RNAprotDB

All interfaces > All interologs > Interface groups > group131 > 6AZ3_A_1,2

Interface analysis

mouse controls

Style

Protein

Cartoon
Licorice
Surface

RNA

Cartoon
Licorice
Surface

Color

Chain
Chain (with hetatm)
Chainbow
Hydrophobicity
Electrostatics (surface only)
Conservation*

View

Focus on

Interface
RNA
Protein
All

Show chains

Interface

show as licorice
show Accessibility
Rim - Core

Contacts -

6AZ3_A
6AZ3_1,2
Distance
Base Pair
Hbond nuc:res
Base Stacking
Residue conservation
A:2 [GLY] 1:959 [OMG] 4.61 80.67
A:2 [GLY] 1:976 [A] 3.44 80.67
A:2 [GLY] 2:2443 [U] 3.21 2:3026 [A] 80.67
A:2 [GLY] 2:2444 [U] 4.66 2:3025 [A] 80.67
A:2 [GLY] 2:2818 [G] 3.03 2:2450 [C] 80.67
A:3 [LYS] 1:960 [A] 3.15 1:970 [U] 90.72
A:3 [LYS] 1:961 [G] 3.15 1:969 [C] base:SC, base:SC 90.72
A:3 [LYS] 1:962 [C] 3.84 1:968 [A] 90.72
A:3 [LYS] 1:967 [G] 4.09 90.72
A:3 [LYS] 1:976 [A] 3.68 90.72
A:3 [LYS] 2:2443 [U] 4.63 2:3026 [A] 90.72
A:3 [LYS] 2:2818 [G] 4.3 2:2450 [C] 90.72
A:4 [THR] 1:960 [A] 3.93 1:970 [U] 79.05
A:4 [THR] 1:961 [G] 3.48 1:969 [C] 79.05
A:4 [THR] 1:963 [G] 4.79 1:966 [A] 79.05
A:5 [VAL] 2:2212 [A] 4.94 2:2180 [U] 82.44
A:6 [LEU] 1:963 [G] 4.22 1:966 [A] 67.46
A:6 [LEU] 1:965 [A] 4.4 67.46
A:7 [SER] 2:2190 [A] 4.94 2:2200 [U] 63.99
A:7 [SER] 2:2191 [U] 3.85 2:2199 [G] 63.99
A:7 [SER] 2:2211 [A] 3.43 2:2181 [U] 63.99
A:7 [SER] 2:2212 [A] 4.76 2:2180 [U] 63.99
A:8 [CYS] 2:2191 [U] 3.36 2:2199 [G] sugar:BB 91.5
A:8 [CYS] 2:2192 [C] 3.21 2:2198 [G] 91.5
A:9 [ARG] 1:961 [G] 3.37 1:969 [C] 92.25
A:9 [ARG] 1:962 [C] 3.08 1:968 [A] base/AA stacks 92.25
A:9 [ARG] 1:963 [G] 3.1 1:966 [A] base:SC, base:SC 92.25
A:10 [LYS] 2:2191 [U] 4.91 2:2199 [G] 86.0
A:10 [LYS] 2:2200 [U] 3.22 2:2190 [A] sugar:BB 86.0
A:10 [LYS] 2:2201 [G] 4.93 2:2189 [C] 86.0
A:10 [LYS] 2:2211 [A] 3.84 2:2181 [U] 86.0
A:11 [GLY] 2:2191 [U] 3.24 2:2199 [G] 96.19
A:11 [GLY] 2:2192 [C] 3.58 2:2198 [G] 96.19
A:11 [GLY] 2:2199 [G] 3.01 2:2191 [U] base:BB 96.19
A:11 [GLY] 2:2200 [U] 3.53 2:2190 [A] 96.19
A:12 [ASN] 1:961 [G] 3.97 1:969 [C] 66.07
A:12 [ASN] 2:2191 [U] 4.78 2:2199 [G] 66.07
A:12 [ASN] 2:2192 [C] 2.54 2:2198 [G] sugar:SC 66.07
A:12 [ASN] 2:2193 [C] 4.22 66.07
A:12 [ASN] 2:2199 [G] 4.37 2:2191 [U] 66.07
A:12 [ASN] 2:2200 [U] 4.03 2:2190 [A] 66.07
A:13 [GLY] 2:2200 [U] 3.28 2:2190 [A] 79.35
A:14 [SER] 1:955 [A2M] 3.26 1:872 [U] 70.3
A:14 [SER] 1:956 [U] 3.44 1:871 [A] sugar:SC 70.3
A:14 [SER] 1:961 [G] 4.74 1:969 [C] 70.3
A:14 [SER] 1:962 [C] 2.7 1:968 [A] 70.3
A:15 [VAL] 1:872 [U] 3.31 1:955 [A2M] 14.93
A:15 [VAL] 1:873 [G] 3.31 1:954 [U] sugar:BB 14.93
A:15 [VAL] 1:955 [A2M] 4.42 1:872 [U] 14.93
A:15 [VAL] 1:956 [U] 3.99 1:871 [A] 14.93
A:15 [VAL] 1:962 [C] 3.78 1:968 [A] 14.93
A:15 [VAL] 1:963 [G] 4.51 1:966 [A] 14.93
A:16 [TYR] 1:962 [C] 3.66 1:968 [A] 53.89
A:16 [TYR] 1:963 [G] 2.27 1:966 [A] 53.89
A:16 [TYR] 2:2200 [U] 4.2 2:2190 [A] 53.89
A:16 [TYR] 2:2201 [G] 3.61 2:2189 [C] 53.89
A:17 [GLN] 1:1644 [G] 4.96 1:1737 [C] 66.46
A:17 [GLN] 2:2200 [U] 3.31 2:2190 [A] 66.46
A:17 [GLN] 2:2201 [G] 3.73 2:2189 [C] 66.46
A:18 [VAL] 2:2200 [U] 4.73 2:2190 [A] 66.91
A:18 [VAL] 2:2201 [G] 3.15 2:2189 [C] 66.91
A:18 [VAL] 2:2202 [U] 3.23 2:2188 [G] 66.91
A:18 [VAL] 2:2203 [A] 3.44 66.91
A:19 [HIS] 1:873 [G] 3.21 1:954 [U] 53.76
A:19 [HIS] 1:874 [C] 3.46 1:953 [G] 53.76
A:20 [GLY] 2:2203 [A] 2.77 52.77
A:21 [HIS] 1:874 [C] 4.72 1:953 [G] 64.44
A:21 [HIS] 1:875 [C] 3.66 1:952 [G] 64.44
A:21 [HIS] 1:876 [U] 3.45 1:951 [G] 64.44
A:21 [HIS] 1:1642 [G] 3.17 sugar:SC 64.44
A:21 [HIS] 1:1643 [A] 3.56 1:1738 [A] 64.44
A:21 [HIS] 2:2203 [A] 4.18 64.44
A:22 [LYS] 1:875 [C] 4.92 1:952 [G] 48.58
A:22 [LYS] 1:876 [U] 4.57 1:951 [G] 48.58
A:23 [ARG] 2:2202 [U] 4.17 2:2188 [G] 44.13
A:23 [ARG] 2:2203 [A] 3.37 sugar:SC 44.13
A:23 [ARG] 2:2204 [U] 4.89 2:2186 [A] 44.13
A:24 [LEU] 1:1664 [G] 4.62 26.05
A:24 [LEU] 2:2203 [A] 2.93 base:BB 26.05
A:25 [GLY] 1:1663 [U] 4.71 57.42
A:25 [GLY] 1:1664 [G] 3.85 57.42
A:25 [GLY] 2:2203 [A] 4.1 57.42
A:25 [GLY] 2:2204 [U] 4.71 2:2186 [A] 57.42
A:26 [PRO] 1:1663 [U] 3.24 3.83
A:26 [PRO] 1:1664 [G] 4.76 3.83
A:26 [PRO] 2:2203 [A] 3.53 3.83
A:26 [PRO] 2:2204 [U] 3.98 2:2186 [A] 3.83
A:27 [ALA] 2:2203 [A] 4.48 58.35
A:27 [ALA] 2:2204 [U] 3.46 2:2186 [A] 58.35
A:28 [LYS] 2:2548 [A] 4.86 2:2796 [U] 28.11
A:28 [LYS] 2:2549 [U] 4.39 2:2551 [A] 28.11
A:31 [ILE] 2:2548 [A] 4.86 2:2796 [U] 12.7
A:31 [ILE] 2:2549 [U] 3.65 2:2551 [A] 12.7
A:31 [ILE] 2:2550 [G] 3.37 12.7
A:33 [ASP] 2:2552 [A] 4.96 46.66
A:33 [ASP] 2:2553 [G] 4.79 46.66
A:34 [TYR] 2:2553 [G] 3.36 base/AA stacks 1.58
A:34 [TYR] 2:2554 [A] 3.28 2:2792 [U] 1.58
A:34 [TYR] 2:2747 [G] 3.56 2:2596 [A] 1.58
A:34 [TYR] 2:2748 [C] 2.14 1.58
A:37 [ARG] 2:2552 [A] 4.94 49.12
A:37 [ARG] 2:2553 [G] 2.94 49.12
A:37 [ARG] 2:2554 [A] 2.42 2:2792 [U] 49.12
A:37 [ARG] 2:2797 [U] 4.98 2:2547 [A] 49.12
A:38 [HIS] 2:2554 [A] 3.92 2:2792 [U] 28.03
A:38 [HIS] 2:2747 [G] 3.36 2:2596 [A] 28.03
A:38 [HIS] 2:2748 [C] 4.12 28.03
A:39 [GLY] 2:2750 [G] 3.64 0.88
A:40 [TYR] 2:2750 [G] 2.89 base:BB, base:BB base/AA stacks 13.11
A:40 [TYR] 2:2751 [U] 3.0 base/AA stacks 13.11
A:41 [MET] 2:2750 [G] 4.79 16.62
A:42 [ARG] 2:2750 [G] 4.57 11.74
A:42 [ARG] 2:2755 [C] 4.55 11.74
A:44 [VAL] 2:2756 [U] 3.69 32.21
A:44 [VAL] 2:2757 [G] 4.69 32.21
A:45 [VAL] 2:2756 [U] 4.74 83.33
A:46 [LYS] 2:2756 [U] 3.23 30.79
A:51 [GLU] 2:2203 [A] 4.51 72.48
A:51 [GLU] 2:2204 [U] 4.54 2:2186 [A] 72.48
A:54 [ARG] 2:2203 [A] 4.71 79.84
A:54 [ARG] 2:2204 [U] 2.28 2:2186 [A] 79.84
A:54 [ARG] 2:2205 [A] 2.9 79.84
A:64 [ARG] 2:2759 [A] 3.44 sugar:SC base/AA stacks 32.93
A:65 [HIS] 2:2550 [G] 4.67 53.49
A:67 [TYR] 2:2552 [A] 2.68 sugar:SC base/AA stacks 11.47
A:67 [TYR] 2:2553 [G] 3.06 base:SC 11.47
A:68 [LYS] 1:1730 [A] 4.99 1:1674 [U] 6.75
A:68 [LYS] 1:1731 [A] 2.59 6.75
A:68 [LYS] 1:1732 [A] 3.74 6.75
A:68 [LYS] 2:2550 [G] 3.33 base:SC 6.75
A:68 [LYS] 2:2552 [A] 3.36 6.75
A:69 [PHE] 2:2759 [A] 3.15 16.88
A:69 [PHE] 2:2760 [C] 3.44 base/AA stacks 16.88
A:70 [ARG] 1:1732 [A] 4.4 11.01
A:70 [ARG] 2:2550 [G] 3.49 base:SC 11.01
A:71 [ARG] 2:2757 [G] 4.87 19.91
A:71 [ARG] 2:2758 [A] 2.84 19.91
A:71 [ARG] 2:2759 [A] 3.43 19.91
A:83 [PHE] 2:2754 [A] 3.64 6.57
A:83 [PHE] 2:2755 [C] 3.72 6.57
A:84 [THR] 2:2756 [U] 3.16 61.61
A:85 [GLY] 2:2755 [C] 3.2 91.92
A:85 [GLY] 2:2756 [U] 3.73 91.92
A:86 [GLN] 2:2754 [A] 2.27 sugar:BB 46.18
A:86 [GLN] 2:2755 [C] 3.79 46.18
A:87 [SER] 2:2754 [A] 2.5 8.63
A:87 [SER] 2:2755 [C] 2.83 8.63
A:89 [PHE] 2:2751 [U] 3.24 0.11
A:93 [LYS] 2:2748 [C] 4.5 27.47
A:93 [LYS] 2:2749 [U] 4.04 27.47
A:93 [LYS] 2:2750 [G] 3.82 base:SC 27.47
A:93 [LYS] 2:2751 [U] 3.02 base:BB 27.47
A:93 [LYS] 2:2752 [A] 3.11 27.47
A:94 [ALA] 2:2751 [U] 4.4 69.84
A:94 [ALA] 2:2752 [A] 4.04 69.84
A:95 [PRO] 2:2751 [U] 3.22 1.93
A:95 [PRO] 2:2752 [A] 3.45 1.93
A:96 [LEU] 2:2752 [A] 4.53 33.84
A:97 [ALA] 2:2753 [A] 3.7 25.81
A:119 [LYS] 2:2186 [A] 4.48 2:2204 [U] 13.45
A:119 [LYS] 2:2187 [U] 3.62 13.45
A:119 [LYS] 2:2546 [G] 4.72 2:2798 [C] 13.45
A:119 [LYS] 2:2547 [A] 3.46 2:2797 [U] 13.45
A:120 [PRO] 2:2798 [C] 4.15 2:2546 [G] 62.94
A:121 [GLY] 2:2547 [A] 4.91 2:2797 [U] 65.07
A:121 [GLY] 2:2548 [A] 3.27 2:2796 [U] 65.07
A:122 [ASP] 2:2547 [A] 3.55 2:2797 [U] 69.83
A:122 [ASP] 2:2548 [A] 3.74 2:2796 [U] 69.83
A:123 [ARG] 2:2548 [A] 3.76 2:2796 [U] 78.84
A:123 [ARG] 2:2549 [U] 2.44 2:2551 [A] 78.84
A:125 [THR] 2:2185 [G] 4.2 61.16
A:125 [THR] 2:2205 [A] 2.42 sugar:BB 61.16
A:126 [LEU] 2:2185 [G] 3.36 40.7
A:126 [LEU] 2:2205 [A] 3.3 40.7
A:126 [LEU] 2:2206 [U] 4.01 40.7
A:127 [ALA] 2:2185 [G] 3.94 67.71
A:127 [ALA] 2:2205 [A] 3.37 67.71
A:127 [ALA] 2:2206 [U] 2.88 67.71
A:128 [ARG] 2:2204 [U] 3.66 2:2186 [A] 95.09
A:128 [ARG] 2:2205 [A] 2.41 95.09
A:128 [ARG] 2:2206 [U] 2.96 95.09
A:129 [ALA] 2:2205 [A] 4.05 78.92
A:129 [ALA] 2:2206 [U] 2.86 78.92
A:129 [ALA] 2:2207 [C] 3.78 78.92
A:129 [ALA] 2:2208 [G] 3.9 2:2184 [U] 78.92
A:130 [SER] 2:2207 [C] 2.88 sugar:BB, sugar:SC 79.89
A:131 [GLY] 2:2207 [C] 3.77 98.81
A:132 [ASP] 2:2206 [U] 3.21 70.07
A:132 [ASP] 2:2207 [C] 2.85 70.07
A:150 [LEU] 2:2185 [G] 3.49 81.7
A:151 [PRO] 2:2185 [G] 3.35 82.25
A:151 [PRO] 2:2206 [U] 3.55 82.25
A:151 [PRO] 2:2207 [C] 4.22 82.25
A:152 [SER] 2:2185 [G] 2.77 base:SC, base:BB, base:SC 98.97
A:152 [SER] 2:2206 [U] 3.25 98.97
A:154 [GLN] 2:2185 [G] 3.14 63.27
A:155 [LYS] 2:2185 [G] 4.95 39.35
A:156 [LYS] 2:2185 [G] 3.48 74.69
A:156 [LYS] 2:2186 [A] 2.61 2:2204 [U] 74.69
A:172 [GLY] 2:2207 [C] 3.91 42.26
A:173 [GLY] 2:2207 [C] 3.12 62.96
A:174 [ARG] 2:2207 [C] 3.14 69.35
A:174 [ARG] 2:2208 [G] 2.62 2:2184 [U] 69.35
A:175 [ILE] 2:2207 [C] 3.57 41.84
A:175 [ILE] 2:2208 [G] 3.76 2:2184 [U] 41.84
A:177 [LYS] 2:2178 [G] 4.53 2:2214 [U] 66.44
A:178 [PRO] 2:2177 [A] 4.63 2:2215 [G] 73.86
A:178 [PRO] 2:2178 [G] 3.63 2:2214 [U] 73.86
A:179 [VAL] 2:2177 [A] 3.35 2:2215 [G] 47.25
A:179 [VAL] 2:2178 [G] 3.14 2:2214 [U] 47.25
A:180 [LEU] 1:911 [G] 4.33 2:2160 [C] 52.14
A:180 [LEU] 2:2177 [A] 3.25 2:2215 [G] sugar:BB 52.14
A:180 [LEU] 2:2178 [G] 4.95 2:2214 [U] 52.14
A:181 [LYS] 1:910 [G] 4.94 1:885 [U] 92.19
A:181 [LYS] 1:911 [G] 2.79 2:2160 [C] 92.19
A:181 [LYS] 1:947 [A] 4.4 2:2161 [U] 92.19
A:181 [LYS] 2:2176 [U] 4.17 92.19
A:181 [LYS] 2:2177 [A] 3.65 2:2215 [G] 92.19
A:182 [ALA] 1:911 [G] 3.07 2:2160 [C] base:BB 98.2
A:182 [ALA] 1:947 [A] 3.45 2:2161 [U] 98.2
A:182 [ALA] 2:2161 [U] 4.9 1:947 [A] 98.2
A:182 [ALA] 2:2176 [U] 3.24 98.2
A:182 [ALA] 2:2177 [A] 4.36 2:2215 [G] 98.2
A:183 [GLY] 1:911 [G] 2.88 2:2160 [C] base:BB 93.59
A:183 [GLY] 1:947 [A] 3.53 2:2161 [U] 93.59
A:184 [ASN] 1:947 [A] 4.94 2:2161 [U] 48.13
A:185 [SER] 2:2176 [U] 4.95 64.61
A:185 [SER] 2:2177 [A] 3.09 2:2215 [G] 64.61
A:186 [PHE] 1:947 [A] 3.61 2:2161 [U] 43.9
A:186 [PHE] 1:948 [U] 3.91 1:879 [A] 43.9
A:187 [TYR] 1:946 [G] 4.94 1:880 [C] 54.84
A:187 [TYR] 1:947 [A] 2.86 2:2161 [U] 54.84
A:187 [TYR] 1:948 [U] 4.41 1:879 [A] 54.84
A:188 [ARG] 2:2208 [G] 4.06 2:2184 [U] 20.64
A:190 [ARG] 1:874 [C] 4.37 1:953 [G] 58.45
A:192 [LYS] 2:2202 [U] 4.59 2:2188 [G] 67.57
A:192 [LYS] 2:2208 [G] 4.75 2:2184 [U] 67.57
A:192 [LYS] 2:2209 [C] 3.48 2:2183 [G] 67.57
A:193 [ARG] 2:2201 [G] 3.8 2:2189 [C] 71.6
A:193 [ARG] 2:2202 [U] 3.77 2:2188 [G] 71.6
A:193 [ARG] 2:2209 [C] 2.98 2:2183 [G] 71.6
A:193 [ARG] 2:2210 [A] 2.76 2:2182 [U] 71.6
A:194 [ASN] 1:872 [U] 3.33 1:955 [A2M] sugar:SC 58.99
A:194 [ASN] 1:873 [G] 3.68 1:954 [U] 58.99
A:194 [ASN] 1:963 [G] 3.47 1:966 [A] 58.99
A:195 [CYS] 2:2210 [A] 4.61 2:2182 [U] 2.04
A:196 [TRP] 1:947 [A] 3.53 2:2161 [U] 60.93
A:196 [TRP] 2:2176 [U] 3.51 60.93
A:196 [TRP] 2:2177 [A] 3.04 2:2215 [G] 60.93
A:197 [PRO] 1:947 [A] 3.86 2:2161 [U] 90.88
A:197 [PRO] 1:964 [A] 3.72 90.88
A:197 [PRO] 2:2175 [A] 3.2 90.88
A:197 [PRO] 2:2176 [U] 3.76 90.88
A:198 [LYS] 2:2175 [A] 3.62 48.21
A:198 [LYS] 2:2176 [U] 2.93 48.21
A:198 [LYS] 2:2211 [A] 4.17 2:2181 [U] 48.21
A:198 [LYS] 2:2215 [G] 4.54 2:2177 [A] 48.21
A:199 [VAL] 1:964 [A] 3.64 89.46
A:199 [VAL] 1:965 [A] 3.59 89.46
A:199 [VAL] 2:2174 [C] 4.17 2:2162 [G] 89.46
A:199 [VAL] 2:2175 [A] 3.41 89.46
A:199 [VAL] 2:2213 [C] 4.97 2:2179 [G] 89.46
A:200 [ARG] 2:2173 [A] 4.85 2:2163 [U] 87.21
A:200 [ARG] 2:2174 [C] 3.15 2:2162 [G] 87.21
A:200 [ARG] 2:2175 [A] 3.04 87.21
A:200 [ARG] 2:2213 [C] 3.47 2:2179 [G] 87.21
A:200 [ARG] 2:2214 [U] 3.65 2:2178 [G] 87.21
A:200 [ARG] 2:2215 [G] 3.52 2:2177 [A] base:SC 87.21
A:201 [GLY] 2:2212 [A] 4.64 2:2180 [U] 89.89
A:201 [GLY] 2:2213 [C] 2.67 2:2179 [G] 89.89
A:202 [VAL] 2:2213 [C] 3.01 2:2179 [G] 84.46
A:202 [VAL] 2:2214 [U] 3.33 2:2178 [G] 84.46
A:203 [ALA] 1:965 [A] 2.97 sugar:BB 92.76
A:203 [ALA] 1:966 [A] 4.15 1:963 [G] 92.76
A:203 [ALA] 2:2174 [C] 3.77 2:2162 [G] 92.76
A:203 [ALA] 2:2175 [A] 4.8 92.76
A:204 [ARG] 1:965 [A] 3.71 base/AA stacks 88.74
A:204 [ARG] 2:2212 [A] 4.34 2:2180 [U] 88.74
A:205 [ASN] 1:966 [A] 4.71 1:963 [G] 96.83
A:205 [ASN] 1:967 [G] 3.15 base/AA stacks 96.83
A:206 [PRO] 2:2443 [U] 3.58 2:3026 [A] 87.23
A:206 [PRO] 2:2444 [U] 3.24 2:3025 [A] 87.23
A:206 [PRO] 2:3188 [A] 3.67 2:3185 [G] 87.23
A:206 [PRO] 2:3189 [G] 4.3 2:3184 [C] 87.23
A:207 [VAL] 1:967 [G] 3.54 74.74
A:207 [VAL] 1:976 [A] 4.18 74.74
A:207 [VAL] 2:2442 [G] 4.88 2:3027 [U] 74.74
A:207 [VAL] 2:2443 [U] 3.38 2:3026 [A] 74.74
A:208 [GLU] 1:962 [C] 3.99 1:968 [A] base:SC 83.37
A:208 [GLU] 1:963 [G] 2.76 1:966 [A] 83.37
A:208 [GLU] 1:965 [A] 4.36 83.37
A:208 [GLU] 1:968 [A] 4.74 1:962 [C] 83.37
A:209 [HIS] 2:2211 [A] 4.88 2:2181 [U] 99.0
A:209 [HIS] 2:2212 [A] 3.08 2:2180 [U] 99.0
A:209 [HIS] 2:2213 [C] 4.82 2:2179 [G] 99.0
A:210 [PRO] 2:2817 [G] 4.5 2:2451 [C] 91.23
A:211 [HIS] 2:2212 [A] 3.09 2:2180 [U] 85.01
A:211 [HIS] 2:2213 [C] 2.94 2:2179 [G] 85.01
A:212 [GLY] 2:3188 [A] 4.13 2:3185 [G] 97.37
A:213 [GLY] 2:3188 [A] 3.29 2:3185 [G] 92.33
A:213 [GLY] 2:3189 [G] 3.98 2:3184 [C] 92.33
A:214 [GLY] 2:3188 [A] 3.41 2:3185 [G] 77.89
A:214 [GLY] 2:3189 [G] 2.77 2:3184 [C] 77.89
A:215 [ASN] 2:3180 [OMC] 4.19 2:3194 [G] 61.33
A:215 [ASN] 2:3181 [C] 4.7 2:3193 [G] 61.33
A:215 [ASN] 2:3189 [G] 3.19 2:3184 [C] base:BB base/AA stacks 61.33
A:215 [ASN] 2:3190 [A] 2.49 2:3183 [U] base:SC 61.33
A:215 [ASN] 2:3191 [C] 4.53 2:3182 [G] 61.33
A:216 [HIS] 2:3181 [C] 3.46 2:3193 [G] base/AA stacks 66.46
A:216 [HIS] 2:3182 [G] 3.32 2:3191 [C] base:SC 66.46
A:216 [HIS] 2:3183 [U] 3.47 2:3190 [A] 66.46
A:216 [HIS] 2:3184 [C] 4.46 2:3189 [G] 66.46
A:216 [HIS] 2:3189 [G] 4.45 2:3184 [C] 66.46
A:216 [HIS] 2:3190 [A] 4.05 2:3183 [U] 66.46
A:217 [GLN] 2:2173 [A] 4.02 2:2163 [U] 65.35
A:217 [GLN] 2:2174 [C] 3.65 2:2162 [G] 65.35
A:217 [GLN] 2:2214 [U] 3.81 2:2178 [G] 65.35
A:217 [GLN] 2:2342 [OMU] 3.57 65.35
A:217 [GLN] 2:3179 [A] 4.8 2:3195 [U] 65.35
A:217 [GLN] 2:3180 [OMC] 3.06 2:3194 [G] 65.35
A:217 [GLN] 2:3181 [C] 4.92 2:3193 [G] 65.35
A:218 [HIS] 2:2274 [G] 3.35 2:2224 [C] 67.8
A:218 [HIS] 2:2342 [OMU] 3.65 67.8
A:218 [HIS] 2:3185 [G] 3.36 2:3188 [A] 67.8
A:218 [HIS] 2:3187 [G] 3.58 67.8
A:218 [HIS] 2:3188 [A] 3.38 2:3185 [G] 67.8
A:219 [ILE] 2:2212 [A] 4.52 2:2180 [U] 27.12
A:219 [ILE] 2:2213 [C] 3.7 2:2179 [G] 27.12
A:219 [ILE] 2:2273 [C] 2.8 2:2227 [G] 27.12
A:219 [ILE] 2:2274 [G] 2.97 2:2224 [C] 27.12
A:220 [GLY] 2:2273 [C] 2.34 2:2227 [G] sugar:BB 79.23
A:220 [GLY] 2:2274 [G] 4.65 2:2224 [C] 79.23
A:220 [GLY] 2:3186 [U] 4.34 79.23
A:220 [GLY] 2:3187 [G] 3.55 79.23
A:221 [HIS] 2:2273 [C] 3.4 2:2227 [G] 58.54
A:221 [HIS] 2:2445 [U] 4.8 58.54
A:221 [HIS] 2:3186 [U] 4.44 58.54
A:221 [HIS] 2:3187 [G] 4.94 58.54
A:222 [PRO] 2:2228 [U] 4.01 2:2272 [A] 53.74
A:222 [PRO] 2:2229 [G] 3.3 2:2269 [U] 53.74
A:222 [PRO] 2:2272 [A] 3.7 2:2228 [U] 53.74
A:222 [PRO] 2:2273 [C] 3.26 2:2227 [G] 53.74
A:223 [SER] 2:2212 [A] 4.49 2:2180 [U] 78.02
A:223 [SER] 2:2272 [A] 2.73 2:2228 [U] sugar:BB, sugar:SC 78.02
A:223 [SER] 2:2273 [C] 4.25 2:2227 [G] 78.02
A:224 [THR] 2:2229 [G] 3.06 2:2269 [U] base:SC, base:SC, sugar:BB 74.16
A:224 [THR] 2:2230 [C] 3.52 2:2268 [G] 74.16
A:224 [THR] 2:2272 [A] 3.83 2:2228 [U] 74.16
A:225 [VAL] 2:2230 [C] 3.85 2:2268 [G] 63.34
A:225 [VAL] 2:2231 [U] 4.61 2:2267 [G] 63.34
A:226 [SER] 2:2230 [C] 3.57 2:2268 [G] 75.54
A:226 [SER] 2:2231 [U] 3.49 2:2267 [G] 75.54
A:227 [ARG] 2:2183 [G] 2.76 2:2209 [C] sugar:SC 85.36
A:227 [ARG] 2:2184 [U] 3.78 2:2208 [G] 85.36
A:227 [ARG] 2:2189 [C] 3.28 2:2201 [G] 85.36
A:227 [ARG] 2:2190 [A] 2.58 2:2200 [U] 85.36
A:227 [ARG] 2:2230 [C] 4.44 2:2268 [G] 85.36
A:227 [ARG] 2:2231 [U] 2.79 2:2267 [G] 85.36
A:227 [ARG] 2:2454 [U] 4.22 2:2813 [A] 85.36
A:228 [HIS] 2:2231 [U] 4.98 2:2267 [G] 49.58
A:228 [HIS] 2:2453 [G] 2.53 2:2814 [U] base:BB 49.58
A:228 [HIS] 2:2454 [U] 3.07 2:2813 [A] 49.58
A:228 [HIS] 2:2455 [C] 3.26 2:2812 [G] 49.58
A:229 [SER] 2:2453 [G] 4.42 2:2814 [U] 80.1
A:230 [PRO] 2:2191 [U] 4.15 2:2199 [G] 73.92
A:230 [PRO] 2:2452 [A] 3.31 2:2815 [G] 73.92
A:230 [PRO] 2:2453 [G] 3.8 2:2814 [U] 73.92
A:230 [PRO] 2:2815 [G] 3.65 2:2452 [A] 73.92
A:230 [PRO] 2:2817 [G] 4.1 2:2451 [C] 73.92
A:231 [PRO] 2:2191 [U] 3.37 2:2199 [G] 78.06
A:231 [PRO] 2:2192 [C] 3.39 2:2198 [G] 78.06
A:231 [PRO] 2:2453 [G] 3.69 2:2814 [U] 78.06
A:231 [PRO] 2:2817 [G] 3.85 2:2451 [C] sugar:BB 78.06
A:232 [GLY] 2:2191 [U] 4.22 2:2199 [G] 89.22
A:232 [GLY] 2:2817 [G] 3.77 2:2451 [C] 89.22
A:233 [GLN] 2:2815 [G] 3.71 2:2452 [A] 61.34
A:233 [GLN] 2:2816 [G] 3.2 61.34
A:233 [GLN] 2:2817 [G] 3.34 2:2451 [C] 61.34
A:234 [LYS] 2:2190 [A] 3.15 2:2200 [U] 91.44
A:234 [LYS] 2:2191 [U] 3.45 2:2199 [G] 91.44
A:234 [LYS] 2:2211 [A] 4.54 2:2181 [U] 91.44
A:235 [VAL] 2:2211 [A] 3.43 2:2181 [U] 93.18
A:235 [VAL] 2:2212 [A] 3.86 2:2180 [U] 93.18
A:236 [GLY] 2:2211 [A] 2.7 2:2181 [U] sugar:BB, sugar:BB 87.23
A:236 [GLY] 2:2212 [A] 3.47 2:2180 [U] 87.23
A:237 [LEU] 2:2181 [U] 3.27 2:2211 [A] 42.61
A:237 [LEU] 2:2182 [U] 3.67 2:2210 [A] 42.61
A:237 [LEU] 2:2211 [A] 4.04 2:2181 [U] 42.61
A:237 [LEU] 2:2212 [A] 4.37 2:2180 [U] 42.61
A:237 [LEU] 2:2230 [C] 4.92 2:2268 [G] 42.61
A:237 [LEU] 2:2272 [A] 3.62 2:2228 [U] 42.61
A:238 [ILE] 2:2182 [U] 2.99 2:2210 [A] 88.01
A:238 [ILE] 2:2183 [G] 3.23 2:2209 [C] sugar:BB 88.01
A:238 [ILE] 2:2190 [A] 3.91 2:2200 [U] 88.01
A:238 [ILE] 2:2211 [A] 3.84 2:2181 [U] 88.01
A:239 [ALA] 2:2182 [U] 4.21 2:2210 [A] 79.64
A:239 [ALA] 2:2183 [G] 3.33 2:2209 [C] 79.64
A:239 [ALA] 2:2230 [C] 3.78 2:2268 [G] 79.64
A:239 [ALA] 2:2231 [U] 3.63 2:2267 [G] 79.64
A:240 [ALA] 2:2182 [U] 3.48 2:2210 [A] 81.53
A:240 [ALA] 2:2183 [G] 4.4 2:2209 [C] 81.53
A:240 [ALA] 2:2230 [C] 2.96 2:2268 [G] sugar:BB 81.53
A:240 [ALA] 2:2231 [U] 3.43 2:2267 [G] 81.53
A:240 [ALA] 2:2268 [G] 4.63 2:2230 [C] 81.53
A:241 [ARG] 2:2182 [U] 3.92 2:2210 [A] 76.64
A:241 [ARG] 2:2183 [G] 3.14 2:2209 [C] 76.64
A:241 [ARG] 2:2184 [U] 2.85 2:2208 [G] 76.64
A:241 [ARG] 2:2230 [C] 4.56 2:2268 [G] 76.64
A:241 [ARG] 2:2231 [U] 3.36 2:2267 [G] 76.64
A:241 [ARG] 2:2232 [C] 4.35 2:2266 [G] 76.64
A:241 [ARG] 2:2268 [G] 2.8 2:2230 [C] base:BB 76.64
A:241 [ARG] 2:2269 [U] 4.8 2:2229 [G] 76.64
A:242 [ARG] 2:2181 [U] 3.73 2:2211 [A] 70.07
A:242 [ARG] 2:2182 [U] 2.78 2:2210 [A] 70.07
A:242 [ARG] 2:2183 [G] 4.79 2:2209 [C] 70.07
A:242 [ARG] 2:2268 [G] 4.76 2:2230 [C] 70.07
A:242 [ARG] 2:2269 [U] 3.5 2:2229 [G] 70.07
A:242 [ARG] 2:2270 [A] 4.11 70.07
A:243 [THR] 2:2181 [U] 4.2 2:2211 [A] 88.31
A:243 [THR] 2:2182 [U] 4.61 2:2210 [A] 88.31
A:243 [THR] 2:2229 [G] 4.76 2:2269 [U] 88.31
A:243 [THR] 2:2269 [U] 2.56 2:2229 [G] sugar:BB, sugar:SC 88.31
A:243 [THR] 2:2270 [A] 3.29 88.31
A:243 [THR] 2:2272 [A] 3.05 2:2228 [U] sugar:SC 88.31
A:244 [GLY] 2:2181 [U] 3.16 2:2211 [A] 87.23
A:244 [GLY] 2:2182 [U] 4.99 2:2210 [A] 87.23
A:244 [GLY] 2:2269 [U] 4.6 2:2229 [G] 87.23
A:244 [GLY] 2:2270 [A] 3.33 87.23
A:244 [GLY] 2:2271 [A] 3.38 87.23
A:244 [GLY] 2:2272 [A] 2.61 2:2228 [U] 87.23
A:245 [ARG] 2:2180 [U] 3.35 2:2212 [A] 78.61
A:245 [ARG] 2:2181 [U] 3.14 2:2211 [A] 78.61
A:245 [ARG] 2:2270 [A] 4.39 78.61
A:245 [ARG] 2:2271 [A] 2.9 78.61
A:245 [ARG] 2:2272 [A] 4.89 2:2228 [U] 78.61
A:246 [ILE] 2:2180 [U] 4.68 2:2212 [A] 39.16
A:246 [ILE] 2:2181 [U] 3.37 2:2211 [A] 39.16
A:246 [ILE] 2:2182 [U] 3.45 2:2210 [A] 39.16
A:253 [LYS] 2:2182 [U] 3.65 2:2210 [A] 30.28
A:253 [LYS] 2:2183 [G] 2.99 2:2209 [C] base:SC 30.28
A:253 [LYS] 2:2184 [U] 3.66 2:2208 [G] 30.28
A:253 [LYS] 2:2185 [G] 4.7 30.28
A:253 [LYS] 2:2206 [U] 4.94 30.28
A:254 [GLY] 2:2184 [U] 3.72 2:2208 [G] 40.38
A:254 [GLY] 2:2185 [G] 3.5 40.38
A:255 [ALA] 2:2184 [U] 3.75 2:2208 [G] 66.38
A:255 [ALA] 2:2185 [G] 3.32 66.38

logo_download Export the table of contacts

*Conservation was calculated using Rate4Site
NB: conservation is missing (completly white) for a very small minority of cases in which no homologous sequences were found (e.g. synthetic proteins 7D3J_A & 7EU9_A)

Properties of this interface

Interolog group ID Structure ID Structure description
 UniProt ID
 		ECOD label(s)
 		RFAM label(s)
 		Is ribosome? RCSB PDB link
group131 6AZ3_A_1,2 A: Ribosomal protein ul2, Leishmania donovani (natural) 1: rRNA alpha, Leishmania donovani (natural) 2: rRNA beta, Leishmania donovani (natural) Nucleic acid-binding proteins & SH3 Eukaryotic large subunit ribosomal RNA ✔

Interologs

Total number of interologs for this interface: 10

Interface 1 Interface 2 Percentage conservation
 		Interface TM-score
 		Interface RMSD
 		Percentage identity
 		Common ECOD label(s)
 		Common RFAM label(s)
 		Explore both interfaces
1VQ8_A_0 6AZ3_A_1,2 0.85 0.8 1.09 0.46 Nucleic acid-binding proteins & SH3 compare
1JJ2_A_0 6AZ3_A_1,2 0.85 0.8 1.08 0.45 Nucleic acid-binding proteins & SH3 compare
6AZ3_A_1,2 6YSI_A_1 0.62 0.76 3.84 0.22 Nucleic acid-binding proteins & SH3 compare
6AZ3_A_1,2 7K00_c_a 0.62 0.77 3.84 0.22 Nucleic acid-binding proteins & SH3 compare
6AZ3_A_1,2 7RYG_C_A 0.56 0.75 3.8 0.23 Nucleic acid-binding proteins & SH3 compare
6AZ3_A_1,2 7OF0_D_A 0.48 0.8 4.46 0.12 Nucleic acid-binding proteins & SH3 compare
6AZ3_A_1,2 6S0Z_C_A 0.60 0.77 3.89 0.24 Nucleic acid-binding proteins & SH3 compare
6AZ3_A_1,2 7O7Y_BA_B5 0.89 0.93 0.81 0.58 Nucleic acid-binding proteins & SH3 Eukaryotic large subunit ribosomal RNA compare
4Y4O_1D_1A 6AZ3_A_1,2 0.59 0.77 3.76 0.22 Nucleic acid-binding proteins & SH3 compare
1YHQ_A_0 6AZ3_A_1,2 0.86 0.8 1.08 0.46 Nucleic acid-binding proteins & SH3 compare