RNAprotDB

All interfaces > All interologs > Interface groups > group131 > 7K00_c_a

Interface analysis

mouse controls

Style

Protein

Cartoon
Licorice
Surface

RNA

Cartoon
Licorice
Surface

Color

Chain
Chain (with hetatm)
Chainbow
Hydrophobicity
Electrostatics (surface only)
Conservation*

View

Focus on

Interface
RNA
Protein
All

Show chains

Interface

show as licorice
show Accessibility
Rim - Core

Contacts -

7K00_c
7K00_a
Distance
Base Pair
Hbond nuc:res
Base Stacking
Residue conservation
c:7 [LYS] a:705 [A] 3.6 a:726 [G] 0.0
c:7 [LYS] a:706 [A] 2.83 a:725 [G] 0.0
c:7 [LYS] a:1695 [G] 4.72 a:1692 [U] 0.0
c:8 [PRO] a:1693 [U] 4.61 a:1829 [A] 0.0
c:8 [PRO] a:1694 [C] 3.46 0.0
c:8 [PRO] a:1695 [G] 3.29 a:1692 [U] 0.0
c:9 [THR] a:705 [A] 3.36 a:726 [G] 0.0
c:9 [THR] a:727 [A] 3.65 a:704 [G] 0.0
c:9 [THR] a:728 [G] 3.84 a:703 [U] base:BB 0.0
c:9 [THR] a:730 [A] 4.99 a:702 [U] 0.0
c:9 [THR] a:1695 [G] 3.95 a:1692 [U] 0.0
c:10 [SER] a:728 [G] 3.14 a:703 [U] 0.0
c:10 [SER] a:729 [G] 2.57 a:1774 [C] 0.0
c:10 [SER] a:730 [A] 3.71 a:702 [U] 0.0
c:11 [PRO] a:729 [G] 4.08 a:1774 [C] 0.0
c:11 [PRO] a:1773 [A] 3.62 a:1977 [A] base:BB 0.0
c:11 [PRO] a:1774 [C] 3.22 a:729 [G] 0.0
c:12 [GLY] a:729 [G] 3.08 a:1774 [C] 0.0
c:12 [GLY] a:1774 [C] 4.22 a:729 [G] 0.0
c:13 [ARG] a:727 [A] 3.85 a:704 [G] 0.0
c:13 [ARG] a:728 [G] 3.69 a:703 [U] 0.0
c:13 [ARG] a:729 [G] 3.23 a:1774 [C] 0.0
c:14 [ARG] a:1693 [U] 2.96 a:1829 [A] sugar:SC 0.0
c:14 [ARG] a:1694 [C] 4.48 0.0
c:14 [ARG] a:1695 [G] 2.96 a:1692 [U] base:SC 0.0
c:14 [ARG] a:1773 [A] 4.77 a:1977 [A] 0.0
c:14 [ARG] a:1829 [A] 4.23 a:1693 [U] 0.0
c:14 [ARG] a:1977 [A] 3.92 a:1773 [A] 0.0
c:15 [HIS] a:1773 [A] 3.73 a:1977 [A] 0.0
c:15 [HIS] a:1791 [A] 4.76 a:1828 [G] 0.0
c:15 [HIS] a:1829 [A] 2.92 a:1693 [U] base:SC 0.0
c:15 [HIS] a:1830 [C] 3.61 a:1975 [G] 0.0
c:18 [LYS] a:1565 [C] 3.64 a:1568 [G] 0.0
c:20 [VAL] a:1565 [C] 4.02 a:1568 [G] 0.0
c:25 [HIS] a:1567 [G] 3.3 base:BB 0.0
c:26 [LYS] a:1564 [C] 4.16 a:1429 [G] 0.0
c:26 [LYS] a:1567 [G] 4.13 0.0
c:27 [GLY] a:1567 [G] 3.76 base:BB 0.0
c:28 [LYS] a:1429 [G] 4.62 a:1564 [C] 0.0
c:28 [LYS] a:1568 [G] 3.55 a:1565 [C] 0.0
c:29 [PRO] a:1568 [G] 4.0 a:1565 [C] 0.0
c:32 [PRO] a:1424 [G] 3.97 a:1574 [C] 0.0
c:35 [GLU] a:1570 [A] 4.96 a:1428 [C] 0.0
c:35 [GLU] a:1816 [C] 2.52 base:SC 0.0
c:35 [GLU] a:2213 [U] 4.79 0.0
c:36 [LYS] a:1353 [A] 3.43 a:1379 [U] 0.0
c:36 [LYS] a:1354 [A] 2.82 a:1377 [G] 0.0
c:36 [LYS] a:1569 [A] 3.44 0.0
c:36 [LYS] a:1570 [A] 3.87 a:1428 [C] 0.0
c:37 [ASN] a:1816 [C] 4.27 0.0
c:38 [SER] a:692 [C] 4.55 a:770 [G] 0.0
c:38 [SER] a:693 [A] 3.65 a:769 [U] 0.0
c:38 [SER] a:1354 [A] 4.09 a:1377 [G] 0.0
c:39 [LYS] a:692 [C] 3.44 a:770 [G] 0.0
c:39 [LYS] a:693 [A] 3.22 a:769 [U] 0.0
c:40 [SER] a:691 [C] 3.93 a:771 [G] 0.0
c:40 [SER] a:692 [C] 4.27 a:770 [G] 0.0
c:40 [SER] a:1813 [G] 3.36 a:1804 [C] 0.0
c:40 [SER] a:1814 [G] 2.71 a:1803 [A] 0.0
c:41 [GLY] a:691 [C] 3.48 a:771 [G] 0.0
c:41 [GLY] a:692 [C] 3.99 a:770 [G] 0.0
c:42 [GLY] a:1813 [G] 3.13 a:1804 [C] 0.0
c:42 [GLY] a:1814 [G] 4.73 a:1803 [A] 0.0
c:43 [ARG] a:690 [G] 2.88 a:772 [C] base:SC, sugar:SC 0.0
c:43 [ARG] a:691 [C] 3.05 a:771 [G] 0.0
c:43 [ARG] a:779 [U] 4.04 a:785 [G] 0.0
c:43 [ARG] a:780 [G] 4.32 a:783 [A] 0.0
c:43 [ARG] a:1813 [G] 3.33 a:1804 [C] 0.0
c:44 [ASN] a:1805 [A] 4.52 a:1812 [U] 0.0
c:44 [ASN] a:1806 [C] 2.81 a:1811 [G] base:SC 0.0
c:44 [ASN] a:1811 [G] 3.65 a:1806 [C] 0.0
c:44 [ASN] a:1812 [U] 2.88 a:1805 [A] base:SC 0.0
c:44 [ASN] a:1813 [G] 3.23 a:1804 [C] 0.0
c:45 [ASN] a:1370 [C] 3.39 a:1361 [G] 0.0
c:45 [ASN] a:1371 [G] 3.74 a:1360 [G] 0.0
c:45 [ASN] a:1811 [G] 3.56 a:1806 [C] base:SC, sugar:SC 0.0
c:45 [ASN] a:1812 [U] 2.77 a:1805 [A] sugar:BB 0.0
c:45 [ASN] a:1813 [G] 4.93 a:1804 [C] 0.0
c:46 [ASN] a:773 [U] 3.2 a:689 [A] 0.0
c:46 [ASN] a:774 [G] 4.92 0.0
c:46 [ASN] a:1370 [C] 4.73 a:1361 [G] 0.0
c:46 [ASN] a:1806 [C] 3.05 a:1811 [G] base:SC, sugar:SC 0.0
c:46 [ASN] a:1807 [G] 3.77 a:1810 [A] sugar:SC 0.0
c:46 [ASN] a:1811 [G] 3.84 a:1806 [C] 0.0
c:47 [GLY] a:772 [C] 3.65 a:690 [G] 0.0
c:47 [GLY] a:773 [U] 3.11 a:689 [A] 0.0
c:47 [GLY] a:779 [U] 4.0 a:785 [G] 0.0
c:48 [ARG] a:773 [U] 3.19 a:689 [A] 0.0
c:48 [ARG] a:774 [G] 2.84 0.0
c:48 [ARG] a:775 [G] 3.5 a:791 [C] 0.0
c:48 [ARG] a:777 [G] 3.4 a:787 [C] 0.0
c:48 [ARG] a:778 [G] 3.55 a:786 [C] 0.0
c:48 [ARG] a:779 [U] 3.66 a:785 [G] 0.0
c:48 [ARG] a:1806 [C] 3.65 a:1811 [G] 0.0
c:48 [ARG] a:1807 [G] 4.21 a:1810 [A] 0.0
c:49 [ILE] a:690 [G] 4.75 a:772 [C] 0.0
c:49 [ILE] a:779 [U] 2.95 a:785 [G] 0.0
c:49 [ILE] a:780 [G] 3.17 a:783 [A] 0.0
c:49 [ILE] a:1805 [A] 3.68 a:1812 [U] sugar:BB 0.0
c:49 [ILE] a:1806 [C] 4.87 a:1811 [G] 0.0
c:50 [THR] a:1804 [C] 4.61 a:1813 [G] 0.0
c:50 [THR] a:1805 [A] 3.21 a:1812 [U] sugar:BB 0.0
c:50 [THR] a:1806 [C] 3.66 a:1811 [G] 0.0
c:50 [THR] a:1812 [U] 4.93 a:1805 [A] 0.0
c:50 [THR] a:1813 [G] 2.95 a:1804 [C] base:BB, base:SC, sugar:SC 0.0
c:51 [THR] a:1804 [C] 4.76 a:1813 [G] 0.0
c:51 [THR] a:1813 [G] 3.25 a:1804 [C] base:SC 0.0
c:51 [THR] a:1814 [G] 3.14 a:1803 [A] sugar:SC 0.0
c:51 [THR] a:1823 [G] 3.69 a:1796 [U] 0.0
c:52 [ARG] a:1823 [G] 4.26 a:1796 [U] 0.0
c:52 [ARG] a:1824 [G] 2.94 a:1795 [C] 0.0
c:52 [ARG] a:1825 [U] 3.01 a:1794 [A] 0.0
c:53 [HIS] a:1824 [G] 3.15 a:1795 [C] 0.0
c:53 [HIS] a:1825 [U] 4.81 a:1794 [A] 0.0
c:54 [ILE] a:691 [C] 4.62 a:771 [G] 0.0
c:54 [ILE] a:1814 [G] 3.65 a:1803 [A] 0.0
c:54 [ILE] a:1823 [G] 4.59 a:1796 [U] 0.0
c:55 [GLY] a:691 [C] 3.9 a:771 [G] 0.0
c:55 [GLY] a:692 [C] 3.95 a:770 [G] 0.0
c:56 [GLY] a:691 [C] 3.82 a:771 [G] 0.0
c:56 [GLY] a:692 [C] 2.92 a:770 [G] 0.0
c:58 [HIS] a:1429 [G] 4.37 a:1564 [C] 0.0
c:58 [HIS] a:1566 [A] 3.81 0.0
c:58 [HIS] a:1567 [G] 3.36 0.0
c:58 [HIS] a:1568 [G] 3.18 a:1565 [C] 0.0
c:59 [LYS] a:694 [U] 3.01 a:768 [G] 0.0
c:59 [LYS] a:1567 [G] 3.78 0.0
c:59 [LYS] a:1568 [G] 3.28 a:1565 [C] 0.0
c:59 [LYS] a:1569 [A] 3.11 sugar:SC 0.0
c:60 [GLN] a:1567 [G] 2.79 0.0
c:60 [GLN] a:1568 [G] 3.65 a:1565 [C] 0.0
c:61 [ALA] a:1568 [G] 2.82 a:1565 [C] 0.0
c:61 [ALA] a:1569 [A] 4.22 0.0
c:62 [TYR] a:1816 [C] 3.41 base/AA stacks 0.0
c:62 [TYR] a:1817 [G] 2.76 a:1800 [C] 0.0
c:63 [ARG] a:1567 [G] 2.95 sugar:SC 0.0
c:63 [ARG] a:1568 [G] 2.63 a:1565 [C] 0.0
c:64 [ILE] a:1816 [C] 4.93 0.0
c:67 [PHE] a:1817 [G] 4.06 a:1800 [C] 0.0
c:68 [LYS] a:2205 [A] 3.4 a:2219 [U] 0.0
c:71 [LYS] a:1490 [A] 4.12 0.0
c:71 [LYS] a:1491 [G] 3.91 a:1499 [C] 0.0
c:73 [GLY] a:1490 [A] 3.49 0.0
c:74 [ILE] a:1490 [A] 3.19 0.0
c:75 [PRO] a:1490 [A] 3.64 0.0
c:83 [TYR] a:1565 [C] 4.48 a:1568 [G] 0.0
c:83 [TYR] a:1566 [A] 4.1 0.0
c:83 [TYR] a:1567 [G] 2.41 base/AA stacks 0.0
c:85 [PRO] a:1567 [G] 3.49 0.0
c:85 [PRO] a:1568 [G] 3.6 a:1565 [C] 0.0
c:86 [ASN] a:1817 [G] 3.45 a:1800 [C] 0.0
c:87 [ARG] a:1817 [G] 2.7 a:1800 [C] 0.0
c:87 [ARG] a:1818 [U] 3.5 a:1799 [G] 0.0
c:88 [SER] a:1818 [U] 4.16 a:1799 [G] 0.0
c:88 [SER] a:1820 [U] 3.79 0.0
c:88 [SER] a:1821 [A] 4.39 a:1798 [U] 0.0
c:95 [LEU] a:1500 [G] 4.47 a:1489 [C] 0.0
c:95 [LEU] a:1501 [G] 3.81 a:1488 [C] 0.0
c:95 [LEU] a:1502 [A] 4.59 a:1487 [U] 0.0
c:96 [TYR] a:1501 [G] 4.93 a:1488 [C] 0.0
c:97 [LYS] a:1490 [A] 4.11 0.0
c:97 [LYS] a:1501 [G] 3.72 a:1488 [C] 0.0
c:98 [ASP] a:1489 [C] 4.88 a:1500 [G] 0.0
c:98 [ASP] a:1490 [A] 2.59 sugar:SC 0.0
c:98 [ASP] a:1491 [G] 3.05 a:1499 [C] 0.0
c:98 [ASP] a:1500 [G] 3.21 a:1489 [C] base:BB 0.0
c:99 [GLY] a:1491 [G] 4.68 a:1499 [C] 0.0
c:99 [GLY] a:1500 [G] 2.43 a:1489 [C] sugar:BB 0.0
c:99 [GLY] a:1501 [G] 3.52 a:1488 [C] 0.0
c:100 [GLU] a:1491 [G] 3.13 a:1499 [C] 0.0
c:100 [GLU] a:1500 [G] 4.63 a:1489 [C] 0.0
c:101 [ARG] a:1500 [G] 2.84 a:1489 [C] 0.0
c:101 [ARG] a:1501 [G] 2.81 a:1488 [C] 0.0
c:146 [MET] a:1799 [G] 4.43 a:1818 [U] 0.0
c:146 [MET] a:1800 [C] 3.65 a:1817 [G] 0.0
c:146 [MET] a:1801 [A] 4.86 0.0
c:147 [LYS] a:2202 [U] 4.38 a:2221 [G] 0.0
c:147 [LYS] a:2204 [G] 3.22 a:2220 [U] 0.0
c:147 [LYS] a:2221 [G] 4.82 a:2202 [U] 0.0
c:148 [PRO] a:2204 [G] 2.98 a:2220 [U] sugar:BB 0.0
c:148 [PRO] a:2205 [A] 4.71 a:2219 [U] 0.0
c:149 [GLY] a:2204 [G] 3.53 a:2220 [U] 0.0
c:149 [GLY] a:2205 [A] 3.71 a:2219 [U] 0.0
c:150 [LYS] a:1800 [C] 4.76 a:1817 [G] 0.0
c:150 [LYS] a:1801 [A] 2.64 0.0
c:150 [LYS] a:2203 [U] 4.11 0.0
c:150 [LYS] a:2204 [G] 3.18 a:2220 [U] 0.0
c:150 [LYS] a:2205 [A] 4.76 a:2219 [U] 0.0
c:153 [GLN] a:1799 [G] 3.91 a:1818 [U] 0.0
c:153 [GLN] a:1800 [C] 3.11 a:1817 [G] sugar:SC 0.0
c:153 [GLN] a:1801 [A] 2.69 0.0
c:153 [GLN] a:1818 [U] 2.44 a:1799 [G] base:SC, sugar:BB 0.0
c:154 [LEU] a:1799 [G] 3.78 a:1818 [U] 0.0
c:154 [LEU] a:1818 [U] 3.36 a:1799 [G] 0.0
c:154 [LEU] a:1819 [A] 4.05 0.0
c:155 [ALA] a:1799 [G] 4.6 a:1818 [U] 0.0
c:155 [ALA] a:1818 [U] 3.46 a:1799 [G] 0.0
c:155 [ALA] a:1819 [A] 2.97 0.0
c:156 [ARG] a:1816 [C] 4.86 0.0
c:156 [ARG] a:1817 [G] 2.86 a:1800 [C] 0.0
c:156 [ARG] a:1818 [U] 3.0 a:1799 [G] 0.0
c:156 [ARG] a:1819 [A] 2.89 0.0
c:157 [SER] a:1818 [U] 3.48 a:1799 [G] 0.0
c:157 [SER] a:1819 [A] 2.9 0.0
c:157 [SER] a:1820 [U] 2.77 sugar:SC 0.0
c:157 [SER] a:1821 [A] 3.24 a:1798 [U] 0.0
c:158 [ALA] a:1820 [U] 2.78 sugar:BB 0.0
c:159 [GLY] a:1820 [U] 3.73 0.0
c:160 [THR] a:1819 [A] 3.37 0.0
c:160 [THR] a:1820 [U] 3.85 0.0
c:171 [TYR] a:2222 [C] 3.82 a:2201 [G] 0.0
c:171 [TYR] a:2223 [G] 3.37 a:2200 [C] 0.0
c:176 [LEU] a:1799 [G] 3.43 a:1818 [U] 0.0
c:177 [ARG] a:1799 [G] 3.67 a:1818 [U] 0.0
c:177 [ARG] a:1819 [A] 3.34 0.0
c:177 [ARG] a:1820 [U] 2.77 0.0
c:178 [SER] a:1799 [G] 2.72 a:1818 [U] base:SC, base:BB 0.0
c:178 [SER] a:1819 [A] 2.98 0.0
c:180 [GLU] a:1799 [G] 2.22 a:1818 [U] sugar:SC, sugar:SC 0.0
c:182 [ARG] a:1799 [G] 2.82 a:1818 [U] sugar:SC 0.0
c:182 [ARG] a:1800 [C] 2.65 a:1817 [G] 0.0
c:185 [GLU] a:2222 [C] 3.09 a:2201 [G] 0.0
c:197 [ASN] a:1820 [U] 4.52 0.0
c:198 [ALA] a:1820 [U] 2.91 base:BB 0.0
c:199 [GLU] a:1820 [U] 4.72 0.0
c:200 [HIS] a:1820 [U] 3.4 0.0
c:200 [HIS] a:1821 [A] 2.61 a:1798 [U] 0.0
c:201 [MET] a:1820 [U] 2.9 base:BB 0.0
c:203 [ARG] a:1792 [G] 4.15 a:1827 [U] 0.0
c:203 [ARG] a:1821 [A] 4.91 a:1798 [U] 0.0
c:204 [VAL] a:1791 [A] 4.01 a:1828 [G] 0.0
c:204 [VAL] a:1792 [G] 3.53 a:1827 [U] 0.0
c:205 [LEU] a:1791 [A] 3.36 a:1828 [G] 0.0
c:205 [LEU] a:1792 [G] 3.08 a:1827 [U] 0.0
c:206 [GLY] a:1791 [A] 2.98 a:1828 [G] sugar:BB 0.0
c:206 [GLY] a:1792 [G] 4.73 a:1827 [U] 0.0
c:207 [LYS] a:729 [G] 2.97 a:1774 [C] sugar:SC 0.0
c:207 [LYS] a:763 [G] 4.44 a:698 [C] 0.0
c:207 [LYS] a:764 [A] 2.71 a:1775 [U] 0.0
c:207 [LYS] a:1790 [C] 4.11 0.0
c:207 [LYS] a:1791 [A] 3.43 a:1828 [G] 0.0
c:208 [ALA] a:729 [G] 2.79 a:1774 [C] base:BB 0.0
c:208 [ALA] a:764 [A] 3.33 a:1775 [U] 0.0
c:208 [ALA] a:1774 [C] 4.93 a:729 [G] 0.0
c:208 [ALA] a:1775 [U] 4.62 a:764 [A] 0.0
c:208 [ALA] a:1790 [C] 3.29 0.0
c:208 [ALA] a:1791 [A] 3.76 a:1828 [G] 0.0
c:209 [GLY] a:729 [G] 2.84 a:1774 [C] base:BB 0.0
c:209 [GLY] a:764 [A] 3.6 a:1775 [U] 0.0
c:210 [ALA] a:764 [A] 4.87 a:1775 [U] 0.0
c:211 [ALA] a:1791 [A] 3.44 a:1828 [G] 0.0
c:212 [ARG] a:691 [C] 4.12 a:771 [G] 0.0
c:212 [ARG] a:764 [A] 2.97 a:1775 [U] base:SC 0.0
c:212 [ARG] a:781 [A] 3.72 0.0
c:213 [TRP] a:764 [A] 2.98 a:1775 [U] 0.0
c:213 [TRP] a:1565 [C] 4.99 a:1568 [G] 0.0
c:213 [TRP] a:1566 [A] 3.28 base/AA stacks 0.0
c:214 [ARG] a:1566 [A] 3.4 0.0
c:217 [ARG] a:690 [G] 3.34 a:772 [C] 0.0
c:217 [ARG] a:691 [C] 3.36 a:771 [G] 0.0
c:217 [ARG] a:780 [G] 2.82 a:783 [A] 0.0
c:217 [ARG] a:781 [A] 2.87 0.0
c:218 [PRO] a:764 [A] 3.77 a:1775 [U] 0.0
c:218 [PRO] a:781 [A] 3.43 0.0
c:218 [PRO] a:1789 [A] 3.25 0.0
c:218 [PRO] a:1790 [C] 3.69 0.0
c:219 [THR] a:1789 [A] 3.27 0.0
c:219 [THR] a:1790 [C] 3.0 0.0
c:219 [THR] a:1825 [U] 4.31 a:1794 [A] 0.0
c:219 [THR] a:1828 [G] 4.84 a:1791 [A] 0.0
c:220 [VAL] a:781 [A] 3.44 0.0
c:220 [VAL] a:782 [A] 3.51 0.0
c:220 [VAL] a:1788 [C] 3.92 a:1776 [G] 0.0
c:220 [VAL] a:1789 [A] 3.28 0.0
c:220 [VAL] a:1826 [G] 4.9 a:1793 [C] 0.0
c:221 [ARG] a:1787 [A] 4.99 a:1777 [U] 0.0
c:221 [ARG] a:1788 [C] 2.75 a:1776 [G] 0.0
c:221 [ARG] a:1789 [A] 2.66 0.0
c:221 [ARG] a:1826 [G] 3.3 a:1793 [C] 0.0
c:221 [ARG] a:1827 [U] 2.81 a:1792 [G] 0.0
c:221 [ARG] a:1828 [G] 3.19 a:1791 [A] base:SC 0.0
c:222 [GLY] a:1825 [U] 4.53 a:1794 [A] 0.0
c:222 [GLY] a:1826 [G] 3.08 a:1793 [C] 0.0
c:223 [THR] a:1826 [G] 2.81 a:1793 [C] 0.0
c:223 [THR] a:1827 [U] 3.97 a:1792 [G] 0.0
c:224 [ALA] a:782 [A] 3.0 0.0
c:224 [ALA] a:783 [A] 3.94 a:780 [G] 0.0
c:224 [ALA] a:1788 [C] 3.81 a:1776 [G] 0.0
c:224 [ALA] a:1789 [A] 4.69 0.0
c:225 [MET] a:782 [A] 3.58 0.0
c:226 [ASN] a:783 [A] 4.09 a:780 [G] 0.0
c:226 [ASN] a:784 [G] 3.03 sugar:SC base/AA stacks 0.0
c:227 [PRO] a:2073 [C] 3.34 a:2436 [G] 0.0
c:227 [PRO] a:2074 [U] 3.88 a:2435 [A] 0.0
c:227 [PRO] a:2598 [A] 3.62 a:2595 [G] 0.0
c:227 [PRO] a:2599 [G] 4.12 a:2594 [C] 0.0
c:228 [VAL] a:784 [G] 3.62 0.0
c:228 [VAL] a:793 [A] 3.78 0.0
c:228 [VAL] a:2073 [C] 4.29 a:2436 [G] 0.0
c:228 [VAL] a:2074 [U] 5.0 a:2435 [A] 0.0
c:229 [ASP] a:780 [G] 2.85 a:783 [A] base:SC, base:SC, base:SC 0.0
c:229 [ASP] a:782 [A] 3.7 0.0
c:230 [HIS] a:1824 [G] 4.73 a:1795 [C] 0.0
c:230 [HIS] a:1825 [U] 2.8 a:1794 [A] 0.0
c:231 [PRO] a:2075 [U] 4.89 0.0
c:231 [PRO] a:2239 [G] 3.87 a:2081 [U] 0.0
c:232 [HIS] a:1825 [U] 3.16 a:1794 [A] 0.0
c:232 [HIS] a:1826 [G] 3.05 a:1793 [C] 0.0
c:233 [GLY] a:2598 [A] 4.14 a:2595 [G] 0.0
c:234 [GLY] a:2598 [A] 3.22 a:2595 [G] 0.0
c:234 [GLY] a:2599 [G] 3.87 a:2594 [C] 0.0
c:235 [GLY] a:2598 [A] 3.09 a:2595 [G] 0.0
c:235 [GLY] a:2599 [G] 2.82 a:2594 [C] 0.0
c:236 [GLU] a:2439 [A] 4.97 0.0
c:236 [GLU] a:2440 [C] 4.39 0.0
c:236 [GLU] a:2599 [G] 2.97 a:2594 [C] base:BB 0.0
c:236 [GLU] a:2600 [A] 2.94 a:2593 [U] base:BB 0.0
c:237 [GLY] a:2590 [A] 3.46 a:2604 [PSU] 0.0
c:237 [GLY] a:2591 [C] 3.83 a:2603 [G] 0.0
c:238 [ARG] a:1787 [A] 3.41 a:1777 [U] 0.0
c:238 [ARG] a:1788 [C] 4.97 a:1776 [G] 0.0
c:238 [ARG] a:1971 [U] 3.78 0.0
c:238 [ARG] a:1972 [G] 3.6 a:1833 [C] 0.0
c:238 [ARG] a:2590 [A] 3.3 a:2604 [PSU] 0.0
c:238 [ARG] a:2591 [C] 3.2 a:2603 [G] 0.0
c:239 [ASN] a:1971 [U] 3.29 0.0
c:239 [ASN] a:2594 [C] 4.66 a:2599 [G] 0.0
c:239 [ASN] a:2595 [G] 3.46 a:2598 [A] 0.0
c:239 [ASN] a:2598 [A] 3.34 a:2595 [G] 0.0
c:239 [ASN] a:2599 [G] 3.15 a:2594 [C] base:SC, base:SC 0.0
c:240 [PHE] a:1825 [U] 4.91 a:1794 [A] 0.0
c:240 [PHE] a:1826 [G] 4.08 a:1793 [C] 0.0
c:240 [PHE] a:1902 [C] 3.82 a:1840 [G] 0.0
c:240 [PHE] a:1903 [G] 3.43 a:1837 [C] 0.0
c:240 [PHE] a:1971 [U] 3.13 0.0
c:240 [PHE] a:2597 [G] 3.85 0.0
c:240 [PHE] a:2598 [A] 4.87 a:2595 [G] 0.0
c:241 [GLY] a:1902 [C] 3.44 a:1840 [G] 0.0
c:241 [GLY] a:1903 [G] 2.64 a:1837 [C] 0.0
c:241 [GLY] a:2596 [U] 2.77 sugar:BB 0.0
c:241 [GLY] a:2597 [G] 3.48 0.0
c:242 [LYS] a:1902 [C] 3.08 a:1840 [G] 0.0
c:242 [LYS] a:1903 [G] 4.97 a:1837 [C] 0.0
c:242 [LYS] a:2075 [U] 4.62 0.0
c:242 [LYS] a:2596 [U] 4.99 0.0
c:242 [LYS] a:2597 [G] 3.7 0.0
c:242 [LYS] a:2598 [A] 3.2 a:2595 [G] 0.0
c:243 [HIS] a:1841 [U] 3.07 a:1901 [A] base:SC 0.0
c:243 [HIS] a:1842 [G] 3.08 a:1898 [U] 0.0
c:243 [HIS] a:1901 [A] 4.19 a:1841 [U] 0.0
c:243 [HIS] a:1902 [C] 3.86 a:1840 [G] 0.0
c:244 [PRO] a:1825 [U] 3.75 a:1794 [A] 0.0
c:244 [PRO] a:1901 [A] 3.3 a:1841 [U] 0.0
c:244 [PRO] a:1902 [C] 4.15 a:1840 [G] 0.0
c:245 [VAL] a:1824 [G] 4.18 a:1795 [C] 0.0
c:245 [VAL] a:1825 [U] 3.44 a:1794 [A] 0.0
c:246 [THR] a:1824 [G] 3.27 a:1795 [C] 0.0
c:246 [THR] a:1825 [U] 4.56 a:1794 [A] 0.0
c:247 [PRO] a:1824 [G] 3.16 a:1795 [C] 0.0
c:247 [PRO] a:1825 [U] 3.57 a:1794 [A] 0.0
c:248 [TRP] a:1804 [C] 3.97 a:1813 [G] 0.0
c:248 [TRP] a:1805 [A] 3.33 a:1812 [U] 0.0
c:248 [TRP] a:1806 [C] 4.04 a:1811 [G] 0.0
c:248 [TRP] a:1824 [G] 4.3 a:1795 [C] 0.0
c:248 [TRP] a:2239 [G] 3.87 a:2081 [U] 0.0
c:249 [GLY] a:2239 [G] 4.32 a:2081 [U] 0.0
c:251 [GLN] a:1842 [G] 4.09 a:1898 [U] 0.0
c:251 [GLN] a:1843 [C] 3.2 a:1897 [G] 0.0
c:252 [THR] a:1796 [U] 3.71 a:1823 [G] 0.0
c:252 [THR] a:1823 [G] 4.33 a:1796 [U] 0.0
c:252 [THR] a:1824 [G] 2.72 a:1795 [C] base:BB, base:SC, sugar:SC 0.0
c:252 [THR] a:1825 [U] 3.33 a:1794 [A] 0.0
c:253 [LYS] a:1794 [A] 4.22 a:1825 [U] 0.0
c:253 [LYS] a:1795 [C] 2.8 a:1824 [G] base:SC 0.0
c:253 [LYS] a:1796 [U] 3.94 a:1823 [G] 0.0
c:253 [LYS] a:1824 [G] 4.03 a:1795 [C] 0.0
c:253 [LYS] a:1825 [U] 2.9 a:1794 [A] base:SC 0.0
c:253 [LYS] a:1843 [C] 3.87 a:1897 [G] sugar:BB 0.0
c:253 [LYS] a:1900 [A] 4.93 0.0
c:253 [LYS] a:1901 [A] 3.01 a:1841 [U] 0.0
c:254 [GLY] a:1796 [U] 2.99 a:1823 [G] sugar:BB 0.0
c:254 [GLY] a:1797 [G] 3.82 a:1822 [C] 0.0
c:254 [GLY] a:1843 [C] 3.11 a:1897 [G] 0.0
c:254 [GLY] a:1844 [C] 3.19 a:1896 [G] 0.0
c:255 [LYS] a:1796 [U] 4.58 a:1823 [G] 0.0
c:255 [LYS] a:1797 [G] 3.29 a:1822 [C] 0.0
c:255 [LYS] a:1843 [C] 3.42 a:1897 [G] 0.0
c:255 [LYS] a:1844 [C] 3.58 a:1896 [G] 0.0
c:256 [LYS] a:1797 [G] 3.53 a:1822 [C] 0.0
c:256 [LYS] a:1798 [U] 3.69 a:1821 [A] 0.0
c:256 [LYS] a:1843 [C] 4.7 a:1897 [G] 0.0
c:256 [LYS] a:1844 [C] 3.19 a:1896 [G] 0.0
c:256 [LYS] a:1845 [G] 3.12 a:1895 [C] 0.0
c:257 [THR] a:1797 [G] 2.8 a:1822 [C] sugar:SC 0.0
c:257 [THR] a:1798 [U] 3.22 a:1821 [A] 0.0
c:257 [THR] a:1803 [A] 2.6 a:1814 [G] sugar:SC 0.0
c:257 [THR] a:1804 [C] 3.66 a:1813 [G] 0.0
c:258 [ARG] a:1797 [G] 4.47 a:1822 [C] 0.0
c:258 [ARG] a:1798 [U] 2.92 a:1821 [A] 0.0
c:258 [ARG] a:1799 [G] 2.66 a:1818 [U] 0.0
c:258 [ARG] a:1800 [C] 2.62 a:1817 [G] 0.0
c:258 [ARG] a:1803 [A] 4.71 a:1814 [G] 0.0
c:259 [SER] a:2085 [U] 3.58 a:2234 [G] 0.0
c:260 [ASN] a:1800 [C] 3.99 a:1817 [G] 0.0
c:260 [ASN] a:1801 [A] 4.84 0.0
c:261 [LYS] a:2086 [U] 3.63 a:2233 [U] 0.0
c:261 [LYS] a:2227 [A] 3.83 a:2092 [U] 0.0
c:261 [LYS] a:2228 [G] 3.92 a:2091 [C] 0.0
c:262 [ARG] a:1801 [A] 3.34 sugar:SC base/AA stacks 0.0
c:262 [ARG] a:2227 [A] 3.81 a:2092 [U] 0.0
c:263 [THR] a:1800 [C] 2.95 a:1817 [G] 0.0
c:265 [LYS] a:2223 [G] 3.19 a:2200 [C] sugar:SC 0.0
c:265 [LYS] a:2224 [G] 3.32 a:2199 [A] 0.0
c:265 [LYS] a:2226 [C] 4.95 0.0
c:267 [ILE] a:1799 [G] 3.31 a:1818 [U] 0.0
c:270 [ARG] a:1798 [U] 3.52 a:1821 [A] 0.0
c:270 [ARG] a:1799 [G] 2.89 a:1818 [U] 0.0
c:271 [ARG] a:1797 [G] 3.14 a:1822 [C] 0.0
c:271 [ARG] a:1798 [U] 2.73 a:1821 [A] 0.0
c:271 [ARG] a:1799 [G] 4.26 a:1818 [U] 0.0
c:271 [ARG] a:1819 [A] 3.9 0.0

logo_download Export the table of contacts

*Conservation was calculated using Rate4Site
NB: conservation is missing (completly white) for a very small minority of cases in which no homologous sequences were found (e.g. synthetic proteins 7D3J_A & 7EU9_A)

Properties of this interface

Interolog group ID Structure ID Structure description
 UniProt ID
 		ECOD label(s)
 		RFAM label(s)
 		Is ribosome? RCSB PDB link
group131 7K00_c_a c: 50s ribosomal protein l2, Escherichia coli (natural) a: 23s rRNA, Escherichia coli (natural) P60422 Nucleic acid-binding proteins & SH3 Bacterial large subunit ribosomal RNA ✔

Interologs

Total number of interologs for this interface: 11

Interface 1 Interface 2 Percentage conservation
 		Interface TM-score
 		Interface RMSD
 		Percentage identity
 		Common ECOD label(s)
 		Common RFAM label(s)
 		Explore both interfaces
6YSI_A_1 7K00_c_a 0.94 1.0 0.5 0.76 Nucleic acid-binding proteins & SH3 Bacterial large subunit ribosomal RNA compare
6S0Z_C_A 7K00_c_a 0.85 0.98 1.04 0.61 Nucleic acid-binding proteins & SH3 Bacterial large subunit ribosomal RNA compare
1VQ8_A_0 7K00_c_a 0.61 0.9 3.27 0.25 Nucleic acid-binding proteins & SH3 compare
1JJ2_A_0 7K00_c_a 0.60 0.9 3.39 0.26 Nucleic acid-binding proteins & SH3 compare
6AZ3_A_1,2 7K00_c_a 0.62 0.77 3.84 0.22 Nucleic acid-binding proteins & SH3 compare
4Y4O_1D_1A 7K00_c_a 0.85 0.97 0.98 0.63 Nucleic acid-binding proteins & SH3 Bacterial large subunit ribosomal RNA compare
6AZ3_A_3 7K00_c_a 0.44 0.7 3.69 0.1 Nucleic acid-binding proteins & SH3 compare
7K00_c_a 7RYG_C_A 0.93 0.99 1.55 0.77 Nucleic acid-binding proteins & SH3 Bacterial large subunit ribosomal RNA compare
7K00_c_a 7OF0_D_A 0.69 0.92 2.63 0.4 Nucleic acid-binding proteins & SH3 Bacterial large subunit ribosomal RNA compare
7K00_c_a 7O7Y_BA_B5 0.60 0.88 3.73 0.23 Nucleic acid-binding proteins & SH3 compare
1YHQ_A_0 7K00_c_a 0.61 0.9 3.27 0.26 Nucleic acid-binding proteins & SH3 compare