RNAprotDB

All interfaces > All interologs > Interface groups > group131 > 1JJ2_A_0 vs 1VQ8_A_0

Interface analysis


mouse controls

Style

Protein

Cartoon
Licorice
Surface

RNA

Cartoon
Licorice
Surface

Color

Structure
Structure (with hetatm)
Chain
Chainbow

View

Focus on

Interface
RNA
Protein
All

Show chains

Interface

show interface as licorice

Common contacts -

1JJ2_A
1JJ2_0
1VQ8_A
1VQ8_0
Conserved?
A:47 [HIS] 0:1653 [A] A:47 [HIS] 0:1653 [A] ✔
A:47 [HIS] 0:1654 [U] A:47 [HIS] 0:1654 [U] ✔
A:164 [ARG] 0:1652 [C] A:164 [ARG] 0:1652 [C] ✔
A:164 [ARG] 0:1876 [C] A:164 [ARG] 0:1876 [C] ✔
A:164 [ARG] 0:1877 [G] A:164 [ARG] 0:1877 [G] ✔
A:217 [ARG] 0:1853 [C] A:217 [ARG] 0:1853 [C] ✔
A:217 [ARG] 0:1854 [C] A:217 [ARG] 0:1854 [C] ✔
A:217 [ARG] 0:1859 [A] A:217 [ARG] 0:1859 [A] ✔
A:217 [ARG] 0:1860 [U] A:217 [ARG] 0:1860 [U] ✔
A:217 [ARG] 0:1899 [C] A:217 [ARG] 0:1899 [C] ✔
A:217 [ARG] 0:1900 [A] A:217 [ARG] 0:1900 [A] ✔
A:217 [ARG] 0:2125 [G] A:217 [ARG] 0:2125 [G] ✔
A:118 [PHE] 0:1855 [G] A:118 [PHE] 0:1855 [G] ✔
A:118 [PHE] 0:1856 [C] A:118 [PHE] 0:1856 [C] ✔
A:118 [PHE] 0:1874 [U] A:118 [PHE] 0:1874 [U] ✔
A:118 [PHE] 0:1875 [A] A:118 [PHE] 0:1875 [A] ✔
A:230 [SER] 0:1852 [A] A:230 [SER] 0:1852 [A] ✔
A:230 [SER] 0:1853 [C] A:230 [SER] 0:1853 [C] ✔
A:230 [SER] 0:1898 [G] A:230 [SER] 0:1898 [G] ✔
A:230 [SER] 0:1899 [C] A:230 [SER] 0:1899 [C] ✔
A:230 [SER] 0:1900 [A] A:230 [SER] 0:1900 [A] ✔
A:230 [SER] 0:1938 [G] A:230 [SER] 0:1938 [G] ✔
A:22 [ARG] 0:783 [C] A:22 [ARG] 0:783 [C] ✔
A:22 [ARG] 0:784 [A] A:22 [ARG] 0:784 [A] ✔
A:22 [ARG] 0:1654 [U] A:22 [ARG] 0:1654 [U] ✔
A:22 [ARG] 0:1655 [G] A:22 [ARG] 0:1655 [G] ✔
A:225 [VAL] 0:1880 [C] A:225 [VAL] 0:1880 [C] ✔
A:225 [VAL] 0:1881 [A] A:225 [VAL] 0:1881 [A] ✔
A:212 [PRO] 0:1897 [U] A:212 [PRO] 0:1897 [U] ✔
A:212 [PRO] 0:1898 [G] A:212 [PRO] 0:1898 [G] ✔
A:212 [PRO] 0:1942 [A] A:212 [PRO] 0:1942 [A] ✔
A:212 [PRO] 0:1943 [C] A:212 [PRO] 0:1943 [C] ✔
A:168 [PRO] 0:1652 [C] A:168 [PRO] 0:1652 [C] ✔
A:168 [PRO] 0:1847 [A] A:168 [PRO] 0:1847 [A] ✔
A:168 [PRO] 0:1848 [G] A:168 [PRO] 0:1848 [G] ✔
A:140 [LEU] 0:1855 [G] A:140 [LEU] 0:1855 [G] ✔
A:51 [ARG] 0:1873 [G] A:51 [ARG] 0:1873 [G] ✔
A:51 [ARG] 0:1874 [U] A:51 [ARG] 0:1874 [U] ✔
A:3 [ARG] 0:870 [G] A:3 [ARG] 0:870 [G] ✔
A:3 [ARG] 0:871 [G] A:3 [ARG] 0:871 [G] ✔
A:3 [ARG] 0:873 [G] A:3 [ARG] 0:873 [G] ✔
A:3 [ARG] 0:1862 [C] A:3 [ARG] 0:1862 [C] ✔
A:3 [ARG] 0:1863 [G] A:3 [ARG] 0:1863 [G] ✔
A:183 [GLY] 0:1870 [C] A:183 [GLY] 0:1870 [C] ✔
A:183 [GLY] 0:1871 [U] A:183 [GLY] 0:1871 [U] ✔
A:183 [GLY] 0:1879 [U] A:183 [GLY] 0:1879 [U] ✔
A:165 [THR] 0:1652 [C] A:165 [THR] 0:1652 [C] ✔
A:165 [THR] 0:1876 [C] A:165 [THR] 0:1876 [C] ✔
A:165 [THR] 0:1877 [G] A:165 [THR] 0:1877 [G] ✔
A:113 [GLY] 0:2248 [C] A:113 [GLY] 0:2248 [C] ✔
A:113 [GLY] 0:2249 [G] A:113 [GLY] 0:2249 [G] ✔
A:20 [SER] 0:1870 [C] A:20 [SER] 0:1870 [C] ✔
A:20 [SER] 0:1871 [U] A:20 [SER] 0:1871 [U] ✔
A:20 [SER] 0:1872 [C] A:20 [SER] 0:1872 [C] ✔
A:228 [ILE] 0:1852 [A] A:228 [ILE] 0:1852 [A] ✔
A:228 [ILE] 0:1853 [C] A:228 [ILE] 0:1853 [C] ✔
A:228 [ILE] 0:1860 [U] A:228 [ILE] 0:1860 [U] ✔
A:228 [ILE] 0:1880 [C] A:228 [ILE] 0:1880 [C] ✔
A:220 [PRO] 0:1861 [C] A:220 [PRO] 0:1861 [C] ✔
A:220 [PRO] 0:2123 [A] A:220 [PRO] 0:2123 [A] ✔
A:220 [PRO] 0:2124 [G] A:220 [PRO] 0:2124 [G] ✔
A:220 [PRO] 0:2270 [G] A:220 [PRO] 0:2270 [G] ✔
A:220 [PRO] 0:2272 [G] A:220 [PRO] 0:2272 [G] ✔
A:117 [LYS] 0:1855 [G] A:117 [LYS] 0:1855 [G] ✔
A:117 [LYS] 0:1856 [C] A:117 [LYS] 0:1856 [C] ✔
A:117 [LYS] 0:1857 [A] A:117 [LYS] 0:1857 [A] ✔
A:117 [LYS] 0:1874 [U] A:117 [LYS] 0:1874 [U] ✔
A:173 [GLY] 0:820 [G] A:173 [GLY] 0:820 [G] ✔
A:173 [GLY] 0:857 [A] A:173 [GLY] 0:857 [A] ✔
A:144 [GLU] 0:1855 [G] A:144 [GLU] 0:1855 [G] ✔
A:188 [ASN] 0:1845 [A] A:188 [ASN] 0:1845 [A] ✔
A:188 [ASN] 0:1846 [U] A:188 [ASN] 0:1846 [U] ✔
A:188 [ASN] 0:1884 [G] A:188 [ASN] 0:1884 [G] ✔
A:142 [SER] 0:1855 [G] A:142 [SER] 0:1855 [G] ✔
A:142 [SER] 0:1875 [A] A:142 [SER] 0:1875 [A] ✔
A:122 [SER] 0:1876 [C] A:122 [SER] 0:1876 [C] ✔
A:33 [GLU] 0:2250 [G] A:33 [GLU] 0:2250 [G] ✔
A:11 [ARG] 0:866 [U] A:11 [ARG] 0:866 [U] ✔
A:11 [ARG] 0:867 [A] A:11 [ARG] 0:867 [A] ✔
A:11 [ARG] 0:870 [G] A:11 [ARG] 0:870 [G] ✔
A:11 [ARG] 0:871 [G] A:11 [ARG] 0:871 [G] ✔
A:11 [ARG] 0:872 [U] A:11 [ARG] 0:872 [U] ✔
A:11 [ARG] 0:1861 [C] A:11 [ARG] 0:1861 [C] ✔
A:11 [ARG] 0:1862 [C] A:11 [ARG] 0:1862 [C] ✔
A:11 [ARG] 0:1868 [G] A:11 [ARG] 0:1868 [G] ✔
A:11 [ARG] 0:1869 [A] A:11 [ARG] 0:1869 [A] ✔
A:193 [ALA] 0:875 [A] A:193 [ALA] 0:875 [A] ✔
A:193 [ALA] 0:876 [A] A:193 [ALA] 0:876 [A] ✔
A:193 [ALA] 0:1844 [C] A:193 [ALA] 0:1844 [C] ✔
A:193 [ALA] 0:1845 [A] A:193 [ALA] 0:1845 [A] ✔
A:171 [LYS] 0:819 [A] A:171 [LYS] 0:819 [A] ✔
A:171 [LYS] 0:820 [G] A:171 [LYS] 0:820 [G] ✔
A:171 [LYS] 0:857 [A] A:171 [LYS] 0:857 [A] ✔
A:171 [LYS] 0:1846 [U] A:171 [LYS] 0:1846 [U] ✔
A:171 [LYS] 0:1847 [A] A:171 [LYS] 0:1847 [A] ✔
A:209 [PRO] 0:1943 [C] A:209 [PRO] 0:1943 [C] ✔
A:209 [PRO] 0:1944 [G] A:209 [PRO] 0:1944 [G] ✔
A:1 [GLY] 0:886 [A] A:1 [GLY] 0:886 [A] ✔
A:1 [GLY] 0:2114 [C] A:1 [GLY] 0:2114 [C] ✔
A:1 [GLY] 0:2115 [U] A:1 [GLY] 0:2115 [U] ✔
A:1 [GLY] 0:2273 [C] A:1 [GLY] 0:2273 [C] ✔
A:1 [GLY] 0:2274 [A] A:1 [GLY] 0:2274 [A] ✔
A:32 [VAL] 0:2250 [G] A:32 [VAL] 0:2250 [G] ✔
A:192 [VAL] 0:1882 [C] A:192 [VAL] 0:1882 [C] ✔
A:192 [VAL] 0:1883 [U] A:192 [VAL] 0:1883 [U] ✔
A:17 [ARG] 0:865 [G] A:17 [ARG] 0:865 [G] ✔
A:17 [ARG] 0:1459 [A] A:17 [ARG] 0:1459 [A] ✔
A:17 [ARG] 0:1460 [G] A:17 [ARG] 0:1460 [G] ✔
A:17 [ARG] 0:1869 [A] A:17 [ARG] 0:1869 [A] ✔
A:17 [ARG] 0:1870 [C] A:17 [ARG] 0:1870 [C] ✔
A:229 [ALA] 0:1852 [A] A:229 [ALA] 0:1852 [A] ✔
A:229 [ALA] 0:1853 [C] A:229 [ALA] 0:1853 [C] ✔
A:229 [ALA] 0:1899 [C] A:229 [ALA] 0:1899 [C] ✔
A:229 [ALA] 0:1900 [A] A:229 [ALA] 0:1900 [A] ✔
A:221 [PRO] 0:1861 [C] A:221 [PRO] 0:1861 [C] ✔
A:221 [PRO] 0:1862 [C] A:221 [PRO] 0:1862 [C] ✔
A:221 [PRO] 0:2124 [G] A:221 [PRO] 0:2124 [G] ✔
A:221 [PRO] 0:2272 [G] A:221 [PRO] 0:2272 [G] ✔
A:161 [GLY] 0:1876 [C] A:161 [GLY] 0:1876 [C] ✔
A:237 [GLY] 0:1939 [U] A:237 [GLY] 0:1939 [U] ✔
A:237 [GLY] 0:1940 [C] A:237 [GLY] 0:1940 [C] ✔
A:203 [GLY] 0:2633 [A] A:203 [GLY] 0:2633 [A] ✔
A:203 [GLY] 0:2634 [G] A:203 [GLY] 0:2634 [G] ✔
A:52 [SER] 0:1652 [C] A:52 [SER] 0:1652 [C] ✔
A:52 [SER] 0:1653 [A] A:52 [SER] 0:1653 [A] ✔
A:162 [GLY] 0:1876 [C] A:162 [GLY] 0:1876 [C] ✔
A:178 [LYS] 0:1652 [C] A:178 [LYS] 0:1652 [C] ✔
A:178 [LYS] 0:1653 [A] A:178 [LYS] 0:1653 [A] ✔
A:178 [LYS] 0:1877 [G] A:178 [LYS] 0:1877 [G] ✔
A:178 [LYS] 0:1878 [G] A:178 [LYS] 0:1878 [G] ✔
A:25 [ALA] 0:1872 [C] A:25 [ALA] 0:1872 [C] ✔
A:25 [ALA] 0:1873 [G] A:25 [ALA] 0:1873 [G] ✔
A:172 [ALA] 0:820 [G] A:172 [ALA] 0:820 [G] ✔
A:172 [ALA] 0:857 [A] A:172 [ALA] 0:857 [A] ✔
A:172 [ALA] 0:1831 [U] A:172 [ALA] 0:1831 [U] ✔
A:172 [ALA] 0:1846 [U] A:172 [ALA] 0:1846 [U] ✔
A:172 [ALA] 0:1847 [A] A:172 [ALA] 0:1847 [A] ✔
A:48 [ASP] 0:1654 [U] A:48 [ASP] 0:1654 [U] ✔
A:48 [ASP] 0:1872 [C] A:48 [ASP] 0:1872 [C] ✔
A:231 [LYS] 0:1852 [A] A:231 [LYS] 0:1852 [A] ✔
A:231 [LYS] 0:1853 [C] A:231 [LYS] 0:1853 [C] ✔
A:231 [LYS] 0:1854 [C] A:231 [LYS] 0:1854 [C] ✔
A:231 [LYS] 0:1899 [C] A:231 [LYS] 0:1899 [C] ✔
A:231 [LYS] 0:1900 [A] A:231 [LYS] 0:1900 [A] ✔
A:231 [LYS] 0:1938 [G] A:231 [LYS] 0:1938 [G] ✔
A:196 [ALA] 0:2114 [C] A:196 [ALA] 0:2114 [C] ✔
A:196 [ALA] 0:2115 [U] A:196 [ALA] 0:2115 [U] ✔
A:196 [ALA] 0:2633 [A] A:196 [ALA] 0:2633 [A] ✔
A:191 [GLY] 0:1881 [A] A:191 [GLY] 0:1881 [A] ✔
A:191 [GLY] 0:1882 [C] A:191 [GLY] 0:1882 [C] ✔
A:215 [ILE] 0:1898 [G] A:215 [ILE] 0:1898 [G] ✔
A:215 [ILE] 0:1899 [C] A:215 [ILE] 0:1899 [C] ✔
A:215 [ILE] 0:1900 [A] A:215 [ILE] 0:1900 [A] ✔
A:141 [PRO] 0:1855 [G] A:141 [PRO] 0:1855 [G] ✔
A:141 [PRO] 0:1875 [A] A:141 [PRO] 0:1875 [A] ✔
A:141 [PRO] 0:1876 [C] A:141 [PRO] 0:1876 [C] ✔
A:210 [GLY] 0:1943 [C] A:210 [GLY] 0:1943 [C] ✔
A:210 [GLY] 0:2631 [U] A:210 [GLY] 0:2631 [U] ✔
A:210 [GLY] 0:2632 [G] A:210 [GLY] 0:2632 [G] ✔
A:4 [ILE] 0:1881 [A] A:4 [ILE] 0:1881 [A] ✔
A:6 [GLY] 0:1861 [C] A:6 [GLY] 0:1861 [C] ✔
A:6 [GLY] 0:1880 [C] A:6 [GLY] 0:1880 [C] ✔
A:5 [GLN] 0:875 [A] A:5 [GLN] 0:875 [A] ✔
A:236 [GLY] 0:1939 [U] A:236 [GLY] 0:1939 [U] ✔
A:236 [GLY] 0:1940 [C] A:236 [GLY] 0:1940 [C] ✔
A:236 [GLY] 0:1941 [A] A:236 [GLY] 0:1941 [A] ✔
A:163 [GLY] 0:1876 [C] A:163 [GLY] 0:1876 [C] ✔
A:207 [GLN] 0:1843 [A] A:207 [GLN] 0:1843 [A] ✔
A:207 [GLN] 0:1844 [C] A:207 [GLN] 0:1844 [C] ✔
A:207 [GLN] 0:1883 [U] A:207 [GLN] 0:1883 [U] ✔
A:207 [GLN] 0:2012 [U] A:207 [GLN] 0:2012 [U] ✔
A:207 [GLN] 0:2625 [C] A:207 [GLN] 0:2625 [C] ✔
A:207 [GLN] 0:2626 [C] A:207 [GLN] 0:2626 [C] ✔
A:200 [PRO] 0:2116 [U] A:200 [PRO] 0:2116 [U] ✔
A:200 [PRO] 0:2272 [G] A:200 [PRO] 0:2272 [G] ✔
A:190 [ARG] 0:1844 [C] A:190 [ARG] 0:1844 [C] ✔
A:190 [ARG] 0:1845 [A] A:190 [ARG] 0:1845 [A] ✔
A:190 [ARG] 0:1882 [C] A:190 [ARG] 0:1882 [C] ✔
A:190 [ARG] 0:1883 [U] A:190 [ARG] 0:1883 [U] ✔
A:190 [ARG] 0:1884 [G] A:190 [ARG] 0:1884 [G] ✔
A:21 [HIS] 0:783 [C] A:21 [HIS] 0:783 [C] ✔
A:21 [HIS] 0:784 [A] A:21 [HIS] 0:784 [A] ✔
A:21 [HIS] 0:1459 [A] A:21 [HIS] 0:1459 [A] ✔
A:21 [HIS] 0:1872 [C] A:21 [HIS] 0:1872 [C] ✔
A:211 [LYS] 0:1943 [C] A:211 [LYS] 0:1943 [C] ✔
A:211 [LYS] 0:2116 [U] A:211 [LYS] 0:2116 [U] ✔
A:211 [LYS] 0:2117 [U] A:211 [LYS] 0:2117 [U] ✔
A:211 [LYS] 0:2271 [G] A:211 [LYS] 0:2271 [G] ✔
A:211 [LYS] 0:2272 [G] A:211 [LYS] 0:2272 [G] ✔
A:146 [LYS] 0:1855 [G] A:146 [LYS] 0:1855 [G] ✔
A:146 [LYS] 0:1856 [C] A:146 [LYS] 0:1856 [C] ✔
A:27 [LEU] 0:1872 [C] A:27 [LEU] 0:1872 [C] ✔
A:27 [LEU] 0:1873 [G] A:27 [LEU] 0:1873 [G] ✔
A:176 [HIS] 0:857 [A] A:176 [HIS] 0:857 [A] ✔
A:176 [HIS] 0:858 [U] A:176 [HIS] 0:858 [U] ✔
A:181 [ALA] 0:1653 [A] A:181 [ALA] 0:1653 [A] ✔
A:181 [ALA] 0:1654 [U] A:181 [ALA] 0:1654 [U] ✔
A:121 [ALA] 0:1874 [U] A:121 [ALA] 0:1874 [U] ✔
A:121 [ALA] 0:1875 [A] A:121 [ALA] 0:1875 [A] ✔
A:121 [ALA] 0:1876 [C] A:121 [ALA] 0:1876 [C] ✔
A:121 [ALA] 0:1877 [G] A:121 [ALA] 0:1877 [G] ✔
A:184 [THR] 0:1878 [G] A:184 [THR] 0:1878 [G] ✔
A:184 [THR] 0:1879 [U] A:184 [THR] 0:1879 [U] ✔
A:26 [ASP] 0:1872 [C] A:26 [ASP] 0:1872 [C] ✔
A:26 [ASP] 0:1873 [G] A:26 [ASP] 0:1873 [G] ✔
A:233 [THR] 0:1851 [G] A:233 [THR] 0:1851 [G] ✔
A:233 [THR] 0:1852 [A] A:233 [THR] 0:1852 [A] ✔
A:233 [THR] 0:1898 [G] A:233 [THR] 0:1898 [G] ✔
A:233 [THR] 0:1939 [U] A:233 [THR] 0:1939 [U] ✔
A:233 [THR] 0:1940 [C] A:233 [THR] 0:1940 [C] ✔
A:233 [THR] 0:1942 [A] A:233 [THR] 0:1942 [A] ✔
A:198 [ASP] 0:873 [G] A:198 [ASP] 0:873 [G] ✔
A:198 [ASP] 0:875 [A] A:198 [ASP] 0:875 [A] ✔
A:15 [THR] 0:781 [C] A:15 [THR] 0:781 [C] ✔
A:15 [THR] 0:782 [G] A:15 [THR] 0:782 [G] ✔
A:15 [THR] 0:865 [G] A:15 [THR] 0:865 [G] ✔
A:15 [THR] 0:872 [U] A:15 [THR] 0:872 [U] ✔
A:15 [THR] 0:873 [G] A:15 [THR] 0:873 [G] ✔
A:205 [GLY] 0:2625 [C] A:205 [GLY] 0:2625 [C] ✔
A:205 [GLY] 0:2634 [G] A:205 [GLY] 0:2634 [G] ✔
A:232 [ARG] 0:1851 [G] A:232 [ARG] 0:1851 [G] ✔
A:232 [ARG] 0:1852 [A] A:232 [ARG] 0:1852 [A] ✔
A:232 [ARG] 0:1853 [C] A:232 [ARG] 0:1853 [C] ✔
A:232 [ARG] 0:1938 [G] A:232 [ARG] 0:1938 [G] ✔
A:232 [ARG] 0:1939 [U] A:232 [ARG] 0:1939 [U] ✔
A:232 [ARG] 0:1940 [C] A:232 [ARG] 0:1940 [C] ✔
A:174 [ASN] 0:857 [A] A:174 [ASN] 0:857 [A] ✔
A:174 [ASN] 0:1652 [C] A:174 [ASN] 0:1652 [C] ✔
A:10 [GLY] 0:1861 [C] A:10 [GLY] 0:1861 [C] ✔
A:10 [GLY] 0:1862 [C] A:10 [GLY] 0:1862 [C] ✔
A:10 [GLY] 0:1868 [G] A:10 [GLY] 0:1868 [G] ✔
A:10 [GLY] 0:1869 [A] A:10 [GLY] 0:1869 [A] ✔
A:14 [SER] 0:782 [G] A:14 [SER] 0:782 [G] ✔
A:14 [SER] 0:783 [C] A:14 [SER] 0:783 [C] ✔
A:14 [SER] 0:865 [G] A:14 [SER] 0:865 [G] ✔
A:112 [PRO] 0:2248 [C] A:112 [PRO] 0:2248 [C] ✔
A:112 [PRO] 0:2249 [G] A:112 [PRO] 0:2249 [G] ✔
A:31 [LYS] 0:2249 [G] A:31 [LYS] 0:2249 [G] ✔
A:31 [LYS] 0:2250 [G] A:31 [LYS] 0:2250 [G] ✔
A:213 [LYS] 0:1881 [A] A:213 [LYS] 0:1881 [A] ✔
A:213 [LYS] 0:1882 [C] A:213 [LYS] 0:1882 [C] ✔
A:213 [LYS] 0:1942 [A] A:213 [LYS] 0:1942 [A] ✔
A:213 [LYS] 0:1943 [C] A:213 [LYS] 0:1943 [C] ✔
A:199 [HIS] 0:1881 [A] A:199 [HIS] 0:1881 [A] ✔
A:16 [PHE] 0:872 [U] A:16 [PHE] 0:872 [U] ✔
A:16 [PHE] 0:873 [G] A:16 [PHE] 0:873 [G] ✔
A:16 [PHE] 0:1869 [A] A:16 [PHE] 0:1869 [A] ✔
A:16 [PHE] 0:1870 [C] A:16 [PHE] 0:1870 [C] ✔
A:169 [PHE] 0:1652 [C] A:169 [PHE] 0:1652 [C] ✔
A:169 [PHE] 0:1847 [A] A:169 [PHE] 0:1847 [A] ✔
A:169 [PHE] 0:1848 [G] A:169 [PHE] 0:1848 [G] ✔
A:218 [ASN] 0:2124 [G] A:218 [ASN] 0:2124 [G] ✔
A:218 [ASN] 0:2125 [G] A:218 [ASN] 0:2125 [G] ✔
A:218 [ASN] 0:2126 [C] A:218 [ASN] 0:2126 [C] ✔
A:218 [ASN] 0:2269 [C] A:218 [ASN] 0:2269 [C] ✔
A:226 [GLY] 0:1851 [G] A:226 [GLY] 0:1851 [G] ✔
A:226 [GLY] 0:1880 [C] A:226 [GLY] 0:1880 [C] ✔
A:226 [GLY] 0:1881 [A] A:226 [GLY] 0:1881 [A] ✔
A:206 [ARG] 0:2625 [C] A:206 [ARG] 0:2625 [C] ✔
A:206 [ARG] 0:2626 [C] A:206 [ARG] 0:2626 [C] ✔
A:206 [ARG] 0:2628 [U] A:206 [ARG] 0:2628 [U] ✔
A:206 [ARG] 0:2629 [C] A:206 [ARG] 0:2629 [C] ✔
A:206 [ARG] 0:2630 [G] A:206 [ARG] 0:2630 [G] ✔
A:206 [ARG] 0:2634 [G] A:206 [ARG] 0:2634 [G] ✔
A:216 [SER] 0:1899 [C] A:216 [SER] 0:1899 [C] ✔
A:216 [SER] 0:1900 [A] A:216 [SER] 0:1900 [A] ✔
A:149 [ASP] 0:2254 [G] A:149 [ASP] 0:2254 [G] ✔
A:149 [ASP] 0:2255 [A] A:149 [ASP] 0:2255 [A] ✔
A:119 [ALA] 0:1855 [G] A:119 [ALA] 0:1855 [G] ✔
A:119 [ALA] 0:1874 [U] A:119 [ALA] 0:1874 [U] ✔
A:119 [ALA] 0:1875 [A] A:119 [ALA] 0:1875 [A] ✔
A:111 [SER] 0:2248 [C] A:111 [SER] 0:2248 [C] ✔
A:9 [ARG] 0:1860 [U] A:9 [ARG] 0:1860 [U] ✔
A:9 [ARG] 0:1861 [C] A:9 [ARG] 0:1861 [C] ✔
A:9 [ARG] 0:1869 [A] A:9 [ARG] 0:1869 [A] ✔
A:9 [ARG] 0:1870 [C] A:9 [ARG] 0:1870 [C] ✔
A:9 [ARG] 0:1879 [U] A:9 [ARG] 0:1879 [U] ✔
A:9 [ARG] 0:1880 [C] A:9 [ARG] 0:1880 [C] ✔
A:214 [SER] 0:1898 [G] A:214 [SER] 0:1898 [G] ✔
A:214 [SER] 0:1899 [C] A:214 [SER] 0:1899 [C] ✔
A:214 [SER] 0:1942 [A] A:214 [SER] 0:1942 [A] ✔
A:13 [THR] 0:866 [U] A:13 [THR] 0:866 [U] ✔
A:13 [THR] 0:871 [G] A:13 [THR] 0:871 [G] ✔
A:13 [THR] 0:872 [U] A:13 [THR] 0:872 [U] ✔
A:8 [ARG] 0:871 [G] A:8 [ARG] 0:871 [G] ✔
A:8 [ARG] 0:872 [U] A:8 [ARG] 0:872 [U] ✔
A:8 [ARG] 0:873 [G] A:8 [ARG] 0:873 [G] ✔
A:8 [ARG] 0:1861 [C] A:8 [ARG] 0:1861 [C] ✔
A:177 [HIS] 0:857 [A] A:177 [HIS] 0:857 [A] ✔
A:177 [HIS] 0:1653 [A] A:177 [HIS] 0:1653 [A] ✔
A:110 [SER] 0:1856 [C] A:110 [SER] 0:1856 [C] ✔
A:110 [SER] 0:1857 [A] A:110 [SER] 0:1857 [A] ✔
A:120 [ARG] 0:1873 [G] A:120 [ARG] 0:1873 [G] ✔
A:120 [ARG] 0:1874 [U] A:120 [ARG] 0:1874 [U] ✔
A:120 [ARG] 0:1875 [A] A:120 [ARG] 0:1875 [A] ✔
A:167 [LYS] 0:1651 [C] A:167 [LYS] 0:1651 [C] ✔
A:167 [LYS] 0:1652 [C] A:167 [LYS] 0:1652 [C] ✔
A:167 [LYS] 0:1848 [G] A:167 [LYS] 0:1848 [G] ✔
A:194 [MET] 0:875 [A] A:194 [MET] 0:875 [A] ✔
A:197 [VAL] 0:877 [G] A:197 [VAL] 0:877 [G] ✔
A:197 [VAL] 0:886 [A] A:197 [VAL] 0:886 [A] ✔
A:197 [VAL] 0:2113 [G] A:197 [VAL] 0:2113 [G] ✔
A:197 [VAL] 0:2114 [C] A:197 [VAL] 0:2114 [C] ✔
A:197 [VAL] 0:2115 [U] A:197 [VAL] 0:2115 [U] ✔
A:235 [ARG] 0:1850 [U] A:235 [ARG] 0:1850 [U] ✔
A:235 [ARG] 0:1851 [G] A:235 [ARG] 0:1851 [G] ✔
A:235 [ARG] 0:1940 [C] A:235 [ARG] 0:1940 [C] ✔
A:235 [ARG] 0:1941 [A] A:235 [ARG] 0:1941 [A] ✔
A:123 [GLY] 0:1876 [C] A:123 [GLY] 0:1876 [C] ✔
A:116 [GLY] 0:1874 [U] A:116 [GLY] 0:1874 [U] ✔
A:114 [ASP] 0:2248 [C] A:114 [ASP] 0:2248 [C] ✔
A:114 [ASP] 0:2249 [G] A:114 [ASP] 0:2249 [G] ✔
A:185 [LYS] 0:781 [C] A:185 [LYS] 0:781 [C] ✔
A:185 [LYS] 0:873 [G] A:185 [LYS] 0:873 [G] ✔
A:185 [LYS] 0:874 [A] A:185 [LYS] 0:874 [A] ✔
A:222 [GLY] 0:1861 [C] A:222 [GLY] 0:1861 [C] ✔
A:222 [GLY] 0:2272 [G] A:222 [GLY] 0:2272 [G] ✔
A:234 [GLY] 0:1851 [G] A:234 [GLY] 0:1851 [G] ✔
A:234 [GLY] 0:1852 [A] A:234 [GLY] 0:1852 [A] ✔
A:234 [GLY] 0:1939 [U] A:234 [GLY] 0:1939 [U] ✔
A:234 [GLY] 0:1940 [C] A:234 [GLY] 0:1940 [C] ✔
A:234 [GLY] 0:1941 [A] A:234 [GLY] 0:1941 [A] ✔
A:234 [GLY] 0:1942 [A] A:234 [GLY] 0:1942 [A] ✔
A:23 [TYR] 0:1871 [U] A:23 [TYR] 0:1871 [U] ✔
A:23 [TYR] 0:1872 [C] A:23 [TYR] 0:1872 [C] ✔
A:227 [ASP] 0:1851 [G] A:227 [ASP] 0:1851 [G] ✔
A:227 [ASP] 0:1852 [A] A:227 [ASP] 0:1852 [A] ✔
A:227 [ASP] 0:1880 [C] A:227 [ASP] 0:1880 [C] ✔
A:227 [ASP] 0:1881 [A] A:227 [ASP] 0:1881 [A] ✔
A:227 [ASP] 0:1942 [A] A:227 [ASP] 0:1942 [A] ✔
A:224 [LYS] 0:1860 [U] A:224 [LYS] 0:1860 [U] ✔
A:224 [LYS] 0:1861 [C] A:224 [LYS] 0:1861 [C] ✔
A:224 [LYS] 0:1880 [C] A:224 [LYS] 0:1880 [C] ✔
A:24 [LYS] 0:1654 [U] A:24 [LYS] 0:1654 [U] ✔
A:24 [LYS] 0:1655 [G] A:24 [LYS] 0:1655 [G] ✔
A:24 [LYS] 0:1872 [C] A:24 [LYS] 0:1872 [C] ✔
A:186 [TRP] 0:857 [A] A:186 [TRP] 0:857 [A] ✔
A:186 [TRP] 0:1846 [U] A:186 [TRP] 0:1846 [U] ✔
A:186 [TRP] 0:1847 [A] A:186 [TRP] 0:1847 [A] ✔
A:2 [ARG] 0:871 [G] A:2 [ARG] 0:871 [G] ✔
A:2 [ARG] 0:872 [U] A:2 [ARG] 0:872 [U] ✔
A:2 [ARG] 0:873 [G] A:2 [ARG] 0:873 [G] ✔
A:2 [ARG] 0:877 [G] A:2 [ARG] 0:877 [G] ✔
A:2 [ARG] 0:878 [G] A:2 [ARG] 0:878 [G] ✔
A:2 [ARG] 0:879 [C] A:2 [ARG] 0:879 [C] ✔
A:2 [ARG] 0:886 [A] A:2 [ARG] 0:886 [A] ✔
A:2 [ARG] 0:2114 [C] A:2 [ARG] 0:2114 [C] ✔
A:2 [ARG] 0:2273 [C] A:2 [ARG] 0:2273 [C] ✔
A:195 [ASN] 0:876 [A] A:195 [ASN] 0:876 [A] ✔
A:195 [ASN] 0:877 [G] A:195 [ASN] 0:877 [G] ✔
A:182 [ARG] 0:1871 [U] A:182 [ARG] 0:1871 [U] ✔
A:182 [ARG] 0:1878 [G] A:182 [ARG] 0:1878 [G] ✔
A:208 [HIS] 0:1944 [G] A:208 [HIS] 0:1944 [G] ✔
A:208 [HIS] 0:2012 [U] A:208 [HIS] 0:2012 [U] ✔
A:208 [HIS] 0:2630 [G] A:208 [HIS] 0:2630 [G] ✔
A:208 [HIS] 0:2632 [G] A:208 [HIS] 0:2632 [G] ✔
A:208 [HIS] 0:2633 [A] A:208 [HIS] 0:2633 [A] ✔
A:204 [GLY] 0:2633 [A] A:204 [GLY] 0:2633 [A] ✔
A:204 [GLY] 0:2634 [G] A:204 [GLY] 0:2634 [G] ✔
A:189 [VAL] 0:874 [A] A:189 [VAL] 0:874 [A] ✔
A:189 [VAL] 0:875 [A] A:189 [VAL] 0:875 [A] ✔
A:189 [VAL] 0:1844 [C] A:189 [VAL] 0:1844 [C] ✔
A:189 [VAL] 0:1845 [A] A:189 [VAL] 0:1845 [A] ✔
A:189 [VAL] 0:1882 [C] A:189 [VAL] 0:1882 [C] ✔
A:187 [PRO] 0:857 [A] A:187 [PRO] 0:857 [A] ✔
A:187 [PRO] 0:874 [A] A:187 [PRO] 0:874 [A] ✔
A:187 [PRO] 0:1845 [A] A:187 [PRO] 0:1845 [A] ✔
A:187 [PRO] 0:1846 [U] A:187 [PRO] 0:1846 [U] ✔
A:170 [VAL] 0:820 [G] A:170 [VAL] 0:820 [G] ✔
A:170 [VAL] 0:1847 [A] A:170 [VAL] 0:1847 [A] ✔
A:170 [VAL] 0:1848 [G] A:170 [VAL] 0:1848 [G] ✔
A:202 [GLY] 0:2633 [A] A:202 [GLY] 0:2633 [A] ✔
A:124 [VAL] 0:1875 [A] A:124 [VAL] 0:1875 [A] ✔
A:124 [VAL] 0:1876 [C] A:124 [VAL] 0:1876 [C] ✔
A:180 [LYS] 0:783 [C] A:180 [LYS] 0:783 [C] ✔
A:49 [PRO] 0:1654 [U] A:49 [PRO] 0:1654 [U] ✔
A:49 [PRO] 0:1655 [G] A:49 [PRO] 0:1655 [G] ✔
A:223 [ARG] 0:2270 [G] A:223 [ARG] 0:2270 [G] ✔
A:223 [ARG] 0:2271 [G] A:223 [ARG] 0:2271 [G] ✔
A:223 [ARG] 0:2272 [G] A:223 [ARG] 0:2272 [G] ✔
A:175 [LYS] 0:1846 [U] A:175 [LYS] 0:1846 [U] ✔
A:175 [LYS] 0:1847 [A] A:175 [LYS] 0:1847 [A] ✔
A:175 [LYS] 0:1848 [G] A:175 [LYS] 0:1848 [G] ✔
A:201 [PHE] 0:1881 [A] A:201 [PHE] 0:1881 [A] ✔
A:201 [PHE] 0:1882 [C] A:201 [PHE] 0:1882 [C] ✔
A:50 [ALA] 0:1872 [C] A:50 [ALA] 0:1872 [C] ✔
A:50 [ALA] 0:1873 [G] A:50 [ALA] 0:1873 [G] ✔
A:50 [ALA] 0:1878 [G] A:50 [ALA] 0:1878 [G] ✔
A:7 [GLN] 0:871 [G] A:7 [GLN] 0:871 [G] ✔
A:7 [GLN] 0:1861 [C] A:7 [GLN] 0:1861 [C] ✔
A:7 [GLN] 0:1862 [C] A:7 [GLN] 0:1862 [C] ✔
A:7 [GLN] 0:2272 [G] A:7 [GLN] 0:2272 [G] ✔
A:12 [GLY] 0:1869 [A] A:12 [GLY] 0:1869 [A] ✔
A:18 [ALA] 0:1869 [A] A:18 [ALA] 0:1869 [A] ✔
A:18 [ALA] 0:1870 [C] A:18 [ALA] 0:1870 [C] ✔
A:18 [ALA] 0:1871 [U] A:18 [ALA] 0:1871 [U] ✔
A:18 [ALA] 0:1872 [C] A:18 [ALA] 0:1872 [C] ✔
A:47 [HIS] 0:1652 [C] A:47 [HIS] 0:1652 [C] ❌ 1VQ8_A_0
A:231 [LYS] 0:1939 [U] A:231 [LYS] 0:1939 [U] ❌ 1VQ8_A_0
A:211 [LYS] 0:2631 [U] A:211 [LYS] 0:2631 [U] ❌ 1VQ8_A_0
A:174 [ASN] 0:820 [G] A:174 [ASN] 0:820 [G] ❌ 1VQ8_A_0
A:112 [PRO] 0:2254 [G] A:112 [PRO] 0:2254 [G] ❌ 1VQ8_A_0
A:213 [LYS] 0:1941 [A] A:213 [LYS] 0:1941 [A] ❌ 1VQ8_A_0
A:206 [ARG] 0:1944 [G] A:206 [ARG] 0:1944 [G] ❌ 1VQ8_A_0
A:206 [ARG] 0:2632 [G] A:206 [ARG] 0:2632 [G] ❌ 1VQ8_A_0
A:208 [HIS] 0:1943 [C] A:208 [HIS] 0:1943 [C] ❌ 1VQ8_A_0
A:1 [GLY] 0:2272 [G] A:1 [GLY] 0:2272 [G] ❌ 1JJ2_A_0
A:120 [ARG] 0:1872 [C] A:120 [ARG] 0:1872 [C] ❌ 1JJ2_A_0
A:13 [THR] 0:1869 [A] A:13 [THR] 0:1869 [A] ❌ 1JJ2_A_0
A:174 [ASN] 0:1653 [A] A:174 [ASN] 0:1653 [A] ❌ 1JJ2_A_0
A:192 [VAL] 0:1881 [A] A:192 [VAL] 0:1881 [A] ❌ 1JJ2_A_0
A:193 [ALA] 0:1882 [C] A:193 [ALA] 0:1882 [C] ❌ 1JJ2_A_0
A:210 [GLY] 0:1944 [G] A:210 [GLY] 0:1944 [G] ❌ 1JJ2_A_0
A:211 [LYS] 0:2632 [G] A:211 [LYS] 0:2632 [G] ❌ 1JJ2_A_0
A:211 [LYS] 0:1944 [G] A:211 [LYS] 0:1944 [G] ❌ 1JJ2_A_0
A:237 [GLY] 0:1938 [G] A:237 [GLY] 0:1938 [G] ❌ 1JJ2_A_0
A:48 [ASP] 0:1873 [G] A:48 [ASP] 0:1873 [G] ❌ 1JJ2_A_0
A:1 [GLY] 0:869 [G] A:1 [GLY] 0:869 [G] ❌ 1VQ8_0:869 no longer at interface
A:206 [ARG] 0:2627 [G] A:206 [ARG] 0:2627 [G] ❌ 1JJ2_0:2627 no longer at interface
A:33 [GLU] 0:2251 [G] A:33 [GLU] 0:2251 [G] ❌ 1JJ2_0:2251 no longer at interface
A:219 [ALA] 0:1861 [C] A:219 [ALA] 0:1861 [C] ❌ 1VQ8_A:219 no longer at interface
A:69 [LEU] 0:1874 [U] A:69 [LEU] 0:1874 [U] ❌ 1VQ8_A:69 no longer at interface

logo_download Export the table of contacts

Properties of this pair

Common ECOD label(s)
 Common RFAM label(s)
 Interface TM-score
 Interface RMSD
 Percentage identity
 Protein TM-score
 RNA TM-score
 Protein coverage
 RNA coverage
 Percentage conservation
 Apolar conservation
 H-bond conservation
 Percentage switching out
Nucleic acid-binding proteins & SH3 Archaeal large subunit ribosomal RNA 1.0 0.27 0.99 1.0 1.0 1.0 0.99 0.99 0.98 0.87 0.20


Other pairs involving 1JJ2_A_0 or 1VQ8_A_0

Total number of entries: 21

Interface 1 Interface 2 Percentage conservation
 		Interface TM-score
 		Interface RMSD
 		Percentage identity
 		Common ECOD label(s)
 		Common RFAM label(s)
 		Explore both interfaces
1VQ8_A_0 7OF0_D_A 0.48 0.92 4.32 0.16 Nucleic acid-binding proteins & SH3 compare
1VQ8_A_0 1YHQ_A_0 1.00 1.0 0.19 0.99 Nucleic acid-binding proteins & SH3 Archaeal large subunit ribosomal RNA compare
1VQ8_A_0 7O7Y_BA_B5 0.83 0.94 1.28 0.57 Nucleic acid-binding proteins & SH3 compare
1VQ8_A_0 6S0Z_C_A 0.59 0.93 3.61 0.26 Nucleic acid-binding proteins & SH3 compare
1VQ8_A_0 6YSI_A_1 0.59 0.91 3.39 0.23 Nucleic acid-binding proteins & SH3 compare
1VQ8_A_0 4Y4O_1D_1A 0.57 0.93 3.73 0.29 Nucleic acid-binding proteins & SH3 compare
1VQ8_A_0 7K00_c_a 0.61 0.9 3.27 0.25 Nucleic acid-binding proteins & SH3 compare
1VQ8_A_0 6AZ3_A_3 0.68 0.83 1.45 0.0 Nucleic acid-binding proteins & SH3 compare
1VQ8_A_0 7RYG_C_A 0.53 0.9 3.94 0.21 Nucleic acid-binding proteins & SH3 compare
1VQ8_A_0 6AZ3_A_1,2 0.85 0.8 1.09 0.46 Nucleic acid-binding proteins & SH3 compare
1JJ2_A_0 7OF0_D_A 0.47 0.93 4.29 0.16 Nucleic acid-binding proteins & SH3 compare
1JJ2_A_0 6AZ3_A_3 0.67 0.83 1.43 0.0 Nucleic acid-binding proteins & SH3 compare
1JJ2_A_0 7O7Y_BA_B5 0.83 0.94 1.22 0.56 Nucleic acid-binding proteins & SH3 compare
1JJ2_A_0 6AZ3_A_1,2 0.85 0.8 1.08 0.45 Nucleic acid-binding proteins & SH3 compare
1JJ2_A_0 6YSI_A_1 0.59 0.91 3.41 0.23 Nucleic acid-binding proteins & SH3 compare
1JJ2_A_0 4Y4O_1D_1A 0.55 0.93 3.52 0.28 Nucleic acid-binding proteins & SH3 compare
1JJ2_A_0 7K00_c_a 0.60 0.9 3.39 0.26 Nucleic acid-binding proteins & SH3 compare
1JJ2_A_0 1VQ8_A_0 0.99 1.0 0.27 0.99 Nucleic acid-binding proteins & SH3 Archaeal large subunit ribosomal RNA compare
1JJ2_A_0 7RYG_C_A 0.51 0.9 3.94 0.22 Nucleic acid-binding proteins & SH3 compare
1JJ2_A_0 1YHQ_A_0 1.00 1.0 0.19 1.0 Nucleic acid-binding proteins & SH3 Archaeal large subunit ribosomal RNA compare
1JJ2_A_0 6S0Z_C_A 0.58 0.93 3.7 0.25 Nucleic acid-binding proteins & SH3 compare