Interface analysis
Style
Protein
CartoonLicorice
Surface
RNA
CartoonLicorice
Surface
Color
ChainChain (with hetatm)
Chainbow
Hydrophobicity Electrostatics (surface only) Conservation*
View
Focus on
InterfaceRNA
Protein
All
Show chains
Interface
show as licoriceshow Accessibility
Rim - Core
Contacts -
| 7RYG_C
|
7RYG_A
|
Distance
|
Base Pair
|
Hbond nuc:res
|
Base Stacking
|
Residue conservation
|
|---|---|---|---|---|---|---|
| C:4 [GLN] | A:704 [A] | 3.17 | A:723 [G] | sugar:SC | 60.64 | |
| C:7 [LYS] | A:703 [A] | 2.97 | A:724 [G] | 76.04 | ||
| C:7 [LYS] | A:704 [A] | 2.67 | A:723 [G] | 76.04 | ||
| C:7 [LYS] | A:1693 [G] | 4.88 | A:1690 [U] | 76.04 | ||
| C:8 [PRO] | A:1691 [U] | 4.94 | A:1825 [A] | 60.57 | ||
| C:8 [PRO] | A:1692 [C] | 3.79 | 60.57 | |||
| C:8 [PRO] | A:1693 [G] | 3.32 | A:1690 [U] | 60.57 | ||
| C:9 [THR] | A:703 [A] | 3.73 | A:724 [G] | 63.63 | ||
| C:9 [THR] | A:725 [A] | 3.9 | A:702 [G] | 63.63 | ||
| C:9 [THR] | A:726 [G] | 4.92 | A:701 [U] | 63.63 | ||
| C:9 [THR] | A:1693 [G] | 4.11 | A:1690 [U] | 63.63 | ||
| C:10 [SER] | A:726 [G] | 3.94 | A:701 [U] | 81.06 | ||
| C:10 [SER] | A:727 [G] | 3.87 | A:1770 [C] | 81.06 | ||
| C:10 [SER] | A:728 [A] | 3.55 | A:700 [U] | sugar:SC | 81.06 | |
| C:11 [PRO] | A:727 [G] | 3.96 | A:1770 [C] | 63.47 | ||
| C:11 [PRO] | A:1769 [A] | 3.83 | A:1973 [A] | base:BB | 63.47 | |
| C:11 [PRO] | A:1770 [C] | 3.57 | A:727 [G] | 63.47 | ||
| C:12 [GLY] | A:727 [G] | 3.25 | A:1770 [C] | 74.07 | ||
| C:12 [GLY] | A:1770 [C] | 4.57 | A:727 [G] | 74.07 | ||
| C:13 [ARG] | A:725 [A] | 3.27 | A:702 [G] | 37.64 | ||
| C:13 [ARG] | A:726 [G] | 3.87 | A:701 [U] | 37.64 | ||
| C:13 [ARG] | A:727 [G] | 3.26 | A:1770 [C] | 37.64 | ||
| C:14 [ARG] | A:1691 [U] | 3.21 | A:1825 [A] | sugar:SC | 93.47 | |
| C:14 [ARG] | A:1692 [C] | 4.61 | 93.47 | |||
| C:14 [ARG] | A:1693 [G] | 3.14 | A:1690 [U] | base:SC | 93.47 | |
| C:14 [ARG] | A:1769 [A] | 4.88 | A:1973 [A] | 93.47 | ||
| C:14 [ARG] | A:1825 [A] | 4.56 | A:1691 [U] | 93.47 | ||
| C:14 [ARG] | A:1973 [A] | 4.42 | A:1769 [A] | 93.47 | ||
| C:15 [PHE] | A:1691 [U] | 4.89 | A:1825 [A] | 56.17 | ||
| C:15 [PHE] | A:1769 [A] | 3.47 | A:1973 [A] | 56.17 | ||
| C:15 [PHE] | A:1787 [A] | 4.92 | A:1824 [G] | 56.17 | ||
| C:15 [PHE] | A:1825 [A] | 3.2 | A:1691 [U] | 56.17 | ||
| C:15 [PHE] | A:1826 [U] | 3.86 | A:1971 [A] | 56.17 | ||
| C:25 [HIS] | A:1565 [G] | 4.18 | 37.52 | |||
| C:26 [LYS] | A:1565 [G] | 3.4 | base:SC | 55.64 | ||
| C:27 [GLY] | A:1565 [G] | 4.09 | 39.36 | |||
| C:29 [PRO] | A:1566 [G] | 4.28 | A:1563 [C] | 64.14 | ||
| C:32 [PRO] | A:1419 [A] | 4.78 | A:1572 [U] | 53.11 | ||
| C:35 [GLU] | A:1812 [C] | 2.88 | base:SC | 2.28 | ||
| C:36 [ALA] | A:1567 [A] | 3.56 | 17.74 | |||
| C:36 [ALA] | A:1568 [A] | 4.32 | A:1423 [C] | 17.74 | ||
| C:37 [LYS] | A:1812 [C] | 3.67 | 1.32 | |||
| C:38 [LYS] | A:690 [C] | 4.88 | A:768 [G] | 40.72 | ||
| C:38 [LYS] | A:691 [A] | 3.84 | A:767 [U] | 40.72 | ||
| C:38 [LYS] | A:1348 [A] | 3.08 | A:1374 [U] | 40.72 | ||
| C:38 [LYS] | A:1349 [A] | 2.86 | A:1372 [G] | 40.72 | ||
| C:39 [ARG] | A:690 [C] | 3.47 | A:768 [G] | 49.46 | ||
| C:39 [ARG] | A:691 [A] | 2.66 | A:767 [U] | 49.46 | ||
| C:39 [ARG] | A:692 [U] | 4.9 | A:766 [G] | 49.46 | ||
| C:40 [THR] | A:689 [C] | 3.99 | A:769 [G] | 55.82 | ||
| C:40 [THR] | A:690 [C] | 4.38 | A:768 [G] | 55.82 | ||
| C:40 [THR] | A:1809 [G] | 3.78 | A:1800 [C] | 55.82 | ||
| C:40 [THR] | A:1810 [G] | 3.16 | A:1799 [A] | 55.82 | ||
| C:40 [THR] | A:1812 [C] | 4.97 | 55.82 | |||
| C:41 [GLY] | A:689 [C] | 3.86 | A:769 [G] | 52.32 | ||
| C:41 [GLY] | A:690 [C] | 4.39 | A:768 [G] | 52.32 | ||
| C:42 [GLY] | A:1809 [G] | 3.51 | A:1800 [C] | 97.44 | ||
| C:43 [ARG] | A:688 [U] | 3.06 | A:770 [A] | sugar:SC | 94.84 | |
| C:43 [ARG] | A:689 [C] | 3.46 | A:769 [G] | 94.84 | ||
| C:43 [ARG] | A:777 [U] | 4.19 | A:783 [G] | 94.84 | ||
| C:43 [ARG] | A:778 [G] | 4.48 | A:781 [A] | 94.84 | ||
| C:43 [ARG] | A:1809 [G] | 3.8 | A:1800 [C] | 94.84 | ||
| C:44 [ASN] | A:1802 [C] | 3.38 | A:1807 [G] | base:SC | 93.15 | |
| C:44 [ASN] | A:1807 [G] | 4.29 | A:1802 [C] | 93.15 | ||
| C:44 [ASN] | A:1808 [U] | 3.35 | A:1801 [A] | base:SC | 93.15 | |
| C:44 [ASN] | A:1809 [G] | 3.69 | A:1800 [C] | 93.15 | ||
| C:45 [ASN] | A:1365 [C] | 3.66 | A:1356 [G] | 72.19 | ||
| C:45 [ASN] | A:1366 [G] | 4.12 | 72.19 | |||
| C:45 [ASN] | A:1807 [G] | 4.11 | A:1802 [C] | 72.19 | ||
| C:45 [ASN] | A:1808 [U] | 3.05 | A:1801 [A] | sugar:BB | 72.19 | |
| C:46 [ASN] | A:770 [A] | 4.94 | A:688 [U] | 11.03 | ||
| C:46 [ASN] | A:771 [U] | 3.41 | A:687 [A] | 11.03 | ||
| C:46 [ASN] | A:772 [A] | 4.83 | 11.03 | |||
| C:46 [ASN] | A:1802 [C] | 3.48 | A:1807 [G] | sugar:SC | 11.03 | |
| C:46 [ASN] | A:1803 [G] | 4.03 | A:1806 [A] | 11.03 | ||
| C:46 [ASN] | A:1807 [G] | 4.33 | A:1802 [C] | 11.03 | ||
| C:47 [GLY] | A:770 [A] | 3.63 | A:688 [U] | 96.24 | ||
| C:47 [GLY] | A:771 [U] | 3.5 | A:687 [A] | 96.24 | ||
| C:47 [GLY] | A:777 [U] | 4.3 | A:783 [G] | 96.24 | ||
| C:48 [HIS] | A:771 [U] | 3.31 | A:687 [A] | 68.82 | ||
| C:48 [HIS] | A:772 [A] | 3.13 | 68.82 | |||
| C:48 [HIS] | A:776 [G] | 4.17 | A:784 [C] | 68.82 | ||
| C:48 [HIS] | A:777 [U] | 3.79 | A:783 [G] | 68.82 | ||
| C:48 [HIS] | A:1802 [C] | 3.18 | A:1807 [G] | sugar:SC | 68.82 | |
| C:48 [HIS] | A:1803 [G] | 4.71 | A:1806 [A] | 68.82 | ||
| C:49 [ILE] | A:688 [U] | 4.97 | A:770 [A] | 92.45 | ||
| C:49 [ILE] | A:777 [U] | 3.13 | A:783 [G] | 92.45 | ||
| C:49 [ILE] | A:778 [G] | 3.29 | A:781 [A] | 92.45 | ||
| C:49 [ILE] | A:1801 [A] | 3.86 | A:1808 [U] | sugar:BB | 92.45 | |
| C:50 [THR] | A:1800 [C] | 4.69 | A:1809 [G] | 89.01 | ||
| C:50 [THR] | A:1801 [A] | 3.51 | A:1808 [U] | sugar:BB | 89.01 | |
| C:50 [THR] | A:1802 [C] | 4.18 | A:1807 [G] | 89.01 | ||
| C:50 [THR] | A:1809 [G] | 3.05 | A:1800 [C] | base:SC, sugar:SC | 89.01 | |
| C:51 [THR] | A:1809 [G] | 3.39 | A:1800 [C] | base:SC | 72.02 | |
| C:51 [THR] | A:1810 [G] | 3.3 | A:1799 [A] | sugar:SC | 72.02 | |
| C:51 [THR] | A:1819 [G] | 3.96 | A:1792 [U] | 72.02 | ||
| C:52 [ARG] | A:1819 [G] | 4.34 | A:1792 [U] | 83.1 | ||
| C:52 [ARG] | A:1820 [G] | 3.07 | A:1791 [C] | 83.1 | ||
| C:52 [ARG] | A:1821 [U] | 3.26 | A:1790 [A] | 83.1 | ||
| C:53 [HIS] | A:1820 [G] | 3.4 | A:1791 [C] | 81.57 | ||
| C:54 [VAL] | A:689 [C] | 4.78 | A:769 [G] | 75.44 | ||
| C:54 [VAL] | A:1819 [G] | 4.77 | A:1792 [U] | 75.44 | ||
| C:55 [GLY] | A:689 [C] | 4.19 | A:769 [G] | 87.54 | ||
| C:55 [GLY] | A:690 [C] | 4.07 | A:768 [G] | 87.54 | ||
| C:56 [GLY] | A:689 [C] | 4.03 | A:769 [G] | 82.08 | ||
| C:56 [GLY] | A:690 [C] | 3.13 | A:768 [G] | 82.08 | ||
| C:58 [HIS] | A:1424 [G] | 4.97 | A:1562 [C] | 60.04 | ||
| C:58 [HIS] | A:1564 [A] | 3.8 | 60.04 | |||
| C:58 [HIS] | A:1565 [G] | 3.31 | 60.04 | |||
| C:58 [HIS] | A:1566 [G] | 3.45 | A:1563 [C] | 60.04 | ||
| C:59 [LYS] | A:692 [U] | 3.46 | A:766 [G] | 85.23 | ||
| C:59 [LYS] | A:1565 [G] | 3.64 | 85.23 | |||
| C:59 [LYS] | A:1566 [G] | 3.35 | A:1563 [C] | 85.23 | ||
| C:59 [LYS] | A:1567 [A] | 3.29 | sugar:SC | 85.23 | ||
| C:60 [GLN] | A:1565 [G] | 2.8 | 75.45 | |||
| C:60 [GLN] | A:1566 [G] | 3.43 | A:1563 [C] | 75.45 | ||
| C:61 [HIS] | A:1566 [G] | 2.93 | A:1563 [C] | 28.32 | ||
| C:61 [HIS] | A:1567 [A] | 3.08 | 28.32 | |||
| C:61 [HIS] | A:1568 [A] | 4.38 | A:1423 [C] | 28.32 | ||
| C:62 [TYR] | A:1812 [C] | 3.26 | base/AA stacks | 58.91 | ||
| C:62 [TYR] | A:1813 [G] | 2.8 | A:1796 [C] | 58.91 | ||
| C:63 [ARG] | A:1565 [G] | 3.32 | sugar:SC | 92.18 | ||
| C:63 [ARG] | A:1566 [G] | 3.2 | A:1563 [C] | 92.18 | ||
| C:67 [PHE] | A:1813 [G] | 3.93 | A:1796 [C] | 67.45 | ||
| C:67 [PHE] | A:1814 [U] | 4.92 | A:1795 [G] | 67.45 | ||
| C:68 [LYS] | A:2201 [U] | 3.43 | A:2215 [A] | 32.53 | ||
| C:83 [TYR] | A:1563 [C] | 4.86 | A:1566 [G] | 82.79 | ||
| C:83 [TYR] | A:1564 [A] | 4.68 | 82.79 | |||
| C:83 [TYR] | A:1565 [G] | 2.85 | base/AA stacks | 82.79 | ||
| C:85 [PRO] | A:1565 [G] | 3.98 | 84.78 | |||
| C:85 [PRO] | A:1566 [G] | 3.96 | A:1563 [C] | 84.78 | ||
| C:86 [ASN] | A:1813 [G] | 4.06 | A:1796 [C] | 76.64 | ||
| C:87 [ARG] | A:1813 [G] | 3.12 | A:1796 [C] | 86.95 | ||
| C:87 [ARG] | A:1814 [U] | 3.28 | A:1795 [G] | 86.95 | ||
| C:88 [THR] | A:1814 [U] | 4.81 | A:1795 [G] | 73.66 | ||
| C:88 [THR] | A:1816 [U] | 3.93 | 73.66 | |||
| C:88 [THR] | A:1817 [A] | 4.01 | A:1794 [U] | 73.66 | ||
| C:146 [LEU] | A:1796 [C] | 4.29 | A:1813 [G] | 45.77 | ||
| C:146 [LEU] | A:1797 [A] | 4.66 | 45.77 | |||
| C:147 [LYS] | A:1797 [A] | 3.32 | base:SC | 2.82 | ||
| C:147 [LYS] | A:2198 [C] | 3.34 | A:2217 [G] | sugar:SC | 2.82 | |
| C:147 [LYS] | A:2200 [G] | 2.89 | A:2216 [C] | 2.82 | ||
| C:148 [ILE] | A:2200 [G] | 2.72 | A:2216 [C] | sugar:BB | 76.55 | |
| C:148 [ILE] | A:2201 [U] | 4.41 | A:2215 [A] | 76.55 | ||
| C:148 [ILE] | A:2217 [G] | 4.57 | A:2198 [C] | 76.55 | ||
| C:149 [GLY] | A:2200 [G] | 3.72 | A:2216 [C] | 44.69 | ||
| C:149 [GLY] | A:2201 [U] | 3.82 | A:2215 [A] | 44.69 | ||
| C:150 [LYS] | A:1796 [C] | 4.82 | A:1813 [G] | 41.3 | ||
| C:150 [LYS] | A:1797 [A] | 2.45 | 41.3 | |||
| C:150 [LYS] | A:2199 [U] | 4.42 | 41.3 | |||
| C:150 [LYS] | A:2200 [G] | 3.06 | A:2216 [C] | 41.3 | ||
| C:153 [GLN] | A:1795 [G] | 4.36 | A:1814 [U] | 64.18 | ||
| C:153 [GLN] | A:1796 [C] | 3.28 | A:1813 [G] | 64.18 | ||
| C:153 [GLN] | A:1797 [A] | 2.52 | 64.18 | |||
| C:153 [GLN] | A:1814 [U] | 2.73 | A:1795 [G] | base:SC, sugar:BB | 64.18 | |
| C:154 [LEU] | A:1795 [G] | 3.28 | A:1814 [U] | 54.22 | ||
| C:154 [LEU] | A:1814 [U] | 3.36 | A:1795 [G] | 54.22 | ||
| C:154 [LEU] | A:1815 [A] | 4.14 | 54.22 | |||
| C:155 [ALA] | A:1795 [G] | 4.34 | A:1814 [U] | 58.42 | ||
| C:155 [ALA] | A:1814 [U] | 3.24 | A:1795 [G] | 58.42 | ||
| C:155 [ALA] | A:1815 [A] | 2.95 | 58.42 | |||
| C:156 [ARG] | A:1813 [G] | 3.25 | A:1796 [C] | 93.36 | ||
| C:156 [ARG] | A:1814 [U] | 2.63 | A:1795 [G] | base/AA stacks | 93.36 | |
| C:156 [ARG] | A:1815 [A] | 3.29 | 93.36 | |||
| C:157 [SER] | A:1814 [U] | 3.7 | A:1795 [G] | 88.07 | ||
| C:157 [SER] | A:1815 [A] | 2.79 | 88.07 | |||
| C:157 [SER] | A:1816 [U] | 2.74 | sugar:SC | 88.07 | ||
| C:157 [SER] | A:1817 [A] | 3.55 | A:1794 [U] | 88.07 | ||
| C:158 [ALA] | A:1816 [U] | 2.91 | sugar:BB | 88.1 | ||
| C:159 [GLY] | A:1816 [U] | 3.75 | 96.02 | |||
| C:160 [ALA] | A:1815 [A] | 3.78 | 74.33 | |||
| C:171 [TYR] | A:2218 [A] | 4.84 | A:2197 [U] | 30.36 | ||
| C:171 [TYR] | A:2219 [G] | 2.42 | A:2196 [C] | 30.36 | ||
| C:176 [LEU] | A:1795 [G] | 3.71 | A:1814 [U] | 79.66 | ||
| C:177 [ARG] | A:1795 [G] | 4.31 | A:1814 [U] | 76.13 | ||
| C:177 [ARG] | A:1815 [A] | 3.67 | 76.13 | |||
| C:177 [ARG] | A:1816 [U] | 2.61 | 76.13 | |||
| C:178 [SER] | A:1795 [G] | 2.91 | A:1814 [U] | base:SC, base:BB | 98.92 | |
| C:178 [SER] | A:1815 [A] | 3.47 | 98.92 | |||
| C:180 [GLU] | A:1795 [G] | 2.74 | A:1814 [U] | sugar:SC | 77.76 | |
| C:182 [ARG] | A:1795 [G] | 4.1 | A:1814 [U] | 69.17 | ||
| C:182 [ARG] | A:1796 [C] | 3.68 | A:1813 [G] | 69.17 | ||
| C:185 [HIS] | A:2218 [A] | 4.2 | A:2197 [U] | 63.75 | ||
| C:185 [HIS] | A:2219 [G] | 4.56 | A:2196 [C] | 63.75 | ||
| C:197 [ASN] | A:1816 [U] | 3.98 | 86.33 | |||
| C:198 [GLN] | A:1816 [U] | 2.84 | base:BB | 5.96 | ||
| C:199 [GLU] | A:1816 [U] | 4.59 | 55.21 | |||
| C:200 [ASN] | A:1816 [U] | 3.49 | 55.04 | |||
| C:200 [ASN] | A:1817 [A] | 4.41 | A:1794 [U] | 55.04 | ||
| C:201 [ASN] | A:1816 [U] | 3.18 | base:BB | base/AA stacks | 14.6 | |
| C:203 [ARG] | A:1564 [A] | 4.05 | 39.88 | |||
| C:203 [ARG] | A:1788 [G] | 4.5 | A:1823 [U] | 39.88 | ||
| C:204 [SER] | A:1787 [A] | 4.66 | A:1824 [G] | 48.02 | ||
| C:204 [SER] | A:1788 [G] | 3.83 | A:1823 [U] | 48.02 | ||
| C:205 [LEU] | A:1787 [A] | 3.93 | A:1824 [G] | 43.81 | ||
| C:205 [LEU] | A:1788 [G] | 3.31 | A:1823 [U] | 43.81 | ||
| C:206 [GLY] | A:1787 [A] | 2.94 | A:1824 [G] | sugar:BB | 66.56 | |
| C:206 [GLY] | A:1788 [G] | 4.72 | A:1823 [U] | 66.56 | ||
| C:207 [LYS] | A:727 [G] | 3.15 | A:1770 [C] | sugar:SC | 92.29 | |
| C:207 [LYS] | A:762 [A] | 3.04 | A:1771 [U] | 92.29 | ||
| C:207 [LYS] | A:1786 [U] | 4.22 | 92.29 | |||
| C:207 [LYS] | A:1787 [A] | 3.48 | A:1824 [G] | 92.29 | ||
| C:208 [ALA] | A:727 [G] | 3.47 | A:1770 [C] | base:BB | 99.0 | |
| C:208 [ALA] | A:762 [A] | 3.69 | A:1771 [U] | 99.0 | ||
| C:208 [ALA] | A:1786 [U] | 3.28 | 99.0 | |||
| C:208 [ALA] | A:1787 [A] | 3.87 | A:1824 [G] | 99.0 | ||
| C:209 [GLY] | A:727 [G] | 3.43 | A:1770 [C] | base:BB | 98.81 | |
| C:209 [GLY] | A:762 [A] | 3.69 | A:1771 [U] | 98.81 | ||
| C:211 [ALA] | A:1787 [A] | 4.02 | A:1824 [G] | 66.9 | ||
| C:212 [ARG] | A:689 [C] | 4.58 | A:769 [G] | 87.65 | ||
| C:212 [ARG] | A:762 [A] | 3.14 | A:1771 [U] | base:SC | 87.65 | |
| C:212 [ARG] | A:779 [A] | 3.94 | 87.65 | |||
| C:213 [TRP] | A:762 [A] | 3.42 | A:1771 [U] | 27.33 | ||
| C:213 [TRP] | A:1564 [A] | 3.43 | base/AA stacks | 27.33 | ||
| C:214 [ARG] | A:1564 [A] | 3.48 | 26.01 | |||
| C:217 [ARG] | A:688 [U] | 3.65 | A:770 [A] | 89.31 | ||
| C:217 [ARG] | A:689 [C] | 2.85 | A:769 [G] | 89.31 | ||
| C:217 [ARG] | A:778 [G] | 3.79 | A:781 [A] | 89.31 | ||
| C:217 [ARG] | A:779 [A] | 2.94 | 89.31 | |||
| C:218 [PRO] | A:762 [A] | 4.86 | A:1771 [U] | 95.46 | ||
| C:218 [PRO] | A:779 [A] | 3.34 | 95.46 | |||
| C:218 [PRO] | A:1785 [A] | 3.34 | 95.46 | |||
| C:218 [PRO] | A:1786 [U] | 4.03 | 95.46 | |||
| C:219 [THR] | A:1785 [A] | 3.34 | 52.3 | |||
| C:219 [THR] | A:1786 [U] | 3.2 | 52.3 | |||
| C:219 [THR] | A:1821 [U] | 4.78 | A:1790 [A] | 52.3 | ||
| C:220 [VAL] | A:779 [A] | 3.48 | 94.89 | |||
| C:220 [VAL] | A:780 [A] | 3.67 | 94.89 | |||
| C:220 [VAL] | A:1784 [C] | 4.31 | A:1772 [G] | 94.89 | ||
| C:220 [VAL] | A:1785 [A] | 3.57 | 94.89 | |||
| C:220 [VAL] | A:1821 [U] | 4.99 | A:1790 [A] | 94.89 | ||
| C:221 [ARG] | A:1784 [C] | 2.99 | A:1772 [G] | 95.3 | ||
| C:221 [ARG] | A:1785 [A] | 2.84 | 95.3 | |||
| C:221 [ARG] | A:1822 [G] | 3.49 | A:1789 [C] | 95.3 | ||
| C:221 [ARG] | A:1823 [U] | 2.84 | A:1788 [G] | 95.3 | ||
| C:221 [ARG] | A:1824 [G] | 3.74 | A:1787 [A] | base:SC | 95.3 | |
| C:222 [GLY] | A:1821 [U] | 4.73 | A:1790 [A] | 96.29 | ||
| C:222 [GLY] | A:1822 [G] | 3.22 | A:1789 [C] | 96.29 | ||
| C:223 [MET] | A:1822 [G] | 2.97 | A:1789 [C] | 79.21 | ||
| C:223 [MET] | A:1823 [U] | 3.41 | A:1788 [G] | 79.21 | ||
| C:223 [MET] | A:1967 [U] | 4.04 | 79.21 | |||
| C:224 [ALA] | A:780 [A] | 3.21 | 93.52 | |||
| C:224 [ALA] | A:781 [A] | 4.08 | A:778 [G] | 93.52 | ||
| C:224 [ALA] | A:1784 [C] | 4.24 | A:1772 [G] | 93.52 | ||
| C:224 [ALA] | A:1785 [A] | 4.55 | 93.52 | |||
| C:225 [MET] | A:780 [A] | 3.47 | 88.56 | |||
| C:226 [ASN] | A:781 [A] | 4.32 | A:778 [G] | 94.49 | ||
| C:226 [ASN] | A:782 [G] | 3.27 | base/AA stacks | 94.49 | ||
| C:227 [PRO] | A:2069 [C] | 4.03 | A:2432 [G] | 87.73 | ||
| C:227 [PRO] | A:2070 [U] | 4.08 | A:2431 [A] | 87.73 | ||
| C:227 [PRO] | A:2594 [A] | 4.29 | A:2591 [G] | 87.73 | ||
| C:227 [PRO] | A:2595 [G] | 4.67 | A:2590 [C] | 87.73 | ||
| C:228 [ILE] | A:782 [G] | 3.77 | 72.41 | |||
| C:228 [ILE] | A:791 [A] | 3.7 | 72.41 | |||
| C:228 [ILE] | A:2069 [C] | 4.67 | A:2432 [G] | 72.41 | ||
| C:229 [ASP] | A:778 [G] | 2.96 | A:781 [A] | base:SC | 91.46 | |
| C:229 [ASP] | A:780 [A] | 3.9 | 91.46 | |||
| C:230 [HIS] | A:1821 [U] | 3.07 | A:1790 [A] | 98.79 | ||
| C:231 [PRO] | A:2235 [G] | 4.6 | A:2077 [C] | 95.59 | ||
| C:232 [HIS] | A:1821 [U] | 3.67 | A:1790 [A] | 90.2 | ||
| C:232 [HIS] | A:1822 [G] | 3.29 | A:1789 [C] | 90.2 | ||
| C:233 [GLY] | A:2594 [A] | 4.82 | A:2591 [G] | 95.64 | ||
| C:234 [GLY] | A:2594 [A] | 3.56 | A:2591 [G] | 96.02 | ||
| C:234 [GLY] | A:2595 [G] | 4.36 | A:2590 [C] | 96.02 | ||
| C:235 [GLY] | A:2594 [A] | 2.93 | A:2591 [G] | 87.56 | ||
| C:235 [GLY] | A:2595 [G] | 3.22 | A:2590 [C] | 87.56 | ||
| C:236 [GLU] | A:2594 [A] | 4.85 | A:2591 [G] | 76.97 | ||
| C:236 [GLU] | A:2595 [G] | 3.54 | A:2590 [C] | base:BB | 76.97 | |
| C:236 [GLU] | A:2596 [A] | 3.69 | A:2589 [U] | 76.97 | ||
| C:237 [GLY] | A:2586 [A] | 3.69 | A:2600 [U] | 87.38 | ||
| C:237 [GLY] | A:2587 [C] | 3.95 | A:2599 [G] | 87.38 | ||
| C:238 [ARG] | A:1783 [A] | 4.25 | A:1773 [U] | 78.31 | ||
| C:238 [ARG] | A:1967 [U] | 3.7 | 78.31 | |||
| C:238 [ARG] | A:1968 [G] | 3.43 | A:1829 [C] | 78.31 | ||
| C:238 [ARG] | A:2586 [A] | 3.61 | A:2600 [U] | 78.31 | ||
| C:238 [ARG] | A:2587 [C] | 3.55 | A:2599 [G] | 78.31 | ||
| C:239 [ASN] | A:1899 [G] | 4.36 | A:1833 [C] | 76.49 | ||
| C:239 [ASN] | A:1967 [U] | 3.31 | base:SC | 76.49 | ||
| C:239 [ASN] | A:2591 [G] | 4.32 | A:2594 [A] | 76.49 | ||
| C:239 [ASN] | A:2593 [G] | 3.26 | 76.49 | |||
| C:240 [LYS] | A:1822 [G] | 3.95 | A:1789 [C] | 70.31 | ||
| C:240 [LYS] | A:1898 [C] | 3.26 | A:1836 [G] | 70.31 | ||
| C:240 [LYS] | A:1899 [G] | 4.06 | A:1833 [C] | 70.31 | ||
| C:240 [LYS] | A:1967 [U] | 3.04 | 70.31 | |||
| C:241 [GLY] | A:1898 [C] | 4.13 | A:1836 [G] | 79.17 | ||
| C:241 [GLY] | A:1899 [G] | 3.71 | A:1833 [C] | 79.17 | ||
| C:241 [GLY] | A:2592 [U] | 4.13 | 79.17 | |||
| C:241 [GLY] | A:2593 [G] | 4.18 | 79.17 | |||
| C:242 [ILE] | A:1898 [C] | 3.63 | A:1836 [G] | 74.05 | ||
| C:243 [GLN] | A:1837 [U] | 4.77 | A:1897 [A] | 36.42 | ||
| C:243 [GLN] | A:1838 [G] | 4.02 | A:1894 [U] | 36.42 | ||
| C:243 [GLN] | A:1897 [A] | 2.58 | A:1837 [U] | base:SC, sugar:SC | 36.42 | |
| C:243 [GLN] | A:1898 [C] | 3.48 | A:1836 [G] | 36.42 | ||
| C:244 [PRO] | A:1821 [U] | 3.85 | A:1790 [A] | 70.55 | ||
| C:244 [PRO] | A:1897 [A] | 3.52 | A:1837 [U] | 70.55 | ||
| C:244 [PRO] | A:1898 [C] | 4.21 | A:1836 [G] | 70.55 | ||
| C:245 [VAL] | A:1820 [G] | 4.27 | A:1791 [C] | 73.8 | ||
| C:245 [VAL] | A:1821 [U] | 3.43 | A:1790 [A] | 73.8 | ||
| C:246 [SER] | A:1820 [G] | 3.64 | A:1791 [C] | 81.59 | ||
| C:246 [SER] | A:1821 [U] | 4.63 | A:1790 [A] | 81.59 | ||
| C:247 [PRO] | A:1820 [G] | 3.34 | A:1791 [C] | 72.8 | ||
| C:247 [PRO] | A:1821 [U] | 3.43 | A:1790 [A] | 72.8 | ||
| C:248 [TRP] | A:1800 [C] | 4.73 | A:1809 [G] | 52.79 | ||
| C:248 [TRP] | A:1801 [A] | 3.54 | A:1808 [U] | 52.79 | ||
| C:248 [TRP] | A:1802 [C] | 3.5 | A:1807 [G] | 52.79 | ||
| C:248 [TRP] | A:1820 [G] | 4.67 | A:1791 [C] | 52.79 | ||
| C:250 [GLN] | A:1800 [C] | 3.42 | A:1809 [G] | 59.21 | ||
| C:250 [GLN] | A:1820 [G] | 4.93 | A:1791 [C] | 59.21 | ||
| C:251 [LYS] | A:1838 [G] | 3.57 | A:1894 [U] | 41.09 | ||
| C:251 [LYS] | A:1839 [C] | 4.34 | A:1893 [G] | 41.09 | ||
| C:252 [ALA] | A:1792 [U] | 3.41 | A:1819 [G] | 61.64 | ||
| C:252 [ALA] | A:1819 [G] | 4.98 | A:1792 [U] | 61.64 | ||
| C:252 [ALA] | A:1820 [G] | 3.4 | A:1791 [C] | base:BB | 61.64 | |
| C:252 [ALA] | A:1821 [U] | 3.94 | A:1790 [A] | 61.64 | ||
| C:253 [LYS] | A:1791 [C] | 3.12 | A:1820 [G] | base:SC | 65.35 | |
| C:253 [LYS] | A:1792 [U] | 3.76 | A:1819 [G] | 65.35 | ||
| C:253 [LYS] | A:1820 [G] | 3.87 | A:1791 [C] | 65.35 | ||
| C:253 [LYS] | A:1821 [U] | 3.62 | A:1790 [A] | base:SC | 65.35 | |
| C:253 [LYS] | A:1839 [C] | 4.27 | A:1893 [G] | 65.35 | ||
| C:253 [LYS] | A:1896 [A] | 4.86 | 65.35 | |||
| C:253 [LYS] | A:1897 [A] | 2.52 | A:1837 [U] | 65.35 | ||
| C:254 [GLY] | A:1792 [U] | 2.77 | A:1819 [G] | sugar:BB | 83.55 | |
| C:254 [GLY] | A:1793 [C] | 4.12 | A:1818 [G] | 83.55 | ||
| C:254 [GLY] | A:1839 [C] | 3.17 | A:1893 [G] | 83.55 | ||
| C:254 [GLY] | A:1840 [U] | 3.61 | A:1892 [A] | 83.55 | ||
| C:255 [TYR] | A:1792 [U] | 4.29 | A:1819 [G] | 0.75 | ||
| C:255 [TYR] | A:1793 [C] | 3.33 | A:1818 [G] | 0.75 | ||
| C:255 [TYR] | A:1839 [C] | 4.04 | A:1893 [G] | 0.75 | ||
| C:255 [TYR] | A:1840 [U] | 4.21 | A:1892 [A] | 0.75 | ||
| C:256 [LYS] | A:1793 [C] | 3.83 | A:1818 [G] | 68.8 | ||
| C:256 [LYS] | A:1794 [U] | 4.18 | A:1817 [A] | 68.8 | ||
| C:256 [LYS] | A:1839 [C] | 4.84 | A:1893 [G] | 68.8 | ||
| C:256 [LYS] | A:1840 [U] | 3.51 | A:1892 [A] | 68.8 | ||
| C:256 [LYS] | A:1841 [G] | 3.04 | A:1891 [C] | 68.8 | ||
| C:257 [THR] | A:1793 [C] | 2.7 | A:1818 [G] | sugar:SC | 88.77 | |
| C:257 [THR] | A:1794 [U] | 3.47 | A:1817 [A] | 88.77 | ||
| C:257 [THR] | A:1799 [A] | 3.31 | A:1810 [G] | sugar:SC | 88.77 | |
| C:257 [THR] | A:1800 [C] | 3.86 | A:1809 [G] | 88.77 | ||
| C:258 [ARG] | A:1793 [C] | 4.83 | A:1818 [G] | 61.13 | ||
| C:258 [ARG] | A:1794 [U] | 3.39 | A:1817 [A] | 61.13 | ||
| C:258 [ARG] | A:1795 [G] | 2.54 | A:1814 [U] | 61.13 | ||
| C:258 [ARG] | A:1796 [C] | 2.62 | A:1813 [G] | 61.13 | ||
| C:259 [THR] | A:1799 [A] | 4.95 | A:1810 [G] | 37.3 | ||
| C:259 [THR] | A:2081 [U] | 4.23 | A:2230 [G] | 37.3 | ||
| C:260 [ASN] | A:1796 [C] | 4.74 | A:1813 [G] | 47.09 | ||
| C:260 [ASN] | A:1797 [A] | 4.87 | 47.09 | |||
| C:261 [LYS] | A:2082 [U] | 4.99 | A:2229 [U] | 76.18 | ||
| C:261 [LYS] | A:2223 [C] | 4.02 | A:2088 [U] | 76.18 | ||
| C:261 [LYS] | A:2224 [G] | 4.26 | A:2087 [C] | 76.18 | ||
| C:262 [ARG] | A:1797 [A] | 3.19 | base/AA stacks | 1.1 | ||
| C:262 [ARG] | A:2223 [C] | 4.75 | A:2088 [U] | 1.1 | ||
| C:263 [THR] | A:1796 [C] | 3.1 | A:1813 [G] | 64.04 | ||
| C:265 [LYS] | A:2220 [G] | 4.95 | A:2195 [A] | 31.94 | ||
| C:267 [ILE] | A:1795 [G] | 4.32 | A:1814 [U] | 71.82 | ||
| C:271 [ARG] | A:1793 [C] | 4.17 | A:1818 [G] | 58.78 | ||
| C:271 [ARG] | A:1794 [U] | 2.43 | A:1817 [A] | 58.78 | ||
| C:271 [ARG] | A:1795 [G] | 4.18 | A:1814 [U] | 58.78 | ||
| C:271 [ARG] | A:1815 [A] | 4.21 | 58.78 | |||
| C:273 [VAL] | A:1792 [U] | 4.87 | A:1819 [G] | 50.91 | ||
| C:273 [VAL] | A:1793 [C] | 2.88 | A:1818 [G] | 50.91 | ||
| C:273 [VAL] | A:1794 [U] | 3.14 | A:1817 [A] | 50.91 |
Export the table of contacts
*Conservation was calculated using Rate4Site
NB: conservation is missing (completly white) for a very small minority of cases in which no homologous sequences were found (e.g. synthetic proteins 7D3J_A & 7EU9_A)
Properties of this interface
| Interolog group ID | Structure ID |
Structure description |
UniProt ID |
ECOD label(s) |
RFAM label(s) |
Is ribosome? | RCSB PDB link |
|---|---|---|---|---|---|---|---|
| group131 | 7RYG_C_A | C: 50s ribosomal protein l2, Acinetobacter baumannii (strain ab0057) (natural) A: 23s ribosomal RNA, Acinetobacter baumannii ab0057 (natural) | B7IA36 | Nucleic acid-binding proteins & SH3 | Bacterial large subunit ribosomal RNA | ✔ |
|
Interologs
Total number of interologs for this interface: 10