RNAprotDB

All interfaces > All interologs > Interface groups > group131 > 4Y4O_1D_1A vs 7OF0_D_A

Interface analysis


mouse controls

Style

Protein

Cartoon
Licorice
Surface

RNA

Cartoon
Licorice
Surface

Color

Structure
Structure (with hetatm)
Chain
Chainbow

View

Focus on

Interface
RNA
Protein
All

Show chains

Interface

show interface as licorice

Common contacts -

4Y4O_1D
4Y4O_1A
7OF0_D
7OF0_A
Conserved?
1D:49 [ILE] 1A:737 [G] D:91 [ILE] A:1922 [C] ✔
1D:49 [ILE] 1A:825 [G] D:91 [ILE] A:1988 [G] ✔
1D:49 [ILE] 1A:826 [U] D:91 [ILE] A:1989 [C] ✔
1D:49 [ILE] 1A:827 [G] D:91 [ILE] A:1990 [G] ✔
1D:160 [GLY] 1A:1851 [U] D:211 [GLY] A:2531 [U] ✔
1D:208 [LYS] 1A:776 [G] D:259 [LYS] A:1939 [G] ✔
1D:208 [LYS] 1A:810 [G] D:259 [LYS] A:1973 [G] ✔
1D:208 [LYS] 1A:811 [A] D:259 [LYS] A:1974 [A] ✔
1D:208 [LYS] 1A:1821 [C] D:259 [LYS] A:2510 [U] ✔
1D:208 [LYS] 1A:1822 [A] D:259 [LYS] A:2511 [C] ✔
1D:151 [LYS] 1A:1832 [G] D:202 [ARG] A:2521 [A] ✔
1D:84 [TYR] 1A:1612 [C] D:131 [TYR] A:2400 [C] ✔
1D:84 [TYR] 1A:1613 [A] D:131 [TYR] A:2401 [A] ✔
1D:84 [TYR] 1A:1614 [A] D:131 [TYR] A:2402 [A] ✔
1D:62 [TYR] 1A:1847 [G] D:104 [TYR] A:2527 [A] ✔
1D:62 [TYR] 1A:1848 [G] D:104 [TYR] A:2528 [G] ✔
1D:161 [THR] 1A:1850 [A] D:212 [THR] A:2530 [A] ✔
1D:161 [THR] 1A:1851 [U] D:212 [THR] A:2531 [U] ✔
1D:86 [PRO] 1A:1614 [A] D:133 [PRO] A:2402 [A] ✔
1D:86 [PRO] 1A:1615 [G] D:133 [PRO] A:2403 [G] ✔
1D:58 [HIS] 1A:1613 [A] D:100 [HIS] A:2401 [A] ✔
1D:58 [HIS] 1A:1614 [A] D:100 [HIS] A:2402 [A] ✔
1D:58 [HIS] 1A:1615 [G] D:100 [HIS] A:2403 [G] ✔
1D:200 [ASP] 1A:1851 [U] D:251 [ASP] A:2531 [U] ✔
1D:63 [ARG] 1A:1614 [A] D:105 [ARG] A:2402 [A] ✔
1D:63 [ARG] 1A:1615 [G] D:105 [ARG] A:2403 [G] ✔
1D:37 [LEU] 1A:1847 [G] D:79 [MET] A:2527 [A] ✔
1D:215 [LEU] 1A:1613 [A] D:266 [LEU] A:2401 [A] ✔
1D:154 [LYS] 1A:1830 [G] D:205 [GLN] A:2519 [G] ✔
1D:154 [LYS] 1A:1831 [C] D:205 [GLN] A:2520 [C] ✔
1D:154 [LYS] 1A:1832 [G] D:205 [GLN] A:2521 [A] ✔
1D:154 [LYS] 1A:1849 [U] D:205 [GLN] A:2529 [U] ✔
1D:209 [ALA] 1A:776 [G] D:260 [ALA] A:1939 [G] ✔
1D:209 [ALA] 1A:811 [A] D:260 [ALA] A:1974 [A] ✔
1D:209 [ALA] 1A:1821 [C] D:260 [ALA] A:2510 [U] ✔
1D:209 [ALA] 1A:1822 [A] D:260 [ALA] A:2511 [C] ✔
1D:210 [GLY] 1A:776 [G] D:261 [GLY] A:1939 [G] ✔
1D:210 [GLY] 1A:811 [A] D:261 [GLY] A:1974 [A] ✔
1D:219 [PRO] 1A:811 [A] D:270 [PRO] A:1974 [A] ✔
1D:219 [PRO] 1A:828 [A] D:270 [PRO] A:1991 [A] ✔
1D:219 [PRO] 1A:1820 [A] D:270 [PRO] A:2509 [A] ✔
1D:219 [PRO] 1A:1821 [C] D:270 [PRO] A:2510 [U] ✔
1D:89 [SER] 1A:1849 [U] D:136 [SER] A:2529 [U] ✔
1D:89 [SER] 1A:1851 [U] D:136 [SER] A:2531 [U] ✔
1D:89 [SER] 1A:1852 [A] D:136 [SER] A:2532 [U] ✔
1D:36 [PRO] 1A:1616 [A] D:78 [LYS] A:2404 [U] ✔
1D:181 [GLU] 1A:1830 [G] D:232 [ARG] A:2519 [G] ✔
1D:205 [VAL] 1A:1822 [A] D:256 [VAL] A:2511 [C] ✔
1D:205 [VAL] 1A:1823 [G] D:256 [VAL] A:2512 [A] ✔
1D:211 [ARG] 1A:811 [A] D:262 [ARG] A:1974 [A] ✔
1D:211 [ARG] 1A:1612 [C] D:262 [ARG] A:2400 [C] ✔
1D:211 [ARG] 1A:1613 [A] D:262 [ARG] A:2401 [A] ✔
1D:213 [ARG] 1A:738 [C] D:264 [ARG] A:1923 [C] ✔
1D:213 [ARG] 1A:811 [A] D:264 [ARG] A:1974 [A] ✔
1D:213 [ARG] 1A:828 [A] D:264 [ARG] A:1991 [A] ✔
1D:206 [LEU] 1A:1822 [A] D:257 [ILE] A:2511 [C] ✔
1D:206 [LEU] 1A:1823 [G] D:257 [ILE] A:2512 [A] ✔
1D:201 [HIS] 1A:1851 [U] D:252 [HIS] A:2531 [U] ✔
1D:201 [HIS] 1A:1852 [A] D:252 [HIS] A:2532 [U] ✔
1D:55 [GLY] 1A:738 [C] D:97 [GLY] A:1923 [C] ✔
1D:55 [GLY] 1A:739 [C] D:97 [GLY] A:1924 [U] ✔
1D:56 [GLY] 1A:738 [C] D:98 [GLY] A:1923 [C] ✔
1D:56 [GLY] 1A:739 [C] D:98 [GLY] A:1924 [U] ✔
1D:156 [ALA] 1A:1830 [G] D:207 [ILE] A:2519 [G] ✔
1D:156 [ALA] 1A:1849 [U] D:207 [ILE] A:2529 [U] ✔
1D:156 [ALA] 1A:1850 [A] D:207 [ILE] A:2530 [A] ✔
1D:60 [ARG] 1A:1614 [A] D:102 [GLN] A:2402 [A] ✔
1D:60 [ARG] 1A:1615 [G] D:102 [GLN] A:2403 [G] ✔
1D:44 [ASN] 1A:1844 [G] D:86 [ASP] A:2524 [A] ✔
1D:198 [ASN] 1A:1851 [U] D:249 [ASN] A:2531 [U] ✔
1D:54 [ARG] 1A:738 [C] D:96 [ILE] A:1923 [C] ✔
1D:54 [ARG] 1A:1845 [G] D:96 [ILE] A:2525 [C] ✔
1D:54 [ARG] 1A:1854 [G] D:96 [ILE] A:2534 [G] ✔
1D:207 [GLY] 1A:1822 [A] D:258 [GLY] A:2511 [C] ✔
1D:207 [GLY] 1A:1823 [G] D:258 [GLY] A:2512 [A] ✔
1D:88 [ARG] 1A:1847 [G] D:135 [ARG] A:2527 [A] ✔
1D:88 [ARG] 1A:1848 [G] D:135 [ARG] A:2528 [G] ✔
1D:88 [ARG] 1A:1849 [U] D:135 [ARG] A:2529 [U] ✔
1D:51 [VAL] 1A:1844 [G] D:93 [VAL] A:2524 [A] ✔
1D:51 [VAL] 1A:1845 [G] D:93 [VAL] A:2525 [C] ✔
1D:51 [VAL] 1A:1854 [G] D:93 [VAL] A:2534 [G] ✔
1D:229 [VAL] 1A:2095 [C] D:278 [LYS] A:2736 [C] ✔
1D:229 [VAL] 1A:2096 [U] D:278 [LYS] A:2737 [U] ✔
1D:157 [ARG] 1A:1848 [G] D:208 [ARG] A:2528 [G] ✔
1D:157 [ARG] 1A:1849 [U] D:208 [ARG] A:2529 [U] ✔
1D:157 [ARG] 1A:1850 [A] D:208 [ARG] A:2530 [A] ✔
1D:223 [GLY] 1A:1856 [A] D:274 [ARG] A:2536 [G] ✔
1D:42 [GLY] 1A:1844 [G] D:84 [GLY] A:2524 [A] ✔
1D:65 [ILE] 1A:1848 [G] D:107 [ILE] A:2528 [G] ✔
1D:87 [ASN] 1A:1848 [G] D:134 [CYS] A:2528 [G] ✔
1D:177 [LEU] 1A:1830 [G] D:228 [LEU] A:2519 [G] ✔
1D:159 [ALA] 1A:1851 [U] D:210 [ALA] A:2531 [U] ✔
1D:67 [PHE] 1A:1848 [G] D:109 [PHE] A:2528 [G] ✔
1D:67 [PHE] 1A:1849 [U] D:109 [PHE] A:2529 [U] ✔
1D:45 [ASN] 1A:1843 [A] D:87 [HIS] A:2523 [C] ✔
1D:43 [ARG] 1A:737 [G] D:85 [ARG] A:1922 [C] ✔
1D:43 [ARG] 1A:738 [C] D:85 [ARG] A:1923 [C] ✔
1D:43 [ARG] 1A:826 [U] D:85 [ARG] A:1989 [C] ✔
1D:43 [ARG] 1A:827 [G] D:85 [ARG] A:1990 [G] ✔
1D:43 [ARG] 1A:1844 [G] D:85 [ARG] A:2524 [A] ✔
1D:48 [ARG] 1A:820 [U] D:90 [ARG] A:1983 [U] ✔
1D:48 [ARG] 1A:821 [A] D:90 [ARG] A:1984 [A] ✔
1D:48 [ARG] 1A:822 [G] D:90 [ARG] A:1985 [G] ✔
1D:48 [ARG] 1A:824 [A] D:90 [ARG] A:1987 [G] ✔
1D:48 [ARG] 1A:825 [G] D:90 [ARG] A:1988 [G] ✔
1D:48 [ARG] 1A:826 [U] D:90 [ARG] A:1989 [C] ✔
1D:41 [GLY] 1A:738 [C] D:83 [GLY] A:1923 [C] ✔
1D:41 [GLY] 1A:739 [C] D:83 [GLY] A:1924 [U] ✔
1D:47 [GLY] 1A:819 [C] D:89 [GLY] A:1982 [G] ✔
1D:47 [GLY] 1A:820 [U] D:89 [GLY] A:1983 [U] ✔
1D:47 [GLY] 1A:826 [U] D:89 [GLY] A:1989 [C] ✔
1D:50 [THR] 1A:1844 [G] D:92 [ARG] A:2524 [A] ✔
1D:204 [ILE] 1A:1823 [G] D:255 [ARG] A:2512 [A] ✔
1D:214 [TRP] 1A:811 [A] D:265 [TRP] A:1974 [A] ✔
1D:214 [TRP] 1A:1613 [A] D:265 [TRP] A:2401 [A] ✔
1D:61 [LEU] 1A:1615 [G] D:103 [ARG] A:2403 [G] ✔
1D:61 [LEU] 1A:1616 [A] D:103 [ARG] A:2404 [U] ✔
1D:40 [THR] 1A:738 [C] D:82 [SER] A:1923 [C] ✔
1D:40 [THR] 1A:739 [C] D:82 [SER] A:1924 [U] ✔
1D:40 [THR] 1A:1844 [G] D:82 [SER] A:2524 [A] ✔
1D:40 [THR] 1A:1845 [G] D:82 [SER] A:2525 [C] ✔
1D:221 [VAL] 1A:828 [A] D:272 [SER] A:1991 [A] ✔
1D:221 [VAL] 1A:829 [A] D:272 [SER] A:1992 [C] ✔
1D:221 [VAL] 1A:1820 [A] D:272 [SER] A:2509 [A] ✔
1D:199 [ALA] 1A:1851 [U] D:250 [VAL] A:2531 [U] ✔
1D:178 [PRO] 1A:1830 [G] D:229 [PRO] A:2519 [G] ✔
1D:178 [PRO] 1A:1850 [A] D:229 [PRO] A:2530 [A] ✔
1D:202 [LYS] 1A:1851 [U] D:253 [ASN] A:2531 [U] ✔
1D:39 [LYS] 1A:739 [C] D:81 [LYS] A:1924 [U] ✔
1D:39 [LYS] 1A:740 [C] D:81 [LYS] A:1925 [A] ✔
1D:218 [ARG] 1A:737 [G] D:269 [ARG] A:1922 [C] ✔
1D:218 [ARG] 1A:738 [C] D:269 [ARG] A:1923 [C] ✔
1D:218 [ARG] 1A:827 [G] D:269 [ARG] A:1990 [G] ✔
1D:155 [LEU] 1A:1830 [G] D:206 [TYR] A:2519 [G] ✔
1D:155 [LEU] 1A:1849 [U] D:206 [TYR] A:2529 [U] ✔
1D:155 [LEU] 1A:1850 [A] D:206 [TYR] A:2530 [A] ✔
1D:212 [SER] 1A:1821 [C] D:263 [ASN] A:2510 [U] ✔
1D:212 [SER] 1A:1822 [A] D:263 [ASN] A:2511 [C] ✔
1D:158 [ALA] 1A:1849 [U] D:209 [ALA] A:2529 [U] ✔
1D:158 [ALA] 1A:1850 [A] D:209 [ALA] A:2530 [A] ✔
1D:158 [ALA] 1A:1851 [U] D:209 [ALA] A:2531 [U] ✔
1D:158 [ALA] 1A:1852 [A] D:209 [ALA] A:2532 [U] ✔
1D:59 [LYS] 1A:741 [U] D:101 [LYS] A:1926 [A] ✔
1D:59 [LYS] 1A:1614 [A] D:101 [LYS] A:2402 [A] ✔
1D:59 [LYS] 1A:1615 [G] D:101 [LYS] A:2403 [G] ✔
1D:59 [LYS] 1A:1616 [A] D:101 [LYS] A:2404 [U] ✔
1D:52 [ARG] 1A:1855 [G] D:94 [HIS] A:2535 [A] ✔
1D:46 [GLN] 1A:819 [C] D:88 [THR] A:1982 [G] ✔
1D:46 [GLN] 1A:820 [U] D:88 [THR] A:1983 [U] ✔
1D:179 [SER] 1A:1830 [G] D:230 [SER] A:2519 [G] ✔
1D:179 [SER] 1A:1850 [A] D:230 [SER] A:2530 [A] ✔
1D:230 [ASP] 1A:827 [G] D:279 [GLY] A:1990 [G] ❌ 7OF0_D_A
1D:230 [ASP] 1A:829 [A] D:279 [GLY] A:1992 [C] ❌ 7OF0_D_A
1D:38 [LYS] 1A:1847 [G] D:80 [ARG] A:2527 [A] ❌ 7OF0_D_A
1D:232 [PRO] 1A:2251 [G] D:281 [TRP] A:2803 [A] ❌ 7OF0_D_A
1D:222 [ARG] 1A:1820 [A] D:273 [GLY] A:2509 [A] ❌ 7OF0_D_A
1D:222 [ARG] 1A:1857 [G] D:273 [GLY] A:2537 [G] ❌ 7OF0_D_A
1D:154 [LYS] 1A:1850 [A] D:205 [GLN] A:2530 [A] ❌ 7OF0_D_A
1D:36 [PRO] 1A:1617 [A] D:78 [LYS] A:2405 [C] ❌ 7OF0_D_A
1D:44 [ASN] 1A:1843 [A] D:86 [ASP] A:2523 [C] ❌ 7OF0_D_A
1D:54 [ARG] 1A:1846 [A] D:96 [ILE] A:2526 [C] ❌ 7OF0_D_A
1D:220 [HIS] 1A:1820 [A] D:271 [ASN] A:2509 [A] ❌ 7OF0_D_A
1D:220 [HIS] 1A:1821 [C] D:271 [ASN] A:2510 [U] ❌ 7OF0_D_A
1D:220 [HIS] 1A:1855 [G] D:271 [ASN] A:2535 [A] ❌ 7OF0_D_A
1D:220 [HIS] 1A:1856 [A] D:271 [ASN] A:2536 [G] ❌ 7OF0_D_A
1D:31 [LYS] 1A:1471 [G] D:73 [THR] A:2388 [A] ❌ 7OF0_D_A
1D:31 [LYS] 1A:1473 [A] D:73 [THR] A:2389 [C] ❌ 7OF0_D_A
1D:254 [THR] 1A:1854 [G] D:285 [LYS] A:2534 [G] ❌ 7OF0_D_A
1D:254 [THR] 1A:1855 [G] D:285 [LYS] A:2535 [A] ❌ 7OF0_D_A
1D:254 [THR] 1A:1856 [A] D:285 [LYS] A:2536 [G] ❌ 7OF0_D_A
1D:223 [GLY] 1A:1857 [G] D:274 [ARG] A:2537 [G] ❌ 7OF0_D_A
1D:42 [GLY] 1A:1845 [G] D:84 [GLY] A:2525 [C] ❌ 7OF0_D_A
1D:45 [ASN] 1A:1844 [G] D:87 [HIS] A:2524 [A] ❌ 7OF0_D_A
1D:32 [SER] 1A:1470 [G] D:74 [ILE] A:2387 [U] ❌ 7OF0_D_A
1D:228 [PRO] 1A:2095 [C] D:277 [ARG] A:2736 [C] ❌ 7OF0_D_A
1D:228 [PRO] 1A:2096 [U] D:277 [ARG] A:2737 [U] ❌ 7OF0_D_A
1D:34 [VAL] 1A:1617 [A] D:76 [PRO] A:2405 [C] ❌ 7OF0_D_A
1D:47 [GLY] 1A:737 [G] D:89 [GLY] A:1922 [C] ❌ 7OF0_D_A
1D:50 [THR] 1A:1843 [A] D:92 [ARG] A:2523 [C] ❌ 7OF0_D_A
1D:214 [TRP] 1A:1612 [C] D:265 [TRP] A:2400 [C] ❌ 7OF0_D_A
1D:221 [VAL] 1A:1856 [A] D:272 [SER] A:2536 [G] ❌ 7OF0_D_A
1D:178 [PRO] 1A:1851 [U] D:229 [PRO] A:2531 [U] ❌ 7OF0_D_A
1D:218 [ARG] 1A:828 [A] D:269 [ARG] A:1991 [A] ❌ 7OF0_D_A
1D:52 [ARG] 1A:1856 [A] D:94 [HIS] A:2536 [G] ❌ 7OF0_D_A
1D:61 [LEU] 1A:1473 [A] D:103 [ARG] A:2389 [C] ❌ 4Y4O_1D_1A
1D:61 [LEU] 1A:1617 [A] D:103 [ARG] A:2405 [C] ❌ 4Y4O_1D_1A
1D:102 [LYS] 1A:1471 [G] D:148 [LYS] A:2388 [A] ❌ 4Y4O_1D_1A
1D:102 [LYS] 1A:1470 [G] D:148 [LYS] A:2387 [U] ❌ 4Y4O_1D_1A
1D:155 [LEU] 1A:1831 [C] D:206 [TYR] A:2520 [C] ❌ 4Y4O_1D_1A
1D:157 [ARG] 1A:1832 [G] D:208 [ARG] A:2521 [A] ❌ 4Y4O_1D_1A
1D:157 [ARG] 1A:1847 [G] D:208 [ARG] A:2527 [A] ❌ 4Y4O_1D_1A
1D:204 [ILE] 1A:1613 [A] D:255 [ARG] A:2401 [A] ❌ 4Y4O_1D_1A
1D:214 [TRP] 1A:1614 [A] D:265 [TRP] A:2402 [A] ❌ 4Y4O_1D_1A
1D:214 [TRP] 1A:810 [G] D:265 [TRP] A:1973 [G] ❌ 4Y4O_1D_1A
1D:215 [LEU] 1A:1614 [A] D:266 [LEU] A:2402 [A] ❌ 4Y4O_1D_1A
1D:218 [ARG] 1A:826 [U] D:269 [ARG] A:1989 [C] ❌ 4Y4O_1D_1A
1D:220 [HIS] 1A:828 [A] D:271 [ASN] A:1991 [A] ❌ 4Y4O_1D_1A
1D:220 [HIS] 1A:827 [G] D:271 [ASN] A:1990 [G] ❌ 4Y4O_1D_1A
1D:221 [VAL] 1A:827 [G] D:272 [SER] A:1990 [G] ❌ 4Y4O_1D_1A
1D:222 [ARG] 1A:827 [G] D:273 [GLY] A:1990 [G] ❌ 4Y4O_1D_1A
1D:222 [ARG] 1A:829 [A] D:273 [GLY] A:1992 [C] ❌ 4Y4O_1D_1A
1D:223 [GLY] 1A:1855 [G] D:274 [ARG] A:2535 [A] ❌ 4Y4O_1D_1A
1D:223 [GLY] 1A:1854 [G] D:274 [ARG] A:2534 [G] ❌ 4Y4O_1D_1A
1D:228 [PRO] 1A:2251 [G] D:277 [ARG] A:2803 [A] ❌ 4Y4O_1D_1A
1D:230 [ASP] 1A:2096 [U] D:279 [GLY] A:2737 [U] ❌ 4Y4O_1D_1A
1D:232 [PRO] 1A:1855 [G] D:281 [TRP] A:2535 [A] ❌ 4Y4O_1D_1A
1D:232 [PRO] 1A:1856 [A] D:281 [TRP] A:2536 [G] ❌ 4Y4O_1D_1A
1D:232 [PRO] 1A:1857 [G] D:281 [TRP] A:2537 [G] ❌ 4Y4O_1D_1A
1D:31 [LYS] 1A:1470 [G] D:73 [THR] A:2387 [U] ❌ 4Y4O_1D_1A
1D:32 [SER] 1A:1471 [G] D:74 [ILE] A:2388 [A] ❌ 4Y4O_1D_1A
1D:34 [VAL] 1A:1473 [A] D:76 [PRO] A:2389 [C] ❌ 4Y4O_1D_1A
1D:34 [VAL] 1A:1471 [G] D:76 [PRO] A:2388 [A] ❌ 4Y4O_1D_1A
1D:36 [PRO] 1A:741 [U] D:78 [LYS] A:1926 [A] ❌ 4Y4O_1D_1A
1D:36 [PRO] 1A:740 [C] D:78 [LYS] A:1925 [A] ❌ 4Y4O_1D_1A
1D:37 [LEU] 1A:740 [C] D:79 [MET] A:1925 [A] ❌ 4Y4O_1D_1A
1D:38 [LYS] 1A:739 [C] D:80 [ARG] A:1924 [U] ❌ 4Y4O_1D_1A
1D:38 [LYS] 1A:740 [C] D:80 [ARG] A:1925 [A] ❌ 4Y4O_1D_1A
1D:43 [ARG] 1A:819 [C] D:85 [ARG] A:1982 [G] ❌ 4Y4O_1D_1A
1D:52 [ARG] 1A:827 [G] D:94 [HIS] A:1990 [G] ❌ 4Y4O_1D_1A
1D:52 [ARG] 1A:1854 [G] D:94 [HIS] A:2534 [G] ❌ 4Y4O_1D_1A
1D:217 [ARG] 1A:1853 [G] D:268 [LYS] A:2533 [A] ❌ 7OF0_D:268, 7OF0_A:2533 no longer at interface
1D:58 [HIS] 1A:1475 [G] D:100 [HIS] A:2391 [A] ❌ 7OF0_A:2391 no longer at interface
1D:222 [ARG] 1A:1818 [A] D:273 [GLY] A:2507 [A] ❌ 7OF0_A:2507 no longer at interface
1D:222 [ARG] 1A:1819 [C] D:273 [GLY] A:2508 [C] ❌ 7OF0_A:2508 no longer at interface
1D:222 [ARG] 1A:1858 [C] D:273 [GLY] A:2538 [C] ❌ 7OF0_A:2538 no longer at interface
1D:222 [ARG] 1A:1859 [G] D:273 [GLY] A:2539 [A] ❌ 7OF0_A:2539 no longer at interface
1D:209 [ALA] 1A:1806 [U] D:260 [ALA] A:2495 [U] ❌ 7OF0_A:2495 no longer at interface
1D:44 [ASN] 1A:1842 [G] D:86 [ASP] A:2522 [U] ❌ 7OF0_A:2522 no longer at interface
1D:54 [ARG] 1A:1853 [G] D:96 [ILE] A:2533 [A] ❌ 7OF0_A:2533 no longer at interface
1D:254 [THR] 1A:1826 [C] D:285 [LYS] A:2515 [U] ❌ 7OF0_A:2515 no longer at interface
1D:254 [THR] 1A:1827 [U] D:285 [LYS] A:2516 [C] ❌ 7OF0_A:2516 no longer at interface
1D:229 [VAL] 1A:831 [A] D:278 [LYS] A:1994 [A] ❌ 7OF0_A:1994 no longer at interface
1D:229 [VAL] 1A:840 [A] D:278 [LYS] A:2003 [A] ❌ 7OF0_A:2003 no longer at interface
1D:229 [VAL] 1A:2094 [G] D:278 [LYS] A:2735 [G] ❌ 7OF0_A:2735 no longer at interface
1D:45 [ASN] 1A:1842 [G] D:87 [HIS] A:2522 [U] ❌ 7OF0_A:2522 no longer at interface
1D:228 [PRO] 1A:2610 [A] D:277 [ARG] A:3085 [A] ❌ 7OF0_A:3085 no longer at interface
1D:228 [PRO] 1A:2611 [G] D:277 [ARG] A:3086 [U] ❌ 7OF0_A:3086 no longer at interface
1D:221 [VAL] 1A:1819 [C] D:272 [SER] A:2508 [C] ❌ 7OF0_A:2508 no longer at interface
1D:46 [GLN] 1A:1842 [G] D:88 [THR] A:2522 [U] ❌ 7OF0_A:2522 no longer at interface
1D:59 [LYS] 1A:742 [G] D:101 [LYS] A:1927 [G] ❌ 4Y4O_1A:742 no longer at interface
1D:83 [GLU] 1A:1474 [C] D:130 [ARG] A:2390 [A] ❌ 4Y4O_1D:83, 4Y4O_1A:1474 no longer at interface
1D:228 [PRO] 1A:2252 [C] D:277 [ARG] A:2804 [A] ❌ 4Y4O_1A:2252 no longer at interface
1D:229 [VAL] 1A:2252 [C] D:278 [LYS] A:2804 [A] ❌ 4Y4O_1A:2252 no longer at interface
1D:229 [VAL] 1A:2253 [A] D:278 [LYS] A:2805 [A] ❌ 4Y4O_1A:2253 no longer at interface
1D:254 [THR] 1A:2098 [U] D:285 [LYS] A:2739 [U] ❌ 4Y4O_1A:2098 no longer at interface
1D:53 [PHE] 1A:828 [A] D:95 [GLY] A:1991 [A] ❌ 7OF0_D:95 no longer at interface
1D:53 [PHE] 1A:829 [A] D:95 [GLY] A:1992 [C] ❌ 7OF0_D:95 no longer at interface
1D:53 [PHE] 1A:1855 [G] D:95 [GLY] A:2535 [A] ❌ 7OF0_D:95 no longer at interface
1D:183 [ARG] 1A:1830 [G] D:234 [MET] A:2519 [G] ❌ 7OF0_D:234 no longer at interface
1D:183 [ARG] 1A:1831 [C] D:234 [MET] A:2520 [C] ❌ 7OF0_D:234 no longer at interface
1D:35 [LYS] 1A:1617 [A] D:77 [VAL] A:2405 [C] ❌ 7OF0_D:77 no longer at interface
1D:35 [LYS] 1A:1847 [G] D:77 [VAL] A:2527 [A] ❌ 7OF0_D:77 no longer at interface
1D:246 [PRO] 1A:1856 [A] D:282 [ALA] A:2536 [G] ❌ 7OF0_D:282 no longer at interface
1D:148 [GLU] 1A:1832 [G] D:199 [GLU] A:2521 [A] ❌ 7OF0_D:199 no longer at interface
1D:147 [LEU] 1A:1830 [G] D:198 [SER] A:2519 [G] ❌ 7OF0_D:198 no longer at interface
1D:147 [LEU] 1A:1831 [C] D:198 [SER] A:2520 [C] ❌ 7OF0_D:198 no longer at interface
1D:147 [LEU] 1A:1832 [G] D:198 [SER] A:2521 [A] ❌ 7OF0_D:198 no longer at interface
1D:247 [ALA] 1A:1855 [G] D:283 [GLY] A:2535 [A] ❌ 7OF0_D:283 no longer at interface
1D:247 [ALA] 1A:1856 [A] D:283 [GLY] A:2536 [G] ❌ 7OF0_D:283 no longer at interface
1D:57 [GLY] 1A:739 [C] D:99 [GLY] A:1924 [U] ❌ 7OF0_D:99 no longer at interface
1D:231 [HIS] 1A:1855 [G] D:280 [GLY] A:2535 [A] ❌ 7OF0_D:280 no longer at interface
1D:231 [HIS] 1A:1856 [A] D:280 [GLY] A:2536 [G] ❌ 7OF0_D:280 no longer at interface
1D:231 [HIS] 1A:1857 [G] D:280 [GLY] A:2537 [G] ❌ 7OF0_D:280 no longer at interface
1D:64 [ILE] 1A:1847 [G] D:106 [MET] A:2527 [A] ❌ 4Y4O_1D:64 no longer at interface
1D:80 [ALA] 1A:1471 [G] D:127 [ILE] A:2388 [A] ❌ 4Y4O_1D:80 no longer at interface
1D:81 [ALA] 1A:1471 [G] D:128 [GLN] A:2388 [A] ❌ 4Y4O_1D:81 no longer at interface
1D:83 [GLU] 1A:1473 [A] D:130 [ARG] A:2389 [C] ❌ 4Y4O_1D:83 no longer at interface
1D:83 [GLU] 1A:1471 [G] D:130 [ARG] A:2388 [A] ❌ 4Y4O_1D:83 no longer at interface
1D:83 [GLU] 1A:1614 [A] D:130 [ARG] A:2402 [A] ❌ 4Y4O_1D:83 no longer at interface
1D:83 [GLU] 1A:1615 [G] D:130 [ARG] A:2403 [G] ❌ 4Y4O_1D:83 no longer at interface
1D:94 [LEU] 1A:1471 [G] D:141 [LEU] A:2388 [A] ❌ 4Y4O_1D:94 no longer at interface
1D:104 [TYR] 1A:1471 [G] D:150 [TRP] A:2388 [A] ❌ 4Y4O_1D:104 no longer at interface
1D:152 [GLY] 1A:1832 [G] D:203 [GLY] A:2521 [A] ❌ 4Y4O_1D:152 no longer at interface
1D:153 [ALA] 1A:1832 [G] D:204 [ALA] A:2521 [A] ❌ 4Y4O_1D:153 no longer at interface
1D:195 [ALA] 1A:1851 [U] D:246 [ARG] A:2531 [U] ❌ 4Y4O_1D:195 no longer at interface
1D:33 [LEU] 1A:1471 [G] D:75 [THR] A:2388 [A] ❌ 4Y4O_1D:33 no longer at interface
1D:33 [LEU] 1A:1470 [G] D:75 [THR] A:2387 [U] ❌ 4Y4O_1D:33 no longer at interface

logo_download Export the table of contacts

Properties of this pair

Common ECOD label(s)
 Common RFAM label(s)
 Interface TM-score
 Interface RMSD
 Percentage identity
 Protein TM-score
 RNA TM-score
 Protein coverage
 RNA coverage
 Percentage conservation
 Apolar conservation
 H-bond conservation
 Percentage switching out
Nucleic acid-binding proteins & SH3 Bacterial large subunit ribosomal RNA 0.95 2.68 0.42 0.78 0.97 0.76 0.84 0.69 0.71 0.44 0.45


Other pairs involving 4Y4O_1D_1A or 7OF0_D_A

Total number of entries: 19

Interface 1 Interface 2 Percentage conservation
 		Interface TM-score
 		Interface RMSD
 		Percentage identity
 		Common ECOD label(s)
 		Common RFAM label(s)
 		Explore both interfaces
6YSI_A_1 7OF0_D_A 0.68 0.92 2.67 0.31 Nucleic acid-binding proteins & SH3 Bacterial large subunit ribosomal RNA compare
6S0Z_C_A 7OF0_D_A 0.68 0.95 2.97 0.33 Nucleic acid-binding proteins & SH3 Bacterial large subunit ribosomal RNA compare
1VQ8_A_0 7OF0_D_A 0.48 0.92 4.32 0.16 Nucleic acid-binding proteins & SH3 compare
1VQ8_A_0 4Y4O_1D_1A 0.57 0.93 3.73 0.29 Nucleic acid-binding proteins & SH3 compare
7OF0_D_A 7RYG_C_A 0.68 0.91 3.39 0.33 Nucleic acid-binding proteins & SH3 Bacterial large subunit ribosomal RNA compare
1JJ2_A_0 7OF0_D_A 0.47 0.93 4.29 0.16 Nucleic acid-binding proteins & SH3 compare
1JJ2_A_0 4Y4O_1D_1A 0.55 0.93 3.52 0.28 Nucleic acid-binding proteins & SH3 compare
6AZ3_A_1,2 7OF0_D_A 0.48 0.8 4.46 0.12 Nucleic acid-binding proteins & SH3 compare
4Y4O_1D_1A 7OF0_D_A 0.69 0.95 2.68 0.42 Nucleic acid-binding proteins & SH3 Bacterial large subunit ribosomal RNA compare
4Y4O_1D_1A 6YSI_A_1 0.86 0.97 1.15 0.57 Nucleic acid-binding proteins & SH3 Bacterial large subunit ribosomal RNA compare
4Y4O_1D_1A 6AZ3_A_1,2 0.59 0.77 3.76 0.22 Nucleic acid-binding proteins & SH3 compare
4Y4O_1D_1A 6S0Z_C_A 0.86 0.97 1.58 0.66 Nucleic acid-binding proteins & SH3 Bacterial large subunit ribosomal RNA compare
4Y4O_1D_1A 6AZ3_A_3 0.47 0.68 3.83 0.1 Nucleic acid-binding proteins & SH3 compare
4Y4O_1D_1A 7K00_c_a 0.85 0.97 0.98 0.63 Nucleic acid-binding proteins & SH3 Bacterial large subunit ribosomal RNA compare
4Y4O_1D_1A 7O7Y_BA_B5 0.60 0.88 3.82 0.22 Nucleic acid-binding proteins & SH3 compare
4Y4O_1D_1A 7RYG_C_A 0.84 0.96 2.18 0.61 Nucleic acid-binding proteins & SH3 Bacterial large subunit ribosomal RNA compare
7K00_c_a 7OF0_D_A 0.69 0.92 2.63 0.4 Nucleic acid-binding proteins & SH3 Bacterial large subunit ribosomal RNA compare
1YHQ_A_0 7OF0_D_A 0.47 0.93 4.33 0.16 Nucleic acid-binding proteins & SH3 compare
1YHQ_A_0 4Y4O_1D_1A 0.57 0.93 3.66 0.29 Nucleic acid-binding proteins & SH3 compare