Interface analysis
Style
Protein
CartoonLicorice
Surface
RNA
CartoonLicorice
Surface
Color
StructureStructure (with hetatm)
Chain
Chainbow
View
Focus on
InterfaceRNA
Protein
All
Show chains
Interface
show interface as licoriceCommon contacts -
6AZ3_T
|
6AZ3_1,2
|
7O9M_T
|
7O9M_A
|
Conserved?
|
---|---|---|---|---|
T:134 [GLY] | 1:934 [A] | T:162 [GLY] | A:1961 [A] | ✔ |
T:134 [GLY] | 2:1811 [C] | T:162 [GLY] | A:2430 [A] | ✔ |
T:27 [LYS] | 1:1539 [G] | T:85 [ASP] | A:2310 [G] | ✔ |
T:141 [CYS] | 2:2383 [G] | T:169 [LYS] | A:2675 [G] | ✔ |
T:23 [ARG] | 2:2382 [C] | T:81 [LYS] | A:2674 [U] | ✔ |
T:129 [THR] | 1:1614 [G] | T:157 [ARG] | A:2356 [A] | ✔ |
T:129 [THR] | 2:2384 [A] | T:157 [ARG] | A:2676 [A] | ✔ |
T:118 [GLN] | 1:453 [G] | T:146 [THR] | A:1818 [A] | ✔ |
T:118 [GLN] | 1:454 [U] | T:146 [THR] | A:1819 [U] | ✔ |
T:142 [SER] | 1:1539 [G] | T:170 [VAL] | A:2310 [G] | ✔ |
T:30 [PHE] | 1:453 [G] | T:88 [TRP] | A:1818 [A] | ✔ |
T:30 [PHE] | 1:454 [U] | T:88 [TRP] | A:1819 [U] | ✔ |
T:87 [SER] | 2:2381 [G] | T:113 [GLY] | A:2673 [G] | ✔ |
T:3 [HIS] | 1:439 [U] | T:50 [LYS] | A:1811 [A] | ✔ |
T:26 [TYR] | 1:452 [C] | T:84 [LYS] | A:1817 [C] | ✔ |
T:132 [ALA] | 1:930 [U] | T:160 [GLY] | A:1957 [A] | ✔ |
T:132 [ALA] | 1:931 [G] | T:160 [GLY] | A:1958 [G] | ✔ |
T:132 [ALA] | 1:933 [A] | T:160 [GLY] | A:1960 [A] | ✔ |
T:132 [ALA] | 1:934 [A] | T:160 [GLY] | A:1961 [A] | ✔ |
T:37 [ASN] | 1:454 [U] | T:95 [ARG] | A:1819 [U] | ✔ |
T:37 [ASN] | 1:455 [G] | T:95 [ARG] | A:1820 [A] | ✔ |
T:86 [LYS] | 2:2380 [A] | T:112 [LYS] | A:2672 [A] | ✔ |
T:86 [LYS] | 2:2381 [G] | T:112 [LYS] | A:2673 [G] | ✔ |
T:86 [LYS] | 2:2382 [C] | T:112 [LYS] | A:2674 [U] | ✔ |
T:138 [PRO] | 2:2384 [A] | T:166 [ILE] | A:2676 [A] | ✔ |
T:138 [PRO] | 2:2385 [A] | T:166 [ILE] | A:2677 [A] | ✔ |
T:28 [ASN] | 1:1539 [G] | T:86 [LYS] | A:2310 [G] | ✔ |
T:140 [MET] | 2:2383 [G] | T:168 [GLU] | A:2675 [G] | ✔ |
T:140 [MET] | 2:2384 [A] | T:168 [GLU] | A:2676 [A] | ✔ |
T:127 [ARG] | 1:1614 [G] | T:155 [ARG] | A:2356 [A] | ✔ |
T:131 [ARG] | 1:930 [U] | T:159 [HIS] | A:1957 [A] | ✔ |
T:131 [ARG] | 1:931 [G] | T:159 [HIS] | A:1958 [G] | ✔ |
T:131 [ARG] | 1:933 [A] | T:159 [HIS] | A:1960 [A] | ✔ |
T:131 [ARG] | 1:934 [A] | T:159 [HIS] | A:1961 [A] | ✔ |
T:131 [ARG] | 2:1812 [A] | T:159 [HIS] | A:2431 [C] | ✔ |
T:131 [ARG] | 2:2384 [A] | T:159 [HIS] | A:2676 [A] | ✔ |
T:131 [ARG] | 2:2385 [A] | T:159 [HIS] | A:2677 [A] | ✔ |
T:119 [VAL] | 1:453 [G] | T:147 [SER] | A:1818 [A] | ✔ |
T:128 [ARG] | 1:1614 [G] | T:156 [ILE] | A:2356 [A] | ✔ |
T:136 [ILE] | 2:1811 [C] | T:164 [PHE] | A:2430 [A] | ✔ |
T:130 [TYR] | 1:931 [G] | T:158 [TYR] | A:1958 [G] | ✔ |
T:130 [TYR] | 1:1614 [G] | T:158 [TYR] | A:2356 [A] | ✔ |
T:130 [TYR] | 2:1811 [C] | T:158 [TYR] | A:2430 [A] | ✔ |
T:130 [TYR] | 2:1812 [A] | T:158 [TYR] | A:2431 [C] | ✔ |
T:83 [TRP] | 2:2379 [U] | T:110 [ASP] | A:2671 [C] | ✔ |
T:83 [TRP] | 2:2380 [A] | T:110 [ASP] | A:2672 [A] | ✔ |
T:24 [CYS] | 2:2382 [C] | T:82 [TYR] | A:2674 [U] | ✔ |
T:135 [ARG] | 1:930 [U] | T:163 [ARG] | A:1957 [A] | ✔ |
T:135 [ARG] | 2:1811 [C] | T:163 [ARG] | A:2430 [A] | ✔ |
T:139 [TYR] | 1:1614 [G] | T:167 [MET] | A:2356 [A] | ✔ |
T:139 [TYR] | 2:2383 [G] | T:167 [MET] | A:2675 [G] | ✔ |
T:139 [TYR] | 2:2384 [A] | T:167 [MET] | A:2676 [A] | ✔ |
T:133 [HIS] | 1:929 [G] | T:161 [ARG] | A:1956 [U] | ✔ |
T:133 [HIS] | 1:930 [U] | T:161 [ARG] | A:1957 [A] | ✔ |
T:133 [HIS] | 1:931 [G] | T:161 [ARG] | A:1958 [G] | ✔ |
T:133 [HIS] | 1:934 [A] | T:161 [ARG] | A:1961 [A] | ✔ |
T:84 [PRO] | 2:2380 [A] | T:111 [LYS] | A:2672 [A] | ✔ |
T:84 [PRO] | 2:2381 [G] | T:111 [LYS] | A:2673 [G] | ✔ |
T:25 [HIS] | 1:1539 [G] | T:83 [SER] | A:2310 [G] | ✔ |
T:121 [GLN] | 1:1535 [U] | T:149 [ARG] | A:2306 [A] | ✔ |
T:137 [THR] | 2:2384 [A] | T:165 [GLY] | A:2676 [A] | ✔ |
T:137 [THR] | 2:2385 [A] | T:165 [GLY] | A:2677 [A] | ✔ |
T:2 [THR] | 1:439 [U] | T:49 [ARG] | A:1811 [A] | ❌ 7O9M_T_A |
T:141 [CYS] | 1:1539 [G] | T:169 [LYS] | A:2310 [G] | ❌ 7O9M_T_A |
T:141 [CYS] | 2:2384 [A] | T:169 [LYS] | A:2676 [A] | ❌ 7O9M_T_A |
T:26 [TYR] | 1:453 [G] | T:84 [LYS] | A:1818 [A] | ❌ 7O9M_T_A |
T:26 [TYR] | 1:1539 [G] | T:84 [LYS] | A:2310 [G] | ❌ 7O9M_T_A |
T:120 [ASP] | 1:453 [G] | T:148 [GLY] | A:1818 [A] | ❌ 7O9M_T_A |
T:138 [PRO] | 2:2383 [G] | T:166 [ILE] | A:2675 [G] | ❌ 7O9M_T_A |
T:5 [SER] | 1:453 [G] | T:52 [GLU] | A:1818 [A] | ❌ 7O9M_T_A |
T:5 [SER] | 1:454 [U] | T:52 [GLU] | A:1819 [U] | ❌ 7O9M_T_A |
T:127 [ARG] | 2:2382 [C] | T:155 [ARG] | A:2674 [U] | ❌ 7O9M_T_A |
T:127 [ARG] | 2:2383 [G] | T:155 [ARG] | A:2675 [G] | ❌ 7O9M_T_A |
T:6 [ARG] | 1:454 [U] | T:54 [LYS] | A:1819 [U] | ❌ 7O9M_T_A |
T:6 [ARG] | 1:455 [G] | T:54 [LYS] | A:1820 [A] | ❌ 7O9M_T_A |
T:4 [TYR] | 1:439 [U] | T:51 [TRP] | A:1811 [A] | ❌ 7O9M_T_A |
T:131 [ARG] | 1:1541 [A2M] | T:159 [HIS] | A:2312 [A] | ❌ 7O9M_T_A |
T:34 [ASN] | 1:453 [G] | T:92 [LYS] | A:1818 [A] | ❌ 7O9M_T_A |
T:34 [ASN] | 1:454 [U] | T:92 [LYS] | A:1819 [U] | ❌ 7O9M_T_A |
T:130 [TYR] | 1:933 [A] | T:158 [TYR] | A:1960 [A] | ❌ 7O9M_T_A |
T:135 [ARG] | 2:2385 [A] | T:163 [ARG] | A:2677 [A] | ❌ 7O9M_T_A |
T:139 [TYR] | 1:1542 [OMG] | T:167 [MET] | A:2313 [A] | ❌ 7O9M_T_A |
T:139 [TYR] | 2:2382 [C] | T:167 [MET] | A:2674 [U] | ❌ 7O9M_T_A |
T:25 [HIS] | 2:2382 [C] | T:83 [SER] | A:2674 [U] | ❌ 7O9M_T_A |
T:25 [HIS] | 2:2383 [G] | T:83 [SER] | A:2675 [G] | ❌ 7O9M_T_A |
T:121 [GLN] | 1:452 [C] | T:149 [ARG] | A:1817 [C] | ❌ 7O9M_T_A |
T:121 [GLN] | 1:1534 [U] | T:149 [ARG] | A:2305 [U] | ❌ 6AZ3_T_1,2 |
T:126 [ARG] | 1:1534 [U] | T:154 [LYS] | A:2305 [U] | ❌ 6AZ3_T_1,2 |
T:128 [ARG] | 2:1811 [C] | T:156 [ILE] | A:2430 [A] | ❌ 6AZ3_T_1,2 |
T:129 [THR] | 1:1542 [OMG] | T:157 [ARG] | A:2313 [A] | ❌ 6AZ3_T_1,2 |
T:129 [THR] | 1:1541 [A2M] | T:157 [ARG] | A:2312 [A] | ❌ 6AZ3_T_1,2 |
T:129 [THR] | 2:2383 [G] | T:157 [ARG] | A:2675 [G] | ❌ 6AZ3_T_1,2 |
T:131 [ARG] | 2:1811 [C] | T:159 [HIS] | A:2430 [A] | ❌ 6AZ3_T_1,2 |
T:133 [HIS] | 2:1811 [C] | T:161 [ARG] | A:2430 [A] | ❌ 6AZ3_T_1,2 |
T:136 [ILE] | 1:930 [U] | T:164 [PHE] | A:1957 [A] | ❌ 6AZ3_T_1,2 |
T:136 [ILE] | 2:2385 [A] | T:164 [PHE] | A:2677 [A] | ❌ 6AZ3_T_1,2 |
T:141 [CYS] | 2:2382 [C] | T:169 [LYS] | A:2674 [U] | ❌ 6AZ3_T_1,2 |
T:141 [CYS] | 1:1614 [G] | T:169 [LYS] | A:2356 [A] | ❌ 6AZ3_T_1,2 |
T:142 [SER] | 2:2383 [G] | T:170 [VAL] | A:2675 [G] | ❌ 6AZ3_T_1,2 |
T:23 [ARG] | 2:2383 [G] | T:81 [LYS] | A:2675 [G] | ❌ 6AZ3_T_1,2 |
T:24 [CYS] | 2:2381 [G] | T:82 [TYR] | A:2673 [G] | ❌ 6AZ3_T_1,2 |
T:26 [TYR] | 1:1535 [U] | T:84 [LYS] | A:2306 [A] | ❌ 6AZ3_T_1,2 |
T:28 [ASN] | 2:2383 [G] | T:86 [LYS] | A:2675 [G] | ❌ 6AZ3_T_1,2 |
T:28 [ASN] | 2:2382 [C] | T:86 [LYS] | A:2674 [U] | ❌ 6AZ3_T_1,2 |
T:37 [ASN] | 1:453 [G] | T:95 [ARG] | A:1818 [A] | ❌ 6AZ3_T_1,2 |
T:27 [LYS] | 1:1538 [C] | T:85 [ASP] | A:2309 [A] | ❌ 7O9M_A:2309 no longer at interface |
T:127 [ARG] | 1:1615 [C] | T:155 [ARG] | A:2357 [C] | ❌ 7O9M_A:2357 no longer at interface |
T:135 [ARG] | 2:2386 [A2M] | T:163 [ARG] | A:2678 [A] | ❌ 7O9M_A:2678 no longer at interface |
T:139 [TYR] | 1:1615 [C] | T:167 [MET] | A:2357 [C] | ❌ 7O9M_A:2357 no longer at interface |
T:86 [LYS] | 1:1616 [A] | T:112 [LYS] | A:2358 [A] | ❌ 6AZ3_1:1616 no longer at interface |
T:121 [GLN] | 1:451 [U] | T:149 [ARG] | A:1816 [G] | ❌ 6AZ3_1:451 no longer at interface |
T:126 [ARG] | 1:1533 [G] | T:154 [LYS] | A:2304 [G] | ❌ 6AZ3_1:1533 no longer at interface |
T:3 [HIS] | 1:447 [G] | T:50 [LYS] | A:1812 [C] | ❌ 6AZ3_1:447 no longer at interface |
T:30 [PHE] | 1:459 [A] | T:88 [TRP] | A:1821 [A] | ❌ 6AZ3_1:459 no longer at interface |
T:34 [ASN] | 1:459 [A] | T:92 [LYS] | A:1821 [A] | ❌ 6AZ3_1:459 no longer at interface |
T:117 [VAL] | 1:454 [U] | T:145 [SER] | A:1819 [U] | ❌ 7O9M_T:145 no longer at interface |
T:116 [HIS] | 1:454 [U] | T:144 [GLU] | A:1819 [U] | ❌ 7O9M_T:144 no longer at interface |
T:124 [ARG] | 1:1534 [U] | T:152 [CYS] | A:2305 [U] | ❌ 7O9M_T:152 no longer at interface |
T:124 [ARG] | 1:1535 [U] | T:152 [CYS] | A:2306 [A] | ❌ 7O9M_T:152 no longer at interface |
Properties of this pair
Common ECOD label(s) |
Common RFAM label(s) |
Interface TM-score |
Interface RMSD |
Percentage identity |
Protein TM-score |
RNA TM-score |
Protein coverage |
RNA coverage |
Percentage conservation |
Apolar conservation |
H-bond conservation |
Percentage switching out |
---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
Ribosomal protein L22 | 0.78 | 2.7 | 0.09 | 0.69 | 0.78 | 0.73 | 0.62 | 0.66 | 0.61 | 0.11 | 0.25 |
Other pairs involving 6AZ3_T_1,2 or 7O9M_T_A
Total number of entries: 16