Interface analysis
Style
Protein
CartoonLicorice
Surface
RNA
CartoonLicorice
Surface
Color
StructureStructure (with hetatm)
Chain
Chainbow
View
Focus on
InterfaceRNA
Protein
All
Show chains
Interface
show interface as licoriceCommon contacts -
6AZ3_A
|
6AZ3_1,2
|
6S0Z_C
|
6S0Z_A
|
Conserved?
|
---|---|---|---|---|
A:204 [ARG] | 1:965 [A] | C:225 [MET] | A:827 [A] | ✔ |
A:10 [LYS] | 2:2200 [U] | C:43 [ARG] | A:1840 [U] | ✔ |
A:174 [ARG] | 2:2207 [C] | C:200 [HIS] | A:1847 [U] | ✔ |
A:174 [ARG] | 2:2208 [G] | C:200 [HIS] | A:1848 [A] | ✔ |
A:175 [ILE] | 2:2207 [C] | C:201 [GLU] | A:1847 [U] | ✔ |
A:223 [SER] | 2:2273 [C] | C:245 [SER] | A:1929 [C] | ✔ |
A:214 [GLY] | 2:3188 [A] | C:235 [GLY] | A:2625 [A] | ✔ |
A:214 [GLY] | 2:3189 [G] | C:235 [GLY] | A:2626 [G] | ✔ |
A:186 [PHE] | 1:947 [A] | C:212 [ARG] | A:809 [A] | ✔ |
A:183 [GLY] | 1:911 [G] | C:209 [GLY] | A:774 [G] | ✔ |
A:183 [GLY] | 1:947 [A] | C:209 [GLY] | A:809 [A] | ✔ |
A:187 [TYR] | 1:947 [A] | C:213 [TRP] | A:809 [A] | ✔ |
A:17 [GLN] | 2:2200 [U] | C:51 [VAL] | A:1840 [U] | ✔ |
A:17 [GLN] | 2:2201 [G] | C:51 [VAL] | A:1841 [G] | ✔ |
A:173 [GLY] | 2:2207 [C] | C:199 [GLN] | A:1847 [U] | ✔ |
A:182 [ALA] | 1:911 [G] | C:208 [ALA] | A:774 [G] | ✔ |
A:182 [ALA] | 1:947 [A] | C:208 [ALA] | A:809 [A] | ✔ |
A:182 [ALA] | 2:2176 [U] | C:208 [ALA] | A:1817 [C] | ✔ |
A:182 [ALA] | 2:2177 [A] | C:208 [ALA] | A:1818 [A] | ✔ |
A:207 [VAL] | 1:967 [G] | C:228 [ASN] | A:829 [U] | ✔ |
A:207 [VAL] | 1:976 [A] | C:228 [ASN] | A:838 [A] | ✔ |
A:207 [VAL] | 2:2443 [U] | C:228 [ASN] | A:2100 [C] | ✔ |
A:16 [TYR] | 2:2200 [U] | C:50 [THR] | A:1840 [U] | ✔ |
A:152 [SER] | 2:2185 [G] | C:178 [SER] | A:1826 [G] | ✔ |
A:152 [SER] | 2:2206 [U] | C:178 [SER] | A:1846 [A] | ✔ |
A:150 [LEU] | 2:2185 [G] | C:176 [LEU] | A:1826 [G] | ✔ |
A:253 [LYS] | 2:2206 [U] | C:274 [ARG] | A:1846 [A] | ✔ |
A:125 [THR] | 2:2185 [G] | C:153 [GLN] | A:1826 [G] | ✔ |
A:125 [THR] | 2:2205 [A] | C:153 [GLN] | A:1845 [U] | ✔ |
A:212 [GLY] | 2:3188 [A] | C:233 [GLY] | A:2625 [A] | ✔ |
A:154 [GLN] | 2:2185 [G] | C:180 [GLU] | A:1826 [G] | ✔ |
A:221 [HIS] | 2:2273 [C] | C:243 [ARG] | A:1929 [C] | ✔ |
A:221 [HIS] | 2:2445 [U] | C:243 [ARG] | A:2102 [U] | ✔ |
A:131 [GLY] | 2:2207 [C] | C:159 [GLY] | A:1847 [U] | ✔ |
A:206 [PRO] | 2:2443 [U] | C:227 [PRO] | A:2100 [C] | ✔ |
A:206 [PRO] | 2:2444 [U] | C:227 [PRO] | A:2101 [U] | ✔ |
A:206 [PRO] | 2:3188 [A] | C:227 [PRO] | A:2625 [A] | ✔ |
A:206 [PRO] | 2:3189 [G] | C:227 [PRO] | A:2626 [G] | ✔ |
A:132 [ASP] | 2:2206 [U] | C:160 [ALA] | A:1846 [A] | ✔ |
A:180 [LEU] | 2:2177 [A] | C:206 [GLY] | A:1818 [A] | ✔ |
A:180 [LEU] | 2:2178 [G] | C:206 [GLY] | A:1819 [G] | ✔ |
A:129 [ALA] | 2:2205 [A] | C:157 [SER] | A:1845 [U] | ✔ |
A:129 [ALA] | 2:2206 [U] | C:157 [SER] | A:1846 [A] | ✔ |
A:129 [ALA] | 2:2207 [C] | C:157 [SER] | A:1847 [U] | ✔ |
A:129 [ALA] | 2:2208 [G] | C:157 [SER] | A:1848 [A] | ✔ |
A:236 [GLY] | 2:2211 [A] | C:254 [THR] | A:1851 [G] | ✔ |
A:236 [GLY] | 2:2212 [A] | C:254 [THR] | A:1852 [G] | ✔ |
A:216 [HIS] | 2:3181 [C] | C:237 [GLY] | A:2618 [C] | ✔ |
A:213 [GLY] | 2:3188 [A] | C:234 [GLY] | A:2625 [A] | ✔ |
A:213 [GLY] | 2:3189 [G] | C:234 [GLY] | A:2626 [G] | ✔ |
A:210 [PRO] | 2:2817 [G] | C:231 [PRO] | A:2266 [G] | ✔ |
A:237 [LEU] | 2:2181 [U] | C:255 [LEU] | A:1822 [C] | ✔ |
A:237 [LEU] | 2:2182 [U] | C:255 [LEU] | A:1823 [U] | ✔ |
A:237 [LEU] | 2:2211 [A] | C:255 [LEU] | A:1851 [G] | ✔ |
A:237 [LEU] | 2:2212 [A] | C:255 [LEU] | A:1852 [G] | ✔ |
A:237 [LEU] | 2:2230 [C] | C:255 [LEU] | A:1870 [C] | ✔ |
A:237 [LEU] | 2:2272 [A] | C:255 [LEU] | A:1928 [A] | ✔ |
A:224 [THR] | 2:2272 [A] | C:246 [PRO] | A:1928 [A] | ✔ |
A:21 [HIS] | 1:876 [U] | C:59 [LYS] | A:739 [U] | ✔ |
A:201 [GLY] | 2:2212 [A] | C:222 [GLY] | A:1852 [G] | ✔ |
A:201 [GLY] | 2:2213 [C] | C:222 [GLY] | A:1853 [C] | ✔ |
A:119 [LYS] | 2:2187 [U] | C:147 [LYS] | A:1828 [U] | ✔ |
A:119 [LYS] | 2:2546 [G] | C:147 [LYS] | A:2229 [C] | ✔ |
A:119 [LYS] | 2:2547 [A] | C:147 [LYS] | A:2230 [G] | ✔ |
A:222 [PRO] | 2:2228 [U] | C:244 [PRO] | A:1868 [U] | ✔ |
A:222 [PRO] | 2:2229 [G] | C:244 [PRO] | A:1869 [G] | ✔ |
A:222 [PRO] | 2:2272 [A] | C:244 [PRO] | A:1928 [A] | ✔ |
A:222 [PRO] | 2:2273 [C] | C:244 [PRO] | A:1929 [C] | ✔ |
A:130 [SER] | 2:2207 [C] | C:158 [ALA] | A:1847 [U] | ✔ |
A:209 [HIS] | 2:2212 [A] | C:230 [HIS] | A:1852 [G] | ✔ |
A:199 [VAL] | 1:964 [A] | C:220 [VAL] | A:826 [A] | ✔ |
A:199 [VAL] | 1:965 [A] | C:220 [VAL] | A:827 [A] | ✔ |
A:199 [VAL] | 2:2174 [C] | C:220 [VAL] | A:1815 [C] | ✔ |
A:199 [VAL] | 2:2175 [A] | C:220 [VAL] | A:1816 [A] | ✔ |
A:219 [ILE] | 2:2212 [A] | C:241 [ILE] | A:1852 [G] | ✔ |
A:219 [ILE] | 2:2213 [C] | C:241 [ILE] | A:1853 [C] | ✔ |
A:219 [ILE] | 2:2273 [C] | C:241 [ILE] | A:1929 [C] | ✔ |
A:219 [ILE] | 2:2274 [G] | C:241 [ILE] | A:1930 [G] | ✔ |
A:18 [VAL] | 2:2201 [G] | C:54 [HIS] | A:1841 [G] | ✔ |
A:18 [VAL] | 2:2202 [U] | C:54 [HIS] | A:1842 [A] | ✔ |
A:179 [VAL] | 2:2177 [A] | C:205 [VAL] | A:1818 [A] | ✔ |
A:179 [VAL] | 2:2178 [G] | C:205 [VAL] | A:1819 [G] | ✔ |
A:211 [HIS] | 2:2212 [A] | C:232 [HIS] | A:1852 [G] | ✔ |
A:211 [HIS] | 2:2213 [C] | C:232 [HIS] | A:1853 [C] | ✔ |
A:185 [SER] | 2:2177 [A] | C:211 [SER] | A:1818 [A] | ✔ |
A:128 [ARG] | 2:2204 [U] | C:156 [ARG] | A:1844 [G] | ✔ |
A:128 [ARG] | 2:2205 [A] | C:156 [ARG] | A:1845 [U] | ✔ |
A:128 [ARG] | 2:2206 [U] | C:156 [ARG] | A:1846 [A] | ✔ |
A:198 [LYS] | 2:2175 [A] | C:219 [THR] | A:1816 [A] | ✔ |
A:198 [LYS] | 2:2176 [U] | C:219 [THR] | A:1817 [C] | ✔ |
A:54 [ARG] | 2:2204 [U] | C:87 [ARG] | A:1844 [G] | ✔ |
A:54 [ARG] | 2:2205 [A] | C:87 [ARG] | A:1845 [U] | ✔ |
A:197 [PRO] | 1:947 [A] | C:218 [PRO] | A:809 [A] | ✔ |
A:197 [PRO] | 1:964 [A] | C:218 [PRO] | A:826 [A] | ✔ |
A:197 [PRO] | 2:2175 [A] | C:218 [PRO] | A:1816 [A] | ✔ |
A:197 [PRO] | 2:2176 [U] | C:218 [PRO] | A:1817 [C] | ✔ |
A:14 [SER] | 1:956 [U] | C:48 [LYS] | A:818 [U] | ✔ |
A:14 [SER] | 1:961 [G] | C:48 [LYS] | A:823 [G] | ✔ |
A:14 [SER] | 1:962 [C] | C:48 [LYS] | A:824 [A] | ✔ |
A:126 [LEU] | 2:2185 [G] | C:154 [ILE] | A:1826 [G] | ✔ |
A:126 [LEU] | 2:2205 [A] | C:154 [ILE] | A:1845 [U] | ✔ |
A:126 [LEU] | 2:2206 [U] | C:154 [ILE] | A:1846 [A] | ✔ |
A:232 [GLY] | 2:2191 [U] | C:250 [TRP] | A:1832 [C] | ✔ |
A:232 [GLY] | 2:2817 [G] | C:250 [TRP] | A:2266 [G] | ✔ |
A:217 [GLN] | 2:2173 [A] | C:238 [ARG] | A:1814 [A] | ✔ |
A:217 [GLN] | 2:2174 [C] | C:238 [ARG] | A:1815 [C] | ✔ |
A:217 [GLN] | 2:2342 [OMU] | C:238 [ARG] | A:1998 [A] | ✔ |
A:217 [GLN] | 2:3180 [OMC] | C:238 [ARG] | A:2617 [A] | ✔ |
A:217 [GLN] | 2:3181 [C] | C:238 [ARG] | A:2618 [C] | ✔ |
A:233 [GLN] | 2:2817 [G] | C:251 [GLY] | A:2266 [G] | ✔ |
A:172 [GLY] | 2:2207 [C] | C:198 [LEU] | A:1847 [U] | ✔ |
A:19 [HIS] | 1:873 [G] | C:55 [GLY] | A:736 [C] | ✔ |
A:19 [HIS] | 1:874 [C] | C:55 [GLY] | A:737 [C] | ✔ |
A:181 [LYS] | 1:911 [G] | C:207 [LYS] | A:774 [G] | ✔ |
A:181 [LYS] | 1:947 [A] | C:207 [LYS] | A:809 [A] | ✔ |
A:181 [LYS] | 2:2176 [U] | C:207 [LYS] | A:1817 [C] | ✔ |
A:181 [LYS] | 2:2177 [A] | C:207 [LYS] | A:1818 [A] | ✔ |
A:218 [HIS] | 2:2342 [OMU] | C:239 [ALA] | A:1998 [A] | ✔ |
A:218 [HIS] | 2:3188 [A] | C:239 [ALA] | A:2625 [A] | ✔ |
A:203 [ALA] | 1:965 [A] | C:224 [VAL] | A:827 [A] | ✔ |
A:203 [ALA] | 1:966 [A] | C:224 [VAL] | A:828 [A] | ✔ |
A:203 [ALA] | 2:2174 [C] | C:224 [VAL] | A:1815 [C] | ✔ |
A:203 [ALA] | 2:2175 [A] | C:224 [VAL] | A:1816 [A] | ✔ |
A:234 [LYS] | 2:2190 [A] | C:252 [LYS] | A:1831 [A] | ✔ |
A:234 [LYS] | 2:2191 [U] | C:252 [LYS] | A:1832 [C] | ✔ |
A:208 [GLU] | 1:962 [C] | C:229 [ASP] | A:824 [A] | ✔ |
A:208 [GLU] | 1:963 [G] | C:229 [ASP] | A:825 [G] | ✔ |
A:208 [GLU] | 1:965 [A] | C:229 [ASP] | A:827 [A] | ✔ |
A:208 [GLU] | 1:968 [A] | C:229 [ASP] | A:830 [U] | ✔ |
A:24 [LEU] | 2:2203 [A] | C:62 [TYR] | A:1843 [U] | ✔ |
A:254 [GLY] | 2:2184 [U] | C:275 [LYS] | A:1825 [U] | ✔ |
A:254 [GLY] | 2:2185 [G] | C:275 [LYS] | A:1826 [G] | ✔ |
A:215 [ASN] | 2:3180 [OMC] | C:236 [GLU] | A:2617 [A] | ✔ |
A:215 [ASN] | 2:3189 [G] | C:236 [GLU] | A:2626 [G] | ✔ |
A:215 [ASN] | 2:3190 [A] | C:236 [GLU] | A:2627 [A] | ✔ |
A:215 [ASN] | 2:3191 [C] | C:236 [GLU] | A:2628 [C] | ✔ |
A:240 [ALA] | 2:2183 [G] | C:258 [LYS] | A:1824 [C] | ✔ |
A:240 [ALA] | 2:2230 [C] | C:258 [LYS] | A:1870 [C] | ✔ |
A:240 [ALA] | 2:2231 [U] | C:258 [LYS] | A:1871 [U] | ✔ |
A:238 [ILE] | 2:2182 [U] | C:256 [GLY] | A:1823 [U] | ✔ |
A:238 [ILE] | 2:2183 [G] | C:256 [GLY] | A:1824 [C] | ✔ |
A:205 [ASN] | 1:966 [A] | C:226 [ASN] | A:828 [A] | ✔ |
A:205 [ASN] | 1:967 [G] | C:226 [ASN] | A:829 [U] | ✔ |
A:120 [PRO] | 2:2798 [C] | C:148 [PRO] | A:2248 [G] | ✔ |
A:127 [ALA] | 2:2185 [G] | C:155 [ALA] | A:1826 [G] | ✔ |
A:127 [ALA] | 2:2205 [A] | C:155 [ALA] | A:1845 [U] | ✔ |
A:127 [ALA] | 2:2206 [U] | C:155 [ALA] | A:1846 [A] | ✔ |
A:200 [ARG] | 2:2174 [C] | C:221 [ARG] | A:1815 [C] | ✔ |
A:200 [ARG] | 2:2175 [A] | C:221 [ARG] | A:1816 [A] | ✔ |
A:200 [ARG] | 2:2213 [C] | C:221 [ARG] | A:1853 [C] | ✔ |
A:200 [ARG] | 2:2214 [U] | C:221 [ARG] | A:1854 [U] | ✔ |
A:200 [ARG] | 2:2215 [G] | C:221 [ARG] | A:1855 [G] | ✔ |
A:156 [LYS] | 2:2185 [G] | C:182 [ARG] | A:1826 [G] | ✔ |
A:156 [LYS] | 2:2186 [A] | C:182 [ARG] | A:1827 [C] | ✔ |
A:11 [GLY] | 2:2192 [C] | C:44 [ASN] | A:1833 [C] | ✔ |
A:11 [GLY] | 2:2199 [G] | C:44 [ASN] | A:1839 [G] | ✔ |
A:11 [GLY] | 2:2200 [U] | C:44 [ASN] | A:1840 [U] | ✔ |
A:220 [GLY] | 2:2273 [C] | C:242 [GLY] | A:1929 [C] | ✔ |
A:220 [GLY] | 2:2274 [G] | C:242 [GLY] | A:1930 [G] | ✔ |
A:220 [GLY] | 2:3186 [U] | C:242 [GLY] | A:2623 [U] | ✔ |
A:220 [GLY] | 2:3187 [G] | C:242 [GLY] | A:2624 [G] | ✔ |
A:239 [ALA] | 2:2182 [U] | C:257 [LYS] | A:1823 [U] | ✔ |
A:239 [ALA] | 2:2183 [G] | C:257 [LYS] | A:1824 [C] | ✔ |
A:239 [ALA] | 2:2230 [C] | C:257 [LYS] | A:1870 [C] | ✔ |
A:239 [ALA] | 2:2231 [U] | C:257 [LYS] | A:1871 [U] | ✔ |
A:122 [ASP] | 2:2547 [A] | C:150 [LYS] | A:2230 [G] | ✔ |
A:122 [ASP] | 2:2548 [A] | C:150 [LYS] | A:2231 [C] | ✔ |
A:12 [ASN] | 2:2192 [C] | C:46 [GLN] | A:1833 [C] | ✔ |
A:12 [ASN] | 2:2193 [C] | C:46 [GLN] | A:1834 [G] | ✔ |
A:202 [VAL] | 2:2213 [C] | C:223 [SER] | A:1853 [C] | ✔ |
A:202 [VAL] | 2:2214 [U] | C:223 [SER] | A:1854 [U] | ✔ |
A:178 [PRO] | 2:2177 [A] | C:204 [ASN] | A:1818 [A] | ✔ |
A:178 [PRO] | 2:2178 [G] | C:204 [ASN] | A:1819 [G] | ✔ |
A:151 [PRO] | 2:2185 [G] | C:177 [ARG] | A:1826 [G] | ✔ |
A:151 [PRO] | 2:2206 [U] | C:177 [ARG] | A:1846 [A] | ✔ |
A:151 [PRO] | 2:2207 [C] | C:177 [ARG] | A:1847 [U] | ✔ |
A:177 [LYS] | 2:2178 [G] | C:203 [VAL] | A:1819 [G] | ✔ |
A:15 [VAL] | 1:962 [C] | C:49 [LEU] | A:824 [A] | ✔ |
A:15 [VAL] | 1:963 [G] | C:49 [LEU] | A:825 [G] | ✔ |
A:204 [ARG] | 2:2212 [A] | C:225 [MET] | A:1852 [G] | ❌ 6S0Z_C_A |
A:10 [LYS] | 2:2191 [U] | C:43 [ARG] | A:1832 [C] | ❌ 6S0Z_C_A |
A:10 [LYS] | 2:2201 [G] | C:43 [ARG] | A:1841 [G] | ❌ 6S0Z_C_A |
A:10 [LYS] | 2:2211 [A] | C:43 [ARG] | A:1851 [G] | ❌ 6S0Z_C_A |
A:175 [ILE] | 2:2208 [G] | C:201 [GLU] | A:1848 [A] | ❌ 6S0Z_C_A |
A:223 [SER] | 2:2212 [A] | C:245 [SER] | A:1852 [G] | ❌ 6S0Z_C_A |
A:223 [SER] | 2:2272 [A] | C:245 [SER] | A:1928 [A] | ❌ 6S0Z_C_A |
A:225 [VAL] | 2:2230 [C] | C:247 [MET] | A:1870 [C] | ❌ 6S0Z_C_A |
A:225 [VAL] | 2:2231 [U] | C:247 [MET] | A:1871 [U] | ❌ 6S0Z_C_A |
A:23 [ARG] | 2:2202 [U] | C:61 [GLN] | A:1842 [A] | ❌ 6S0Z_C_A |
A:23 [ARG] | 2:2203 [A] | C:61 [GLN] | A:1843 [U] | ❌ 6S0Z_C_A |
A:23 [ARG] | 2:2204 [U] | C:61 [GLN] | A:1844 [G] | ❌ 6S0Z_C_A |
A:22 [LYS] | 1:875 [C] | C:60 [ARG] | A:738 [U] | ❌ 6S0Z_C_A |
A:22 [LYS] | 1:876 [U] | C:60 [ARG] | A:739 [U] | ❌ 6S0Z_C_A |
A:17 [GLN] | 1:1644 [G] | C:51 [VAL] | A:1392 [G] | ❌ 6S0Z_C_A |
A:184 [ASN] | 1:947 [A] | C:210 [ARG] | A:809 [A] | ❌ 6S0Z_C_A |
A:196 [TRP] | 1:947 [A] | C:217 [ARG] | A:809 [A] | ❌ 6S0Z_C_A |
A:196 [TRP] | 2:2176 [U] | C:217 [ARG] | A:1817 [C] | ❌ 6S0Z_C_A |
A:196 [TRP] | 2:2177 [A] | C:217 [ARG] | A:1818 [A] | ❌ 6S0Z_C_A |
A:13 [GLY] | 2:2200 [U] | C:47 [GLY] | A:1840 [U] | ❌ 6S0Z_C_A |
A:16 [TYR] | 1:962 [C] | C:50 [THR] | A:824 [A] | ❌ 6S0Z_C_A |
A:16 [TYR] | 1:963 [G] | C:50 [THR] | A:825 [G] | ❌ 6S0Z_C_A |
A:16 [TYR] | 2:2201 [G] | C:50 [THR] | A:1841 [G] | ❌ 6S0Z_C_A |
A:253 [LYS] | 2:2182 [U] | C:274 [ARG] | A:1823 [U] | ❌ 6S0Z_C_A |
A:253 [LYS] | 2:2183 [G] | C:274 [ARG] | A:1824 [C] | ❌ 6S0Z_C_A |
A:253 [LYS] | 2:2184 [U] | C:274 [ARG] | A:1825 [U] | ❌ 6S0Z_C_A |
A:253 [LYS] | 2:2185 [G] | C:274 [ARG] | A:1826 [G] | ❌ 6S0Z_C_A |
A:221 [HIS] | 2:3186 [U] | C:243 [ARG] | A:2623 [U] | ❌ 6S0Z_C_A |
A:221 [HIS] | 2:3187 [G] | C:243 [ARG] | A:2624 [G] | ❌ 6S0Z_C_A |
A:20 [GLY] | 2:2203 [A] | C:56 [GLY] | A:1843 [U] | ❌ 6S0Z_C_A |
A:132 [ASP] | 2:2207 [C] | C:160 [ALA] | A:1847 [U] | ❌ 6S0Z_C_A |
A:180 [LEU] | 1:911 [G] | C:206 [GLY] | A:774 [G] | ❌ 6S0Z_C_A |
A:216 [HIS] | 2:3182 [G] | C:237 [GLY] | A:2619 [G] | ❌ 6S0Z_C_A |
A:216 [HIS] | 2:3183 [U] | C:237 [GLY] | A:2620 [U] | ❌ 6S0Z_C_A |
A:216 [HIS] | 2:3184 [C] | C:237 [GLY] | A:2621 [C] | ❌ 6S0Z_C_A |
A:216 [HIS] | 2:3189 [G] | C:237 [GLY] | A:2626 [G] | ❌ 6S0Z_C_A |
A:216 [HIS] | 2:3190 [A] | C:237 [GLY] | A:2627 [A] | ❌ 6S0Z_C_A |
A:231 [PRO] | 2:2191 [U] | C:249 [PRO] | A:1832 [C] | ❌ 6S0Z_C_A |
A:231 [PRO] | 2:2192 [C] | C:249 [PRO] | A:1833 [C] | ❌ 6S0Z_C_A |
A:231 [PRO] | 2:2817 [G] | C:249 [PRO] | A:2266 [G] | ❌ 6S0Z_C_A |
A:224 [THR] | 2:2229 [G] | C:246 [PRO] | A:1869 [G] | ❌ 6S0Z_C_A |
A:224 [THR] | 2:2230 [C] | C:246 [PRO] | A:1870 [C] | ❌ 6S0Z_C_A |
A:188 [ARG] | 2:2208 [G] | C:214 [LYS] | A:1848 [A] | ❌ 6S0Z_C_A |
A:70 [ARG] | 2:2550 [G] | C:98 [ASP] | A:2233 [C] | ❌ 6S0Z_C_A |
A:21 [HIS] | 1:874 [C] | C:59 [LYS] | A:737 [C] | ❌ 6S0Z_C_A |
A:21 [HIS] | 1:875 [C] | C:59 [LYS] | A:738 [U] | ❌ 6S0Z_C_A |
A:21 [HIS] | 1:1643 [A] | C:59 [LYS] | A:1391 [A] | ❌ 6S0Z_C_A |
A:21 [HIS] | 2:2203 [A] | C:59 [LYS] | A:1843 [U] | ❌ 6S0Z_C_A |
A:121 [GLY] | 2:2547 [A] | C:149 [GLY] | A:2230 [G] | ❌ 6S0Z_C_A |
A:121 [GLY] | 2:2548 [A] | C:149 [GLY] | A:2231 [C] | ❌ 6S0Z_C_A |
A:119 [LYS] | 2:2186 [A] | C:147 [LYS] | A:1827 [C] | ❌ 6S0Z_C_A |
A:25 [GLY] | 2:2203 [A] | C:63 [ARG] | A:1843 [U] | ❌ 6S0Z_C_A |
A:25 [GLY] | 2:2204 [U] | C:63 [ARG] | A:1844 [G] | ❌ 6S0Z_C_A |
A:209 [HIS] | 2:2211 [A] | C:230 [HIS] | A:1851 [G] | ❌ 6S0Z_C_A |
A:209 [HIS] | 2:2213 [C] | C:230 [HIS] | A:1853 [C] | ❌ 6S0Z_C_A |
A:199 [VAL] | 2:2213 [C] | C:220 [VAL] | A:1853 [C] | ❌ 6S0Z_C_A |
A:18 [VAL] | 2:2200 [U] | C:54 [HIS] | A:1840 [U] | ❌ 6S0Z_C_A |
A:18 [VAL] | 2:2203 [A] | C:54 [HIS] | A:1843 [U] | ❌ 6S0Z_C_A |
A:185 [SER] | 2:2176 [U] | C:211 [SER] | A:1817 [C] | ❌ 6S0Z_C_A |
A:198 [LYS] | 2:2211 [A] | C:219 [THR] | A:1851 [G] | ❌ 6S0Z_C_A |
A:198 [LYS] | 2:2215 [G] | C:219 [THR] | A:1855 [G] | ❌ 6S0Z_C_A |
A:54 [ARG] | 2:2203 [A] | C:87 [ARG] | A:1843 [U] | ❌ 6S0Z_C_A |
A:14 [SER] | 1:955 [A2M] | C:48 [LYS] | A:817 [G] | ❌ 6S0Z_C_A |
A:217 [GLN] | 2:2214 [U] | C:238 [ARG] | A:1854 [U] | ❌ 6S0Z_C_A |
A:233 [GLN] | 2:2816 [G] | C:251 [GLY] | A:2265 [G] | ❌ 6S0Z_C_A |
A:9 [ARG] | 1:961 [G] | C:42 [GLY] | A:823 [G] | ❌ 6S0Z_C_A |
A:9 [ARG] | 1:962 [C] | C:42 [GLY] | A:824 [A] | ❌ 6S0Z_C_A |
A:9 [ARG] | 1:963 [G] | C:42 [GLY] | A:825 [G] | ❌ 6S0Z_C_A |
A:181 [LYS] | 1:910 [G] | C:207 [LYS] | A:773 [G] | ❌ 6S0Z_C_A |
A:218 [HIS] | 2:2274 [G] | C:239 [ALA] | A:1930 [G] | ❌ 6S0Z_C_A |
A:218 [HIS] | 2:3187 [G] | C:239 [ALA] | A:2624 [G] | ❌ 6S0Z_C_A |
A:234 [LYS] | 2:2211 [A] | C:252 [LYS] | A:1851 [G] | ❌ 6S0Z_C_A |
A:215 [ASN] | 2:3181 [C] | C:236 [GLU] | A:2618 [C] | ❌ 6S0Z_C_A |
A:240 [ALA] | 2:2182 [U] | C:258 [LYS] | A:1823 [U] | ❌ 6S0Z_C_A |
A:238 [ILE] | 2:2190 [A] | C:256 [GLY] | A:1831 [A] | ❌ 6S0Z_C_A |
A:238 [ILE] | 2:2211 [A] | C:256 [GLY] | A:1851 [G] | ❌ 6S0Z_C_A |
A:200 [ARG] | 2:2173 [A] | C:221 [ARG] | A:1814 [A] | ❌ 6S0Z_C_A |
A:11 [GLY] | 2:2191 [U] | C:44 [ASN] | A:1832 [C] | ❌ 6S0Z_C_A |
A:12 [ASN] | 1:961 [G] | C:46 [GLN] | A:823 [G] | ❌ 6S0Z_C_A |
A:12 [ASN] | 2:2191 [U] | C:46 [GLN] | A:1832 [C] | ❌ 6S0Z_C_A |
A:12 [ASN] | 2:2199 [G] | C:46 [GLN] | A:1839 [G] | ❌ 6S0Z_C_A |
A:12 [ASN] | 2:2200 [U] | C:46 [GLN] | A:1840 [U] | ❌ 6S0Z_C_A |
A:15 [VAL] | 1:872 [U] | C:49 [LEU] | A:735 [C] | ❌ 6S0Z_C_A |
A:15 [VAL] | 1:873 [G] | C:49 [LEU] | A:736 [C] | ❌ 6S0Z_C_A |
A:15 [VAL] | 1:955 [A2M] | C:49 [LEU] | A:817 [G] | ❌ 6S0Z_C_A |
A:15 [VAL] | 1:956 [U] | C:49 [LEU] | A:818 [U] | ❌ 6S0Z_C_A |
A:119 [LYS] | 2:2548 [A] | C:147 [LYS] | A:2231 [C] | ❌ 6AZ3_A_1,2 |
A:120 [PRO] | 2:2549 [U] | C:148 [PRO] | A:2232 [A] | ❌ 6AZ3_A_1,2 |
A:121 [GLY] | 2:2549 [U] | C:149 [GLY] | A:2232 [A] | ❌ 6AZ3_A_1,2 |
A:122 [ASP] | 2:2549 [U] | C:150 [LYS] | A:2232 [A] | ❌ 6AZ3_A_1,2 |
A:122 [ASP] | 2:2187 [U] | C:150 [LYS] | A:1828 [U] | ❌ 6AZ3_A_1,2 |
A:125 [THR] | 2:2186 [A] | C:153 [GLN] | A:1827 [C] | ❌ 6AZ3_A_1,2 |
A:125 [THR] | 2:2187 [U] | C:153 [GLN] | A:1828 [U] | ❌ 6AZ3_A_1,2 |
A:128 [ARG] | 2:2203 [A] | C:156 [ARG] | A:1843 [U] | ❌ 6AZ3_A_1,2 |
A:186 [PHE] | 1:964 [A] | C:212 [ARG] | A:826 [A] | ❌ 6AZ3_A_1,2 |
A:186 [PHE] | 1:873 [G] | C:212 [ARG] | A:736 [C] | ❌ 6AZ3_A_1,2 |
A:196 [TRP] | 1:963 [G] | C:217 [ARG] | A:825 [G] | ❌ 6AZ3_A_1,2 |
A:196 [TRP] | 1:964 [A] | C:217 [ARG] | A:826 [A] | ❌ 6AZ3_A_1,2 |
A:196 [TRP] | 1:872 [U] | C:217 [ARG] | A:735 [C] | ❌ 6AZ3_A_1,2 |
A:196 [TRP] | 1:873 [G] | C:217 [ARG] | A:736 [C] | ❌ 6AZ3_A_1,2 |
A:207 [VAL] | 1:968 [A] | C:228 [ASN] | A:830 [U] | ❌ 6AZ3_A_1,2 |
A:215 [ASN] | 2:3182 [G] | C:236 [GLU] | A:2619 [G] | ❌ 6AZ3_A_1,2 |
A:215 [ASN] | 2:3184 [C] | C:236 [GLU] | A:2621 [C] | ❌ 6AZ3_A_1,2 |
A:215 [ASN] | 2:3183 [U] | C:236 [GLU] | A:2620 [U] | ❌ 6AZ3_A_1,2 |
A:216 [HIS] | 2:3180 [OMC] | C:237 [GLY] | A:2617 [A] | ❌ 6AZ3_A_1,2 |
A:221 [HIS] | 2:2817 [G] | C:243 [ARG] | A:2266 [G] | ❌ 6AZ3_A_1,2 |
A:221 [HIS] | 2:2816 [G] | C:243 [ARG] | A:2265 [G] | ❌ 6AZ3_A_1,2 |
A:223 [SER] | 2:2229 [G] | C:245 [SER] | A:1869 [G] | ❌ 6AZ3_A_1,2 |
A:224 [THR] | 2:2273 [C] | C:246 [PRO] | A:1929 [C] | ❌ 6AZ3_A_1,2 |
A:224 [THR] | 2:2212 [A] | C:246 [PRO] | A:1852 [G] | ❌ 6AZ3_A_1,2 |
A:225 [VAL] | 2:2211 [A] | C:247 [MET] | A:1851 [G] | ❌ 6AZ3_A_1,2 |
A:225 [VAL] | 2:2817 [G] | C:247 [MET] | A:2266 [G] | ❌ 6AZ3_A_1,2 |
A:225 [VAL] | 2:2212 [A] | C:247 [MET] | A:1852 [G] | ❌ 6AZ3_A_1,2 |
A:229 [SER] | 2:2211 [A] | C:248 [SER] | A:1851 [G] | ❌ 6AZ3_A_1,2 |
A:229 [SER] | 2:2212 [A] | C:248 [SER] | A:1852 [G] | ❌ 6AZ3_A_1,2 |
A:231 [PRO] | 2:2211 [A] | C:249 [PRO] | A:1851 [G] | ❌ 6AZ3_A_1,2 |
A:231 [PRO] | 2:2212 [A] | C:249 [PRO] | A:1852 [G] | ❌ 6AZ3_A_1,2 |
A:232 [GLY] | 2:2190 [A] | C:250 [TRP] | A:1831 [A] | ❌ 6AZ3_A_1,2 |
A:232 [GLY] | 2:2211 [A] | C:250 [TRP] | A:1851 [G] | ❌ 6AZ3_A_1,2 |
A:232 [GLY] | 2:2192 [C] | C:250 [TRP] | A:1833 [C] | ❌ 6AZ3_A_1,2 |
A:236 [GLY] | 2:2210 [A] | C:254 [THR] | A:1850 [G] | ❌ 6AZ3_A_1,2 |
A:236 [GLY] | 2:2182 [U] | C:254 [THR] | A:1823 [U] | ❌ 6AZ3_A_1,2 |
A:238 [ILE] | 2:2231 [U] | C:256 [GLY] | A:1871 [U] | ❌ 6AZ3_A_1,2 |
A:238 [ILE] | 2:2230 [C] | C:256 [GLY] | A:1870 [C] | ❌ 6AZ3_A_1,2 |
A:240 [ALA] | 2:2232 [C] | C:258 [LYS] | A:1872 [G] | ❌ 6AZ3_A_1,2 |
A:240 [ALA] | 2:2184 [U] | C:258 [LYS] | A:1825 [U] | ❌ 6AZ3_A_1,2 |
A:254 [GLY] | 2:2183 [G] | C:275 [LYS] | A:1824 [C] | ❌ 6AZ3_A_1,2 |
A:254 [GLY] | 2:2206 [U] | C:275 [LYS] | A:1846 [A] | ❌ 6AZ3_A_1,2 |
A:9 [ARG] | 2:2201 [G] | C:42 [GLY] | A:1841 [G] | ❌ 6AZ3_A_1,2 |
A:9 [ARG] | 2:2200 [U] | C:42 [GLY] | A:1840 [U] | ❌ 6AZ3_A_1,2 |
A:10 [LYS] | 1:955 [A2M] | C:43 [ARG] | A:817 [G] | ❌ 6AZ3_A_1,2 |
A:10 [LYS] | 1:872 [U] | C:43 [ARG] | A:735 [C] | ❌ 6AZ3_A_1,2 |
A:10 [LYS] | 1:963 [G] | C:43 [ARG] | A:825 [G] | ❌ 6AZ3_A_1,2 |
A:10 [LYS] | 1:873 [G] | C:43 [ARG] | A:736 [C] | ❌ 6AZ3_A_1,2 |
A:10 [LYS] | 1:962 [C] | C:43 [ARG] | A:824 [A] | ❌ 6AZ3_A_1,2 |
A:12 [ASN] | 1:955 [A2M] | C:46 [GLN] | A:817 [G] | ❌ 6AZ3_A_1,2 |
A:12 [ASN] | 1:956 [U] | C:46 [GLN] | A:818 [U] | ❌ 6AZ3_A_1,2 |
A:13 [GLY] | 1:955 [A2M] | C:47 [GLY] | A:817 [G] | ❌ 6AZ3_A_1,2 |
A:13 [GLY] | 1:956 [U] | C:47 [GLY] | A:818 [U] | ❌ 6AZ3_A_1,2 |
A:13 [GLY] | 1:962 [C] | C:47 [GLY] | A:824 [A] | ❌ 6AZ3_A_1,2 |
A:14 [SER] | 1:960 [A] | C:48 [LYS] | A:822 [G] | ❌ 6AZ3_A_1,2 |
A:14 [SER] | 2:2192 [C] | C:48 [LYS] | A:1833 [C] | ❌ 6AZ3_A_1,2 |
A:14 [SER] | 2:2193 [C] | C:48 [LYS] | A:1834 [G] | ❌ 6AZ3_A_1,2 |
A:15 [VAL] | 2:2191 [U] | C:49 [LEU] | A:1832 [C] | ❌ 6AZ3_A_1,2 |
A:16 [TYR] | 2:2191 [U] | C:50 [THR] | A:1832 [C] | ❌ 6AZ3_A_1,2 |
A:16 [TYR] | 2:2192 [C] | C:50 [THR] | A:1833 [C] | ❌ 6AZ3_A_1,2 |
A:16 [TYR] | 2:2199 [G] | C:50 [THR] | A:1839 [G] | ❌ 6AZ3_A_1,2 |
A:17 [GLN] | 2:2190 [A] | C:51 [VAL] | A:1831 [A] | ❌ 6AZ3_A_1,2 |
A:17 [GLN] | 2:2191 [U] | C:51 [VAL] | A:1832 [C] | ❌ 6AZ3_A_1,2 |
A:18 [VAL] | 2:2209 [C] | C:54 [HIS] | A:1849 [G] | ❌ 6AZ3_A_1,2 |
A:18 [VAL] | 2:2210 [A] | C:54 [HIS] | A:1850 [G] | ❌ 6AZ3_A_1,2 |
A:20 [GLY] | 1:874 [C] | C:56 [GLY] | A:737 [C] | ❌ 6AZ3_A_1,2 |
A:20 [GLY] | 1:873 [G] | C:56 [GLY] | A:736 [C] | ❌ 6AZ3_A_1,2 |
A:24 [LEU] | 2:2204 [U] | C:62 [TYR] | A:1844 [G] | ❌ 6AZ3_A_1,2 |
A:186 [PHE] | 1:948 [U] | C:212 [ARG] | A:810 [A] | ❌ 6S0Z_A:810 no longer at interface |
A:187 [TYR] | 1:946 [G] | C:213 [TRP] | A:808 [G] | ❌ 6S0Z_A:808 no longer at interface |
A:187 [TYR] | 1:948 [U] | C:213 [TRP] | A:810 [A] | ❌ 6S0Z_A:810 no longer at interface |
A:229 [SER] | 2:2453 [G] | C:248 [SER] | A:2110 [G] | ❌ 6S0Z_A:2110 no longer at interface |
A:182 [ALA] | 2:2161 [U] | C:208 [ALA] | A:1802 [U] | ❌ 6S0Z_A:1802 no longer at interface |
A:207 [VAL] | 2:2442 [G] | C:228 [ASN] | A:2099 [G] | ❌ 6S0Z_A:2099 no longer at interface |
A:231 [PRO] | 2:2453 [G] | C:249 [PRO] | A:2110 [G] | ❌ 6S0Z_A:2110 no longer at interface |
A:21 [HIS] | 1:1642 [G] | C:59 [LYS] | A:1390 [A] | ❌ 6S0Z_A:1390 no longer at interface |
A:217 [GLN] | 2:3179 [A] | C:238 [ARG] | A:2616 [A] | ❌ 6S0Z_A:2616 no longer at interface |
A:233 [GLN] | 2:2815 [G] | C:251 [GLY] | A:2264 [G] | ❌ 6S0Z_A:2264 no longer at interface |
A:218 [HIS] | 2:3185 [G] | C:239 [ALA] | A:2622 [G] | ❌ 6S0Z_A:2622 no longer at interface |
A:240 [ALA] | 2:2268 [G] | C:258 [LYS] | A:1924 [G] | ❌ 6S0Z_A:1924 no longer at interface |
A:144 [GLY] | 2:2800 [A] | C:170 [LYS] | A:2250 [A] | ❌ 6AZ3_A:144, 6AZ3_2:2800 no longer at interface |
A:144 [GLY] | 2:2799 [G] | C:170 [LYS] | A:2249 [G] | ❌ 6AZ3_A:144, 6AZ3_2:2799 no longer at interface |
A:145 [ARG] | 2:2800 [A] | C:171 [TYR] | A:2250 [A] | ❌ 6AZ3_A:145, 6AZ3_2:2800 no longer at interface |
A:145 [ARG] | 2:2799 [G] | C:171 [TYR] | A:2249 [G] | ❌ 6AZ3_A:145, 6AZ3_2:2799 no longer at interface |
A:159 [PRO] | 2:2799 [G] | C:185 [LEU] | A:2249 [G] | ❌ 6AZ3_A:159, 6AZ3_2:2799 no longer at interface |
A:217 [GLN] | 2:2343 [G] | C:238 [ARG] | A:1999 [G] | ❌ 6AZ3_2:2343 no longer at interface |
A:11 [GLY] | 2:2198 [G] | C:44 [ASN] | A:1838 [G] | ❌ 6AZ3_2:2198 no longer at interface |
A:12 [ASN] | 2:2197 [U] | C:46 [GLN] | A:1837 [A] | ❌ 6AZ3_2:2197 no longer at interface |
A:12 [ASN] | 2:2198 [G] | C:46 [GLN] | A:1838 [G] | ❌ 6AZ3_2:2198 no longer at interface |
A:12 [ASN] | 1:957 [C] | C:46 [GLN] | A:819 [A] | ❌ 6AZ3_1:957 no longer at interface |
A:14 [SER] | 1:957 [C] | C:48 [LYS] | A:819 [A] | ❌ 6AZ3_1:957 no longer at interface |
A:123 [ARG] | 2:2548 [A] | C:151 [GLY] | A:2231 [C] | ❌ 6S0Z_C:151 no longer at interface |
A:123 [ARG] | 2:2549 [U] | C:151 [GLY] | A:2232 [A] | ❌ 6S0Z_C:151 no longer at interface |
A:195 [CYS] | 2:2210 [A] | C:216 [ILE] | A:1850 [G] | ❌ 6S0Z_C:216 no longer at interface |
A:51 [GLU] | 2:2203 [A] | C:84 [ASP] | A:1843 [U] | ❌ 6S0Z_C:84 no longer at interface |
A:51 [GLU] | 2:2204 [U] | C:84 [ASP] | A:1844 [G] | ❌ 6S0Z_C:84 no longer at interface |
A:28 [LYS] | 2:2548 [A] | C:66 [ASP] | A:2231 [C] | ❌ 6S0Z_C:66 no longer at interface |
A:28 [LYS] | 2:2549 [U] | C:66 [ASP] | A:2232 [A] | ❌ 6S0Z_C:66 no longer at interface |
A:190 [ARG] | 1:874 [C] | C:215 [GLY] | A:737 [C] | ❌ 6S0Z_C:215 no longer at interface |
A:27 [ALA] | 2:2203 [A] | C:65 [ILE] | A:1843 [U] | ❌ 6S0Z_C:65 no longer at interface |
A:27 [ALA] | 2:2204 [U] | C:65 [ILE] | A:1844 [G] | ❌ 6S0Z_C:65 no longer at interface |
A:31 [ILE] | 2:2548 [A] | C:69 [ARG] | A:2231 [C] | ❌ 6S0Z_C:69 no longer at interface |
A:31 [ILE] | 2:2549 [U] | C:69 [ARG] | A:2232 [A] | ❌ 6S0Z_C:69 no longer at interface |
A:31 [ILE] | 2:2550 [G] | C:69 [ARG] | A:2233 [C] | ❌ 6S0Z_C:69 no longer at interface |
A:155 [LYS] | 2:2185 [G] | C:181 [VAL] | A:1826 [G] | ❌ 6S0Z_C:181 no longer at interface |
A:26 [PRO] | 2:2203 [A] | C:64 [VAL] | A:1843 [U] | ❌ 6S0Z_C:64 no longer at interface |
A:26 [PRO] | 2:2204 [U] | C:64 [VAL] | A:1844 [G] | ❌ 6S0Z_C:64 no longer at interface |
A:235 [VAL] | 2:2211 [A] | C:253 [PRO] | A:1851 [G] | ❌ 6S0Z_C:253 no longer at interface |
A:235 [VAL] | 2:2212 [A] | C:253 [PRO] | A:1852 [G] | ❌ 6S0Z_C:253 no longer at interface |
A:168 [ILE] | 2:2207 [C] | C:194 [GLN] | A:1847 [U] | ❌ 6AZ3_A:168 no longer at interface |
A:171 [GLY] | 2:2207 [C] | C:197 [ASN] | A:1847 [U] | ❌ 6AZ3_A:171 no longer at interface |
A:29 [LEU] | 2:2204 [U] | C:67 [PHE] | A:1844 [G] | ❌ 6AZ3_A:29 no longer at interface |
A:29 [LEU] | 2:2205 [A] | C:67 [PHE] | A:1845 [U] | ❌ 6AZ3_A:29 no longer at interface |
A:30 [ARG] | 2:2549 [U] | C:68 [LYS] | A:2232 [A] | ❌ 6AZ3_A:30 no longer at interface |
A:30 [ARG] | 2:2550 [G] | C:68 [LYS] | A:2233 [C] | ❌ 6AZ3_A:30 no longer at interface |
A:53 [GLY] | 2:2204 [U] | C:86 [ASN] | A:1844 [G] | ❌ 6AZ3_A:53 no longer at interface |
A:55 [GLY] | 2:2207 [C] | C:88 [SER] | A:1847 [U] | ❌ 6AZ3_A:55 no longer at interface |
A:55 [GLY] | 2:2205 [A] | C:88 [SER] | A:1845 [U] | ❌ 6AZ3_A:55 no longer at interface |
A:55 [GLY] | 2:2208 [G] | C:88 [SER] | A:1848 [A] | ❌ 6AZ3_A:55 no longer at interface |
Properties of this pair
Common ECOD label(s) |
Common RFAM label(s) |
Interface TM-score |
Interface RMSD |
Percentage identity |
Protein TM-score |
RNA TM-score |
Protein coverage |
RNA coverage |
Percentage conservation |
Apolar conservation |
H-bond conservation |
Percentage switching out |
---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
Nucleic acid-binding proteins & SH3 | 0.77 | 3.89 | 0.24 | 0.73 | 0.76 | 0.64 | 0.68 | 0.60 | 0.56 | 0.29 | 0.25 |
Other pairs involving 6AZ3_A_1,2 or 6S0Z_C_A
Total number of entries: 20