Interface analysis
Style
Protein
CartoonLicorice
Surface
RNA
CartoonLicorice
Surface
Color
StructureStructure (with hetatm)
Chain
Chainbow
View
Focus on
InterfaceRNA
Protein
All
Show chains
Interface
show interface as licoriceCommon contacts -
6AZ3_A
|
6AZ3_3
|
6S0Z_C
|
6S0Z_A
|
Conserved?
|
---|---|---|---|---|
A:52 [ALA] | 3:197 [G] | C:85 [PRO] | A:1614 [A] | ✔ |
A:187 [TYR] | 3:196 [C] | C:213 [TRP] | A:1613 [G] | ✔ |
A:22 [LYS] | 3:198 [C] | C:60 [ARG] | A:1615 [G] | ✔ |
A:21 [HIS] | 3:199 [A] | C:59 [LYS] | A:1616 [A] | ✔ |
A:50 [HIS] | 3:196 [C] | C:83 [TYR] | A:1613 [G] | ✔ |
A:50 [HIS] | 3:197 [G] | C:83 [TYR] | A:1614 [A] | ✔ |
A:54 [ARG] | 3:196 [C] | C:87 [ARG] | A:1613 [G] | ❌ 6S0Z_C_A |
A:22 [LYS] | 3:199 [A] | C:60 [ARG] | A:1616 [A] | ❌ 6S0Z_C_A |
A:53 [GLY] | 3:196 [C] | C:86 [ASN] | A:1613 [G] | ❌ 6S0Z_C_A |
A:50 [HIS] | 3:198 [C] | C:83 [TYR] | A:1615 [G] | ❌ 6S0Z_C_A |
A:177 [LYS] | 3:194 [A] | C:203 [VAL] | A:1612 [C] | ❌ 6S0Z_C_A |
A:184 [ASN] | 3:196 [C] | C:210 [ARG] | A:1613 [G] | ❌ 6AZ3_A_3 |
A:184 [ASN] | 3:194 [A] | C:210 [ARG] | A:1612 [C] | ❌ 6AZ3_A_3 |
A:21 [HIS] | 3:197 [G] | C:59 [LYS] | A:1614 [A] | ❌ 6AZ3_A_3 |
A:21 [HIS] | 3:198 [C] | C:59 [LYS] | A:1615 [G] | ❌ 6AZ3_A_3 |
A:22 [LYS] | 3:197 [G] | C:60 [ARG] | A:1614 [A] | ❌ 6AZ3_A_3 |
A:50 [HIS] | 3:194 [A] | C:83 [TYR] | A:1612 [C] | ❌ 6AZ3_A_3 |
A:52 [ALA] | 3:198 [C] | C:85 [PRO] | A:1615 [G] | ❌ 6AZ3_A_3 |
A:73 [LYS] | 3:25 [A] | C:101 [LYS] | A:1467 [G] | ❌ 6S0Z_A:1467 no longer at interface |
A:73 [LYS] | 3:26 [G] | C:101 [LYS] | A:1468 [G] | ❌ 6S0Z_A:1468 no longer at interface |
A:71 [ARG] | 3:24 [C] | C:99 [GLY] | A:1466 [G] | ❌ 6S0Z_A:1466 no longer at interface |
A:71 [ARG] | 3:25 [A] | C:99 [GLY] | A:1467 [G] | ❌ 6S0Z_A:1467 no longer at interface |
A:20 [GLY] | 3:32 [A] | C:58 [HIS] | A:1473 [G] | ❌ 6AZ3_A:20, 6AZ3_3:32 no longer at interface |
A:23 [ARG] | 3:200 [A] | C:61 [GLN] | A:1617 [A] | ❌ 6AZ3_A:23, 6AZ3_3:200 no longer at interface |
A:190 [ARG] | 3:196 [C] | C:215 [GLY] | A:1613 [G] | ❌ 6S0Z_C:215 no longer at interface |
A:190 [ARG] | 3:197 [G] | C:215 [GLY] | A:1614 [A] | ❌ 6S0Z_C:215 no longer at interface |
A:190 [ARG] | 3:198 [C] | C:215 [GLY] | A:1615 [G] | ❌ 6S0Z_C:215 no longer at interface |
A:189 [PHE] | 3:196 [C] | C:214 [LYS] | A:1613 [G] | ❌ 6AZ3_A:189 no longer at interface |
A:20 [GLY] | 3:196 [C] | C:58 [HIS] | A:1613 [G] | ❌ 6AZ3_A:20 no longer at interface |
A:20 [GLY] | 3:197 [G] | C:58 [HIS] | A:1614 [A] | ❌ 6AZ3_A:20 no longer at interface |
A:20 [GLY] | 3:198 [C] | C:58 [HIS] | A:1615 [G] | ❌ 6AZ3_A:20 no longer at interface |
A:23 [ARG] | 3:199 [A] | C:61 [GLN] | A:1616 [A] | ❌ 6AZ3_A:23 no longer at interface |
A:23 [ARG] | 3:198 [C] | C:61 [GLN] | A:1615 [G] | ❌ 6AZ3_A:23 no longer at interface |
A:25 [GLY] | 3:197 [G] | C:63 [ARG] | A:1614 [A] | ❌ 6AZ3_A:25 no longer at interface |
A:25 [GLY] | 3:198 [C] | C:63 [ARG] | A:1615 [G] | ❌ 6AZ3_A:25 no longer at interface |
Properties of this pair
Common ECOD label(s) |
Common RFAM label(s) |
Interface TM-score |
Interface RMSD |
Percentage identity |
Protein TM-score |
RNA TM-score |
Protein coverage |
RNA coverage |
Percentage conservation |
Apolar conservation |
H-bond conservation |
Percentage switching out |
---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
Nucleic acid-binding proteins & SH3 | 0.72 | 3.6 | 0.09 | 0.73 | 0.56 | 0.75 | 0.45 | 0.39 | 0.51 | 0.17 | 0.59 |
Other pairs involving 6AZ3_A_3 or 6S0Z_C_A
Total number of entries: 19