Interface analysis
Style
Protein
CartoonLicorice
Surface
RNA
CartoonLicorice
Surface
Color
StructureStructure (with hetatm)
Chain
Chainbow
View
Focus on
InterfaceRNA
Protein
All
Show chains
Interface
show interface as licoriceCommon contacts -
6S0Z_I
|
6S0Z_A
|
7O7Y_BV
|
7O7Y_B5
|
Conserved?
|
---|---|---|---|---|
I:55 [GLY] | A:1979 [A] | BV:74 [LYS] | B5:3531 [A] | ✔ |
I:24 [VAL] | A:2589 [U] | BV:42 [VAL] | B5:4254 [C] | ✔ |
I:23 [LYS] | A:2588 [A] | BV:41 [SER] | B5:4253 [A] | ✔ |
I:23 [LYS] | A:2589 [U] | BV:41 [SER] | B5:4254 [C] | ✔ |
I:5 [GLU] | A:1710 [G] | BV:23 [GLY] | B5:2690 [G] | ✔ |
I:5 [GLU] | A:1711 [G] | BV:23 [GLY] | B5:2691 [G] | ✔ |
I:5 [GLU] | A:1712 [A] | BV:23 [GLY] | B5:2692 [A] | ✔ |
I:5 [GLU] | A:1713 [A] | BV:23 [GLY] | B5:2693 [A] | ✔ |
I:74 [GLY] | A:2710 [C] | BV:93 [GLY] | B5:4374 [PSU] | ✔ |
I:28 [SER] | A:2574 [U] | BV:46 [LYS] | B5:4239 [U] | ✔ |
I:28 [SER] | A:2590 [U] | BV:46 [LYS] | B5:4255 [U] | ✔ |
I:28 [SER] | A:2592 [A] | BV:46 [LYS] | B5:4257 [A] | ✔ |
I:28 [SER] | A:2593 [A] | BV:46 [LYS] | B5:4258 [U] | ✔ |
I:28 [SER] | A:2701 [G] | BV:46 [LYS] | B5:4365 [U] | ✔ |
I:44 [LYS] | A:1978 [U] | BV:66 [LYS] | B5:3530 [U] | ✔ |
I:44 [LYS] | A:1979 [A] | BV:66 [LYS] | B5:3531 [A] | ✔ |
I:20 [LEU] | A:1979 [A] | BV:38 [TYR] | B5:3531 [A] | ✔ |
I:4 [GLN] | A:1710 [G] | BV:22 [VAL] | B5:2690 [G] | ✔ |
I:4 [GLN] | A:1713 [A] | BV:22 [VAL] | B5:2693 [A] | ✔ |
I:4 [GLN] | A:2575 [G] | BV:22 [VAL] | B5:4240 [OMG] | ✔ |
I:42 [THR] | A:1979 [A] | BV:64 [THR] | B5:3531 [A] | ✔ |
I:82 [ASN] | A:1709 [A] | BV:101 [ASN] | B5:2689 [G] | ✔ |
I:82 [ASN] | A:1710 [G] | BV:101 [ASN] | B5:2690 [G] | ✔ |
I:40 [VAL] | A:2588 [A] | BV:62 [MET] | B5:4253 [A] | ✔ |
I:40 [VAL] | A:2589 [U] | BV:62 [MET] | B5:4254 [C] | ✔ |
I:6 [THR] | A:1710 [G] | BV:24 [ALA] | B5:2690 [G] | ✔ |
I:6 [THR] | A:1711 [G] | BV:24 [ALA] | B5:2691 [G] | ✔ |
I:76 [TYR] | A:2710 [C] | BV:95 [PHE] | B5:4374 [PSU] | ✔ |
I:76 [TYR] | A:2711 [U] | BV:95 [PHE] | B5:4375 [U] | ✔ |
I:29 [GLY] | A:2574 [U] | BV:47 [GLY] | B5:4239 [U] | ✔ |
I:29 [GLY] | A:2701 [G] | BV:47 [GLY] | B5:4365 [U] | ✔ |
I:29 [GLY] | A:2702 [A] | BV:47 [GLY] | B5:4366 [OMU] | ✔ |
I:22 [ILE] | A:1979 [A] | BV:40 [ILE] | B5:3531 [A] | ✔ |
I:22 [ILE] | A:2588 [A] | BV:40 [ILE] | B5:4253 [A] | ✔ |
I:54 [LYS] | A:1978 [U] | BV:73 [ARG] | B5:3530 [U] | ✔ |
I:66 [LYS] | A:1709 [A] | BV:85 [ARG] | B5:2689 [G] | ✔ |
I:66 [LYS] | A:1710 [G] | BV:85 [ARG] | B5:2690 [G] | ✔ |
I:26 [GLY] | A:2589 [U] | BV:44 [GLY] | B5:4254 [C] | ✔ |
I:26 [GLY] | A:2590 [U] | BV:44 [GLY] | B5:4255 [U] | ✔ |
I:3 [GLN] | A:1709 [A] | BV:21 [PRO] | B5:2689 [G] | ✔ |
I:3 [GLN] | A:1710 [G] | BV:21 [PRO] | B5:2690 [G] | ✔ |
I:3 [GLN] | A:2022 [U] | BV:21 [PRO] | B5:3574 [C] | ✔ |
I:70 [ARG] | A:2710 [C] | BV:89 [ARG] | B5:4374 [PSU] | ✔ |
I:70 [ARG] | A:2755 [U] | BV:89 [ARG] | B5:4418 [A] | ✔ |
I:70 [ARG] | A:2756 [G] | BV:89 [ARG] | B5:4419 [PSU] | ✔ |
I:1 [MET] | A:1709 [A] | BV:19 [GLY] | B5:2689 [G] | ✔ |
I:1 [MET] | A:1710 [G] | BV:19 [GLY] | B5:2690 [G] | ✔ |
I:67 [SER] | A:1709 [A] | BV:86 [LYS] | B5:2689 [G] | ✔ |
I:25 [LEU] | A:2589 [U] | BV:43 [LYS] | B5:4254 [C] | ✔ |
I:25 [LEU] | A:2590 [U] | BV:43 [LYS] | B5:4255 [U] | ✔ |
I:57 [VAL] | A:1979 [A] | BV:76 [VAL] | B5:3531 [A] | ✔ |
I:57 [VAL] | A:2588 [A] | BV:76 [VAL] | B5:4253 [A] | ✔ |
I:7 [ARG] | A:1710 [G] | BV:25 [VAL] | B5:2690 [G] | ✔ |
I:7 [ARG] | A:1711 [G] | BV:25 [VAL] | B5:2691 [G] | ✔ |
I:27 [GLY] | A:2589 [U] | BV:45 [ILE] | B5:4254 [C] | ✔ |
I:27 [GLY] | A:2590 [U] | BV:45 [ILE] | B5:4255 [U] | ✔ |
I:23 [LYS] | A:2574 [U] | BV:41 [SER] | B5:4239 [U] | ❌ 7O7Y_BV_B5 |
I:23 [LYS] | A:2575 [G] | BV:41 [SER] | B5:4240 [OMG] | ❌ 7O7Y_BV_B5 |
I:5 [GLU] | A:1979 [A] | BV:23 [GLY] | B5:3531 [A] | ❌ 7O7Y_BV_B5 |
I:5 [GLU] | A:2576 [G] | BV:23 [GLY] | B5:4241 [G] | ❌ 7O7Y_BV_B5 |
I:28 [SER] | A:2702 [A] | BV:46 [LYS] | B5:4366 [OMU] | ❌ 7O7Y_BV_B5 |
I:4 [GLN] | A:1979 [A] | BV:22 [VAL] | B5:3531 [A] | ❌ 7O7Y_BV_B5 |
I:4 [GLN] | A:2576 [G] | BV:22 [VAL] | B5:4241 [G] | ❌ 7O7Y_BV_B5 |
I:31 [LYS] | A:2022 [U] | BV:53 [PRO] | B5:3574 [C] | ❌ 7O7Y_BV_B5 |
I:31 [LYS] | A:2023 [C] | BV:53 [PRO] | B5:3575 [C] | ❌ 7O7Y_BV_B5 |
I:31 [LYS] | A:2702 [A] | BV:53 [PRO] | B5:4366 [OMU] | ❌ 7O7Y_BV_B5 |
I:76 [TYR] | A:2754 [G] | BV:95 [PHE] | B5:4417 [C] | ❌ 7O7Y_BV_B5 |
I:26 [GLY] | A:2591 [A] | BV:44 [GLY] | B5:4256 [A] | ❌ 7O7Y_BV_B5 |
I:3 [GLN] | A:1713 [A] | BV:21 [PRO] | B5:2693 [A] | ❌ 7O7Y_BV_B5 |
I:70 [ARG] | A:2754 [G] | BV:89 [ARG] | B5:4417 [C] | ❌ 7O7Y_BV_B5 |
I:30 [ARG] | A:2701 [G] | BV:52 [LEU] | B5:4365 [U] | ❌ 7O7Y_BV_B5 |
I:30 [ARG] | A:2702 [A] | BV:52 [LEU] | B5:4366 [OMU] | ❌ 7O7Y_BV_B5 |
I:1 [MET] | A:1708 [A] | BV:19 [GLY] | B5:2688 [A] | ❌ 7O7Y_BV_B5 |
I:1 [MET] | A:2023 [C] | BV:19 [GLY] | B5:3575 [C] | ❌ 7O7Y_BV_B5 |
I:1 [MET] | A:2753 [U] | BV:19 [GLY] | B5:4416 [C] | ❌ 7O7Y_BV_B5 |
I:27 [GLY] | A:2701 [G] | BV:45 [ILE] | B5:4365 [U] | ❌ 7O7Y_BV_B5 |
I:22 [ILE] | A:2575 [G] | BV:40 [ILE] | B5:4240 [OMG] | ❌ 6S0Z_I_A |
I:27 [GLY] | A:2593 [A] | BV:45 [ILE] | B5:4258 [U] | ❌ 6S0Z_I_A |
I:28 [SER] | A:2591 [A] | BV:46 [LYS] | B5:4256 [A] | ❌ 6S0Z_I_A |
I:28 [SER] | A:2589 [U] | BV:46 [LYS] | B5:4254 [C] | ❌ 6S0Z_I_A |
I:30 [ARG] | A:2022 [U] | BV:52 [LEU] | B5:3574 [C] | ❌ 6S0Z_I_A |
I:30 [ARG] | A:1713 [A] | BV:52 [LEU] | B5:2693 [A] | ❌ 6S0Z_I_A |
I:30 [ARG] | A:2576 [G] | BV:52 [LEU] | B5:4241 [G] | ❌ 6S0Z_I_A |
I:30 [ARG] | A:2575 [G] | BV:52 [LEU] | B5:4240 [OMG] | ❌ 6S0Z_I_A |
I:30 [ARG] | A:1710 [G] | BV:52 [LEU] | B5:2690 [G] | ❌ 6S0Z_I_A |
I:31 [LYS] | A:2575 [G] | BV:53 [PRO] | B5:4240 [OMG] | ❌ 6S0Z_I_A |
I:55 [GLY] | A:1978 [U] | BV:74 [LYS] | B5:3530 [U] | ❌ 6S0Z_I_A |
I:67 [SER] | A:2754 [G] | BV:86 [LYS] | B5:4417 [C] | ❌ 6S0Z_I_A |
I:67 [SER] | A:1708 [A] | BV:86 [LYS] | B5:2688 [A] | ❌ 6S0Z_I_A |
I:67 [SER] | A:2712 [G] | BV:86 [LYS] | B5:4376 [G] | ❌ 6S0Z_I_A |
I:76 [TYR] | A:2755 [U] | BV:95 [PHE] | B5:4418 [A] | ❌ 6S0Z_I_A |
I:7 [ARG] | A:2015 [C] | BV:25 [VAL] | B5:3567 [C] | ❌ 7O7Y_B5:3567 no longer at interface |
I:20 [LEU] | A:1980 [A] | BV:38 [TYR] | B5:3532 [A] | ❌ 6S0Z_A:1980 no longer at interface |
I:22 [ILE] | A:2587 [C] | BV:40 [ILE] | B5:4252 [C] | ❌ 6S0Z_A:2587 no longer at interface |
I:28 [SER] | A:2674 [U] | BV:46 [LYS] | B5:4338 [C] | ❌ 6S0Z_A:2674 no longer at interface |
I:28 [SER] | A:2675 [G] | BV:46 [LYS] | B5:4339 [C] | ❌ 6S0Z_A:2675 no longer at interface |
I:29 [GLY] | A:2573 [U] | BV:47 [GLY] | B5:4238 [U] | ❌ 6S0Z_A:2573 no longer at interface |
I:30 [ARG] | A:2021 [C] | BV:52 [LEU] | B5:3573 [OMC] | ❌ 6S0Z_A:2021 no longer at interface |
I:55 [GLY] | A:1977 [G] | BV:74 [LYS] | B5:3529 [C] | ❌ 6S0Z_A:1977 no longer at interface |
I:57 [VAL] | A:2587 [C] | BV:76 [VAL] | B5:4252 [C] | ❌ 6S0Z_A:2587 no longer at interface |
I:72 [ASN] | A:2757 [U] | BV:91 [LYS] | B5:4420 [C] | ❌ 6S0Z_I:72, 6S0Z_A:2757 no longer at interface |
I:43 [VAL] | A:1979 [A] | BV:65 [VAL] | B5:3531 [A] | ❌ 7O7Y_BV:65 no longer at interface |
I:78 [LYS] | A:2711 [U] | BV:97 [TYR] | B5:4375 [U] | ❌ 7O7Y_BV:97 no longer at interface |
I:78 [LYS] | A:2712 [G] | BV:97 [TYR] | B5:4376 [G] | ❌ 7O7Y_BV:97 no longer at interface |
I:59 [LYS] | A:2589 [U] | BV:78 [PRO] | B5:4254 [C] | ❌ 7O7Y_BV:78 no longer at interface |
I:2 [ILE] | A:1709 [A] | BV:20 [LEU] | B5:2689 [G] | ❌ 6S0Z_I:2 no longer at interface |
I:2 [ILE] | A:1710 [G] | BV:20 [LEU] | B5:2690 [G] | ❌ 6S0Z_I:2 no longer at interface |
I:56 [ASP] | A:1979 [A] | BV:75 [LYS] | B5:3531 [A] | ❌ 6S0Z_I:56 no longer at interface |
I:68 [GLY] | A:2711 [U] | BV:87 [SER] | B5:4375 [U] | ❌ 6S0Z_I:68 no longer at interface |
Properties of this pair
Common ECOD label(s) |
Common RFAM label(s) |
Interface TM-score |
Interface RMSD |
Percentage identity |
Protein TM-score |
RNA TM-score |
Protein coverage |
RNA coverage |
Percentage conservation |
Apolar conservation |
H-bond conservation |
Percentage switching out |
---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
Ribosomal protein L14-related | 0.89 | 2.29 | 0.31 | 0.89 | 0.89 | 0.91 | 0.97 | 0.63 | 0.58 | 0.18 | 0.34 |
Other pairs involving 6S0Z_I_A or 7O7Y_BV_B5
Total number of entries: 17