RNAprotDB

All interfaces > All interologs > Interface groups > group131 > 6YSI_A_1 vs 7RYG_C_A

Interface analysis


mouse controls

Style

Protein

Cartoon
Licorice
Surface

RNA

Cartoon
Licorice
Surface

Color

Structure
Structure (with hetatm)
Chain
Chainbow

View

Focus on

Interface
RNA
Protein
All

Show chains

Interface

show interface as licorice

Common contacts -

6YSI_A
6YSI_1
7RYG_C
7RYG_A
Conserved?
A:49 [ILE] 1:681 [U] C:49 [ILE] A:688 [U] ✔
A:49 [ILE] 1:770 [U] C:49 [ILE] A:777 [U] ✔
A:49 [ILE] 1:771 [G] C:49 [ILE] A:778 [G] ✔
A:49 [ILE] 1:1794 [A] C:49 [ILE] A:1801 [A] ✔
A:260 [ASN] 1:1789 [C] C:260 [ASN] A:1796 [C] ✔
A:217 [ARG] 1:681 [U] C:217 [ARG] A:688 [U] ✔
A:217 [ARG] 1:682 [C] C:217 [ARG] A:689 [C] ✔
A:217 [ARG] 1:771 [G] C:217 [ARG] A:778 [G] ✔
A:217 [ARG] 1:772 [A] C:217 [ARG] A:779 [A] ✔
A:247 [PRO] 1:1813 [G] C:247 [PRO] A:1820 [G] ✔
A:247 [PRO] 1:1814 [U] C:247 [PRO] A:1821 [U] ✔
A:252 [ALA] 1:1785 [U] C:252 [ALA] A:1792 [U] ✔
A:252 [ALA] 1:1813 [G] C:252 [ALA] A:1820 [G] ✔
A:252 [ALA] 1:1814 [U] C:252 [ALA] A:1821 [U] ✔
A:265 [LYS] 1:2213 [G] C:265 [LYS] A:2220 [G] ✔
A:159 [GLY] 1:1809 [U] C:159 [GLY] A:1816 [U] ✔
A:177 [ARG] 1:1788 [G] C:177 [ARG] A:1795 [G] ✔
A:177 [ARG] 1:1808 [A] C:177 [ARG] A:1815 [A] ✔
A:177 [ARG] 1:1809 [U] C:177 [ARG] A:1816 [U] ✔
A:228 [ILE] 1:775 [G] C:228 [ILE] A:782 [G] ✔
A:228 [ILE] 1:784 [A] C:228 [ILE] A:791 [A] ✔
A:228 [ILE] 1:2062 [C] C:228 [ILE] A:2069 [C] ✔
A:209 [GLY] 1:720 [G] C:209 [GLY] A:727 [G] ✔
A:209 [GLY] 1:755 [A] C:209 [GLY] A:762 [A] ✔
A:62 [TYR] 1:1805 [C] C:62 [TYR] A:1812 [C] ✔
A:62 [TYR] 1:1806 [G] C:62 [TYR] A:1813 [G] ✔
A:243 [GLN] 1:1830 [U] C:243 [GLN] A:1837 [U] ✔
A:243 [GLN] 1:1831 [G] C:243 [GLN] A:1838 [G] ✔
A:243 [GLN] 1:1890 [A] C:243 [GLN] A:1897 [A] ✔
A:243 [GLN] 1:1891 [C] C:243 [GLN] A:1898 [C] ✔
A:160 [ALA] 1:1808 [A] C:160 [ALA] A:1815 [A] ✔
A:11 [PRO] 1:720 [G] C:11 [PRO] A:727 [G] ✔
A:11 [PRO] 1:1762 [A] C:11 [PRO] A:1769 [A] ✔
A:11 [PRO] 1:1763 [C] C:11 [PRO] A:1770 [C] ✔
A:48 [HIS] 1:764 [U] C:48 [HIS] A:771 [U] ✔
A:48 [HIS] 1:765 [A] C:48 [HIS] A:772 [A] ✔
A:48 [HIS] 1:769 [G] C:48 [HIS] A:776 [G] ✔
A:48 [HIS] 1:770 [U] C:48 [HIS] A:777 [U] ✔
A:48 [HIS] 1:1795 [C] C:48 [HIS] A:1802 [C] ✔
A:48 [HIS] 1:1796 [G] C:48 [HIS] A:1803 [G] ✔
A:87 [ARG] 1:1806 [G] C:87 [ARG] A:1813 [G] ✔
A:87 [ARG] 1:1807 [U] C:87 [ARG] A:1814 [U] ✔
A:206 [GLY] 1:1780 [A] C:206 [GLY] A:1787 [A] ✔
A:206 [GLY] 1:1781 [G] C:206 [GLY] A:1788 [G] ✔
A:176 [LEU] 1:1788 [G] C:176 [LEU] A:1795 [G] ✔
A:38 [LYS] 1:683 [C] C:38 [LYS] A:690 [C] ✔
A:38 [LYS] 1:684 [A] C:38 [LYS] A:691 [A] ✔
A:38 [LYS] 1:1342 [A] C:38 [LYS] A:1349 [A] ✔
A:58 [HIS] 1:1417 [G] C:58 [HIS] A:1424 [G] ✔
A:58 [HIS] 1:1557 [A] C:58 [HIS] A:1564 [A] ✔
A:58 [HIS] 1:1558 [G] C:58 [HIS] A:1565 [G] ✔
A:58 [HIS] 1:1559 [G] C:58 [HIS] A:1566 [G] ✔
A:53 [HIS] 1:1813 [G] C:53 [HIS] A:1820 [G] ✔
A:233 [GLY] 1:2587 [A] C:233 [GLY] A:2594 [A] ✔
A:239 [ASN] 1:1892 [G] C:239 [ASN] A:1899 [G] ✔
A:239 [ASN] 1:1960 [U] C:239 [ASN] A:1967 [U] ✔
A:239 [ASN] 1:2584 [G] C:239 [ASN] A:2591 [G] ✔
A:239 [ASN] 1:2586 [G] C:239 [ASN] A:2593 [G] ✔
A:218 [PRO] 1:755 [A] C:218 [PRO] A:762 [A] ✔
A:218 [PRO] 1:772 [A] C:218 [PRO] A:779 [A] ✔
A:218 [PRO] 1:1778 [A] C:218 [PRO] A:1785 [A] ✔
A:218 [PRO] 1:1779 [U] C:218 [PRO] A:1786 [U] ✔
A:61 [HIS] 1:1559 [G] C:61 [HIS] A:1566 [G] ✔
A:61 [HIS] 1:1560 [A] C:61 [HIS] A:1567 [A] ✔
A:61 [HIS] 1:1561 [A] C:61 [HIS] A:1568 [A] ✔
A:253 [LYS] 1:1784 [C] C:253 [LYS] A:1791 [C] ✔
A:253 [LYS] 1:1785 [U] C:253 [LYS] A:1792 [U] ✔
A:253 [LYS] 1:1813 [G] C:253 [LYS] A:1820 [G] ✔
A:253 [LYS] 1:1814 [U] C:253 [LYS] A:1821 [U] ✔
A:253 [LYS] 1:1832 [C] C:253 [LYS] A:1839 [C] ✔
A:253 [LYS] 1:1890 [A] C:253 [LYS] A:1897 [A] ✔
A:88 [THR] 1:1807 [U] C:88 [THR] A:1814 [U] ✔
A:88 [THR] 1:1809 [U] C:88 [THR] A:1816 [U] ✔
A:88 [THR] 1:1810 [A] C:88 [THR] A:1817 [A] ✔
A:63 [ARG] 1:1558 [G] C:63 [ARG] A:1565 [G] ✔
A:63 [ARG] 1:1559 [G] C:63 [ARG] A:1566 [G] ✔
A:223 [MET] 1:1815 [G] C:223 [MET] A:1822 [G] ✔
A:223 [MET] 1:1816 [U] C:223 [MET] A:1823 [U] ✔
A:223 [MET] 1:1960 [U] C:223 [MET] A:1967 [U] ✔
A:198 [GLN] 1:1809 [U] C:198 [GLN] A:1816 [U] ✔
A:146 [LEU] 1:1789 [C] C:146 [LEU] A:1796 [C] ✔
A:146 [LEU] 1:1790 [A] C:146 [LEU] A:1797 [A] ✔
A:237 [GLY] 1:2579 [A] C:237 [GLY] A:2586 [A] ✔
A:237 [GLY] 1:2580 [C] C:237 [GLY] A:2587 [C] ✔
A:262 [ARG] 1:1790 [A] C:262 [ARG] A:1797 [A] ✔
A:262 [ARG] 1:2216 [C] C:262 [ARG] A:2223 [C] ✔
A:15 [PHE] 1:1684 [U] C:15 [PHE] A:1691 [U] ✔
A:15 [PHE] 1:1762 [A] C:15 [PHE] A:1769 [A] ✔
A:15 [PHE] 1:1780 [A] C:15 [PHE] A:1787 [A] ✔
A:15 [PHE] 1:1818 [A] C:15 [PHE] A:1825 [A] ✔
A:15 [PHE] 1:1819 [U] C:15 [PHE] A:1826 [U] ✔
A:238 [ARG] 1:1776 [A] C:238 [ARG] A:1783 [A] ✔
A:238 [ARG] 1:1960 [U] C:238 [ARG] A:1967 [U] ✔
A:238 [ARG] 1:1961 [G] C:238 [ARG] A:1968 [G] ✔
A:238 [ARG] 1:2579 [A] C:238 [ARG] A:2586 [A] ✔
A:238 [ARG] 1:2580 [C] C:238 [ARG] A:2587 [C] ✔
A:26 [LYS] 1:1558 [G] C:26 [LYS] A:1565 [G] ✔
A:37 [LYS] 1:1805 [C] C:37 [LYS] A:1812 [C] ✔
A:86 [SER] 1:1806 [G] C:86 [ASN] A:1813 [G] ✔
A:200 [ASN] 1:1809 [U] C:200 [ASN] A:1816 [U] ✔
A:200 [ASN] 1:1810 [A] C:200 [ASN] A:1817 [A] ✔
A:185 [HIS] 1:2211 [A] C:185 [HIS] A:2218 [A] ✔
A:185 [HIS] 1:2212 [G] C:185 [HIS] A:2219 [G] ✔
A:263 [THR] 1:1789 [C] C:263 [THR] A:1796 [C] ✔
A:153 [GLN] 1:1788 [G] C:153 [GLN] A:1795 [G] ✔
A:153 [GLN] 1:1789 [C] C:153 [GLN] A:1796 [C] ✔
A:153 [GLN] 1:1790 [A] C:153 [GLN] A:1797 [A] ✔
A:153 [GLN] 1:1807 [U] C:153 [GLN] A:1814 [U] ✔
A:171 [TYR] 1:2211 [A] C:171 [TYR] A:2218 [A] ✔
A:171 [TYR] 1:2212 [G] C:171 [TYR] A:2219 [G] ✔
A:226 [ASN] 1:774 [A] C:226 [ASN] A:781 [A] ✔
A:226 [ASN] 1:775 [G] C:226 [ASN] A:782 [G] ✔
A:199 [GLU] 1:1809 [U] C:199 [GLU] A:1816 [U] ✔
A:235 [GLY] 1:2587 [A] C:235 [GLY] A:2594 [A] ✔
A:235 [GLY] 1:2588 [G] C:235 [GLY] A:2595 [G] ✔
A:60 [GLN] 1:1558 [G] C:60 [GLN] A:1565 [G] ✔
A:60 [GLN] 1:1559 [G] C:60 [GLN] A:1566 [G] ✔
A:178 [SER] 1:1788 [G] C:178 [SER] A:1795 [G] ✔
A:178 [SER] 1:1808 [A] C:178 [SER] A:1815 [A] ✔
A:231 [PRO] 1:2228 [G] C:231 [PRO] A:2235 [G] ✔
A:46 [ASN] 1:764 [U] C:46 [ASN] A:771 [U] ✔
A:46 [ASN] 1:765 [A] C:46 [ASN] A:772 [A] ✔
A:46 [ASN] 1:1795 [C] C:46 [ASN] A:1802 [C] ✔
A:46 [ASN] 1:1796 [G] C:46 [ASN] A:1803 [G] ✔
A:46 [ASN] 1:1800 [G] C:46 [ASN] A:1807 [G] ✔
A:207 [LYS] 1:720 [G] C:207 [LYS] A:727 [G] ✔
A:207 [LYS] 1:755 [A] C:207 [LYS] A:762 [A] ✔
A:207 [LYS] 1:1779 [U] C:207 [LYS] A:1786 [U] ✔
A:207 [LYS] 1:1780 [A] C:207 [LYS] A:1787 [A] ✔
A:225 [MET] 1:773 [A] C:225 [MET] A:780 [A] ✔
A:8 [PRO] 1:1684 [U] C:8 [PRO] A:1691 [U] ✔
A:8 [PRO] 1:1685 [C] C:8 [PRO] A:1692 [C] ✔
A:8 [PRO] 1:1686 [G] C:8 [PRO] A:1693 [G] ✔
A:220 [VAL] 1:772 [A] C:220 [VAL] A:779 [A] ✔
A:220 [VAL] 1:773 [A] C:220 [VAL] A:780 [A] ✔
A:220 [VAL] 1:1777 [C] C:220 [VAL] A:1784 [C] ✔
A:220 [VAL] 1:1778 [A] C:220 [VAL] A:1785 [A] ✔
A:220 [VAL] 1:1814 [U] C:220 [VAL] A:1821 [U] ✔
A:248 [TRP] 1:1793 [C] C:248 [TRP] A:1800 [C] ✔
A:248 [TRP] 1:1794 [A] C:248 [TRP] A:1801 [A] ✔
A:248 [TRP] 1:1795 [C] C:248 [TRP] A:1802 [C] ✔
A:248 [TRP] 1:1813 [G] C:248 [TRP] A:1820 [G] ✔
A:267 [ILE] 1:1788 [G] C:267 [ILE] A:1795 [G] ✔
A:271 [ARG] 1:1786 [C] C:271 [ARG] A:1793 [C] ✔
A:271 [ARG] 1:1787 [U] C:271 [ARG] A:1794 [U] ✔
A:271 [ARG] 1:1808 [A] C:271 [ARG] A:1815 [A] ✔
A:9 [THR] 1:696 [A] C:9 [THR] A:703 [A] ✔
A:9 [THR] 1:718 [A] C:9 [THR] A:725 [A] ✔
A:9 [THR] 1:719 [G] C:9 [THR] A:726 [G] ✔
A:9 [THR] 1:1686 [G] C:9 [THR] A:1693 [G] ✔
A:156 [ARG] 1:1806 [G] C:156 [ARG] A:1813 [G] ✔
A:156 [ARG] 1:1807 [U] C:156 [ARG] A:1814 [U] ✔
A:156 [ARG] 1:1808 [A] C:156 [ARG] A:1815 [A] ✔
A:55 [GLY] 1:682 [C] C:55 [GLY] A:689 [C] ✔
A:55 [GLY] 1:683 [C] C:55 [GLY] A:690 [C] ✔
A:56 [GLY] 1:682 [C] C:56 [GLY] A:689 [C] ✔
A:56 [GLY] 1:683 [C] C:56 [GLY] A:690 [C] ✔
A:44 [ASN] 1:1795 [C] C:44 [ASN] A:1802 [C] ✔
A:44 [ASN] 1:1800 [G] C:44 [ASN] A:1807 [G] ✔
A:44 [ASN] 1:1801 [U] C:44 [ASN] A:1808 [U] ✔
A:44 [ASN] 1:1802 [G] C:44 [ASN] A:1809 [G] ✔
A:150 [LYS] 1:1789 [C] C:150 [LYS] A:1796 [C] ✔
A:150 [LYS] 1:1790 [A] C:150 [LYS] A:1797 [A] ✔
A:150 [LYS] 1:2192 [U] C:150 [LYS] A:2199 [U] ✔
A:150 [LYS] 1:2193 [G] C:150 [LYS] A:2200 [G] ✔
A:221 [ARG] 1:1777 [C] C:221 [ARG] A:1784 [C] ✔
A:221 [ARG] 1:1778 [A] C:221 [ARG] A:1785 [A] ✔
A:221 [ARG] 1:1815 [G] C:221 [ARG] A:1822 [G] ✔
A:221 [ARG] 1:1816 [U] C:221 [ARG] A:1823 [U] ✔
A:221 [ARG] 1:1817 [G] C:221 [ARG] A:1824 [G] ✔
A:85 [PRO] 1:1558 [G] C:85 [PRO] A:1565 [G] ✔
A:85 [PRO] 1:1559 [G] C:85 [PRO] A:1566 [G] ✔
A:68 [LYS] 1:2194 [U] C:68 [LYS] A:2201 [U] ✔
A:4 [GLN] 1:697 [A] C:4 [GLN] A:704 [A] ✔
A:250 [GLN] 1:1793 [C] C:250 [GLN] A:1800 [C] ✔
A:250 [GLN] 1:1813 [G] C:250 [GLN] A:1820 [G] ✔
A:246 [SER] 1:1813 [G] C:246 [SER] A:1820 [G] ✔
A:246 [SER] 1:1814 [U] C:246 [SER] A:1821 [U] ✔
A:29 [PRO] 1:1559 [G] C:29 [PRO] A:1566 [G] ✔
A:83 [TYR] 1:1556 [C] C:83 [TYR] A:1563 [C] ✔
A:83 [TYR] 1:1557 [A] C:83 [TYR] A:1564 [A] ✔
A:83 [TYR] 1:1558 [G] C:83 [TYR] A:1565 [G] ✔
A:224 [ALA] 1:773 [A] C:224 [ALA] A:780 [A] ✔
A:224 [ALA] 1:774 [A] C:224 [ALA] A:781 [A] ✔
A:224 [ALA] 1:1777 [C] C:224 [ALA] A:1784 [C] ✔
A:224 [ALA] 1:1778 [A] C:224 [ALA] A:1785 [A] ✔
A:42 [GLY] 1:1802 [G] C:42 [GLY] A:1809 [G] ✔
A:32 [PRO] 1:1412 [A] C:32 [PRO] A:1419 [A] ✔
A:230 [HIS] 1:1814 [U] C:230 [HIS] A:1821 [U] ✔
A:256 [LYS] 1:1786 [C] C:256 [LYS] A:1793 [C] ✔
A:256 [LYS] 1:1787 [U] C:256 [LYS] A:1794 [U] ✔
A:256 [LYS] 1:1832 [C] C:256 [LYS] A:1839 [C] ✔
A:256 [LYS] 1:1833 [U] C:256 [LYS] A:1840 [U] ✔
A:256 [LYS] 1:1834 [G] C:256 [LYS] A:1841 [G] ✔
A:219 [THR] 1:1778 [A] C:219 [THR] A:1785 [A] ✔
A:219 [THR] 1:1779 [U] C:219 [THR] A:1786 [U] ✔
A:219 [THR] 1:1814 [U] C:219 [THR] A:1821 [U] ✔
A:203 [ARG] 1:1557 [A] C:203 [ARG] A:1564 [A] ✔
A:203 [ARG] 1:1781 [G] C:203 [ARG] A:1788 [G] ✔
A:242 [ILE] 1:1891 [C] C:242 [ILE] A:1898 [C] ✔
A:67 [PHE] 1:1806 [G] C:67 [PHE] A:1813 [G] ✔
A:67 [PHE] 1:1807 [U] C:67 [PHE] A:1814 [U] ✔
A:45 [ASN] 1:1358 [C] C:45 [ASN] A:1365 [C] ✔
A:45 [ASN] 1:1359 [G] C:45 [ASN] A:1366 [G] ✔
A:45 [ASN] 1:1800 [G] C:45 [ASN] A:1807 [G] ✔
A:45 [ASN] 1:1801 [U] C:45 [ASN] A:1808 [U] ✔
A:240 [LYS] 1:1815 [G] C:240 [LYS] A:1822 [G] ✔
A:240 [LYS] 1:1891 [C] C:240 [LYS] A:1898 [C] ✔
A:240 [LYS] 1:1892 [G] C:240 [LYS] A:1899 [G] ✔
A:240 [LYS] 1:1960 [U] C:240 [LYS] A:1967 [U] ✔
A:27 [GLY] 1:1558 [G] C:27 [GLY] A:1565 [G] ✔
A:36 [ALA] 1:1560 [A] C:36 [ALA] A:1567 [A] ✔
A:36 [ALA] 1:1561 [A] C:36 [ALA] A:1568 [A] ✔
A:254 [GLY] 1:1785 [U] C:254 [GLY] A:1792 [U] ✔
A:254 [GLY] 1:1786 [C] C:254 [GLY] A:1793 [C] ✔
A:254 [GLY] 1:1832 [C] C:254 [GLY] A:1839 [C] ✔
A:254 [GLY] 1:1833 [U] C:254 [GLY] A:1840 [U] ✔
A:148 [ILE] 1:2193 [G] C:148 [ILE] A:2200 [G] ✔
A:148 [ILE] 1:2194 [U] C:148 [ILE] A:2201 [U] ✔
A:148 [ILE] 1:2210 [G] C:148 [ILE] A:2217 [G] ✔
A:43 [ARG] 1:681 [U] C:43 [ARG] A:688 [U] ✔
A:43 [ARG] 1:682 [C] C:43 [ARG] A:689 [C] ✔
A:43 [ARG] 1:770 [U] C:43 [ARG] A:777 [U] ✔
A:43 [ARG] 1:771 [G] C:43 [ARG] A:778 [G] ✔
A:43 [ARG] 1:1802 [G] C:43 [ARG] A:1809 [G] ✔
A:222 [GLY] 1:1814 [U] C:222 [GLY] A:1821 [U] ✔
A:222 [GLY] 1:1815 [G] C:222 [GLY] A:1822 [G] ✔
A:234 [GLY] 1:2587 [A] C:234 [GLY] A:2594 [A] ✔
A:234 [GLY] 1:2588 [G] C:234 [GLY] A:2595 [G] ✔
A:154 [LEU] 1:1788 [G] C:154 [LEU] A:1795 [G] ✔
A:154 [LEU] 1:1807 [U] C:154 [LEU] A:1814 [U] ✔
A:154 [LEU] 1:1808 [A] C:154 [LEU] A:1815 [A] ✔
A:229 [ASP] 1:771 [G] C:229 [ASP] A:778 [G] ✔
A:229 [ASP] 1:773 [A] C:229 [ASP] A:780 [A] ✔
A:211 [ALA] 1:1780 [A] C:211 [ALA] A:1787 [A] ✔
A:41 [GLY] 1:682 [C] C:41 [GLY] A:689 [C] ✔
A:41 [GLY] 1:683 [C] C:41 [GLY] A:690 [C] ✔
A:182 [ARG] 1:1788 [G] C:182 [ARG] A:1795 [G] ✔
A:182 [ARG] 1:1789 [C] C:182 [ARG] A:1796 [C] ✔
A:14 [ARG] 1:1684 [U] C:14 [ARG] A:1691 [U] ✔
A:14 [ARG] 1:1685 [C] C:14 [ARG] A:1692 [C] ✔
A:14 [ARG] 1:1686 [G] C:14 [ARG] A:1693 [G] ✔
A:14 [ARG] 1:1762 [A] C:14 [ARG] A:1769 [A] ✔
A:14 [ARG] 1:1818 [A] C:14 [ARG] A:1825 [A] ✔
A:14 [ARG] 1:1966 [A] C:14 [ARG] A:1973 [A] ✔
A:47 [GLY] 1:763 [A] C:47 [GLY] A:770 [A] ✔
A:47 [GLY] 1:764 [U] C:47 [GLY] A:771 [U] ✔
A:47 [GLY] 1:770 [U] C:47 [GLY] A:777 [U] ✔
A:259 [THR] 1:1792 [A] C:259 [THR] A:1799 [A] ✔
A:259 [THR] 1:2074 [U] C:259 [THR] A:2081 [U] ✔
A:50 [THR] 1:1793 [C] C:50 [THR] A:1800 [C] ✔
A:50 [THR] 1:1794 [A] C:50 [THR] A:1801 [A] ✔
A:50 [THR] 1:1795 [C] C:50 [THR] A:1802 [C] ✔
A:50 [THR] 1:1802 [G] C:50 [THR] A:1809 [G] ✔
A:214 [ARG] 1:1557 [A] C:214 [ARG] A:1564 [A] ✔
A:7 [LYS] 1:696 [A] C:7 [LYS] A:703 [A] ✔
A:7 [LYS] 1:697 [A] C:7 [LYS] A:704 [A] ✔
A:7 [LYS] 1:1686 [G] C:7 [LYS] A:1693 [G] ✔
A:10 [SER] 1:719 [G] C:10 [SER] A:726 [G] ✔
A:10 [SER] 1:720 [G] C:10 [SER] A:727 [G] ✔
A:10 [SER] 1:721 [A] C:10 [SER] A:728 [A] ✔
A:147 [LYS] 1:1790 [A] C:147 [LYS] A:1797 [A] ✔
A:147 [LYS] 1:2191 [C] C:147 [LYS] A:2198 [C] ✔
A:147 [LYS] 1:2193 [G] C:147 [LYS] A:2200 [G] ✔
A:25 [HIS] 1:1558 [G] C:25 [HIS] A:1565 [G] ✔
A:213 [TRP] 1:755 [A] C:213 [TRP] A:762 [A] ✔
A:213 [TRP] 1:1557 [A] C:213 [TRP] A:1564 [A] ✔
A:40 [THR] 1:682 [C] C:40 [THR] A:689 [C] ✔
A:40 [THR] 1:683 [C] C:40 [THR] A:690 [C] ✔
A:40 [THR] 1:1802 [G] C:40 [THR] A:1809 [G] ✔
A:40 [THR] 1:1803 [G] C:40 [THR] A:1810 [G] ✔
A:40 [THR] 1:1805 [C] C:40 [THR] A:1812 [C] ✔
A:13 [ARG] 1:718 [A] C:13 [ARG] A:725 [A] ✔
A:13 [ARG] 1:719 [G] C:13 [ARG] A:726 [G] ✔
A:13 [ARG] 1:720 [G] C:13 [ARG] A:727 [G] ✔
A:35 [GLU] 1:1805 [C] C:35 [GLU] A:1812 [C] ✔
A:257 [THR] 1:1786 [C] C:257 [THR] A:1793 [C] ✔
A:257 [THR] 1:1787 [U] C:257 [THR] A:1794 [U] ✔
A:257 [THR] 1:1792 [A] C:257 [THR] A:1799 [A] ✔
A:257 [THR] 1:1793 [C] C:257 [THR] A:1800 [C] ✔
A:258 [ARG] 1:1786 [C] C:258 [ARG] A:1793 [C] ✔
A:258 [ARG] 1:1787 [U] C:258 [ARG] A:1794 [U] ✔
A:258 [ARG] 1:1788 [G] C:258 [ARG] A:1795 [G] ✔
A:258 [ARG] 1:1789 [C] C:258 [ARG] A:1796 [C] ✔
A:245 [VAL] 1:1813 [G] C:245 [VAL] A:1820 [G] ✔
A:245 [VAL] 1:1814 [U] C:245 [VAL] A:1821 [U] ✔
A:51 [THR] 1:1802 [G] C:51 [THR] A:1809 [G] ✔
A:51 [THR] 1:1803 [G] C:51 [THR] A:1810 [G] ✔
A:51 [THR] 1:1812 [G] C:51 [THR] A:1819 [G] ✔
A:241 [GLY] 1:1891 [C] C:241 [GLY] A:1898 [C] ✔
A:241 [GLY] 1:1892 [G] C:241 [GLY] A:1899 [G] ✔
A:241 [GLY] 1:2585 [U] C:241 [GLY] A:2592 [U] ✔
A:241 [GLY] 1:2586 [G] C:241 [GLY] A:2593 [G] ✔
A:208 [ALA] 1:720 [G] C:208 [ALA] A:727 [G] ✔
A:208 [ALA] 1:755 [A] C:208 [ALA] A:762 [A] ✔
A:208 [ALA] 1:1779 [U] C:208 [ALA] A:1786 [U] ✔
A:208 [ALA] 1:1780 [A] C:208 [ALA] A:1787 [A] ✔
A:212 [ARG] 1:682 [C] C:212 [ARG] A:689 [C] ✔
A:212 [ARG] 1:755 [A] C:212 [ARG] A:762 [A] ✔
A:212 [ARG] 1:772 [A] C:212 [ARG] A:779 [A] ✔
A:39 [ARG] 1:683 [C] C:39 [ARG] A:690 [C] ✔
A:39 [ARG] 1:684 [A] C:39 [ARG] A:691 [A] ✔
A:255 [TYR] 1:1785 [U] C:255 [TYR] A:1792 [U] ✔
A:255 [TYR] 1:1786 [C] C:255 [TYR] A:1793 [C] ✔
A:255 [TYR] 1:1832 [C] C:255 [TYR] A:1839 [C] ✔
A:255 [TYR] 1:1833 [U] C:255 [TYR] A:1840 [U] ✔
A:205 [LEU] 1:1780 [A] C:205 [LEU] A:1787 [A] ✔
A:205 [LEU] 1:1781 [G] C:205 [LEU] A:1788 [G] ✔
A:244 [PRO] 1:1814 [U] C:244 [PRO] A:1821 [U] ✔
A:244 [PRO] 1:1890 [A] C:244 [PRO] A:1897 [A] ✔
A:244 [PRO] 1:1891 [C] C:244 [PRO] A:1898 [C] ✔
A:201 [ASN] 1:1809 [U] C:201 [ASN] A:1816 [U] ✔
A:158 [ALA] 1:1809 [U] C:158 [ALA] A:1816 [U] ✔
A:155 [ALA] 1:1788 [G] C:155 [ALA] A:1795 [G] ✔
A:155 [ALA] 1:1807 [U] C:155 [ALA] A:1814 [U] ✔
A:155 [ALA] 1:1808 [A] C:155 [ALA] A:1815 [A] ✔
A:236 [GLU] 1:2587 [A] C:236 [GLU] A:2594 [A] ✔
A:236 [GLU] 1:2588 [G] C:236 [GLU] A:2595 [G] ✔
A:236 [GLU] 1:2589 [A] C:236 [GLU] A:2596 [A] ✔
A:59 [LYS] 1:685 [U] C:59 [LYS] A:692 [U] ✔
A:59 [LYS] 1:1558 [G] C:59 [LYS] A:1565 [G] ✔
A:59 [LYS] 1:1559 [G] C:59 [LYS] A:1566 [G] ✔
A:59 [LYS] 1:1560 [A] C:59 [LYS] A:1567 [A] ✔
A:52 [ARG] 1:1812 [G] C:52 [ARG] A:1819 [G] ✔
A:52 [ARG] 1:1813 [G] C:52 [ARG] A:1820 [G] ✔
A:52 [ARG] 1:1814 [U] C:52 [ARG] A:1821 [U] ✔
A:54 [VAL] 1:1812 [G] C:54 [VAL] A:1819 [G] ✔
A:180 [GLU] 1:1788 [G] C:180 [GLU] A:1795 [G] ✔
A:12 [GLY] 1:720 [G] C:12 [GLY] A:727 [G] ✔
A:12 [GLY] 1:1763 [C] C:12 [GLY] A:1770 [C] ✔
A:251 [LYS] 1:1831 [G] C:251 [LYS] A:1838 [G] ✔
A:251 [LYS] 1:1832 [C] C:251 [LYS] A:1839 [C] ✔
A:227 [PRO] 1:2062 [C] C:227 [PRO] A:2069 [C] ✔
A:227 [PRO] 1:2063 [U] C:227 [PRO] A:2070 [U] ✔
A:227 [PRO] 1:2587 [A] C:227 [PRO] A:2594 [A] ✔
A:227 [PRO] 1:2588 [G] C:227 [PRO] A:2595 [G] ✔
A:149 [GLY] 1:2193 [G] C:149 [GLY] A:2200 [G] ✔
A:149 [GLY] 1:2194 [U] C:149 [GLY] A:2201 [U] ✔
A:157 [SER] 1:1807 [U] C:157 [SER] A:1814 [U] ✔
A:157 [SER] 1:1808 [A] C:157 [SER] A:1815 [A] ✔
A:157 [SER] 1:1809 [U] C:157 [SER] A:1816 [U] ✔
A:157 [SER] 1:1810 [A] C:157 [SER] A:1817 [A] ✔
A:261 [LYS] 1:2075 [U] C:261 [LYS] A:2082 [U] ✔
A:261 [LYS] 1:2216 [C] C:261 [LYS] A:2223 [C] ✔
A:261 [LYS] 1:2217 [G] C:261 [LYS] A:2224 [G] ✔
A:232 [HIS] 1:1814 [U] C:232 [HIS] A:1821 [U] ✔
A:232 [HIS] 1:1815 [G] C:232 [HIS] A:1822 [G] ✔
A:204 [SER] 1:1780 [A] C:204 [SER] A:1787 [A] ✔
A:204 [SER] 1:1781 [G] C:204 [SER] A:1788 [G] ✔
A:49 [ILE] 1:1795 [C] C:49 [ILE] A:1802 [C] ❌ 7RYG_C_A
A:53 [HIS] 1:1814 [U] C:53 [HIS] A:1821 [U] ❌ 7RYG_C_A
A:239 [ASN] 1:2587 [A] C:239 [ASN] A:2594 [A] ❌ 7RYG_C_A
A:238 [ARG] 1:1777 [C] C:238 [ARG] A:1784 [C] ❌ 7RYG_C_A
A:86 [SER] 1:1805 [C] C:86 [ASN] A:1812 [C] ❌ 7RYG_C_A
A:263 [THR] 1:1788 [G] C:263 [THR] A:1795 [G] ❌ 7RYG_C_A
A:60 [GLN] 1:1557 [A] C:60 [GLN] A:1564 [A] ❌ 7RYG_C_A
A:220 [VAL] 1:1815 [G] C:220 [VAL] A:1822 [G] ❌ 7RYG_C_A
A:248 [TRP] 1:2228 [G] C:248 [TRP] A:2235 [G] ❌ 7RYG_C_A
A:267 [ILE] 1:1789 [C] C:267 [ILE] A:1796 [C] ❌ 7RYG_C_A
A:44 [ASN] 1:1794 [A] C:44 [ASN] A:1801 [A] ❌ 7RYG_C_A
A:150 [LYS] 1:2194 [U] C:150 [LYS] A:2201 [U] ❌ 7RYG_C_A
A:250 [GLN] 1:1792 [A] C:250 [GLN] A:1799 [A] ❌ 7RYG_C_A
A:42 [GLY] 1:1803 [G] C:42 [GLY] A:1810 [G] ❌ 7RYG_C_A
A:230 [HIS] 1:1813 [G] C:230 [HIS] A:1820 [G] ❌ 7RYG_C_A
A:242 [ILE] 1:1892 [G] C:242 [ILE] A:1899 [G] ❌ 7RYG_C_A
A:148 [ILE] 1:2211 [A] C:148 [ILE] A:2218 [A] ❌ 7RYG_C_A
A:259 [THR] 1:2217 [G] C:259 [THR] A:2224 [G] ❌ 7RYG_C_A
A:50 [THR] 1:1801 [U] C:50 [THR] A:1808 [U] ❌ 7RYG_C_A
A:147 [LYS] 1:2192 [U] C:147 [LYS] A:2199 [U] ❌ 7RYG_C_A
A:35 [GLU] 1:1561 [A] C:35 [GLU] A:1568 [A] ❌ 7RYG_C_A
A:258 [ARG] 1:1792 [A] C:258 [ARG] A:1799 [A] ❌ 7RYG_C_A
A:261 [LYS] 1:2074 [U] C:261 [LYS] A:2081 [U] ❌ 7RYG_C_A
A:252 [ALA] 1:1812 [G] C:252 [ALA] A:1819 [G] ❌ 6YSI_A_1
A:260 [ASN] 1:1790 [A] C:260 [ASN] A:1797 [A] ❌ 6YSI_A_1
A:271 [ARG] 1:1788 [G] C:271 [ARG] A:1795 [G] ❌ 6YSI_A_1
A:39 [ARG] 1:685 [U] C:39 [ARG] A:692 [U] ❌ 6YSI_A_1
A:46 [ASN] 1:763 [A] C:46 [ASN] A:770 [A] ❌ 6YSI_A_1
A:54 [VAL] 1:682 [C] C:54 [VAL] A:689 [C] ❌ 6YSI_A_1
A:38 [LYS] 1:1343 [G] C:38 [LYS] A:1350 [G] ❌ 7RYG_A:1350 no longer at interface
A:253 [LYS] 1:1783 [A] C:253 [LYS] A:1790 [A] ❌ 7RYG_A:1790 no longer at interface
A:26 [LYS] 1:1555 [C] C:26 [LYS] A:1562 [C] ❌ 7RYG_A:1562 no longer at interface
A:231 [PRO] 1:2064 [U] C:231 [PRO] A:2071 [U] ❌ 7RYG_A:2071 no longer at interface
A:207 [LYS] 1:754 [G] C:207 [LYS] A:761 [G] ❌ 7RYG_A:761 no longer at interface
A:242 [ILE] 1:2064 [U] C:242 [ILE] A:2071 [U] ❌ 7RYG_A:2071 no longer at interface
A:240 [LYS] 1:1959 [A] C:240 [LYS] A:1966 [A] ❌ 7RYG_A:1966 no longer at interface
A:35 [GLU] 1:2202 [U] C:35 [GLU] A:2209 [U] ❌ 7RYG_A:2209 no longer at interface
A:18 [LYS] 1:1555 [C] C:18 [LYS] A:1562 [C] ❌ 7RYG_C:18, 7RYG_A:1562 no longer at interface
A:236 [GLU] 1:2429 [C] C:236 [GLU] A:2436 [C] ❌ 7RYG_A:2436 no longer at interface
A:253 [LYS] 1:1889 [A] C:253 [LYS] A:1896 [A] ❌ 6YSI_1:1889 no longer at interface
A:38 [LYS] 1:1341 [A] C:38 [LYS] A:1348 [A] ❌ 6YSI_1:1341 no longer at interface
A:64 [ILE] 1:1805 [C] C:64 [ILE] A:1812 [C] ❌ 7RYG_C:64 no longer at interface
A:210 [ALA] 1:755 [A] C:210 [ALA] A:762 [A] ❌ 7RYG_C:210 no longer at interface
A:272 [ARG] 1:1786 [C] C:272 [ARG] A:1793 [C] ❌ 7RYG_C:272 no longer at interface
A:272 [ARG] 1:1787 [U] C:272 [ARG] A:1794 [U] ❌ 7RYG_C:272 no longer at interface
A:194 [GLU] 1:1809 [U] C:194 [GLU] A:1816 [U] ❌ 7RYG_C:194 no longer at interface
A:18 [LYS] 1:1556 [C] C:18 [LYS] A:1563 [C] ❌ 7RYG_C:18 no longer at interface
A:197 [ASN] 1:1809 [U] C:197 [ASN] A:1816 [U] ❌ 6YSI_A:197 no longer at interface
A:273 [VAL] 1:1787 [U] C:273 [VAL] A:1794 [U] ❌ 6YSI_A:273 no longer at interface
A:273 [VAL] 1:1785 [U] C:273 [VAL] A:1792 [U] ❌ 6YSI_A:273 no longer at interface
A:273 [VAL] 1:1786 [C] C:273 [VAL] A:1793 [C] ❌ 6YSI_A:273 no longer at interface

logo_download Export the table of contacts

Properties of this pair

Common ECOD label(s)
 Common RFAM label(s)
 Interface TM-score
 Interface RMSD
 Percentage identity
 Protein TM-score
 RNA TM-score
 Protein coverage
 RNA coverage
 Percentage conservation
 Apolar conservation
 H-bond conservation
 Percentage switching out
Nucleic acid-binding proteins & SH3 Bacterial large subunit ribosomal RNA 0.98 1.27 0.98 0.99 0.98 0.99 0.98 0.96 0.93 0.71 0.43


Other pairs involving 6YSI_A_1 or 7RYG_C_A

Total number of entries: 20

Interface 1 Interface 2 Percentage conservation
 		Interface TM-score
 		Interface RMSD
 		Percentage identity
 		Common ECOD label(s)
 		Common RFAM label(s)
 		Explore both interfaces
6S0Z_C_A 6YSI_A_1 0.86 0.98 0.99 0.57 Nucleic acid-binding proteins & SH3 Bacterial large subunit ribosomal RNA compare
1VQ8_A_0 6YSI_A_1 0.59 0.91 3.39 0.23 Nucleic acid-binding proteins & SH3 compare
1JJ2_A_0 6YSI_A_1 0.59 0.91 3.41 0.23 Nucleic acid-binding proteins & SH3 compare
6AZ3_A_1,2 6YSI_A_1 0.62 0.76 3.84 0.22 Nucleic acid-binding proteins & SH3 compare
4Y4O_1D_1A 6YSI_A_1 0.86 0.97 1.15 0.57 Nucleic acid-binding proteins & SH3 Bacterial large subunit ribosomal RNA compare
6AZ3_A_3 6YSI_A_1 0.31 0.54 3.47 0.05 Nucleic acid-binding proteins & SH3 compare
1YHQ_A_0 6YSI_A_1 0.58 0.91 3.28 0.23 Nucleic acid-binding proteins & SH3 compare
6YSI_A_1 7K00_c_a 0.94 1.0 0.5 0.76 Nucleic acid-binding proteins & SH3 Bacterial large subunit ribosomal RNA compare
6YSI_A_1 7O7Y_BA_B5 0.60 0.89 3.76 0.21 Nucleic acid-binding proteins & SH3 compare
6YSI_A_1 7OF0_D_A 0.68 0.92 2.67 0.31 Nucleic acid-binding proteins & SH3 Bacterial large subunit ribosomal RNA compare
6YSI_A_1 7RYG_C_A 0.96 0.98 1.27 0.98 Nucleic acid-binding proteins & SH3 Bacterial large subunit ribosomal RNA compare
6S0Z_C_A 7RYG_C_A 0.86 0.98 1.12 0.6 Nucleic acid-binding proteins & SH3 Bacterial large subunit ribosomal RNA compare
1VQ8_A_0 7RYG_C_A 0.53 0.9 3.94 0.21 Nucleic acid-binding proteins & SH3 compare
7OF0_D_A 7RYG_C_A 0.68 0.91 3.39 0.33 Nucleic acid-binding proteins & SH3 Bacterial large subunit ribosomal RNA compare
1JJ2_A_0 7RYG_C_A 0.51 0.9 3.94 0.22 Nucleic acid-binding proteins & SH3 compare
6AZ3_A_1,2 7RYG_C_A 0.56 0.75 3.8 0.23 Nucleic acid-binding proteins & SH3 compare
4Y4O_1D_1A 7RYG_C_A 0.84 0.96 2.18 0.61 Nucleic acid-binding proteins & SH3 Bacterial large subunit ribosomal RNA compare
6AZ3_A_3 7RYG_C_A 0.42 0.69 3.02 0.1 Nucleic acid-binding proteins & SH3 compare
7K00_c_a 7RYG_C_A 0.93 0.99 1.55 0.77 Nucleic acid-binding proteins & SH3 Bacterial large subunit ribosomal RNA compare
1YHQ_A_0 7RYG_C_A 0.51 0.9 3.92 0.22 Nucleic acid-binding proteins & SH3 compare