✔
1E:149 [ARG] 1A:2075 [G] D:157 [ARG] A:2049 [G] ✔
1E:149 [ARG] 1A:2630 [G] D:157 [ARG] A:2614 [A] ✔
1E:146 [THR] 1A:1176 [U] D:154 [THR] A:1127 [U] ✔
1E:146 [THR] 1A:2054 [G] D:154 [THR] A:2028 [G] ✔
1E:146 [THR] 1A:2583 [C] D:154 [THR] A:2567 [U] ✔
1E:146 [THR] 1A:2584 [A] D:154 [THR] A:2568 [A] ✔
1E:118 [LYS] 1A:2736 [C] D:126 [LYS] A:2719 [C] ✔
1E:118 [LYS] 1A:2737 [C] D:126 [LYS] A:2720 [U] ✔
1E:127 [ASP] 1A:2015 [U] D:135 [ALA] A:1989 [U] ✔
1E:127 [ASP] 1A:2016 [C] D:135 [ALA] A:1990 [C] ✔
1E:137 [HIS] 1A:1703 [C] D:145 [VAL] A:1654 [C] ✔
1E:137 [HIS] 1A:1704 [C] D:145 [VAL] A:1655 [U] ✔
1E:137 [HIS] 1A:2073 [A] D:145 [VAL] A:2047 [U] ✔
1E:137 [HIS] 1A:2523 [U] D:145 [VAL] A:2507 [U] ✔
1E:133 [LYS] 1A:791 [G] D:141 [VAL] A:742 [C] ✔
1E:133 [LYS] 1A:1704 [C] D:141 [VAL] A:1655 [U] ✔
1E:133 [LYS] 1A:1705 [C] D:141 [VAL] A:1656 [C] ✔
1E:122 [PHE] 1A:2019 [G] D:130 [PHE] A:1993 [C] ✔
1E:122 [PHE] 1A:2524 [C] D:130 [PHE] A:2508 [C] ✔
1E:122 [PHE] 1A:2525 [G] D:130 [PHE] A:2509 [A] ✔
1E:78 [LEU] 1A:2646 [G] D:80 [VAL] A:2630 [A] ✔
1E:78 [LEU] 1A:2647 [C] D:80 [VAL] A:2631 [U] ✔
1E:78 [LEU] 1A:2648 [U] D:80 [VAL] A:2632 [U] ✔
1E:185 [LYS] 1A:2742 [G] D:193 [LYS] A:2725 [U] ✔
1E:185 [LYS] 1A:2743 [C] D:193 [LYS] A:2726 [C] ✔
1E:44 [TYR] 1A:2648 [U] D:46 [TYR] A:2632 [U] ✔
1E:44 [TYR] 1A:2649 [U] D:46 [TYR] A:2633 [U] ✔
1E:153 [GLY] 1A:2631 [C] D:161 [GLY] A:2615 [C] ✔
1E:153 [GLY] 1A:2632 [C] D:161 [GLY] A:2616 [C] ✔
1E:134 [ILE] 1A:1704 [C] D:142 [SER] A:1655 [U] ✔
1E:134 [ILE] 1A:2590 [G] D:142 [SER] A:2574 [G] ✔
1E:134 [ILE] 1A:2591 [C] D:142 [SER] A:2575 [C] ✔
1E:167 [VAL] 1A:2691 [A] D:175 [VAL] A:2675 [A] ✔
1E:167 [VAL] 1A:2743 [C] D:175 [VAL] A:2726 [C] ✔
1E:190 [GLY] 1A:2691 [A] D:198 [GLY] A:2675 [A] ✔
1E:190 [GLY] 1A:2692 [C] D:198 [GLY] A:2676 [C] ✔
1E:190 [GLY] 1A:2693 [C] D:198 [GLY] A:2677 [C] ✔
1E:159 [HIS] 1A:2633 [A] D:167 [HIS] A:2617 [G] ✔
1E:159 [HIS] 1A:2634 [C] D:167 [HIS] A:2618 [U] ✔
1E:159 [HIS] 1A:2832 [G] D:167 [HIS] A:2818 [G] ✔
1E:162 [ALA] 1A:2831 [A] D:170 [ASP] A:2817 [A] ✔
1E:162 [ALA] 1A:2832 [G] D:170 [ASP] A:2818 [G] ✔
1E:62 [PRO] 1A:2644 [A] D:64 [ALA] A:2628 [A] ✔
1E:62 [PRO] 1A:2645 [G] D:64 [ALA] A:2629 [A] ✔
1E:62 [PRO] 1A:2799 [U] D:64 [ALA] A:2782 [U] ✔
1E:62 [PRO] 1A:2800 [C] D:64 [ALA] A:2783 [C] ✔
1E:142 [GLY] 1A:2074 [G] D:150 [GLY] A:2048 [A] ✔
1E:142 [GLY] 1A:2586 [G] D:150 [GLY] A:2570 [G] ✔
1E:142 [GLY] 1A:2587 [C] D:150 [GLY] A:2571 [C] ✔
1E:69 [LYS] 1A:2798 [C] D:71 [LYS] A:2781 [U] ✔
1E:69 [LYS] 1A:2799 [U] D:71 [LYS] A:2782 [U] ✔
1E:124 [GLY] 1A:2523 [U] D:132 [THR] A:2507 [U] ✔
1E:147 [PRO] 1A:1176 [U] D:155 [PRO] A:1127 [U] ✔
1E:147 [PRO] 1A:2047 [C] D:155 [PRO] A:2021 [C] ✔
1E:147 [PRO] 1A:2583 [C] D:155 [PRO] A:2567 [U] ✔
1E:140 [SER] 1A:2074 [G] D:148 [SER] A:2048 [A] ✔
1E:140 [SER] 1A:2523 [U] D:148 [SER] A:2507 [U] ✔
1E:140 [SER] 1A:2524 [C] D:148 [SER] A:2508 [C] ✔
1E:140 [SER] 1A:2586 [G] D:148 [SER] A:2570 [G] ✔
1E:140 [SER] 1A:2587 [C] D:148 [SER] A:2571 [C] ✔
1E:140 [SER] 1A:2590 [G] D:148 [SER] A:2574 [G] ✔
1E:113 [PHE] 1A:1701 [A] D:121 [PHE] A:1652 [A] ✔
1E:113 [PHE] 1A:1702 [A] D:121 [PHE] A:1653 [A] ✔
1E:113 [PHE] 1A:2070 [G] D:121 [PHE] A:2044 [G] ✔
1E:113 [PHE] 1A:2071 [G] D:121 [PHE] A:2045 [G] ✔
1E:113 [PHE] 1A:2832 [G] D:121 [PHE] A:2818 [G] ✔
1E:113 [PHE] 1A:2833 [A] D:121 [PHE] A:2819 [A] ✔
1E:135 [HIS] 1A:1704 [C] D:143 [HIS] A:1655 [U] ✔
1E:135 [HIS] 1A:1705 [C] D:143 [HIS] A:1656 [C] ✔
1E:22 [PRO] 1A:2694 [U] D:24 [PRO] A:2678 [U] ✔
1E:22 [PRO] 1A:2741 [U] D:24 [PRO] A:2724 [U] ✔
1E:22 [PRO] 1A:2742 [G] D:24 [PRO] A:2725 [U] ✔
1E:13 [ARG] 1A:2694 [U] D:14 [ARG] A:2678 [U] ✔
1E:13 [ARG] 1A:2695 [C] D:14 [ARG] A:2679 [C] ✔
1E:12 [THR] 1A:2694 [U] D:13 [THR] A:2678 [U] ✔
1E:37 [ARG] 1A:2647 [C] D:39 [LYS] A:2631 [U] ✔
1E:37 [ARG] 1A:2797 [C] D:39 [LYS] A:2780 [U] ✔
1E:150 [VAL] 1A:2074 [G] D:158 [VAL] A:2048 [A] ✔
1E:150 [VAL] 1A:2630 [G] D:158 [VAL] A:2614 [A] ✔
1E:150 [VAL] 1A:2631 [C] D:158 [VAL] A:2615 [C] ✔
1E:192 [ASN] 1A:2830 [A] D:200 [THR] A:2816 [G] ✔
1E:187 [ALA] 1A:2691 [A] D:195 [ALA] A:2675 [A] ✔
1E:187 [ALA] 1A:2692 [C] D:195 [ALA] A:2676 [C] ✔
1E:187 [ALA] 1A:2742 [G] D:195 [ALA] A:2725 [U] ✔
1E:123 [ALA] 1A:2019 [G] D:131 [ARG] A:1993 [C] ✔
1E:123 [ALA] 1A:2523 [U] D:131 [ARG] A:2507 [U] ✔
1E:123 [ALA] 1A:2524 [C] D:131 [ARG] A:2508 [C] ✔
1E:202 [LYS] 1A:2784 [C] D:210 [ILE] A:2767 [C] ✔
1E:202 [LYS] 1A:2785 [C] D:210 [ILE] A:2768 [C] ✔
1E:82 [ARG] 1A:2649 [U] D:84 [ARG] A:2633 [U] ✔
1E:82 [ARG] 1A:2650 [G] D:84 [ARG] A:2634 [G] ✔
1E:119 [ARG] 1A:2632 [C] D:127 [ARG] A:2616 [C] ✔
1E:119 [ARG] 1A:2633 [A] D:127 [ARG] A:2617 [G] ✔
1E:119 [ARG] 1A:2690 [C] D:127 [ARG] A:2674 [A] ✔
1E:160 [TYR] 1A:2691 [A] D:168 [LEU] A:2675 [A] ✔
1E:160 [TYR] 1A:2832 [G] D:168 [LEU] A:2818 [G] ✔
1E:144 [ARG] 1A:2074 [G] D:152 [ASN] A:2048 [A] ✔
1E:144 [ARG] 1A:2075 [G] D:152 [ASN] A:2049 [G] ✔
1E:144 [ARG] 1A:2584 [A] D:152 [ASN] A:2568 [A] ✔
1E:144 [ARG] 1A:2586 [G] D:152 [ASN] A:2570 [G] ✔
1E:144 [ARG] 1A:2587 [C] D:152 [ASN] A:2571 [C] ✔
1E:80 [GLU] 1A:2647 [C] D:82 [GLU] A:2631 [U] ✔
1E:80 [GLU] 1A:2648 [U] D:82 [GLU] A:2632 [U] ✔
1E:128 [SER] 1A:1722 [C] D:136 [THR] A:1673 [C] ✔
1E:128 [SER] 1A:1723 [A] D:136 [THR] A:1674 [A] ✔
1E:128 [SER] 1A:2015 [U] D:136 [THR] A:1989 [U] ✔
1E:128 [SER] 1A:2016 [C] D:136 [THR] A:1990 [C] ✔
1E:165 [VAL] 1A:2690 [C] D:173 [VAL] A:2674 [A] ✔
1E:165 [VAL] 1A:2691 [A] D:173 [VAL] A:2675 [A] ✔
1E:165 [VAL] 1A:2786 [C] D:173 [VAL] A:2769 [U] ✔
1E:41 [LYS] 1A:2796 [G] D:43 [THR] A:2779 [A] ✔
1E:41 [LYS] 1A:2797 [C] D:43 [THR] A:2780 [U] ✔
1E:41 [LYS] 1A:2798 [C] D:43 [THR] A:2781 [U] ✔
1E:60 [ASN] 1A:2645 [G] D:62 [THR] A:2629 [A] ✔
1E:60 [ASN] 1A:2821 [G] D:62 [THR] A:2807 [G] ✔
1E:60 [ASN] 1A:2822 [G] D:62 [THR] A:2808 [A] ✔
1E:114 [ALA] 1A:1701 [A] D:122 [GLN] A:1652 [A] ✔
1E:114 [ALA] 1A:1702 [A] D:122 [GLN] A:1653 [A] ✔
1E:55 [ASN] 1A:2844 [G] D:57 [ARG] A:2830 [G] ✔
1E:191 [PRO] 1A:2693 [C] D:199 [ALA] A:2677 [C] ❌ 7RYG_D_A
1E:110 [GLY] 1A:2830 [A] D:118 [GLY] A:2816 [G] ❌ 7RYG_D_A
1E:111 [ARG] 1A:2691 [A] D:119 [LYS] A:2675 [A] ❌ 7RYG_D_A
1E:111 [ARG] 1A:2831 [A] D:119 [LYS] A:2817 [A] ❌ 7RYG_D_A
1E:35 [GLN] 1A:2646 [G] D:37 [GLN] A:2630 [A] ❌ 7RYG_D_A
1E:126 [PRO] 1A:2522 [C] D:134 [ASP] A:2506 [C] ❌ 7RYG_D_A
1E:151 [TYR] 1A:2525 [G] D:159 [PHE] A:2509 [A] ❌ 7RYG_D_A
1E:151 [TYR] 1A:2632 [C] D:159 [PHE] A:2616 [C] ❌ 7RYG_D_A
1E:141 [ILE] 1A:2630 [G] D:149 [THR] A:2614 [A] ❌ 7RYG_D_A
1E:156 [MET] 1A:2630 [G] D:164 [MET] A:2614 [A] ❌ 7RYG_D_A
1E:66 [HIS] 1A:2645 [G] D:68 [HIS] A:2629 [A] ❌ 7RYG_D_A
1E:129 [HIS] 1A:790 [G] D:137 [HIS] A:741 [U] ❌ 7RYG_D_A
1E:108 [SER] 1A:2831 [A] D:116 [SER] A:2817 [A] ❌ 7RYG_D_A
1E:139 [GLY] 1A:2524 [C] D:147 [GLY] A:2508 [C] ❌ 7RYG_D_A
1E:138 [PRO] 1A:2073 [A] D:146 [LEU] A:2047 [U] ❌ 7RYG_D_A
1E:109 [LYS] 1A:2691 [A] D:117 [LYS] A:2675 [A] ❌ 7RYG_D_A
1E:186 [GLY] 1A:2741 [U] D:194 [GLY] A:2724 [U] ❌ 7RYG_D_A
1E:58 [ARG] 1A:2844 [G] D:60 [ARG] A:2830 [G] ❌ 7RYG_D_A
1E:58 [ARG] 1A:2845 [A] D:60 [ARG] A:2831 [A] ❌ 7RYG_D_A
1E:130 [GLY] 1A:1722 [C] D:138 [GLY] A:1673 [C] ❌ 7RYG_D_A
1E:158 [GLY] 1A:2070 [G] D:166 [GLY] A:2044 [G] ❌ 7RYG_D_A
1E:118 [LYS] 1A:2020 [G] D:126 [LYS] A:1994 [A] ❌ 7RYG_D_A
1E:137 [HIS] 1A:2072 [C] D:145 [VAL] A:2046 [C] ❌ 7RYG_D_A
1E:167 [VAL] 1A:2742 [G] D:175 [VAL] A:2725 [U] ❌ 7RYG_D_A
1E:159 [HIS] 1A:2833 [A] D:167 [HIS] A:2819 [A] ❌ 7RYG_D_A
1E:62 [PRO] 1A:2820 [A] D:64 [ALA] A:2806 [A] ❌ 7RYG_D_A
1E:62 [PRO] 1A:2821 [G] D:64 [ALA] A:2807 [G] ❌ 7RYG_D_A
1E:142 [GLY] 1A:2524 [C] D:150 [GLY] A:2508 [C] ❌ 7RYG_D_A
1E:124 [GLY] 1A:2524 [C] D:132 [THR] A:2508 [C] ❌ 7RYG_D_A
1E:147 [PRO] 1A:2074 [G] D:155 [PRO] A:2048 [A] ❌ 7RYG_D_A
1E:37 [ARG] 1A:2646 [G] D:39 [LYS] A:2630 [A] ❌ 7RYG_D_A
1E:37 [ARG] 1A:2796 [G] D:39 [LYS] A:2779 [A] ❌ 7RYG_D_A
1E:37 [ARG] 1A:2798 [C] D:39 [LYS] A:2781 [U] ❌ 7RYG_D_A
1E:192 [ASN] 1A:2693 [C] D:200 [THR] A:2677 [C] ❌ 7RYG_D_A
1E:187 [ALA] 1A:2741 [U] D:195 [ALA] A:2724 [U] ❌ 7RYG_D_A
1E:202 [LYS] 1A:2746 [A] D:210 [ILE] A:2729 [A] ❌ 7RYG_D_A
1E:160 [TYR] 1A:2690 [C] D:168 [LEU] A:2674 [A] ❌ 7RYG_D_A
1E:80 [GLU] 1A:2649 [U] D:82 [GLU] A:2633 [U] ❌ 7RYG_D_A
1E:111 [ARG] 1A:2736 [C] D:119 [LYS] A:2719 [C] ❌ 4Y4O_1E_1A
1E:124 [GLY] 1A:2019 [G] D:132 [THR] A:1993 [C] ❌ 4Y4O_1E_1A
1E:125 [GLY] 1A:2522 [C] D:133 [GLN] A:2506 [C] ❌ 4Y4O_1E_1A
1E:125 [GLY] 1A:2591 [C] D:133 [GLN] A:2575 [C] ❌ 4Y4O_1E_1A
1E:125 [GLY] 1A:2590 [G] D:133 [GLN] A:2574 [G] ❌ 4Y4O_1E_1A
1E:125 [GLY] 1A:2523 [U] D:133 [GLN] A:2507 [U] ❌ 4Y4O_1E_1A
1E:126 [PRO] 1A:1718 [U] D:134 [ASP] A:1669 [U] ❌ 4Y4O_1E_1A
1E:126 [PRO] 1A:1717 [C] D:134 [ASP] A:1668 [C] ❌ 4Y4O_1E_1A
1E:126 [PRO] 1A:2015 [U] D:134 [ASP] A:1989 [U] ❌ 4Y4O_1E_1A
1E:132 [HIS] 1A:1705 [C] D:140 [SER] A:1656 [C] ❌ 4Y4O_1E_1A
1E:132 [HIS] 1A:1704 [C] D:140 [SER] A:1655 [U] ❌ 4Y4O_1E_1A
1E:137 [HIS] 1A:2590 [G] D:145 [VAL] A:2574 [G] ❌ 4Y4O_1E_1A
1E:143 [ASN] 1A:2526 [U] D:151 [GLN] A:2510 [U] ❌ 4Y4O_1E_1A
1E:145 [LYS] 1A:2074 [G] D:153 [GLN] A:2048 [A] ❌ 4Y4O_1E_1A
1E:151 [TYR] 1A:1176 [U] D:159 [PHE] A:1127 [U] ❌ 4Y4O_1E_1A
1E:151 [TYR] 1A:2630 [G] D:159 [PHE] A:2614 [A] ❌ 4Y4O_1E_1A
1E:159 [HIS] 1A:2831 [A] D:167 [HIS] A:2817 [A] ❌ 4Y4O_1E_1A
1E:164 [ARG] 1A:2785 [C] D:172 [ARG] A:2768 [C] ❌ 4Y4O_1E_1A
1E:37 [ARG] 1A:2648 [U] D:39 [LYS] A:2632 [U] ❌ 4Y4O_1E_1A
1E:54 [GLN] 1A:2839 [C] D:56 [ARG] A:2825 [A] ❌ 4Y4O_1E_1A
1E:55 [ASN] 1A:2841 [G] D:57 [ARG] A:2827 [G] ❌ 4Y4O_1E_1A
1E:55 [ASN] 1A:2845 [A] D:57 [ARG] A:2831 [A] ❌ 4Y4O_1E_1A
1E:55 [ASN] 1A:2840 [G] D:57 [ARG] A:2826 [C] ❌ 4Y4O_1E_1A
1E:57 [LYS] 1A:2841 [G] D:59 [SER] A:2827 [G] ❌ 4Y4O_1E_1A
1E:82 [ARG] 1A:2648 [U] D:84 [ARG] A:2632 [U] ❌ 4Y4O_1E_1A
1E:132 [HIS] 1A:792 [G] D:140 [SER] A:743 [G] ❌ 7RYG_A:743 no longer at interface
1E:132 [HIS] 1A:2623 [U] D:140 [SER] A:2607 [C] ❌ 7RYG_A:2607 no longer at interface
1E:132 [HIS] 1A:2624 [C] D:140 [SER] A:2608 [C] ❌ 7RYG_A:2608 no longer at interface
1E:145 [LYS] 1A:2055 [A] D:153 [GLN] A:2029 [A] ❌ 7RYG_A:2029 no longer at interface
1E:145 [LYS] 1A:2076 [A] D:153 [GLN] A:2050 [A] ❌ 7RYG_A:2050 no longer at interface
1E:145 [LYS] 1A:2077 [C] D:153 [GLN] A:2051 [C] ❌ 7RYG_A:2051 no longer at interface
1E:155 [LYS] 1A:2656 [G] D:163 [LYS] A:2640 [A] ❌ 7RYG_A:2640 no longer at interface
1E:118 [LYS] 1A:2021 [C] D:126 [LYS] A:1995 [G] ❌ 7RYG_A:1995 no longer at interface
1E:133 [LYS] 1A:792 [G] D:141 [VAL] A:743 [G] ❌ 7RYG_A:743 no longer at interface
1E:133 [LYS] 1A:793 [A] D:141 [VAL] A:744 [U] ❌ 7RYG_A:744 no longer at interface
1E:133 [LYS] 1A:2624 [C] D:141 [VAL] A:2608 [C] ❌ 7RYG_A:2608 no longer at interface
1E:57 [LYS] 1A:2843 [G] D:59 [SER] A:2829 [U] ❌ 7RYG_A:2829 no longer at interface
1E:159 [HIS] 1A:2835 [C] D:167 [HIS] A:2821 [U] ❌ 7RYG_A:2821 no longer at interface
1E:144 [ARG] 1A:2516 [U] D:152 [ASN] A:2500 [PSU] ❌ 7RYG_A:2500 no longer at interface
1E:144 [ARG] 1A:2518 [U] D:152 [ASN] A:2502 [U] ❌ 7RYG_A:2502 no longer at interface
1E:55 [ASN] 1A:2843 [G] D:57 [ARG] A:2829 [U] ❌ 7RYG_A:2829 no longer at interface
1E:124 [GLY] 1A:2018 [C] D:132 [THR] A:1992 [C] ❌ 4Y4O_1A:2018 no longer at interface
1E:149 [ARG] 1A:1177 [G] D:157 [ARG] A:1128 [G] ❌ 4Y4O_1A:1177 no longer at interface
1E:76 [ARG] 1A:2839 [C] D:78 [ARG] A:2825 [A] ❌ 7RYG_D:78 no longer at interface
1E:76 [ARG] 1A:2840 [G] D:78 [ARG] A:2826 [C] ❌ 7RYG_D:78 no longer at interface
1E:161 [GLY] 1A:2832 [G] D:169 [GLY] A:2818 [G] ❌ 7RYG_D:169 no longer at interface
1E:64 [LYS] 1A:2799 [U] D:66 [LYS] A:2782 [U] ❌ 7RYG_D:66 no longer at interface
1E:163 [GLU] 1A:2634 [C] D:171 [GLU] A:2618 [U] ❌ 7RYG_D:171 no longer at interface
1E:163 [GLU] 1A:2787 [C] D:171 [GLU] A:2770 [C] ❌ 7RYG_D:171 no longer at interface
1E:120 [TRP] 1A:2633 [A] D:128 [TRP] A:2617 [G] ❌ 7RYG_D:128 no longer at interface
1E:120 [TRP] 1A:2690 [C] D:128 [TRP] A:2674 [A] ❌ 7RYG_D:128 no longer at interface
1E:199 [ARG] 1A:2785 [C] D:207 [ARG] A:2768 [C] ❌ 7RYG_D:207 no longer at interface
1E:116 [VAL] 1A:1702 [A] D:124 [GLY] A:1653 [A] ❌ 7RYG_D:124 no longer at interface
1E:116 [VAL] 1A:1703 [C] D:124 [GLY] A:1654 [C] ❌ 7RYG_D:124 no longer at interface
1E:103 [ASP] 1A:2785 [C] D:111 [ASP] A:2768 [C] ❌ 7RYG_D:111 no longer at interface
1E:101 [ARG] 1A:2743 [C] D:109 [ILE] A:2726 [C] ❌ 7RYG_D:109 no longer at interface
1E:193 [GLY] 1A:2830 [A] D:201 [GLY] A:2816 [G] ❌ 4Y4O_1E:193 no longer at interface
1E:59 [VAL] 1A:2821 [G] D:61 [VAL] A:2807 [G] ❌ 4Y4O_1E:59 no longer at interface

logo_download Export the table of contacts

Properties of this pair

Common ECOD label(s)
 Common RFAM label(s)
 Interface TM-score
 Interface RMSD
 Percentage identity
 Protein TM-score
 RNA TM-score
 Protein coverage
 RNA coverage
 Percentage conservation
 Apolar conservation
 H-bond conservation
 Percentage switching out
Alanine racemase-C Bacterial large subunit ribosomal RNA 0.96 1.71 0.58 0.95 0.96 0.98 0.98 0.89 0.85 0.48 0.34


Other pairs involving 4Y4O_1E_1A or 7RYG_D_A

Total number of entries: 16

Interface 1 Interface 2 Percentage conservation
 		Interface TM-score
 		Interface RMSD
 		Percentage identity
 		Common ECOD label(s)
 		Common RFAM label(s)
 		Explore both interfaces
1YHQ_B_0 4Y4O_1E_1A 0.64 0.9 2.2 0.29 Alanine racemase-C compare
1YHQ_B_0 7RYG_D_A 0.66 0.92 2.66 0.29 Alanine racemase-C compare
6AZ3_B_1 7RYG_D_A 0.73 0.65 1.88 0.29 Alanine racemase-C compare
7K00_d_a 7RYG_D_A 0.95 0.99 1.46 0.76 Alanine racemase-C Bacterial large subunit ribosomal RNA compare
1VQ8_B_0 7RYG_D_A 0.64 0.92 2.83 0.29 Alanine racemase-C compare
1VQ8_B_0 4Y4O_1E_1A 0.64 0.9 2.32 0.29 Alanine racemase-C compare
7OF0_E_A 7RYG_D_A 0.76 0.88 2.28 0.35 Alanine racemase-C Bacterial large subunit ribosomal RNA compare
6S0Z_D_A 7RYG_D_A 0.84 0.98 1.08 0.51 Alanine racemase-C Bacterial large subunit ribosomal RNA compare
6AZ3_B_4 7RYG_D_A 0.53 0.59 3.16 0.14 Alanine racemase-C compare
4Y4O_1E_1A 6S0Z_D_A 0.88 0.97 1.32 0.54 Alanine racemase-C Bacterial large subunit ribosomal RNA compare
4Y4O_1E_1A 7RYG_D_A 0.89 0.96 1.71 0.58 Alanine racemase-C Bacterial large subunit ribosomal RNA compare
4Y4O_1E_1A 6AZ3_B_4 0.55 0.58 2.75 0.17 Alanine racemase-C compare
4Y4O_1E_1A 7K00_d_a 0.92 0.97 0.69 0.64 Alanine racemase-C Bacterial large subunit ribosomal RNA compare
4Y4O_1E_1A 7OF0_E_A 0.76 0.91 1.65 0.36 Alanine racemase-C Bacterial large subunit ribosomal RNA compare
4Y4O_1E_1A 7O7Y_BB_B5 0.62 0.9 2.62 0.26 Alanine racemase-C compare
4Y4O_1E_1A 6AZ3_B_1 0.61 0.66 1.78 0.17 Alanine racemase-C compare