RNAprotDB

All interfaces > All interologs > Interface groups > group131 > 1VQ8_A_0 vs 7K00_c_a

Interface analysis


mouse controls

Style

Protein

Cartoon
Licorice
Surface

RNA

Cartoon
Licorice
Surface

Color

Structure
Structure (with hetatm)
Chain
Chainbow

View

Focus on

Interface
RNA
Protein
All

Show chains

Interface

show interface as licorice

Common contacts -

1VQ8_A
1VQ8_0
7K00_c
7K00_a
Conserved?
A:47 [HIS] 0:1653 [A] c:83 [TYR] a:1566 [A] ✔
A:47 [HIS] 0:1654 [U] c:83 [TYR] a:1567 [G] ✔
A:164 [ARG] 0:1876 [C] c:200 [HIS] a:1820 [U] ✔
A:164 [ARG] 0:1877 [G] c:200 [HIS] a:1821 [A] ✔
A:118 [PHE] 0:1855 [G] c:154 [LEU] a:1799 [G] ✔
A:118 [PHE] 0:1874 [U] c:154 [LEU] a:1818 [U] ✔
A:118 [PHE] 0:1875 [A] c:154 [LEU] a:1819 [A] ✔
A:230 [SER] 0:1853 [C] c:256 [LYS] a:1797 [G] ✔
A:230 [SER] 0:1899 [C] c:256 [LYS] a:1843 [C] ✔
A:230 [SER] 0:1900 [A] c:256 [LYS] a:1844 [C] ✔
A:22 [ARG] 0:1654 [U] c:60 [GLN] a:1567 [G] ✔
A:22 [ARG] 0:1655 [G] c:60 [GLN] a:1568 [G] ✔
A:212 [PRO] 0:1897 [U] c:243 [HIS] a:1841 [U] ✔
A:212 [PRO] 0:1898 [G] c:243 [HIS] a:1842 [G] ✔
A:212 [PRO] 0:1942 [A] c:243 [HIS] a:1901 [A] ✔
A:212 [PRO] 0:1943 [C] c:243 [HIS] a:1902 [C] ✔
A:168 [PRO] 0:1847 [A] c:204 [VAL] a:1791 [A] ✔
A:168 [PRO] 0:1848 [G] c:204 [VAL] a:1792 [G] ✔
A:140 [LEU] 0:1855 [G] c:176 [LEU] a:1799 [G] ✔
A:51 [ARG] 0:1873 [G] c:87 [ARG] a:1817 [G] ✔
A:51 [ARG] 0:1874 [U] c:87 [ARG] a:1818 [U] ✔
A:165 [THR] 0:1876 [C] c:201 [MET] a:1820 [U] ✔
A:113 [GLY] 0:2248 [C] c:149 [GLY] a:2204 [G] ✔
A:113 [GLY] 0:2249 [G] c:149 [GLY] a:2205 [A] ✔
A:228 [ILE] 0:1852 [A] c:254 [GLY] a:1796 [U] ✔
A:228 [ILE] 0:1853 [C] c:254 [GLY] a:1797 [G] ✔
A:117 [LYS] 0:1855 [G] c:153 [GLN] a:1799 [G] ✔
A:117 [LYS] 0:1856 [C] c:153 [GLN] a:1800 [C] ✔
A:117 [LYS] 0:1857 [A] c:153 [GLN] a:1801 [A] ✔
A:117 [LYS] 0:1874 [U] c:153 [GLN] a:1818 [U] ✔
A:173 [GLY] 0:820 [G] c:209 [GLY] a:729 [G] ✔
A:173 [GLY] 0:857 [A] c:209 [GLY] a:764 [A] ✔
A:144 [GLU] 0:1855 [G] c:180 [GLU] a:1799 [G] ✔
A:188 [ASN] 0:1845 [A] c:219 [THR] a:1789 [A] ✔
A:188 [ASN] 0:1846 [U] c:219 [THR] a:1790 [C] ✔
A:188 [ASN] 0:1884 [G] c:219 [THR] a:1828 [G] ✔
A:142 [SER] 0:1855 [G] c:178 [SER] a:1799 [G] ✔
A:142 [SER] 0:1875 [A] c:178 [SER] a:1819 [A] ✔
A:122 [SER] 0:1876 [C] c:158 [ALA] a:1820 [U] ✔
A:11 [ARG] 0:1868 [G] c:45 [ASN] a:1812 [U] ✔
A:11 [ARG] 0:1869 [A] c:45 [ASN] a:1813 [G] ✔
A:193 [ALA] 0:875 [A] c:224 [ALA] a:782 [A] ✔
A:193 [ALA] 0:876 [A] c:224 [ALA] a:783 [A] ✔
A:193 [ALA] 0:1844 [C] c:224 [ALA] a:1788 [C] ✔
A:193 [ALA] 0:1845 [A] c:224 [ALA] a:1789 [A] ✔
A:171 [LYS] 0:820 [G] c:207 [LYS] a:729 [G] ✔
A:171 [LYS] 0:857 [A] c:207 [LYS] a:764 [A] ✔
A:171 [LYS] 0:1846 [U] c:207 [LYS] a:1790 [C] ✔
A:171 [LYS] 0:1847 [A] c:207 [LYS] a:1791 [A] ✔
A:209 [PRO] 0:1943 [C] c:240 [PHE] a:1902 [C] ✔
A:209 [PRO] 0:1944 [G] c:240 [PHE] a:1903 [G] ✔
A:192 [VAL] 0:1882 [C] c:223 [THR] a:1826 [G] ✔
A:192 [VAL] 0:1883 [U] c:223 [THR] a:1827 [U] ✔
A:17 [ARG] 0:1870 [C] c:54 [ILE] a:1814 [G] ✔
A:229 [ALA] 0:1852 [A] c:255 [LYS] a:1796 [U] ✔
A:229 [ALA] 0:1853 [C] c:255 [LYS] a:1797 [G] ✔
A:229 [ALA] 0:1899 [C] c:255 [LYS] a:1843 [C] ✔
A:229 [ALA] 0:1900 [A] c:255 [LYS] a:1844 [C] ✔
A:161 [GLY] 0:1876 [C] c:197 [ASN] a:1820 [U] ✔
A:203 [GLY] 0:2633 [A] c:234 [GLY] a:2598 [A] ✔
A:203 [GLY] 0:2634 [G] c:234 [GLY] a:2599 [G] ✔
A:162 [GLY] 0:1876 [C] c:198 [ALA] a:1820 [U] ✔
A:178 [LYS] 0:1653 [A] c:214 [ARG] a:1566 [A] ✔
A:172 [ALA] 0:820 [G] c:208 [ALA] a:729 [G] ✔
A:172 [ALA] 0:857 [A] c:208 [ALA] a:764 [A] ✔
A:172 [ALA] 0:1831 [U] c:208 [ALA] a:1775 [U] ✔
A:172 [ALA] 0:1846 [U] c:208 [ALA] a:1790 [C] ✔
A:172 [ALA] 0:1847 [A] c:208 [ALA] a:1791 [A] ✔
A:196 [ALA] 0:2114 [C] c:227 [PRO] a:2073 [C] ✔
A:196 [ALA] 0:2115 [U] c:227 [PRO] a:2074 [U] ✔
A:196 [ALA] 0:2633 [A] c:227 [PRO] a:2598 [A] ✔
A:191 [GLY] 0:1881 [A] c:222 [GLY] a:1825 [U] ✔
A:191 [GLY] 0:1882 [C] c:222 [GLY] a:1826 [G] ✔
A:141 [PRO] 0:1855 [G] c:177 [ARG] a:1799 [G] ✔
A:141 [PRO] 0:1875 [A] c:177 [ARG] a:1819 [A] ✔
A:141 [PRO] 0:1876 [C] c:177 [ARG] a:1820 [U] ✔
A:210 [GLY] 0:1943 [C] c:241 [GLY] a:1902 [C] ✔
A:210 [GLY] 0:1944 [G] c:241 [GLY] a:1903 [G] ✔
A:210 [GLY] 0:2631 [U] c:241 [GLY] a:2596 [U] ✔
A:210 [GLY] 0:2632 [G] c:241 [GLY] a:2597 [G] ✔
A:163 [GLY] 0:1876 [C] c:199 [GLU] a:1820 [U] ✔
A:207 [GLN] 0:1843 [A] c:238 [ARG] a:1787 [A] ✔
A:207 [GLN] 0:1844 [C] c:238 [ARG] a:1788 [C] ✔
A:207 [GLN] 0:2012 [U] c:238 [ARG] a:1971 [U] ✔
A:207 [GLN] 0:2625 [C] c:238 [ARG] a:2590 [A] ✔
A:207 [GLN] 0:2626 [C] c:238 [ARG] a:2591 [C] ✔
A:200 [PRO] 0:2116 [U] c:231 [PRO] a:2075 [U] ✔
A:200 [PRO] 0:2272 [G] c:231 [PRO] a:2239 [G] ✔
A:190 [ARG] 0:1844 [C] c:221 [ARG] a:1788 [C] ✔
A:190 [ARG] 0:1845 [A] c:221 [ARG] a:1789 [A] ✔
A:190 [ARG] 0:1882 [C] c:221 [ARG] a:1826 [G] ✔
A:190 [ARG] 0:1883 [U] c:221 [ARG] a:1827 [U] ✔
A:190 [ARG] 0:1884 [G] c:221 [ARG] a:1828 [G] ✔
A:211 [LYS] 0:1943 [C] c:242 [LYS] a:1902 [C] ✔
A:211 [LYS] 0:1944 [G] c:242 [LYS] a:1903 [G] ✔
A:211 [LYS] 0:2116 [U] c:242 [LYS] a:2075 [U] ✔
A:211 [LYS] 0:2632 [G] c:242 [LYS] a:2597 [G] ✔
A:146 [LYS] 0:1855 [G] c:182 [ARG] a:1799 [G] ✔
A:146 [LYS] 0:1856 [C] c:182 [ARG] a:1800 [C] ✔
A:176 [HIS] 0:857 [A] c:212 [ARG] a:764 [A] ✔
A:121 [ALA] 0:1874 [U] c:157 [SER] a:1818 [U] ✔
A:121 [ALA] 0:1875 [A] c:157 [SER] a:1819 [A] ✔
A:121 [ALA] 0:1876 [C] c:157 [SER] a:1820 [U] ✔
A:121 [ALA] 0:1877 [G] c:157 [SER] a:1821 [A] ✔
A:26 [ASP] 0:1872 [C] c:64 [ILE] a:1816 [C] ✔
A:198 [ASP] 0:873 [G] c:229 [ASP] a:780 [G] ✔
A:198 [ASP] 0:875 [A] c:229 [ASP] a:782 [A] ✔
A:15 [THR] 0:781 [C] c:49 [ILE] a:690 [G] ✔
A:15 [THR] 0:872 [U] c:49 [ILE] a:779 [U] ✔
A:15 [THR] 0:873 [G] c:49 [ILE] a:780 [G] ✔
A:205 [GLY] 0:2634 [G] c:236 [GLU] a:2599 [G] ✔
A:174 [ASN] 0:857 [A] c:210 [ALA] a:764 [A] ✔
A:10 [GLY] 0:1861 [C] c:44 [ASN] a:1805 [A] ✔
A:10 [GLY] 0:1862 [C] c:44 [ASN] a:1806 [C] ✔
A:10 [GLY] 0:1868 [G] c:44 [ASN] a:1812 [U] ✔
A:10 [GLY] 0:1869 [A] c:44 [ASN] a:1813 [G] ✔
A:112 [PRO] 0:2248 [C] c:148 [PRO] a:2204 [G] ✔
A:112 [PRO] 0:2249 [G] c:148 [PRO] a:2205 [A] ✔
A:213 [LYS] 0:1881 [A] c:244 [PRO] a:1825 [U] ✔
A:213 [LYS] 0:1942 [A] c:244 [PRO] a:1901 [A] ✔
A:213 [LYS] 0:1943 [C] c:244 [PRO] a:1902 [C] ✔
A:199 [HIS] 0:1881 [A] c:230 [HIS] a:1825 [U] ✔
A:16 [PHE] 0:1869 [A] c:51 [THR] a:1813 [G] ✔
A:16 [PHE] 0:1870 [C] c:51 [THR] a:1814 [G] ✔
A:169 [PHE] 0:1847 [A] c:205 [LEU] a:1791 [A] ✔
A:169 [PHE] 0:1848 [G] c:205 [LEU] a:1792 [G] ✔
A:226 [GLY] 0:1880 [C] c:252 [THR] a:1824 [G] ✔
A:226 [GLY] 0:1881 [A] c:252 [THR] a:1825 [U] ✔
A:206 [ARG] 0:2625 [C] c:237 [GLY] a:2590 [A] ✔
A:206 [ARG] 0:2626 [C] c:237 [GLY] a:2591 [C] ✔
A:149 [ASP] 0:2255 [A] c:185 [GLU] a:2222 [C] ✔
A:119 [ALA] 0:1855 [G] c:155 [ALA] a:1799 [G] ✔
A:119 [ALA] 0:1874 [U] c:155 [ALA] a:1818 [U] ✔
A:119 [ALA] 0:1875 [A] c:155 [ALA] a:1819 [A] ✔
A:111 [SER] 0:2248 [C] c:147 [LYS] a:2204 [G] ✔
A:9 [ARG] 0:1869 [A] c:43 [ARG] a:1813 [G] ✔
A:13 [THR] 0:866 [U] c:47 [GLY] a:773 [U] ✔
A:13 [THR] 0:872 [U] c:47 [GLY] a:779 [U] ✔
A:177 [HIS] 0:857 [A] c:213 [TRP] a:764 [A] ✔
A:177 [HIS] 0:1653 [A] c:213 [TRP] a:1566 [A] ✔
A:110 [SER] 0:1856 [C] c:146 [MET] a:1800 [C] ✔
A:110 [SER] 0:1857 [A] c:146 [MET] a:1801 [A] ✔
A:120 [ARG] 0:1872 [C] c:156 [ARG] a:1816 [C] ✔
A:120 [ARG] 0:1873 [G] c:156 [ARG] a:1817 [G] ✔
A:120 [ARG] 0:1874 [U] c:156 [ARG] a:1818 [U] ✔
A:120 [ARG] 0:1875 [A] c:156 [ARG] a:1819 [A] ✔
A:167 [LYS] 0:1848 [G] c:203 [ARG] a:1792 [G] ✔
A:194 [MET] 0:875 [A] c:225 [MET] a:782 [A] ✔
A:197 [VAL] 0:877 [G] c:228 [VAL] a:784 [G] ✔
A:197 [VAL] 0:886 [A] c:228 [VAL] a:793 [A] ✔
A:197 [VAL] 0:2114 [C] c:228 [VAL] a:2073 [C] ✔
A:197 [VAL] 0:2115 [U] c:228 [VAL] a:2074 [U] ✔
A:123 [GLY] 0:1876 [C] c:159 [GLY] a:1820 [U] ✔
A:114 [ASP] 0:2248 [C] c:150 [LYS] a:2204 [G] ✔
A:114 [ASP] 0:2249 [G] c:150 [LYS] a:2205 [A] ✔
A:222 [GLY] 0:1861 [C] c:248 [TRP] a:1805 [A] ✔
A:222 [GLY] 0:2272 [G] c:248 [TRP] a:2239 [G] ✔
A:227 [ASP] 0:1851 [G] c:253 [LYS] a:1795 [C] ✔
A:227 [ASP] 0:1852 [A] c:253 [LYS] a:1796 [U] ✔
A:227 [ASP] 0:1880 [C] c:253 [LYS] a:1824 [G] ✔
A:227 [ASP] 0:1881 [A] c:253 [LYS] a:1825 [U] ✔
A:227 [ASP] 0:1942 [A] c:253 [LYS] a:1901 [A] ✔
A:24 [LYS] 0:1872 [C] c:62 [TYR] a:1816 [C] ✔
A:195 [ASN] 0:876 [A] c:226 [ASN] a:783 [A] ✔
A:195 [ASN] 0:877 [G] c:226 [ASN] a:784 [G] ✔
A:208 [HIS] 0:2012 [U] c:239 [ASN] a:1971 [U] ✔
A:208 [HIS] 0:2630 [G] c:239 [ASN] a:2595 [G] ✔
A:208 [HIS] 0:2633 [A] c:239 [ASN] a:2598 [A] ✔
A:204 [GLY] 0:2633 [A] c:235 [GLY] a:2598 [A] ✔
A:204 [GLY] 0:2634 [G] c:235 [GLY] a:2599 [G] ✔
A:189 [VAL] 0:874 [A] c:220 [VAL] a:781 [A] ✔
A:189 [VAL] 0:875 [A] c:220 [VAL] a:782 [A] ✔
A:189 [VAL] 0:1844 [C] c:220 [VAL] a:1788 [C] ✔
A:189 [VAL] 0:1845 [A] c:220 [VAL] a:1789 [A] ✔
A:189 [VAL] 0:1882 [C] c:220 [VAL] a:1826 [G] ✔
A:187 [PRO] 0:857 [A] c:218 [PRO] a:764 [A] ✔
A:187 [PRO] 0:874 [A] c:218 [PRO] a:781 [A] ✔
A:187 [PRO] 0:1845 [A] c:218 [PRO] a:1789 [A] ✔
A:187 [PRO] 0:1846 [U] c:218 [PRO] a:1790 [C] ✔
A:170 [VAL] 0:1847 [A] c:206 [GLY] a:1791 [A] ✔
A:170 [VAL] 0:1848 [G] c:206 [GLY] a:1792 [G] ✔
A:202 [GLY] 0:2633 [A] c:233 [GLY] a:2598 [A] ✔
A:124 [VAL] 0:1875 [A] c:160 [THR] a:1819 [A] ✔
A:124 [VAL] 0:1876 [C] c:160 [THR] a:1820 [U] ✔
A:49 [PRO] 0:1654 [U] c:85 [PRO] a:1567 [G] ✔
A:49 [PRO] 0:1655 [G] c:85 [PRO] a:1568 [G] ✔
A:223 [ARG] 0:2272 [G] c:249 [GLY] a:2239 [G] ✔
A:175 [LYS] 0:1847 [A] c:211 [ALA] a:1791 [A] ✔
A:201 [PHE] 0:1881 [A] c:232 [HIS] a:1825 [U] ✔
A:201 [PHE] 0:1882 [C] c:232 [HIS] a:1826 [G] ✔
A:50 [ALA] 0:1873 [G] c:86 [ASN] a:1817 [G] ✔
A:118 [PHE] 0:1856 [C] c:154 [LEU] a:1800 [C] ❌ 7K00_c_a
A:230 [SER] 0:1852 [A] c:256 [LYS] a:1796 [U] ❌ 7K00_c_a
A:230 [SER] 0:1898 [G] c:256 [LYS] a:1842 [G] ❌ 7K00_c_a
A:22 [ARG] 0:783 [C] c:60 [GLN] a:692 [C] ❌ 7K00_c_a
A:22 [ARG] 0:784 [A] c:60 [GLN] a:693 [A] ❌ 7K00_c_a
A:225 [VAL] 0:1880 [C] c:251 [GLN] a:1824 [G] ❌ 7K00_c_a
A:225 [VAL] 0:1881 [A] c:251 [GLN] a:1825 [U] ❌ 7K00_c_a
A:165 [THR] 0:1877 [G] c:201 [MET] a:1821 [A] ❌ 7K00_c_a
A:228 [ILE] 0:1860 [U] c:254 [GLY] a:1804 [C] ❌ 7K00_c_a
A:228 [ILE] 0:1880 [C] c:254 [GLY] a:1824 [G] ❌ 7K00_c_a
A:11 [ARG] 0:866 [U] c:45 [ASN] a:773 [U] ❌ 7K00_c_a
A:11 [ARG] 0:867 [A] c:45 [ASN] a:774 [G] ❌ 7K00_c_a
A:11 [ARG] 0:870 [G] c:45 [ASN] a:777 [G] ❌ 7K00_c_a
A:11 [ARG] 0:871 [G] c:45 [ASN] a:778 [G] ❌ 7K00_c_a
A:11 [ARG] 0:872 [U] c:45 [ASN] a:779 [U] ❌ 7K00_c_a
A:11 [ARG] 0:1861 [C] c:45 [ASN] a:1805 [A] ❌ 7K00_c_a
A:11 [ARG] 0:1862 [C] c:45 [ASN] a:1806 [C] ❌ 7K00_c_a
A:193 [ALA] 0:1882 [C] c:224 [ALA] a:1826 [G] ❌ 7K00_c_a
A:171 [LYS] 0:819 [A] c:207 [LYS] a:728 [G] ❌ 7K00_c_a
A:192 [VAL] 0:1881 [A] c:223 [THR] a:1825 [U] ❌ 7K00_c_a
A:17 [ARG] 0:865 [G] c:54 [ILE] a:772 [C] ❌ 7K00_c_a
A:17 [ARG] 0:1459 [A] c:54 [ILE] a:1354 [A] ❌ 7K00_c_a
A:17 [ARG] 0:1869 [A] c:54 [ILE] a:1813 [G] ❌ 7K00_c_a
A:221 [PRO] 0:1861 [C] c:247 [PRO] a:1805 [A] ❌ 7K00_c_a
A:221 [PRO] 0:1862 [C] c:247 [PRO] a:1806 [C] ❌ 7K00_c_a
A:221 [PRO] 0:2272 [G] c:247 [PRO] a:2239 [G] ❌ 7K00_c_a
A:52 [SER] 0:1653 [A] c:88 [SER] a:1566 [A] ❌ 7K00_c_a
A:178 [LYS] 0:1877 [G] c:214 [ARG] a:1821 [A] ❌ 7K00_c_a
A:25 [ALA] 0:1872 [C] c:63 [ARG] a:1816 [C] ❌ 7K00_c_a
A:25 [ALA] 0:1873 [G] c:63 [ARG] a:1817 [G] ❌ 7K00_c_a
A:215 [ILE] 0:1898 [G] c:245 [VAL] a:1842 [G] ❌ 7K00_c_a
A:215 [ILE] 0:1899 [C] c:245 [VAL] a:1843 [C] ❌ 7K00_c_a
A:215 [ILE] 0:1900 [A] c:245 [VAL] a:1844 [C] ❌ 7K00_c_a
A:207 [GLN] 0:1883 [U] c:238 [ARG] a:1827 [U] ❌ 7K00_c_a
A:21 [HIS] 0:783 [C] c:59 [LYS] a:692 [C] ❌ 7K00_c_a
A:21 [HIS] 0:784 [A] c:59 [LYS] a:693 [A] ❌ 7K00_c_a
A:21 [HIS] 0:1459 [A] c:59 [LYS] a:1354 [A] ❌ 7K00_c_a
A:21 [HIS] 0:1872 [C] c:59 [LYS] a:1816 [C] ❌ 7K00_c_a
A:211 [LYS] 0:2272 [G] c:242 [LYS] a:2239 [G] ❌ 7K00_c_a
A:26 [ASP] 0:1873 [G] c:64 [ILE] a:1817 [G] ❌ 7K00_c_a
A:15 [THR] 0:782 [G] c:49 [ILE] a:691 [C] ❌ 7K00_c_a
A:15 [THR] 0:865 [G] c:49 [ILE] a:772 [C] ❌ 7K00_c_a
A:205 [GLY] 0:2625 [C] c:236 [GLU] a:2590 [A] ❌ 7K00_c_a
A:174 [ASN] 0:1653 [A] c:210 [ALA] a:1566 [A] ❌ 7K00_c_a
A:14 [SER] 0:782 [G] c:48 [ARG] a:691 [C] ❌ 7K00_c_a
A:14 [SER] 0:783 [C] c:48 [ARG] a:692 [C] ❌ 7K00_c_a
A:14 [SER] 0:865 [G] c:48 [ARG] a:772 [C] ❌ 7K00_c_a
A:213 [LYS] 0:1882 [C] c:244 [PRO] a:1826 [G] ❌ 7K00_c_a
A:16 [PHE] 0:872 [U] c:51 [THR] a:779 [U] ❌ 7K00_c_a
A:16 [PHE] 0:873 [G] c:51 [THR] a:780 [G] ❌ 7K00_c_a
A:226 [GLY] 0:1851 [G] c:252 [THR] a:1795 [C] ❌ 7K00_c_a
A:206 [ARG] 0:2629 [C] c:237 [GLY] a:2594 [C] ❌ 7K00_c_a
A:206 [ARG] 0:2630 [G] c:237 [GLY] a:2595 [G] ❌ 7K00_c_a
A:206 [ARG] 0:2634 [G] c:237 [GLY] a:2599 [G] ❌ 7K00_c_a
A:149 [ASP] 0:2254 [G] c:185 [GLU] a:2221 [G] ❌ 7K00_c_a
A:9 [ARG] 0:1860 [U] c:43 [ARG] a:1804 [C] ❌ 7K00_c_a
A:9 [ARG] 0:1861 [C] c:43 [ARG] a:1805 [A] ❌ 7K00_c_a
A:9 [ARG] 0:1870 [C] c:43 [ARG] a:1814 [G] ❌ 7K00_c_a
A:9 [ARG] 0:1879 [U] c:43 [ARG] a:1823 [G] ❌ 7K00_c_a
A:9 [ARG] 0:1880 [C] c:43 [ARG] a:1824 [G] ❌ 7K00_c_a
A:13 [THR] 0:871 [G] c:47 [GLY] a:778 [G] ❌ 7K00_c_a
A:13 [THR] 0:1869 [A] c:47 [GLY] a:1813 [G] ❌ 7K00_c_a
A:8 [ARG] 0:871 [G] c:42 [GLY] a:778 [G] ❌ 7K00_c_a
A:8 [ARG] 0:872 [U] c:42 [GLY] a:779 [U] ❌ 7K00_c_a
A:8 [ARG] 0:873 [G] c:42 [GLY] a:780 [G] ❌ 7K00_c_a
A:8 [ARG] 0:1861 [C] c:42 [GLY] a:1805 [A] ❌ 7K00_c_a
A:167 [LYS] 0:1651 [C] c:203 [ARG] a:1565 [C] ❌ 7K00_c_a
A:23 [TYR] 0:1872 [C] c:61 [ALA] a:1816 [C] ❌ 7K00_c_a
A:24 [LYS] 0:1654 [U] c:62 [TYR] a:1567 [G] ❌ 7K00_c_a
A:24 [LYS] 0:1655 [G] c:62 [TYR] a:1568 [G] ❌ 7K00_c_a
A:186 [TRP] 0:857 [A] c:217 [ARG] a:764 [A] ❌ 7K00_c_a
A:186 [TRP] 0:1846 [U] c:217 [ARG] a:1790 [C] ❌ 7K00_c_a
A:186 [TRP] 0:1847 [A] c:217 [ARG] a:1791 [A] ❌ 7K00_c_a
A:208 [HIS] 0:1944 [G] c:239 [ASN] a:1903 [G] ❌ 7K00_c_a
A:208 [HIS] 0:2632 [G] c:239 [ASN] a:2597 [G] ❌ 7K00_c_a
A:170 [VAL] 0:820 [G] c:206 [GLY] a:729 [G] ❌ 7K00_c_a
A:175 [LYS] 0:1846 [U] c:211 [ALA] a:1790 [C] ❌ 7K00_c_a
A:175 [LYS] 0:1848 [G] c:211 [ALA] a:1792 [G] ❌ 7K00_c_a
A:50 [ALA] 0:1872 [C] c:86 [ASN] a:1816 [C] ❌ 7K00_c_a
A:12 [GLY] 0:1869 [A] c:46 [ASN] a:1813 [G] ❌ 7K00_c_a
A:18 [ALA] 0:1869 [A] c:55 [GLY] a:1813 [G] ❌ 7K00_c_a
A:18 [ALA] 0:1870 [C] c:55 [GLY] a:1814 [G] ❌ 7K00_c_a
A:18 [ALA] 0:1872 [C] c:55 [GLY] a:1816 [C] ❌ 7K00_c_a
A:110 [SER] 0:1855 [G] c:146 [MET] a:1799 [G] ❌ 1VQ8_A_0
A:111 [SER] 0:2254 [G] c:147 [LYS] a:2221 [G] ❌ 1VQ8_A_0
A:114 [ASP] 0:1857 [A] c:150 [LYS] a:1801 [A] ❌ 1VQ8_A_0
A:114 [ASP] 0:1856 [C] c:150 [LYS] a:1800 [C] ❌ 1VQ8_A_0
A:167 [LYS] 0:1877 [G] c:203 [ARG] a:1821 [A] ❌ 1VQ8_A_0
A:176 [HIS] 0:874 [A] c:212 [ARG] a:781 [A] ❌ 1VQ8_A_0
A:176 [HIS] 0:782 [G] c:212 [ARG] a:691 [C] ❌ 1VQ8_A_0
A:177 [HIS] 0:1651 [C] c:213 [TRP] a:1565 [C] ❌ 1VQ8_A_0
A:186 [TRP] 0:873 [G] c:217 [ARG] a:780 [G] ❌ 1VQ8_A_0
A:186 [TRP] 0:781 [C] c:217 [ARG] a:690 [G] ❌ 1VQ8_A_0
A:186 [TRP] 0:874 [A] c:217 [ARG] a:781 [A] ❌ 1VQ8_A_0
A:186 [TRP] 0:782 [G] c:217 [ARG] a:691 [C] ❌ 1VQ8_A_0
A:188 [ASN] 0:1881 [A] c:219 [THR] a:1825 [U] ❌ 1VQ8_A_0
A:190 [ARG] 0:1843 [A] c:221 [ARG] a:1787 [A] ❌ 1VQ8_A_0
A:196 [ALA] 0:2634 [G] c:227 [PRO] a:2599 [G] ❌ 1VQ8_A_0
A:199 [HIS] 0:1880 [C] c:230 [HIS] a:1824 [G] ❌ 1VQ8_A_0
A:208 [HIS] 0:2629 [C] c:239 [ASN] a:2594 [C] ❌ 1VQ8_A_0
A:208 [HIS] 0:2634 [G] c:239 [ASN] a:2599 [G] ❌ 1VQ8_A_0
A:209 [PRO] 0:2012 [U] c:240 [PHE] a:1971 [U] ❌ 1VQ8_A_0
A:209 [PRO] 0:1881 [A] c:240 [PHE] a:1825 [U] ❌ 1VQ8_A_0
A:209 [PRO] 0:2632 [G] c:240 [PHE] a:2597 [G] ❌ 1VQ8_A_0
A:209 [PRO] 0:2633 [A] c:240 [PHE] a:2598 [A] ❌ 1VQ8_A_0
A:209 [PRO] 0:1882 [C] c:240 [PHE] a:1826 [G] ❌ 1VQ8_A_0
A:211 [LYS] 0:2631 [U] c:242 [LYS] a:2596 [U] ❌ 1VQ8_A_0
A:211 [LYS] 0:2633 [A] c:242 [LYS] a:2598 [A] ❌ 1VQ8_A_0
A:215 [ILE] 0:1880 [C] c:245 [VAL] a:1824 [G] ❌ 1VQ8_A_0
A:215 [ILE] 0:1881 [A] c:245 [VAL] a:1825 [U] ❌ 1VQ8_A_0
A:221 [PRO] 0:1880 [C] c:247 [PRO] a:1824 [G] ❌ 1VQ8_A_0
A:221 [PRO] 0:1881 [A] c:247 [PRO] a:1825 [U] ❌ 1VQ8_A_0
A:222 [GLY] 0:1880 [C] c:248 [TRP] a:1824 [G] ❌ 1VQ8_A_0
A:222 [GLY] 0:1862 [C] c:248 [TRP] a:1806 [C] ❌ 1VQ8_A_0
A:222 [GLY] 0:1860 [U] c:248 [TRP] a:1804 [C] ❌ 1VQ8_A_0
A:225 [VAL] 0:1899 [C] c:251 [GLN] a:1843 [C] ❌ 1VQ8_A_0
A:225 [VAL] 0:1898 [G] c:251 [GLN] a:1842 [G] ❌ 1VQ8_A_0
A:226 [GLY] 0:1852 [A] c:252 [THR] a:1796 [U] ❌ 1VQ8_A_0
A:226 [GLY] 0:1879 [U] c:252 [THR] a:1823 [G] ❌ 1VQ8_A_0
A:227 [ASP] 0:1941 [A] c:253 [LYS] a:1900 [A] ❌ 1VQ8_A_0
A:227 [ASP] 0:1850 [U] c:253 [LYS] a:1794 [A] ❌ 1VQ8_A_0
A:227 [ASP] 0:1899 [C] c:253 [LYS] a:1843 [C] ❌ 1VQ8_A_0
A:228 [ILE] 0:1900 [A] c:254 [GLY] a:1844 [C] ❌ 1VQ8_A_0
A:228 [ILE] 0:1899 [C] c:254 [GLY] a:1843 [C] ❌ 1VQ8_A_0
A:230 [SER] 0:1854 [C] c:256 [LYS] a:1798 [U] ❌ 1VQ8_A_0
A:8 [ARG] 0:1870 [C] c:42 [GLY] a:1814 [G] ❌ 1VQ8_A_0
A:8 [ARG] 0:1869 [A] c:42 [GLY] a:1813 [G] ❌ 1VQ8_A_0
A:9 [ARG] 0:873 [G] c:43 [ARG] a:780 [G] ❌ 1VQ8_A_0
A:9 [ARG] 0:781 [C] c:43 [ARG] a:690 [G] ❌ 1VQ8_A_0
A:9 [ARG] 0:782 [G] c:43 [ARG] a:691 [C] ❌ 1VQ8_A_0
A:9 [ARG] 0:872 [U] c:43 [ARG] a:779 [U] ❌ 1VQ8_A_0
A:12 [GLY] 0:1862 [C] c:46 [ASN] a:1806 [C] ❌ 1VQ8_A_0
A:12 [GLY] 0:867 [A] c:46 [ASN] a:774 [G] ❌ 1VQ8_A_0
A:12 [GLY] 0:1863 [G] c:46 [ASN] a:1807 [G] ❌ 1VQ8_A_0
A:12 [GLY] 0:866 [U] c:46 [ASN] a:773 [U] ❌ 1VQ8_A_0
A:13 [THR] 0:865 [G] c:47 [GLY] a:772 [C] ❌ 1VQ8_A_0
A:14 [SER] 0:870 [G] c:48 [ARG] a:777 [G] ❌ 1VQ8_A_0
A:14 [SER] 0:1862 [C] c:48 [ARG] a:1806 [C] ❌ 1VQ8_A_0
A:14 [SER] 0:867 [A] c:48 [ARG] a:774 [G] ❌ 1VQ8_A_0
A:14 [SER] 0:1863 [G] c:48 [ARG] a:1807 [G] ❌ 1VQ8_A_0
A:14 [SER] 0:871 [G] c:48 [ARG] a:778 [G] ❌ 1VQ8_A_0
A:14 [SER] 0:872 [U] c:48 [ARG] a:779 [U] ❌ 1VQ8_A_0
A:14 [SER] 0:866 [U] c:48 [ARG] a:773 [U] ❌ 1VQ8_A_0
A:15 [THR] 0:1862 [C] c:49 [ILE] a:1806 [C] ❌ 1VQ8_A_0
A:15 [THR] 0:1861 [C] c:49 [ILE] a:1805 [A] ❌ 1VQ8_A_0
A:16 [PHE] 0:1860 [U] c:51 [THR] a:1804 [C] ❌ 1VQ8_A_0
A:16 [PHE] 0:1879 [U] c:51 [THR] a:1823 [G] ❌ 1VQ8_A_0
A:17 [ARG] 0:782 [G] c:54 [ILE] a:691 [C] ❌ 1VQ8_A_0
A:17 [ARG] 0:1879 [U] c:54 [ILE] a:1823 [G] ❌ 1VQ8_A_0
A:18 [ALA] 0:783 [C] c:55 [GLY] a:692 [C] ❌ 1VQ8_A_0
A:18 [ALA] 0:782 [G] c:55 [GLY] a:691 [C] ❌ 1VQ8_A_0
A:21 [HIS] 0:1655 [G] c:59 [LYS] a:1568 [G] ❌ 1VQ8_A_0
A:21 [HIS] 0:1654 [U] c:59 [LYS] a:1567 [G] ❌ 1VQ8_A_0
A:23 [TYR] 0:1655 [G] c:61 [ALA] a:1568 [G] ❌ 1VQ8_A_0
A:24 [LYS] 0:1873 [G] c:62 [TYR] a:1817 [G] ❌ 1VQ8_A_0
A:25 [ALA] 0:1655 [G] c:63 [ARG] a:1568 [G] ❌ 1VQ8_A_0
A:25 [ALA] 0:1654 [U] c:63 [ARG] a:1567 [G] ❌ 1VQ8_A_0
A:47 [HIS] 0:1651 [C] c:83 [TYR] a:1565 [C] ❌ 1VQ8_A_0
A:52 [SER] 0:1876 [C] c:88 [SER] a:1820 [U] ❌ 1VQ8_A_0
A:52 [SER] 0:1874 [U] c:88 [SER] a:1818 [U] ❌ 1VQ8_A_0
A:52 [SER] 0:1877 [G] c:88 [SER] a:1821 [A] ❌ 1VQ8_A_0
A:230 [SER] 0:1938 [G] c:256 [LYS] a:1897 [G] ❌ 7K00_a:1897 no longer at interface
A:32 [VAL] 0:2250 [G] c:70 [ASN] a:2206 [C] ❌ 7K00_c:70, 7K00_a:2206 no longer at interface
A:17 [ARG] 0:1460 [G] c:54 [ILE] a:1355 [G] ❌ 7K00_a:1355 no longer at interface
A:221 [PRO] 0:2124 [G] c:247 [PRO] a:2083 [G] ❌ 7K00_a:2083 no longer at interface
A:178 [LYS] 0:1878 [G] c:214 [ARG] a:1822 [C] ❌ 7K00_a:1822 no longer at interface
A:211 [LYS] 0:2117 [U] c:242 [LYS] a:2076 [U] ❌ 7K00_a:2076 no longer at interface
A:211 [LYS] 0:2271 [G] c:242 [LYS] a:2238 [G] ❌ 7K00_a:2238 no longer at interface
A:176 [HIS] 0:858 [U] c:212 [ARG] a:765 [C] ❌ 7K00_a:765 no longer at interface
A:184 [THR] 0:1878 [G] c:216 [VAL] a:1822 [C] ❌ 7K00_c:216, 7K00_a:1822 no longer at interface
A:31 [LYS] 0:2250 [G] c:69 [ARG] a:2206 [C] ❌ 7K00_c:69, 7K00_a:2206 no longer at interface
A:206 [ARG] 0:2627 [G] c:237 [GLY] a:2592 [G] ❌ 7K00_a:2592 no longer at interface
A:206 [ARG] 0:2628 [U] c:237 [GLY] a:2593 [U] ❌ 7K00_a:2593 no longer at interface
A:197 [VAL] 0:2113 [G] c:228 [VAL] a:2072 [C] ❌ 7K00_a:2072 no longer at interface
A:23 [TYR] 0:1871 [U] c:61 [ALA] a:1815 [A] ❌ 7K00_a:1815 no longer at interface
A:223 [ARG] 0:2270 [G] c:249 [GLY] a:2237 [G] ❌ 7K00_a:2237 no longer at interface
A:223 [ARG] 0:2271 [G] c:249 [GLY] a:2238 [G] ❌ 7K00_a:2238 no longer at interface
A:50 [ALA] 0:1878 [G] c:86 [ASN] a:1822 [C] ❌ 7K00_a:1822 no longer at interface
A:18 [ALA] 0:1871 [U] c:55 [GLY] a:1815 [A] ❌ 7K00_a:1815 no longer at interface
A:111 [SER] 0:2247 [C] c:147 [LYS] a:2202 [U] ❌ 1VQ8_0:2247 no longer at interface
A:135 [VAL] 0:2256 [G] c:171 [TYR] a:2223 [G] ❌ 1VQ8_A:135, 1VQ8_0:2256 no longer at interface
A:171 [LYS] 0:856 [G] c:207 [LYS] a:763 [G] ❌ 1VQ8_0:856 no longer at interface
A:172 [ALA] 0:1830 [C] c:208 [ALA] a:1774 [C] ❌ 1VQ8_0:1830 no longer at interface
A:205 [GLY] 0:2635 [A] c:236 [GLU] a:2600 [A] ❌ 1VQ8_0:2635 no longer at interface
A:205 [GLY] 0:2474 [A] c:236 [GLU] a:2439 [A] ❌ 1VQ8_0:2474 no longer at interface
A:205 [GLY] 0:2475 [C] c:236 [GLU] a:2440 [C] ❌ 1VQ8_0:2475 no longer at interface
A:207 [GLN] 0:2013 [G] c:238 [ARG] a:1972 [G] ❌ 1VQ8_0:2013 no longer at interface
A:230 [SER] 0:1901 [G] c:256 [LYS] a:1845 [G] ❌ 1VQ8_0:1901 no longer at interface
A:10 [GLY] 0:1867 [G] c:44 [ASN] a:1811 [G] ❌ 1VQ8_0:1867 no longer at interface
A:11 [ARG] 0:1867 [G] c:45 [ASN] a:1811 [G] ❌ 1VQ8_0:1867 no longer at interface
A:11 [ARG] 0:1476 [A] c:45 [ASN] a:1370 [C] ❌ 1VQ8_0:1476 no longer at interface
A:11 [ARG] 0:1477 [C] c:45 [ASN] a:1371 [G] ❌ 1VQ8_0:1477 no longer at interface
A:12 [GLY] 0:1867 [G] c:46 [ASN] a:1811 [G] ❌ 1VQ8_0:1867 no longer at interface
A:12 [GLY] 0:1476 [A] c:46 [ASN] a:1370 [C] ❌ 1VQ8_0:1476 no longer at interface
A:14 [SER] 0:868 [G] c:48 [ARG] a:775 [G] ❌ 1VQ8_0:868 no longer at interface
A:21 [HIS] 0:1656 [A] c:59 [LYS] a:1569 [A] ❌ 1VQ8_0:1656 no longer at interface
A:21 [HIS] 0:785 [U] c:59 [LYS] a:694 [U] ❌ 1VQ8_0:785 no longer at interface
A:23 [TYR] 0:1656 [A] c:61 [ALA] a:1569 [A] ❌ 1VQ8_0:1656 no longer at interface
A:48 [ASP] 0:1654 [U] c:84 [ASP] a:1567 [G] ❌ 7K00_c:84 no longer at interface
A:48 [ASP] 0:1872 [C] c:84 [ASP] a:1816 [C] ❌ 7K00_c:84 no longer at interface
A:48 [ASP] 0:1873 [G] c:84 [ASP] a:1817 [G] ❌ 7K00_c:84 no longer at interface
A:27 [LEU] 0:1872 [C] c:65 [VAL] a:1816 [C] ❌ 7K00_c:65 no longer at interface
A:27 [LEU] 0:1873 [G] c:65 [VAL] a:1817 [G] ❌ 7K00_c:65 no longer at interface
A:184 [THR] 0:1879 [U] c:216 [VAL] a:1823 [G] ❌ 7K00_c:216 no longer at interface
A:31 [LYS] 0:2249 [G] c:69 [ARG] a:2205 [A] ❌ 7K00_c:69 no longer at interface
A:116 [GLY] 0:1874 [U] c:152 [GLY] a:1818 [U] ❌ 7K00_c:152 no longer at interface
A:224 [LYS] 0:1860 [U] c:250 [VAL] a:1804 [C] ❌ 7K00_c:250 no longer at interface
A:224 [LYS] 0:1861 [C] c:250 [VAL] a:1805 [A] ❌ 7K00_c:250 no longer at interface
A:224 [LYS] 0:1880 [C] c:250 [VAL] a:1824 [G] ❌ 7K00_c:250 no longer at interface
A:180 [LYS] 0:783 [C] c:215 [GLY] a:692 [C] ❌ 7K00_c:215 no longer at interface
A:135 [VAL] 0:2255 [A] c:171 [TYR] a:2222 [C] ❌ 1VQ8_A:135 no longer at interface
A:219 [ALA] 0:1880 [C] c:246 [THR] a:1824 [G] ❌ 1VQ8_A:219 no longer at interface
A:219 [ALA] 0:1881 [A] c:246 [THR] a:1825 [U] ❌ 1VQ8_A:219 no longer at interface
A:19 [PRO] 0:783 [C] c:56 [GLY] a:692 [C] ❌ 1VQ8_A:19 no longer at interface
A:19 [PRO] 0:782 [G] c:56 [GLY] a:691 [C] ❌ 1VQ8_A:19 no longer at interface
A:29 [HIS] 0:1873 [G] c:67 [PHE] a:1817 [G] ❌ 1VQ8_A:29 no longer at interface
A:30 [ARG] 0:2249 [G] c:68 [LYS] a:2205 [A] ❌ 1VQ8_A:30 no longer at interface

logo_download Export the table of contacts

Properties of this pair

Common ECOD label(s)
 Common RFAM label(s)
 Interface TM-score
 Interface RMSD
 Percentage identity
 Protein TM-score
 RNA TM-score
 Protein coverage
 RNA coverage
 Percentage conservation
 Apolar conservation
 H-bond conservation
 Percentage switching out
Nucleic acid-binding proteins & SH3 0.9 3.27 0.25 0.78 0.9 0.74 0.78 0.61 0.60 0.27 0.26


Other pairs involving 1VQ8_A_0 or 7K00_c_a

Total number of entries: 21

Interface 1 Interface 2 Percentage conservation
 		Interface TM-score
 		Interface RMSD
 		Percentage identity
 		Common ECOD label(s)
 		Common RFAM label(s)
 		Explore both interfaces
6YSI_A_1 7K00_c_a 0.94 1.0 0.5 0.76 Nucleic acid-binding proteins & SH3 Bacterial large subunit ribosomal RNA compare
6S0Z_C_A 7K00_c_a 0.85 0.98 1.04 0.61 Nucleic acid-binding proteins & SH3 Bacterial large subunit ribosomal RNA compare
1VQ8_A_0 7OF0_D_A 0.48 0.92 4.32 0.16 Nucleic acid-binding proteins & SH3 compare
1VQ8_A_0 1YHQ_A_0 1.00 1.0 0.19 0.99 Nucleic acid-binding proteins & SH3 Archaeal large subunit ribosomal RNA compare
1VQ8_A_0 7O7Y_BA_B5 0.83 0.94 1.28 0.57 Nucleic acid-binding proteins & SH3 compare
1VQ8_A_0 6S0Z_C_A 0.59 0.93 3.61 0.26 Nucleic acid-binding proteins & SH3 compare
1VQ8_A_0 6YSI_A_1 0.59 0.91 3.39 0.23 Nucleic acid-binding proteins & SH3 compare
1VQ8_A_0 4Y4O_1D_1A 0.57 0.93 3.73 0.29 Nucleic acid-binding proteins & SH3 compare
1VQ8_A_0 7K00_c_a 0.61 0.9 3.27 0.25 Nucleic acid-binding proteins & SH3 compare
1VQ8_A_0 6AZ3_A_3 0.68 0.83 1.45 0.0 Nucleic acid-binding proteins & SH3 compare
1VQ8_A_0 7RYG_C_A 0.53 0.9 3.94 0.21 Nucleic acid-binding proteins & SH3 compare
1VQ8_A_0 6AZ3_A_1,2 0.85 0.8 1.09 0.46 Nucleic acid-binding proteins & SH3 compare
1JJ2_A_0 7K00_c_a 0.60 0.9 3.39 0.26 Nucleic acid-binding proteins & SH3 compare
1JJ2_A_0 1VQ8_A_0 0.99 1.0 0.27 0.99 Nucleic acid-binding proteins & SH3 Archaeal large subunit ribosomal RNA compare
6AZ3_A_1,2 7K00_c_a 0.62 0.77 3.84 0.22 Nucleic acid-binding proteins & SH3 compare
4Y4O_1D_1A 7K00_c_a 0.85 0.97 0.98 0.63 Nucleic acid-binding proteins & SH3 Bacterial large subunit ribosomal RNA compare
6AZ3_A_3 7K00_c_a 0.44 0.7 3.69 0.1 Nucleic acid-binding proteins & SH3 compare
7K00_c_a 7RYG_C_A 0.93 0.99 1.55 0.77 Nucleic acid-binding proteins & SH3 Bacterial large subunit ribosomal RNA compare
7K00_c_a 7OF0_D_A 0.69 0.92 2.63 0.4 Nucleic acid-binding proteins & SH3 Bacterial large subunit ribosomal RNA compare
7K00_c_a 7O7Y_BA_B5 0.60 0.88 3.73 0.23 Nucleic acid-binding proteins & SH3 compare
1YHQ_A_0 7K00_c_a 0.61 0.9 3.27 0.26 Nucleic acid-binding proteins & SH3 compare