Interface analysis
Style
Protein
CartoonLicorice
Surface
RNA
CartoonLicorice
Surface
Color
StructureStructure (with hetatm)
Chain
Chainbow
View
Focus on
InterfaceRNA
Protein
All
Show chains
Interface
show interface as licoriceCommon contacts -
6AZ3_A
|
6AZ3_1,2
|
7K00_c
|
7K00_a
|
Conserved?
|
---|---|---|---|---|
A:204 [ARG] | 1:965 [A] | c:225 [MET] | a:782 [A] | ✔ |
A:10 [LYS] | 2:2200 [U] | c:43 [ARG] | a:1813 [G] | ✔ |
A:174 [ARG] | 2:2207 [C] | c:200 [HIS] | a:1820 [U] | ✔ |
A:174 [ARG] | 2:2208 [G] | c:200 [HIS] | a:1821 [A] | ✔ |
A:175 [ILE] | 2:2207 [C] | c:201 [MET] | a:1820 [U] | ✔ |
A:223 [SER] | 2:2212 [A] | c:244 [PRO] | a:1825 [U] | ✔ |
A:223 [SER] | 2:2272 [A] | c:244 [PRO] | a:1901 [A] | ✔ |
A:223 [SER] | 2:2273 [C] | c:244 [PRO] | a:1902 [C] | ✔ |
A:214 [GLY] | 2:3188 [A] | c:235 [GLY] | a:2598 [A] | ✔ |
A:214 [GLY] | 2:3189 [G] | c:235 [GLY] | a:2599 [G] | ✔ |
A:186 [PHE] | 1:947 [A] | c:212 [ARG] | a:764 [A] | ✔ |
A:183 [GLY] | 1:911 [G] | c:209 [GLY] | a:729 [G] | ✔ |
A:183 [GLY] | 1:947 [A] | c:209 [GLY] | a:764 [A] | ✔ |
A:187 [TYR] | 1:947 [A] | c:213 [TRP] | a:764 [A] | ✔ |
A:17 [GLN] | 2:2200 [U] | c:51 [THR] | a:1813 [G] | ✔ |
A:17 [GLN] | 2:2201 [G] | c:51 [THR] | a:1814 [G] | ✔ |
A:184 [ASN] | 1:947 [A] | c:210 [ALA] | a:764 [A] | ✔ |
A:173 [GLY] | 2:2207 [C] | c:199 [GLU] | a:1820 [U] | ✔ |
A:182 [ALA] | 1:911 [G] | c:208 [ALA] | a:729 [G] | ✔ |
A:182 [ALA] | 1:947 [A] | c:208 [ALA] | a:764 [A] | ✔ |
A:182 [ALA] | 2:2161 [U] | c:208 [ALA] | a:1775 [U] | ✔ |
A:182 [ALA] | 2:2176 [U] | c:208 [ALA] | a:1790 [C] | ✔ |
A:182 [ALA] | 2:2177 [A] | c:208 [ALA] | a:1791 [A] | ✔ |
A:207 [VAL] | 1:967 [G] | c:228 [VAL] | a:784 [G] | ✔ |
A:207 [VAL] | 1:976 [A] | c:228 [VAL] | a:793 [A] | ✔ |
A:207 [VAL] | 2:2443 [U] | c:228 [VAL] | a:2073 [C] | ✔ |
A:16 [TYR] | 2:2200 [U] | c:50 [THR] | a:1813 [G] | ✔ |
A:152 [SER] | 2:2185 [G] | c:178 [SER] | a:1799 [G] | ✔ |
A:152 [SER] | 2:2206 [U] | c:178 [SER] | a:1819 [A] | ✔ |
A:150 [LEU] | 2:2185 [G] | c:176 [LEU] | a:1799 [G] | ✔ |
A:253 [LYS] | 2:2184 [U] | c:270 [ARG] | a:1798 [U] | ✔ |
A:253 [LYS] | 2:2185 [G] | c:270 [ARG] | a:1799 [G] | ✔ |
A:125 [THR] | 2:2185 [G] | c:153 [GLN] | a:1799 [G] | ✔ |
A:125 [THR] | 2:2205 [A] | c:153 [GLN] | a:1818 [U] | ✔ |
A:212 [GLY] | 2:3188 [A] | c:233 [GLY] | a:2598 [A] | ✔ |
A:154 [GLN] | 2:2185 [G] | c:180 [GLU] | a:1799 [G] | ✔ |
A:221 [HIS] | 2:2273 [C] | c:242 [LYS] | a:1902 [C] | ✔ |
A:221 [HIS] | 2:2445 [U] | c:242 [LYS] | a:2075 [U] | ✔ |
A:221 [HIS] | 2:3186 [U] | c:242 [LYS] | a:2596 [U] | ✔ |
A:221 [HIS] | 2:3187 [G] | c:242 [LYS] | a:2597 [G] | ✔ |
A:131 [GLY] | 2:2207 [C] | c:159 [GLY] | a:1820 [U] | ✔ |
A:206 [PRO] | 2:2443 [U] | c:227 [PRO] | a:2073 [C] | ✔ |
A:206 [PRO] | 2:2444 [U] | c:227 [PRO] | a:2074 [U] | ✔ |
A:206 [PRO] | 2:3188 [A] | c:227 [PRO] | a:2598 [A] | ✔ |
A:206 [PRO] | 2:3189 [G] | c:227 [PRO] | a:2599 [G] | ✔ |
A:132 [ASP] | 2:2206 [U] | c:160 [THR] | a:1819 [A] | ✔ |
A:132 [ASP] | 2:2207 [C] | c:160 [THR] | a:1820 [U] | ✔ |
A:180 [LEU] | 2:2177 [A] | c:206 [GLY] | a:1791 [A] | ✔ |
A:180 [LEU] | 2:2178 [G] | c:206 [GLY] | a:1792 [G] | ✔ |
A:129 [ALA] | 2:2205 [A] | c:157 [SER] | a:1818 [U] | ✔ |
A:129 [ALA] | 2:2206 [U] | c:157 [SER] | a:1819 [A] | ✔ |
A:129 [ALA] | 2:2207 [C] | c:157 [SER] | a:1820 [U] | ✔ |
A:129 [ALA] | 2:2208 [G] | c:157 [SER] | a:1821 [A] | ✔ |
A:236 [GLY] | 2:2211 [A] | c:252 [THR] | a:1824 [G] | ✔ |
A:236 [GLY] | 2:2212 [A] | c:252 [THR] | a:1825 [U] | ✔ |
A:216 [HIS] | 2:3181 [C] | c:237 [GLY] | a:2591 [C] | ✔ |
A:213 [GLY] | 2:3188 [A] | c:234 [GLY] | a:2598 [A] | ✔ |
A:213 [GLY] | 2:3189 [G] | c:234 [GLY] | a:2599 [G] | ✔ |
A:210 [PRO] | 2:2817 [G] | c:231 [PRO] | a:2239 [G] | ✔ |
A:237 [LEU] | 2:2181 [U] | c:253 [LYS] | a:1795 [C] | ✔ |
A:237 [LEU] | 2:2182 [U] | c:253 [LYS] | a:1796 [U] | ✔ |
A:237 [LEU] | 2:2211 [A] | c:253 [LYS] | a:1824 [G] | ✔ |
A:237 [LEU] | 2:2212 [A] | c:253 [LYS] | a:1825 [U] | ✔ |
A:237 [LEU] | 2:2230 [C] | c:253 [LYS] | a:1843 [C] | ✔ |
A:237 [LEU] | 2:2272 [A] | c:253 [LYS] | a:1901 [A] | ✔ |
A:21 [HIS] | 1:876 [U] | c:59 [LYS] | a:694 [U] | ✔ |
A:121 [GLY] | 2:2548 [A] | c:149 [GLY] | a:2204 [G] | ✔ |
A:201 [GLY] | 2:2212 [A] | c:222 [GLY] | a:1825 [U] | ✔ |
A:201 [GLY] | 2:2213 [C] | c:222 [GLY] | a:1826 [G] | ✔ |
A:119 [LYS] | 2:2546 [G] | c:147 [LYS] | a:2202 [U] | ✔ |
A:222 [PRO] | 2:2228 [U] | c:243 [HIS] | a:1841 [U] | ✔ |
A:222 [PRO] | 2:2229 [G] | c:243 [HIS] | a:1842 [G] | ✔ |
A:222 [PRO] | 2:2272 [A] | c:243 [HIS] | a:1901 [A] | ✔ |
A:222 [PRO] | 2:2273 [C] | c:243 [HIS] | a:1902 [C] | ✔ |
A:130 [SER] | 2:2207 [C] | c:158 [ALA] | a:1820 [U] | ✔ |
A:209 [HIS] | 2:2211 [A] | c:230 [HIS] | a:1824 [G] | ✔ |
A:209 [HIS] | 2:2212 [A] | c:230 [HIS] | a:1825 [U] | ✔ |
A:199 [VAL] | 1:964 [A] | c:220 [VAL] | a:781 [A] | ✔ |
A:199 [VAL] | 1:965 [A] | c:220 [VAL] | a:782 [A] | ✔ |
A:199 [VAL] | 2:2174 [C] | c:220 [VAL] | a:1788 [C] | ✔ |
A:199 [VAL] | 2:2175 [A] | c:220 [VAL] | a:1789 [A] | ✔ |
A:199 [VAL] | 2:2213 [C] | c:220 [VAL] | a:1826 [G] | ✔ |
A:219 [ILE] | 2:2212 [A] | c:240 [PHE] | a:1825 [U] | ✔ |
A:219 [ILE] | 2:2213 [C] | c:240 [PHE] | a:1826 [G] | ✔ |
A:219 [ILE] | 2:2273 [C] | c:240 [PHE] | a:1902 [C] | ✔ |
A:219 [ILE] | 2:2274 [G] | c:240 [PHE] | a:1903 [G] | ✔ |
A:18 [VAL] | 2:2201 [G] | c:54 [ILE] | a:1814 [G] | ✔ |
A:179 [VAL] | 2:2177 [A] | c:205 [LEU] | a:1791 [A] | ✔ |
A:179 [VAL] | 2:2178 [G] | c:205 [LEU] | a:1792 [G] | ✔ |
A:211 [HIS] | 2:2212 [A] | c:232 [HIS] | a:1825 [U] | ✔ |
A:211 [HIS] | 2:2213 [C] | c:232 [HIS] | a:1826 [G] | ✔ |
A:185 [SER] | 2:2177 [A] | c:211 [ALA] | a:1791 [A] | ✔ |
A:128 [ARG] | 2:2204 [U] | c:156 [ARG] | a:1817 [G] | ✔ |
A:128 [ARG] | 2:2205 [A] | c:156 [ARG] | a:1818 [U] | ✔ |
A:128 [ARG] | 2:2206 [U] | c:156 [ARG] | a:1819 [A] | ✔ |
A:198 [LYS] | 2:2175 [A] | c:219 [THR] | a:1789 [A] | ✔ |
A:198 [LYS] | 2:2176 [U] | c:219 [THR] | a:1790 [C] | ✔ |
A:198 [LYS] | 2:2215 [G] | c:219 [THR] | a:1828 [G] | ✔ |
A:54 [ARG] | 2:2204 [U] | c:87 [ARG] | a:1817 [G] | ✔ |
A:54 [ARG] | 2:2205 [A] | c:87 [ARG] | a:1818 [U] | ✔ |
A:197 [PRO] | 1:947 [A] | c:218 [PRO] | a:764 [A] | ✔ |
A:197 [PRO] | 1:964 [A] | c:218 [PRO] | a:781 [A] | ✔ |
A:197 [PRO] | 2:2175 [A] | c:218 [PRO] | a:1789 [A] | ✔ |
A:197 [PRO] | 2:2176 [U] | c:218 [PRO] | a:1790 [C] | ✔ |
A:14 [SER] | 1:956 [U] | c:48 [ARG] | a:773 [U] | ✔ |
A:14 [SER] | 1:961 [G] | c:48 [ARG] | a:778 [G] | ✔ |
A:14 [SER] | 1:962 [C] | c:48 [ARG] | a:779 [U] | ✔ |
A:126 [LEU] | 2:2185 [G] | c:154 [LEU] | a:1799 [G] | ✔ |
A:126 [LEU] | 2:2205 [A] | c:154 [LEU] | a:1818 [U] | ✔ |
A:126 [LEU] | 2:2206 [U] | c:154 [LEU] | a:1819 [A] | ✔ |
A:232 [GLY] | 2:2191 [U] | c:248 [TRP] | a:1805 [A] | ✔ |
A:232 [GLY] | 2:2817 [G] | c:248 [TRP] | a:2239 [G] | ✔ |
A:217 [GLN] | 2:2173 [A] | c:238 [ARG] | a:1787 [A] | ✔ |
A:217 [GLN] | 2:2174 [C] | c:238 [ARG] | a:1788 [C] | ✔ |
A:217 [GLN] | 2:2342 [OMU] | c:238 [ARG] | a:1971 [U] | ✔ |
A:217 [GLN] | 2:3180 [OMC] | c:238 [ARG] | a:2590 [A] | ✔ |
A:217 [GLN] | 2:3181 [C] | c:238 [ARG] | a:2591 [C] | ✔ |
A:233 [GLN] | 2:2817 [G] | c:249 [GLY] | a:2239 [G] | ✔ |
A:172 [GLY] | 2:2207 [C] | c:198 [ALA] | a:1820 [U] | ✔ |
A:19 [HIS] | 1:873 [G] | c:55 [GLY] | a:691 [C] | ✔ |
A:19 [HIS] | 1:874 [C] | c:55 [GLY] | a:692 [C] | ✔ |
A:181 [LYS] | 1:911 [G] | c:207 [LYS] | a:729 [G] | ✔ |
A:181 [LYS] | 1:947 [A] | c:207 [LYS] | a:764 [A] | ✔ |
A:181 [LYS] | 2:2176 [U] | c:207 [LYS] | a:1790 [C] | ✔ |
A:181 [LYS] | 2:2177 [A] | c:207 [LYS] | a:1791 [A] | ✔ |
A:218 [HIS] | 2:2342 [OMU] | c:239 [ASN] | a:1971 [U] | ✔ |
A:218 [HIS] | 2:3185 [G] | c:239 [ASN] | a:2595 [G] | ✔ |
A:218 [HIS] | 2:3188 [A] | c:239 [ASN] | a:2598 [A] | ✔ |
A:26 [PRO] | 2:2203 [A] | c:64 [ILE] | a:1816 [C] | ✔ |
A:203 [ALA] | 1:965 [A] | c:224 [ALA] | a:782 [A] | ✔ |
A:203 [ALA] | 1:966 [A] | c:224 [ALA] | a:783 [A] | ✔ |
A:203 [ALA] | 2:2174 [C] | c:224 [ALA] | a:1788 [C] | ✔ |
A:203 [ALA] | 2:2175 [A] | c:224 [ALA] | a:1789 [A] | ✔ |
A:208 [GLU] | 1:963 [G] | c:229 [ASP] | a:780 [G] | ✔ |
A:208 [GLU] | 1:965 [A] | c:229 [ASP] | a:782 [A] | ✔ |
A:24 [LEU] | 2:2203 [A] | c:62 [TYR] | a:1816 [C] | ✔ |
A:254 [GLY] | 2:2184 [U] | c:271 [ARG] | a:1798 [U] | ✔ |
A:254 [GLY] | 2:2185 [G] | c:271 [ARG] | a:1799 [G] | ✔ |
A:215 [ASN] | 2:3189 [G] | c:236 [GLU] | a:2599 [G] | ✔ |
A:215 [ASN] | 2:3190 [A] | c:236 [GLU] | a:2600 [A] | ✔ |
A:240 [ALA] | 2:2183 [G] | c:256 [LYS] | a:1797 [G] | ✔ |
A:240 [ALA] | 2:2230 [C] | c:256 [LYS] | a:1843 [C] | ✔ |
A:240 [ALA] | 2:2231 [U] | c:256 [LYS] | a:1844 [C] | ✔ |
A:238 [ILE] | 2:2182 [U] | c:254 [GLY] | a:1796 [U] | ✔ |
A:238 [ILE] | 2:2183 [G] | c:254 [GLY] | a:1797 [G] | ✔ |
A:205 [ASN] | 1:966 [A] | c:226 [ASN] | a:783 [A] | ✔ |
A:205 [ASN] | 1:967 [G] | c:226 [ASN] | a:784 [G] | ✔ |
A:127 [ALA] | 2:2185 [G] | c:155 [ALA] | a:1799 [G] | ✔ |
A:127 [ALA] | 2:2205 [A] | c:155 [ALA] | a:1818 [U] | ✔ |
A:127 [ALA] | 2:2206 [U] | c:155 [ALA] | a:1819 [A] | ✔ |
A:200 [ARG] | 2:2173 [A] | c:221 [ARG] | a:1787 [A] | ✔ |
A:200 [ARG] | 2:2174 [C] | c:221 [ARG] | a:1788 [C] | ✔ |
A:200 [ARG] | 2:2175 [A] | c:221 [ARG] | a:1789 [A] | ✔ |
A:200 [ARG] | 2:2213 [C] | c:221 [ARG] | a:1826 [G] | ✔ |
A:200 [ARG] | 2:2214 [U] | c:221 [ARG] | a:1827 [U] | ✔ |
A:200 [ARG] | 2:2215 [G] | c:221 [ARG] | a:1828 [G] | ✔ |
A:156 [LYS] | 2:2185 [G] | c:182 [ARG] | a:1799 [G] | ✔ |
A:156 [LYS] | 2:2186 [A] | c:182 [ARG] | a:1800 [C] | ✔ |
A:11 [GLY] | 2:2191 [U] | c:44 [ASN] | a:1805 [A] | ✔ |
A:11 [GLY] | 2:2192 [C] | c:44 [ASN] | a:1806 [C] | ✔ |
A:11 [GLY] | 2:2199 [G] | c:44 [ASN] | a:1812 [U] | ✔ |
A:11 [GLY] | 2:2200 [U] | c:44 [ASN] | a:1813 [G] | ✔ |
A:220 [GLY] | 2:2273 [C] | c:241 [GLY] | a:1902 [C] | ✔ |
A:220 [GLY] | 2:2274 [G] | c:241 [GLY] | a:1903 [G] | ✔ |
A:220 [GLY] | 2:3186 [U] | c:241 [GLY] | a:2596 [U] | ✔ |
A:220 [GLY] | 2:3187 [G] | c:241 [GLY] | a:2597 [G] | ✔ |
A:239 [ALA] | 2:2182 [U] | c:255 [LYS] | a:1796 [U] | ✔ |
A:239 [ALA] | 2:2183 [G] | c:255 [LYS] | a:1797 [G] | ✔ |
A:239 [ALA] | 2:2230 [C] | c:255 [LYS] | a:1843 [C] | ✔ |
A:239 [ALA] | 2:2231 [U] | c:255 [LYS] | a:1844 [C] | ✔ |
A:122 [ASP] | 2:2547 [A] | c:150 [LYS] | a:2203 [U] | ✔ |
A:122 [ASP] | 2:2548 [A] | c:150 [LYS] | a:2204 [G] | ✔ |
A:12 [ASN] | 2:2192 [C] | c:46 [ASN] | a:1806 [C] | ✔ |
A:12 [ASN] | 2:2193 [C] | c:46 [ASN] | a:1807 [G] | ✔ |
A:202 [VAL] | 2:2213 [C] | c:223 [THR] | a:1826 [G] | ✔ |
A:202 [VAL] | 2:2214 [U] | c:223 [THR] | a:1827 [U] | ✔ |
A:178 [PRO] | 2:2177 [A] | c:204 [VAL] | a:1791 [A] | ✔ |
A:178 [PRO] | 2:2178 [G] | c:204 [VAL] | a:1792 [G] | ✔ |
A:151 [PRO] | 2:2185 [G] | c:177 [ARG] | a:1799 [G] | ✔ |
A:151 [PRO] | 2:2206 [U] | c:177 [ARG] | a:1819 [A] | ✔ |
A:151 [PRO] | 2:2207 [C] | c:177 [ARG] | a:1820 [U] | ✔ |
A:177 [LYS] | 2:2178 [G] | c:203 [ARG] | a:1792 [G] | ✔ |
A:15 [VAL] | 1:872 [U] | c:49 [ILE] | a:690 [G] | ✔ |
A:15 [VAL] | 1:962 [C] | c:49 [ILE] | a:779 [U] | ✔ |
A:15 [VAL] | 1:963 [G] | c:49 [ILE] | a:780 [G] | ✔ |
A:204 [ARG] | 2:2212 [A] | c:225 [MET] | a:1825 [U] | ❌ 7K00_c_a |
A:10 [LYS] | 2:2191 [U] | c:43 [ARG] | a:1805 [A] | ❌ 7K00_c_a |
A:10 [LYS] | 2:2201 [G] | c:43 [ARG] | a:1814 [G] | ❌ 7K00_c_a |
A:10 [LYS] | 2:2211 [A] | c:43 [ARG] | a:1824 [G] | ❌ 7K00_c_a |
A:175 [ILE] | 2:2208 [G] | c:201 [MET] | a:1821 [A] | ❌ 7K00_c_a |
A:225 [VAL] | 2:2230 [C] | c:245 [VAL] | a:1843 [C] | ❌ 7K00_c_a |
A:225 [VAL] | 2:2231 [U] | c:245 [VAL] | a:1844 [C] | ❌ 7K00_c_a |
A:23 [ARG] | 2:2203 [A] | c:61 [ALA] | a:1816 [C] | ❌ 7K00_c_a |
A:23 [ARG] | 2:2204 [U] | c:61 [ALA] | a:1817 [G] | ❌ 7K00_c_a |
A:187 [TYR] | 1:946 [G] | c:213 [TRP] | a:763 [G] | ❌ 7K00_c_a |
A:22 [LYS] | 1:875 [C] | c:60 [GLN] | a:693 [A] | ❌ 7K00_c_a |
A:22 [LYS] | 1:876 [U] | c:60 [GLN] | a:694 [U] | ❌ 7K00_c_a |
A:196 [TRP] | 1:947 [A] | c:217 [ARG] | a:764 [A] | ❌ 7K00_c_a |
A:196 [TRP] | 2:2176 [U] | c:217 [ARG] | a:1790 [C] | ❌ 7K00_c_a |
A:196 [TRP] | 2:2177 [A] | c:217 [ARG] | a:1791 [A] | ❌ 7K00_c_a |
A:13 [GLY] | 2:2200 [U] | c:47 [GLY] | a:1813 [G] | ❌ 7K00_c_a |
A:16 [TYR] | 1:962 [C] | c:50 [THR] | a:779 [U] | ❌ 7K00_c_a |
A:16 [TYR] | 1:963 [G] | c:50 [THR] | a:780 [G] | ❌ 7K00_c_a |
A:16 [TYR] | 2:2201 [G] | c:50 [THR] | a:1814 [G] | ❌ 7K00_c_a |
A:253 [LYS] | 2:2182 [U] | c:270 [ARG] | a:1796 [U] | ❌ 7K00_c_a |
A:253 [LYS] | 2:2183 [G] | c:270 [ARG] | a:1797 [G] | ❌ 7K00_c_a |
A:253 [LYS] | 2:2206 [U] | c:270 [ARG] | a:1819 [A] | ❌ 7K00_c_a |
A:20 [GLY] | 2:2203 [A] | c:58 [HIS] | a:1816 [C] | ❌ 7K00_c_a |
A:180 [LEU] | 1:911 [G] | c:206 [GLY] | a:729 [G] | ❌ 7K00_c_a |
A:216 [HIS] | 2:3184 [C] | c:237 [GLY] | a:2594 [C] | ❌ 7K00_c_a |
A:216 [HIS] | 2:3189 [G] | c:237 [GLY] | a:2599 [G] | ❌ 7K00_c_a |
A:216 [HIS] | 2:3190 [A] | c:237 [GLY] | a:2600 [A] | ❌ 7K00_c_a |
A:231 [PRO] | 2:2191 [U] | c:247 [PRO] | a:1805 [A] | ❌ 7K00_c_a |
A:231 [PRO] | 2:2192 [C] | c:247 [PRO] | a:1806 [C] | ❌ 7K00_c_a |
A:231 [PRO] | 2:2817 [G] | c:247 [PRO] | a:2239 [G] | ❌ 7K00_c_a |
A:188 [ARG] | 2:2208 [G] | c:214 [ARG] | a:1821 [A] | ❌ 7K00_c_a |
A:21 [HIS] | 1:874 [C] | c:59 [LYS] | a:692 [C] | ❌ 7K00_c_a |
A:21 [HIS] | 1:875 [C] | c:59 [LYS] | a:693 [A] | ❌ 7K00_c_a |
A:21 [HIS] | 1:1642 [G] | c:59 [LYS] | a:1353 [A] | ❌ 7K00_c_a |
A:21 [HIS] | 1:1643 [A] | c:59 [LYS] | a:1354 [A] | ❌ 7K00_c_a |
A:21 [HIS] | 2:2203 [A] | c:59 [LYS] | a:1816 [C] | ❌ 7K00_c_a |
A:121 [GLY] | 2:2547 [A] | c:149 [GLY] | a:2203 [U] | ❌ 7K00_c_a |
A:119 [LYS] | 2:2186 [A] | c:147 [LYS] | a:1800 [C] | ❌ 7K00_c_a |
A:119 [LYS] | 2:2187 [U] | c:147 [LYS] | a:1801 [A] | ❌ 7K00_c_a |
A:119 [LYS] | 2:2547 [A] | c:147 [LYS] | a:2203 [U] | ❌ 7K00_c_a |
A:25 [GLY] | 2:2203 [A] | c:63 [ARG] | a:1816 [C] | ❌ 7K00_c_a |
A:25 [GLY] | 2:2204 [U] | c:63 [ARG] | a:1817 [G] | ❌ 7K00_c_a |
A:209 [HIS] | 2:2213 [C] | c:230 [HIS] | a:1826 [G] | ❌ 7K00_c_a |
A:18 [VAL] | 2:2200 [U] | c:54 [ILE] | a:1813 [G] | ❌ 7K00_c_a |
A:18 [VAL] | 2:2203 [A] | c:54 [ILE] | a:1816 [C] | ❌ 7K00_c_a |
A:185 [SER] | 2:2176 [U] | c:211 [ALA] | a:1790 [C] | ❌ 7K00_c_a |
A:198 [LYS] | 2:2211 [A] | c:219 [THR] | a:1824 [G] | ❌ 7K00_c_a |
A:54 [ARG] | 2:2203 [A] | c:87 [ARG] | a:1816 [C] | ❌ 7K00_c_a |
A:14 [SER] | 1:955 [A2M] | c:48 [ARG] | a:772 [C] | ❌ 7K00_c_a |
A:217 [GLN] | 2:2214 [U] | c:238 [ARG] | a:1827 [U] | ❌ 7K00_c_a |
A:9 [ARG] | 1:961 [G] | c:42 [GLY] | a:778 [G] | ❌ 7K00_c_a |
A:9 [ARG] | 1:962 [C] | c:42 [GLY] | a:779 [U] | ❌ 7K00_c_a |
A:9 [ARG] | 1:963 [G] | c:42 [GLY] | a:780 [G] | ❌ 7K00_c_a |
A:181 [LYS] | 1:910 [G] | c:207 [LYS] | a:728 [G] | ❌ 7K00_c_a |
A:218 [HIS] | 2:2274 [G] | c:239 [ASN] | a:1903 [G] | ❌ 7K00_c_a |
A:218 [HIS] | 2:3187 [G] | c:239 [ASN] | a:2597 [G] | ❌ 7K00_c_a |
A:26 [PRO] | 2:2204 [U] | c:64 [ILE] | a:1817 [G] | ❌ 7K00_c_a |
A:208 [GLU] | 1:962 [C] | c:229 [ASP] | a:779 [U] | ❌ 7K00_c_a |
A:235 [VAL] | 2:2211 [A] | c:251 [GLN] | a:1824 [G] | ❌ 7K00_c_a |
A:235 [VAL] | 2:2212 [A] | c:251 [GLN] | a:1825 [U] | ❌ 7K00_c_a |
A:215 [ASN] | 2:3180 [OMC] | c:236 [GLU] | a:2590 [A] | ❌ 7K00_c_a |
A:215 [ASN] | 2:3181 [C] | c:236 [GLU] | a:2591 [C] | ❌ 7K00_c_a |
A:240 [ALA] | 2:2182 [U] | c:256 [LYS] | a:1796 [U] | ❌ 7K00_c_a |
A:238 [ILE] | 2:2190 [A] | c:254 [GLY] | a:1804 [C] | ❌ 7K00_c_a |
A:238 [ILE] | 2:2211 [A] | c:254 [GLY] | a:1824 [G] | ❌ 7K00_c_a |
A:120 [PRO] | 2:2798 [C] | c:148 [PRO] | a:2221 [G] | ❌ 7K00_c_a |
A:12 [ASN] | 1:961 [G] | c:46 [ASN] | a:778 [G] | ❌ 7K00_c_a |
A:12 [ASN] | 2:2191 [U] | c:46 [ASN] | a:1805 [A] | ❌ 7K00_c_a |
A:12 [ASN] | 2:2199 [G] | c:46 [ASN] | a:1812 [U] | ❌ 7K00_c_a |
A:12 [ASN] | 2:2200 [U] | c:46 [ASN] | a:1813 [G] | ❌ 7K00_c_a |
A:15 [VAL] | 1:873 [G] | c:49 [ILE] | a:691 [C] | ❌ 7K00_c_a |
A:15 [VAL] | 1:955 [A2M] | c:49 [ILE] | a:772 [C] | ❌ 7K00_c_a |
A:15 [VAL] | 1:956 [U] | c:49 [ILE] | a:773 [U] | ❌ 7K00_c_a |
A:119 [LYS] | 2:2548 [A] | c:147 [LYS] | a:2204 [G] | ❌ 6AZ3_A_1,2 |
A:119 [LYS] | 2:2798 [C] | c:147 [LYS] | a:2221 [G] | ❌ 6AZ3_A_1,2 |
A:120 [PRO] | 2:2548 [A] | c:148 [PRO] | a:2204 [G] | ❌ 6AZ3_A_1,2 |
A:120 [PRO] | 2:2549 [U] | c:148 [PRO] | a:2205 [A] | ❌ 6AZ3_A_1,2 |
A:121 [GLY] | 2:2549 [U] | c:149 [GLY] | a:2205 [A] | ❌ 6AZ3_A_1,2 |
A:122 [ASP] | 2:2549 [U] | c:150 [LYS] | a:2205 [A] | ❌ 6AZ3_A_1,2 |
A:122 [ASP] | 2:2187 [U] | c:150 [LYS] | a:1801 [A] | ❌ 6AZ3_A_1,2 |
A:122 [ASP] | 2:2186 [A] | c:150 [LYS] | a:1800 [C] | ❌ 6AZ3_A_1,2 |
A:125 [THR] | 2:2186 [A] | c:153 [GLN] | a:1800 [C] | ❌ 6AZ3_A_1,2 |
A:125 [THR] | 2:2187 [U] | c:153 [GLN] | a:1801 [A] | ❌ 6AZ3_A_1,2 |
A:128 [ARG] | 2:2203 [A] | c:156 [ARG] | a:1816 [C] | ❌ 6AZ3_A_1,2 |
A:177 [LYS] | 2:2208 [G] | c:203 [ARG] | a:1821 [A] | ❌ 6AZ3_A_1,2 |
A:181 [LYS] | 1:946 [G] | c:207 [LYS] | a:763 [G] | ❌ 6AZ3_A_1,2 |
A:186 [PHE] | 1:964 [A] | c:212 [ARG] | a:781 [A] | ❌ 6AZ3_A_1,2 |
A:186 [PHE] | 1:873 [G] | c:212 [ARG] | a:691 [C] | ❌ 6AZ3_A_1,2 |
A:196 [TRP] | 1:963 [G] | c:217 [ARG] | a:780 [G] | ❌ 6AZ3_A_1,2 |
A:196 [TRP] | 1:872 [U] | c:217 [ARG] | a:690 [G] | ❌ 6AZ3_A_1,2 |
A:196 [TRP] | 1:964 [A] | c:217 [ARG] | a:781 [A] | ❌ 6AZ3_A_1,2 |
A:196 [TRP] | 1:873 [G] | c:217 [ARG] | a:691 [C] | ❌ 6AZ3_A_1,2 |
A:198 [LYS] | 2:2212 [A] | c:219 [THR] | a:1825 [U] | ❌ 6AZ3_A_1,2 |
A:207 [VAL] | 2:2444 [U] | c:228 [VAL] | a:2074 [U] | ❌ 6AZ3_A_1,2 |
A:210 [PRO] | 2:2445 [U] | c:231 [PRO] | a:2075 [U] | ❌ 6AZ3_A_1,2 |
A:216 [HIS] | 2:3180 [OMC] | c:237 [GLY] | a:2590 [A] | ❌ 6AZ3_A_1,2 |
A:218 [HIS] | 2:3184 [C] | c:239 [ASN] | a:2594 [C] | ❌ 6AZ3_A_1,2 |
A:218 [HIS] | 2:3189 [G] | c:239 [ASN] | a:2599 [G] | ❌ 6AZ3_A_1,2 |
A:219 [ILE] | 2:2342 [OMU] | c:240 [PHE] | a:1971 [U] | ❌ 6AZ3_A_1,2 |
A:219 [ILE] | 2:3187 [G] | c:240 [PHE] | a:2597 [G] | ❌ 6AZ3_A_1,2 |
A:219 [ILE] | 2:3188 [A] | c:240 [PHE] | a:2598 [A] | ❌ 6AZ3_A_1,2 |
A:221 [HIS] | 2:2274 [G] | c:242 [LYS] | a:1903 [G] | ❌ 6AZ3_A_1,2 |
A:221 [HIS] | 2:3188 [A] | c:242 [LYS] | a:2598 [A] | ❌ 6AZ3_A_1,2 |
A:225 [VAL] | 2:2211 [A] | c:245 [VAL] | a:1824 [G] | ❌ 6AZ3_A_1,2 |
A:225 [VAL] | 2:2212 [A] | c:245 [VAL] | a:1825 [U] | ❌ 6AZ3_A_1,2 |
A:229 [SER] | 2:2211 [A] | c:246 [THR] | a:1824 [G] | ❌ 6AZ3_A_1,2 |
A:229 [SER] | 2:2212 [A] | c:246 [THR] | a:1825 [U] | ❌ 6AZ3_A_1,2 |
A:231 [PRO] | 2:2211 [A] | c:247 [PRO] | a:1824 [G] | ❌ 6AZ3_A_1,2 |
A:231 [PRO] | 2:2212 [A] | c:247 [PRO] | a:1825 [U] | ❌ 6AZ3_A_1,2 |
A:232 [GLY] | 2:2211 [A] | c:248 [TRP] | a:1824 [G] | ❌ 6AZ3_A_1,2 |
A:232 [GLY] | 2:2192 [C] | c:248 [TRP] | a:1806 [C] | ❌ 6AZ3_A_1,2 |
A:232 [GLY] | 2:2190 [A] | c:248 [TRP] | a:1804 [C] | ❌ 6AZ3_A_1,2 |
A:235 [VAL] | 2:2230 [C] | c:251 [GLN] | a:1843 [C] | ❌ 6AZ3_A_1,2 |
A:235 [VAL] | 2:2229 [G] | c:251 [GLN] | a:1842 [G] | ❌ 6AZ3_A_1,2 |
A:236 [GLY] | 2:2182 [U] | c:252 [THR] | a:1796 [U] | ❌ 6AZ3_A_1,2 |
A:236 [GLY] | 2:2210 [A] | c:252 [THR] | a:1823 [G] | ❌ 6AZ3_A_1,2 |
A:237 [LEU] | 2:2271 [A] | c:253 [LYS] | a:1900 [A] | ❌ 6AZ3_A_1,2 |
A:237 [LEU] | 2:2180 [U] | c:253 [LYS] | a:1794 [A] | ❌ 6AZ3_A_1,2 |
A:238 [ILE] | 2:2231 [U] | c:254 [GLY] | a:1844 [C] | ❌ 6AZ3_A_1,2 |
A:238 [ILE] | 2:2230 [C] | c:254 [GLY] | a:1843 [C] | ❌ 6AZ3_A_1,2 |
A:240 [ALA] | 2:2184 [U] | c:256 [LYS] | a:1798 [U] | ❌ 6AZ3_A_1,2 |
A:240 [ALA] | 2:2232 [C] | c:256 [LYS] | a:1845 [G] | ❌ 6AZ3_A_1,2 |
A:254 [GLY] | 2:2206 [U] | c:271 [ARG] | a:1819 [A] | ❌ 6AZ3_A_1,2 |
A:254 [GLY] | 2:2183 [G] | c:271 [ARG] | a:1797 [G] | ❌ 6AZ3_A_1,2 |
A:9 [ARG] | 2:2201 [G] | c:42 [GLY] | a:1814 [G] | ❌ 6AZ3_A_1,2 |
A:9 [ARG] | 2:2200 [U] | c:42 [GLY] | a:1813 [G] | ❌ 6AZ3_A_1,2 |
A:10 [LYS] | 1:963 [G] | c:43 [ARG] | a:780 [G] | ❌ 6AZ3_A_1,2 |
A:10 [LYS] | 1:872 [U] | c:43 [ARG] | a:690 [G] | ❌ 6AZ3_A_1,2 |
A:10 [LYS] | 1:873 [G] | c:43 [ARG] | a:691 [C] | ❌ 6AZ3_A_1,2 |
A:10 [LYS] | 1:962 [C] | c:43 [ARG] | a:779 [U] | ❌ 6AZ3_A_1,2 |
A:12 [ASN] | 1:956 [U] | c:46 [ASN] | a:773 [U] | ❌ 6AZ3_A_1,2 |
A:13 [GLY] | 1:962 [C] | c:47 [GLY] | a:779 [U] | ❌ 6AZ3_A_1,2 |
A:13 [GLY] | 1:955 [A2M] | c:47 [GLY] | a:772 [C] | ❌ 6AZ3_A_1,2 |
A:13 [GLY] | 1:956 [U] | c:47 [GLY] | a:773 [U] | ❌ 6AZ3_A_1,2 |
A:14 [SER] | 1:960 [A] | c:48 [ARG] | a:777 [G] | ❌ 6AZ3_A_1,2 |
A:14 [SER] | 2:2192 [C] | c:48 [ARG] | a:1806 [C] | ❌ 6AZ3_A_1,2 |
A:14 [SER] | 2:2193 [C] | c:48 [ARG] | a:1807 [G] | ❌ 6AZ3_A_1,2 |
A:15 [VAL] | 2:2192 [C] | c:49 [ILE] | a:1806 [C] | ❌ 6AZ3_A_1,2 |
A:15 [VAL] | 2:2191 [U] | c:49 [ILE] | a:1805 [A] | ❌ 6AZ3_A_1,2 |
A:16 [TYR] | 2:2192 [C] | c:50 [THR] | a:1806 [C] | ❌ 6AZ3_A_1,2 |
A:16 [TYR] | 2:2199 [G] | c:50 [THR] | a:1812 [U] | ❌ 6AZ3_A_1,2 |
A:16 [TYR] | 2:2190 [A] | c:50 [THR] | a:1804 [C] | ❌ 6AZ3_A_1,2 |
A:16 [TYR] | 2:2191 [U] | c:50 [THR] | a:1805 [A] | ❌ 6AZ3_A_1,2 |
A:17 [GLN] | 2:2190 [A] | c:51 [THR] | a:1804 [C] | ❌ 6AZ3_A_1,2 |
A:17 [GLN] | 2:2210 [A] | c:51 [THR] | a:1823 [G] | ❌ 6AZ3_A_1,2 |
A:18 [VAL] | 1:873 [G] | c:54 [ILE] | a:691 [C] | ❌ 6AZ3_A_1,2 |
A:18 [VAL] | 2:2210 [A] | c:54 [ILE] | a:1823 [G] | ❌ 6AZ3_A_1,2 |
A:24 [LEU] | 2:2204 [U] | c:62 [TYR] | a:1817 [G] | ❌ 6AZ3_A_1,2 |
A:186 [PHE] | 1:948 [U] | c:212 [ARG] | a:765 [C] | ❌ 7K00_a:765 no longer at interface |
A:23 [ARG] | 2:2202 [U] | c:61 [ALA] | a:1815 [A] | ❌ 7K00_a:1815 no longer at interface |
A:187 [TYR] | 1:948 [U] | c:213 [TRP] | a:765 [C] | ❌ 7K00_a:765 no longer at interface |
A:17 [GLN] | 1:1644 [G] | c:51 [THR] | a:1355 [G] | ❌ 7K00_a:1355 no longer at interface |
A:229 [SER] | 2:2453 [G] | c:246 [THR] | a:2083 [G] | ❌ 7K00_a:2083 no longer at interface |
A:207 [VAL] | 2:2442 [G] | c:228 [VAL] | a:2072 [C] | ❌ 7K00_a:2072 no longer at interface |
A:65 [HIS] | 2:2550 [G] | c:98 [ASP] | a:2206 [C] | ❌ 7K00_a:2206 no longer at interface |
A:216 [HIS] | 2:3182 [G] | c:237 [GLY] | a:2592 [G] | ❌ 7K00_a:2592 no longer at interface |
A:216 [HIS] | 2:3183 [U] | c:237 [GLY] | a:2593 [U] | ❌ 7K00_a:2593 no longer at interface |
A:231 [PRO] | 2:2453 [G] | c:247 [PRO] | a:2083 [G] | ❌ 7K00_a:2083 no longer at interface |
A:31 [ILE] | 2:2550 [G] | c:69 [ARG] | a:2206 [C] | ❌ 7K00_c:69, 7K00_a:2206 no longer at interface |
A:18 [VAL] | 2:2202 [U] | c:54 [ILE] | a:1815 [A] | ❌ 7K00_a:1815 no longer at interface |
A:217 [GLN] | 2:3179 [A] | c:238 [ARG] | a:2589 [A] | ❌ 7K00_a:2589 no longer at interface |
A:233 [GLN] | 2:2815 [G] | c:249 [GLY] | a:2237 [G] | ❌ 7K00_a:2237 no longer at interface |
A:233 [GLN] | 2:2816 [G] | c:249 [GLY] | a:2238 [G] | ❌ 7K00_a:2238 no longer at interface |
A:208 [GLU] | 1:968 [A] | c:229 [ASP] | a:785 [G] | ❌ 7K00_a:785 no longer at interface |
A:215 [ASN] | 2:3191 [C] | c:236 [GLU] | a:2601 [C] | ❌ 7K00_a:2601 no longer at interface |
A:240 [ALA] | 2:2268 [G] | c:256 [LYS] | a:1897 [G] | ❌ 7K00_a:1897 no longer at interface |
A:145 [ARG] | 2:2800 [A] | c:171 [TYR] | a:2223 [G] | ❌ 6AZ3_A:145, 6AZ3_2:2800 no longer at interface |
A:145 [ARG] | 2:2799 [G] | c:171 [TYR] | a:2222 [C] | ❌ 6AZ3_A:145, 6AZ3_2:2799 no longer at interface |
A:159 [PRO] | 2:2799 [G] | c:185 [GLU] | a:2222 [C] | ❌ 6AZ3_A:159, 6AZ3_2:2799 no longer at interface |
A:182 [ALA] | 2:2160 [C] | c:208 [ALA] | a:1774 [C] | ❌ 6AZ3_2:2160 no longer at interface |
A:215 [ASN] | 2:3029 [A] | c:236 [GLU] | a:2439 [A] | ❌ 6AZ3_2:3029 no longer at interface |
A:215 [ASN] | 2:3030 [C] | c:236 [GLU] | a:2440 [C] | ❌ 6AZ3_2:3030 no longer at interface |
A:217 [GLN] | 2:2343 [G] | c:238 [ARG] | a:1972 [G] | ❌ 6AZ3_2:2343 no longer at interface |
A:11 [GLY] | 2:2198 [G] | c:44 [ASN] | a:1811 [G] | ❌ 6AZ3_2:2198 no longer at interface |
A:12 [ASN] | 2:2198 [G] | c:46 [ASN] | a:1811 [G] | ❌ 6AZ3_2:2198 no longer at interface |
A:12 [ASN] | 1:957 [C] | c:46 [ASN] | a:774 [G] | ❌ 6AZ3_1:957 no longer at interface |
A:12 [ASN] | 1:1659 [G] | c:46 [ASN] | a:1370 [C] | ❌ 6AZ3_1:1659 no longer at interface |
A:14 [SER] | 1:957 [C] | c:48 [ARG] | a:774 [G] | ❌ 6AZ3_1:957 no longer at interface |
A:14 [SER] | 1:958 [G] | c:48 [ARG] | a:775 [G] | ❌ 6AZ3_1:958 no longer at interface |
A:123 [ARG] | 2:2548 [A] | c:151 [GLY] | a:2204 [G] | ❌ 7K00_c:151 no longer at interface |
A:123 [ARG] | 2:2549 [U] | c:151 [GLY] | a:2205 [A] | ❌ 7K00_c:151 no longer at interface |
A:195 [CYS] | 2:2210 [A] | c:216 [VAL] | a:1823 [G] | ❌ 7K00_c:216 no longer at interface |
A:51 [GLU] | 2:2203 [A] | c:84 [ASP] | a:1816 [C] | ❌ 7K00_c:84 no longer at interface |
A:51 [GLU] | 2:2204 [U] | c:84 [ASP] | a:1817 [G] | ❌ 7K00_c:84 no longer at interface |
A:28 [LYS] | 2:2548 [A] | c:66 [ASP] | a:2204 [G] | ❌ 7K00_c:66 no longer at interface |
A:28 [LYS] | 2:2549 [U] | c:66 [ASP] | a:2205 [A] | ❌ 7K00_c:66 no longer at interface |
A:190 [ARG] | 1:874 [C] | c:215 [GLY] | a:692 [C] | ❌ 7K00_c:215 no longer at interface |
A:27 [ALA] | 2:2203 [A] | c:65 [VAL] | a:1816 [C] | ❌ 7K00_c:65 no longer at interface |
A:27 [ALA] | 2:2204 [U] | c:65 [VAL] | a:1817 [G] | ❌ 7K00_c:65 no longer at interface |
A:31 [ILE] | 2:2548 [A] | c:69 [ARG] | a:2204 [G] | ❌ 7K00_c:69 no longer at interface |
A:31 [ILE] | 2:2549 [U] | c:69 [ARG] | a:2205 [A] | ❌ 7K00_c:69 no longer at interface |
A:155 [LYS] | 2:2185 [G] | c:181 [MET] | a:1799 [G] | ❌ 7K00_c:181 no longer at interface |
A:234 [LYS] | 2:2190 [A] | c:250 [VAL] | a:1804 [C] | ❌ 7K00_c:250 no longer at interface |
A:234 [LYS] | 2:2191 [U] | c:250 [VAL] | a:1805 [A] | ❌ 7K00_c:250 no longer at interface |
A:234 [LYS] | 2:2211 [A] | c:250 [VAL] | a:1824 [G] | ❌ 7K00_c:250 no longer at interface |
A:255 [ALA] | 2:2184 [U] | c:272 [SER] | a:1798 [U] | ❌ 7K00_c:272 no longer at interface |
A:255 [ALA] | 2:2185 [G] | c:272 [SER] | a:1799 [G] | ❌ 7K00_c:272 no longer at interface |
A:118 [ALA] | 2:2186 [A] | c:146 [MET] | a:1800 [C] | ❌ 6AZ3_A:118 no longer at interface |
A:118 [ALA] | 2:2185 [G] | c:146 [MET] | a:1799 [G] | ❌ 6AZ3_A:118 no longer at interface |
A:118 [ALA] | 2:2187 [U] | c:146 [MET] | a:1801 [A] | ❌ 6AZ3_A:118 no longer at interface |
A:171 [GLY] | 2:2207 [C] | c:197 [ASN] | a:1820 [U] | ❌ 6AZ3_A:171 no longer at interface |
A:29 [LEU] | 2:2204 [U] | c:67 [PHE] | a:1817 [G] | ❌ 6AZ3_A:29 no longer at interface |
A:30 [ARG] | 2:2549 [U] | c:68 [LYS] | a:2205 [A] | ❌ 6AZ3_A:30 no longer at interface |
A:53 [GLY] | 2:2204 [U] | c:86 [ASN] | a:1817 [G] | ❌ 6AZ3_A:53 no longer at interface |
A:55 [GLY] | 2:2207 [C] | c:88 [SER] | a:1820 [U] | ❌ 6AZ3_A:55 no longer at interface |
A:55 [GLY] | 2:2205 [A] | c:88 [SER] | a:1818 [U] | ❌ 6AZ3_A:55 no longer at interface |
A:55 [GLY] | 2:2208 [G] | c:88 [SER] | a:1821 [A] | ❌ 6AZ3_A:55 no longer at interface |
Properties of this pair
Common ECOD label(s) |
Common RFAM label(s) |
Interface TM-score |
Interface RMSD |
Percentage identity |
Protein TM-score |
RNA TM-score |
Protein coverage |
RNA coverage |
Percentage conservation |
Apolar conservation |
H-bond conservation |
Percentage switching out |
---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
Nucleic acid-binding proteins & SH3 | 0.77 | 3.84 | 0.22 | 0.73 | 0.76 | 0.66 | 0.67 | 0.62 | 0.58 | 0.28 | 0.29 |
Other pairs involving 6AZ3_A_1,2 or 7K00_c_a
Total number of entries: 20