RNAprotDB

All interfaces > All interologs > Interface groups > group132 > 4Y4O_1O_1A vs 6AZ3_J_2

Interface analysis


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Licorice
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Licorice
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RNA
Protein
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Interface

show interface as licorice

Common contacts -

4Y4O_1O
4Y4O_1A
6AZ3_J
6AZ3_2
Conserved?
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1O:7 [TYR] 1A:2010 [C] J:24 [VAL] 2:577 [C] ❌ 6AZ3_2:577 no longer at interface
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1O:32 [TYR] 1A:2018 [C] J:53 [SER] 2:585 [C] ❌ 6AZ3_J:53 no longer at interface
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1O:54 [GLU] 1A:1974 [A] J:72 [ARG] 2:541 [A] ❌ 4Y4O_1O:54 no longer at interface
1O:54 [GLU] 1A:1973 [U] J:72 [ARG] 2:540 [C] ❌ 4Y4O_1O:54 no longer at interface
1O:56 [ASP] 1A:1974 [A] J:74 [LYS] 2:541 [A] ❌ 4Y4O_1O:56 no longer at interface

logo_download Export the table of contacts

Properties of this pair

Common ECOD label(s)
 Common RFAM label(s)
 Interface TM-score
 Interface RMSD
 Percentage identity
 Protein TM-score
 RNA TM-score
 Protein coverage
 RNA coverage
 Percentage conservation
 Apolar conservation
 H-bond conservation
 Percentage switching out
Ribosomal protein L14-related 0.83 2.11 0.24 0.89 0.83 0.79 0.8 0.70 0.66 0.19 0.28


Other pairs involving 4Y4O_1O_1A or 6AZ3_J_2

Total number of entries: 19

Interface 1 Interface 2 Percentage conservation
 		Interface TM-score
 		Interface RMSD
 		Percentage identity
 		Common ECOD label(s)
 		Common RFAM label(s)
 		Explore both interfaces
1YHQ_K_0 6AZ3_J_2 0.86 0.83 1.04 0.5 Ribosomal protein L14-related compare
1YHQ_K_0 4Y4O_1O_1A 0.54 0.93 2.31 0.24 Ribosomal protein L14-related compare
1VQ8_K_0 6AZ3_J_2 0.86 0.83 1.08 0.5 Ribosomal protein L14-related compare
1VQ8_K_0 4Y4O_1O_1A 0.55 0.93 2.28 0.24 Ribosomal protein L14-related compare
1JJ2_J_0 4Y4O_1O_1A 0.53 0.93 2.26 0.26 Ribosomal protein L14-related compare
1JJ2_J_0 6AZ3_J_2 0.88 0.83 1.04 0.5 Ribosomal protein L14-related compare
4Y4O_1O_1A 6AZ3_J_2 0.70 0.83 2.11 0.24 Ribosomal protein L14-related compare
4Y4O_1O_1A 7RYG_J_A 0.86 0.96 1.53 0.52 Ribosomal protein L14-related Bacterial large subunit ribosomal RNA compare
4Y4O_1O_1A 7K00_j_a 0.87 0.97 0.94 0.62 Ribosomal protein L14-related Bacterial large subunit ribosomal RNA compare
4Y4O_1O_1A 6S0Z_I_A 0.77 0.97 1.1 0.56 Ribosomal protein L14-related Bacterial large subunit ribosomal RNA compare
4Y4O_1O_1A 7OF0_L_A 0.62 0.97 1.57 0.28 Ribosomal protein L14-related Bacterial large subunit ribosomal RNA compare
4Y4O_1O_1A 7O7Y_BV_B5 0.59 0.9 2.27 0.21 Ribosomal protein L14-related compare
3CC2_K_0 4Y4O_1O_1A 0.54 0.93 2.31 0.24 Ribosomal protein L14-related compare
3CC2_K_0 6AZ3_J_2 0.85 0.83 1.03 0.47 Ribosomal protein L14-related compare
6AZ3_J_2 7K00_j_a 0.72 0.83 1.83 0.21 Ribosomal protein L14-related compare
6AZ3_J_2 7RYG_J_A 0.66 0.82 2.44 0.21 Ribosomal protein L14-related compare
6AZ3_J_2 6S0Z_I_A 0.67 0.83 2.18 0.25 Ribosomal protein L14-related compare
6AZ3_J_2 7OF0_L_A 0.66 0.53 2.07 0.09 Ribosomal protein L14-related compare
6AZ3_J_2 7O7Y_BV_B5 0.93 0.91 0.71 0.72 Ribosomal protein L14-related Eukaryotic large subunit ribosomal RNA compare