Interface analysis
Style
Protein
CartoonLicorice
Surface
RNA
CartoonLicorice
Surface
Color
StructureStructure (with hetatm)
Chain
Chainbow
View
Focus on
InterfaceRNA
Protein
All
Show chains
Interface
show interface as licoriceCommon contacts -
3CC2_K
|
3CC2_0
|
4Y4O_1O
|
4Y4O_1A
|
Conserved?
|
---|---|---|---|---|
K:68 [VAL] | 0:1993 [C] | 1O:57 [VAL] | 1A:1974 [A] | ✔ |
K:68 [VAL] | 0:2596 [A] | 1O:57 [VAL] | 1A:2573 [A] | ✔ |
K:66 [ARG] | 0:1993 [C] | 1O:55 [GLY] | 1A:1974 [A] | ✔ |
K:77 [ARG] | 0:1743 [G] | 1O:66 [LYS] | 1A:1712 [A] | ✔ |
K:77 [ARG] | 0:1744 [G] | 1O:66 [LYS] | 1A:1713 [G] | ✔ |
K:79 [PRO] | 0:2721 [U] | 1O:68 [GLU] | 1A:2696 [U] | ✔ |
K:37 [TYR] | 0:2597 [U] | 1O:27 [GLY] | 1A:2574 [U] | ✔ |
K:37 [TYR] | 0:2598 [U] | 1O:27 [GLY] | 1A:2575 [U] | ✔ |
K:37 [TYR] | 0:2711 [U] | 1O:27 [GLY] | 1A:2686 [G] | ✔ |
K:85 [GLY] | 0:2720 [C] | 1O:74 [GLY] | 1A:2695 [C] | ✔ |
K:17 [LEU] | 0:1744 [G] | 1O:7 [TYR] | 1A:1713 [G] | ✔ |
K:17 [LEU] | 0:1745 [G] | 1O:7 [TYR] | 1A:1714 [G] | ✔ |
K:11 [GLY] | 0:1743 [G] | 1O:1 [MET] | 1A:1712 [A] | ✔ |
K:11 [GLY] | 0:1744 [G] | 1O:1 [MET] | 1A:1713 [G] | ✔ |
K:81 [ARG] | 0:2720 [C] | 1O:70 [LYS] | 1A:2695 [C] | ✔ |
K:81 [ARG] | 0:2763 [G] | 1O:70 [LYS] | 1A:2740 [G] | ✔ |
K:81 [ARG] | 0:2764 [C] | 1O:70 [LYS] | 1A:2741 [U] | ✔ |
K:13 [GLU] | 0:1743 [G] | 1O:3 [GLN] | 1A:1712 [A] | ✔ |
K:13 [GLU] | 0:1744 [G] | 1O:3 [GLN] | 1A:1713 [G] | ✔ |
K:13 [GLU] | 0:1747 [A] | 1O:3 [GLN] | 1A:1716 [A] | ✔ |
K:13 [GLU] | 0:2036 [C] | 1O:3 [GLN] | 1A:2017 [U] | ✔ |
K:87 [ARG] | 0:2721 [U] | 1O:76 [ALA] | 1A:2696 [U] | ✔ |
K:14 [LYS] | 0:1747 [A] | 1O:4 [PRO] | 1A:1716 [A] | ✔ |
K:14 [LYS] | 0:2583 [A] | 1O:4 [PRO] | 1A:2560 [G] | ✔ |
K:32 [ILE] | 0:1993 [C] | 1O:22 [ILE] | 1A:1974 [A] | ✔ |
K:32 [ILE] | 0:2596 [A] | 1O:22 [ILE] | 1A:2573 [A] | ✔ |
K:35 [HIS] | 0:2597 [U] | 1O:25 [LEU] | 1A:2574 [U] | ✔ |
K:78 [LYS] | 0:1742 [A] | 1O:67 [LYS] | 1A:1711 [A] | ✔ |
K:78 [LYS] | 0:1743 [G] | 1O:67 [LYS] | 1A:1712 [A] | ✔ |
K:78 [LYS] | 0:2722 [G] | 1O:67 [LYS] | 1A:2697 [G] | ✔ |
K:78 [LYS] | 0:2762 [C] | 1O:67 [LYS] | 1A:2739 [U] | ✔ |
K:30 [LYS] | 0:1993 [C] | 1O:20 [MET] | 1A:1974 [A] | ✔ |
K:39 [GLY] | 0:2581 [U] | 1O:29 [ASN] | 1A:2558 [U] | ✔ |
K:39 [GLY] | 0:2582 [G] | 1O:29 [ASN] | 1A:2559 [U] | ✔ |
K:39 [GLY] | 0:2601 [A] | 1O:29 [ASN] | 1A:2578 [A] | ✔ |
K:39 [GLY] | 0:2711 [U] | 1O:29 [ASN] | 1A:2686 [G] | ✔ |
K:39 [GLY] | 0:2712 [G] | 1O:29 [ASN] | 1A:2687 [A] | ✔ |
K:15 [GLY] | 0:1745 [G] | 1O:5 [GLN] | 1A:1714 [G] | ✔ |
K:15 [GLY] | 0:1746 [A] | 1O:5 [GLN] | 1A:1715 [A] | ✔ |
K:33 [SER] | 0:2596 [A] | 1O:23 [ARG] | 1A:2573 [A] | ✔ |
K:33 [SER] | 0:2597 [U] | 1O:23 [ARG] | 1A:2574 [U] | ✔ |
K:93 [ASN] | 0:1743 [G] | 1O:82 [ASN] | 1A:1712 [A] | ✔ |
K:93 [ASN] | 0:1744 [G] | 1O:82 [ASN] | 1A:1713 [G] | ✔ |
K:38 [SER] | 0:2582 [G] | 1O:28 [SER] | 1A:2559 [U] | ✔ |
K:38 [SER] | 0:2598 [U] | 1O:28 [SER] | 1A:2575 [U] | ✔ |
K:38 [SER] | 0:2600 [A] | 1O:28 [SER] | 1A:2577 [A] | ✔ |
K:38 [SER] | 0:2601 [A] | 1O:28 [SER] | 1A:2578 [A] | ✔ |
K:38 [SER] | 0:2711 [U] | 1O:28 [SER] | 1A:2686 [G] | ✔ |
K:46 [LYS] | 0:2712 [G] | 1O:32 [TYR] | 1A:2687 [A] | ✔ |
K:12 [LEU] | 0:1743 [G] | 1O:2 [ILE] | 1A:1712 [A] | ✔ |
K:12 [LEU] | 0:1744 [G] | 1O:2 [ILE] | 1A:1713 [G] | ✔ |
K:16 [SER] | 0:1744 [G] | 1O:6 [THR] | 1A:1713 [G] | ✔ |
K:16 [SER] | 0:1745 [G] | 1O:6 [THR] | 1A:1714 [G] | ✔ |
K:58 [THR] | 0:1993 [C] | 1O:44 [LYS] | 1A:1974 [A] | ✔ |
K:56 [SER] | 0:1993 [C] | 1O:42 [SER] | 1A:1974 [A] | ✔ |
K:34 [VAL] | 0:2597 [U] | 1O:24 [VAL] | 1A:2574 [U] | ✔ |
K:54 [THR] | 0:2596 [A] | 1O:40 [VAL] | 1A:2573 [A] | ✔ |
K:54 [THR] | 0:2597 [U] | 1O:40 [VAL] | 1A:2574 [U] | ✔ |
K:66 [ARG] | 0:1992 [U] | 1O:55 [GLY] | 1A:1973 [U] | ❌ 4Y4O_1O_1A |
K:37 [TYR] | 0:2601 [A] | 1O:27 [GLY] | 1A:2578 [A] | ❌ 4Y4O_1O_1A |
K:37 [TYR] | 0:2712 [G] | 1O:27 [GLY] | 1A:2687 [A] | ❌ 4Y4O_1O_1A |
K:45 [PRO] | 0:2583 [A] | 1O:31 [LYS] | 1A:2560 [G] | ❌ 4Y4O_1O_1A |
K:87 [ARG] | 0:2720 [C] | 1O:76 [ALA] | 1A:2695 [C] | ❌ 4Y4O_1O_1A |
K:87 [ARG] | 0:2763 [G] | 1O:76 [ALA] | 1A:2740 [G] | ❌ 4Y4O_1O_1A |
K:87 [ARG] | 0:2764 [C] | 1O:76 [ALA] | 1A:2741 [U] | ❌ 4Y4O_1O_1A |
K:14 [LYS] | 0:1993 [C] | 1O:4 [PRO] | 1A:1974 [A] | ❌ 4Y4O_1O_1A |
K:14 [LYS] | 0:2596 [A] | 1O:4 [PRO] | 1A:2573 [A] | ❌ 4Y4O_1O_1A |
K:35 [HIS] | 0:2598 [U] | 1O:25 [LEU] | 1A:2575 [U] | ❌ 4Y4O_1O_1A |
K:36 [GLY] | 0:2597 [U] | 1O:26 [LYS] | 1A:2574 [U] | ❌ 4Y4O_1O_1A |
K:36 [GLY] | 0:2598 [U] | 1O:26 [LYS] | 1A:2575 [U] | ❌ 4Y4O_1O_1A |
K:36 [GLY] | 0:2599 [A] | 1O:26 [LYS] | 1A:2576 [A] | ❌ 4Y4O_1O_1A |
K:30 [LYS] | 0:1992 [U] | 1O:20 [MET] | 1A:1973 [U] | ❌ 4Y4O_1O_1A |
K:38 [SER] | 0:2712 [G] | 1O:28 [SER] | 1A:2687 [A] | ❌ 4Y4O_1O_1A |
K:46 [LYS] | 0:2711 [U] | 1O:32 [TYR] | 1A:2686 [G] | ❌ 4Y4O_1O_1A |
K:44 [HIS] | 0:1744 [G] | 1O:30 [ALA] | 1A:1713 [G] | ❌ 4Y4O_1O_1A |
K:44 [HIS] | 0:1747 [A] | 1O:30 [ALA] | 1A:1716 [A] | ❌ 4Y4O_1O_1A |
K:44 [HIS] | 0:2036 [C] | 1O:30 [ALA] | 1A:2017 [U] | ❌ 4Y4O_1O_1A |
K:44 [HIS] | 0:2583 [A] | 1O:30 [ALA] | 1A:2560 [G] | ❌ 4Y4O_1O_1A |
K:34 [VAL] | 0:2598 [U] | 1O:24 [VAL] | 1A:2575 [U] | ❌ 4Y4O_1O_1A |
K:11 [GLY] | 0:2762 [C] | 1O:1 [MET] | 1A:2739 [U] | ❌ 3CC2_K_0 |
K:11 [GLY] | 0:1742 [A] | 1O:1 [MET] | 1A:1711 [A] | ❌ 3CC2_K_0 |
K:11 [GLY] | 0:2037 [C] | 1O:1 [MET] | 1A:2018 [C] | ❌ 3CC2_K_0 |
K:30 [LYS] | 0:1746 [A] | 1O:20 [MET] | 1A:1715 [A] | ❌ 3CC2_K_0 |
K:32 [ILE] | 0:2583 [A] | 1O:22 [ILE] | 1A:2560 [G] | ❌ 3CC2_K_0 |
K:33 [SER] | 0:2583 [A] | 1O:23 [ARG] | 1A:2560 [G] | ❌ 3CC2_K_0 |
K:33 [SER] | 0:2582 [G] | 1O:23 [ARG] | 1A:2559 [U] | ❌ 3CC2_K_0 |
K:33 [SER] | 0:2601 [A] | 1O:23 [ARG] | 1A:2578 [A] | ❌ 3CC2_K_0 |
K:35 [HIS] | 0:2596 [A] | 1O:25 [LEU] | 1A:2573 [A] | ❌ 3CC2_K_0 |
K:36 [GLY] | 0:2711 [U] | 1O:26 [LYS] | 1A:2686 [G] | ❌ 3CC2_K_0 |
K:36 [GLY] | 0:2710 [U] | 1O:26 [LYS] | 1A:2685 [G] | ❌ 3CC2_K_0 |
K:38 [SER] | 0:2599 [A] | 1O:28 [SER] | 1A:2576 [A] | ❌ 3CC2_K_0 |
K:38 [SER] | 0:2597 [U] | 1O:28 [SER] | 1A:2574 [U] | ❌ 3CC2_K_0 |
K:44 [HIS] | 0:2711 [U] | 1O:30 [ALA] | 1A:2686 [G] | ❌ 3CC2_K_0 |
K:44 [HIS] | 0:2712 [G] | 1O:30 [ALA] | 1A:2687 [A] | ❌ 3CC2_K_0 |
K:45 [PRO] | 0:2711 [U] | 1O:31 [LYS] | 1A:2686 [G] | ❌ 3CC2_K_0 |
K:45 [PRO] | 0:2036 [C] | 1O:31 [LYS] | 1A:2017 [U] | ❌ 3CC2_K_0 |
K:45 [PRO] | 0:2713 [G] | 1O:31 [LYS] | 1A:2688 [C] | ❌ 3CC2_K_0 |
K:45 [PRO] | 0:2712 [G] | 1O:31 [LYS] | 1A:2687 [A] | ❌ 3CC2_K_0 |
K:45 [PRO] | 0:2037 [C] | 1O:31 [LYS] | 1A:2018 [C] | ❌ 3CC2_K_0 |
K:46 [LYS] | 0:2036 [C] | 1O:32 [TYR] | 1A:2017 [U] | ❌ 3CC2_K_0 |
K:46 [LYS] | 0:2762 [C] | 1O:32 [TYR] | 1A:2739 [U] | ❌ 3CC2_K_0 |
K:46 [LYS] | 0:1743 [G] | 1O:32 [TYR] | 1A:1712 [A] | ❌ 3CC2_K_0 |
K:46 [LYS] | 0:2037 [C] | 1O:32 [TYR] | 1A:2018 [C] | ❌ 3CC2_K_0 |
K:14 [LYS] | 0:1744 [G] | 1O:4 [PRO] | 1A:1713 [G] | ❌ 3CC2_K_0 |
K:56 [SER] | 0:1992 [U] | 1O:42 [SER] | 1A:1973 [U] | ❌ 3CC2_K_0 |
K:58 [THR] | 0:1992 [U] | 1O:44 [LYS] | 1A:1973 [U] | ❌ 3CC2_K_0 |
K:15 [GLY] | 0:1747 [A] | 1O:5 [GLN] | 1A:1716 [A] | ❌ 3CC2_K_0 |
K:15 [GLY] | 0:1993 [C] | 1O:5 [GLN] | 1A:1974 [A] | ❌ 3CC2_K_0 |
K:15 [GLY] | 0:1744 [G] | 1O:5 [GLN] | 1A:1713 [G] | ❌ 3CC2_K_0 |
K:78 [LYS] | 0:2721 [U] | 1O:67 [LYS] | 1A:2696 [U] | ❌ 3CC2_K_0 |
K:79 [PRO] | 0:2722 [G] | 1O:68 [GLU] | 1A:2697 [G] | ❌ 3CC2_K_0 |
K:79 [PRO] | 0:1742 [A] | 1O:68 [GLU] | 1A:1711 [A] | ❌ 3CC2_K_0 |
K:81 [ARG] | 0:2721 [U] | 1O:70 [LYS] | 1A:2696 [U] | ❌ 3CC2_K_0 |
K:66 [ARG] | 0:1994 [A] | 1O:55 [GLY] | 1A:1975 [A] | ❌ 4Y4O_1A:1975 no longer at interface |
K:81 [ARG] | 0:2765 [C] | 1O:70 [LYS] | 1A:2742 [G] | ❌ 4Y4O_1A:2742 no longer at interface |
K:14 [LYS] | 0:2584 [G] | 1O:4 [PRO] | 1A:2561 [G] | ❌ 4Y4O_1A:2561 no longer at interface |
K:120 [ARG] | 0:2709 [G] | 1O:110 [GLY] | 1A:2684 [G] | ❌ 4Y4O_1O:110, 4Y4O_1A:2684 no longer at interface |
K:44 [HIS] | 0:2035 [C] | 1O:30 [ALA] | 1A:2016 [C] | ❌ 4Y4O_1A:2016 no longer at interface |
K:44 [HIS] | 0:2584 [G] | 1O:30 [ALA] | 1A:2561 [G] | ❌ 4Y4O_1A:2561 no longer at interface |
K:32 [ILE] | 0:2595 [U] | 1O:22 [ILE] | 1A:2572 [C] | ❌ 3CC2_0:2595 no longer at interface |
K:17 [LEU] | 0:2029 [C] | 1O:7 [TYR] | 1A:2010 [C] | ❌ 3CC2_0:2029 no longer at interface |
K:57 [VAL] | 0:1993 [C] | 1O:43 [VAL] | 1A:1974 [A] | ❌ 3CC2_K:57 no longer at interface |
K:70 [GLU] | 0:2597 [U] | 1O:59 [LYS] | 1A:2574 [U] | ❌ 3CC2_K:70 no longer at interface |
K:89 [LYS] | 0:2722 [G] | 1O:78 [ARG] | 1A:2697 [G] | ❌ 3CC2_K:89 no longer at interface |
K:89 [LYS] | 0:2721 [U] | 1O:78 [ARG] | 1A:2696 [U] | ❌ 3CC2_K:89 no longer at interface |
Properties of this pair
Common ECOD label(s) |
Common RFAM label(s) |
Interface TM-score |
Interface RMSD |
Percentage identity |
Protein TM-score |
RNA TM-score |
Protein coverage |
RNA coverage |
Percentage conservation |
Apolar conservation |
H-bond conservation |
Percentage switching out |
---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
Ribosomal protein L14-related | 0.93 | 2.31 | 0.24 | 0.9 | 0.93 | 0.91 | 0.94 | 0.54 | 0.44 | 0.17 | 0.18 |
Other pairs involving 3CC2_K_0 or 4Y4O_1O_1A
Total number of entries: 20