Interface analysis
Style
Protein
CartoonLicorice
Surface
RNA
CartoonLicorice
Surface
Color
ChainChain (with hetatm)
Chainbow
Hydrophobicity Electrostatics (surface only) Conservation*
View
Focus on
InterfaceRNA
Protein
All
Show chains
Interface
show as licoriceshow Accessibility
Rim - Core
Contacts -
| 7RYG_D
|
7RYG_A
|
Distance
|
Base Pair
|
Hbond nuc:res
|
Base Stacking
|
Residue conservation
|
|---|---|---|---|---|---|---|
| D:9 [LYS] | A:2676 [C] | 3.78 | A:2723 [G] | 98.98 | ||
| D:9 [LYS] | A:2677 [C] | 4.17 | 98.98 | |||
| D:12 [MET] | A:2676 [C] | 3.37 | A:2723 [G] | 95.13 | ||
| D:12 [MET] | A:2677 [C] | 3.77 | 95.13 | |||
| D:12 [MET] | A:2678 [U] | 3.32 | 95.13 | |||
| D:13 [THR] | A:2678 [U] | 3.4 | 87.87 | |||
| D:14 [ARG] | A:2678 [U] | 3.66 | 77.61 | |||
| D:14 [ARG] | A:2679 [C] | 3.88 | 77.61 | |||
| D:24 [PRO] | A:2678 [U] | 3.78 | 73.31 | |||
| D:24 [PRO] | A:2724 [U] | 3.55 | A:2675 [A] | 73.31 | ||
| D:24 [PRO] | A:2725 [U] | 4.38 | A:2674 [A] | 73.31 | ||
| D:37 [GLN] | A:2780 [U] | 3.44 | A:2630 [A] | sugar:SC | 49.14 | |
| D:37 [GLN] | A:2781 [U] | 3.44 | A:2629 [A] | sugar:SC | 49.14 | |
| D:39 [LYS] | A:2631 [U] | 3.48 | A:2779 [A] | base:SC | 74.21 | |
| D:39 [LYS] | A:2632 [U] | 4.34 | A:2778 [G] | 74.21 | ||
| D:39 [LYS] | A:2780 [U] | 4.78 | A:2630 [A] | 74.21 | ||
| D:43 [THR] | A:2779 [A] | 4.65 | A:2631 [U] | 62.7 | ||
| D:43 [THR] | A:2780 [U] | 3.59 | A:2630 [A] | 62.7 | ||
| D:43 [THR] | A:2781 [U] | 4.56 | A:2629 [A] | 62.7 | ||
| D:44 [ASP] | A:2779 [A] | 3.96 | A:2631 [U] | sugar:BB | 72.81 | |
| D:44 [ASP] | A:2780 [U] | 3.02 | A:2630 [A] | sugar:SC | 72.81 | |
| D:46 [TYR] | A:2632 [U] | 2.82 | A:2778 [G] | sugar:SC | 67.43 | |
| D:46 [TYR] | A:2633 [U] | 3.98 | A:2772 [A] | 67.43 | ||
| D:50 [GLN] | A:2631 [U] | 3.22 | A:2779 [A] | sugar:SC | 62.4 | |
| D:56 [ARG] | A:2825 [A] | 3.37 | A:2813 [U] | 39.0 | ||
| D:56 [ARG] | A:2826 [C] | 3.09 | A:2812 [G] | 39.0 | ||
| D:57 [ARG] | A:2826 [C] | 3.34 | A:2812 [G] | 48.74 | ||
| D:57 [ARG] | A:2827 [G] | 2.81 | A:2811 [C] | 48.74 | ||
| D:57 [ARG] | A:2830 [G] | 3.32 | A:2879 [A] | 48.74 | ||
| D:57 [ARG] | A:2831 [A] | 3.68 | 48.74 | |||
| D:59 [SER] | A:2827 [G] | 4.54 | A:2811 [C] | 47.38 | ||
| D:60 [ARG] | A:2826 [C] | 3.49 | A:2812 [G] | base/AA stacks | 53.25 | |
| D:60 [ARG] | A:2827 [G] | 3.03 | A:2811 [C] | base:SC | 53.25 | |
| D:61 [VAL] | A:2807 [G] | 4.96 | A:2885 [C] | 39.77 | ||
| D:62 [THR] | A:2629 [A] | 3.57 | A:2781 [U] | sugar:SC | 69.23 | |
| D:62 [THR] | A:2807 [G] | 3.93 | A:2885 [C] | 69.23 | ||
| D:62 [THR] | A:2808 [A] | 4.64 | A:2884 [U] | 69.23 | ||
| D:63 [ASN] | A:2782 [U] | 4.12 | A:2628 [A] | 76.62 | ||
| D:63 [ASN] | A:2783 [C] | 3.46 | A:2627 [G] | 76.62 | ||
| D:63 [ASN] | A:2784 [C] | 4.58 | A:2626 [G] | 76.62 | ||
| D:63 [ASN] | A:2806 [A] | 3.77 | A:2886 [G] | 76.62 | ||
| D:63 [ASN] | A:2807 [G] | 3.07 | A:2885 [C] | 76.62 | ||
| D:64 [ALA] | A:2628 [A] | 4.28 | A:2782 [U] | 60.07 | ||
| D:64 [ALA] | A:2629 [A] | 3.99 | A:2781 [U] | 60.07 | ||
| D:64 [ALA] | A:2782 [U] | 2.65 | A:2628 [A] | sugar:BB | 60.07 | |
| D:64 [ALA] | A:2783 [C] | 3.48 | A:2627 [G] | 60.07 | ||
| D:65 [GLN] | A:2629 [A] | 3.26 | A:2781 [U] | base:SC | 13.17 | |
| D:65 [GLN] | A:2630 [A] | 3.46 | A:2780 [U] | 13.17 | ||
| D:65 [GLN] | A:2782 [U] | 4.73 | A:2628 [A] | 13.17 | ||
| D:67 [GLY] | A:2782 [U] | 3.41 | A:2628 [A] | 68.03 | ||
| D:67 [GLY] | A:2783 [C] | 4.6 | A:2627 [G] | 68.03 | ||
| D:68 [HIS] | A:2781 [U] | 2.96 | A:2629 [A] | sugar:SC | 42.29 | |
| D:68 [HIS] | A:2782 [U] | 3.48 | A:2628 [A] | 42.29 | ||
| D:71 [LYS] | A:2781 [U] | 3.71 | A:2629 [A] | 72.33 | ||
| D:71 [LYS] | A:2782 [U] | 2.91 | A:2628 [A] | 72.33 | ||
| D:80 [VAL] | A:2630 [A] | 4.66 | A:2780 [U] | 53.66 | ||
| D:80 [VAL] | A:2631 [U] | 3.62 | A:2779 [A] | 53.66 | ||
| D:80 [VAL] | A:2632 [U] | 4.99 | A:2778 [G] | 53.66 | ||
| D:81 [LYS] | A:2631 [U] | 4.24 | A:2779 [A] | 41.59 | ||
| D:81 [LYS] | A:2632 [U] | 3.97 | A:2778 [G] | 41.59 | ||
| D:82 [GLU] | A:2631 [U] | 2.18 | A:2779 [A] | sugar:SC | 80.0 | |
| D:82 [GLU] | A:2632 [U] | 3.21 | A:2778 [G] | 80.0 | ||
| D:84 [ARG] | A:2632 [U] | 4.93 | A:2778 [G] | 55.05 | ||
| D:84 [ARG] | A:2633 [U] | 2.89 | A:2772 [A] | 55.05 | ||
| D:84 [ARG] | A:2634 [G] | 3.02 | A:2774 [A] | 55.05 | ||
| D:113 [THR] | A:2769 [U] | 4.52 | A:2637 [A] | 60.34 | ||
| D:115 [GLN] | A:2676 [C] | 4.98 | A:2723 [G] | 59.42 | ||
| D:116 [SER] | A:2675 [A] | 4.19 | A:2724 [U] | 84.96 | ||
| D:116 [SER] | A:2676 [C] | 3.67 | A:2723 [G] | 84.96 | ||
| D:117 [LYS] | A:2676 [C] | 3.14 | A:2723 [G] | 84.55 | ||
| D:117 [LYS] | A:2677 [C] | 2.94 | 84.55 | |||
| D:117 [LYS] | A:2718 [G] | 4.85 | A:2683 [U] | 84.55 | ||
| D:117 [LYS] | A:2719 [C] | 3.14 | A:2682 [G] | 84.55 | ||
| D:117 [LYS] | A:2816 [G] | 3.96 | 84.55 | |||
| D:117 [LYS] | A:2817 [A] | 3.76 | A:2822 [A] | 84.55 | ||
| D:118 [GLY] | A:2817 [A] | 2.66 | A:2822 [A] | 93.75 | ||
| D:118 [GLY] | A:2818 [G] | 3.07 | 93.75 | |||
| D:119 [LYS] | A:1652 [A] | 4.82 | 78.2 | |||
| D:119 [LYS] | A:2676 [C] | 4.66 | A:2723 [G] | 78.2 | ||
| D:119 [LYS] | A:2719 [C] | 4.65 | A:2682 [G] | 78.2 | ||
| D:119 [LYS] | A:2720 [U] | 2.81 | A:2681 [G] | 78.2 | ||
| D:119 [LYS] | A:2818 [G] | 3.71 | 78.2 | |||
| D:120 [GLY] | A:1652 [A] | 4.36 | 98.95 | |||
| D:120 [GLY] | A:2818 [G] | 3.21 | 98.95 | |||
| D:120 [GLY] | A:2819 [A] | 3.6 | 98.95 | |||
| D:121 [PHE] | A:1652 [A] | 2.58 | sugar:BB | 90.96 | ||
| D:121 [PHE] | A:1653 [A] | 3.47 | A:2001 [G] | 90.96 | ||
| D:121 [PHE] | A:2044 [G] | 3.64 | A:2616 [C] | 90.96 | ||
| D:121 [PHE] | A:2045 [G] | 4.52 | A:2615 [C] | 90.96 | ||
| D:121 [PHE] | A:2818 [G] | 4.86 | 90.96 | |||
| D:121 [PHE] | A:2819 [A] | 3.51 | 90.96 | |||
| D:122 [GLN] | A:1652 [A] | 4.62 | 80.24 | |||
| D:122 [GLN] | A:1653 [A] | 3.67 | A:2001 [G] | 80.24 | ||
| D:123 [GLY] | A:1653 [A] | 3.42 | A:2001 [G] | 97.09 | ||
| D:123 [GLY] | A:1654 [C] | 4.49 | A:2000 [G] | 97.09 | ||
| D:125 [VAL] | A:1654 [C] | 4.83 | A:2000 [G] | 80.44 | ||
| D:125 [VAL] | A:1993 [C] | 4.47 | A:1661 [G] | 80.44 | ||
| D:125 [VAL] | A:1994 [A] | 4.13 | A:1660 [U] | 80.44 | ||
| D:126 [LYS] | A:2719 [C] | 4.64 | A:2682 [G] | 91.71 | ||
| D:126 [LYS] | A:2720 [U] | 2.82 | A:2681 [G] | 91.71 | ||
| D:127 [ARG] | A:2616 [C] | 3.08 | A:2044 [G] | sugar:SC | 96.97 | |
| D:127 [ARG] | A:2617 [G] | 2.99 | A:2043 [C] | 96.97 | ||
| D:127 [ARG] | A:2674 [A] | 4.4 | A:2725 [U] | 96.97 | ||
| D:129 [ASN] | A:2508 [C] | 4.84 | A:2570 [G] | 75.24 | ||
| D:129 [ASN] | A:2673 [G] | 3.68 | A:2726 [C] | 75.24 | ||
| D:129 [ASN] | A:2674 [A] | 3.66 | A:2725 [U] | 75.24 | ||
| D:130 [PHE] | A:1993 [C] | 4.94 | A:1661 [G] | 76.86 | ||
| D:130 [PHE] | A:2508 [C] | 3.5 | A:2570 [G] | 76.86 | ||
| D:130 [PHE] | A:2509 [A] | 4.01 | A:2567 [U] | 76.86 | ||
| D:131 [ARG] | A:1993 [C] | 4.13 | A:1661 [G] | 38.76 | ||
| D:131 [ARG] | A:2507 [U] | 3.62 | A:2571 [C] | 38.76 | ||
| D:131 [ARG] | A:2508 [C] | 2.95 | A:2570 [G] | 38.76 | ||
| D:132 [THR] | A:1992 [C] | 4.84 | A:1662 [A] | 81.88 | ||
| D:132 [THR] | A:1993 [C] | 2.42 | A:1661 [G] | 81.88 | ||
| D:132 [THR] | A:2507 [U] | 4.4 | A:2571 [C] | 81.88 | ||
| D:133 [GLN] | A:1990 [C] | 4.31 | A:1664 [G] | 58.7 | ||
| D:133 [GLN] | A:2506 [C] | 4.29 | A:2574 [G] | 58.7 | ||
| D:133 [GLN] | A:2507 [U] | 4.01 | A:2571 [C] | 58.7 | ||
| D:133 [GLN] | A:2574 [G] | 3.5 | A:2506 [C] | 58.7 | ||
| D:133 [GLN] | A:2575 [C] | 3.59 | A:2505 [G] | 58.7 | ||
| D:134 [ASP] | A:1668 [C] | 3.81 | sugar:SC | 72.3 | ||
| D:134 [ASP] | A:1669 [U] | 4.83 | 72.3 | |||
| D:134 [ASP] | A:1989 [U] | 4.49 | A:1667 [A] | 72.3 | ||
| D:134 [ASP] | A:1990 [C] | 3.69 | A:1664 [G] | 72.3 | ||
| D:135 [ALA] | A:1989 [U] | 4.2 | A:1667 [A] | 70.79 | ||
| D:135 [ALA] | A:1990 [C] | 3.04 | A:1664 [G] | 70.79 | ||
| D:136 [THR] | A:1673 [C] | 3.21 | base:SC | 80.76 | ||
| D:136 [THR] | A:1674 [A] | 4.14 | 80.76 | |||
| D:136 [THR] | A:1989 [U] | 3.32 | A:1667 [A] | 80.76 | ||
| D:136 [THR] | A:1990 [C] | 4.92 | A:1664 [G] | 80.76 | ||
| D:137 [HIS] | A:1668 [C] | 3.12 | base:SC | 93.82 | ||
| D:137 [HIS] | A:1669 [U] | 4.24 | 93.82 | |||
| D:137 [HIS] | A:1671 [G] | 3.03 | base:SC | 93.82 | ||
| D:137 [HIS] | A:1673 [C] | 3.23 | base:BB | base/AA stacks | 93.82 | |
| D:137 [HIS] | A:1989 [U] | 3.95 | A:1667 [A] | 93.82 | ||
| D:137 [HIS] | A:2576 [PSU] | 4.07 | A:2504 [G] | 93.82 | ||
| D:137 [HIS] | A:2577 [G] | 4.69 | 93.82 | |||
| D:138 [GLY] | A:741 [U] | 3.61 | A:752 [C] | 91.84 | ||
| D:138 [GLY] | A:2575 [C] | 4.7 | A:2505 [G] | 91.84 | ||
| D:138 [GLY] | A:2576 [PSU] | 3.03 | A:2504 [G] | 91.84 | ||
| D:138 [GLY] | A:2577 [G] | 4.2 | 91.84 | |||
| D:139 [ASN] | A:741 [U] | 4.92 | A:752 [C] | 45.4 | ||
| D:139 [ASN] | A:742 [C] | 4.37 | A:751 [G] | 45.4 | ||
| D:139 [ASN] | A:2575 [C] | 3.79 | A:2505 [G] | 45.4 | ||
| D:139 [ASN] | A:2576 [PSU] | 4.37 | A:2504 [G] | 45.4 | ||
| D:140 [SER] | A:741 [U] | 4.64 | A:752 [C] | 79.42 | ||
| D:140 [SER] | A:742 [C] | 2.68 | A:751 [G] | 79.42 | ||
| D:140 [SER] | A:1655 [U] | 4.67 | A:1999 [A] | 79.42 | ||
| D:140 [SER] | A:1656 [C] | 3.11 | A:1998 [G] | 79.42 | ||
| D:140 [SER] | A:2575 [C] | 3.79 | A:2505 [G] | 79.42 | ||
| D:140 [SER] | A:2576 [PSU] | 2.59 | A:2504 [G] | 79.42 | ||
| D:141 [VAL] | A:742 [C] | 4.39 | A:751 [G] | 45.26 | ||
| D:141 [VAL] | A:1655 [U] | 3.3 | A:1999 [A] | 45.26 | ||
| D:141 [VAL] | A:1656 [C] | 3.91 | A:1998 [G] | 45.26 | ||
| D:142 [SER] | A:1655 [U] | 4.41 | A:1999 [A] | 63.69 | ||
| D:142 [SER] | A:2574 [G] | 3.67 | A:2506 [C] | sugar:SC | 63.69 | |
| D:142 [SER] | A:2575 [C] | 3.23 | A:2505 [G] | 63.69 | ||
| D:143 [HIS] | A:1655 [U] | 3.43 | A:1999 [A] | 80.42 | ||
| D:143 [HIS] | A:1656 [C] | 3.68 | A:1998 [G] | 80.42 | ||
| D:144 [ARG] | A:1654 [C] | 2.99 | A:2000 [G] | 95.27 | ||
| D:144 [ARG] | A:1655 [U] | 2.75 | A:1999 [A] | 95.27 | ||
| D:144 [ARG] | A:1994 [A] | 3.23 | A:1660 [U] | 95.27 | ||
| D:145 [VAL] | A:1654 [C] | 4.18 | A:2000 [G] | 35.05 | ||
| D:145 [VAL] | A:1655 [U] | 4.04 | A:1999 [A] | 35.05 | ||
| D:145 [VAL] | A:2047 [U] | 4.92 | 35.05 | |||
| D:145 [VAL] | A:2507 [U] | 4.59 | A:2571 [C] | 35.05 | ||
| D:145 [VAL] | A:2574 [G] | 4.24 | A:2506 [C] | 35.05 | ||
| D:146 [LEU] | A:2046 [C] | 3.92 | A:2614 [A] | 41.37 | ||
| D:146 [LEU] | A:2507 [U] | 2.99 | A:2571 [C] | sugar:BB | 41.37 | |
| D:146 [LEU] | A:2508 [C] | 4.02 | A:2570 [G] | 41.37 | ||
| D:147 [GLY] | A:2047 [U] | 4.08 | 94.43 | |||
| D:147 [GLY] | A:2048 [A] | 4.34 | A:2613 [U] | 94.43 | ||
| D:147 [GLY] | A:2507 [U] | 4.03 | A:2571 [C] | 94.43 | ||
| D:147 [GLY] | A:2574 [G] | 3.69 | A:2506 [C] | 94.43 | ||
| D:148 [SER] | A:2048 [A] | 3.83 | A:2613 [U] | 93.55 | ||
| D:148 [SER] | A:2507 [U] | 3.23 | A:2571 [C] | base:BB | 93.55 | |
| D:148 [SER] | A:2508 [C] | 3.4 | A:2570 [G] | sugar:BB | 93.55 | |
| D:148 [SER] | A:2570 [G] | 3.39 | A:2508 [C] | 93.55 | ||
| D:148 [SER] | A:2571 [C] | 3.07 | A:2507 [U] | sugar:SC | 93.55 | |
| D:148 [SER] | A:2574 [G] | 3.5 | A:2506 [C] | 93.55 | ||
| D:149 [THR] | A:2046 [C] | 4.0 | A:2614 [A] | 76.23 | ||
| D:149 [THR] | A:2047 [U] | 3.62 | 76.23 | |||
| D:149 [THR] | A:2048 [A] | 2.37 | A:2613 [U] | 76.23 | ||
| D:149 [THR] | A:2508 [C] | 4.93 | A:2570 [G] | 76.23 | ||
| D:150 [GLY] | A:2048 [A] | 3.62 | A:2613 [U] | 91.01 | ||
| D:150 [GLY] | A:2570 [G] | 3.69 | A:2508 [C] | 91.01 | ||
| D:150 [GLY] | A:2571 [C] | 3.71 | A:2507 [U] | 91.01 | ||
| D:151 [GLN] | A:2048 [A] | 2.99 | A:2613 [U] | sugar:BB | 54.6 | |
| D:151 [GLN] | A:2049 [G] | 4.43 | A:2612 [C] | 54.6 | ||
| D:151 [GLN] | A:2509 [A] | 3.02 | A:2567 [U] | base:SC | 54.6 | |
| D:151 [GLN] | A:2510 [U] | 4.79 | A:2566 [G] | 54.6 | ||
| D:151 [GLN] | A:2567 [U] | 3.62 | A:2509 [A] | 54.6 | ||
| D:151 [GLN] | A:2568 [A] | 4.34 | 54.6 | |||
| D:151 [GLN] | A:2570 [G] | 3.5 | A:2508 [C] | 54.6 | ||
| D:151 [GLN] | A:2571 [C] | 4.57 | A:2507 [U] | 54.6 | ||
| D:152 [ASN] | A:2048 [A] | 4.02 | A:2613 [U] | 37.74 | ||
| D:152 [ASN] | A:2049 [G] | 2.71 | A:2612 [C] | 37.74 | ||
| D:152 [ASN] | A:2568 [A] | 3.29 | sugar:SC | base/AA stacks | 37.74 | |
| D:152 [ASN] | A:2570 [G] | 3.08 | A:2508 [C] | sugar:BB | 37.74 | |
| D:152 [ASN] | A:2571 [C] | 3.19 | A:2507 [U] | 37.74 | ||
| D:153 [GLN] | A:572 [A] | 3.54 | 66.22 | |||
| D:153 [GLN] | A:2028 [G] | 2.71 | sugar:SC | base/AA stacks | 66.22 | |
| D:153 [GLN] | A:2048 [A] | 4.95 | A:2613 [U] | 66.22 | ||
| D:153 [GLN] | A:2049 [G] | 3.97 | A:2612 [C] | 66.22 | ||
| D:153 [GLN] | A:2568 [A] | 3.19 | base:SC | 66.22 | ||
| D:154 [THR] | A:1127 [U] | 3.82 | 46.29 | |||
| D:154 [THR] | A:2028 [G] | 2.99 | base:SC | 46.29 | ||
| D:154 [THR] | A:2567 [U] | 2.8 | A:2509 [A] | sugar:BB | 46.29 | |
| D:154 [THR] | A:2568 [A] | 3.24 | 46.29 | |||
| D:155 [PRO] | A:1127 [U] | 3.22 | 81.94 | |||
| D:155 [PRO] | A:2021 [C] | 4.11 | A:2034 [G] | 81.94 | ||
| D:155 [PRO] | A:2567 [U] | 4.48 | A:2509 [A] | 81.94 | ||
| D:156 [GLY] | A:2048 [A] | 3.41 | A:2613 [U] | 66.21 | ||
| D:156 [GLY] | A:2049 [G] | 3.57 | A:2612 [C] | 66.21 | ||
| D:157 [ARG] | A:1127 [U] | 2.94 | base:SC | 84.5 | ||
| D:157 [ARG] | A:1128 [G] | 4.6 | 84.5 | |||
| D:157 [ARG] | A:2020 [G] | 3.39 | A:2035 [U] | 84.5 | ||
| D:157 [ARG] | A:2021 [C] | 3.13 | A:2034 [G] | 84.5 | ||
| D:157 [ARG] | A:2048 [A] | 3.28 | A:2613 [U] | 84.5 | ||
| D:157 [ARG] | A:2049 [G] | 4.7 | A:2612 [C] | 84.5 | ||
| D:157 [ARG] | A:2614 [A] | 3.8 | A:2046 [C] | 84.5 | ||
| D:158 [VAL] | A:2048 [A] | 3.65 | A:2613 [U] | 89.49 | ||
| D:158 [VAL] | A:2614 [A] | 2.65 | A:2046 [C] | sugar:BB, sugar:BB | 89.49 | |
| D:158 [VAL] | A:2615 [C] | 3.22 | A:2045 [G] | 89.49 | ||
| D:159 [PHE] | A:1127 [U] | 4.46 | 4.72 | |||
| D:159 [PHE] | A:2510 [U] | 4.05 | A:2566 [G] | 4.72 | ||
| D:159 [PHE] | A:2614 [A] | 4.76 | A:2046 [C] | 4.72 | ||
| D:159 [PHE] | A:2615 [C] | 3.46 | A:2045 [G] | 4.72 | ||
| D:160 [LYS] | A:2615 [C] | 3.22 | A:2045 [G] | 81.33 | ||
| D:160 [LYS] | A:2616 [C] | 3.95 | A:2044 [G] | 81.33 | ||
| D:161 [GLY] | A:2615 [C] | 3.85 | A:2045 [G] | 88.98 | ||
| D:161 [GLY] | A:2616 [C] | 3.02 | A:2044 [G] | 88.98 | ||
| D:162 [LYS] | A:2508 [C] | 3.3 | A:2570 [G] | sugar:SC | 74.73 | |
| D:162 [LYS] | A:2509 [A] | 4.51 | A:2567 [U] | 74.73 | ||
| D:162 [LYS] | A:2615 [C] | 3.92 | A:2045 [G] | 74.73 | ||
| D:162 [LYS] | A:2616 [C] | 3.21 | A:2044 [G] | 74.73 | ||
| D:163 [LYS] | A:2509 [A] | 4.06 | A:2567 [U] | 76.83 | ||
| D:164 [MET] | A:2045 [G] | 3.82 | A:2615 [C] | 92.15 | ||
| D:164 [MET] | A:2046 [C] | 3.78 | A:2614 [A] | 92.15 | ||
| D:164 [MET] | A:2615 [C] | 3.49 | A:2045 [G] | 92.15 | ||
| D:164 [MET] | A:2616 [C] | 3.41 | A:2044 [G] | 92.15 | ||
| D:165 [ALA] | A:1653 [A] | 3.7 | A:2001 [G] | 71.21 | ||
| D:165 [ALA] | A:2044 [G] | 4.46 | A:2616 [C] | 71.21 | ||
| D:165 [ALA] | A:2045 [G] | 4.82 | A:2615 [C] | 71.21 | ||
| D:165 [ALA] | A:2616 [C] | 3.17 | A:2044 [G] | 71.21 | ||
| D:165 [ALA] | A:2617 [G] | 4.86 | A:2043 [C] | 71.21 | ||
| D:166 [GLY] | A:2616 [C] | 4.33 | A:2044 [G] | 94.76 | ||
| D:166 [GLY] | A:2617 [G] | 4.37 | A:2043 [C] | 94.76 | ||
| D:167 [HIS] | A:2617 [G] | 3.53 | A:2043 [C] | sugar:BB | 76.41 | |
| D:167 [HIS] | A:2618 [U] | 3.67 | A:2042 [G] | 76.41 | ||
| D:167 [HIS] | A:2817 [A] | 4.55 | A:2822 [A] | 76.41 | ||
| D:167 [HIS] | A:2818 [G] | 2.64 | 76.41 | |||
| D:168 [LEU] | A:2675 [A] | 4.79 | A:2724 [U] | 76.6 | ||
| D:168 [LEU] | A:2818 [G] | 4.38 | 76.6 | |||
| D:170 [ASP] | A:2817 [A] | 4.0 | A:2822 [A] | 38.62 | ||
| D:170 [ASP] | A:2818 [G] | 4.21 | 38.62 | |||
| D:172 [ARG] | A:2768 [C] | 4.99 | A:2638 [G] | 42.69 | ||
| D:172 [ARG] | A:2769 [U] | 2.55 | A:2637 [A] | 42.69 | ||
| D:172 [ARG] | A:2770 [C] | 3.65 | A:2636 [G] | 42.69 | ||
| D:173 [VAL] | A:2674 [A] | 4.58 | A:2725 [U] | 51.42 | ||
| D:173 [VAL] | A:2675 [A] | 4.32 | A:2724 [U] | 51.42 | ||
| D:173 [VAL] | A:2769 [U] | 4.79 | A:2637 [A] | 51.42 | ||
| D:174 [THR] | A:2768 [C] | 3.59 | A:2638 [G] | 89.54 | ||
| D:174 [THR] | A:2769 [U] | 2.76 | A:2637 [A] | 89.54 | ||
| D:175 [VAL] | A:2675 [A] | 4.76 | A:2724 [U] | 58.31 | ||
| D:175 [VAL] | A:2726 [C] | 4.06 | A:2673 [G] | 58.31 | ||
| D:176 [GLN] | A:2726 [C] | 3.09 | A:2673 [G] | sugar:BB | 49.7 | |
| D:176 [GLN] | A:2727 [G] | 4.29 | A:2672 [C] | 49.7 | ||
| D:176 [GLN] | A:2767 [C] | 3.38 | A:2639 [G] | sugar:SC | 49.7 | |
| D:176 [GLN] | A:2768 [C] | 3.9 | A:2638 [G] | 49.7 | ||
| D:177 [GLY] | A:2726 [C] | 3.66 | A:2673 [G] | 80.64 | ||
| D:177 [GLY] | A:2727 [G] | 3.81 | A:2672 [C] | 80.64 | ||
| D:178 [LEU] | A:2725 [U] | 4.06 | A:2674 [A] | 60.09 | ||
| D:178 [LEU] | A:2726 [C] | 4.09 | A:2673 [G] | 60.09 | ||
| D:193 [LYS] | A:2725 [U] | 3.42 | A:2674 [A] | 63.81 | ||
| D:193 [LYS] | A:2726 [C] | 3.73 | A:2673 [G] | 63.81 | ||
| D:194 [GLY] | A:2725 [U] | 3.8 | A:2674 [A] | 98.25 | ||
| D:195 [ALA] | A:2675 [A] | 4.66 | A:2724 [U] | 66.43 | ||
| D:195 [ALA] | A:2676 [C] | 3.99 | A:2723 [G] | 66.43 | ||
| D:195 [ALA] | A:2725 [U] | 4.31 | A:2674 [A] | 66.43 | ||
| D:196 [ILE] | A:2675 [A] | 4.05 | A:2724 [U] | 81.34 | ||
| D:196 [ILE] | A:2676 [C] | 3.62 | A:2723 [G] | 81.34 | ||
| D:197 [PRO] | A:2675 [A] | 3.66 | A:2724 [U] | 92.49 | ||
| D:197 [PRO] | A:2676 [C] | 4.13 | A:2723 [G] | 92.49 | ||
| D:198 [GLY] | A:2675 [A] | 4.42 | A:2724 [U] | 97.48 | ||
| D:198 [GLY] | A:2676 [C] | 3.39 | A:2723 [G] | 97.48 | ||
| D:198 [GLY] | A:2677 [C] | 4.5 | 97.48 | |||
| D:199 [ALA] | A:2816 [G] | 3.9 | 45.21 | |||
| D:199 [ALA] | A:2817 [A] | 4.6 | A:2822 [A] | 45.21 | ||
| D:200 [THR] | A:2816 [G] | 3.11 | 39.26 | |||
| D:201 [GLY] | A:2816 [G] | 4.47 | 62.27 | |||
| D:210 [ILE] | A:2767 [C] | 4.02 | A:2639 [G] | 0.24 | ||
| D:210 [ILE] | A:2768 [C] | 4.45 | A:2638 [G] | 0.24 | ||
| D:211 [LYS] | A:2727 [G] | 3.34 | A:2672 [C] | 58.93 | ||
| D:211 [LYS] | A:2728 [G] | 3.33 | A:2671 [A] | 58.93 | ||
| D:211 [LYS] | A:2729 [A] | 3.7 | 58.93 | |||
| D:211 [LYS] | A:2767 [C] | 4.04 | A:2639 [G] | 58.93 | ||
| D:212 [ALA] | A:2729 [A] | 4.17 | 50.79 | |||
| D:212 [ALA] | A:2730 [A] | 4.85 | 50.79 |
Export the table of contacts
*Conservation was calculated using Rate4Site
NB: conservation is missing (completly white) for a very small minority of cases in which no homologous sequences were found (e.g. synthetic proteins 7D3J_A & 7EU9_A)
Properties of this interface
| Interolog group ID | Structure ID |
Structure description |
UniProt ID |
ECOD label(s) |
RFAM label(s) |
Is ribosome? | RCSB PDB link |
|---|---|---|---|---|---|---|---|
| group129 | 7RYG_D_A | D: 50s ribosomal protein l3, Acinetobacter baumannii (strain ab0057) (natural) A: 23s ribosomal RNA, Acinetobacter baumannii ab0057 (natural) | B7IA39 | Alanine racemase-C | Bacterial large subunit ribosomal RNA | ✔ |
|
Interologs
Total number of interologs for this interface: 8
| Interface 1 | Interface 2 |
Percentage conservation |
Interface TM-score |
Interface RMSD |
Percentage identity |
Common ECOD label(s) |
Common RFAM label(s) |
Explore both interfaces |
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| 1YHQ_B_0 | 7RYG_D_A | 0.66 | 0.92 | 2.66 | 0.29 | Alanine racemase-C | compare | |
| 6AZ3_B_1 | 7RYG_D_A | 0.73 | 0.65 | 1.88 | 0.29 | Alanine racemase-C | compare | |
| 7K00_d_a | 7RYG_D_A | 0.95 | 0.99 | 1.46 | 0.76 | Alanine racemase-C | Bacterial large subunit ribosomal RNA | compare |
| 1VQ8_B_0 | 7RYG_D_A | 0.64 | 0.92 | 2.83 | 0.29 | Alanine racemase-C | compare | |
| 7OF0_E_A | 7RYG_D_A | 0.76 | 0.88 | 2.28 | 0.35 | Alanine racemase-C | Bacterial large subunit ribosomal RNA | compare |
| 6S0Z_D_A | 7RYG_D_A | 0.84 | 0.98 | 1.08 | 0.51 | Alanine racemase-C | Bacterial large subunit ribosomal RNA | compare |
| 6AZ3_B_4 | 7RYG_D_A | 0.53 | 0.59 | 3.16 | 0.14 | Alanine racemase-C | compare | |
| 4Y4O_1E_1A | 7RYG_D_A | 0.89 | 0.96 | 1.71 | 0.58 | Alanine racemase-C | Bacterial large subunit ribosomal RNA | compare |