Interface analysis
Style
Protein
CartoonLicorice
Surface
RNA
CartoonLicorice
Surface
Color
ChainChain (with hetatm)
Chainbow
Hydrophobicity Electrostatics (surface only) Conservation*
View
Focus on
InterfaceRNA
Protein
All
Show chains
Interface
show as licoriceshow Accessibility
Rim - Core
Contacts -
| 6S0Z_D
|
6S0Z_A
|
Distance
|
Base Pair
|
Hbond nuc:res
|
Base Stacking
|
Residue conservation
|
|---|---|---|---|---|---|---|
| D:8 [ARG] | A:2840 [A] | 4.63 | 64.38 | |||
| D:9 [LYS] | A:2707 [C] | 3.95 | A:2754 [G] | 99.0 | ||
| D:9 [LYS] | A:2708 [C] | 4.73 | 99.0 | |||
| D:12 [MET] | A:2707 [C] | 3.3 | A:2754 [G] | 98.35 | ||
| D:12 [MET] | A:2708 [C] | 4.25 | 98.35 | |||
| D:12 [MET] | A:2709 [U] | 3.4 | 98.35 | |||
| D:13 [THR] | A:2709 [U] | 3.67 | 90.33 | |||
| D:14 [GLN] | A:2709 [U] | 2.26 | sugar:SC | 76.75 | ||
| D:14 [GLN] | A:2710 [C] | 3.6 | 76.75 | |||
| D:22 [LEU] | A:2756 [G] | 4.94 | A:2705 [U] | 19.44 | ||
| D:24 [PRO] | A:2709 [U] | 3.76 | 78.32 | |||
| D:24 [PRO] | A:2755 [U] | 3.45 | A:2706 [A] | 78.32 | ||
| D:24 [PRO] | A:2756 [G] | 4.08 | A:2705 [U] | 78.32 | ||
| D:37 [GLN] | A:2811 [U] | 3.35 | A:2661 [A] | sugar:SC | 52.68 | |
| D:37 [GLN] | A:2812 [U] | 3.38 | A:2660 [A] | 52.68 | ||
| D:39 [LYS] | A:2662 [U] | 3.2 | A:2810 [A] | base:SC | 79.04 | |
| D:39 [LYS] | A:2663 [U] | 4.61 | A:2809 [G] | 79.04 | ||
| D:39 [LYS] | A:2810 [A] | 4.8 | A:2662 [U] | 79.04 | ||
| D:39 [LYS] | A:2811 [U] | 3.95 | A:2661 [A] | 79.04 | ||
| D:43 [VAL] | A:2810 [A] | 4.56 | A:2662 [U] | 65.32 | ||
| D:43 [VAL] | A:2811 [U] | 4.1 | A:2661 [A] | 65.32 | ||
| D:43 [VAL] | A:2812 [U] | 4.8 | A:2660 [A] | 65.32 | ||
| D:44 [ASP] | A:2810 [A] | 4.24 | A:2662 [U] | 84.69 | ||
| D:44 [ASP] | A:2811 [U] | 2.63 | A:2661 [A] | sugar:SC | 84.69 | |
| D:46 [TYR] | A:2663 [U] | 2.39 | A:2809 [G] | 79.48 | ||
| D:46 [TYR] | A:2664 [U] | 4.08 | A:2803 [A] | 79.48 | ||
| D:50 [GLN] | A:2662 [U] | 2.33 | A:2810 [A] | sugar:SC | 65.81 | |
| D:59 [TYR] | A:2830 [A] | 4.03 | A:2910 [G] | 70.52 | ||
| D:59 [TYR] | A:2831 [G] | 3.67 | A:2909 [C] | 70.52 | ||
| D:60 [LYS] | A:2852 [U] | 4.46 | 70.52 | |||
| D:60 [LYS] | A:2853 [U] | 3.24 | sugar:SC | 70.52 | ||
| D:61 [LYS] | A:2829 [A] | 4.99 | 70.52 | |||
| D:61 [LYS] | A:2830 [A] | 3.68 | A:2910 [G] | 70.52 | ||
| D:64 [LYS] | A:2851 [G] | 3.43 | A:2835 [C] | 70.52 | ||
| D:64 [LYS] | A:2852 [U] | 3.71 | 70.52 | |||
| D:65 [SER] | A:2850 [G] | 4.07 | A:2836 [C] | 70.52 | ||
| D:65 [SER] | A:2851 [G] | 2.25 | A:2835 [C] | 70.52 | ||
| D:66 [ASN] | A:2849 [A] | 3.46 | A:2837 [U] | 28.7 | ||
| D:66 [ASN] | A:2850 [G] | 4.55 | A:2836 [C] | 28.7 | ||
| D:67 [LYS] | A:2850 [G] | 3.09 | A:2836 [C] | 56.86 | ||
| D:67 [LYS] | A:2851 [G] | 2.73 | A:2835 [C] | 56.86 | ||
| D:67 [LYS] | A:2854 [A] | 3.06 | A:2903 [A] | 56.86 | ||
| D:67 [LYS] | A:2855 [A] | 3.51 | 56.86 | |||
| D:68 [TYR] | A:2851 [G] | 3.68 | A:2835 [C] | 47.41 | ||
| D:68 [TYR] | A:2853 [U] | 3.74 | 47.41 | |||
| D:68 [TYR] | A:2854 [A] | 3.84 | A:2903 [A] | 47.41 | ||
| D:70 [ASN] | A:2660 [A] | 3.23 | A:2812 [U] | sugar:SC | 64.55 | |
| D:70 [ASN] | A:2831 [G] | 3.56 | A:2909 [C] | 64.55 | ||
| D:70 [ASN] | A:2832 [A] | 3.8 | A:2908 [U] | 64.55 | ||
| D:71 [LYS] | A:2813 [U] | 3.94 | A:2659 [A] | sugar:BB | 82.85 | |
| D:71 [LYS] | A:2814 [C] | 3.44 | A:2658 [G] | 82.85 | ||
| D:71 [LYS] | A:2815 [C] | 4.65 | A:2657 [G] | 82.85 | ||
| D:71 [LYS] | A:2830 [A] | 3.65 | A:2910 [G] | 82.85 | ||
| D:71 [LYS] | A:2831 [G] | 3.52 | A:2909 [C] | 82.85 | ||
| D:72 [PRO] | A:2659 [A] | 4.58 | A:2813 [U] | 63.2 | ||
| D:72 [PRO] | A:2660 [A] | 3.89 | A:2812 [U] | 63.2 | ||
| D:72 [PRO] | A:2813 [U] | 2.73 | A:2659 [A] | sugar:BB | 63.2 | |
| D:72 [PRO] | A:2814 [C] | 3.61 | A:2658 [G] | 63.2 | ||
| D:72 [PRO] | A:2830 [A] | 4.31 | A:2910 [G] | 63.2 | ||
| D:72 [PRO] | A:2831 [G] | 4.67 | A:2909 [C] | 63.2 | ||
| D:73 [ALA] | A:2813 [U] | 4.78 | A:2659 [A] | 7.63 | ||
| D:75 [GLY] | A:2813 [U] | 3.34 | A:2659 [A] | 76.23 | ||
| D:75 [GLY] | A:2814 [C] | 4.53 | A:2658 [G] | 76.23 | ||
| D:76 [HIS] | A:2812 [U] | 2.99 | A:2660 [A] | sugar:SC | 47.49 | |
| D:76 [HIS] | A:2813 [U] | 3.39 | A:2659 [A] | 47.49 | ||
| D:79 [LYS] | A:2812 [U] | 3.28 | A:2660 [A] | 82.2 | ||
| D:79 [LYS] | A:2813 [U] | 2.92 | A:2659 [A] | 82.2 | ||
| D:86 [ARG] | A:2849 [A] | 3.38 | A:2837 [U] | 52.59 | ||
| D:86 [ARG] | A:2850 [G] | 2.3 | A:2836 [C] | 52.59 | ||
| D:88 [ILE] | A:2661 [A] | 3.99 | A:2811 [U] | 45.39 | ||
| D:88 [ILE] | A:2662 [U] | 3.51 | A:2810 [A] | 45.39 | ||
| D:88 [ILE] | A:2663 [U] | 4.51 | A:2809 [G] | 45.39 | ||
| D:89 [ARG] | A:2662 [U] | 3.72 | A:2810 [A] | 48.51 | ||
| D:89 [ARG] | A:2663 [U] | 3.44 | A:2809 [G] | 48.51 | ||
| D:90 [GLU] | A:2662 [U] | 2.69 | A:2810 [A] | sugar:SC | 89.09 | |
| D:90 [GLU] | A:2663 [U] | 2.92 | A:2809 [G] | 89.09 | ||
| D:92 [ARG] | A:2664 [U] | 3.4 | A:2803 [A] | 62.34 | ||
| D:92 [ARG] | A:2665 [G] | 3.07 | A:2805 [A] | 62.34 | ||
| D:119 [THR] | A:2800 [U] | 4.46 | A:2668 [A] | 68.59 | ||
| D:121 [VAL] | A:2707 [C] | 4.85 | A:2754 [G] | 53.94 | ||
| D:122 [SER] | A:2706 [A] | 3.78 | A:2755 [U] | 90.67 | ||
| D:122 [SER] | A:2707 [C] | 3.84 | A:2754 [G] | 90.67 | ||
| D:123 [LYS] | A:2706 [A] | 4.87 | A:2755 [U] | 92.18 | ||
| D:123 [LYS] | A:2707 [C] | 3.16 | A:2754 [G] | 92.18 | ||
| D:123 [LYS] | A:2708 [C] | 3.47 | 92.18 | |||
| D:123 [LYS] | A:2749 [G] | 4.62 | A:2714 [U] | 92.18 | ||
| D:123 [LYS] | A:2750 [C] | 3.15 | A:2713 [G] | 92.18 | ||
| D:123 [LYS] | A:2840 [A] | 4.33 | 92.18 | |||
| D:123 [LYS] | A:2841 [A] | 2.58 | A:2846 [A] | 92.18 | ||
| D:124 [GLY] | A:2841 [A] | 3.62 | A:2846 [A] | 98.87 | ||
| D:124 [GLY] | A:2842 [G] | 3.92 | 98.87 | |||
| D:125 [LYS] | A:1698 [A] | 4.98 | 82.07 | |||
| D:125 [LYS] | A:2707 [C] | 3.78 | A:2754 [G] | 82.07 | ||
| D:125 [LYS] | A:2750 [C] | 4.5 | A:2713 [G] | 82.07 | ||
| D:125 [LYS] | A:2751 [U] | 3.15 | A:2712 [G] | 82.07 | ||
| D:125 [LYS] | A:2842 [G] | 3.76 | 82.07 | |||
| D:125 [LYS] | A:2843 [A] | 4.87 | 82.07 | |||
| D:126 [GLY] | A:1698 [A] | 4.75 | 98.95 | |||
| D:126 [GLY] | A:2842 [G] | 3.52 | 98.95 | |||
| D:126 [GLY] | A:2843 [A] | 3.4 | 98.95 | |||
| D:127 [PHE] | A:1698 [A] | 2.78 | sugar:BB | 91.81 | ||
| D:127 [PHE] | A:1699 [A] | 3.46 | 91.81 | |||
| D:127 [PHE] | A:2075 [G] | 3.79 | A:2647 [C] | 91.81 | ||
| D:127 [PHE] | A:2076 [A] | 4.19 | A:2646 [U] | 91.81 | ||
| D:127 [PHE] | A:2843 [A] | 3.16 | 91.81 | |||
| D:128 [GLN] | A:1698 [A] | 4.48 | 78.92 | |||
| D:128 [GLN] | A:1699 [A] | 3.96 | 78.92 | |||
| D:129 [GLY] | A:1699 [A] | 3.57 | 98.17 | |||
| D:129 [GLY] | A:1700 [C] | 4.26 | A:2031 [G] | 98.17 | ||
| D:131 [ILE] | A:1700 [C] | 4.85 | A:2031 [G] | 83.12 | ||
| D:131 [ILE] | A:2024 [A] | 4.11 | A:1707 [U] | 83.12 | ||
| D:131 [ILE] | A:2025 [A] | 4.12 | A:1706 [U] | 83.12 | ||
| D:132 [LYS] | A:2025 [A] | 4.04 | A:1706 [U] | 92.49 | ||
| D:132 [LYS] | A:2026 [C] | 3.0 | A:1705 [G] | 92.49 | ||
| D:132 [LYS] | A:2750 [C] | 4.75 | A:2713 [G] | 92.49 | ||
| D:132 [LYS] | A:2751 [U] | 3.13 | A:2712 [G] | 92.49 | ||
| D:133 [ARG] | A:2647 [C] | 2.98 | A:2075 [G] | sugar:SC | 94.85 | |
| D:133 [ARG] | A:2648 [G] | 2.62 | A:2074 [C] | 94.85 | ||
| D:133 [ARG] | A:2705 [U] | 4.82 | A:2756 [G] | 94.85 | ||
| D:135 [GLY] | A:2704 [A] | 4.96 | A:2757 [U] | 79.27 | ||
| D:136 [GLN] | A:2024 [A] | 4.42 | A:1707 [U] | 89.94 | ||
| D:136 [GLN] | A:2538 [U] | 4.56 | A:2602 [C] | 89.94 | ||
| D:136 [GLN] | A:2539 [C] | 3.69 | A:2601 [G] | 89.94 | ||
| D:136 [GLN] | A:2540 [A] | 4.89 | A:2598 [U] | 89.94 | ||
| D:137 [SER] | A:2024 [A] | 3.91 | A:1707 [U] | 45.1 | ||
| D:137 [SER] | A:2538 [U] | 2.84 | A:2602 [C] | 45.1 | ||
| D:137 [SER] | A:2539 [C] | 3.02 | A:2601 [G] | 45.1 | ||
| D:138 [ARG] | A:2019 [G] | 4.13 | A:2023 [C] | 77.19 | ||
| D:138 [ARG] | A:2021 [C] | 3.1 | A:1710 [G] | 77.19 | ||
| D:138 [ARG] | A:2022 [U] | 3.33 | A:1709 [A] | 77.19 | ||
| D:138 [ARG] | A:2023 [C] | 3.36 | A:2019 [G] | 77.19 | ||
| D:138 [ARG] | A:2024 [A] | 2.69 | A:1707 [U] | 77.19 | ||
| D:138 [ARG] | A:2538 [U] | 4.93 | A:2602 [C] | 77.19 | ||
| D:139 [GLY] | A:2021 [C] | 4.2 | A:1710 [G] | 74.53 | ||
| D:140 [PRO] | A:2021 [C] | 3.91 | A:1710 [G] | 76.05 | ||
| D:140 [PRO] | A:2537 [C] | 4.16 | A:2605 [G] | 76.05 | ||
| D:141 [MET] | A:2020 [U] | 4.23 | A:1713 [A] | 63.23 | ||
| D:141 [MET] | A:2021 [C] | 3.4 | A:1710 [G] | 63.23 | ||
| D:142 [SER] | A:1719 [C] | 3.0 | base:SC | 84.37 | ||
| D:142 [SER] | A:1720 [A] | 4.84 | 84.37 | |||
| D:142 [SER] | A:2020 [U] | 3.41 | A:1713 [A] | 84.37 | ||
| D:143 [HIS] | A:1714 [C] | 2.76 | base:SC | 98.69 | ||
| D:143 [HIS] | A:1715 [U] | 3.88 | 98.69 | |||
| D:143 [HIS] | A:1717 [G] | 2.89 | base:SC | 98.69 | ||
| D:143 [HIS] | A:1719 [C] | 3.15 | base:BB | base/AA stacks | 98.69 | |
| D:143 [HIS] | A:2020 [U] | 4.24 | A:1713 [A] | 98.69 | ||
| D:143 [HIS] | A:2607 [U] | 3.83 | A:2535 [G] | 98.69 | ||
| D:143 [HIS] | A:2608 [G] | 4.45 | 98.69 | |||
| D:144 [GLY] | A:788 [A] | 3.4 | A:799 [U] | 98.84 | ||
| D:144 [GLY] | A:1719 [C] | 4.67 | 98.84 | |||
| D:144 [GLY] | A:2606 [C] | 4.66 | A:2536 [G] | 98.84 | ||
| D:144 [GLY] | A:2607 [U] | 3.06 | A:2535 [G] | 98.84 | ||
| D:144 [GLY] | A:2608 [G] | 4.26 | 98.84 | |||
| D:145 [SER] | A:788 [A] | 4.99 | A:799 [U] | 83.13 | ||
| D:145 [SER] | A:2606 [C] | 3.93 | A:2536 [G] | 83.13 | ||
| D:145 [SER] | A:2607 [U] | 4.45 | A:2535 [G] | 83.13 | ||
| D:146 [HIS] | A:788 [A] | 4.45 | A:799 [U] | 54.07 | ||
| D:146 [HIS] | A:789 [C] | 2.82 | A:798 [G] | 54.07 | ||
| D:146 [HIS] | A:2606 [C] | 3.29 | A:2536 [G] | sugar:BB | 54.07 | |
| D:146 [HIS] | A:2607 [U] | 2.91 | A:2535 [G] | 54.07 | ||
| D:147 [PHE] | A:2538 [U] | 3.55 | A:2602 [C] | 51.83 | ||
| D:147 [PHE] | A:2605 [G] | 3.98 | A:2537 [C] | 51.83 | ||
| D:147 [PHE] | A:2606 [C] | 3.32 | A:2536 [G] | 51.83 | ||
| D:148 [HIS] | A:1701 [U] | 3.46 | A:2030 [A] | 73.55 | ||
| D:148 [HIS] | A:1702 [C] | 3.05 | A:2029 [G] | 73.55 | ||
| D:149 [ARG] | A:1700 [C] | 2.97 | A:2031 [G] | 98.74 | ||
| D:149 [ARG] | A:1701 [U] | 2.9 | A:2030 [A] | 98.74 | ||
| D:149 [ARG] | A:2025 [A] | 3.05 | A:1706 [U] | 98.74 | ||
| D:150 [ALA] | A:1700 [C] | 4.27 | A:2031 [G] | 53.96 | ||
| D:150 [ALA] | A:1701 [U] | 3.86 | A:2030 [A] | 53.96 | ||
| D:150 [ALA] | A:2078 [A] | 4.21 | 53.96 | |||
| D:150 [ALA] | A:2538 [U] | 4.66 | A:2602 [C] | 53.96 | ||
| D:151 [PRO] | A:2077 [C] | 4.32 | A:2645 [G] | 67.13 | ||
| D:151 [PRO] | A:2078 [A] | 4.43 | 67.13 | |||
| D:151 [PRO] | A:2538 [U] | 4.31 | A:2602 [C] | 67.13 | ||
| D:151 [PRO] | A:2605 [G] | 4.8 | A:2537 [C] | 67.13 | ||
| D:152 [GLY] | A:2078 [A] | 4.34 | 97.24 | |||
| D:152 [GLY] | A:2079 [G] | 4.55 | A:2644 [C] | 97.24 | ||
| D:152 [GLY] | A:2538 [U] | 3.24 | A:2602 [C] | 97.24 | ||
| D:152 [GLY] | A:2539 [C] | 4.18 | A:2601 [G] | 97.24 | ||
| D:152 [GLY] | A:2605 [G] | 4.43 | A:2537 [C] | 97.24 | ||
| D:153 [SER] | A:2079 [G] | 3.26 | A:2644 [C] | 95.47 | ||
| D:153 [SER] | A:2538 [U] | 3.15 | A:2602 [C] | base:BB | 95.47 | |
| D:153 [SER] | A:2539 [C] | 2.64 | A:2601 [G] | base:SC, sugar:BB | 95.47 | |
| D:153 [SER] | A:2601 [G] | 3.56 | A:2539 [C] | 95.47 | ||
| D:153 [SER] | A:2602 [C] | 2.72 | A:2538 [U] | base:SC | 95.47 | |
| D:153 [SER] | A:2605 [G] | 3.7 | A:2537 [C] | 95.47 | ||
| D:154 [VAL] | A:2077 [C] | 3.93 | A:2645 [G] | 83.41 | ||
| D:154 [VAL] | A:2078 [A] | 3.63 | 83.41 | |||
| D:154 [VAL] | A:2079 [G] | 3.1 | A:2644 [C] | 83.41 | ||
| D:154 [VAL] | A:2539 [C] | 4.93 | A:2601 [G] | 83.41 | ||
| D:155 [GLY] | A:2079 [G] | 3.53 | A:2644 [C] | 93.78 | ||
| D:155 [GLY] | A:2601 [G] | 3.98 | A:2539 [C] | 93.78 | ||
| D:155 [GLY] | A:2602 [C] | 4.06 | A:2538 [U] | 93.78 | ||
| D:156 [MET] | A:2079 [G] | 4.07 | A:2644 [C] | 55.69 | ||
| D:156 [MET] | A:2080 [G] | 4.71 | A:2643 [C] | 55.69 | ||
| D:156 [MET] | A:2540 [A] | 3.79 | A:2598 [U] | 55.69 | ||
| D:156 [MET] | A:2598 [U] | 3.35 | A:2540 [A] | 55.69 | ||
| D:156 [MET] | A:2599 [A] | 4.57 | 55.69 | |||
| D:156 [MET] | A:2601 [G] | 3.15 | A:2539 [C] | 55.69 | ||
| D:156 [MET] | A:2602 [C] | 3.08 | A:2538 [U] | sugar:BB | 55.69 | |
| D:157 [ALA] | A:2079 [G] | 3.36 | A:2644 [C] | 57.21 | ||
| D:157 [ALA] | A:2080 [G] | 4.06 | A:2643 [C] | 57.21 | ||
| D:157 [ALA] | A:2598 [U] | 5.0 | A:2540 [A] | 57.21 | ||
| D:157 [ALA] | A:2599 [A] | 3.1 | 57.21 | |||
| D:157 [ALA] | A:2601 [G] | 3.5 | A:2539 [C] | 57.21 | ||
| D:157 [ALA] | A:2602 [C] | 4.41 | A:2538 [U] | 57.21 | ||
| D:158 [SER] | A:617 [A] | 4.73 | 68.99 | |||
| D:158 [SER] | A:1174 [U] | 4.85 | 68.99 | |||
| D:158 [SER] | A:2059 [G] | 4.12 | 68.99 | |||
| D:158 [SER] | A:2079 [G] | 4.92 | A:2644 [C] | 68.99 | ||
| D:158 [SER] | A:2080 [G] | 3.89 | A:2643 [C] | 68.99 | ||
| D:158 [SER] | A:2599 [A] | 3.24 | 68.99 | |||
| D:159 [ASP] | A:1174 [U] | 3.47 | 43.16 | |||
| D:159 [ASP] | A:2059 [G] | 4.49 | 43.16 | |||
| D:159 [ASP] | A:2598 [U] | 3.36 | A:2540 [A] | sugar:SC | 43.16 | |
| D:159 [ASP] | A:2599 [A] | 2.82 | 43.16 | |||
| D:160 [ALA] | A:1174 [U] | 3.03 | 85.02 | |||
| D:160 [ALA] | A:2052 [C] | 4.68 | A:2065 [G] | 85.02 | ||
| D:160 [ALA] | A:2079 [G] | 3.36 | A:2644 [C] | sugar:BB | 85.02 | |
| D:161 [SER] | A:1174 [U] | 4.69 | 75.89 | |||
| D:161 [SER] | A:2051 [C] | 4.92 | A:2066 [G] | 75.89 | ||
| D:161 [SER] | A:2079 [G] | 3.19 | A:2644 [C] | base:BB | 75.89 | |
| D:161 [SER] | A:2080 [G] | 3.47 | A:2643 [C] | 75.89 | ||
| D:162 [ARG] | A:1174 [U] | 2.74 | base:SC | 88.59 | ||
| D:162 [ARG] | A:1175 [G] | 4.36 | 88.59 | |||
| D:162 [ARG] | A:2051 [C] | 3.34 | A:2066 [G] | 88.59 | ||
| D:162 [ARG] | A:2052 [C] | 3.24 | A:2065 [G] | 88.59 | ||
| D:162 [ARG] | A:2079 [G] | 3.43 | A:2644 [C] | 88.59 | ||
| D:162 [ARG] | A:2080 [G] | 4.6 | A:2643 [C] | 88.59 | ||
| D:162 [ARG] | A:2645 [G] | 3.97 | A:2077 [C] | 88.59 | ||
| D:163 [VAL] | A:2079 [G] | 3.77 | A:2644 [C] | 86.75 | ||
| D:163 [VAL] | A:2645 [G] | 3.06 | A:2077 [C] | sugar:BB, sugar:BB | 86.75 | |
| D:163 [VAL] | A:2646 [U] | 3.43 | A:2076 [A] | 86.75 | ||
| D:164 [PHE] | A:1174 [U] | 4.26 | 5.63 | |||
| D:164 [PHE] | A:2541 [U] | 4.08 | A:2597 [G] | 5.63 | ||
| D:164 [PHE] | A:2646 [U] | 3.65 | A:2076 [A] | 5.63 | ||
| D:165 [LYS] | A:2646 [U] | 2.82 | A:2076 [A] | 81.98 | ||
| D:165 [LYS] | A:2647 [C] | 3.71 | A:2075 [G] | 81.98 | ||
| D:166 [GLY] | A:2646 [U] | 4.0 | A:2076 [A] | 91.27 | ||
| D:166 [GLY] | A:2647 [C] | 3.31 | A:2075 [G] | 91.27 | ||
| D:167 [GLN] | A:2539 [C] | 3.5 | A:2601 [G] | sugar:SC | 64.72 | |
| D:167 [GLN] | A:2540 [A] | 4.31 | A:2598 [U] | 64.72 | ||
| D:167 [GLN] | A:2646 [U] | 3.77 | A:2076 [A] | 64.72 | ||
| D:167 [GLN] | A:2647 [C] | 4.35 | A:2075 [G] | 64.72 | ||
| D:168 [LYS] | A:2540 [A] | 4.0 | A:2598 [U] | 78.24 | ||
| D:168 [LYS] | A:2647 [C] | 4.91 | A:2075 [G] | 78.24 | ||
| D:169 [MET] | A:2076 [A] | 4.24 | A:2646 [U] | 92.05 | ||
| D:169 [MET] | A:2077 [C] | 3.16 | A:2645 [G] | 92.05 | ||
| D:169 [MET] | A:2645 [G] | 4.17 | A:2077 [C] | 92.05 | ||
| D:169 [MET] | A:2646 [U] | 3.06 | A:2076 [A] | 92.05 | ||
| D:169 [MET] | A:2647 [C] | 3.38 | A:2075 [G] | 92.05 | ||
| D:170 [PRO] | A:1699 [A] | 4.14 | 82.46 | |||
| D:170 [PRO] | A:2075 [G] | 4.8 | A:2647 [C] | 82.46 | ||
| D:170 [PRO] | A:2076 [A] | 3.68 | A:2646 [U] | 82.46 | ||
| D:170 [PRO] | A:2077 [C] | 4.79 | A:2645 [G] | 82.46 | ||
| D:170 [PRO] | A:2647 [C] | 2.5 | A:2075 [G] | sugar:BB | 82.46 | |
| D:170 [PRO] | A:2648 [G] | 4.79 | A:2074 [C] | 82.46 | ||
| D:171 [GLY] | A:2647 [C] | 4.28 | A:2075 [G] | 96.17 | ||
| D:171 [GLY] | A:2648 [G] | 4.15 | A:2074 [C] | 96.17 | ||
| D:172 [ARG] | A:2648 [G] | 3.17 | A:2074 [C] | sugar:BB | 80.71 | |
| D:172 [ARG] | A:2649 [U] | 4.04 | A:2073 [G] | 80.71 | ||
| D:172 [ARG] | A:2842 [G] | 3.18 | 80.71 | |||
| D:172 [ARG] | A:2843 [A] | 2.92 | 80.71 | |||
| D:172 [ARG] | A:2844 [U] | 3.65 | base:SC | 80.71 | ||
| D:172 [ARG] | A:2845 [G] | 3.55 | 80.71 | |||
| D:172 [ARG] | A:2846 [A] | 4.38 | A:2841 [A] | 80.71 | ||
| D:173 [MET] | A:2842 [G] | 3.97 | 78.66 | |||
| D:174 [GLY] | A:2842 [G] | 4.52 | 98.64 | |||
| D:175 [GLY] | A:2842 [G] | 4.86 | 54.86 | |||
| D:176 [ASN] | A:2706 [A] | 4.61 | A:2755 [U] | 38.8 | ||
| D:177 [THR] | A:2800 [U] | 3.08 | A:2668 [A] | 42.1 | ||
| D:177 [THR] | A:2801 [C] | 3.01 | A:2667 [G] | 42.1 | ||
| D:178 [VAL] | A:2705 [U] | 4.08 | A:2756 [G] | 73.86 | ||
| D:178 [VAL] | A:2706 [A] | 4.2 | A:2755 [U] | 73.86 | ||
| D:178 [VAL] | A:2800 [U] | 4.8 | A:2668 [A] | 73.86 | ||
| D:179 [THR] | A:2799 [C] | 3.63 | A:2669 [G] | 95.03 | ||
| D:179 [THR] | A:2800 [U] | 3.24 | A:2668 [A] | 95.03 | ||
| D:180 [VAL] | A:2756 [G] | 4.47 | A:2705 [U] | 74.39 | ||
| D:180 [VAL] | A:2757 [U] | 4.49 | A:2704 [A] | 74.39 | ||
| D:181 [GLN] | A:2757 [U] | 2.73 | A:2704 [A] | sugar:BB | 69.18 | |
| D:181 [GLN] | A:2758 [G] | 4.02 | A:2703 [C] | 69.18 | ||
| D:181 [GLN] | A:2798 [C] | 2.94 | A:2670 [G] | sugar:SC | 69.18 | |
| D:181 [GLN] | A:2799 [C] | 3.84 | A:2669 [G] | 69.18 | ||
| D:182 [ASN] | A:2757 [U] | 3.8 | A:2704 [A] | 79.67 | ||
| D:182 [ASN] | A:2758 [G] | 2.86 | A:2703 [C] | 79.67 | ||
| D:182 [ASN] | A:2759 [G] | 4.86 | A:2702 [A] | 79.67 | ||
| D:183 [LEU] | A:2756 [G] | 3.8 | A:2705 [U] | 77.44 | ||
| D:183 [LEU] | A:2757 [U] | 3.82 | A:2704 [A] | 77.44 | ||
| D:198 [LYS] | A:2756 [G] | 3.53 | A:2705 [U] | 61.78 | ||
| D:198 [LYS] | A:2757 [U] | 3.35 | A:2704 [A] | 61.78 | ||
| D:199 [GLY] | A:2756 [G] | 3.73 | A:2705 [U] | 98.61 | ||
| D:200 [ASN] | A:2706 [A] | 3.33 | A:2755 [U] | 71.7 | ||
| D:200 [ASN] | A:2707 [C] | 3.87 | A:2754 [G] | 71.7 | ||
| D:200 [ASN] | A:2709 [U] | 4.81 | 71.7 | |||
| D:200 [ASN] | A:2755 [U] | 3.03 | A:2706 [A] | base:SC | 71.7 | |
| D:200 [ASN] | A:2756 [G] | 3.66 | A:2705 [U] | 71.7 | ||
| D:201 [VAL] | A:2706 [A] | 3.7 | A:2755 [U] | 84.47 | ||
| D:201 [VAL] | A:2707 [C] | 3.58 | A:2754 [G] | 84.47 | ||
| D:202 [PRO] | A:2706 [A] | 3.31 | A:2755 [U] | 97.0 | ||
| D:202 [PRO] | A:2707 [C] | 4.14 | A:2754 [G] | 97.0 | ||
| D:203 [GLY] | A:2706 [A] | 4.42 | A:2755 [U] | 98.12 | ||
| D:203 [GLY] | A:2707 [C] | 3.19 | A:2754 [G] | 98.12 | ||
| D:203 [GLY] | A:2708 [C] | 5.0 | 98.12 | |||
| D:204 [PRO] | A:2840 [A] | 3.68 | 45.88 | |||
| D:204 [PRO] | A:2841 [A] | 4.54 | A:2846 [A] | 45.88 | ||
| D:205 [LYS] | A:2749 [G] | 3.18 | A:2714 [U] | 41.04 | ||
| D:205 [LYS] | A:2840 [A] | 4.07 | 41.04 | |||
| D:206 [LYS] | A:2840 [A] | 3.45 | 62.88 | |||
| D:206 [LYS] | A:2895 [G] | 4.72 | A:2862 [C] | 62.88 | ||
| D:207 [GLY] | A:2840 [A] | 4.95 | 63.95 | |||
| D:215 [ILE] | A:2798 [C] | 4.59 | A:2670 [G] | 3.94 | ||
| D:215 [ILE] | A:2799 [C] | 4.6 | A:2669 [G] | 3.94 | ||
| D:216 [LYS] | A:2758 [G] | 4.16 | A:2703 [C] | 76.76 | ||
| D:216 [LYS] | A:2759 [G] | 3.58 | A:2702 [A] | 76.76 | ||
| D:216 [LYS] | A:2798 [C] | 4.02 | A:2670 [G] | 76.76 |
Export the table of contacts
*Conservation was calculated using Rate4Site
NB: conservation is missing (completly white) for a very small minority of cases in which no homologous sequences were found (e.g. synthetic proteins 7D3J_A & 7EU9_A)
Properties of this interface
| Interolog group ID | Structure ID |
Structure description |
UniProt ID |
ECOD label(s) |
RFAM label(s) |
Is ribosome? | RCSB PDB link |
|---|---|---|---|---|---|---|---|
| group129 | 6S0Z_D_A | D: 50s ribosomal protein l3, Staphylococcus aureus (natural) A: 23s ribosomal RNA, Staphylococcus aureus (natural) | W8U3W0 | Alanine racemase-C | Bacterial large subunit ribosomal RNA | ✔ |
|
Interologs
Total number of interologs for this interface: 9
| Interface 1 | Interface 2 |
Percentage conservation |
Interface TM-score |
Interface RMSD |
Percentage identity |
Common ECOD label(s) |
Common RFAM label(s) |
Explore both interfaces |
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| 1YHQ_B_0 | 6S0Z_D_A | 0.63 | 0.89 | 2.53 | 0.28 | Alanine racemase-C | compare | |
| 6AZ3_B_1 | 6S0Z_D_A | 0.76 | 0.67 | 1.81 | 0.29 | Alanine racemase-C | compare | |
| 1VQ8_B_0 | 6S0Z_D_A | 0.62 | 0.89 | 2.6 | 0.28 | Alanine racemase-C | compare | |
| 6S0Z_D_A | 7O7Y_BB_B5 | 0.60 | 0.89 | 3.01 | 0.23 | Alanine racemase-C | compare | |
| 6S0Z_D_A | 7RYG_D_A | 0.84 | 0.98 | 1.08 | 0.51 | Alanine racemase-C | Bacterial large subunit ribosomal RNA | compare |
| 6S0Z_D_A | 7K00_d_a | 0.88 | 0.97 | 1.25 | 0.51 | Alanine racemase-C | Bacterial large subunit ribosomal RNA | compare |
| 6S0Z_D_A | 7OF0_E_A | 0.73 | 0.91 | 1.94 | 0.35 | Alanine racemase-C | Bacterial large subunit ribosomal RNA | compare |
| 6AZ3_B_4 | 6S0Z_D_A | 0.58 | 0.59 | 3.03 | 0.16 | Alanine racemase-C | compare | |
| 4Y4O_1E_1A | 6S0Z_D_A | 0.88 | 0.97 | 1.32 | 0.54 | Alanine racemase-C | Bacterial large subunit ribosomal RNA | compare |