Interface analysis
Style
Protein
CartoonLicorice
Surface
RNA
CartoonLicorice
Surface
Color
StructureStructure (with hetatm)
Chain
Chainbow
View
Focus on
InterfaceRNA
Protein
All
Show chains
Interface
show interface as licoriceCommon contacts -
7OF0_L
|
7OF0_A
|
7RYG_J
|
7RYG_A
|
Conserved?
|
---|---|---|---|---|
L:61 [TYR] | A:3049 [U] | J:25 [LEU] | A:2558 [U] | ✔ |
L:61 [TYR] | A:3050 [U] | J:25 [LEU] | A:2559 [U] | ✔ |
L:56 [ARG] | A:2472 [A] | J:20 [GLN] | A:1666 [A] | ✔ |
L:35 [MET] | A:2470 [G] | J:5 [GLU] | A:1664 [G] | ✔ |
L:35 [MET] | A:2471 [G] | J:5 [GLU] | A:1665 [G] | ✔ |
L:35 [MET] | A:2472 [A] | J:5 [GLU] | A:1666 [A] | ✔ |
L:35 [MET] | A:2473 [A] | J:5 [GLU] | A:1667 [A] | ✔ |
L:35 [MET] | A:2615 [A] | J:5 [GLU] | A:1948 [A] | ✔ |
L:90 [CYS] | A:2469 [A] | J:66 [LYS] | A:1663 [A] | ✔ |
L:90 [CYS] | A:2470 [G] | J:66 [LYS] | A:1664 [G] | ✔ |
L:63 [LYS] | A:3050 [U] | J:28 [SER] | A:2559 [U] | ✔ |
L:63 [LYS] | A:3142 [A] | J:28 [SER] | A:2670 [G] | ✔ |
L:81 [LYS] | A:2615 [A] | J:57 [VAL] | A:1948 [A] | ✔ |
L:81 [LYS] | A:3048 [A] | J:57 [VAL] | A:2557 [U] | ✔ |
L:64 [ASN] | A:3142 [A] | J:30 [ARG] | A:2670 [G] | ✔ |
L:64 [ASN] | A:3143 [U] | J:30 [ARG] | A:2671 [A] | ✔ |
L:33 [GLN] | A:2469 [A] | J:3 [GLN] | A:1663 [A] | ✔ |
L:33 [GLN] | A:2470 [G] | J:3 [GLN] | A:1664 [G] | ✔ |
L:33 [GLN] | A:2658 [U] | J:3 [GLN] | A:1991 [U] | ✔ |
L:59 [HIS] | A:3048 [A] | J:23 [LYS] | A:2557 [U] | ✔ |
L:59 [HIS] | A:3049 [U] | J:23 [LYS] | A:2558 [U] | ✔ |
L:58 [ILE] | A:2615 [A] | J:22 [ILE] | A:1948 [A] | ✔ |
L:76 [ALA] | A:2615 [A] | J:42 [THR] | A:1948 [A] | ✔ |
L:74 [LEU] | A:3048 [A] | J:40 [LYS] | A:2557 [U] | ✔ |
L:74 [LEU] | A:3049 [U] | J:40 [LYS] | A:2558 [U] | ✔ |
L:37 [ARG] | A:2470 [G] | J:7 [MET] | A:1664 [G] | ✔ |
L:37 [ARG] | A:2471 [G] | J:7 [MET] | A:1665 [G] | ✔ |
L:103 [ASN] | A:2469 [A] | J:82 [ASN] | A:1663 [A] | ✔ |
L:103 [ASN] | A:2470 [G] | J:82 [ASN] | A:1664 [G] | ✔ |
L:31 [ALA] | A:2469 [A] | J:1 [MET] | A:1663 [A] | ✔ |
L:31 [ALA] | A:2470 [G] | J:1 [MET] | A:1664 [G] | ✔ |
L:62 [LYS] | A:3142 [A] | J:27 [GLY] | A:2670 [G] | ✔ |
L:79 [GLY] | A:2615 [A] | J:55 [GLY] | A:1948 [A] | ✔ |
L:91 [MET] | A:2468 [A] | J:67 [PHE] | A:1662 [A] | ✔ |
L:91 [MET] | A:2469 [A] | J:67 [PHE] | A:1663 [A] | ✔ |
L:91 [MET] | A:3162 [C] | J:67 [PHE] | A:2722 [U] | ✔ |
L:83 [LYS] | A:3049 [U] | J:59 [ASN] | A:2558 [U] | ✔ |
L:34 [LYS] | A:2470 [G] | J:4 [THR] | A:1664 [G] | ✔ |
L:34 [LYS] | A:2473 [A] | J:4 [THR] | A:1667 [A] | ✔ |
L:34 [LYS] | A:3035 [C] | J:4 [THR] | A:2544 [U] | ✔ |
L:95 [ARG] | A:3151 [A] | J:74 [GLY] | A:2679 [C] | ✔ |
L:95 [ARG] | A:3152 [C] | J:74 [GLY] | A:2680 [U] | ✔ |
L:36 [THR] | A:2470 [G] | J:6 [THR] | A:1664 [G] | ✔ |
L:36 [THR] | A:2471 [G] | J:6 [THR] | A:1665 [G] | ✔ |
L:61 [TYR] | A:3048 [A] | J:25 [LEU] | A:2557 [U] | ❌ 7RYG_J_A |
L:56 [ARG] | A:2471 [G] | J:20 [GLN] | A:1665 [G] | ❌ 7RYG_J_A |
L:99 [ARG] | A:2469 [A] | J:78 [ARG] | A:1663 [A] | ❌ 7RYG_J_A |
L:81 [LYS] | A:3047 [G] | J:57 [VAL] | A:2556 [A] | ❌ 7RYG_J_A |
L:33 [GLN] | A:2659 [C] | J:3 [GLN] | A:1992 [C] | ❌ 7RYG_J_A |
L:62 [LYS] | A:3141 [A] | J:27 [GLY] | A:2669 [G] | ❌ 7RYG_J_A |
L:34 [LYS] | A:3047 [G] | J:4 [THR] | A:2556 [A] | ❌ 7RYG_J_A |
L:34 [LYS] | A:3048 [A] | J:4 [THR] | A:2557 [U] | ❌ 7RYG_J_A |
L:31 [ALA] | A:3162 [C] | J:1 [MET] | A:2722 [U] | ❌ 7OF0_L_A |
L:31 [ALA] | A:2468 [A] | J:1 [MET] | A:1662 [A] | ❌ 7OF0_L_A |
L:31 [ALA] | A:2659 [C] | J:1 [MET] | A:1992 [C] | ❌ 7OF0_L_A |
L:58 [ILE] | A:3048 [A] | J:22 [ILE] | A:2557 [U] | ❌ 7OF0_L_A |
L:59 [HIS] | A:3035 [C] | J:23 [LYS] | A:2544 [U] | ❌ 7OF0_L_A |
L:59 [HIS] | A:3047 [G] | J:23 [LYS] | A:2556 [A] | ❌ 7OF0_L_A |
L:62 [LYS] | A:3050 [U] | J:27 [GLY] | A:2559 [U] | ❌ 7OF0_L_A |
L:62 [LYS] | A:3049 [U] | J:27 [GLY] | A:2558 [U] | ❌ 7OF0_L_A |
L:63 [LYS] | A:3143 [U] | J:28 [SER] | A:2671 [A] | ❌ 7OF0_L_A |
L:33 [GLN] | A:2473 [A] | J:3 [GLN] | A:1667 [A] | ❌ 7OF0_L_A |
L:64 [ASN] | A:3141 [A] | J:30 [ARG] | A:2669 [G] | ❌ 7OF0_L_A |
L:34 [LYS] | A:2615 [A] | J:4 [THR] | A:1948 [A] | ❌ 7OF0_L_A |
L:91 [MET] | A:3163 [G] | J:67 [PHE] | A:2723 [G] | ❌ 7OF0_L_A |
L:99 [ARG] | A:3153 [U] | J:78 [ARG] | A:2681 [G] | ❌ 7OF0_L_A |
L:99 [ARG] | A:3152 [C] | J:78 [ARG] | A:2680 [U] | ❌ 7OF0_L_A |
L:35 [MET] | A:2616 [A] | J:5 [GLU] | A:1949 [A] | ❌ 7RYG_A:1949 no longer at interface |
L:63 [LYS] | A:3051 [A] | J:28 [SER] | A:2560 [A] | ❌ 7RYG_A:2560 no longer at interface |
L:63 [LYS] | A:3115 [U] | J:28 [SER] | A:2643 [U] | ❌ 7RYG_A:2643 no longer at interface |
L:63 [LYS] | A:3116 [C] | J:28 [SER] | A:2644 [G] | ❌ 7RYG_A:2644 no longer at interface |
L:37 [ARG] | A:2652 [G] | J:7 [MET] | A:1985 [G] | ❌ 7RYG_A:1985 no longer at interface |
L:37 [ARG] | A:2653 [C] | J:7 [MET] | A:1986 [C] | ❌ 7RYG_A:1986 no longer at interface |
L:34 [LYS] | A:3036 [G] | J:4 [THR] | A:2545 [G] | ❌ 7RYG_A:2545 no longer at interface |
L:59 [HIS] | A:3034 [U] | J:23 [LYS] | A:2543 [A] | ❌ 7OF0_A:3034 no longer at interface |
L:63 [LYS] | A:3034 [U] | J:28 [SER] | A:2543 [A] | ❌ 7OF0_A:3034 no longer at interface |
L:63 [LYS] | A:3053 [A] | J:28 [SER] | A:2562 [A] | ❌ 7OF0_A:3053 no longer at interface |
L:63 [LYS] | A:3052 [A] | J:28 [SER] | A:2561 [A] | ❌ 7OF0_A:3052 no longer at interface |
L:65 [GLY] | A:3144 [A] | J:31 [ARG] | A:2672 [C] | ❌ 7OF0_L:65, 7OF0_A:3144 no longer at interface |
L:94 [PRO] | A:3164 [C] | J:70 [ARG] | A:2724 [U] | ❌ 7OF0_L:94, 7OF0_A:3164 no longer at interface |
L:68 [LYS] | A:3163 [G] | J:34 [SER] | A:2723 [G] | ❌ 7RYG_J:34 no longer at interface |
L:93 [GLY] | A:3152 [C] | J:69 [ILE] | A:2680 [U] | ❌ 7RYG_J:69 no longer at interface |
L:32 [ILE] | A:2469 [A] | J:2 [ILE] | A:1663 [A] | ❌ 7RYG_J:2 no longer at interface |
L:92 [PRO] | A:2468 [A] | J:68 [GLY] | A:1662 [A] | ❌ 7RYG_J:68 no longer at interface |
L:92 [PRO] | A:2469 [A] | J:68 [GLY] | A:1663 [A] | ❌ 7RYG_J:68 no longer at interface |
L:92 [PRO] | A:3152 [C] | J:68 [GLY] | A:2680 [U] | ❌ 7RYG_J:68 no longer at interface |
L:92 [PRO] | A:3153 [U] | J:68 [GLY] | A:2681 [G] | ❌ 7RYG_J:68 no longer at interface |
L:80 [GLN] | A:2615 [A] | J:56 [ASP] | A:1948 [A] | ❌ 7RYG_J:56 no longer at interface |
L:60 [VAL] | A:3049 [U] | J:24 [VAL] | A:2558 [U] | ❌ 7OF0_L:60 no longer at interface |
L:65 [GLY] | A:3143 [U] | J:31 [ARG] | A:2671 [A] | ❌ 7OF0_L:65 no longer at interface |
L:65 [GLY] | A:2658 [U] | J:31 [ARG] | A:1991 [U] | ❌ 7OF0_L:65 no longer at interface |
L:65 [GLY] | A:2659 [C] | J:31 [ARG] | A:1992 [C] | ❌ 7OF0_L:65 no longer at interface |
L:66 [VAL] | A:2658 [U] | J:32 [TYR] | A:1991 [U] | ❌ 7OF0_L:66 no longer at interface |
L:66 [VAL] | A:2659 [C] | J:32 [TYR] | A:1992 [C] | ❌ 7OF0_L:66 no longer at interface |
L:66 [VAL] | A:3162 [C] | J:32 [TYR] | A:2722 [U] | ❌ 7OF0_L:66 no longer at interface |
L:77 [ILE] | A:2615 [A] | J:43 [VAL] | A:1948 [A] | ❌ 7OF0_L:77 no longer at interface |
L:78 [LYS] | A:2614 [U] | J:54 [LYS] | A:1947 [U] | ❌ 7OF0_L:78 no longer at interface |
L:94 [PRO] | A:3163 [G] | J:70 [ARG] | A:2723 [G] | ❌ 7OF0_L:94 no longer at interface |
L:94 [PRO] | A:3151 [A] | J:70 [ARG] | A:2679 [C] | ❌ 7OF0_L:94 no longer at interface |
L:94 [PRO] | A:3152 [C] | J:70 [ARG] | A:2680 [U] | ❌ 7OF0_L:94 no longer at interface |
L:97 [THR] | A:3153 [U] | J:76 [VAL] | A:2681 [G] | ❌ 7OF0_L:97 no longer at interface |
L:97 [THR] | A:3152 [C] | J:76 [VAL] | A:2680 [U] | ❌ 7OF0_L:97 no longer at interface |
Properties of this pair
Common ECOD label(s) |
Common RFAM label(s) |
Interface TM-score |
Interface RMSD |
Percentage identity |
Protein TM-score |
RNA TM-score |
Protein coverage |
RNA coverage |
Percentage conservation |
Apolar conservation |
H-bond conservation |
Percentage switching out |
---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
Ribosomal protein L14-related | Bacterial large subunit ribosomal RNA | 0.93 | 2.2 | 0.19 | 0.82 | 0.93 | 0.72 | 0.79 | 0.63 | 0.67 | 0.18 | 0.60 |
Other pairs involving 7OF0_L_A or 7RYG_J_A
Total number of entries: 15