Interface analysis
Style
Protein
CartoonLicorice
Surface
RNA
CartoonLicorice
Surface
Color
StructureStructure (with hetatm)
Chain
Chainbow
View
Focus on
InterfaceRNA
Protein
All
Show chains
Interface
show interface as licoriceCommon contacts -
6S0Z_C
|
6S0Z_A
|
7OF0_D
|
7OF0_A
|
Conserved?
|
---|---|---|---|---|
C:88 [SER] | A:1845 [U] | D:136 [SER] | A:2529 [U] | ✔ |
C:88 [SER] | A:1847 [U] | D:136 [SER] | A:2531 [U] | ✔ |
C:88 [SER] | A:1848 [A] | D:136 [SER] | A:2532 [U] | ✔ |
C:217 [ARG] | A:735 [C] | D:269 [ARG] | A:1922 [C] | ✔ |
C:217 [ARG] | A:736 [C] | D:269 [ARG] | A:1923 [C] | ✔ |
C:217 [ARG] | A:825 [G] | D:269 [ARG] | A:1990 [G] | ✔ |
C:211 [SER] | A:1818 [A] | D:263 [ASN] | A:2511 [C] | ✔ |
C:159 [GLY] | A:1847 [U] | D:211 [GLY] | A:2531 [U] | ✔ |
C:177 [ARG] | A:1826 [G] | D:229 [PRO] | A:2519 [G] | ✔ |
C:177 [ARG] | A:1846 [A] | D:229 [PRO] | A:2530 [A] | ✔ |
C:209 [GLY] | A:774 [G] | D:261 [GLY] | A:1939 [G] | ✔ |
C:209 [GLY] | A:809 [A] | D:261 [GLY] | A:1974 [A] | ✔ |
C:62 [TYR] | A:1843 [U] | D:104 [TYR] | A:2527 [A] | ✔ |
C:62 [TYR] | A:1844 [G] | D:104 [TYR] | A:2528 [G] | ✔ |
C:160 [ALA] | A:1846 [A] | D:212 [THR] | A:2530 [A] | ✔ |
C:87 [ARG] | A:1844 [G] | D:135 [ARG] | A:2528 [G] | ✔ |
C:87 [ARG] | A:1845 [U] | D:135 [ARG] | A:2529 [U] | ✔ |
C:204 [ASN] | A:1818 [A] | D:256 [VAL] | A:2511 [C] | ✔ |
C:204 [ASN] | A:1819 [G] | D:256 [VAL] | A:2512 [A] | ✔ |
C:206 [GLY] | A:1818 [A] | D:258 [GLY] | A:2511 [C] | ✔ |
C:206 [GLY] | A:1819 [G] | D:258 [GLY] | A:2512 [A] | ✔ |
C:48 [LYS] | A:818 [U] | D:90 [ARG] | A:1983 [U] | ✔ |
C:48 [LYS] | A:819 [A] | D:90 [ARG] | A:1984 [A] | ✔ |
C:48 [LYS] | A:822 [G] | D:90 [ARG] | A:1987 [G] | ✔ |
C:48 [LYS] | A:823 [G] | D:90 [ARG] | A:1988 [G] | ✔ |
C:48 [LYS] | A:824 [A] | D:90 [ARG] | A:1989 [C] | ✔ |
C:199 [GLN] | A:1847 [U] | D:251 [ASP] | A:2531 [U] | ✔ |
C:203 [VAL] | A:1819 [G] | D:255 [ARG] | A:2512 [A] | ✔ |
C:176 [LEU] | A:1826 [G] | D:228 [LEU] | A:2519 [G] | ✔ |
C:194 [GLN] | A:1847 [U] | D:246 [ARG] | A:2531 [U] | ✔ |
C:86 [ASN] | A:1844 [G] | D:134 [CYS] | A:2528 [G] | ✔ |
C:58 [HIS] | A:1613 [G] | D:100 [HIS] | A:2401 [A] | ✔ |
C:58 [HIS] | A:1614 [A] | D:100 [HIS] | A:2402 [A] | ✔ |
C:58 [HIS] | A:1615 [G] | D:100 [HIS] | A:2403 [G] | ✔ |
C:218 [PRO] | A:809 [A] | D:270 [PRO] | A:1974 [A] | ✔ |
C:218 [PRO] | A:826 [A] | D:270 [PRO] | A:1991 [A] | ✔ |
C:218 [PRO] | A:1816 [A] | D:270 [PRO] | A:2509 [A] | ✔ |
C:218 [PRO] | A:1817 [C] | D:270 [PRO] | A:2510 [U] | ✔ |
C:63 [ARG] | A:1614 [A] | D:105 [ARG] | A:2402 [A] | ✔ |
C:63 [ARG] | A:1615 [G] | D:105 [ARG] | A:2403 [G] | ✔ |
C:37 [LEU] | A:1843 [U] | D:79 [MET] | A:2527 [A] | ✔ |
C:200 [HIS] | A:1847 [U] | D:252 [HIS] | A:2531 [U] | ✔ |
C:200 [HIS] | A:1848 [A] | D:252 [HIS] | A:2532 [U] | ✔ |
C:153 [GLN] | A:1826 [G] | D:205 [GLN] | A:2519 [G] | ✔ |
C:153 [GLN] | A:1827 [C] | D:205 [GLN] | A:2520 [C] | ✔ |
C:153 [GLN] | A:1828 [U] | D:205 [GLN] | A:2521 [A] | ✔ |
C:153 [GLN] | A:1845 [U] | D:205 [GLN] | A:2529 [U] | ✔ |
C:178 [SER] | A:1826 [G] | D:230 [SER] | A:2519 [G] | ✔ |
C:178 [SER] | A:1846 [A] | D:230 [SER] | A:2530 [A] | ✔ |
C:36 [PRO] | A:1616 [A] | D:78 [LYS] | A:2404 [U] | ✔ |
C:228 [ASN] | A:2100 [C] | D:278 [LYS] | A:2736 [C] | ✔ |
C:205 [VAL] | A:1818 [A] | D:257 [ILE] | A:2511 [C] | ✔ |
C:205 [VAL] | A:1819 [G] | D:257 [ILE] | A:2512 [A] | ✔ |
C:207 [LYS] | A:774 [G] | D:259 [LYS] | A:1939 [G] | ✔ |
C:207 [LYS] | A:809 [A] | D:259 [LYS] | A:1974 [A] | ✔ |
C:207 [LYS] | A:1817 [C] | D:259 [LYS] | A:2510 [U] | ✔ |
C:207 [LYS] | A:1818 [A] | D:259 [LYS] | A:2511 [C] | ✔ |
C:198 [LEU] | A:1847 [U] | D:250 [VAL] | A:2531 [U] | ✔ |
C:220 [VAL] | A:826 [A] | D:272 [SER] | A:1991 [A] | ✔ |
C:220 [VAL] | A:827 [A] | D:272 [SER] | A:1992 [C] | ✔ |
C:220 [VAL] | A:1816 [A] | D:272 [SER] | A:2509 [A] | ✔ |
C:40 [LYS] | A:736 [C] | D:82 [SER] | A:1923 [C] | ✔ |
C:40 [LYS] | A:737 [C] | D:82 [SER] | A:1924 [U] | ✔ |
C:40 [LYS] | A:1840 [U] | D:82 [SER] | A:2524 [A] | ✔ |
C:40 [LYS] | A:1841 [G] | D:82 [SER] | A:2525 [C] | ✔ |
C:214 [LYS] | A:1613 [G] | D:266 [LEU] | A:2401 [A] | ✔ |
C:156 [ARG] | A:1843 [U] | D:208 [ARG] | A:2527 [A] | ✔ |
C:156 [ARG] | A:1844 [G] | D:208 [ARG] | A:2528 [G] | ✔ |
C:156 [ARG] | A:1845 [U] | D:208 [ARG] | A:2529 [U] | ✔ |
C:156 [ARG] | A:1846 [A] | D:208 [ARG] | A:2530 [A] | ✔ |
C:55 [GLY] | A:736 [C] | D:97 [GLY] | A:1923 [C] | ✔ |
C:55 [GLY] | A:737 [C] | D:97 [GLY] | A:1924 [U] | ✔ |
C:56 [GLY] | A:736 [C] | D:98 [GLY] | A:1923 [C] | ✔ |
C:56 [GLY] | A:737 [C] | D:98 [GLY] | A:1924 [U] | ✔ |
C:60 [ARG] | A:1614 [A] | D:102 [GLN] | A:2402 [A] | ✔ |
C:60 [ARG] | A:1615 [G] | D:102 [GLN] | A:2403 [G] | ✔ |
C:44 [ASN] | A:1840 [U] | D:86 [ASP] | A:2524 [A] | ✔ |
C:150 [LYS] | A:1828 [U] | D:202 [ARG] | A:2521 [A] | ✔ |
C:210 [ARG] | A:1612 [C] | D:262 [ARG] | A:2400 [C] | ✔ |
C:210 [ARG] | A:1613 [G] | D:262 [ARG] | A:2401 [A] | ✔ |
C:51 [VAL] | A:1840 [U] | D:93 [VAL] | A:2524 [A] | ✔ |
C:51 [VAL] | A:1841 [G] | D:93 [VAL] | A:2525 [C] | ✔ |
C:85 [PRO] | A:1614 [A] | D:133 [PRO] | A:2402 [A] | ✔ |
C:85 [PRO] | A:1615 [G] | D:133 [PRO] | A:2403 [G] | ✔ |
C:49 [LEU] | A:824 [A] | D:91 [ILE] | A:1989 [C] | ✔ |
C:49 [LEU] | A:825 [G] | D:91 [ILE] | A:1990 [G] | ✔ |
C:83 [TYR] | A:1612 [C] | D:131 [TYR] | A:2400 [C] | ✔ |
C:83 [TYR] | A:1613 [G] | D:131 [TYR] | A:2401 [A] | ✔ |
C:83 [TYR] | A:1614 [A] | D:131 [TYR] | A:2402 [A] | ✔ |
C:42 [GLY] | A:1840 [U] | D:84 [GLY] | A:2524 [A] | ✔ |
C:201 [GLU] | A:1847 [U] | D:253 [ASN] | A:2531 [U] | ✔ |
C:67 [PHE] | A:1844 [G] | D:109 [PHE] | A:2528 [G] | ✔ |
C:67 [PHE] | A:1845 [U] | D:109 [PHE] | A:2529 [U] | ✔ |
C:45 [ASN] | A:1839 [G] | D:87 [HIS] | A:2523 [C] | ✔ |
C:197 [ASN] | A:1847 [U] | D:249 [ASN] | A:2531 [U] | ✔ |
C:54 [HIS] | A:1841 [G] | D:96 [ILE] | A:2525 [C] | ✔ |
C:54 [HIS] | A:1850 [G] | D:96 [ILE] | A:2534 [G] | ✔ |
C:43 [ARG] | A:735 [C] | D:85 [ARG] | A:1922 [C] | ✔ |
C:43 [ARG] | A:736 [C] | D:85 [ARG] | A:1923 [C] | ✔ |
C:43 [ARG] | A:817 [G] | D:85 [ARG] | A:1982 [G] | ✔ |
C:43 [ARG] | A:824 [A] | D:85 [ARG] | A:1989 [C] | ✔ |
C:43 [ARG] | A:825 [G] | D:85 [ARG] | A:1990 [G] | ✔ |
C:43 [ARG] | A:1840 [U] | D:85 [ARG] | A:2524 [A] | ✔ |
C:222 [GLY] | A:1852 [G] | D:274 [ARG] | A:2536 [G] | ✔ |
C:61 [GLN] | A:1615 [G] | D:103 [ARG] | A:2403 [G] | ✔ |
C:61 [GLN] | A:1616 [A] | D:103 [ARG] | A:2404 [U] | ✔ |
C:61 [GLN] | A:1617 [A] | D:103 [ARG] | A:2405 [C] | ✔ |
C:47 [GLY] | A:817 [G] | D:89 [GLY] | A:1982 [G] | ✔ |
C:47 [GLY] | A:818 [U] | D:89 [GLY] | A:1983 [U] | ✔ |
C:47 [GLY] | A:824 [A] | D:89 [GLY] | A:1989 [C] | ✔ |
C:50 [THR] | A:1840 [U] | D:92 [ARG] | A:2524 [A] | ✔ |
C:213 [TRP] | A:809 [A] | D:265 [TRP] | A:1974 [A] | ✔ |
C:213 [TRP] | A:1613 [G] | D:265 [TRP] | A:2401 [A] | ✔ |
C:38 [PRO] | A:737 [C] | D:80 [ARG] | A:1924 [U] | ✔ |
C:38 [PRO] | A:738 [U] | D:80 [ARG] | A:1925 [A] | ✔ |
C:208 [ALA] | A:774 [G] | D:260 [ALA] | A:1939 [G] | ✔ |
C:208 [ALA] | A:809 [A] | D:260 [ALA] | A:1974 [A] | ✔ |
C:208 [ALA] | A:1817 [C] | D:260 [ALA] | A:2510 [U] | ✔ |
C:208 [ALA] | A:1818 [A] | D:260 [ALA] | A:2511 [C] | ✔ |
C:39 [LYS] | A:737 [C] | D:81 [LYS] | A:1924 [U] | ✔ |
C:39 [LYS] | A:738 [U] | D:81 [LYS] | A:1925 [A] | ✔ |
C:212 [ARG] | A:736 [C] | D:264 [ARG] | A:1923 [C] | ✔ |
C:212 [ARG] | A:809 [A] | D:264 [ARG] | A:1974 [A] | ✔ |
C:212 [ARG] | A:826 [A] | D:264 [ARG] | A:1991 [A] | ✔ |
C:41 [ALA] | A:736 [C] | D:83 [GLY] | A:1923 [C] | ✔ |
C:41 [ALA] | A:737 [C] | D:83 [GLY] | A:1924 [U] | ✔ |
C:158 [ALA] | A:1847 [U] | D:210 [ALA] | A:2531 [U] | ✔ |
C:155 [ALA] | A:1826 [G] | D:207 [ILE] | A:2519 [G] | ✔ |
C:155 [ALA] | A:1845 [U] | D:207 [ILE] | A:2529 [U] | ✔ |
C:155 [ALA] | A:1846 [A] | D:207 [ILE] | A:2530 [A] | ✔ |
C:59 [LYS] | A:739 [U] | D:101 [LYS] | A:1926 [A] | ✔ |
C:59 [LYS] | A:1614 [A] | D:101 [LYS] | A:2402 [A] | ✔ |
C:59 [LYS] | A:1615 [G] | D:101 [LYS] | A:2403 [G] | ✔ |
C:59 [LYS] | A:1616 [A] | D:101 [LYS] | A:2404 [U] | ✔ |
C:52 [ARG] | A:1850 [G] | D:94 [HIS] | A:2534 [G] | ✔ |
C:52 [ARG] | A:1851 [G] | D:94 [HIS] | A:2535 [A] | ✔ |
C:180 [GLU] | A:1826 [G] | D:232 [ARG] | A:2519 [G] | ✔ |
C:46 [GLN] | A:817 [G] | D:88 [THR] | A:1982 [G] | ✔ |
C:46 [GLN] | A:818 [U] | D:88 [THR] | A:1983 [U] | ✔ |
C:154 [ILE] | A:1826 [G] | D:206 [TYR] | A:2519 [G] | ✔ |
C:154 [ILE] | A:1845 [U] | D:206 [TYR] | A:2529 [U] | ✔ |
C:154 [ILE] | A:1846 [A] | D:206 [TYR] | A:2530 [A] | ✔ |
C:157 [SER] | A:1845 [U] | D:209 [ALA] | A:2529 [U] | ✔ |
C:157 [SER] | A:1846 [A] | D:209 [ALA] | A:2530 [A] | ✔ |
C:157 [SER] | A:1847 [U] | D:209 [ALA] | A:2531 [U] | ✔ |
C:157 [SER] | A:1848 [A] | D:209 [ALA] | A:2532 [U] | ✔ |
C:217 [ARG] | A:826 [A] | D:269 [ARG] | A:1991 [A] | ❌ 7OF0_D_A |
C:177 [ARG] | A:1847 [U] | D:229 [PRO] | A:2531 [U] | ❌ 7OF0_D_A |
C:36 [PRO] | A:1617 [A] | D:78 [LYS] | A:2405 [C] | ❌ 7OF0_D_A |
C:36 [PRO] | A:1843 [U] | D:78 [LYS] | A:2527 [A] | ❌ 7OF0_D_A |
C:231 [PRO] | A:2266 [G] | D:281 [TRP] | A:2803 [A] | ❌ 7OF0_D_A |
C:225 [MET] | A:827 [A] | D:275 [TRP] | A:1992 [C] | ❌ 7OF0_D_A |
C:40 [LYS] | A:1843 [U] | D:82 [SER] | A:2527 [A] | ❌ 7OF0_D_A |
C:44 [ASN] | A:1839 [G] | D:86 [ASP] | A:2523 [C] | ❌ 7OF0_D_A |
C:34 [LEU] | A:1617 [A] | D:76 [PRO] | A:2405 [C] | ❌ 7OF0_D_A |
C:221 [ARG] | A:1816 [A] | D:273 [GLY] | A:2509 [A] | ❌ 7OF0_D_A |
C:221 [ARG] | A:1853 [C] | D:273 [GLY] | A:2537 [G] | ❌ 7OF0_D_A |
C:31 [LYS] | A:1469 [G] | D:73 [THR] | A:2388 [A] | ❌ 7OF0_D_A |
C:31 [LYS] | A:1471 [A] | D:73 [THR] | A:2389 [C] | ❌ 7OF0_D_A |
C:42 [GLY] | A:1841 [G] | D:84 [GLY] | A:2525 [C] | ❌ 7OF0_D_A |
C:219 [THR] | A:1816 [A] | D:271 [ASN] | A:2509 [A] | ❌ 7OF0_D_A |
C:219 [THR] | A:1817 [C] | D:271 [ASN] | A:2510 [U] | ❌ 7OF0_D_A |
C:54 [HIS] | A:1842 [A] | D:96 [ILE] | A:2526 [C] | ❌ 7OF0_D_A |
C:222 [GLY] | A:1853 [C] | D:274 [ARG] | A:2537 [G] | ❌ 7OF0_D_A |
C:229 [ASP] | A:824 [A] | D:279 [GLY] | A:1989 [C] | ❌ 7OF0_D_A |
C:229 [ASP] | A:825 [G] | D:279 [GLY] | A:1990 [G] | ❌ 7OF0_D_A |
C:229 [ASP] | A:827 [A] | D:279 [GLY] | A:1992 [C] | ❌ 7OF0_D_A |
C:50 [THR] | A:1839 [G] | D:92 [ARG] | A:2523 [C] | ❌ 7OF0_D_A |
C:41 [ALA] | A:1841 [G] | D:83 [GLY] | A:2525 [C] | ❌ 7OF0_D_A |
C:52 [ARG] | A:1852 [G] | D:94 [HIS] | A:2536 [G] | ❌ 7OF0_D_A |
C:46 [GLN] | A:819 [A] | D:88 [THR] | A:1984 [A] | ❌ 7OF0_D_A |
C:227 [PRO] | A:2100 [C] | D:277 [ARG] | A:2736 [C] | ❌ 7OF0_D_A |
C:227 [PRO] | A:2101 [U] | D:277 [ARG] | A:2737 [U] | ❌ 7OF0_D_A |
C:61 [GLN] | A:1471 [A] | D:103 [ARG] | A:2389 [C] | ❌ 6S0Z_C_A |
C:87 [ARG] | A:1843 [U] | D:135 [ARG] | A:2527 [A] | ❌ 6S0Z_C_A |
C:101 [LYS] | A:1469 [G] | D:148 [LYS] | A:2388 [A] | ❌ 6S0Z_C_A |
C:154 [ILE] | A:1827 [C] | D:206 [TYR] | A:2520 [C] | ❌ 6S0Z_C_A |
C:156 [ARG] | A:1828 [U] | D:208 [ARG] | A:2521 [A] | ❌ 6S0Z_C_A |
C:160 [ALA] | A:1847 [U] | D:212 [THR] | A:2531 [U] | ❌ 6S0Z_C_A |
C:203 [VAL] | A:1613 [G] | D:255 [ARG] | A:2401 [A] | ❌ 6S0Z_C_A |
C:210 [ARG] | A:809 [A] | D:262 [ARG] | A:1974 [A] | ❌ 6S0Z_C_A |
C:211 [SER] | A:1817 [C] | D:263 [ASN] | A:2510 [U] | ❌ 6S0Z_C_A |
C:213 [TRP] | A:1614 [A] | D:265 [TRP] | A:2402 [A] | ❌ 6S0Z_C_A |
C:214 [LYS] | A:1614 [A] | D:266 [LEU] | A:2402 [A] | ❌ 6S0Z_C_A |
C:217 [ARG] | A:824 [A] | D:269 [ARG] | A:1989 [C] | ❌ 6S0Z_C_A |
C:219 [THR] | A:826 [A] | D:271 [ASN] | A:1991 [A] | ❌ 6S0Z_C_A |
C:219 [THR] | A:825 [G] | D:271 [ASN] | A:1990 [G] | ❌ 6S0Z_C_A |
C:220 [VAL] | A:825 [G] | D:272 [SER] | A:1990 [G] | ❌ 6S0Z_C_A |
C:221 [ARG] | A:825 [G] | D:273 [GLY] | A:1990 [G] | ❌ 6S0Z_C_A |
C:221 [ARG] | A:827 [A] | D:273 [GLY] | A:1992 [C] | ❌ 6S0Z_C_A |
C:222 [GLY] | A:1851 [G] | D:274 [ARG] | A:2535 [A] | ❌ 6S0Z_C_A |
C:222 [GLY] | A:1850 [G] | D:274 [ARG] | A:2534 [G] | ❌ 6S0Z_C_A |
C:225 [MET] | A:1851 [G] | D:275 [TRP] | A:2535 [A] | ❌ 6S0Z_C_A |
C:225 [MET] | A:1852 [G] | D:275 [TRP] | A:2536 [G] | ❌ 6S0Z_C_A |
C:227 [PRO] | A:2266 [G] | D:277 [ARG] | A:2803 [A] | ❌ 6S0Z_C_A |
C:228 [ASN] | A:2101 [U] | D:278 [LYS] | A:2737 [U] | ❌ 6S0Z_C_A |
C:229 [ASP] | A:2101 [U] | D:279 [GLY] | A:2737 [U] | ❌ 6S0Z_C_A |
C:231 [PRO] | A:1851 [G] | D:281 [TRP] | A:2535 [A] | ❌ 6S0Z_C_A |
C:231 [PRO] | A:1852 [G] | D:281 [TRP] | A:2536 [G] | ❌ 6S0Z_C_A |
C:231 [PRO] | A:1853 [C] | D:281 [TRP] | A:2537 [G] | ❌ 6S0Z_C_A |
C:34 [LEU] | A:1471 [A] | D:76 [PRO] | A:2389 [C] | ❌ 6S0Z_C_A |
C:34 [LEU] | A:1469 [G] | D:76 [PRO] | A:2388 [A] | ❌ 6S0Z_C_A |
C:36 [PRO] | A:739 [U] | D:78 [LYS] | A:1926 [A] | ❌ 6S0Z_C_A |
C:36 [PRO] | A:738 [U] | D:78 [LYS] | A:1925 [A] | ❌ 6S0Z_C_A |
C:37 [LEU] | A:738 [U] | D:79 [MET] | A:1925 [A] | ❌ 6S0Z_C_A |
C:49 [LEU] | A:823 [G] | D:91 [ILE] | A:1988 [G] | ❌ 6S0Z_C_A |
C:49 [LEU] | A:735 [C] | D:91 [ILE] | A:1922 [C] | ❌ 6S0Z_C_A |
C:51 [VAL] | A:1850 [G] | D:93 [VAL] | A:2534 [G] | ❌ 6S0Z_C_A |
C:52 [ARG] | A:825 [G] | D:94 [HIS] | A:1990 [G] | ❌ 6S0Z_C_A |
C:54 [HIS] | A:736 [C] | D:96 [ILE] | A:1923 [C] | ❌ 6S0Z_C_A |
C:58 [HIS] | A:1473 [G] | D:100 [HIS] | A:2391 [A] | ❌ 7OF0_A:2391 no longer at interface |
C:243 [ARG] | A:2102 [U] | D:284 [ARG] | A:2738 [U] | ❌ 7OF0_D:284, 7OF0_A:2738 no longer at interface |
C:228 [ASN] | A:829 [U] | D:278 [LYS] | A:1994 [A] | ❌ 7OF0_A:1994 no longer at interface |
C:228 [ASN] | A:830 [U] | D:278 [LYS] | A:1995 [A] | ❌ 7OF0_A:1995 no longer at interface |
C:228 [ASN] | A:838 [A] | D:278 [LYS] | A:2003 [A] | ❌ 7OF0_A:2003 no longer at interface |
C:220 [VAL] | A:1815 [C] | D:272 [SER] | A:2508 [C] | ❌ 7OF0_A:2508 no longer at interface |
C:44 [ASN] | A:1838 [G] | D:86 [ASP] | A:2522 [U] | ❌ 7OF0_A:2522 no longer at interface |
C:221 [ARG] | A:1815 [C] | D:273 [GLY] | A:2508 [C] | ❌ 7OF0_A:2508 no longer at interface |
C:221 [ARG] | A:1854 [U] | D:273 [GLY] | A:2538 [C] | ❌ 7OF0_A:2538 no longer at interface |
C:221 [ARG] | A:1855 [G] | D:273 [GLY] | A:2539 [A] | ❌ 7OF0_A:2539 no longer at interface |
C:45 [ASN] | A:1838 [G] | D:87 [HIS] | A:2522 [U] | ❌ 7OF0_A:2522 no longer at interface |
C:54 [HIS] | A:1849 [G] | D:96 [ILE] | A:2533 [A] | ❌ 7OF0_A:2533 no longer at interface |
C:229 [ASP] | A:830 [U] | D:279 [GLY] | A:1995 [A] | ❌ 7OF0_A:1995 no longer at interface |
C:46 [GLN] | A:1838 [G] | D:88 [THR] | A:2522 [U] | ❌ 7OF0_A:2522 no longer at interface |
C:227 [PRO] | A:2625 [A] | D:277 [ARG] | A:3085 [A] | ❌ 7OF0_A:3085 no longer at interface |
C:227 [PRO] | A:2626 [G] | D:277 [ARG] | A:3086 [U] | ❌ 7OF0_A:3086 no longer at interface |
C:59 [LYS] | A:740 [G] | D:101 [LYS] | A:1927 [G] | ❌ 6S0Z_A:740 no longer at interface |
C:82 [GLN] | A:1472 [C] | D:130 [ARG] | A:2390 [A] | ❌ 6S0Z_C:82, 6S0Z_A:1472 no longer at interface |
C:101 [LYS] | A:1468 [G] | D:148 [LYS] | A:2387 [U] | ❌ 6S0Z_A:1468 no longer at interface |
C:207 [LYS] | A:808 [G] | D:259 [LYS] | A:1973 [G] | ❌ 6S0Z_A:808 no longer at interface |
C:213 [TRP] | A:808 [G] | D:265 [TRP] | A:1973 [G] | ❌ 6S0Z_A:808 no longer at interface |
C:227 [PRO] | A:2267 [C] | D:277 [ARG] | A:2804 [A] | ❌ 6S0Z_A:2267 no longer at interface |
C:228 [ASN] | A:2267 [C] | D:278 [LYS] | A:2804 [A] | ❌ 6S0Z_A:2267 no longer at interface |
C:228 [ASN] | A:2268 [A] | D:278 [LYS] | A:2805 [A] | ❌ 6S0Z_A:2268 no longer at interface |
C:244 [PRO] | A:2103 [U] | D:285 [LYS] | A:2739 [U] | ❌ 6S0Z_A:2103 no longer at interface |
C:31 [LYS] | A:1468 [G] | D:73 [THR] | A:2387 [U] | ❌ 6S0Z_A:1468 no longer at interface |
C:33 [LEU] | A:1468 [G] | D:75 [THR] | A:2387 [U] | ❌ 6S0Z_C:33, 6S0Z_A:1468 no longer at interface |
C:48 [LYS] | A:820 [G] | D:90 [ARG] | A:1985 [G] | ❌ 6S0Z_A:820 no longer at interface |
C:53 [HIS] | A:1851 [G] | D:95 [GLY] | A:2535 [A] | ❌ 7OF0_D:95 no longer at interface |
C:243 [ARG] | A:2266 [G] | D:284 [ARG] | A:2803 [A] | ❌ 7OF0_D:284 no longer at interface |
C:35 [LYS] | A:1843 [U] | D:77 [VAL] | A:2527 [A] | ❌ 7OF0_D:77 no longer at interface |
C:230 [HIS] | A:1852 [G] | D:280 [GLY] | A:2536 [G] | ❌ 7OF0_D:280 no longer at interface |
C:57 [GLY] | A:737 [C] | D:99 [GLY] | A:1924 [U] | ❌ 7OF0_D:99 no longer at interface |
C:241 [ILE] | A:1852 [G] | D:283 [GLY] | A:2536 [G] | ❌ 7OF0_D:283 no longer at interface |
C:241 [ILE] | A:1853 [C] | D:283 [GLY] | A:2537 [G] | ❌ 7OF0_D:283 no longer at interface |
C:182 [ARG] | A:1826 [G] | D:234 [MET] | A:2519 [G] | ❌ 7OF0_D:234 no longer at interface |
C:182 [ARG] | A:1827 [C] | D:234 [MET] | A:2520 [C] | ❌ 7OF0_D:234 no longer at interface |
C:147 [LYS] | A:1828 [U] | D:199 [GLU] | A:2521 [A] | ❌ 7OF0_D:199 no longer at interface |
C:232 [HIS] | A:1852 [G] | D:282 [ALA] | A:2536 [G] | ❌ 7OF0_D:282 no longer at interface |
C:232 [HIS] | A:1853 [C] | D:282 [ALA] | A:2537 [G] | ❌ 7OF0_D:282 no longer at interface |
C:64 [VAL] | A:1843 [U] | D:106 [MET] | A:2527 [A] | ❌ 6S0Z_C:64 no longer at interface |
C:65 [ILE] | A:1844 [G] | D:107 [ILE] | A:2528 [G] | ❌ 6S0Z_C:65 no longer at interface |
C:79 [ASP] | A:1469 [G] | D:127 [ILE] | A:2388 [A] | ❌ 6S0Z_C:79 no longer at interface |
C:80 [SER] | A:1469 [G] | D:128 [GLN] | A:2388 [A] | ❌ 6S0Z_C:80 no longer at interface |
C:82 [GLN] | A:1471 [A] | D:130 [ARG] | A:2389 [C] | ❌ 6S0Z_C:82 no longer at interface |
C:82 [GLN] | A:1469 [G] | D:130 [ARG] | A:2388 [A] | ❌ 6S0Z_C:82 no longer at interface |
C:82 [GLN] | A:1614 [A] | D:130 [ARG] | A:2402 [A] | ❌ 6S0Z_C:82 no longer at interface |
C:82 [GLN] | A:1615 [G] | D:130 [ARG] | A:2403 [G] | ❌ 6S0Z_C:82 no longer at interface |
C:93 [LEU] | A:1469 [G] | D:141 [LEU] | A:2388 [A] | ❌ 6S0Z_C:93 no longer at interface |
C:103 [TYR] | A:1469 [G] | D:150 [TRP] | A:2388 [A] | ❌ 6S0Z_C:103 no longer at interface |
C:151 [GLY] | A:1828 [U] | D:203 [GLY] | A:2521 [A] | ❌ 6S0Z_C:151 no longer at interface |
C:152 [GLY] | A:1828 [U] | D:204 [ALA] | A:2521 [A] | ❌ 6S0Z_C:152 no longer at interface |
C:32 [SER] | A:1469 [G] | D:74 [ILE] | A:2388 [A] | ❌ 6S0Z_C:32 no longer at interface |
C:33 [LEU] | A:1469 [G] | D:75 [THR] | A:2388 [A] | ❌ 6S0Z_C:33 no longer at interface |
Properties of this pair
Common ECOD label(s) |
Common RFAM label(s) |
Interface TM-score |
Interface RMSD |
Percentage identity |
Protein TM-score |
RNA TM-score |
Protein coverage |
RNA coverage |
Percentage conservation |
Apolar conservation |
H-bond conservation |
Percentage switching out |
---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
Nucleic acid-binding proteins & SH3 | Bacterial large subunit ribosomal RNA | 0.95 | 2.97 | 0.33 | 0.77 | 0.96 | 0.76 | 0.79 | 0.68 | 0.68 | 0.41 | 0.46 |
Other pairs involving 6S0Z_C_A or 7OF0_D_A
Total number of entries: 19