Interface analysis
Style
Protein
CartoonLicorice
Surface
RNA
CartoonLicorice
Surface
Color
StructureStructure (with hetatm)
Chain
Chainbow
View
Focus on
InterfaceRNA
Protein
All
Show chains
Interface
show interface as licoriceCommon contacts -
3OL9_A
|
3OL9_B,C
|
7AAP_A
|
7AAP_T
|
Conserved?
|
---|---|---|---|---|
A:210 [VAL] | B:602 [C] | A:589 [ILE] | T:12 [U] | ✔ |
A:210 [VAL] | B:603 [U] | A:589 [ILE] | T:13 [A] | ✔ |
A:214 [PRO] | B:604 [C] | A:593 [LYS] | T:14 [A] | ✔ |
A:289 [GLY] | B:600 [G] | A:683 [GLY] | T:10 [C] | ✔ |
A:289 [GLY] | B:601 [U] | A:683 [GLY] | T:11 [A] | ✔ |
A:177 [GLU] | B:600 [G] | A:558 [ALA] | T:10 [C] | ✔ |
A:20 [PRO] | B:598 [A] | A:408 [GLN] | T:8 [U] | ✔ |
A:178 [ALA] | B:600 [G] | A:559 [GLY] | T:10 [C] | ✔ |
A:115 [SER] | B:599 [G] | A:501 [SER] | T:9 [U] | ✔ |
A:115 [SER] | B:600 [G] | A:501 [SER] | T:10 [C] | ✔ |
A:115 [SER] | B:601 [U] | A:501 [SER] | T:11 [A] | ✔ |
A:157 [TYR] | B:599 [G] | A:543 [ASN] | T:9 [U] | ✔ |
A:211 [GLY] | B:603 [U] | A:590 [GLY] | T:13 [A] | ✔ |
A:211 [GLY] | B:604 [C] | A:590 [GLY] | T:14 [A] | ✔ |
A:121 [VAL] | B:599 [G] | A:507 [ASN] | T:9 [U] | ✔ |
A:199 [HIS] | B:603 [U] | A:580 [ALA] | T:13 [A] | ✔ |
A:412 [ASP] | B:607 [G] | A:857 [GLU] | T:17 [U] | ✔ |
A:213 [ASP] | B:604 [C] | A:592 [SER] | T:14 [A] | ✔ |
A:213 [ASP] | B:605 [U] | A:592 [SER] | T:15 [C] | ✔ |
A:456 [ARG] | B:606 [C] | A:924 [MET] | T:16 [U] | ✔ |
A:419 [LEU] | B:605 [U] | A:864 [ILE] | T:15 [C] | ✔ |
A:419 [LEU] | B:606 [C] | A:864 [ILE] | T:16 [U] | ✔ |
A:212 [CYS] | B:603 [U] | A:591 [THR] | T:13 [A] | ✔ |
A:212 [CYS] | B:604 [C] | A:591 [THR] | T:14 [A] | ✔ |
A:188 [ARG] | B:602 [C] | A:569 [ARG] | T:12 [U] | ✔ |
A:416 [SER] | B:606 [C] | A:861 [SER] | T:16 [U] | ✔ |
A:288 [SER] | B:600 [G] | A:682 [SER] | T:10 [C] | ✔ |
A:288 [SER] | B:601 [U] | A:682 [SER] | T:11 [A] | ✔ |
A:294 [SER] | B:602 [C] | A:688 [ALA] | T:12 [U] | ✔ |
A:291 [SER] | B:601 [U] | A:685 [ALA] | T:11 [A] | ✔ |
A:291 [SER] | B:602 [C] | A:685 [ALA] | T:12 [U] | ✔ |
A:176 [ILE] | B:599 [G] | A:557 [VAL] | T:9 [U] | ✔ |
A:176 [ILE] | B:600 [G] | A:557 [VAL] | T:10 [C] | ✔ |
A:111 [ASP] | B:601 [U] | A:497 [ASN] | T:11 [A] | ✔ |
A:114 [THR] | B:600 [G] | A:500 [LYS] | T:10 [C] | ✔ |
A:114 [THR] | B:601 [U] | A:500 [LYS] | T:11 [A] | ✔ |
A:415 [ARG] | B:606 [C] | A:860 [VAL] | T:16 [U] | ✔ |
A:293 [THR] | B:601 [U] | A:687 [THR] | T:11 [A] | ✔ |
A:290 [CYS] | B:601 [U] | A:684 [ASP] | T:11 [A] | ✔ |
A:292 [GLY] | B:601 [U] | A:686 [THR] | T:11 [A] | ✔ |
A:110 [LEU] | B:602 [C] | A:496 [ASN] | T:12 [U] | ✔ |
A:179 [SER] | B:600 [G] | A:560 [VAL] | T:10 [C] | ✔ |
A:159 [LYS] | B:600 [G] | A:545 [LYS] | T:10 [C] | ✔ |
A:20 [PRO] | B:599 [G] | A:408 [GLN] | T:9 [U] | ❌ 7AAP_A_T |
A:199 [HIS] | B:602 [C] | A:580 [ALA] | T:12 [U] | ❌ 7AAP_A_T |
A:456 [ARG] | B:607 [G] | A:924 [MET] | T:17 [U] | ❌ 7AAP_A_T |
A:294 [SER] | B:601 [U] | A:688 [ALA] | T:11 [A] | ❌ 7AAP_A_T |
A:111 [ASP] | B:602 [C] | A:497 [ASN] | T:12 [U] | ❌ 7AAP_A_T |
A:415 [ARG] | B:607 [G] | A:860 [VAL] | T:17 [U] | ❌ 7AAP_A_T |
A:290 [CYS] | B:600 [G] | A:684 [ASP] | T:10 [C] | ❌ 7AAP_A_T |
A:110 [LEU] | B:601 [U] | A:496 [ASN] | T:11 [A] | ❌ 7AAP_A_T |
A:179 [SER] | B:601 [U] | A:560 [VAL] | T:11 [A] | ❌ 7AAP_A_T |
A:110 [LEU] | B:603 [U] | A:496 [ASN] | T:13 [A] | ❌ 3OL9_A_B,C |
A:121 [VAL] | B:598 [A] | A:507 [ASN] | T:8 [U] | ❌ 3OL9_A_B,C |
A:126 [LYS] | B:599 [G] | A:511 [LYS] | T:9 [U] | ❌ 3OL9_A_B,C |
A:157 [TYR] | B:598 [A] | A:543 [ASN] | T:8 [U] | ❌ 3OL9_A_B,C |
A:188 [ARG] | B:601 [U] | A:569 [ARG] | T:11 [A] | ❌ 3OL9_A_B,C |
A:199 [HIS] | B:604 [C] | A:580 [ALA] | T:14 [A] | ❌ 3OL9_A_B,C |
A:456 [ARG] | B:605 [U] | A:924 [MET] | T:15 [C] | ❌ 3OL9_A_B,C |
A:447 [LEU] | B:608 [U] | A:915 [TYR] | T:18 [A] | ❌ 3OL9_A:447, 3OL9_B:608 no longer at interface |
A:109 [ALA] | B:602 [C] | A:495 [VAL] | T:12 [U] | ❌ 7AAP_A:495 no longer at interface |
A:24 [LYS] | B:598 [A] | A:412 [PRO] | T:8 [U] | ❌ 7AAP_A:412 no longer at interface |
A:24 [LYS] | B:599 [G] | A:412 [PRO] | T:9 [U] | ❌ 7AAP_A:412 no longer at interface |
A:19 [ALA] | B:598 [A] | A:407 [PHE] | T:8 [U] | ❌ 7AAP_A:407 no longer at interface |
A:209 [ALA] | B:603 [U] | A:588 [VAL] | T:13 [A] | ❌ 7AAP_A:588 no longer at interface |
A:160 [ASP] | B:599 [G] | A:546 [TYR] | T:9 [U] | ❌ 7AAP_A:546 no longer at interface |
A:22 [LYS] | B:598 [A] | A:410 [VAL] | T:8 [U] | ❌ 7AAP_A:410 no longer at interface |
A:22 [LYS] | B:599 [G] | A:410 [VAL] | T:9 [U] | ❌ 7AAP_A:410 no longer at interface |
A:184 [SER] | B:601 [U] | A:565 [THR] | T:11 [A] | ❌ 7AAP_A:565 no longer at interface |
A:23 [THR] | B:599 [G] | A:411 [LYS] | T:9 [U] | ❌ 7AAP_A:411 no longer at interface |
A:127 [LYS] | B:600 [G] | A:512 [ALA] | T:10 [C] | ❌ 7AAP_A:512 no longer at interface |
A:127 [LYS] | B:601 [U] | A:512 [ALA] | T:11 [A] | ❌ 7AAP_A:512 no longer at interface |
A:18 [ASN] | B:598 [A] | A:406 [ALA] | T:8 [U] | ❌ 7AAP_A:406 no longer at interface |
A:326 [TYR] | B:602 [C] | A:758 [LEU] | T:12 [U] | ❌ 7AAP_A:758 no longer at interface |
A:326 [TYR] | B:603 [U] | A:758 [LEU] | T:13 [A] | ❌ 7AAP_A:758 no longer at interface |
A:113 [SER] | B:600 [G] | A:499 [ASP] | T:10 [C] | ❌ 7AAP_A:499 no longer at interface |
A:43 [LEU] | B:599 [G] | A:444 [GLN] | T:9 [U] | ❌ 7AAP_A:444 no longer at interface |
A:155 [VAL] | B:599 [G] | A:541 [GLN] | T:9 [U] | ❌ 3OL9_A:155 no longer at interface |
A:155 [VAL] | B:598 [A] | A:541 [GLN] | T:8 [U] | ❌ 3OL9_A:155 no longer at interface |
A:158 [VAL] | B:599 [G] | A:544 [LEU] | T:9 [U] | ❌ 3OL9_A:158 no longer at interface |
A:196 [ALA] | B:602 [C] | A:577 [LYS] | T:12 [U] | ❌ 3OL9_A:196 no longer at interface |
A:196 [ALA] | B:603 [U] | A:577 [LYS] | T:13 [A] | ❌ 3OL9_A:196 no longer at interface |
A:202 [PRO] | B:604 [C] | A:583 [ARG] | T:14 [A] | ❌ 3OL9_A:202 no longer at interface |
A:215 [ASP] | B:604 [C] | A:594 [PHE] | T:14 [A] | ❌ 3OL9_A:215 no longer at interface |
A:215 [ASP] | B:605 [U] | A:594 [PHE] | T:15 [C] | ❌ 3OL9_A:215 no longer at interface |
A:295 [ILE] | B:602 [C] | A:689 [TYR] | T:12 [U] | ❌ 3OL9_A:295 no longer at interface |
A:295 [ILE] | B:603 [U] | A:689 [TYR] | T:13 [A] | ❌ 3OL9_A:295 no longer at interface |
A:447 [LEU] | B:607 [G] | A:915 [TYR] | T:17 [U] | ❌ 3OL9_A:447 no longer at interface |
A:452 [THR] | B:607 [G] | A:920 [PHE] | T:17 [U] | ❌ 3OL9_A:452 no longer at interface |
A:452 [THR] | B:606 [C] | A:920 [PHE] | T:16 [U] | ❌ 3OL9_A:452 no longer at interface |
Properties of this pair
Common ECOD label(s) |
Common RFAM label(s) |
Interface TM-score |
Interface RMSD |
Percentage identity |
Protein TM-score |
RNA TM-score |
Protein coverage |
RNA coverage |
Percentage conservation |
Apolar conservation |
H-bond conservation |
Percentage switching out |
---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
Adenylyl and guanylyl cyclase catalytic domain-like | 0.79 | 1.81 | 0.00 | 0.81 | 0.52 | 0.76 | 0.91 | 0.68 | 0.57 | 0.33 | 0.66 |
Other pairs involving 3OL9_A_B,C or 7AAP_A_T
Total number of entries: 18