Interface analysis
Style
Protein
CartoonLicorice
Surface
RNA
CartoonLicorice
Surface
Color
StructureStructure (with hetatm)
Chain
Chainbow
View
Focus on
InterfaceRNA
Protein
All
Show chains
Interface
show interface as licoriceCommon contacts -
7AAP_A
|
7AAP_T
|
7BV2_A
|
7BV2_T
|
Conserved?
|
---|---|---|---|---|
A:864 [ILE] | T:15 [C] | A:864 [ILE] | T:15 [C] | ✔ |
A:864 [ILE] | T:16 [U] | A:864 [ILE] | T:16 [U] | ✔ |
A:861 [SER] | T:16 [U] | A:861 [SER] | T:16 [U] | ✔ |
A:511 [LYS] | T:9 [U] | A:511 [LYS] | T:9 [U] | ✔ |
A:559 [GLY] | T:10 [C] | A:559 [GLY] | T:10 [U] | ✔ |
A:857 [GLU] | T:17 [U] | A:857 [GLU] | T:17 [U] | ✔ |
A:569 [ARG] | T:11 [A] | A:569 [ARG] | T:11 [A] | ✔ |
A:569 [ARG] | T:12 [U] | A:569 [ARG] | T:12 [U] | ✔ |
A:544 [LEU] | T:9 [U] | A:544 [LEU] | T:9 [U] | ✔ |
A:541 [GLN] | T:8 [U] | A:541 [GLN] | T:8 [U] | ✔ |
A:541 [GLN] | T:9 [U] | A:541 [GLN] | T:9 [U] | ✔ |
A:496 [ASN] | T:12 [U] | A:496 [ASN] | T:12 [U] | ✔ |
A:496 [ASN] | T:13 [A] | A:496 [ASN] | T:13 [A] | ✔ |
A:545 [LYS] | T:10 [C] | A:545 [LYS] | T:10 [U] | ✔ |
A:543 [ASN] | T:8 [U] | A:543 [ASN] | T:8 [U] | ✔ |
A:543 [ASN] | T:9 [U] | A:543 [ASN] | T:9 [U] | ✔ |
A:580 [ALA] | T:13 [A] | A:580 [ALA] | T:13 [A] | ✔ |
A:580 [ALA] | T:14 [A] | A:580 [ALA] | T:14 [A] | ✔ |
A:860 [VAL] | T:16 [U] | A:860 [VAL] | T:16 [U] | ✔ |
A:684 [ASP] | T:11 [A] | A:684 [ASP] | T:11 [A] | ✔ |
A:685 [ALA] | T:11 [A] | A:685 [ALA] | T:11 [A] | ✔ |
A:685 [ALA] | T:12 [U] | A:685 [ALA] | T:12 [U] | ✔ |
A:590 [GLY] | T:13 [A] | A:590 [GLY] | T:13 [A] | ✔ |
A:590 [GLY] | T:14 [A] | A:590 [GLY] | T:14 [A] | ✔ |
A:595 [TYR] | T:15 [C] | A:595 [TYR] | T:15 [C] | ✔ |
A:595 [TYR] | T:16 [U] | A:595 [TYR] | T:16 [U] | ✔ |
A:592 [SER] | T:14 [A] | A:592 [SER] | T:14 [A] | ✔ |
A:592 [SER] | T:15 [C] | A:592 [SER] | T:15 [C] | ✔ |
A:686 [THR] | T:11 [A] | A:686 [THR] | T:11 [A] | ✔ |
A:683 [GLY] | T:10 [C] | A:683 [GLY] | T:10 [U] | ✔ |
A:683 [GLY] | T:11 [A] | A:683 [GLY] | T:11 [A] | ✔ |
A:501 [SER] | T:9 [U] | A:501 [SER] | T:9 [U] | ✔ |
A:501 [SER] | T:10 [C] | A:501 [SER] | T:10 [U] | ✔ |
A:501 [SER] | T:11 [A] | A:501 [SER] | T:11 [A] | ✔ |
A:507 [ASN] | T:8 [U] | A:507 [ASN] | T:8 [U] | ✔ |
A:507 [ASN] | T:9 [U] | A:507 [ASN] | T:9 [U] | ✔ |
A:682 [SER] | T:10 [C] | A:682 [SER] | T:10 [U] | ✔ |
A:682 [SER] | T:11 [A] | A:682 [SER] | T:11 [A] | ✔ |
A:558 [ALA] | T:10 [C] | A:558 [ALA] | T:10 [U] | ✔ |
A:915 [TYR] | T:17 [U] | A:915 [TYR] | T:17 [U] | ✔ |
A:560 [VAL] | T:10 [C] | A:560 [VAL] | T:10 [U] | ✔ |
A:557 [VAL] | T:9 [U] | A:557 [VAL] | T:9 [U] | ✔ |
A:557 [VAL] | T:10 [C] | A:557 [VAL] | T:10 [U] | ✔ |
A:591 [THR] | T:13 [A] | A:591 [THR] | T:13 [A] | ✔ |
A:591 [THR] | T:14 [A] | A:591 [THR] | T:14 [A] | ✔ |
A:689 [TYR] | T:12 [U] | A:689 [TYR] | T:12 [U] | ✔ |
A:689 [TYR] | T:13 [A] | A:689 [TYR] | T:13 [A] | ✔ |
A:594 [PHE] | T:14 [A] | A:594 [PHE] | T:14 [A] | ✔ |
A:594 [PHE] | T:15 [C] | A:594 [PHE] | T:15 [C] | ✔ |
A:500 [LYS] | T:10 [C] | A:500 [LYS] | T:10 [U] | ✔ |
A:500 [LYS] | T:11 [A] | A:500 [LYS] | T:11 [A] | ✔ |
A:497 [ASN] | T:11 [A] | A:497 [ASN] | T:11 [A] | ✔ |
A:577 [LYS] | T:13 [A] | A:577 [LYS] | T:13 [A] | ✔ |
A:920 [PHE] | T:16 [U] | A:920 [PHE] | T:16 [U] | ✔ |
A:920 [PHE] | T:17 [U] | A:920 [PHE] | T:17 [U] | ✔ |
A:583 [ARG] | T:14 [A] | A:583 [ARG] | T:14 [A] | ✔ |
A:593 [LYS] | T:14 [A] | A:593 [LYS] | T:14 [A] | ✔ |
A:589 [ILE] | T:12 [U] | A:589 [ILE] | T:12 [U] | ✔ |
A:589 [ILE] | T:13 [A] | A:589 [ILE] | T:13 [A] | ✔ |
A:924 [MET] | T:15 [C] | A:924 [MET] | T:15 [C] | ✔ |
A:924 [MET] | T:16 [U] | A:924 [MET] | T:16 [U] | ✔ |
A:577 [LYS] | T:12 [U] | A:577 [LYS] | T:12 [U] | ❌ 7BV2_A_T |
A:501 [SER] | T:8 [U] | A:501 [SER] | T:8 [U] | ❌ 7AAP_A_T |
A:545 [LYS] | T:9 [U] | A:545 [LYS] | T:9 [U] | ❌ 7AAP_A_T |
A:915 [TYR] | T:18 [A] | A:915 [TYR] | T:18 [A] | ❌ 7BV2_T:18 no longer at interface |
A:914 [ARG] | T:18 [A] | A:914 [ARG] | T:18 [A] | ❌ 7BV2_A:914, 7BV2_T:18 no longer at interface |
A:408 [GLN] | T:8 [U] | A:408 [GLN] | T:8 [U] | ❌ 7BV2_A:408 no longer at interface |
A:688 [ALA] | T:12 [U] | A:688 [ALA] | T:12 [U] | ❌ 7BV2_A:688 no longer at interface |
A:914 [ARG] | T:17 [U] | A:914 [ARG] | T:17 [U] | ❌ 7BV2_A:914 no longer at interface |
A:687 [THR] | T:11 [A] | A:687 [THR] | T:11 [A] | ❌ 7BV2_A:687 no longer at interface |
A:565 [THR] | T:11 [A] | A:565 [THR] | T:11 [A] | ❌ 7AAP_A:565 no longer at interface |
A:913 [SER] | T:17 [U] | A:913 [SER] | T:17 [U] | ❌ 7AAP_A:913 no longer at interface |
Properties of this pair
Common ECOD label(s) |
Common RFAM label(s) |
Interface TM-score |
Interface RMSD |
Percentage identity |
Protein TM-score |
RNA TM-score |
Protein coverage |
RNA coverage |
Percentage conservation |
Apolar conservation |
H-bond conservation |
Percentage switching out |
---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
Adenylyl and guanylyl cyclase catalytic domain-like | 0.99 | 0.42 | 0.90 | 1.0 | 0.7 | 0.95 | 1.0 | 0.96 | 0.95 | 0.53 | 0.73 |
Other pairs involving 7AAP_A_T or 7BV2_A_T
Total number of entries: 17