Interface analysis
Style
Protein
CartoonLicorice
Surface
RNA
CartoonLicorice
Surface
Color
StructureStructure (with hetatm)
Chain
Chainbow
View
Focus on
InterfaceRNA
Protein
All
Show chains
Interface
show interface as licoriceCommon contacts -
6AZ3_A
|
6AZ3_3
|
7RYG_C
|
7RYG_A
|
Conserved?
|
---|---|---|---|---|
A:52 [ALA] | 3:197 [G] | C:85 [PRO] | A:1565 [G] | ✔ |
A:187 [TYR] | 3:196 [C] | C:213 [TRP] | A:1564 [A] | ✔ |
A:22 [LYS] | 3:198 [C] | C:60 [GLN] | A:1566 [G] | ✔ |
A:188 [ARG] | 3:196 [C] | C:214 [ARG] | A:1564 [A] | ✔ |
A:21 [HIS] | 3:199 [A] | C:59 [LYS] | A:1567 [A] | ✔ |
A:50 [HIS] | 3:196 [C] | C:83 [TYR] | A:1564 [A] | ✔ |
A:50 [HIS] | 3:197 [G] | C:83 [TYR] | A:1565 [G] | ✔ |
A:54 [ARG] | 3:196 [C] | C:87 [ARG] | A:1564 [A] | ❌ 7RYG_C_A |
A:22 [LYS] | 3:199 [A] | C:60 [GLN] | A:1567 [A] | ❌ 7RYG_C_A |
A:53 [GLY] | 3:196 [C] | C:86 [ASN] | A:1564 [A] | ❌ 7RYG_C_A |
A:50 [HIS] | 3:198 [C] | C:83 [TYR] | A:1566 [G] | ❌ 7RYG_C_A |
A:177 [LYS] | 3:194 [A] | C:203 [ARG] | A:1563 [C] | ❌ 7RYG_C_A |
A:177 [LYS] | 3:196 [C] | C:203 [ARG] | A:1564 [A] | ❌ 6AZ3_A_3 |
A:21 [HIS] | 3:198 [C] | C:59 [LYS] | A:1566 [G] | ❌ 6AZ3_A_3 |
A:21 [HIS] | 3:197 [G] | C:59 [LYS] | A:1565 [G] | ❌ 6AZ3_A_3 |
A:22 [LYS] | 3:197 [G] | C:60 [GLN] | A:1565 [G] | ❌ 6AZ3_A_3 |
A:50 [HIS] | 3:194 [A] | C:83 [TYR] | A:1563 [C] | ❌ 6AZ3_A_3 |
A:52 [ALA] | 3:198 [C] | C:85 [PRO] | A:1566 [G] | ❌ 6AZ3_A_3 |
A:73 [LYS] | 3:25 [A] | C:101 [ARG] | A:1418 [G] | ❌ 7RYG_C:101, 7RYG_A:1418 no longer at interface |
A:71 [ARG] | 3:24 [C] | C:99 [GLY] | A:1417 [A] | ❌ 7RYG_C:99, 7RYG_A:1417 no longer at interface |
A:71 [ARG] | 3:25 [A] | C:99 [GLY] | A:1418 [G] | ❌ 7RYG_C:99, 7RYG_A:1418 no longer at interface |
A:20 [GLY] | 3:32 [A] | C:58 [HIS] | A:1424 [G] | ❌ 6AZ3_A:20, 6AZ3_3:32 no longer at interface |
A:23 [ARG] | 3:200 [A] | C:61 [HIS] | A:1568 [A] | ❌ 6AZ3_A:23, 6AZ3_3:200 no longer at interface |
A:73 [LYS] | 3:26 [G] | C:101 [ARG] | A:1419 [A] | ❌ 7RYG_C:101 no longer at interface |
A:20 [GLY] | 3:196 [C] | C:58 [HIS] | A:1564 [A] | ❌ 6AZ3_A:20 no longer at interface |
A:20 [GLY] | 3:198 [C] | C:58 [HIS] | A:1566 [G] | ❌ 6AZ3_A:20 no longer at interface |
A:20 [GLY] | 3:197 [G] | C:58 [HIS] | A:1565 [G] | ❌ 6AZ3_A:20 no longer at interface |
A:23 [ARG] | 3:199 [A] | C:61 [HIS] | A:1567 [A] | ❌ 6AZ3_A:23 no longer at interface |
A:23 [ARG] | 3:198 [C] | C:61 [HIS] | A:1566 [G] | ❌ 6AZ3_A:23 no longer at interface |
A:25 [GLY] | 3:198 [C] | C:63 [ARG] | A:1566 [G] | ❌ 6AZ3_A:25 no longer at interface |
A:25 [GLY] | 3:197 [G] | C:63 [ARG] | A:1565 [G] | ❌ 6AZ3_A:25 no longer at interface |
Properties of this pair
Common ECOD label(s) |
Common RFAM label(s) |
Interface TM-score |
Interface RMSD |
Percentage identity |
Protein TM-score |
RNA TM-score |
Protein coverage |
RNA coverage |
Percentage conservation |
Apolar conservation |
H-bond conservation |
Percentage switching out |
---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
Nucleic acid-binding proteins & SH3 | 0.69 | 3.02 | 0.10 | 0.73 | 0.51 | 0.65 | 0.55 | 0.42 | 0.53 | 0.25 | 0.54 |
Other pairs involving 6AZ3_A_3 or 7RYG_C_A
Total number of entries: 18