RNAprotDB

All interfaces > All interologs > Interface groups > group131 > 1YHQ_A_0 vs 6AZ3_A_1,2

Interface analysis


mouse controls

Style

Protein

Cartoon
Licorice
Surface

RNA

Cartoon
Licorice
Surface

Color

Structure
Structure (with hetatm)
Chain
Chainbow

View

Focus on

Interface
RNA
Protein
All

Show chains

Interface

show interface as licorice

Common contacts -

1YHQ_A
1YHQ_0
6AZ3_A
6AZ3_1,2
Conserved?
A:164 [ARG] 0:1876 [C] A:174 [ARG] 2:2207 [C]
A:164 [ARG] 0:1877 [G] A:174 [ARG] 2:2208 [G]
A:217 [ARG] 0:1853 [C] A:227 [ARG] 2:2183 [G]
A:217 [ARG] 0:1854 [C] A:227 [ARG] 2:2184 [U]
A:217 [ARG] 0:1859 [A] A:227 [ARG] 2:2189 [C]
A:217 [ARG] 0:1860 [U] A:227 [ARG] 2:2190 [A]
A:217 [ARG] 0:1899 [C] A:227 [ARG] 2:2230 [C]
A:217 [ARG] 0:1900 [A] A:227 [ARG] 2:2231 [U]
A:217 [ARG] 0:2125 [G] A:227 [ARG] 2:2454 [U]
A:118 [PHE] 0:1855 [G] A:126 [LEU] 2:2185 [G]
A:118 [PHE] 0:1874 [U] A:126 [LEU] 2:2205 [A]
A:118 [PHE] 0:1875 [A] A:126 [LEU] 2:2206 [U]
A:230 [SER] 0:1852 [A] A:240 [ALA] 2:2182 [U]
A:230 [SER] 0:1853 [C] A:240 [ALA] 2:2183 [G]
A:230 [SER] 0:1899 [C] A:240 [ALA] 2:2230 [C]
A:230 [SER] 0:1900 [A] A:240 [ALA] 2:2231 [U]
A:230 [SER] 0:1938 [G] A:240 [ALA] 2:2268 [G]
A:22 [ARG] 0:784 [A] A:22 [LYS] 1:875 [C]
A:225 [VAL] 0:1880 [C] A:235 [VAL] 2:2211 [A]
A:225 [VAL] 0:1881 [A] A:235 [VAL] 2:2212 [A]
A:212 [PRO] 0:1897 [U] A:222 [PRO] 2:2228 [U]
A:212 [PRO] 0:1898 [G] A:222 [PRO] 2:2229 [G]
A:212 [PRO] 0:1942 [A] A:222 [PRO] 2:2272 [A]
A:212 [PRO] 0:1943 [C] A:222 [PRO] 2:2273 [C]
A:168 [PRO] 0:1847 [A] A:178 [PRO] 2:2177 [A]
A:168 [PRO] 0:1848 [G] A:178 [PRO] 2:2178 [G]
A:140 [LEU] 0:1855 [G] A:150 [LEU] 2:2185 [G]
A:51 [ARG] 0:1873 [G] A:54 [ARG] 2:2204 [U]
A:51 [ARG] 0:1874 [U] A:54 [ARG] 2:2205 [A]
A:3 [ARG] 0:870 [G] A:4 [THR] 1:960 [A]
A:3 [ARG] 0:871 [G] A:4 [THR] 1:961 [G]
A:3 [ARG] 0:873 [G] A:4 [THR] 1:963 [G]
A:183 [GLY] 0:1870 [C] A:193 [ARG] 2:2201 [G]
A:183 [GLY] 0:1871 [U] A:193 [ARG] 2:2202 [U]
A:183 [GLY] 0:1879 [U] A:193 [ARG] 2:2210 [A]
A:165 [THR] 0:1876 [C] A:175 [ILE] 2:2207 [C]
A:165 [THR] 0:1877 [G] A:175 [ILE] 2:2208 [G]
A:113 [GLY] 0:2248 [C] A:121 [GLY] 2:2547 [A]
A:113 [GLY] 0:2249 [G] A:121 [GLY] 2:2548 [A]
A:20 [SER] 0:1872 [C] A:20 [GLY] 2:2203 [A]
A:228 [ILE] 0:1852 [A] A:238 [ILE] 2:2182 [U]
A:228 [ILE] 0:1853 [C] A:238 [ILE] 2:2183 [G]
A:228 [ILE] 0:1860 [U] A:238 [ILE] 2:2190 [A]
A:228 [ILE] 0:1880 [C] A:238 [ILE] 2:2211 [A]
A:220 [PRO] 0:1861 [C] A:230 [PRO] 2:2191 [U]
A:220 [PRO] 0:2123 [A] A:230 [PRO] 2:2452 [A]
A:220 [PRO] 0:2124 [G] A:230 [PRO] 2:2453 [G]
A:220 [PRO] 0:2270 [G] A:230 [PRO] 2:2815 [G]
A:220 [PRO] 0:2272 [G] A:230 [PRO] 2:2817 [G]
A:117 [LYS] 0:1855 [G] A:125 [THR] 2:2185 [G]
A:117 [LYS] 0:1874 [U] A:125 [THR] 2:2205 [A]
A:173 [GLY] 0:820 [G] A:183 [GLY] 1:911 [G]
A:173 [GLY] 0:857 [A] A:183 [GLY] 1:947 [A]
A:144 [GLU] 0:1855 [G] A:154 [GLN] 2:2185 [G]
A:188 [ASN] 0:1845 [A] A:198 [LYS] 2:2175 [A]
A:188 [ASN] 0:1846 [U] A:198 [LYS] 2:2176 [U]
A:188 [ASN] 0:1884 [G] A:198 [LYS] 2:2215 [G]
A:142 [SER] 0:1855 [G] A:152 [SER] 2:2185 [G]
A:142 [SER] 0:1875 [A] A:152 [SER] 2:2206 [U]
A:122 [SER] 0:1876 [C] A:130 [SER] 2:2207 [C]
A:11 [ARG] 0:871 [G] A:12 [ASN] 1:961 [G]
A:11 [ARG] 0:1861 [C] A:12 [ASN] 2:2191 [U]
A:11 [ARG] 0:1862 [C] A:12 [ASN] 2:2192 [C]
A:11 [ARG] 0:1868 [G] A:12 [ASN] 2:2199 [G]
A:11 [ARG] 0:1869 [A] A:12 [ASN] 2:2200 [U]
A:193 [ALA] 0:875 [A] A:203 [ALA] 1:965 [A]
A:193 [ALA] 0:876 [A] A:203 [ALA] 1:966 [A]
A:193 [ALA] 0:1844 [C] A:203 [ALA] 2:2174 [C]
A:193 [ALA] 0:1845 [A] A:203 [ALA] 2:2175 [A]
A:171 [LYS] 0:819 [A] A:181 [LYS] 1:910 [G]
A:171 [LYS] 0:820 [G] A:181 [LYS] 1:911 [G]
A:171 [LYS] 0:857 [A] A:181 [LYS] 1:947 [A]
A:171 [LYS] 0:1846 [U] A:181 [LYS] 2:2176 [U]
A:171 [LYS] 0:1847 [A] A:181 [LYS] 2:2177 [A]
A:209 [PRO] 0:1943 [C] A:219 [ILE] 2:2273 [C]
A:209 [PRO] 0:1944 [G] A:219 [ILE] 2:2274 [G]
A:1 [GLY] 0:869 [G] A:2 [GLY] 1:959 [OMG]
A:1 [GLY] 0:886 [A] A:2 [GLY] 1:976 [A]
A:1 [GLY] 0:2114 [C] A:2 [GLY] 2:2443 [U]
A:1 [GLY] 0:2115 [U] A:2 [GLY] 2:2444 [U]
A:1 [GLY] 0:2273 [C] A:2 [GLY] 2:2818 [G]
A:192 [VAL] 0:1882 [C] A:202 [VAL] 2:2213 [C]
A:192 [VAL] 0:1883 [U] A:202 [VAL] 2:2214 [U]
A:17 [ARG] 0:1460 [G] A:17 [GLN] 1:1644 [G]
A:17 [ARG] 0:1869 [A] A:17 [GLN] 2:2200 [U]
A:17 [ARG] 0:1870 [C] A:17 [GLN] 2:2201 [G]
A:229 [ALA] 0:1852 [A] A:239 [ALA] 2:2182 [U]
A:229 [ALA] 0:1853 [C] A:239 [ALA] 2:2183 [G]
A:229 [ALA] 0:1899 [C] A:239 [ALA] 2:2230 [C]
A:229 [ALA] 0:1900 [A] A:239 [ALA] 2:2231 [U]
A:221 [PRO] 0:1861 [C] A:231 [PRO] 2:2191 [U]
A:221 [PRO] 0:1862 [C] A:231 [PRO] 2:2192 [C]
A:221 [PRO] 0:2124 [G] A:231 [PRO] 2:2453 [G]
A:221 [PRO] 0:2272 [G] A:231 [PRO] 2:2817 [G]
A:203 [GLY] 0:2633 [A] A:213 [GLY] 2:3188 [A]
A:203 [GLY] 0:2634 [G] A:213 [GLY] 2:3189 [G]
A:162 [GLY] 0:1876 [C] A:172 [GLY] 2:2207 [C]
A:178 [LYS] 0:1877 [G] A:188 [ARG] 2:2208 [G]
A:25 [ALA] 0:1872 [C] A:25 [GLY] 2:2203 [A]
A:25 [ALA] 0:1873 [G] A:25 [GLY] 2:2204 [U]
A:172 [ALA] 0:820 [G] A:182 [ALA] 1:911 [G]
A:172 [ALA] 0:857 [A] A:182 [ALA] 1:947 [A]
A:172 [ALA] 0:1831 [U] A:182 [ALA] 2:2161 [U]
A:172 [ALA] 0:1846 [U] A:182 [ALA] 2:2176 [U]
A:172 [ALA] 0:1847 [A] A:182 [ALA] 2:2177 [A]
A:48 [ASP] 0:1872 [C] A:51 [GLU] 2:2203 [A]
A:231 [LYS] 0:1852 [A] A:241 [ARG] 2:2182 [U]
A:231 [LYS] 0:1853 [C] A:241 [ARG] 2:2183 [G]
A:231 [LYS] 0:1854 [C] A:241 [ARG] 2:2184 [U]
A:231 [LYS] 0:1899 [C] A:241 [ARG] 2:2230 [C]
A:231 [LYS] 0:1900 [A] A:241 [ARG] 2:2231 [U]
A:231 [LYS] 0:1938 [G] A:241 [ARG] 2:2268 [G]
A:196 [ALA] 0:2114 [C] A:206 [PRO] 2:2443 [U]
A:196 [ALA] 0:2115 [U] A:206 [PRO] 2:2444 [U]
A:196 [ALA] 0:2633 [A] A:206 [PRO] 2:3188 [A]
A:191 [GLY] 0:1881 [A] A:201 [GLY] 2:2212 [A]
A:191 [GLY] 0:1882 [C] A:201 [GLY] 2:2213 [C]
A:215 [ILE] 0:1899 [C] A:225 [VAL] 2:2230 [C]
A:215 [ILE] 0:1900 [A] A:225 [VAL] 2:2231 [U]
A:141 [PRO] 0:1855 [G] A:151 [PRO] 2:2185 [G]
A:141 [PRO] 0:1875 [A] A:151 [PRO] 2:2206 [U]
A:141 [PRO] 0:1876 [C] A:151 [PRO] 2:2207 [C]
A:210 [GLY] 0:1943 [C] A:220 [GLY] 2:2273 [C]
A:210 [GLY] 0:2631 [U] A:220 [GLY] 2:3186 [U]
A:210 [GLY] 0:2632 [G] A:220 [GLY] 2:3187 [G]
A:4 [ILE] 0:1881 [A] A:5 [VAL] 2:2212 [A]
A:6 [GLY] 0:1861 [C] A:7 [SER] 2:2191 [U]
A:6 [GLY] 0:1880 [C] A:7 [SER] 2:2211 [A]
A:5 [GLN] 0:875 [A] A:6 [LEU] 1:965 [A]
A:163 [GLY] 0:1876 [C] A:173 [GLY] 2:2207 [C]
A:207 [GLN] 0:1843 [A] A:217 [GLN] 2:2173 [A]
A:207 [GLN] 0:1844 [C] A:217 [GLN] 2:2174 [C]
A:207 [GLN] 0:1883 [U] A:217 [GLN] 2:2214 [U]
A:207 [GLN] 0:2012 [U] A:217 [GLN] 2:2342 [OMU]
A:207 [GLN] 0:2625 [C] A:217 [GLN] 2:3180 [OMC]
A:207 [GLN] 0:2626 [C] A:217 [GLN] 2:3181 [C]
A:200 [PRO] 0:2272 [G] A:210 [PRO] 2:2817 [G]
A:190 [ARG] 0:1844 [C] A:200 [ARG] 2:2174 [C]
A:190 [ARG] 0:1845 [A] A:200 [ARG] 2:2175 [A]
A:190 [ARG] 0:1882 [C] A:200 [ARG] 2:2213 [C]
A:190 [ARG] 0:1883 [U] A:200 [ARG] 2:2214 [U]
A:190 [ARG] 0:1884 [G] A:200 [ARG] 2:2215 [G]
A:21 [HIS] 0:783 [C] A:21 [HIS] 1:874 [C]
A:21 [HIS] 0:784 [A] A:21 [HIS] 1:875 [C]
A:21 [HIS] 0:1459 [A] A:21 [HIS] 1:1643 [A]
A:21 [HIS] 0:1872 [C] A:21 [HIS] 2:2203 [A]
A:211 [LYS] 0:1943 [C] A:221 [HIS] 2:2273 [C]
A:211 [LYS] 0:2116 [U] A:221 [HIS] 2:2445 [U]
A:211 [LYS] 0:2631 [U] A:221 [HIS] 2:3186 [U]
A:146 [LYS] 0:1855 [G] A:156 [LYS] 2:2185 [G]
A:146 [LYS] 0:1856 [C] A:156 [LYS] 2:2186 [A]
A:27 [LEU] 0:1872 [C] A:27 [ALA] 2:2203 [A]
A:27 [LEU] 0:1873 [G] A:27 [ALA] 2:2204 [U]
A:176 [HIS] 0:857 [A] A:186 [PHE] 1:947 [A]
A:176 [HIS] 0:858 [U] A:186 [PHE] 1:948 [U]
A:121 [ALA] 0:1874 [U] A:129 [ALA] 2:2205 [A]
A:121 [ALA] 0:1875 [A] A:129 [ALA] 2:2206 [U]
A:121 [ALA] 0:1876 [C] A:129 [ALA] 2:2207 [C]
A:121 [ALA] 0:1877 [G] A:129 [ALA] 2:2208 [G]
A:26 [ASP] 0:1872 [C] A:26 [PRO] 2:2203 [A]
A:26 [ASP] 0:1873 [G] A:26 [PRO] 2:2204 [U]
A:233 [THR] 0:1851 [G] A:243 [THR] 2:2181 [U]
A:233 [THR] 0:1852 [A] A:243 [THR] 2:2182 [U]
A:233 [THR] 0:1898 [G] A:243 [THR] 2:2229 [G]
A:233 [THR] 0:1939 [U] A:243 [THR] 2:2269 [U]
A:233 [THR] 0:1940 [C] A:243 [THR] 2:2270 [A]
A:233 [THR] 0:1942 [A] A:243 [THR] 2:2272 [A]
A:198 [ASP] 0:873 [G] A:208 [GLU] 1:963 [G]
A:198 [ASP] 0:875 [A] A:208 [GLU] 1:965 [A]
A:15 [THR] 0:781 [C] A:15 [VAL] 1:872 [U]
A:15 [THR] 0:782 [G] A:15 [VAL] 1:873 [G]
A:15 [THR] 0:865 [G] A:15 [VAL] 1:955 [A2M]
A:15 [THR] 0:872 [U] A:15 [VAL] 1:962 [C]
A:15 [THR] 0:873 [G] A:15 [VAL] 1:963 [G]
A:205 [GLY] 0:2625 [C] A:215 [ASN] 2:3180 [OMC]
A:205 [GLY] 0:2634 [G] A:215 [ASN] 2:3189 [G]
A:232 [ARG] 0:1851 [G] A:242 [ARG] 2:2181 [U]
A:232 [ARG] 0:1852 [A] A:242 [ARG] 2:2182 [U]
A:232 [ARG] 0:1853 [C] A:242 [ARG] 2:2183 [G]
A:232 [ARG] 0:1938 [G] A:242 [ARG] 2:2268 [G]
A:232 [ARG] 0:1939 [U] A:242 [ARG] 2:2269 [U]
A:232 [ARG] 0:1940 [C] A:242 [ARG] 2:2270 [A]
A:174 [ASN] 0:857 [A] A:184 [ASN] 1:947 [A]
A:10 [GLY] 0:1861 [C] A:11 [GLY] 2:2191 [U]
A:10 [GLY] 0:1862 [C] A:11 [GLY] 2:2192 [C]
A:10 [GLY] 0:1868 [G] A:11 [GLY] 2:2199 [G]
A:10 [GLY] 0:1869 [A] A:11 [GLY] 2:2200 [U]
A:112 [PRO] 0:2254 [G] A:120 [PRO] 2:2798 [C]
A:31 [LYS] 0:2249 [G] A:31 [ILE] 2:2548 [A]
A:31 [LYS] 0:2250 [G] A:31 [ILE] 2:2549 [U]
A:213 [LYS] 0:1881 [A] A:223 [SER] 2:2212 [A]
A:213 [LYS] 0:1942 [A] A:223 [SER] 2:2272 [A]
A:213 [LYS] 0:1943 [C] A:223 [SER] 2:2273 [C]
A:199 [HIS] 0:1881 [A] A:209 [HIS] 2:2212 [A]
A:16 [PHE] 0:872 [U] A:16 [TYR] 1:962 [C]
A:16 [PHE] 0:873 [G] A:16 [TYR] 1:963 [G]
A:16 [PHE] 0:1869 [A] A:16 [TYR] 2:2200 [U]
A:16 [PHE] 0:1870 [C] A:16 [TYR] 2:2201 [G]
A:169 [PHE] 0:1847 [A] A:179 [VAL] 2:2177 [A]
A:169 [PHE] 0:1848 [G] A:179 [VAL] 2:2178 [G]
A:218 [ASN] 0:2124 [G] A:228 [HIS] 2:2453 [G]
A:218 [ASN] 0:2125 [G] A:228 [HIS] 2:2454 [U]
A:218 [ASN] 0:2126 [C] A:228 [HIS] 2:2455 [C]
A:226 [GLY] 0:1880 [C] A:236 [GLY] 2:2211 [A]
A:226 [GLY] 0:1881 [A] A:236 [GLY] 2:2212 [A]
A:206 [ARG] 0:2626 [C] A:216 [HIS] 2:3181 [C]
A:206 [ARG] 0:2628 [U] A:216 [HIS] 2:3183 [U]
A:206 [ARG] 0:2629 [C] A:216 [HIS] 2:3184 [C]
A:206 [ARG] 0:2634 [G] A:216 [HIS] 2:3189 [G]
A:216 [SER] 0:1899 [C] A:226 [SER] 2:2230 [C]
A:216 [SER] 0:1900 [A] A:226 [SER] 2:2231 [U]
A:119 [ALA] 0:1855 [G] A:127 [ALA] 2:2185 [G]
A:119 [ALA] 0:1874 [U] A:127 [ALA] 2:2205 [A]
A:119 [ALA] 0:1875 [A] A:127 [ALA] 2:2206 [U]
A:111 [SER] 0:2248 [C] A:119 [LYS] 2:2547 [A]
A:9 [ARG] 0:1861 [C] A:10 [LYS] 2:2191 [U]
A:9 [ARG] 0:1869 [A] A:10 [LYS] 2:2200 [U]
A:9 [ARG] 0:1870 [C] A:10 [LYS] 2:2201 [G]
A:9 [ARG] 0:1880 [C] A:10 [LYS] 2:2211 [A]
A:214 [SER] 0:1898 [G] A:224 [THR] 2:2229 [G]
A:214 [SER] 0:1899 [C] A:224 [THR] 2:2230 [C]
A:214 [SER] 0:1942 [A] A:224 [THR] 2:2272 [A]
A:13 [THR] 0:866 [U] A:14 [SER] 1:956 [U]
A:13 [THR] 0:871 [G] A:14 [SER] 1:961 [G]
A:13 [THR] 0:872 [U] A:14 [SER] 1:962 [C]
A:8 [ARG] 0:871 [G] A:9 [ARG] 1:961 [G]
A:8 [ARG] 0:872 [U] A:9 [ARG] 1:962 [C]
A:8 [ARG] 0:873 [G] A:9 [ARG] 1:963 [G]
A:177 [HIS] 0:857 [A] A:187 [TYR] 1:947 [A]
A:120 [ARG] 0:1873 [G] A:128 [ARG] 2:2204 [U]
A:120 [ARG] 0:1874 [U] A:128 [ARG] 2:2205 [A]
A:120 [ARG] 0:1875 [A] A:128 [ARG] 2:2206 [U]
A:167 [LYS] 0:1848 [G] A:177 [LYS] 2:2178 [G]
A:194 [MET] 0:875 [A] A:204 [ARG] 1:965 [A]
A:197 [VAL] 0:877 [G] A:207 [VAL] 1:967 [G]
A:197 [VAL] 0:886 [A] A:207 [VAL] 1:976 [A]
A:197 [VAL] 0:2113 [G] A:207 [VAL] 2:2442 [G]
A:197 [VAL] 0:2114 [C] A:207 [VAL] 2:2443 [U]
A:235 [ARG] 0:1850 [U] A:245 [ARG] 2:2180 [U]
A:235 [ARG] 0:1851 [G] A:245 [ARG] 2:2181 [U]
A:235 [ARG] 0:1940 [C] A:245 [ARG] 2:2270 [A]
A:235 [ARG] 0:1941 [A] A:245 [ARG] 2:2271 [A]
A:123 [GLY] 0:1876 [C] A:131 [GLY] 2:2207 [C]
A:114 [ASP] 0:2248 [C] A:122 [ASP] 2:2547 [A]
A:114 [ASP] 0:2249 [G] A:122 [ASP] 2:2548 [A]
A:222 [GLY] 0:1861 [C] A:232 [GLY] 2:2191 [U]
A:222 [GLY] 0:2272 [G] A:232 [GLY] 2:2817 [G]
A:234 [GLY] 0:1851 [G] A:244 [GLY] 2:2181 [U]
A:234 [GLY] 0:1852 [A] A:244 [GLY] 2:2182 [U]
A:234 [GLY] 0:1939 [U] A:244 [GLY] 2:2269 [U]
A:234 [GLY] 0:1940 [C] A:244 [GLY] 2:2270 [A]
A:234 [GLY] 0:1941 [A] A:244 [GLY] 2:2271 [A]
A:234 [GLY] 0:1942 [A] A:244 [GLY] 2:2272 [A]
A:23 [TYR] 0:1871 [U] A:23 [ARG] 2:2202 [U]
A:23 [TYR] 0:1872 [C] A:23 [ARG] 2:2203 [A]
A:227 [ASP] 0:1851 [G] A:237 [LEU] 2:2181 [U]
A:227 [ASP] 0:1852 [A] A:237 [LEU] 2:2182 [U]
A:227 [ASP] 0:1880 [C] A:237 [LEU] 2:2211 [A]
A:227 [ASP] 0:1881 [A] A:237 [LEU] 2:2212 [A]
A:227 [ASP] 0:1942 [A] A:237 [LEU] 2:2272 [A]
A:224 [LYS] 0:1860 [U] A:234 [LYS] 2:2190 [A]
A:224 [LYS] 0:1861 [C] A:234 [LYS] 2:2191 [U]
A:224 [LYS] 0:1880 [C] A:234 [LYS] 2:2211 [A]
A:24 [LYS] 0:1872 [C] A:24 [LEU] 2:2203 [A]
A:186 [TRP] 0:857 [A] A:196 [TRP] 1:947 [A]
A:186 [TRP] 0:1846 [U] A:196 [TRP] 2:2176 [U]
A:186 [TRP] 0:1847 [A] A:196 [TRP] 2:2177 [A]
A:2 [ARG] 0:871 [G] A:3 [LYS] 1:961 [G]
A:2 [ARG] 0:872 [U] A:3 [LYS] 1:962 [C]
A:2 [ARG] 0:877 [G] A:3 [LYS] 1:967 [G]
A:2 [ARG] 0:886 [A] A:3 [LYS] 1:976 [A]
A:2 [ARG] 0:2114 [C] A:3 [LYS] 2:2443 [U]
A:2 [ARG] 0:2273 [C] A:3 [LYS] 2:2818 [G]
A:195 [ASN] 0:876 [A] A:205 [ASN] 1:966 [A]
A:195 [ASN] 0:877 [G] A:205 [ASN] 1:967 [G]
A:182 [ARG] 0:1871 [U] A:192 [LYS] 2:2202 [U]
A:182 [ARG] 0:1878 [G] A:192 [LYS] 2:2209 [C]
A:208 [HIS] 0:1944 [G] A:218 [HIS] 2:2274 [G]
A:208 [HIS] 0:2012 [U] A:218 [HIS] 2:2342 [OMU]
A:208 [HIS] 0:2630 [G] A:218 [HIS] 2:3185 [G]
A:208 [HIS] 0:2632 [G] A:218 [HIS] 2:3187 [G]
A:208 [HIS] 0:2633 [A] A:218 [HIS] 2:3188 [A]
A:204 [GLY] 0:2633 [A] A:214 [GLY] 2:3188 [A]
A:204 [GLY] 0:2634 [G] A:214 [GLY] 2:3189 [G]
A:189 [VAL] 0:874 [A] A:199 [VAL] 1:964 [A]
A:189 [VAL] 0:875 [A] A:199 [VAL] 1:965 [A]
A:189 [VAL] 0:1844 [C] A:199 [VAL] 2:2174 [C]
A:189 [VAL] 0:1845 [A] A:199 [VAL] 2:2175 [A]
A:189 [VAL] 0:1882 [C] A:199 [VAL] 2:2213 [C]
A:187 [PRO] 0:857 [A] A:197 [PRO] 1:947 [A]
A:187 [PRO] 0:874 [A] A:197 [PRO] 1:964 [A]
A:187 [PRO] 0:1845 [A] A:197 [PRO] 2:2175 [A]
A:187 [PRO] 0:1846 [U] A:197 [PRO] 2:2176 [U]
A:170 [VAL] 0:820 [G] A:180 [LEU] 1:911 [G]
A:170 [VAL] 0:1847 [A] A:180 [LEU] 2:2177 [A]
A:170 [VAL] 0:1848 [G] A:180 [LEU] 2:2178 [G]
A:202 [GLY] 0:2633 [A] A:212 [GLY] 2:3188 [A]
A:124 [VAL] 0:1875 [A] A:132 [ASP] 2:2206 [U]
A:124 [VAL] 0:1876 [C] A:132 [ASP] 2:2207 [C]
A:180 [LYS] 0:783 [C] A:190 [ARG] 1:874 [C]
A:223 [ARG] 0:2270 [G] A:233 [GLN] 2:2815 [G]
A:223 [ARG] 0:2271 [G] A:233 [GLN] 2:2816 [G]
A:223 [ARG] 0:2272 [G] A:233 [GLN] 2:2817 [G]
A:175 [LYS] 0:1846 [U] A:185 [SER] 2:2176 [U]
A:175 [LYS] 0:1847 [A] A:185 [SER] 2:2177 [A]
A:201 [PHE] 0:1881 [A] A:211 [HIS] 2:2212 [A]
A:201 [PHE] 0:1882 [C] A:211 [HIS] 2:2213 [C]
A:7 [GLN] 0:1861 [C] A:8 [CYS] 2:2191 [U]
A:7 [GLN] 0:1862 [C] A:8 [CYS] 2:2192 [C]
A:12 [GLY] 0:1869 [A] A:13 [GLY] 2:2200 [U]
A:18 [ALA] 0:1869 [A] A:18 [VAL] 2:2200 [U]
A:18 [ALA] 0:1870 [C] A:18 [VAL] 2:2201 [G]
A:18 [ALA] 0:1871 [U] A:18 [VAL] 2:2202 [U]
A:18 [ALA] 0:1872 [C] A:18 [VAL] 2:2203 [A]
A:118 [PHE] 0:1856 [C] A:126 [LEU] 2:2186 [A] ❌ 6AZ3_A_1,2
A:230 [SER] 0:1898 [G] A:240 [ALA] 2:2229 [G] ❌ 6AZ3_A_1,2
A:22 [ARG] 0:783 [C] A:22 [LYS] 1:874 [C] ❌ 6AZ3_A_1,2
A:3 [ARG] 0:1862 [C] A:4 [THR] 2:2192 [C] ❌ 6AZ3_A_1,2
A:3 [ARG] 0:1863 [G] A:4 [THR] 2:2193 [C] ❌ 6AZ3_A_1,2
A:20 [SER] 0:1870 [C] A:20 [GLY] 2:2201 [G] ❌ 6AZ3_A_1,2
A:20 [SER] 0:1871 [U] A:20 [GLY] 2:2202 [U] ❌ 6AZ3_A_1,2
A:117 [LYS] 0:1856 [C] A:125 [THR] 2:2186 [A] ❌ 6AZ3_A_1,2
A:117 [LYS] 0:1857 [A] A:125 [THR] 2:2187 [U] ❌ 6AZ3_A_1,2
A:33 [GLU] 0:2250 [G] A:34 [TYR] 2:2549 [U] ❌ 6AZ3_A_1,2
A:11 [ARG] 0:866 [U] A:12 [ASN] 1:956 [U] ❌ 6AZ3_A_1,2
A:11 [ARG] 0:870 [G] A:12 [ASN] 1:960 [A] ❌ 6AZ3_A_1,2
A:11 [ARG] 0:872 [U] A:12 [ASN] 1:962 [C] ❌ 6AZ3_A_1,2
A:32 [VAL] 0:2250 [G] A:33 [ASP] 2:2549 [U] ❌ 6AZ3_A_1,2
A:17 [ARG] 0:865 [G] A:17 [GLN] 1:955 [A2M] ❌ 6AZ3_A_1,2
A:17 [ARG] 0:1459 [A] A:17 [GLN] 1:1643 [A] ❌ 6AZ3_A_1,2
A:178 [LYS] 0:1878 [G] A:188 [ARG] 2:2209 [C] ❌ 6AZ3_A_1,2
A:215 [ILE] 0:1898 [G] A:225 [VAL] 2:2229 [G] ❌ 6AZ3_A_1,2
A:236 [GLY] 0:1939 [U] A:246 [ILE] 2:2269 [U] ❌ 6AZ3_A_1,2
A:236 [GLY] 0:1940 [C] A:246 [ILE] 2:2270 [A] ❌ 6AZ3_A_1,2
A:236 [GLY] 0:1941 [A] A:246 [ILE] 2:2271 [A] ❌ 6AZ3_A_1,2
A:200 [PRO] 0:2116 [U] A:210 [PRO] 2:2445 [U] ❌ 6AZ3_A_1,2
A:211 [LYS] 0:2271 [G] A:221 [HIS] 2:2816 [G] ❌ 6AZ3_A_1,2
A:211 [LYS] 0:2272 [G] A:221 [HIS] 2:2817 [G] ❌ 6AZ3_A_1,2
A:184 [THR] 0:1878 [G] A:194 [ASN] 2:2209 [C] ❌ 6AZ3_A_1,2
A:184 [THR] 0:1879 [U] A:194 [ASN] 2:2210 [A] ❌ 6AZ3_A_1,2
A:112 [PRO] 0:2248 [C] A:120 [PRO] 2:2547 [A] ❌ 6AZ3_A_1,2
A:112 [PRO] 0:2249 [G] A:120 [PRO] 2:2548 [A] ❌ 6AZ3_A_1,2
A:213 [LYS] 0:1882 [C] A:223 [SER] 2:2213 [C] ❌ 6AZ3_A_1,2
A:213 [LYS] 0:1941 [A] A:223 [SER] 2:2271 [A] ❌ 6AZ3_A_1,2
A:226 [GLY] 0:1851 [G] A:236 [GLY] 2:2181 [U] ❌ 6AZ3_A_1,2
A:206 [ARG] 0:2625 [C] A:216 [HIS] 2:3180 [OMC] ❌ 6AZ3_A_1,2
A:206 [ARG] 0:2630 [G] A:216 [HIS] 2:3185 [G] ❌ 6AZ3_A_1,2
A:206 [ARG] 0:2632 [G] A:216 [HIS] 2:3187 [G] ❌ 6AZ3_A_1,2
A:9 [ARG] 0:1860 [U] A:10 [LYS] 2:2190 [A] ❌ 6AZ3_A_1,2
A:9 [ARG] 0:1879 [U] A:10 [LYS] 2:2210 [A] ❌ 6AZ3_A_1,2
A:8 [ARG] 0:1861 [C] A:9 [ARG] 2:2191 [U] ❌ 6AZ3_A_1,2
A:120 [ARG] 0:1872 [C] A:128 [ARG] 2:2203 [A] ❌ 6AZ3_A_1,2
A:197 [VAL] 0:2115 [U] A:207 [VAL] 2:2444 [U] ❌ 6AZ3_A_1,2
A:185 [LYS] 0:781 [C] A:195 [CYS] 1:872 [U] ❌ 6AZ3_A_1,2
A:185 [LYS] 0:873 [G] A:195 [CYS] 1:963 [G] ❌ 6AZ3_A_1,2
A:185 [LYS] 0:874 [A] A:195 [CYS] 1:964 [A] ❌ 6AZ3_A_1,2
A:2 [ARG] 0:873 [G] A:3 [LYS] 1:963 [G] ❌ 6AZ3_A_1,2
A:2 [ARG] 0:878 [G] A:3 [LYS] 1:968 [A] ❌ 6AZ3_A_1,2
A:208 [HIS] 0:1943 [C] A:218 [HIS] 2:2273 [C] ❌ 6AZ3_A_1,2
A:175 [LYS] 0:1848 [G] A:185 [SER] 2:2178 [G] ❌ 6AZ3_A_1,2
A:7 [GLN] 0:871 [G] A:8 [CYS] 1:961 [G] ❌ 6AZ3_A_1,2
A:7 [GLN] 0:2272 [G] A:8 [CYS] 2:2817 [G] ❌ 6AZ3_A_1,2
A:111 [SER] 0:1856 [C] A:119 [LYS] 2:2186 [A] ❌ 1YHQ_A_0
A:111 [SER] 0:1857 [A] A:119 [LYS] 2:2187 [U] ❌ 1YHQ_A_0
A:11 [ARG] 0:1863 [G] A:12 [ASN] 2:2193 [C] ❌ 1YHQ_A_0
A:13 [THR] 0:865 [G] A:14 [SER] 1:955 [A2M] ❌ 1YHQ_A_0
A:15 [THR] 0:866 [U] A:15 [VAL] 1:956 [U] ❌ 1YHQ_A_0
A:177 [HIS] 0:858 [U] A:187 [TYR] 1:948 [U] ❌ 1YHQ_A_0
A:182 [ARG] 0:1877 [G] A:192 [LYS] 2:2208 [G] ❌ 1YHQ_A_0
A:183 [GLY] 0:1878 [G] A:193 [ARG] 2:2209 [C] ❌ 1YHQ_A_0
A:184 [THR] 0:873 [G] A:194 [ASN] 1:963 [G] ❌ 1YHQ_A_0
A:184 [THR] 0:782 [G] A:194 [ASN] 1:873 [G] ❌ 1YHQ_A_0
A:184 [THR] 0:781 [C] A:194 [ASN] 1:872 [U] ❌ 1YHQ_A_0
A:185 [LYS] 0:1879 [U] A:195 [CYS] 2:2210 [A] ❌ 1YHQ_A_0
A:188 [ASN] 0:1880 [C] A:198 [LYS] 2:2211 [A] ❌ 1YHQ_A_0
A:190 [ARG] 0:1843 [A] A:200 [ARG] 2:2173 [A] ❌ 1YHQ_A_0
A:194 [MET] 0:1881 [A] A:204 [ARG] 2:2212 [A] ❌ 1YHQ_A_0
A:196 [ALA] 0:2634 [G] A:206 [PRO] 2:3189 [G] ❌ 1YHQ_A_0
A:198 [ASP] 0:872 [U] A:208 [GLU] 1:962 [C] ❌ 1YHQ_A_0
A:198 [ASP] 0:878 [G] A:208 [GLU] 1:968 [A] ❌ 1YHQ_A_0
A:199 [HIS] 0:1880 [C] A:209 [HIS] 2:2211 [A] ❌ 1YHQ_A_0
A:199 [HIS] 0:1882 [C] A:209 [HIS] 2:2213 [C] ❌ 1YHQ_A_0
A:205 [GLY] 0:2626 [C] A:215 [ASN] 2:3181 [C] ❌ 1YHQ_A_0
A:209 [PRO] 0:1882 [C] A:219 [ILE] 2:2213 [C] ❌ 1YHQ_A_0
A:209 [PRO] 0:1881 [A] A:219 [ILE] 2:2212 [A] ❌ 1YHQ_A_0
A:210 [GLY] 0:1944 [G] A:220 [GLY] 2:2274 [G] ❌ 1YHQ_A_0
A:211 [LYS] 0:2632 [G] A:221 [HIS] 2:3187 [G] ❌ 1YHQ_A_0
A:218 [ASN] 0:1900 [A] A:228 [HIS] 2:2231 [U] ❌ 1YHQ_A_0
A:23 [TYR] 0:1873 [G] A:23 [ARG] 2:2204 [U] ❌ 1YHQ_A_0
A:227 [ASP] 0:1899 [C] A:237 [LEU] 2:2230 [C] ❌ 1YHQ_A_0
A:231 [LYS] 0:1939 [U] A:241 [ARG] 2:2269 [U] ❌ 1YHQ_A_0
A:235 [ARG] 0:1942 [A] A:245 [ARG] 2:2272 [A] ❌ 1YHQ_A_0
A:236 [GLY] 0:1852 [A] A:246 [ILE] 2:2182 [U] ❌ 1YHQ_A_0
A:236 [GLY] 0:1850 [U] A:246 [ILE] 2:2180 [U] ❌ 1YHQ_A_0
A:236 [GLY] 0:1851 [G] A:246 [ILE] 2:2181 [U] ❌ 1YHQ_A_0
A:2 [ARG] 0:870 [G] A:3 [LYS] 1:960 [A] ❌ 1YHQ_A_0
A:48 [ASP] 0:1873 [G] A:51 [GLU] 2:2204 [U] ❌ 1YHQ_A_0
A:51 [ARG] 0:1872 [C] A:54 [ARG] 2:2203 [A] ❌ 1YHQ_A_0
A:5 [GLN] 0:873 [G] A:6 [LEU] 1:963 [G] ❌ 1YHQ_A_0
A:6 [GLY] 0:1881 [A] A:7 [SER] 2:2212 [A] ❌ 1YHQ_A_0
A:6 [GLY] 0:1860 [U] A:7 [SER] 2:2190 [A] ❌ 1YHQ_A_0
A:33 [GLU] 0:2251 [G] A:34 [TYR] 2:2551 [A] ❌ 6AZ3_2:769 no longer at interface
A:11 [ARG] 0:867 [A] A:12 [ASN] 1:957 [C] ❌ 6AZ3_1:957 no longer at interface
A:1 [GLY] 0:2274 [A] A:2 [GLY] 2:2819 [A] ❌ 6AZ3_2:1037 no longer at interface
A:211 [LYS] 0:2117 [U] A:221 [HIS] 2:2446 [G] ❌ 6AZ3_2:664 no longer at interface
A:218 [ASN] 0:2269 [C] A:228 [HIS] 2:2814 [U] ❌ 6AZ3_2:1032 no longer at interface
A:149 [ASP] 0:2255 [A] A:159 [PRO] 2:2799 [G] ❌ 6AZ3_A:159, 6AZ3_2:1017 no longer at interface
A:2 [ARG] 0:879 [C] A:3 [LYS] 1:969 [C] ❌ 6AZ3_1:969 no longer at interface
A:111 [SER] 0:2247 [C] A:119 [LYS] 2:2546 [G] ❌ 1YHQ_0:2247 no longer at interface
A:177 [HIS] 0:856 [G] A:187 [TYR] 1:946 [G] ❌ 1YHQ_0:856 no longer at interface
A:21 [HIS] 0:1458 [A] A:21 [HIS] 1:1642 [G] ❌ 1YHQ_0:1458 no longer at interface
A:21 [HIS] 0:785 [U] A:21 [HIS] 1:876 [U] ❌ 1YHQ_0:785 no longer at interface
A:205 [GLY] 0:2635 [A] A:215 [ASN] 2:3190 [A] ❌ 1YHQ_0:2635 no longer at interface
A:205 [GLY] 0:2636 [C] A:215 [ASN] 2:3191 [C] ❌ 1YHQ_0:2636 no longer at interface
A:206 [ARG] 0:2635 [A] A:216 [HIS] 2:3190 [A] ❌ 1YHQ_0:2635 no longer at interface
A:206 [ARG] 0:2627 [G] A:216 [HIS] 2:3182 [G] ❌ 1YHQ_0:2627 no longer at interface
A:207 [GLN] 0:2624 [A] A:217 [GLN] 2:3179 [A] ❌ 1YHQ_0:2624 no longer at interface
A:22 [ARG] 0:785 [U] A:22 [LYS] 1:876 [U] ❌ 1YHQ_0:785 no longer at interface
A:231 [LYS] 0:1901 [G] A:241 [ARG] 2:2232 [C] ❌ 1YHQ_0:1901 no longer at interface
A:161 [GLY] 0:1876 [C] A:171 [GLY] 2:2207 [C] ❌ 6AZ3_A:171 no longer at interface
A:237 [GLY] 0:1938 [G] A:247 [ARG] 2:2268 [G] ❌ 6AZ3_A:247 no longer at interface
A:237 [GLY] 0:1939 [U] A:247 [ARG] 2:2269 [U] ❌ 6AZ3_A:247 no longer at interface
A:237 [GLY] 0:1940 [C] A:247 [ARG] 2:2270 [A] ❌ 6AZ3_A:247 no longer at interface
A:149 [ASP] 0:2254 [G] A:159 [PRO] 2:2798 [C] ❌ 6AZ3_A:159 no longer at interface
A:110 [SER] 0:1856 [C] A:118 [ALA] 2:2186 [A] ❌ 6AZ3_A:118 no longer at interface
A:110 [SER] 0:1857 [A] A:118 [ALA] 2:2187 [U] ❌ 6AZ3_A:118 no longer at interface
A:116 [GLY] 0:1874 [U] A:124 [GLY] 2:2205 [A] ❌ 6AZ3_A:124 no longer at interface
A:50 [ALA] 0:1872 [C] A:53 [GLY] 2:2203 [A] ❌ 6AZ3_A:53 no longer at interface
A:50 [ALA] 0:1873 [G] A:53 [GLY] 2:2204 [U] ❌ 6AZ3_A:53 no longer at interface
A:50 [ALA] 0:1878 [G] A:53 [GLY] 2:2209 [C] ❌ 6AZ3_A:53 no longer at interface
A:115 [GLY] 0:2250 [G] A:123 [ARG] 2:2549 [U] ❌ 1YHQ_A:115 no longer at interface
A:115 [GLY] 0:2249 [G] A:123 [ARG] 2:2548 [A] ❌ 1YHQ_A:115 no longer at interface
A:145 [MET] 0:1855 [G] A:155 [LYS] 2:2185 [G] ❌ 1YHQ_A:145 no longer at interface
A:19 [PRO] 0:783 [C] A:19 [HIS] 1:874 [C] ❌ 1YHQ_A:19 no longer at interface
A:19 [PRO] 0:782 [G] A:19 [HIS] 1:873 [G] ❌ 1YHQ_A:19 no longer at interface
A:219 [ALA] 0:2124 [G] A:229 [SER] 2:2453 [G] ❌ 1YHQ_A:219 no longer at interface
A:28 [GLU] 0:2250 [G] A:28 [LYS] 2:2549 [U] ❌ 1YHQ_A:28 no longer at interface
A:28 [GLU] 0:2249 [G] A:28 [LYS] 2:2548 [A] ❌ 1YHQ_A:28 no longer at interface

logo_download Export the table of contacts

Properties of this pair

Common ECOD label(s)
Common RFAM label(s)
Interface TM-score
Interface RMSD
Percentage identity
Protein TM-score
RNA TM-score
Protein coverage
RNA coverage
Percentage conservation
Apolar conservation
H-bond conservation
Percentage switching out
Nucleic acid-binding proteins & SH3 0.8 1.08 0.46 0.96 0.79 0.91 0.89 0.86 0.84 0.39 0.30


Other pairs involving 1YHQ_A_0 or 6AZ3_A_1,2

Total number of entries: 20

Interface 1 Interface 2 Percentage conservation
Interface TM-score
Interface RMSD
Percentage identity
Common ECOD label(s)
Common RFAM label(s)
Explore both interfaces
1VQ8_A_0 1YHQ_A_0 1.00 1.0 0.19 0.99 Nucleic acid-binding proteins & SH3 Archaeal large subunit ribosomal RNA compare
1VQ8_A_0 6AZ3_A_1,2 0.85 0.8 1.09 0.46 Nucleic acid-binding proteins & SH3 compare
1JJ2_A_0 6AZ3_A_1,2 0.85 0.8 1.08 0.45 Nucleic acid-binding proteins & SH3 compare
1JJ2_A_0 1YHQ_A_0 1.00 1.0 0.19 1.0 Nucleic acid-binding proteins & SH3 Archaeal large subunit ribosomal RNA compare
6AZ3_A_1,2 6YSI_A_1 0.62 0.76 3.84 0.22 Nucleic acid-binding proteins & SH3 compare
6AZ3_A_1,2 7K00_c_a 0.62 0.77 3.84 0.22 Nucleic acid-binding proteins & SH3 compare
6AZ3_A_1,2 7RYG_C_A 0.56 0.75 3.8 0.23 Nucleic acid-binding proteins & SH3 compare
6AZ3_A_1,2 7OF0_D_A 0.48 0.8 4.46 0.12 Nucleic acid-binding proteins & SH3 compare
6AZ3_A_1,2 6S0Z_C_A 0.60 0.77 3.89 0.24 Nucleic acid-binding proteins & SH3 compare
6AZ3_A_1,2 7O7Y_BA_B5 0.89 0.93 0.81 0.58 Nucleic acid-binding proteins & SH3 Eukaryotic large subunit ribosomal RNA compare
4Y4O_1D_1A 6AZ3_A_1,2 0.59 0.77 3.76 0.22 Nucleic acid-binding proteins & SH3 compare
1YHQ_A_0 7OF0_D_A 0.47 0.93 4.33 0.16 Nucleic acid-binding proteins & SH3 compare
1YHQ_A_0 7O7Y_BA_B5 0.83 0.94 1.26 0.56 Nucleic acid-binding proteins & SH3 compare
1YHQ_A_0 7RYG_C_A 0.51 0.9 3.92 0.22 Nucleic acid-binding proteins & SH3 compare
1YHQ_A_0 6AZ3_A_1,2 0.86 0.8 1.08 0.46 Nucleic acid-binding proteins & SH3 compare
1YHQ_A_0 6YSI_A_1 0.58 0.91 3.28 0.23 Nucleic acid-binding proteins & SH3 compare
1YHQ_A_0 6S0Z_C_A 0.59 0.93 3.59 0.26 Nucleic acid-binding proteins & SH3 compare
1YHQ_A_0 4Y4O_1D_1A 0.57 0.93 3.66 0.29 Nucleic acid-binding proteins & SH3 compare
1YHQ_A_0 6AZ3_A_3 0.68 0.83 1.41 0.0 Nucleic acid-binding proteins & SH3 compare
1YHQ_A_0 7K00_c_a 0.61 0.9 3.27 0.26 Nucleic acid-binding proteins & SH3 compare