Interface analysis
Style
Protein
CartoonLicorice
Surface
RNA
CartoonLicorice
Surface
Color
StructureStructure (with hetatm)
Chain
Chainbow
View
Focus on
InterfaceRNA
Protein
All
Show chains
Interface
show interface as licoriceCommon contacts -
6AZ3_A
|
6AZ3_1,2
|
7RYG_C
|
7RYG_A
|
Conserved?
|
---|---|---|---|---|
A:204 [ARG] | 1:965 [A] | C:225 [MET] | A:780 [A] | ✔ |
A:10 [LYS] | 2:2200 [U] | C:43 [ARG] | A:1809 [G] | ✔ |
A:174 [ARG] | 2:2207 [C] | C:200 [ASN] | A:1816 [U] | ✔ |
A:174 [ARG] | 2:2208 [G] | C:200 [ASN] | A:1817 [A] | ✔ |
A:175 [ILE] | 2:2207 [C] | C:201 [ASN] | A:1816 [U] | ✔ |
A:223 [SER] | 2:2212 [A] | C:244 [PRO] | A:1821 [U] | ✔ |
A:223 [SER] | 2:2272 [A] | C:244 [PRO] | A:1897 [A] | ✔ |
A:223 [SER] | 2:2273 [C] | C:244 [PRO] | A:1898 [C] | ✔ |
A:214 [GLY] | 2:3188 [A] | C:235 [GLY] | A:2594 [A] | ✔ |
A:214 [GLY] | 2:3189 [G] | C:235 [GLY] | A:2595 [G] | ✔ |
A:186 [PHE] | 1:947 [A] | C:212 [ARG] | A:762 [A] | ✔ |
A:183 [GLY] | 1:911 [G] | C:209 [GLY] | A:727 [G] | ✔ |
A:183 [GLY] | 1:947 [A] | C:209 [GLY] | A:762 [A] | ✔ |
A:187 [TYR] | 1:947 [A] | C:213 [TRP] | A:762 [A] | ✔ |
A:17 [GLN] | 2:2200 [U] | C:51 [THR] | A:1809 [G] | ✔ |
A:17 [GLN] | 2:2201 [G] | C:51 [THR] | A:1810 [G] | ✔ |
A:173 [GLY] | 2:2207 [C] | C:199 [GLU] | A:1816 [U] | ✔ |
A:182 [ALA] | 1:911 [G] | C:208 [ALA] | A:727 [G] | ✔ |
A:182 [ALA] | 1:947 [A] | C:208 [ALA] | A:762 [A] | ✔ |
A:182 [ALA] | 2:2176 [U] | C:208 [ALA] | A:1786 [U] | ✔ |
A:182 [ALA] | 2:2177 [A] | C:208 [ALA] | A:1787 [A] | ✔ |
A:207 [VAL] | 1:967 [G] | C:228 [ILE] | A:782 [G] | ✔ |
A:207 [VAL] | 1:976 [A] | C:228 [ILE] | A:791 [A] | ✔ |
A:207 [VAL] | 2:2443 [U] | C:228 [ILE] | A:2069 [C] | ✔ |
A:16 [TYR] | 2:2200 [U] | C:50 [THR] | A:1809 [G] | ✔ |
A:152 [SER] | 2:2185 [G] | C:178 [SER] | A:1795 [G] | ✔ |
A:152 [SER] | 2:2206 [U] | C:178 [SER] | A:1815 [A] | ✔ |
A:150 [LEU] | 2:2185 [G] | C:176 [LEU] | A:1795 [G] | ✔ |
A:125 [THR] | 2:2185 [G] | C:153 [GLN] | A:1795 [G] | ✔ |
A:125 [THR] | 2:2205 [A] | C:153 [GLN] | A:1814 [U] | ✔ |
A:212 [GLY] | 2:3188 [A] | C:233 [GLY] | A:2594 [A] | ✔ |
A:154 [GLN] | 2:2185 [G] | C:180 [GLU] | A:1795 [G] | ✔ |
A:221 [HIS] | 2:2273 [C] | C:242 [ILE] | A:1898 [C] | ✔ |
A:131 [GLY] | 2:2207 [C] | C:159 [GLY] | A:1816 [U] | ✔ |
A:206 [PRO] | 2:2443 [U] | C:227 [PRO] | A:2069 [C] | ✔ |
A:206 [PRO] | 2:2444 [U] | C:227 [PRO] | A:2070 [U] | ✔ |
A:206 [PRO] | 2:3188 [A] | C:227 [PRO] | A:2594 [A] | ✔ |
A:206 [PRO] | 2:3189 [G] | C:227 [PRO] | A:2595 [G] | ✔ |
A:132 [ASP] | 2:2206 [U] | C:160 [ALA] | A:1815 [A] | ✔ |
A:180 [LEU] | 2:2177 [A] | C:206 [GLY] | A:1787 [A] | ✔ |
A:180 [LEU] | 2:2178 [G] | C:206 [GLY] | A:1788 [G] | ✔ |
A:129 [ALA] | 2:2205 [A] | C:157 [SER] | A:1814 [U] | ✔ |
A:129 [ALA] | 2:2206 [U] | C:157 [SER] | A:1815 [A] | ✔ |
A:129 [ALA] | 2:2207 [C] | C:157 [SER] | A:1816 [U] | ✔ |
A:129 [ALA] | 2:2208 [G] | C:157 [SER] | A:1817 [A] | ✔ |
A:236 [GLY] | 2:2211 [A] | C:252 [ALA] | A:1820 [G] | ✔ |
A:236 [GLY] | 2:2212 [A] | C:252 [ALA] | A:1821 [U] | ✔ |
A:216 [HIS] | 2:3181 [C] | C:237 [GLY] | A:2587 [C] | ✔ |
A:213 [GLY] | 2:3188 [A] | C:234 [GLY] | A:2594 [A] | ✔ |
A:213 [GLY] | 2:3189 [G] | C:234 [GLY] | A:2595 [G] | ✔ |
A:210 [PRO] | 2:2817 [G] | C:231 [PRO] | A:2235 [G] | ✔ |
A:237 [LEU] | 2:2181 [U] | C:253 [LYS] | A:1791 [C] | ✔ |
A:237 [LEU] | 2:2182 [U] | C:253 [LYS] | A:1792 [U] | ✔ |
A:237 [LEU] | 2:2211 [A] | C:253 [LYS] | A:1820 [G] | ✔ |
A:237 [LEU] | 2:2212 [A] | C:253 [LYS] | A:1821 [U] | ✔ |
A:237 [LEU] | 2:2230 [C] | C:253 [LYS] | A:1839 [C] | ✔ |
A:237 [LEU] | 2:2272 [A] | C:253 [LYS] | A:1897 [A] | ✔ |
A:21 [HIS] | 1:876 [U] | C:59 [LYS] | A:692 [U] | ✔ |
A:121 [GLY] | 2:2548 [A] | C:149 [GLY] | A:2200 [G] | ✔ |
A:201 [GLY] | 2:2212 [A] | C:222 [GLY] | A:1821 [U] | ✔ |
A:201 [GLY] | 2:2213 [C] | C:222 [GLY] | A:1822 [G] | ✔ |
A:119 [LYS] | 2:2187 [U] | C:147 [LYS] | A:1797 [A] | ✔ |
A:119 [LYS] | 2:2546 [G] | C:147 [LYS] | A:2198 [C] | ✔ |
A:222 [PRO] | 2:2228 [U] | C:243 [GLN] | A:1837 [U] | ✔ |
A:222 [PRO] | 2:2229 [G] | C:243 [GLN] | A:1838 [G] | ✔ |
A:222 [PRO] | 2:2272 [A] | C:243 [GLN] | A:1897 [A] | ✔ |
A:222 [PRO] | 2:2273 [C] | C:243 [GLN] | A:1898 [C] | ✔ |
A:130 [SER] | 2:2207 [C] | C:158 [ALA] | A:1816 [U] | ✔ |
A:209 [HIS] | 2:2212 [A] | C:230 [HIS] | A:1821 [U] | ✔ |
A:199 [VAL] | 1:964 [A] | C:220 [VAL] | A:779 [A] | ✔ |
A:199 [VAL] | 1:965 [A] | C:220 [VAL] | A:780 [A] | ✔ |
A:199 [VAL] | 2:2174 [C] | C:220 [VAL] | A:1784 [C] | ✔ |
A:199 [VAL] | 2:2175 [A] | C:220 [VAL] | A:1785 [A] | ✔ |
A:219 [ILE] | 2:2213 [C] | C:240 [LYS] | A:1822 [G] | ✔ |
A:219 [ILE] | 2:2273 [C] | C:240 [LYS] | A:1898 [C] | ✔ |
A:219 [ILE] | 2:2274 [G] | C:240 [LYS] | A:1899 [G] | ✔ |
A:179 [VAL] | 2:2177 [A] | C:205 [LEU] | A:1787 [A] | ✔ |
A:179 [VAL] | 2:2178 [G] | C:205 [LEU] | A:1788 [G] | ✔ |
A:211 [HIS] | 2:2212 [A] | C:232 [HIS] | A:1821 [U] | ✔ |
A:211 [HIS] | 2:2213 [C] | C:232 [HIS] | A:1822 [G] | ✔ |
A:185 [SER] | 2:2177 [A] | C:211 [ALA] | A:1787 [A] | ✔ |
A:128 [ARG] | 2:2204 [U] | C:156 [ARG] | A:1813 [G] | ✔ |
A:128 [ARG] | 2:2205 [A] | C:156 [ARG] | A:1814 [U] | ✔ |
A:128 [ARG] | 2:2206 [U] | C:156 [ARG] | A:1815 [A] | ✔ |
A:198 [LYS] | 2:2175 [A] | C:219 [THR] | A:1785 [A] | ✔ |
A:198 [LYS] | 2:2176 [U] | C:219 [THR] | A:1786 [U] | ✔ |
A:54 [ARG] | 2:2204 [U] | C:87 [ARG] | A:1813 [G] | ✔ |
A:54 [ARG] | 2:2205 [A] | C:87 [ARG] | A:1814 [U] | ✔ |
A:197 [PRO] | 1:947 [A] | C:218 [PRO] | A:762 [A] | ✔ |
A:197 [PRO] | 1:964 [A] | C:218 [PRO] | A:779 [A] | ✔ |
A:197 [PRO] | 2:2175 [A] | C:218 [PRO] | A:1785 [A] | ✔ |
A:197 [PRO] | 2:2176 [U] | C:218 [PRO] | A:1786 [U] | ✔ |
A:14 [SER] | 1:956 [U] | C:48 [HIS] | A:771 [U] | ✔ |
A:14 [SER] | 1:961 [G] | C:48 [HIS] | A:776 [G] | ✔ |
A:14 [SER] | 1:962 [C] | C:48 [HIS] | A:777 [U] | ✔ |
A:126 [LEU] | 2:2185 [G] | C:154 [LEU] | A:1795 [G] | ✔ |
A:126 [LEU] | 2:2205 [A] | C:154 [LEU] | A:1814 [U] | ✔ |
A:126 [LEU] | 2:2206 [U] | C:154 [LEU] | A:1815 [A] | ✔ |
A:232 [GLY] | 2:2191 [U] | C:248 [TRP] | A:1801 [A] | ✔ |
A:217 [GLN] | 2:2173 [A] | C:238 [ARG] | A:1783 [A] | ✔ |
A:217 [GLN] | 2:2342 [OMU] | C:238 [ARG] | A:1967 [U] | ✔ |
A:217 [GLN] | 2:3180 [OMC] | C:238 [ARG] | A:2586 [A] | ✔ |
A:217 [GLN] | 2:3181 [C] | C:238 [ARG] | A:2587 [C] | ✔ |
A:172 [GLY] | 2:2207 [C] | C:198 [GLN] | A:1816 [U] | ✔ |
A:19 [HIS] | 1:873 [G] | C:55 [GLY] | A:689 [C] | ✔ |
A:19 [HIS] | 1:874 [C] | C:55 [GLY] | A:690 [C] | ✔ |
A:181 [LYS] | 1:911 [G] | C:207 [LYS] | A:727 [G] | ✔ |
A:181 [LYS] | 1:947 [A] | C:207 [LYS] | A:762 [A] | ✔ |
A:181 [LYS] | 2:2176 [U] | C:207 [LYS] | A:1786 [U] | ✔ |
A:181 [LYS] | 2:2177 [A] | C:207 [LYS] | A:1787 [A] | ✔ |
A:218 [HIS] | 2:2274 [G] | C:239 [ASN] | A:1899 [G] | ✔ |
A:218 [HIS] | 2:2342 [OMU] | C:239 [ASN] | A:1967 [U] | ✔ |
A:218 [HIS] | 2:3185 [G] | C:239 [ASN] | A:2591 [G] | ✔ |
A:218 [HIS] | 2:3187 [G] | C:239 [ASN] | A:2593 [G] | ✔ |
A:203 [ALA] | 1:965 [A] | C:224 [ALA] | A:780 [A] | ✔ |
A:203 [ALA] | 1:966 [A] | C:224 [ALA] | A:781 [A] | ✔ |
A:203 [ALA] | 2:2174 [C] | C:224 [ALA] | A:1784 [C] | ✔ |
A:203 [ALA] | 2:2175 [A] | C:224 [ALA] | A:1785 [A] | ✔ |
A:234 [LYS] | 2:2190 [A] | C:250 [GLN] | A:1800 [C] | ✔ |
A:234 [LYS] | 2:2211 [A] | C:250 [GLN] | A:1820 [G] | ✔ |
A:208 [GLU] | 1:963 [G] | C:229 [ASP] | A:778 [G] | ✔ |
A:208 [GLU] | 1:965 [A] | C:229 [ASP] | A:780 [A] | ✔ |
A:24 [LEU] | 2:2203 [A] | C:62 [TYR] | A:1812 [C] | ✔ |
A:254 [GLY] | 2:2184 [U] | C:273 [VAL] | A:1794 [U] | ✔ |
A:215 [ASN] | 2:3189 [G] | C:236 [GLU] | A:2595 [G] | ✔ |
A:215 [ASN] | 2:3190 [A] | C:236 [GLU] | A:2596 [A] | ✔ |
A:240 [ALA] | 2:2183 [G] | C:256 [LYS] | A:1793 [C] | ✔ |
A:240 [ALA] | 2:2230 [C] | C:256 [LYS] | A:1839 [C] | ✔ |
A:240 [ALA] | 2:2231 [U] | C:256 [LYS] | A:1840 [U] | ✔ |
A:241 [ARG] | 2:2183 [G] | C:257 [THR] | A:1793 [C] | ✔ |
A:241 [ARG] | 2:2184 [U] | C:257 [THR] | A:1794 [U] | ✔ |
A:238 [ILE] | 2:2182 [U] | C:254 [GLY] | A:1792 [U] | ✔ |
A:238 [ILE] | 2:2183 [G] | C:254 [GLY] | A:1793 [C] | ✔ |
A:205 [ASN] | 1:966 [A] | C:226 [ASN] | A:781 [A] | ✔ |
A:205 [ASN] | 1:967 [G] | C:226 [ASN] | A:782 [G] | ✔ |
A:120 [PRO] | 2:2798 [C] | C:148 [ILE] | A:2217 [G] | ✔ |
A:127 [ALA] | 2:2185 [G] | C:155 [ALA] | A:1795 [G] | ✔ |
A:127 [ALA] | 2:2205 [A] | C:155 [ALA] | A:1814 [U] | ✔ |
A:127 [ALA] | 2:2206 [U] | C:155 [ALA] | A:1815 [A] | ✔ |
A:200 [ARG] | 2:2174 [C] | C:221 [ARG] | A:1784 [C] | ✔ |
A:200 [ARG] | 2:2175 [A] | C:221 [ARG] | A:1785 [A] | ✔ |
A:200 [ARG] | 2:2213 [C] | C:221 [ARG] | A:1822 [G] | ✔ |
A:200 [ARG] | 2:2214 [U] | C:221 [ARG] | A:1823 [U] | ✔ |
A:200 [ARG] | 2:2215 [G] | C:221 [ARG] | A:1824 [G] | ✔ |
A:156 [LYS] | 2:2185 [G] | C:182 [ARG] | A:1795 [G] | ✔ |
A:156 [LYS] | 2:2186 [A] | C:182 [ARG] | A:1796 [C] | ✔ |
A:11 [GLY] | 2:2192 [C] | C:44 [ASN] | A:1802 [C] | ✔ |
A:11 [GLY] | 2:2199 [G] | C:44 [ASN] | A:1808 [U] | ✔ |
A:11 [GLY] | 2:2200 [U] | C:44 [ASN] | A:1809 [G] | ✔ |
A:220 [GLY] | 2:2273 [C] | C:241 [GLY] | A:1898 [C] | ✔ |
A:220 [GLY] | 2:2274 [G] | C:241 [GLY] | A:1899 [G] | ✔ |
A:220 [GLY] | 2:3186 [U] | C:241 [GLY] | A:2592 [U] | ✔ |
A:220 [GLY] | 2:3187 [G] | C:241 [GLY] | A:2593 [G] | ✔ |
A:239 [ALA] | 2:2182 [U] | C:255 [TYR] | A:1792 [U] | ✔ |
A:239 [ALA] | 2:2183 [G] | C:255 [TYR] | A:1793 [C] | ✔ |
A:239 [ALA] | 2:2230 [C] | C:255 [TYR] | A:1839 [C] | ✔ |
A:239 [ALA] | 2:2231 [U] | C:255 [TYR] | A:1840 [U] | ✔ |
A:122 [ASP] | 2:2547 [A] | C:150 [LYS] | A:2199 [U] | ✔ |
A:122 [ASP] | 2:2548 [A] | C:150 [LYS] | A:2200 [G] | ✔ |
A:12 [ASN] | 2:2192 [C] | C:46 [ASN] | A:1802 [C] | ✔ |
A:12 [ASN] | 2:2193 [C] | C:46 [ASN] | A:1803 [G] | ✔ |
A:202 [VAL] | 2:2213 [C] | C:223 [MET] | A:1822 [G] | ✔ |
A:202 [VAL] | 2:2214 [U] | C:223 [MET] | A:1823 [U] | ✔ |
A:178 [PRO] | 2:2177 [A] | C:204 [SER] | A:1787 [A] | ✔ |
A:178 [PRO] | 2:2178 [G] | C:204 [SER] | A:1788 [G] | ✔ |
A:151 [PRO] | 2:2185 [G] | C:177 [ARG] | A:1795 [G] | ✔ |
A:151 [PRO] | 2:2206 [U] | C:177 [ARG] | A:1815 [A] | ✔ |
A:151 [PRO] | 2:2207 [C] | C:177 [ARG] | A:1816 [U] | ✔ |
A:177 [LYS] | 2:2178 [G] | C:203 [ARG] | A:1788 [G] | ✔ |
A:15 [VAL] | 1:872 [U] | C:49 [ILE] | A:688 [U] | ✔ |
A:15 [VAL] | 1:962 [C] | C:49 [ILE] | A:777 [U] | ✔ |
A:15 [VAL] | 1:963 [G] | C:49 [ILE] | A:778 [G] | ✔ |
A:204 [ARG] | 2:2212 [A] | C:225 [MET] | A:1821 [U] | ❌ 7RYG_C_A |
A:10 [LYS] | 2:2191 [U] | C:43 [ARG] | A:1801 [A] | ❌ 7RYG_C_A |
A:10 [LYS] | 2:2201 [G] | C:43 [ARG] | A:1810 [G] | ❌ 7RYG_C_A |
A:10 [LYS] | 2:2211 [A] | C:43 [ARG] | A:1820 [G] | ❌ 7RYG_C_A |
A:175 [ILE] | 2:2208 [G] | C:201 [ASN] | A:1817 [A] | ❌ 7RYG_C_A |
A:225 [VAL] | 2:2230 [C] | C:246 [SER] | A:1839 [C] | ❌ 7RYG_C_A |
A:225 [VAL] | 2:2231 [U] | C:246 [SER] | A:1840 [U] | ❌ 7RYG_C_A |
A:23 [ARG] | 2:2203 [A] | C:61 [HIS] | A:1812 [C] | ❌ 7RYG_C_A |
A:23 [ARG] | 2:2204 [U] | C:61 [HIS] | A:1813 [G] | ❌ 7RYG_C_A |
A:22 [LYS] | 1:875 [C] | C:60 [GLN] | A:691 [A] | ❌ 7RYG_C_A |
A:22 [LYS] | 1:876 [U] | C:60 [GLN] | A:692 [U] | ❌ 7RYG_C_A |
A:196 [TRP] | 1:947 [A] | C:217 [ARG] | A:762 [A] | ❌ 7RYG_C_A |
A:196 [TRP] | 2:2176 [U] | C:217 [ARG] | A:1786 [U] | ❌ 7RYG_C_A |
A:196 [TRP] | 2:2177 [A] | C:217 [ARG] | A:1787 [A] | ❌ 7RYG_C_A |
A:13 [GLY] | 2:2200 [U] | C:47 [GLY] | A:1809 [G] | ❌ 7RYG_C_A |
A:16 [TYR] | 1:962 [C] | C:50 [THR] | A:777 [U] | ❌ 7RYG_C_A |
A:16 [TYR] | 1:963 [G] | C:50 [THR] | A:778 [G] | ❌ 7RYG_C_A |
A:16 [TYR] | 2:2201 [G] | C:50 [THR] | A:1810 [G] | ❌ 7RYG_C_A |
A:51 [GLU] | 2:2203 [A] | C:85 [PRO] | A:1812 [C] | ❌ 7RYG_C_A |
A:51 [GLU] | 2:2204 [U] | C:85 [PRO] | A:1813 [G] | ❌ 7RYG_C_A |
A:221 [HIS] | 2:3186 [U] | C:242 [ILE] | A:2592 [U] | ❌ 7RYG_C_A |
A:221 [HIS] | 2:3187 [G] | C:242 [ILE] | A:2593 [G] | ❌ 7RYG_C_A |
A:132 [ASP] | 2:2207 [C] | C:160 [ALA] | A:1816 [U] | ❌ 7RYG_C_A |
A:180 [LEU] | 1:911 [G] | C:206 [GLY] | A:727 [G] | ❌ 7RYG_C_A |
A:216 [HIS] | 2:3189 [G] | C:237 [GLY] | A:2595 [G] | ❌ 7RYG_C_A |
A:216 [HIS] | 2:3190 [A] | C:237 [GLY] | A:2596 [A] | ❌ 7RYG_C_A |
A:231 [PRO] | 2:2191 [U] | C:247 [PRO] | A:1801 [A] | ❌ 7RYG_C_A |
A:231 [PRO] | 2:2192 [C] | C:247 [PRO] | A:1802 [C] | ❌ 7RYG_C_A |
A:231 [PRO] | 2:2817 [G] | C:247 [PRO] | A:2235 [G] | ❌ 7RYG_C_A |
A:224 [THR] | 2:2229 [G] | C:245 [VAL] | A:1838 [G] | ❌ 7RYG_C_A |
A:224 [THR] | 2:2230 [C] | C:245 [VAL] | A:1839 [C] | ❌ 7RYG_C_A |
A:224 [THR] | 2:2272 [A] | C:245 [VAL] | A:1897 [A] | ❌ 7RYG_C_A |
A:188 [ARG] | 2:2208 [G] | C:214 [ARG] | A:1817 [A] | ❌ 7RYG_C_A |
A:21 [HIS] | 1:874 [C] | C:59 [LYS] | A:690 [C] | ❌ 7RYG_C_A |
A:21 [HIS] | 1:875 [C] | C:59 [LYS] | A:691 [A] | ❌ 7RYG_C_A |
A:21 [HIS] | 1:1642 [G] | C:59 [LYS] | A:1348 [A] | ❌ 7RYG_C_A |
A:21 [HIS] | 1:1643 [A] | C:59 [LYS] | A:1349 [A] | ❌ 7RYG_C_A |
A:21 [HIS] | 2:2203 [A] | C:59 [LYS] | A:1812 [C] | ❌ 7RYG_C_A |
A:121 [GLY] | 2:2547 [A] | C:149 [GLY] | A:2199 [U] | ❌ 7RYG_C_A |
A:119 [LYS] | 2:2186 [A] | C:147 [LYS] | A:1796 [C] | ❌ 7RYG_C_A |
A:119 [LYS] | 2:2547 [A] | C:147 [LYS] | A:2199 [U] | ❌ 7RYG_C_A |
A:25 [GLY] | 2:2203 [A] | C:63 [ARG] | A:1812 [C] | ❌ 7RYG_C_A |
A:25 [GLY] | 2:2204 [U] | C:63 [ARG] | A:1813 [G] | ❌ 7RYG_C_A |
A:209 [HIS] | 2:2211 [A] | C:230 [HIS] | A:1820 [G] | ❌ 7RYG_C_A |
A:209 [HIS] | 2:2213 [C] | C:230 [HIS] | A:1822 [G] | ❌ 7RYG_C_A |
A:199 [VAL] | 2:2213 [C] | C:220 [VAL] | A:1822 [G] | ❌ 7RYG_C_A |
A:219 [ILE] | 2:2212 [A] | C:240 [LYS] | A:1821 [U] | ❌ 7RYG_C_A |
A:18 [VAL] | 2:2200 [U] | C:54 [VAL] | A:1809 [G] | ❌ 7RYG_C_A |
A:18 [VAL] | 2:2201 [G] | C:54 [VAL] | A:1810 [G] | ❌ 7RYG_C_A |
A:18 [VAL] | 2:2203 [A] | C:54 [VAL] | A:1812 [C] | ❌ 7RYG_C_A |
A:185 [SER] | 2:2176 [U] | C:211 [ALA] | A:1786 [U] | ❌ 7RYG_C_A |
A:198 [LYS] | 2:2211 [A] | C:219 [THR] | A:1820 [G] | ❌ 7RYG_C_A |
A:198 [LYS] | 2:2215 [G] | C:219 [THR] | A:1824 [G] | ❌ 7RYG_C_A |
A:54 [ARG] | 2:2203 [A] | C:87 [ARG] | A:1812 [C] | ❌ 7RYG_C_A |
A:14 [SER] | 1:955 [A2M] | C:48 [HIS] | A:770 [A] | ❌ 7RYG_C_A |
A:232 [GLY] | 2:2817 [G] | C:248 [TRP] | A:2235 [G] | ❌ 7RYG_C_A |
A:217 [GLN] | 2:2174 [C] | C:238 [ARG] | A:1784 [C] | ❌ 7RYG_C_A |
A:217 [GLN] | 2:2214 [U] | C:238 [ARG] | A:1823 [U] | ❌ 7RYG_C_A |
A:9 [ARG] | 1:961 [G] | C:42 [GLY] | A:776 [G] | ❌ 7RYG_C_A |
A:9 [ARG] | 1:962 [C] | C:42 [GLY] | A:777 [U] | ❌ 7RYG_C_A |
A:9 [ARG] | 1:963 [G] | C:42 [GLY] | A:778 [G] | ❌ 7RYG_C_A |
A:181 [LYS] | 1:910 [G] | C:207 [LYS] | A:726 [G] | ❌ 7RYG_C_A |
A:218 [HIS] | 2:3188 [A] | C:239 [ASN] | A:2594 [A] | ❌ 7RYG_C_A |
A:234 [LYS] | 2:2191 [U] | C:250 [GLN] | A:1801 [A] | ❌ 7RYG_C_A |
A:208 [GLU] | 1:962 [C] | C:229 [ASP] | A:777 [U] | ❌ 7RYG_C_A |
A:254 [GLY] | 2:2185 [G] | C:273 [VAL] | A:1795 [G] | ❌ 7RYG_C_A |
A:235 [VAL] | 2:2211 [A] | C:251 [LYS] | A:1820 [G] | ❌ 7RYG_C_A |
A:235 [VAL] | 2:2212 [A] | C:251 [LYS] | A:1821 [U] | ❌ 7RYG_C_A |
A:215 [ASN] | 2:3180 [OMC] | C:236 [GLU] | A:2586 [A] | ❌ 7RYG_C_A |
A:215 [ASN] | 2:3181 [C] | C:236 [GLU] | A:2587 [C] | ❌ 7RYG_C_A |
A:240 [ALA] | 2:2182 [U] | C:256 [LYS] | A:1792 [U] | ❌ 7RYG_C_A |
A:241 [ARG] | 2:2182 [U] | C:257 [THR] | A:1792 [U] | ❌ 7RYG_C_A |
A:241 [ARG] | 2:2230 [C] | C:257 [THR] | A:1839 [C] | ❌ 7RYG_C_A |
A:241 [ARG] | 2:2231 [U] | C:257 [THR] | A:1840 [U] | ❌ 7RYG_C_A |
A:241 [ARG] | 2:2232 [C] | C:257 [THR] | A:1841 [G] | ❌ 7RYG_C_A |
A:238 [ILE] | 2:2190 [A] | C:254 [GLY] | A:1800 [C] | ❌ 7RYG_C_A |
A:238 [ILE] | 2:2211 [A] | C:254 [GLY] | A:1820 [G] | ❌ 7RYG_C_A |
A:200 [ARG] | 2:2173 [A] | C:221 [ARG] | A:1783 [A] | ❌ 7RYG_C_A |
A:11 [GLY] | 2:2191 [U] | C:44 [ASN] | A:1801 [A] | ❌ 7RYG_C_A |
A:12 [ASN] | 1:961 [G] | C:46 [ASN] | A:776 [G] | ❌ 7RYG_C_A |
A:12 [ASN] | 2:2191 [U] | C:46 [ASN] | A:1801 [A] | ❌ 7RYG_C_A |
A:12 [ASN] | 2:2199 [G] | C:46 [ASN] | A:1808 [U] | ❌ 7RYG_C_A |
A:12 [ASN] | 2:2200 [U] | C:46 [ASN] | A:1809 [G] | ❌ 7RYG_C_A |
A:15 [VAL] | 1:873 [G] | C:49 [ILE] | A:689 [C] | ❌ 7RYG_C_A |
A:15 [VAL] | 1:955 [A2M] | C:49 [ILE] | A:770 [A] | ❌ 7RYG_C_A |
A:15 [VAL] | 1:956 [U] | C:49 [ILE] | A:771 [U] | ❌ 7RYG_C_A |
A:119 [LYS] | 2:2548 [A] | C:147 [LYS] | A:2200 [G] | ❌ 6AZ3_A_1,2 |
A:120 [PRO] | 2:2548 [A] | C:148 [ILE] | A:2200 [G] | ❌ 6AZ3_A_1,2 |
A:120 [PRO] | 2:2549 [U] | C:148 [ILE] | A:2201 [U] | ❌ 6AZ3_A_1,2 |
A:121 [GLY] | 2:2549 [U] | C:149 [GLY] | A:2201 [U] | ❌ 6AZ3_A_1,2 |
A:122 [ASP] | 2:2187 [U] | C:150 [LYS] | A:1797 [A] | ❌ 6AZ3_A_1,2 |
A:122 [ASP] | 2:2186 [A] | C:150 [LYS] | A:1796 [C] | ❌ 6AZ3_A_1,2 |
A:125 [THR] | 2:2187 [U] | C:153 [GLN] | A:1797 [A] | ❌ 6AZ3_A_1,2 |
A:125 [THR] | 2:2186 [A] | C:153 [GLN] | A:1796 [C] | ❌ 6AZ3_A_1,2 |
A:186 [PHE] | 1:873 [G] | C:212 [ARG] | A:689 [C] | ❌ 6AZ3_A_1,2 |
A:186 [PHE] | 1:964 [A] | C:212 [ARG] | A:779 [A] | ❌ 6AZ3_A_1,2 |
A:196 [TRP] | 1:873 [G] | C:217 [ARG] | A:689 [C] | ❌ 6AZ3_A_1,2 |
A:196 [TRP] | 1:872 [U] | C:217 [ARG] | A:688 [U] | ❌ 6AZ3_A_1,2 |
A:196 [TRP] | 1:963 [G] | C:217 [ARG] | A:778 [G] | ❌ 6AZ3_A_1,2 |
A:196 [TRP] | 1:964 [A] | C:217 [ARG] | A:779 [A] | ❌ 6AZ3_A_1,2 |
A:198 [LYS] | 2:2212 [A] | C:219 [THR] | A:1821 [U] | ❌ 6AZ3_A_1,2 |
A:199 [VAL] | 2:2212 [A] | C:220 [VAL] | A:1821 [U] | ❌ 6AZ3_A_1,2 |
A:202 [VAL] | 2:2342 [OMU] | C:223 [MET] | A:1967 [U] | ❌ 6AZ3_A_1,2 |
A:215 [ASN] | 2:3188 [A] | C:236 [GLU] | A:2594 [A] | ❌ 6AZ3_A_1,2 |
A:216 [HIS] | 2:3180 [OMC] | C:237 [GLY] | A:2586 [A] | ❌ 6AZ3_A_1,2 |
A:219 [ILE] | 2:2342 [OMU] | C:240 [LYS] | A:1967 [U] | ❌ 6AZ3_A_1,2 |
A:224 [THR] | 2:2212 [A] | C:245 [VAL] | A:1821 [U] | ❌ 6AZ3_A_1,2 |
A:224 [THR] | 2:2211 [A] | C:245 [VAL] | A:1820 [G] | ❌ 6AZ3_A_1,2 |
A:225 [VAL] | 2:2212 [A] | C:246 [SER] | A:1821 [U] | ❌ 6AZ3_A_1,2 |
A:225 [VAL] | 2:2211 [A] | C:246 [SER] | A:1820 [G] | ❌ 6AZ3_A_1,2 |
A:231 [PRO] | 2:2212 [A] | C:247 [PRO] | A:1821 [U] | ❌ 6AZ3_A_1,2 |
A:231 [PRO] | 2:2211 [A] | C:247 [PRO] | A:1820 [G] | ❌ 6AZ3_A_1,2 |
A:232 [GLY] | 2:2190 [A] | C:248 [TRP] | A:1800 [C] | ❌ 6AZ3_A_1,2 |
A:232 [GLY] | 2:2192 [C] | C:248 [TRP] | A:1802 [C] | ❌ 6AZ3_A_1,2 |
A:232 [GLY] | 2:2211 [A] | C:248 [TRP] | A:1820 [G] | ❌ 6AZ3_A_1,2 |
A:235 [VAL] | 2:2229 [G] | C:251 [LYS] | A:1838 [G] | ❌ 6AZ3_A_1,2 |
A:235 [VAL] | 2:2230 [C] | C:251 [LYS] | A:1839 [C] | ❌ 6AZ3_A_1,2 |
A:236 [GLY] | 2:2182 [U] | C:252 [ALA] | A:1792 [U] | ❌ 6AZ3_A_1,2 |
A:236 [GLY] | 2:2210 [A] | C:252 [ALA] | A:1819 [G] | ❌ 6AZ3_A_1,2 |
A:237 [LEU] | 2:2271 [A] | C:253 [LYS] | A:1896 [A] | ❌ 6AZ3_A_1,2 |
A:238 [ILE] | 2:2230 [C] | C:254 [GLY] | A:1839 [C] | ❌ 6AZ3_A_1,2 |
A:238 [ILE] | 2:2231 [U] | C:254 [GLY] | A:1840 [U] | ❌ 6AZ3_A_1,2 |
A:240 [ALA] | 2:2184 [U] | C:256 [LYS] | A:1794 [U] | ❌ 6AZ3_A_1,2 |
A:240 [ALA] | 2:2232 [C] | C:256 [LYS] | A:1841 [G] | ❌ 6AZ3_A_1,2 |
A:241 [ARG] | 2:2190 [A] | C:257 [THR] | A:1800 [C] | ❌ 6AZ3_A_1,2 |
A:241 [ARG] | 2:2189 [C] | C:257 [THR] | A:1799 [A] | ❌ 6AZ3_A_1,2 |
A:254 [GLY] | 2:2182 [U] | C:273 [VAL] | A:1792 [U] | ❌ 6AZ3_A_1,2 |
A:254 [GLY] | 2:2183 [G] | C:273 [VAL] | A:1793 [C] | ❌ 6AZ3_A_1,2 |
A:9 [ARG] | 2:2200 [U] | C:42 [GLY] | A:1809 [G] | ❌ 6AZ3_A_1,2 |
A:10 [LYS] | 1:963 [G] | C:43 [ARG] | A:778 [G] | ❌ 6AZ3_A_1,2 |
A:10 [LYS] | 1:962 [C] | C:43 [ARG] | A:777 [U] | ❌ 6AZ3_A_1,2 |
A:10 [LYS] | 1:873 [G] | C:43 [ARG] | A:689 [C] | ❌ 6AZ3_A_1,2 |
A:10 [LYS] | 1:872 [U] | C:43 [ARG] | A:688 [U] | ❌ 6AZ3_A_1,2 |
A:12 [ASN] | 1:955 [A2M] | C:46 [ASN] | A:770 [A] | ❌ 6AZ3_A_1,2 |
A:12 [ASN] | 1:956 [U] | C:46 [ASN] | A:771 [U] | ❌ 6AZ3_A_1,2 |
A:13 [GLY] | 1:962 [C] | C:47 [GLY] | A:777 [U] | ❌ 6AZ3_A_1,2 |
A:13 [GLY] | 1:955 [A2M] | C:47 [GLY] | A:770 [A] | ❌ 6AZ3_A_1,2 |
A:13 [GLY] | 1:956 [U] | C:47 [GLY] | A:771 [U] | ❌ 6AZ3_A_1,2 |
A:14 [SER] | 2:2192 [C] | C:48 [HIS] | A:1802 [C] | ❌ 6AZ3_A_1,2 |
A:14 [SER] | 2:2193 [C] | C:48 [HIS] | A:1803 [G] | ❌ 6AZ3_A_1,2 |
A:15 [VAL] | 2:2191 [U] | C:49 [ILE] | A:1801 [A] | ❌ 6AZ3_A_1,2 |
A:16 [TYR] | 2:2191 [U] | C:50 [THR] | A:1801 [A] | ❌ 6AZ3_A_1,2 |
A:16 [TYR] | 2:2190 [A] | C:50 [THR] | A:1800 [C] | ❌ 6AZ3_A_1,2 |
A:16 [TYR] | 2:2192 [C] | C:50 [THR] | A:1802 [C] | ❌ 6AZ3_A_1,2 |
A:17 [GLN] | 2:2210 [A] | C:51 [THR] | A:1819 [G] | ❌ 6AZ3_A_1,2 |
A:18 [VAL] | 1:873 [G] | C:54 [VAL] | A:689 [C] | ❌ 6AZ3_A_1,2 |
A:18 [VAL] | 2:2210 [A] | C:54 [VAL] | A:1819 [G] | ❌ 6AZ3_A_1,2 |
A:24 [LEU] | 2:2204 [U] | C:62 [TYR] | A:1813 [G] | ❌ 6AZ3_A_1,2 |
A:186 [PHE] | 1:948 [U] | C:212 [ARG] | A:763 [C] | ❌ 7RYG_A:763 no longer at interface |
A:23 [ARG] | 2:2202 [U] | C:61 [HIS] | A:1811 [A] | ❌ 7RYG_A:1811 no longer at interface |
A:187 [TYR] | 1:946 [G] | C:213 [TRP] | A:761 [G] | ❌ 7RYG_A:761 no longer at interface |
A:187 [TYR] | 1:948 [U] | C:213 [TRP] | A:763 [C] | ❌ 7RYG_A:763 no longer at interface |
A:17 [GLN] | 1:1644 [G] | C:51 [THR] | A:1350 [G] | ❌ 7RYG_A:1350 no longer at interface |
A:182 [ALA] | 2:2161 [U] | C:208 [ALA] | A:1771 [U] | ❌ 7RYG_A:1771 no longer at interface |
A:207 [VAL] | 2:2442 [G] | C:228 [ILE] | A:2068 [C] | ❌ 7RYG_A:2068 no longer at interface |
A:221 [HIS] | 2:2445 [U] | C:242 [ILE] | A:2071 [U] | ❌ 7RYG_A:2071 no longer at interface |
A:65 [HIS] | 2:2550 [G] | C:98 [ASP] | A:2202 [C] | ❌ 7RYG_C:98, 7RYG_A:2202 no longer at interface |
A:216 [HIS] | 2:3182 [G] | C:237 [GLY] | A:2588 [G] | ❌ 7RYG_A:2588 no longer at interface |
A:216 [HIS] | 2:3183 [U] | C:237 [GLY] | A:2589 [U] | ❌ 7RYG_A:2589 no longer at interface |
A:216 [HIS] | 2:3184 [C] | C:237 [GLY] | A:2590 [C] | ❌ 7RYG_A:2590 no longer at interface |
A:231 [PRO] | 2:2453 [G] | C:247 [PRO] | A:2079 [G] | ❌ 7RYG_A:2079 no longer at interface |
A:70 [ARG] | 2:2550 [G] | C:99 [GLY] | A:2202 [C] | ❌ 7RYG_C:99, 7RYG_A:2202 no longer at interface |
A:31 [ILE] | 2:2550 [G] | C:69 [ARG] | A:2202 [C] | ❌ 7RYG_C:69, 7RYG_A:2202 no longer at interface |
A:18 [VAL] | 2:2202 [U] | C:54 [VAL] | A:1811 [A] | ❌ 7RYG_A:1811 no longer at interface |
A:217 [GLN] | 2:3179 [A] | C:238 [ARG] | A:2585 [A] | ❌ 7RYG_A:2585 no longer at interface |
A:233 [GLN] | 2:2815 [G] | C:249 [GLY] | A:2233 [G] | ❌ 7RYG_C:249, 7RYG_A:2233 no longer at interface |
A:233 [GLN] | 2:2816 [G] | C:249 [GLY] | A:2234 [G] | ❌ 7RYG_C:249, 7RYG_A:2234 no longer at interface |
A:208 [GLU] | 1:968 [A] | C:229 [ASP] | A:783 [G] | ❌ 7RYG_A:783 no longer at interface |
A:215 [ASN] | 2:3191 [C] | C:236 [GLU] | A:2597 [C] | ❌ 7RYG_A:2597 no longer at interface |
A:240 [ALA] | 2:2268 [G] | C:256 [LYS] | A:1893 [G] | ❌ 7RYG_A:1893 no longer at interface |
A:241 [ARG] | 2:2268 [G] | C:257 [THR] | A:1893 [G] | ❌ 7RYG_A:1893 no longer at interface |
A:241 [ARG] | 2:2269 [U] | C:257 [THR] | A:1894 [U] | ❌ 7RYG_A:1894 no longer at interface |
A:145 [ARG] | 2:2799 [G] | C:171 [TYR] | A:2218 [A] | ❌ 6AZ3_A:145, 6AZ3_2:2799 no longer at interface |
A:145 [ARG] | 2:2800 [A] | C:171 [TYR] | A:2219 [G] | ❌ 6AZ3_A:145, 6AZ3_2:2800 no longer at interface |
A:159 [PRO] | 2:2799 [G] | C:185 [HIS] | A:2218 [A] | ❌ 6AZ3_A:159, 6AZ3_2:2799 no longer at interface |
A:159 [PRO] | 2:2800 [A] | C:185 [HIS] | A:2219 [G] | ❌ 6AZ3_A:159, 6AZ3_2:2800 no longer at interface |
A:217 [GLN] | 2:2343 [G] | C:238 [ARG] | A:1968 [G] | ❌ 6AZ3_2:2343 no longer at interface |
A:11 [GLY] | 2:2198 [G] | C:44 [ASN] | A:1807 [G] | ❌ 6AZ3_2:2198 no longer at interface |
A:12 [ASN] | 2:2198 [G] | C:46 [ASN] | A:1807 [G] | ❌ 6AZ3_2:2198 no longer at interface |
A:12 [ASN] | 1:957 [C] | C:46 [ASN] | A:772 [A] | ❌ 6AZ3_1:957 no longer at interface |
A:14 [SER] | 1:957 [C] | C:48 [HIS] | A:772 [A] | ❌ 6AZ3_1:957 no longer at interface |
A:123 [ARG] | 2:2548 [A] | C:151 [GLY] | A:2200 [G] | ❌ 7RYG_C:151 no longer at interface |
A:123 [ARG] | 2:2549 [U] | C:151 [GLY] | A:2201 [U] | ❌ 7RYG_C:151 no longer at interface |
A:184 [ASN] | 1:947 [A] | C:210 [ALA] | A:762 [A] | ❌ 7RYG_C:210 no longer at interface |
A:28 [LYS] | 2:2548 [A] | C:66 [ASP] | A:2200 [G] | ❌ 7RYG_C:66 no longer at interface |
A:28 [LYS] | 2:2549 [U] | C:66 [ASP] | A:2201 [U] | ❌ 7RYG_C:66 no longer at interface |
A:253 [LYS] | 2:2182 [U] | C:272 [ARG] | A:1792 [U] | ❌ 7RYG_C:272 no longer at interface |
A:253 [LYS] | 2:2183 [G] | C:272 [ARG] | A:1793 [C] | ❌ 7RYG_C:272 no longer at interface |
A:253 [LYS] | 2:2184 [U] | C:272 [ARG] | A:1794 [U] | ❌ 7RYG_C:272 no longer at interface |
A:253 [LYS] | 2:2185 [G] | C:272 [ARG] | A:1795 [G] | ❌ 7RYG_C:272 no longer at interface |
A:253 [LYS] | 2:2206 [U] | C:272 [ARG] | A:1815 [A] | ❌ 7RYG_C:272 no longer at interface |
A:20 [GLY] | 2:2203 [A] | C:57 [GLY] | A:1812 [C] | ❌ 7RYG_C:57 no longer at interface |
A:190 [ARG] | 1:874 [C] | C:216 [VAL] | A:690 [C] | ❌ 7RYG_C:216 no longer at interface |
A:27 [ALA] | 2:2203 [A] | C:65 [VAL] | A:1812 [C] | ❌ 7RYG_C:65 no longer at interface |
A:27 [ALA] | 2:2204 [U] | C:65 [VAL] | A:1813 [G] | ❌ 7RYG_C:65 no longer at interface |
A:31 [ILE] | 2:2548 [A] | C:69 [ARG] | A:2200 [G] | ❌ 7RYG_C:69 no longer at interface |
A:31 [ILE] | 2:2549 [U] | C:69 [ARG] | A:2201 [U] | ❌ 7RYG_C:69 no longer at interface |
A:155 [LYS] | 2:2185 [G] | C:181 [MET] | A:1795 [G] | ❌ 7RYG_C:181 no longer at interface |
A:233 [GLN] | 2:2817 [G] | C:249 [GLY] | A:2235 [G] | ❌ 7RYG_C:249 no longer at interface |
A:26 [PRO] | 2:2203 [A] | C:64 [ILE] | A:1812 [C] | ❌ 7RYG_C:64 no longer at interface |
A:26 [PRO] | 2:2204 [U] | C:64 [ILE] | A:1813 [G] | ❌ 7RYG_C:64 no longer at interface |
A:118 [ALA] | 2:2187 [U] | C:146 [LEU] | A:1797 [A] | ❌ 6AZ3_A:118 no longer at interface |
A:118 [ALA] | 2:2186 [A] | C:146 [LEU] | A:1796 [C] | ❌ 6AZ3_A:118 no longer at interface |
A:171 [GLY] | 2:2207 [C] | C:197 [ASN] | A:1816 [U] | ❌ 6AZ3_A:171 no longer at interface |
A:252 [VAL] | 2:2184 [U] | C:271 [ARG] | A:1794 [U] | ❌ 6AZ3_A:252 no longer at interface |
A:252 [VAL] | 2:2185 [G] | C:271 [ARG] | A:1795 [G] | ❌ 6AZ3_A:252 no longer at interface |
A:252 [VAL] | 2:2206 [U] | C:271 [ARG] | A:1815 [A] | ❌ 6AZ3_A:252 no longer at interface |
A:252 [VAL] | 2:2183 [G] | C:271 [ARG] | A:1793 [C] | ❌ 6AZ3_A:252 no longer at interface |
A:29 [LEU] | 2:2204 [U] | C:67 [PHE] | A:1813 [G] | ❌ 6AZ3_A:29 no longer at interface |
A:29 [LEU] | 2:2205 [A] | C:67 [PHE] | A:1814 [U] | ❌ 6AZ3_A:29 no longer at interface |
A:30 [ARG] | 2:2549 [U] | C:68 [LYS] | A:2201 [U] | ❌ 6AZ3_A:30 no longer at interface |
A:52 [ALA] | 2:2204 [U] | C:86 [ASN] | A:1813 [G] | ❌ 6AZ3_A:52 no longer at interface |
A:55 [GLY] | 2:2208 [G] | C:88 [THR] | A:1817 [A] | ❌ 6AZ3_A:55 no longer at interface |
A:55 [GLY] | 2:2207 [C] | C:88 [THR] | A:1816 [U] | ❌ 6AZ3_A:55 no longer at interface |
A:55 [GLY] | 2:2205 [A] | C:88 [THR] | A:1814 [U] | ❌ 6AZ3_A:55 no longer at interface |
Properties of this pair
Common ECOD label(s) |
Common RFAM label(s) |
Interface TM-score |
Interface RMSD |
Percentage identity |
Protein TM-score |
RNA TM-score |
Protein coverage |
RNA coverage |
Percentage conservation |
Apolar conservation |
H-bond conservation |
Percentage switching out |
---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
Nucleic acid-binding proteins & SH3 | 0.75 | 3.8 | 0.23 | 0.73 | 0.75 | 0.67 | 0.72 | 0.56 | 0.48 | 0.28 | 0.31 |
Other pairs involving 6AZ3_A_1,2 or 7RYG_C_A
Total number of entries: 19