RNAprotDB

All interfaces > All interologs > Interface groups > group131 > 6YSI_A_1 vs 7K00_c_a

Interface analysis


mouse controls

Style

Protein

Cartoon
Licorice
Surface

RNA

Cartoon
Licorice
Surface

Color

Structure
Structure (with hetatm)
Chain
Chainbow

View

Focus on

Interface
RNA
Protein
All

Show chains

Interface

show interface as licorice

Common contacts -

6YSI_A
6YSI_1
7K00_c
7K00_a
Conserved?
A:49 [ILE] 1:681 [U] c:49 [ILE] a:690 [G] ✔
A:49 [ILE] 1:770 [U] c:49 [ILE] a:779 [U] ✔
A:49 [ILE] 1:771 [G] c:49 [ILE] a:780 [G] ✔
A:49 [ILE] 1:1794 [A] c:49 [ILE] a:1805 [A] ✔
A:49 [ILE] 1:1795 [C] c:49 [ILE] a:1806 [C] ✔
A:260 [ASN] 1:1789 [C] c:260 [ASN] a:1800 [C] ✔
A:217 [ARG] 1:681 [U] c:217 [ARG] a:690 [G] ✔
A:217 [ARG] 1:682 [C] c:217 [ARG] a:691 [C] ✔
A:217 [ARG] 1:771 [G] c:217 [ARG] a:780 [G] ✔
A:217 [ARG] 1:772 [A] c:217 [ARG] a:781 [A] ✔
A:64 [ILE] 1:1805 [C] c:64 [ILE] a:1816 [C] ✔
A:73 [GLY] 1:1478 [A] c:73 [GLY] a:1490 [A] ✔
A:247 [PRO] 1:1813 [G] c:247 [PRO] a:1824 [G] ✔
A:247 [PRO] 1:1814 [U] c:247 [PRO] a:1825 [U] ✔
A:252 [ALA] 1:1785 [U] c:252 [THR] a:1796 [U] ✔
A:252 [ALA] 1:1813 [G] c:252 [THR] a:1824 [G] ✔
A:252 [ALA] 1:1814 [U] c:252 [THR] a:1825 [U] ✔
A:265 [LYS] 1:2213 [G] c:265 [LYS] a:2224 [G] ✔
A:210 [ALA] 1:755 [A] c:210 [ALA] a:764 [A] ✔
A:159 [GLY] 1:1809 [U] c:159 [GLY] a:1820 [U] ✔
A:177 [ARG] 1:1788 [G] c:177 [ARG] a:1799 [G] ✔
A:177 [ARG] 1:1808 [A] c:177 [ARG] a:1819 [A] ✔
A:177 [ARG] 1:1809 [U] c:177 [ARG] a:1820 [U] ✔
A:228 [ILE] 1:775 [G] c:228 [VAL] a:784 [G] ✔
A:228 [ILE] 1:784 [A] c:228 [VAL] a:793 [A] ✔
A:228 [ILE] 1:2062 [C] c:228 [VAL] a:2073 [C] ✔
A:209 [GLY] 1:720 [G] c:209 [GLY] a:729 [G] ✔
A:209 [GLY] 1:755 [A] c:209 [GLY] a:764 [A] ✔
A:62 [TYR] 1:1805 [C] c:62 [TYR] a:1816 [C] ✔
A:62 [TYR] 1:1806 [G] c:62 [TYR] a:1817 [G] ✔
A:98 [ASP] 1:1478 [A] c:98 [ASP] a:1490 [A] ✔
A:98 [ASP] 1:1479 [G] c:98 [ASP] a:1491 [G] ✔
A:98 [ASP] 1:1488 [G] c:98 [ASP] a:1500 [G] ✔
A:243 [GLN] 1:1830 [U] c:243 [HIS] a:1841 [U] ✔
A:243 [GLN] 1:1831 [G] c:243 [HIS] a:1842 [G] ✔
A:243 [GLN] 1:1890 [A] c:243 [HIS] a:1901 [A] ✔
A:243 [GLN] 1:1891 [C] c:243 [HIS] a:1902 [C] ✔
A:160 [ALA] 1:1808 [A] c:160 [THR] a:1819 [A] ✔
A:11 [PRO] 1:720 [G] c:11 [PRO] a:729 [G] ✔
A:11 [PRO] 1:1762 [A] c:11 [PRO] a:1773 [A] ✔
A:11 [PRO] 1:1763 [C] c:11 [PRO] a:1774 [C] ✔
A:48 [HIS] 1:764 [U] c:48 [ARG] a:773 [U] ✔
A:48 [HIS] 1:765 [A] c:48 [ARG] a:774 [G] ✔
A:48 [HIS] 1:769 [G] c:48 [ARG] a:778 [G] ✔
A:48 [HIS] 1:770 [U] c:48 [ARG] a:779 [U] ✔
A:48 [HIS] 1:1795 [C] c:48 [ARG] a:1806 [C] ✔
A:48 [HIS] 1:1796 [G] c:48 [ARG] a:1807 [G] ✔
A:87 [ARG] 1:1806 [G] c:87 [ARG] a:1817 [G] ✔
A:87 [ARG] 1:1807 [U] c:87 [ARG] a:1818 [U] ✔
A:99 [GLY] 1:1488 [G] c:99 [GLY] a:1500 [G] ✔
A:99 [GLY] 1:1489 [G] c:99 [GLY] a:1501 [G] ✔
A:206 [GLY] 1:1780 [A] c:206 [GLY] a:1791 [A] ✔
A:206 [GLY] 1:1781 [G] c:206 [GLY] a:1792 [G] ✔
A:71 [LYS] 1:1478 [A] c:71 [LYS] a:1490 [A] ✔
A:71 [LYS] 1:1479 [G] c:71 [LYS] a:1491 [G] ✔
A:75 [PRO] 1:1478 [A] c:75 [PRO] a:1490 [A] ✔
A:176 [LEU] 1:1788 [G] c:176 [LEU] a:1799 [G] ✔
A:38 [LYS] 1:683 [C] c:38 [SER] a:692 [C] ✔
A:38 [LYS] 1:684 [A] c:38 [SER] a:693 [A] ✔
A:38 [LYS] 1:1342 [A] c:38 [SER] a:1354 [A] ✔
A:58 [HIS] 1:1417 [G] c:58 [HIS] a:1429 [G] ✔
A:58 [HIS] 1:1557 [A] c:58 [HIS] a:1566 [A] ✔
A:58 [HIS] 1:1558 [G] c:58 [HIS] a:1567 [G] ✔
A:58 [HIS] 1:1559 [G] c:58 [HIS] a:1568 [G] ✔
A:53 [HIS] 1:1813 [G] c:53 [HIS] a:1824 [G] ✔
A:53 [HIS] 1:1814 [U] c:53 [HIS] a:1825 [U] ✔
A:233 [GLY] 1:2587 [A] c:233 [GLY] a:2598 [A] ✔
A:239 [ASN] 1:1960 [U] c:239 [ASN] a:1971 [U] ✔
A:239 [ASN] 1:2584 [G] c:239 [ASN] a:2595 [G] ✔
A:239 [ASN] 1:2587 [A] c:239 [ASN] a:2598 [A] ✔
A:218 [PRO] 1:755 [A] c:218 [PRO] a:764 [A] ✔
A:218 [PRO] 1:772 [A] c:218 [PRO] a:781 [A] ✔
A:218 [PRO] 1:1778 [A] c:218 [PRO] a:1789 [A] ✔
A:218 [PRO] 1:1779 [U] c:218 [PRO] a:1790 [C] ✔
A:61 [HIS] 1:1559 [G] c:61 [ALA] a:1568 [G] ✔
A:61 [HIS] 1:1560 [A] c:61 [ALA] a:1569 [A] ✔
A:253 [LYS] 1:1783 [A] c:253 [LYS] a:1794 [A] ✔
A:253 [LYS] 1:1784 [C] c:253 [LYS] a:1795 [C] ✔
A:253 [LYS] 1:1785 [U] c:253 [LYS] a:1796 [U] ✔
A:253 [LYS] 1:1813 [G] c:253 [LYS] a:1824 [G] ✔
A:253 [LYS] 1:1814 [U] c:253 [LYS] a:1825 [U] ✔
A:253 [LYS] 1:1832 [C] c:253 [LYS] a:1843 [C] ✔
A:253 [LYS] 1:1890 [A] c:253 [LYS] a:1901 [A] ✔
A:88 [THR] 1:1807 [U] c:88 [SER] a:1818 [U] ✔
A:88 [THR] 1:1809 [U] c:88 [SER] a:1820 [U] ✔
A:88 [THR] 1:1810 [A] c:88 [SER] a:1821 [A] ✔
A:63 [ARG] 1:1558 [G] c:63 [ARG] a:1567 [G] ✔
A:63 [ARG] 1:1559 [G] c:63 [ARG] a:1568 [G] ✔
A:223 [MET] 1:1815 [G] c:223 [THR] a:1826 [G] ✔
A:223 [MET] 1:1816 [U] c:223 [THR] a:1827 [U] ✔
A:198 [GLN] 1:1809 [U] c:198 [ALA] a:1820 [U] ✔
A:146 [LEU] 1:1789 [C] c:146 [MET] a:1800 [C] ✔
A:146 [LEU] 1:1790 [A] c:146 [MET] a:1801 [A] ✔
A:237 [GLY] 1:2579 [A] c:237 [GLY] a:2590 [A] ✔
A:237 [GLY] 1:2580 [C] c:237 [GLY] a:2591 [C] ✔
A:262 [ARG] 1:1790 [A] c:262 [ARG] a:1801 [A] ✔
A:262 [ARG] 1:2216 [C] c:262 [ARG] a:2227 [A] ✔
A:74 [VAL] 1:1478 [A] c:74 [ILE] a:1490 [A] ✔
A:15 [PHE] 1:1762 [A] c:15 [HIS] a:1773 [A] ✔
A:15 [PHE] 1:1780 [A] c:15 [HIS] a:1791 [A] ✔
A:15 [PHE] 1:1818 [A] c:15 [HIS] a:1829 [A] ✔
A:15 [PHE] 1:1819 [U] c:15 [HIS] a:1830 [C] ✔
A:238 [ARG] 1:1776 [A] c:238 [ARG] a:1787 [A] ✔
A:238 [ARG] 1:1777 [C] c:238 [ARG] a:1788 [C] ✔
A:238 [ARG] 1:1960 [U] c:238 [ARG] a:1971 [U] ✔
A:238 [ARG] 1:1961 [G] c:238 [ARG] a:1972 [G] ✔
A:238 [ARG] 1:2579 [A] c:238 [ARG] a:2590 [A] ✔
A:238 [ARG] 1:2580 [C] c:238 [ARG] a:2591 [C] ✔
A:26 [LYS] 1:1555 [C] c:26 [LYS] a:1564 [C] ✔
A:26 [LYS] 1:1558 [G] c:26 [LYS] a:1567 [G] ✔
A:37 [LYS] 1:1805 [C] c:37 [ASN] a:1816 [C] ✔
A:86 [SER] 1:1806 [G] c:86 [ASN] a:1817 [G] ✔
A:200 [ASN] 1:1809 [U] c:200 [HIS] a:1820 [U] ✔
A:200 [ASN] 1:1810 [A] c:200 [HIS] a:1821 [A] ✔
A:185 [HIS] 1:2211 [A] c:185 [GLU] a:2222 [C] ✔
A:263 [THR] 1:1789 [C] c:263 [THR] a:1800 [C] ✔
A:153 [GLN] 1:1788 [G] c:153 [GLN] a:1799 [G] ✔
A:153 [GLN] 1:1789 [C] c:153 [GLN] a:1800 [C] ✔
A:153 [GLN] 1:1790 [A] c:153 [GLN] a:1801 [A] ✔
A:153 [GLN] 1:1807 [U] c:153 [GLN] a:1818 [U] ✔
A:171 [TYR] 1:2211 [A] c:171 [TYR] a:2222 [C] ✔
A:171 [TYR] 1:2212 [G] c:171 [TYR] a:2223 [G] ✔
A:226 [ASN] 1:774 [A] c:226 [ASN] a:783 [A] ✔
A:226 [ASN] 1:775 [G] c:226 [ASN] a:784 [G] ✔
A:199 [GLU] 1:1809 [U] c:199 [GLU] a:1820 [U] ✔
A:235 [GLY] 1:2587 [A] c:235 [GLY] a:2598 [A] ✔
A:235 [GLY] 1:2588 [G] c:235 [GLY] a:2599 [G] ✔
A:60 [GLN] 1:1558 [G] c:60 [GLN] a:1567 [G] ✔
A:60 [GLN] 1:1559 [G] c:60 [GLN] a:1568 [G] ✔
A:178 [SER] 1:1788 [G] c:178 [SER] a:1799 [G] ✔
A:178 [SER] 1:1808 [A] c:178 [SER] a:1819 [A] ✔
A:231 [PRO] 1:2064 [U] c:231 [PRO] a:2075 [U] ✔
A:231 [PRO] 1:2228 [G] c:231 [PRO] a:2239 [G] ✔
A:46 [ASN] 1:764 [U] c:46 [ASN] a:773 [U] ✔
A:46 [ASN] 1:765 [A] c:46 [ASN] a:774 [G] ✔
A:46 [ASN] 1:1795 [C] c:46 [ASN] a:1806 [C] ✔
A:46 [ASN] 1:1796 [G] c:46 [ASN] a:1807 [G] ✔
A:46 [ASN] 1:1800 [G] c:46 [ASN] a:1811 [G] ✔
A:207 [LYS] 1:720 [G] c:207 [LYS] a:729 [G] ✔
A:207 [LYS] 1:754 [G] c:207 [LYS] a:763 [G] ✔
A:207 [LYS] 1:755 [A] c:207 [LYS] a:764 [A] ✔
A:207 [LYS] 1:1779 [U] c:207 [LYS] a:1790 [C] ✔
A:207 [LYS] 1:1780 [A] c:207 [LYS] a:1791 [A] ✔
A:225 [MET] 1:773 [A] c:225 [MET] a:782 [A] ✔
A:96 [TYR] 1:1489 [G] c:96 [TYR] a:1501 [G] ✔
A:8 [PRO] 1:1684 [U] c:8 [PRO] a:1693 [U] ✔
A:8 [PRO] 1:1685 [C] c:8 [PRO] a:1694 [C] ✔
A:8 [PRO] 1:1686 [G] c:8 [PRO] a:1695 [G] ✔
A:220 [VAL] 1:772 [A] c:220 [VAL] a:781 [A] ✔
A:220 [VAL] 1:773 [A] c:220 [VAL] a:782 [A] ✔
A:220 [VAL] 1:1777 [C] c:220 [VAL] a:1788 [C] ✔
A:220 [VAL] 1:1778 [A] c:220 [VAL] a:1789 [A] ✔
A:220 [VAL] 1:1815 [G] c:220 [VAL] a:1826 [G] ✔
A:248 [TRP] 1:1793 [C] c:248 [TRP] a:1804 [C] ✔
A:248 [TRP] 1:1794 [A] c:248 [TRP] a:1805 [A] ✔
A:248 [TRP] 1:1795 [C] c:248 [TRP] a:1806 [C] ✔
A:248 [TRP] 1:1813 [G] c:248 [TRP] a:1824 [G] ✔
A:248 [TRP] 1:2228 [G] c:248 [TRP] a:2239 [G] ✔
A:267 [ILE] 1:1788 [G] c:267 [ILE] a:1799 [G] ✔
A:271 [ARG] 1:1786 [C] c:271 [ARG] a:1797 [G] ✔
A:271 [ARG] 1:1787 [U] c:271 [ARG] a:1798 [U] ✔
A:271 [ARG] 1:1808 [A] c:271 [ARG] a:1819 [A] ✔
A:9 [THR] 1:696 [A] c:9 [THR] a:705 [A] ✔
A:9 [THR] 1:718 [A] c:9 [THR] a:727 [A] ✔
A:9 [THR] 1:719 [G] c:9 [THR] a:728 [G] ✔
A:9 [THR] 1:1686 [G] c:9 [THR] a:1695 [G] ✔
A:156 [ARG] 1:1806 [G] c:156 [ARG] a:1817 [G] ✔
A:156 [ARG] 1:1807 [U] c:156 [ARG] a:1818 [U] ✔
A:156 [ARG] 1:1808 [A] c:156 [ARG] a:1819 [A] ✔
A:55 [GLY] 1:682 [C] c:55 [GLY] a:691 [C] ✔
A:55 [GLY] 1:683 [C] c:55 [GLY] a:692 [C] ✔
A:56 [GLY] 1:682 [C] c:56 [GLY] a:691 [C] ✔
A:56 [GLY] 1:683 [C] c:56 [GLY] a:692 [C] ✔
A:44 [ASN] 1:1794 [A] c:44 [ASN] a:1805 [A] ✔
A:44 [ASN] 1:1795 [C] c:44 [ASN] a:1806 [C] ✔
A:44 [ASN] 1:1800 [G] c:44 [ASN] a:1811 [G] ✔
A:44 [ASN] 1:1801 [U] c:44 [ASN] a:1812 [U] ✔
A:44 [ASN] 1:1802 [G] c:44 [ASN] a:1813 [G] ✔
A:150 [LYS] 1:1789 [C] c:150 [LYS] a:1800 [C] ✔
A:150 [LYS] 1:1790 [A] c:150 [LYS] a:1801 [A] ✔
A:150 [LYS] 1:2192 [U] c:150 [LYS] a:2203 [U] ✔
A:150 [LYS] 1:2193 [G] c:150 [LYS] a:2204 [G] ✔
A:150 [LYS] 1:2194 [U] c:150 [LYS] a:2205 [A] ✔
A:221 [ARG] 1:1777 [C] c:221 [ARG] a:1788 [C] ✔
A:221 [ARG] 1:1778 [A] c:221 [ARG] a:1789 [A] ✔
A:221 [ARG] 1:1815 [G] c:221 [ARG] a:1826 [G] ✔
A:221 [ARG] 1:1816 [U] c:221 [ARG] a:1827 [U] ✔
A:221 [ARG] 1:1817 [G] c:221 [ARG] a:1828 [G] ✔
A:85 [PRO] 1:1558 [G] c:85 [PRO] a:1567 [G] ✔
A:85 [PRO] 1:1559 [G] c:85 [PRO] a:1568 [G] ✔
A:68 [LYS] 1:2194 [U] c:68 [LYS] a:2205 [A] ✔
A:95 [LYS] 1:1489 [G] c:95 [LEU] a:1501 [G] ✔
A:95 [LYS] 1:1490 [G] c:95 [LEU] a:1502 [A] ✔
A:246 [SER] 1:1813 [G] c:246 [THR] a:1824 [G] ✔
A:246 [SER] 1:1814 [U] c:246 [THR] a:1825 [U] ✔
A:29 [PRO] 1:1559 [G] c:29 [PRO] a:1568 [G] ✔
A:83 [TYR] 1:1556 [C] c:83 [TYR] a:1565 [C] ✔
A:83 [TYR] 1:1557 [A] c:83 [TYR] a:1566 [A] ✔
A:83 [TYR] 1:1558 [G] c:83 [TYR] a:1567 [G] ✔
A:224 [ALA] 1:773 [A] c:224 [ALA] a:782 [A] ✔
A:224 [ALA] 1:774 [A] c:224 [ALA] a:783 [A] ✔
A:224 [ALA] 1:1777 [C] c:224 [ALA] a:1788 [C] ✔
A:224 [ALA] 1:1778 [A] c:224 [ALA] a:1789 [A] ✔
A:42 [GLY] 1:1802 [G] c:42 [GLY] a:1813 [G] ✔
A:42 [GLY] 1:1803 [G] c:42 [GLY] a:1814 [G] ✔
A:32 [PRO] 1:1412 [A] c:32 [PRO] a:1424 [G] ✔
A:230 [HIS] 1:1813 [G] c:230 [HIS] a:1824 [G] ✔
A:230 [HIS] 1:1814 [U] c:230 [HIS] a:1825 [U] ✔
A:256 [LYS] 1:1786 [C] c:256 [LYS] a:1797 [G] ✔
A:256 [LYS] 1:1787 [U] c:256 [LYS] a:1798 [U] ✔
A:256 [LYS] 1:1832 [C] c:256 [LYS] a:1843 [C] ✔
A:256 [LYS] 1:1833 [U] c:256 [LYS] a:1844 [C] ✔
A:256 [LYS] 1:1834 [G] c:256 [LYS] a:1845 [G] ✔
A:219 [THR] 1:1778 [A] c:219 [THR] a:1789 [A] ✔
A:219 [THR] 1:1779 [U] c:219 [THR] a:1790 [C] ✔
A:219 [THR] 1:1814 [U] c:219 [THR] a:1825 [U] ✔
A:203 [ARG] 1:1781 [G] c:203 [ARG] a:1792 [G] ✔
A:242 [ILE] 1:1891 [C] c:242 [LYS] a:1902 [C] ✔
A:242 [ILE] 1:1892 [G] c:242 [LYS] a:1903 [G] ✔
A:242 [ILE] 1:2064 [U] c:242 [LYS] a:2075 [U] ✔
A:67 [PHE] 1:1806 [G] c:67 [PHE] a:1817 [G] ✔
A:45 [ASN] 1:1358 [C] c:45 [ASN] a:1370 [C] ✔
A:45 [ASN] 1:1359 [G] c:45 [ASN] a:1371 [G] ✔
A:45 [ASN] 1:1800 [G] c:45 [ASN] a:1811 [G] ✔
A:45 [ASN] 1:1801 [U] c:45 [ASN] a:1812 [U] ✔
A:240 [LYS] 1:1815 [G] c:240 [PHE] a:1826 [G] ✔
A:240 [LYS] 1:1891 [C] c:240 [PHE] a:1902 [C] ✔
A:240 [LYS] 1:1892 [G] c:240 [PHE] a:1903 [G] ✔
A:240 [LYS] 1:1960 [U] c:240 [PHE] a:1971 [U] ✔
A:27 [GLY] 1:1558 [G] c:27 [GLY] a:1567 [G] ✔
A:36 [ALA] 1:1560 [A] c:36 [LYS] a:1569 [A] ✔
A:36 [ALA] 1:1561 [A] c:36 [LYS] a:1570 [A] ✔
A:254 [GLY] 1:1785 [U] c:254 [GLY] a:1796 [U] ✔
A:254 [GLY] 1:1786 [C] c:254 [GLY] a:1797 [G] ✔
A:254 [GLY] 1:1832 [C] c:254 [GLY] a:1843 [C] ✔
A:254 [GLY] 1:1833 [U] c:254 [GLY] a:1844 [C] ✔
A:148 [ILE] 1:2193 [G] c:148 [PRO] a:2204 [G] ✔
A:148 [ILE] 1:2194 [U] c:148 [PRO] a:2205 [A] ✔
A:43 [ARG] 1:681 [U] c:43 [ARG] a:690 [G] ✔
A:43 [ARG] 1:682 [C] c:43 [ARG] a:691 [C] ✔
A:43 [ARG] 1:770 [U] c:43 [ARG] a:779 [U] ✔
A:43 [ARG] 1:771 [G] c:43 [ARG] a:780 [G] ✔
A:43 [ARG] 1:1802 [G] c:43 [ARG] a:1813 [G] ✔
A:222 [GLY] 1:1814 [U] c:222 [GLY] a:1825 [U] ✔
A:222 [GLY] 1:1815 [G] c:222 [GLY] a:1826 [G] ✔
A:234 [GLY] 1:2587 [A] c:234 [GLY] a:2598 [A] ✔
A:234 [GLY] 1:2588 [G] c:234 [GLY] a:2599 [G] ✔
A:154 [LEU] 1:1788 [G] c:154 [LEU] a:1799 [G] ✔
A:154 [LEU] 1:1807 [U] c:154 [LEU] a:1818 [U] ✔
A:154 [LEU] 1:1808 [A] c:154 [LEU] a:1819 [A] ✔
A:229 [ASP] 1:771 [G] c:229 [ASP] a:780 [G] ✔
A:229 [ASP] 1:773 [A] c:229 [ASP] a:782 [A] ✔
A:211 [ALA] 1:1780 [A] c:211 [ALA] a:1791 [A] ✔
A:41 [GLY] 1:682 [C] c:41 [GLY] a:691 [C] ✔
A:41 [GLY] 1:683 [C] c:41 [GLY] a:692 [C] ✔
A:100 [GLU] 1:1479 [G] c:100 [GLU] a:1491 [G] ✔
A:100 [GLU] 1:1488 [G] c:100 [GLU] a:1500 [G] ✔
A:182 [ARG] 1:1788 [G] c:182 [ARG] a:1799 [G] ✔
A:182 [ARG] 1:1789 [C] c:182 [ARG] a:1800 [C] ✔
A:14 [ARG] 1:1684 [U] c:14 [ARG] a:1693 [U] ✔
A:14 [ARG] 1:1685 [C] c:14 [ARG] a:1694 [C] ✔
A:14 [ARG] 1:1686 [G] c:14 [ARG] a:1695 [G] ✔
A:14 [ARG] 1:1762 [A] c:14 [ARG] a:1773 [A] ✔
A:14 [ARG] 1:1818 [A] c:14 [ARG] a:1829 [A] ✔
A:14 [ARG] 1:1966 [A] c:14 [ARG] a:1977 [A] ✔
A:47 [GLY] 1:763 [A] c:47 [GLY] a:772 [C] ✔
A:47 [GLY] 1:764 [U] c:47 [GLY] a:773 [U] ✔
A:47 [GLY] 1:770 [U] c:47 [GLY] a:779 [U] ✔
A:259 [THR] 1:2074 [U] c:259 [SER] a:2085 [U] ✔
A:50 [THR] 1:1793 [C] c:50 [THR] a:1804 [C] ✔
A:50 [THR] 1:1794 [A] c:50 [THR] a:1805 [A] ✔
A:50 [THR] 1:1795 [C] c:50 [THR] a:1806 [C] ✔
A:50 [THR] 1:1801 [U] c:50 [THR] a:1812 [U] ✔
A:50 [THR] 1:1802 [G] c:50 [THR] a:1813 [G] ✔
A:214 [ARG] 1:1557 [A] c:214 [ARG] a:1566 [A] ✔
A:7 [LYS] 1:696 [A] c:7 [LYS] a:705 [A] ✔
A:7 [LYS] 1:697 [A] c:7 [LYS] a:706 [A] ✔
A:7 [LYS] 1:1686 [G] c:7 [LYS] a:1695 [G] ✔
A:10 [SER] 1:719 [G] c:10 [SER] a:728 [G] ✔
A:10 [SER] 1:720 [G] c:10 [SER] a:729 [G] ✔
A:10 [SER] 1:721 [A] c:10 [SER] a:730 [A] ✔
A:101 [ARG] 1:1488 [G] c:101 [ARG] a:1500 [G] ✔
A:101 [ARG] 1:1489 [G] c:101 [ARG] a:1501 [G] ✔
A:147 [LYS] 1:2191 [C] c:147 [LYS] a:2202 [U] ✔
A:147 [LYS] 1:2193 [G] c:147 [LYS] a:2204 [G] ✔
A:25 [HIS] 1:1558 [G] c:25 [HIS] a:1567 [G] ✔
A:213 [TRP] 1:755 [A] c:213 [TRP] a:764 [A] ✔
A:213 [TRP] 1:1557 [A] c:213 [TRP] a:1566 [A] ✔
A:40 [THR] 1:682 [C] c:40 [SER] a:691 [C] ✔
A:40 [THR] 1:683 [C] c:40 [SER] a:692 [C] ✔
A:40 [THR] 1:1802 [G] c:40 [SER] a:1813 [G] ✔
A:40 [THR] 1:1803 [G] c:40 [SER] a:1814 [G] ✔
A:13 [ARG] 1:718 [A] c:13 [ARG] a:727 [A] ✔
A:13 [ARG] 1:719 [G] c:13 [ARG] a:728 [G] ✔
A:13 [ARG] 1:720 [G] c:13 [ARG] a:729 [G] ✔
A:97 [ALA] 1:1478 [A] c:97 [LYS] a:1490 [A] ✔
A:97 [ALA] 1:1489 [G] c:97 [LYS] a:1501 [G] ✔
A:35 [GLU] 1:1561 [A] c:35 [GLU] a:1570 [A] ✔
A:35 [GLU] 1:1805 [C] c:35 [GLU] a:1816 [C] ✔
A:35 [GLU] 1:2202 [U] c:35 [GLU] a:2213 [U] ✔
A:18 [LYS] 1:1556 [C] c:18 [LYS] a:1565 [C] ✔
A:257 [THR] 1:1786 [C] c:257 [THR] a:1797 [G] ✔
A:257 [THR] 1:1787 [U] c:257 [THR] a:1798 [U] ✔
A:257 [THR] 1:1792 [A] c:257 [THR] a:1803 [A] ✔
A:257 [THR] 1:1793 [C] c:257 [THR] a:1804 [C] ✔
A:258 [ARG] 1:1786 [C] c:258 [ARG] a:1797 [G] ✔
A:258 [ARG] 1:1787 [U] c:258 [ARG] a:1798 [U] ✔
A:258 [ARG] 1:1788 [G] c:258 [ARG] a:1799 [G] ✔
A:258 [ARG] 1:1789 [C] c:258 [ARG] a:1800 [C] ✔
A:258 [ARG] 1:1792 [A] c:258 [ARG] a:1803 [A] ✔
A:245 [VAL] 1:1813 [G] c:245 [VAL] a:1824 [G] ✔
A:245 [VAL] 1:1814 [U] c:245 [VAL] a:1825 [U] ✔
A:51 [THR] 1:1802 [G] c:51 [THR] a:1813 [G] ✔
A:51 [THR] 1:1803 [G] c:51 [THR] a:1814 [G] ✔
A:51 [THR] 1:1812 [G] c:51 [THR] a:1823 [G] ✔
A:241 [GLY] 1:1891 [C] c:241 [GLY] a:1902 [C] ✔
A:241 [GLY] 1:1892 [G] c:241 [GLY] a:1903 [G] ✔
A:241 [GLY] 1:2585 [U] c:241 [GLY] a:2596 [U] ✔
A:241 [GLY] 1:2586 [G] c:241 [GLY] a:2597 [G] ✔
A:208 [ALA] 1:720 [G] c:208 [ALA] a:729 [G] ✔
A:208 [ALA] 1:755 [A] c:208 [ALA] a:764 [A] ✔
A:208 [ALA] 1:1779 [U] c:208 [ALA] a:1790 [C] ✔
A:208 [ALA] 1:1780 [A] c:208 [ALA] a:1791 [A] ✔
A:212 [ARG] 1:682 [C] c:212 [ARG] a:691 [C] ✔
A:212 [ARG] 1:755 [A] c:212 [ARG] a:764 [A] ✔
A:212 [ARG] 1:772 [A] c:212 [ARG] a:781 [A] ✔
A:39 [ARG] 1:683 [C] c:39 [LYS] a:692 [C] ✔
A:39 [ARG] 1:684 [A] c:39 [LYS] a:693 [A] ✔
A:255 [TYR] 1:1785 [U] c:255 [LYS] a:1796 [U] ✔
A:255 [TYR] 1:1786 [C] c:255 [LYS] a:1797 [G] ✔
A:255 [TYR] 1:1832 [C] c:255 [LYS] a:1843 [C] ✔
A:255 [TYR] 1:1833 [U] c:255 [LYS] a:1844 [C] ✔
A:205 [LEU] 1:1780 [A] c:205 [LEU] a:1791 [A] ✔
A:205 [LEU] 1:1781 [G] c:205 [LEU] a:1792 [G] ✔
A:244 [PRO] 1:1814 [U] c:244 [PRO] a:1825 [U] ✔
A:244 [PRO] 1:1890 [A] c:244 [PRO] a:1901 [A] ✔
A:244 [PRO] 1:1891 [C] c:244 [PRO] a:1902 [C] ✔
A:201 [ASN] 1:1809 [U] c:201 [MET] a:1820 [U] ✔
A:158 [ALA] 1:1809 [U] c:158 [ALA] a:1820 [U] ✔
A:155 [ALA] 1:1788 [G] c:155 [ALA] a:1799 [G] ✔
A:155 [ALA] 1:1807 [U] c:155 [ALA] a:1818 [U] ✔
A:155 [ALA] 1:1808 [A] c:155 [ALA] a:1819 [A] ✔
A:236 [GLU] 1:2429 [C] c:236 [GLU] a:2440 [C] ✔
A:236 [GLU] 1:2588 [G] c:236 [GLU] a:2599 [G] ✔
A:236 [GLU] 1:2589 [A] c:236 [GLU] a:2600 [A] ✔
A:59 [LYS] 1:685 [U] c:59 [LYS] a:694 [U] ✔
A:59 [LYS] 1:1558 [G] c:59 [LYS] a:1567 [G] ✔
A:59 [LYS] 1:1559 [G] c:59 [LYS] a:1568 [G] ✔
A:59 [LYS] 1:1560 [A] c:59 [LYS] a:1569 [A] ✔
A:52 [ARG] 1:1812 [G] c:52 [ARG] a:1823 [G] ✔
A:52 [ARG] 1:1813 [G] c:52 [ARG] a:1824 [G] ✔
A:52 [ARG] 1:1814 [U] c:52 [ARG] a:1825 [U] ✔
A:54 [VAL] 1:1812 [G] c:54 [ILE] a:1823 [G] ✔
A:180 [GLU] 1:1788 [G] c:180 [GLU] a:1799 [G] ✔
A:12 [GLY] 1:720 [G] c:12 [GLY] a:729 [G] ✔
A:12 [GLY] 1:1763 [C] c:12 [GLY] a:1774 [C] ✔
A:251 [LYS] 1:1831 [G] c:251 [GLN] a:1842 [G] ✔
A:251 [LYS] 1:1832 [C] c:251 [GLN] a:1843 [C] ✔
A:227 [PRO] 1:2062 [C] c:227 [PRO] a:2073 [C] ✔
A:227 [PRO] 1:2063 [U] c:227 [PRO] a:2074 [U] ✔
A:227 [PRO] 1:2587 [A] c:227 [PRO] a:2598 [A] ✔
A:227 [PRO] 1:2588 [G] c:227 [PRO] a:2599 [G] ✔
A:149 [GLY] 1:2193 [G] c:149 [GLY] a:2204 [G] ✔
A:149 [GLY] 1:2194 [U] c:149 [GLY] a:2205 [A] ✔
A:157 [SER] 1:1807 [U] c:157 [SER] a:1818 [U] ✔
A:157 [SER] 1:1808 [A] c:157 [SER] a:1819 [A] ✔
A:157 [SER] 1:1809 [U] c:157 [SER] a:1820 [U] ✔
A:157 [SER] 1:1810 [A] c:157 [SER] a:1821 [A] ✔
A:261 [LYS] 1:2075 [U] c:261 [LYS] a:2086 [U] ✔
A:261 [LYS] 1:2216 [C] c:261 [LYS] a:2227 [A] ✔
A:261 [LYS] 1:2217 [G] c:261 [LYS] a:2228 [G] ✔
A:232 [HIS] 1:1814 [U] c:232 [HIS] a:1825 [U] ✔
A:232 [HIS] 1:1815 [G] c:232 [HIS] a:1826 [G] ✔
A:204 [SER] 1:1780 [A] c:204 [VAL] a:1791 [A] ✔
A:204 [SER] 1:1781 [G] c:204 [VAL] a:1792 [G] ✔
A:98 [ASP] 1:1489 [G] c:98 [ASP] a:1501 [G] ❌ 7K00_c_a
A:239 [ASN] 1:1892 [G] c:239 [ASN] a:1903 [G] ❌ 7K00_c_a
A:239 [ASN] 1:2586 [G] c:239 [ASN] a:2597 [G] ❌ 7K00_c_a
A:61 [HIS] 1:1561 [A] c:61 [ALA] a:1570 [A] ❌ 7K00_c_a
A:223 [MET] 1:1960 [U] c:223 [THR] a:1971 [U] ❌ 7K00_c_a
A:15 [PHE] 1:1684 [U] c:15 [HIS] a:1693 [U] ❌ 7K00_c_a
A:86 [SER] 1:1805 [C] c:86 [ASN] a:1816 [C] ❌ 7K00_c_a
A:185 [HIS] 1:2212 [G] c:185 [GLU] a:2223 [G] ❌ 7K00_c_a
A:263 [THR] 1:1788 [G] c:263 [THR] a:1799 [G] ❌ 7K00_c_a
A:60 [GLN] 1:1557 [A] c:60 [GLN] a:1566 [A] ❌ 7K00_c_a
A:220 [VAL] 1:1814 [U] c:220 [VAL] a:1825 [U] ❌ 7K00_c_a
A:267 [ILE] 1:1789 [C] c:267 [ILE] a:1800 [C] ❌ 7K00_c_a
A:203 [ARG] 1:1557 [A] c:203 [ARG] a:1566 [A] ❌ 7K00_c_a
A:67 [PHE] 1:1807 [U] c:67 [PHE] a:1818 [U] ❌ 7K00_c_a
A:148 [ILE] 1:2210 [G] c:148 [PRO] a:2221 [G] ❌ 7K00_c_a
A:148 [ILE] 1:2211 [A] c:148 [PRO] a:2222 [C] ❌ 7K00_c_a
A:259 [THR] 1:1792 [A] c:259 [SER] a:1803 [A] ❌ 7K00_c_a
A:259 [THR] 1:2217 [G] c:259 [SER] a:2228 [G] ❌ 7K00_c_a
A:147 [LYS] 1:1790 [A] c:147 [LYS] a:1801 [A] ❌ 7K00_c_a
A:147 [LYS] 1:2192 [U] c:147 [LYS] a:2203 [U] ❌ 7K00_c_a
A:40 [THR] 1:1805 [C] c:40 [SER] a:1816 [C] ❌ 7K00_c_a
A:18 [LYS] 1:1555 [C] c:18 [LYS] a:1564 [C] ❌ 7K00_c_a
A:236 [GLU] 1:2587 [A] c:236 [GLU] a:2598 [A] ❌ 7K00_c_a
A:261 [LYS] 1:2074 [U] c:261 [LYS] a:2085 [U] ❌ 7K00_c_a
A:146 [LEU] 1:1788 [G] c:146 [MET] a:1799 [G] ❌ 6YSI_A_1
A:147 [LYS] 1:2210 [G] c:147 [LYS] a:2221 [G] ❌ 6YSI_A_1
A:156 [ARG] 1:1805 [C] c:156 [ARG] a:1816 [C] ❌ 6YSI_A_1
A:160 [ALA] 1:1809 [U] c:160 [THR] a:1820 [U] ❌ 6YSI_A_1
A:203 [ARG] 1:1810 [A] c:203 [ARG] a:1821 [A] ❌ 6YSI_A_1
A:208 [ALA] 1:1763 [C] c:208 [ALA] a:1774 [C] ❌ 6YSI_A_1
A:213 [TRP] 1:1556 [C] c:213 [TRP] a:1565 [C] ❌ 6YSI_A_1
A:219 [THR] 1:1817 [G] c:219 [THR] a:1828 [G] ❌ 6YSI_A_1
A:221 [ARG] 1:1776 [A] c:221 [ARG] a:1787 [A] ❌ 6YSI_A_1
A:228 [ILE] 1:2063 [U] c:228 [VAL] a:2074 [U] ❌ 6YSI_A_1
A:239 [ASN] 1:2588 [G] c:239 [ASN] a:2599 [G] ❌ 6YSI_A_1
A:240 [LYS] 1:1814 [U] c:240 [PHE] a:1825 [U] ❌ 6YSI_A_1
A:240 [LYS] 1:2586 [G] c:240 [PHE] a:2597 [G] ❌ 6YSI_A_1
A:240 [LYS] 1:2587 [A] c:240 [PHE] a:2598 [A] ❌ 6YSI_A_1
A:242 [ILE] 1:2585 [U] c:242 [LYS] a:2596 [U] ❌ 6YSI_A_1
A:242 [ILE] 1:2586 [G] c:242 [LYS] a:2597 [G] ❌ 6YSI_A_1
A:242 [ILE] 1:2587 [A] c:242 [LYS] a:2598 [A] ❌ 6YSI_A_1
A:252 [ALA] 1:1812 [G] c:252 [THR] a:1823 [G] ❌ 6YSI_A_1
A:260 [ASN] 1:1790 [A] c:260 [ASN] a:1801 [A] ❌ 6YSI_A_1
A:265 [LYS] 1:2212 [G] c:265 [LYS] a:2223 [G] ❌ 6YSI_A_1
A:271 [ARG] 1:1788 [G] c:271 [ARG] a:1799 [G] ❌ 6YSI_A_1
A:36 [ALA] 1:1342 [A] c:36 [LYS] a:1354 [A] ❌ 6YSI_A_1
A:45 [ASN] 1:1802 [G] c:45 [ASN] a:1813 [G] ❌ 6YSI_A_1
A:46 [ASN] 1:1358 [C] c:46 [ASN] a:1370 [C] ❌ 6YSI_A_1
A:51 [THR] 1:1793 [C] c:51 [THR] a:1804 [C] ❌ 6YSI_A_1
A:54 [VAL] 1:1803 [G] c:54 [ILE] a:1814 [G] ❌ 6YSI_A_1
A:54 [VAL] 1:682 [C] c:54 [ILE] a:691 [C] ❌ 6YSI_A_1
A:9 [THR] 1:721 [A] c:9 [THR] a:730 [A] ❌ 6YSI_A_1
A:95 [LYS] 1:1488 [G] c:95 [LEU] a:1500 [G] ❌ 6YSI_A_1
A:99 [GLY] 1:1479 [G] c:99 [GLY] a:1491 [G] ❌ 6YSI_A_1
A:38 [LYS] 1:1343 [G] c:38 [SER] a:1355 [G] ❌ 7K00_a:1355 no longer at interface
A:240 [LYS] 1:1959 [A] c:240 [PHE] a:1970 [A] ❌ 7K00_a:1970 no longer at interface
A:208 [ALA] 1:1764 [U] c:208 [ALA] a:1775 [U] ❌ 6YSI_1:1764 no longer at interface
A:236 [GLU] 1:2428 [A] c:236 [GLU] a:2439 [A] ❌ 6YSI_1:2428 no longer at interface
A:239 [ASN] 1:2583 [C] c:239 [ASN] a:2594 [C] ❌ 6YSI_1:2583 no longer at interface
A:253 [LYS] 1:1889 [A] c:253 [LYS] a:1900 [A] ❌ 6YSI_1:1889 no longer at interface
A:265 [LYS] 1:2215 [C] c:265 [LYS] a:2226 [C] ❌ 6YSI_1:2215 no longer at interface
A:36 [ALA] 1:1341 [A] c:36 [LYS] a:1353 [A] ❌ 6YSI_1:1341 no longer at interface
A:48 [HIS] 1:768 [G] c:48 [ARG] a:777 [G] ❌ 6YSI_1:768 no longer at interface
A:48 [HIS] 1:766 [G] c:48 [ARG] a:775 [G] ❌ 6YSI_1:766 no longer at interface
A:98 [ASP] 1:1477 [U] c:98 [ASP] a:1489 [C] ❌ 6YSI_1:1477 no longer at interface
A:272 [ARG] 1:1786 [C] c:272 [SER] a:1797 [G] ❌ 7K00_c:272 no longer at interface
A:272 [ARG] 1:1787 [U] c:272 [SER] a:1798 [U] ❌ 7K00_c:272 no longer at interface
A:4 [GLN] 1:697 [A] c:4 [VAL] a:706 [A] ❌ 7K00_c:4 no longer at interface
A:250 [GLN] 1:1792 [A] c:250 [VAL] a:1803 [A] ❌ 7K00_c:250 no longer at interface
A:250 [GLN] 1:1793 [C] c:250 [VAL] a:1804 [C] ❌ 7K00_c:250 no longer at interface
A:250 [GLN] 1:1813 [G] c:250 [VAL] a:1824 [G] ❌ 7K00_c:250 no longer at interface
A:194 [GLU] 1:1809 [U] c:194 [GLU] a:1820 [U] ❌ 7K00_c:194 no longer at interface
A:197 [ASN] 1:1809 [U] c:197 [ASN] a:1820 [U] ❌ 6YSI_A:197 no longer at interface
A:20 [VAL] 1:1556 [C] c:20 [VAL] a:1565 [C] ❌ 6YSI_A:20 no longer at interface
A:249 [GLY] 1:2228 [G] c:249 [GLY] a:2239 [G] ❌ 6YSI_A:249 no longer at interface
A:270 [ASP] 1:1787 [U] c:270 [ARG] a:1798 [U] ❌ 6YSI_A:270 no longer at interface
A:270 [ASP] 1:1788 [G] c:270 [ARG] a:1799 [G] ❌ 6YSI_A:270 no longer at interface
A:28 [ALA] 1:1559 [G] c:28 [LYS] a:1568 [G] ❌ 6YSI_A:28 no longer at interface
A:28 [ALA] 1:1417 [G] c:28 [LYS] a:1429 [G] ❌ 6YSI_A:28 no longer at interface

logo_download Export the table of contacts

Properties of this pair

Common ECOD label(s)
 Common RFAM label(s)
 Interface TM-score
 Interface RMSD
 Percentage identity
 Protein TM-score
 RNA TM-score
 Protein coverage
 RNA coverage
 Percentage conservation
 Apolar conservation
 H-bond conservation
 Percentage switching out
Nucleic acid-binding proteins & SH3 Bacterial large subunit ribosomal RNA 1.0 0.5 0.76 0.99 1.0 0.97 0.98 0.94 0.92 0.65 0.32


Other pairs involving 6YSI_A_1 or 7K00_c_a

Total number of entries: 21

Interface 1 Interface 2 Percentage conservation
 		Interface TM-score
 		Interface RMSD
 		Percentage identity
 		Common ECOD label(s)
 		Common RFAM label(s)
 		Explore both interfaces
6S0Z_C_A 6YSI_A_1 0.86 0.98 0.99 0.57 Nucleic acid-binding proteins & SH3 Bacterial large subunit ribosomal RNA compare
1VQ8_A_0 6YSI_A_1 0.59 0.91 3.39 0.23 Nucleic acid-binding proteins & SH3 compare
1JJ2_A_0 6YSI_A_1 0.59 0.91 3.41 0.23 Nucleic acid-binding proteins & SH3 compare
6AZ3_A_1,2 6YSI_A_1 0.62 0.76 3.84 0.22 Nucleic acid-binding proteins & SH3 compare
4Y4O_1D_1A 6YSI_A_1 0.86 0.97 1.15 0.57 Nucleic acid-binding proteins & SH3 Bacterial large subunit ribosomal RNA compare
6AZ3_A_3 6YSI_A_1 0.31 0.54 3.47 0.05 Nucleic acid-binding proteins & SH3 compare
1YHQ_A_0 6YSI_A_1 0.58 0.91 3.28 0.23 Nucleic acid-binding proteins & SH3 compare
6YSI_A_1 7K00_c_a 0.94 1.0 0.5 0.76 Nucleic acid-binding proteins & SH3 Bacterial large subunit ribosomal RNA compare
6S0Z_C_A 7K00_c_a 0.85 0.98 1.04 0.61 Nucleic acid-binding proteins & SH3 Bacterial large subunit ribosomal RNA compare
1VQ8_A_0 7K00_c_a 0.61 0.9 3.27 0.25 Nucleic acid-binding proteins & SH3 compare
1JJ2_A_0 7K00_c_a 0.60 0.9 3.39 0.26 Nucleic acid-binding proteins & SH3 compare
6AZ3_A_1,2 7K00_c_a 0.62 0.77 3.84 0.22 Nucleic acid-binding proteins & SH3 compare
4Y4O_1D_1A 7K00_c_a 0.85 0.97 0.98 0.63 Nucleic acid-binding proteins & SH3 Bacterial large subunit ribosomal RNA compare
6AZ3_A_3 7K00_c_a 0.44 0.7 3.69 0.1 Nucleic acid-binding proteins & SH3 compare
1YHQ_A_0 7K00_c_a 0.61 0.9 3.27 0.26 Nucleic acid-binding proteins & SH3 compare
6YSI_A_1 7O7Y_BA_B5 0.60 0.89 3.76 0.21 Nucleic acid-binding proteins & SH3 compare
7K00_c_a 7O7Y_BA_B5 0.60 0.88 3.73 0.23 Nucleic acid-binding proteins & SH3 compare
6YSI_A_1 7OF0_D_A 0.68 0.92 2.67 0.31 Nucleic acid-binding proteins & SH3 Bacterial large subunit ribosomal RNA compare
7K00_c_a 7OF0_D_A 0.69 0.92 2.63 0.4 Nucleic acid-binding proteins & SH3 Bacterial large subunit ribosomal RNA compare
6YSI_A_1 7RYG_C_A 0.96 0.98 1.27 0.98 Nucleic acid-binding proteins & SH3 Bacterial large subunit ribosomal RNA compare
7K00_c_a 7RYG_C_A 0.93 0.99 1.55 0.77 Nucleic acid-binding proteins & SH3 Bacterial large subunit ribosomal RNA compare