RNAprotDB

All interfaces > All interologs > Interface groups > group129 > 7OF0_E_A

Interface analysis

mouse controls

Style

Protein

Cartoon
Licorice
Surface

RNA

Cartoon
Licorice
Surface

Color

Chain
Chain (with hetatm)
Chainbow
Hydrophobicity
Electrostatics (surface only)
Conservation*

View

Focus on

Interface
RNA
Protein
All

Show chains

Interface

show as licorice
show Accessibility
Rim - Core

Contacts -

7OF0_E
7OF0_A
Distance
Base Pair
Hbond nuc:res
Base Stacking
Residue conservation
E:46 [GLY] A:3212 [C] 3.96 25.49
E:48 [TRP] A:3212 [C] 3.39 base/AA stacks 11.78
E:49 [TRP] A:3228 [U] 3.06 0.72
E:50 [ASP] A:3228 [U] 4.76 37.72
E:62 [LYS] A:3228 [U] 3.85 21.44
E:65 [VAL] A:3228 [U] 3.02 17.54
E:66 [SER] A:3228 [U] 3.57 6.13
E:69 [ASP] A:3228 [U] 2.71 base:SC 37.4
E:103 [LYS] A:3148 [C] 3.24 A:3163 [G] 99.0
E:103 [LYS] A:3149 [C] 3.93 99.0
E:105 [GLY] A:3150 [U] 5.0 92.36
E:106 [MET] A:3148 [C] 3.26 A:3163 [G] 89.82
E:106 [MET] A:3149 [C] 3.58 89.82
E:106 [MET] A:3150 [U] 3.13 89.82
E:107 [MET] A:3150 [U] 3.57 78.48
E:108 [PRO] A:3150 [U] 3.59 69.98
E:115 [GLN] A:3140 [A] 4.23 A:3116 [C] 31.54
E:116 [LYS] A:3150 [U] 3.48 base:SC 51.72
E:116 [LYS] A:3151 [A] 4.84 51.72
E:118 [VAL] A:3150 [U] 3.3 69.48
E:118 [VAL] A:3164 [C] 3.66 A:3147 [G] 69.48
E:139 [ASN] A:3206 [C] 3.91 base:SC 60.64
E:142 [MET] A:3202 [U] 4.96 20.27
E:142 [MET] A:3203 [A] 3.47 20.27
E:152 [VAL] A:3226 [G] 4.29 A:3214 [C] 10.76
E:152 [VAL] A:3227 [U] 3.55 A:3213 [A] 10.76
E:152 [VAL] A:3228 [U] 4.68 10.76
E:153 [SER] A:3226 [G] 4.95 A:3214 [C] 62.49
E:153 [SER] A:3227 [U] 2.67 A:3213 [A] 62.49
E:153 [SER] A:3228 [U] 2.48 62.49
E:154 [ARG] A:3228 [U] 3.09 base:BB 50.15
E:155 [PHE] A:3228 [U] 3.58 41.62
E:156 [ARG] A:3212 [C] 4.46 32.42
E:156 [ARG] A:3213 [A] 4.55 A:3227 [U] 32.42
E:156 [ARG] A:3227 [U] 3.58 A:3213 [A] base/AA stacks 32.42
E:156 [ARG] A:3228 [U] 2.94 32.42
E:157 [LYS] A:3207 [A] 4.09 44.66
E:157 [LYS] A:3226 [G] 3.3 A:3214 [C] 44.66
E:158 [ALA] A:3209 [A] 3.27 62.59
E:160 [SER] A:3207 [A] 4.55 54.52
E:160 [SER] A:3208 [C] 4.67 54.52
E:160 [SER] A:3209 [A] 2.37 54.52
E:161 [ILE] A:3207 [A] 3.81 39.21
E:161 [ILE] A:3209 [A] 4.69 39.21
E:164 [PHE] A:3207 [A] 4.08 49.68
E:165 [TYR] A:3207 [A] 2.72 base:SC 66.31
E:173 [LYS] A:3207 [A] 2.99 base:BB 55.47
E:174 [GLN] A:3207 [A] 3.44 54.56
E:174 [GLN] A:3225 [G] 3.88 A:3215 [C] 54.56
E:174 [GLN] A:3226 [G] 3.71 A:3214 [C] 54.56
E:175 [THR] A:3207 [A] 4.37 28.08
E:176 [VAL] A:3206 [C] 4.05 51.02
E:176 [VAL] A:3207 [A] 3.19 51.02
E:177 [LYS] A:3205 [C] 3.13 48.39
E:177 [LYS] A:3206 [C] 3.96 48.39
E:178 [ILE] A:3204 [C] 4.99 80.72
E:178 [ILE] A:3205 [C] 4.48 80.72
E:178 [ILE] A:3206 [C] 3.66 80.72
E:180 [ASN] A:3203 [A] 3.53 46.19
E:180 [ASN] A:3204 [C] 4.38 46.19
E:207 [THR] A:3204 [C] 3.43 59.76
E:207 [THR] A:3205 [C] 3.82 59.76
E:209 [LYS] A:3148 [C] 4.83 A:3163 [G] 47.05
E:209 [LYS] A:3224 [G] 4.7 A:3216 [C] 47.05
E:210 [THR] A:3147 [G] 3.58 A:3164 [C] 87.49
E:210 [THR] A:3148 [C] 3.33 A:3163 [G] 87.49
E:210 [THR] A:3218 [A] 4.43 A:3223 [A] 87.49
E:211 [ILE] A:3147 [G] 4.65 A:3164 [C] 84.52
E:211 [ILE] A:3148 [C] 2.62 A:3163 [G] 84.52
E:211 [ILE] A:3149 [C] 3.15 84.52
E:211 [ILE] A:3159 [A] 3.94 A:3154 [U] 84.52
E:211 [ILE] A:3217 [A] 4.0 84.52
E:211 [ILE] A:3218 [A] 3.66 A:3223 [A] 84.52
E:212 [GLY] A:3217 [A] 4.38 89.55
E:212 [GLY] A:3218 [A] 2.65 A:3223 [A] 89.55
E:212 [GLY] A:3219 [G] 2.81 89.55
E:213 [LYS] A:2458 [A] 4.66 81.67
E:213 [LYS] A:3148 [C] 4.4 A:3163 [G] 81.67
E:213 [LYS] A:3160 [A] 3.23 A:3153 [U] 81.67
E:213 [LYS] A:3218 [A] 4.47 A:3223 [A] 81.67
E:213 [LYS] A:3219 [G] 3.47 81.67
E:214 [GLY] A:2458 [A] 4.32 98.84
E:214 [GLY] A:3219 [G] 3.06 98.84
E:214 [GLY] A:3220 [A] 3.27 98.84
E:215 [PHE] A:2458 [A] 2.27 sugar:BB 94.5
E:215 [PHE] A:2459 [A] 3.31 94.5
E:215 [PHE] A:2711 [A] 4.14 A:3107 [U] 94.5
E:215 [PHE] A:2712 [G] 3.49 A:3106 [C] 94.5
E:215 [PHE] A:3107 [U] 4.9 A:2711 [A] 94.5
E:215 [PHE] A:3219 [G] 4.51 94.5
E:215 [PHE] A:3220 [A] 3.15 94.5
E:216 [GLN] A:2458 [A] 4.17 84.73
E:216 [GLN] A:2459 [A] 3.88 84.73
E:217 [GLY] A:2459 [A] 3.16 98.6
E:217 [GLY] A:2460 [A] 3.97 A:2667 [U] 98.6
E:218 [VAL] A:2459 [A] 4.98 86.1
E:218 [VAL] A:2460 [A] 4.96 A:2667 [U] 86.1
E:219 [MET] A:2660 [U] 3.54 A:2467 [A] 83.93
E:219 [MET] A:2661 [U] 3.74 A:2466 [A] 83.93
E:220 [LYS] A:2661 [U] 4.14 A:2466 [A] 92.23
E:220 [LYS] A:2662 [A] 2.91 A:2465 [U] 92.23
E:220 [LYS] A:3159 [A] 4.41 A:3154 [U] 92.23
E:220 [LYS] A:3160 [A] 3.15 A:3153 [U] 92.23
E:221 [ARG] A:3107 [U] 2.85 A:2711 [A] sugar:SC 98.54
E:221 [ARG] A:3108 [U] 2.68 98.54
E:222 [TRP] A:3108 [U] 4.05 73.45
E:222 [TRP] A:3145 [A] 4.69 A:3166 [U] 73.45
E:222 [TRP] A:3146 [G] 3.67 A:3165 [C] 73.45
E:223 [GLY] A:2999 [C] 4.6 A:3061 [G] 76.28
E:224 [PHE] A:2660 [U] 4.69 A:2467 [A] 82.32
E:224 [PHE] A:2998 [U] 4.7 A:3062 [U] 82.32
E:224 [PHE] A:2999 [C] 3.39 A:3061 [G] 82.32
E:224 [PHE] A:3000 [A] 4.15 A:3058 [U] 82.32
E:225 [LYS] A:2658 [U] 2.92 A:2469 [A] 51.11
E:225 [LYS] A:2659 [C] 4.2 A:2468 [A] 51.11
E:225 [LYS] A:2660 [U] 3.28 A:2467 [A] 51.11
E:225 [LYS] A:2998 [U] 3.29 A:3062 [U] 51.11
E:225 [LYS] A:2999 [C] 2.98 A:3061 [G] 51.11
E:226 [GLY] A:2997 [A] 4.67 A:3065 [U] 88.29
E:226 [GLY] A:2998 [U] 3.24 A:3062 [U] 88.29
E:226 [GLY] A:2999 [C] 5.0 A:3061 [G] 88.29
E:227 [GLN] A:2657 [C] 4.54 A:2470 [G] 57.79
E:227 [GLN] A:2997 [A] 4.87 A:3065 [U] 57.79
E:227 [GLN] A:2998 [U] 3.95 A:3062 [U] sugar:SC 57.79
E:227 [GLN] A:3065 [U] 4.56 A:2997 [A] 57.79
E:228 [PRO] A:2656 [U] 4.86 A:2473 [A] 68.65
E:228 [PRO] A:2657 [C] 3.32 A:2470 [G] 68.65
E:228 [PRO] A:2997 [A] 3.87 A:3065 [U] 68.65
E:229 [ALA] A:2656 [U] 3.9 A:2473 [A] 77.27
E:229 [ALA] A:2657 [C] 2.75 A:2470 [G] 77.27
E:230 [THR] A:2479 [C] 3.08 base:SC, base:SC 85.64
E:230 [THR] A:2480 [A] 4.33 85.64
E:230 [THR] A:2656 [U] 3.22 A:2473 [A] 85.64
E:230 [THR] A:2657 [C] 4.84 A:2470 [G] 85.64
E:231 [HIS] A:2474 [C] 2.49 base:SC 97.02
E:231 [HIS] A:2475 [U] 3.61 97.02
E:231 [HIS] A:2477 [G] 2.88 base:SC 97.02
E:231 [HIS] A:2479 [C] 3.2 base:BB base/AA stacks 97.02
E:231 [HIS] A:2656 [U] 3.77 A:2473 [A] 97.02
E:231 [HIS] A:3067 [U] 4.18 A:2995 [G] 97.02
E:232 [GLY] A:1953 [A] 3.36 A:1964 [U] 96.4
E:232 [GLY] A:2477 [G] 4.97 96.4
E:232 [GLY] A:3066 [C] 4.42 A:2996 [G] 96.4
E:232 [GLY] A:3067 [U] 3.08 A:2995 [G] 96.4
E:233 [GLN] A:1953 [A] 4.92 A:1964 [U] 69.31
E:233 [GLN] A:1954 [U] 4.92 A:1963 [A] 69.31
E:233 [GLN] A:2996 [G] 4.75 A:3066 [C] 69.31
E:233 [GLN] A:3066 [C] 2.47 A:2996 [G] 69.31
E:233 [GLN] A:3067 [U] 3.27 A:2995 [G] sugar:SC 69.31
E:234 [THR] A:1953 [A] 4.42 A:1964 [U] 89.71
E:234 [THR] A:1954 [U] 3.39 A:1963 [A] 89.71
E:234 [THR] A:2462 [A] 4.26 A:2665 [U] 89.71
E:234 [THR] A:3066 [C] 3.29 A:2996 [G] sugar:BB 89.71
E:234 [THR] A:3067 [U] 3.12 A:2995 [G] 89.71
E:235 [LYS] A:1954 [U] 3.9 A:1963 [A] 72.16
E:235 [LYS] A:1955 [G] 3.59 A:1960 [A] 72.16
E:235 [LYS] A:1956 [U] 4.89 72.16
E:235 [LYS] A:2461 [A] 3.09 A:2666 [U] 72.16
E:235 [LYS] A:2462 [A] 3.06 A:2665 [U] 72.16
E:235 [LYS] A:3099 [C] 4.9 A:2719 [G] 72.16
E:236 [THR] A:2461 [A] 3.64 A:2666 [U] 62.99
E:236 [THR] A:2462 [A] 4.39 A:2665 [U] 62.99
E:236 [THR] A:3065 [U] 3.0 A:2997 [A] 62.99
E:236 [THR] A:3066 [C] 3.2 A:2996 [G] sugar:SC 62.99
E:237 [HIS] A:2460 [A] 4.96 A:2667 [U] 82.16
E:237 [HIS] A:2461 [A] 2.65 A:2666 [U] 82.16
E:237 [HIS] A:2462 [A] 3.0 A:2665 [U] 82.16
E:238 [ARG] A:2460 [A] 2.78 A:2667 [U] 98.44
E:238 [ARG] A:2461 [A] 2.71 A:2666 [U] 98.44
E:238 [ARG] A:2660 [U] 4.97 A:2467 [A] 98.44
E:238 [ARG] A:2661 [U] 2.69 A:2466 [A] 98.44
E:239 [ARG] A:2460 [A] 3.23 A:2667 [U] 68.91
E:239 [ARG] A:2461 [A] 3.82 A:2666 [U] 68.91
E:239 [ARG] A:2714 [A] 3.11 68.91
E:239 [ARG] A:2998 [U] 4.43 A:3062 [U] 68.91
E:239 [ARG] A:3064 [A] 4.86 68.91
E:239 [ARG] A:3065 [U] 2.47 A:2997 [A] 68.91
E:240 [PRO] A:2713 [C] 3.45 A:3105 [A] 52.68
E:240 [PRO] A:2714 [A] 3.26 52.68
E:240 [PRO] A:2998 [U] 4.13 A:3062 [U] 52.68
E:240 [PRO] A:3065 [U] 4.26 A:2997 [A] 52.68
E:241 [GLY] A:2714 [A] 3.72 98.95
E:241 [GLY] A:2715 [A] 3.9 A:3104 [U] 98.95
E:241 [GLY] A:2998 [U] 3.07 A:3062 [U] sugar:BB 98.95
E:241 [GLY] A:2999 [C] 4.3 A:3061 [G] 98.95
E:241 [GLY] A:3065 [U] 3.93 A:2997 [A] 98.95
E:242 [ALA] A:2715 [A] 3.25 A:3104 [U] 90.43
E:242 [ALA] A:2998 [U] 2.8 A:3062 [U] base:BB 90.43
E:242 [ALA] A:2999 [C] 3.26 A:3061 [G] sugar:BB 90.43
E:242 [ALA] A:3061 [G] 3.64 A:2999 [C] 90.43
E:242 [ALA] A:3062 [U] 3.18 A:2998 [U] 90.43
E:242 [ALA] A:3065 [U] 3.74 A:2997 [A] 90.43
E:243 [VAL] A:2713 [C] 3.63 A:3105 [A] 79.95
E:243 [VAL] A:2714 [A] 3.78 79.95
E:243 [VAL] A:2715 [A] 2.87 A:3104 [U] 79.95
E:243 [VAL] A:2999 [C] 4.68 A:3061 [G] 79.95
E:244 [ALA] A:2715 [A] 3.51 A:3104 [U] 88.13
E:244 [ALA] A:3061 [G] 3.41 A:2999 [C] base:BB 88.13
E:244 [ALA] A:3062 [U] 4.31 A:2998 [U] 88.13
E:245 [THR] A:2715 [A] 2.95 A:3104 [U] sugar:BB 45.02
E:245 [THR] A:3000 [A] 3.73 A:3058 [U] 45.02
E:245 [THR] A:3001 [G] 4.46 A:3057 [C] 45.02
E:245 [THR] A:3058 [U] 3.59 A:3000 [A] sugar:SC 45.02
E:245 [THR] A:3059 [A] 4.86 45.02
E:245 [THR] A:3061 [G] 3.68 A:2999 [C] 45.02
E:245 [THR] A:3062 [U] 4.71 A:2998 [U] 45.02
E:246 [GLY] A:2715 [A] 3.53 A:3104 [U] 52.38
E:246 [GLY] A:2716 [G] 3.57 A:3103 [C] 52.38
E:246 [GLY] A:3059 [A] 3.8 52.38
E:246 [GLY] A:3061 [G] 3.02 A:2999 [C] sugar:BB 52.38
E:246 [GLY] A:3062 [U] 4.24 A:2998 [U] 52.38
E:247 [ASP] A:2233 [U] 3.78 45.03
E:247 [ASP] A:3058 [U] 2.96 A:3000 [A] sugar:SC 45.03
E:247 [ASP] A:3059 [A] 3.42 45.03
E:247 [ASP] A:3061 [G] 4.37 A:2999 [C] 45.03
E:248 [ILE] A:2233 [U] 3.54 78.76
E:248 [ILE] A:2688 [C] 3.8 A:2701 [G] 78.76
E:248 [ILE] A:2715 [A] 4.6 A:3104 [U] 78.76
E:249 [GLY] A:2687 [C] 4.83 A:2702 [G] 75.26
E:249 [GLY] A:2715 [A] 3.34 A:3104 [U] 75.26
E:249 [GLY] A:2716 [G] 3.21 A:3103 [C] 75.26
E:249 [GLY] A:3104 [U] 4.86 A:2715 [A] 75.26
E:250 [ARG] A:2233 [U] 2.92 base:SC 82.19
E:250 [ARG] A:2234 [C] 3.99 82.19
E:250 [ARG] A:2687 [C] 3.1 A:2702 [G] 82.19
E:250 [ARG] A:2688 [C] 2.76 A:2701 [G] 82.19
E:250 [ARG] A:2715 [A] 3.34 A:3104 [U] 82.19
E:250 [ARG] A:2716 [G] 4.3 A:3103 [C] 82.19
E:250 [ARG] A:3105 [A] 3.73 A:2713 [C] 82.19
E:251 [VAL] A:2715 [A] 3.66 A:3104 [U] 88.61
E:251 [VAL] A:3105 [A] 2.47 A:2713 [C] sugar:BB, sugar:BB 88.61
E:251 [VAL] A:3106 [C] 3.37 A:2712 [G] 88.61
E:252 [TRP] A:2233 [U] 3.71 9.64
E:252 [TRP] A:2234 [C] 3.95 9.64
E:252 [TRP] A:3001 [G] 3.51 A:3057 [C] 9.64
E:252 [TRP] A:3105 [A] 4.61 A:2713 [C] 9.64
E:252 [TRP] A:3106 [C] 3.39 A:2712 [G] sugar:BB 9.64
E:253 [PRO] A:3106 [C] 3.49 A:2712 [G] 83.87
E:253 [PRO] A:3107 [U] 3.87 A:2711 [A] 83.87
E:253 [PRO] A:3109 [U] 4.76 83.87
E:254 [GLY] A:3106 [C] 3.38 A:2712 [G] 92.41
E:254 [GLY] A:3107 [U] 2.82 A:2711 [A] 92.41
E:254 [GLY] A:3109 [U] 4.21 92.41
E:255 [THR] A:3106 [C] 3.68 A:2712 [G] 72.0
E:255 [THR] A:3107 [U] 3.34 A:2711 [A] 72.0
E:256 [LYS] A:3000 [A] 4.93 A:3058 [U] 86.87
E:256 [LYS] A:3146 [G] 4.87 A:3165 [C] 86.87
E:257 [MET] A:2712 [G] 3.54 A:3106 [C] 93.81
E:257 [MET] A:2713 [C] 3.54 A:3105 [A] 93.81
E:257 [MET] A:3105 [A] 4.62 A:2713 [C] 93.81
E:257 [MET] A:3106 [C] 3.11 A:2712 [G] 93.81
E:257 [MET] A:3107 [U] 3.25 A:2711 [A] 93.81
E:258 [PRO] A:2459 [A] 3.9 70.23
E:258 [PRO] A:2712 [G] 3.85 A:3106 [C] 70.23
E:258 [PRO] A:2713 [C] 4.42 A:3105 [A] 70.23
E:258 [PRO] A:3107 [U] 2.83 A:2711 [A] 70.23
E:259 [GLY] A:3107 [U] 3.94 A:2711 [A] 98.57
E:259 [GLY] A:3108 [U] 4.76 98.57
E:260 [LYS] A:3108 [U] 3.04 76.29
E:260 [LYS] A:3219 [G] 3.4 76.29
E:260 [LYS] A:3220 [A] 2.84 76.29
E:260 [LYS] A:3221 [A] 4.64 76.29
E:260 [LYS] A:3222 [C] 4.99 76.29
E:261 [MET] A:3108 [U] 3.94 85.32
E:261 [MET] A:3219 [G] 3.91 85.32
E:262 [GLY] A:3108 [U] 2.77 base:BB 98.84
E:262 [GLY] A:3219 [G] 4.82 98.84
E:263 [ASN] A:3218 [A] 3.55 A:3223 [A] 59.31
E:263 [ASN] A:3219 [G] 3.89 59.31
E:264 [ILE] A:3108 [U] 3.27 37.95
E:264 [ILE] A:3147 [G] 3.79 A:3164 [C] 37.95
E:265 [TYR] A:3204 [C] 3.44 28.24
E:265 [TYR] A:3205 [C] 3.42 28.24
E:265 [TYR] A:3206 [C] 3.84 28.24
E:266 [ARG] A:3108 [U] 4.52 62.67
E:266 [ARG] A:3146 [G] 2.77 A:3165 [C] 62.67
E:266 [ARG] A:3147 [G] 3.58 A:3164 [C] 62.67
E:267 [THR] A:3203 [A] 4.54 88.21
E:267 [THR] A:3204 [C] 3.71 88.21
E:268 [GLU] A:3146 [G] 3.18 A:3165 [C] base:SC, base:SC 52.13
E:268 [GLU] A:3147 [G] 4.11 A:3164 [C] 52.13
E:268 [GLU] A:3165 [C] 4.18 A:3146 [G] 52.13
E:268 [GLU] A:3166 [U] 3.45 A:3145 [A] 52.13
E:269 [TYR] A:3166 [U] 2.7 A:3145 [A] sugar:BB 63.2
E:269 [TYR] A:3167 [U] 4.22 A:3144 [A] 63.2
E:269 [TYR] A:3168 [C] 3.45 base/AA stacks 63.2
E:269 [TYR] A:3203 [A] 2.62 sugar:SC 63.2
E:270 [GLY] A:3166 [U] 3.78 A:3145 [A] 83.87
E:270 [GLY] A:3167 [U] 4.47 A:3144 [A] 83.87
E:271 [LEU] A:3165 [C] 3.79 A:3146 [G] 70.87
E:271 [LEU] A:3166 [U] 3.67 A:3145 [A] 70.87
E:286 [ASN] A:3165 [C] 3.41 A:3146 [G] 54.1
E:286 [ASN] A:3166 [U] 3.31 A:3145 [A] 54.1
E:287 [GLY] A:3165 [C] 3.41 A:3146 [G] 98.22
E:288 [SER] A:3147 [G] 2.89 A:3164 [C] base:SC 71.13
E:288 [SER] A:3148 [C] 3.71 A:3163 [G] 71.13
E:288 [SER] A:3164 [C] 4.01 A:3147 [G] 71.13
E:288 [SER] A:3165 [C] 3.68 A:3146 [G] sugar:BB 71.13
E:289 [VAL] A:3147 [G] 4.03 A:3164 [C] 85.78
E:289 [VAL] A:3148 [C] 3.2 A:3163 [G] 85.78
E:290 [PRO] A:3147 [G] 3.5 A:3164 [C] 95.17
E:290 [PRO] A:3148 [C] 3.84 A:3163 [G] 95.17
E:291 [GLY] A:3147 [G] 4.03 A:3164 [C] 98.65
E:291 [GLY] A:3148 [C] 2.94 A:3163 [G] 98.65
E:291 [GLY] A:3149 [C] 4.09 98.65
E:292 [HIS] A:3148 [C] 4.82 A:3163 [G] 16.6
E:292 [HIS] A:3149 [C] 4.33 16.6
E:292 [HIS] A:3217 [A] 3.25 base/AA stacks 16.6
E:292 [HIS] A:3218 [A] 3.8 A:3223 [A] 16.6
E:293 [LYS] A:3149 [C] 4.14 38.85
E:293 [LYS] A:3150 [U] 4.14 38.85
E:293 [LYS] A:3217 [A] 3.41 38.85
E:294 [ASN] A:3217 [A] 2.8 base:SC 63.56
E:298 [LYS] A:3204 [C] 3.1 30.42
E:298 [LYS] A:3205 [C] 2.74 30.42
E:300 [LYS] A:3203 [A] 4.25 45.6
E:300 [LYS] A:3204 [C] 3.18 45.6
E:303 [LYS] A:3168 [C] 2.95 base:SC, base:SC 0.0
E:303 [LYS] A:3201 [A] 4.02 0.0
E:303 [LYS] A:3202 [U] 3.04 base:SC 0.0
E:303 [LYS] A:3203 [A] 3.48 0.0
E:304 [LEU] A:3167 [U] 3.74 A:3144 [A] 62.58
E:304 [LEU] A:3168 [C] 4.28 62.58
E:305 [PRO] A:3168 [C] 3.24 1.98
E:305 [PRO] A:3169 [C] 4.9 1.98
E:307 [TYR] A:3167 [U] 4.31 A:3144 [A] 22.54

logo_download Export the table of contacts

*Conservation was calculated using Rate4Site
NB: conservation is missing (completly white) for a very small minority of cases in which no homologous sequences were found (e.g. synthetic proteins 7D3J_A & 7EU9_A)

Properties of this interface

Interolog group ID Structure ID Structure description
 UniProt ID
 		ECOD label(s)
 		RFAM label(s)
 		Is ribosome? RCSB PDB link
group129 7OF0_E_A E: 39s ribosomal protein l3, mitochondrial, Homo sapiens (natural) A: 16s ribosomal RNA, Homo sapiens (natural) P09001 Alanine racemase-C Bacterial large subunit ribosomal RNA ✔

Interologs

Total number of interologs for this interface: 4

Interface 1 Interface 2 Percentage conservation
 		Interface TM-score
 		Interface RMSD
 		Percentage identity
 		Common ECOD label(s)
 		Common RFAM label(s)
 		Explore both interfaces
7OF0_E_A 7RYG_D_A 0.76 0.88 2.28 0.35 Alanine racemase-C Bacterial large subunit ribosomal RNA compare
7K00_d_a 7OF0_E_A 0.78 0.89 1.59 0.36 Alanine racemase-C Bacterial large subunit ribosomal RNA compare
6S0Z_D_A 7OF0_E_A 0.73 0.91 1.94 0.35 Alanine racemase-C Bacterial large subunit ribosomal RNA compare
4Y4O_1E_1A 7OF0_E_A 0.76 0.91 1.65 0.36 Alanine racemase-C Bacterial large subunit ribosomal RNA compare