Interface analysis
Style
Protein
CartoonLicorice
Surface
RNA
CartoonLicorice
Surface
Color
StructureStructure (with hetatm)
Chain
Chainbow
View
Focus on
InterfaceRNA
Protein
All
Show chains
Interface
show interface as licoriceCommon contacts -
6AZ3_T
|
6AZ3_1,2
|
7RYG_R
|
7RYG_A
|
Conserved?
|
---|---|---|---|---|
T:117 [VAL] | 1:454 [U] | R:74 [ILE] | A:518 [C] | ✔ |
T:134 [GLY] | 1:934 [A] | R:91 [GLY] | A:749 [A] | ✔ |
T:134 [GLY] | 2:1811 [C] | R:91 [GLY] | A:1612 [A] | ✔ |
T:27 [LYS] | 1:1539 [G] | R:15 [GLN] | A:1261 [G] | ✔ |
T:141 [CYS] | 2:2383 [G] | R:98 [LYS] | A:2008 [G] | ✔ |
T:23 [ARG] | 1:1611 [A] | R:11 [ALA] | A:1317 [A] | ✔ |
T:23 [ARG] | 2:2382 [C] | R:11 [ALA] | A:2007 [U] | ✔ |
T:129 [THR] | 1:1614 [G] | R:86 [MET] | A:1320 [U] | ✔ |
T:129 [THR] | 2:2384 [A] | R:86 [MET] | A:2009 [A] | ✔ |
T:20 [SER] | 1:428 [A] | R:8 [ARG] | A:492 [G] | ✔ |
T:20 [SER] | 1:429 [G] | R:8 [ARG] | A:493 [G] | ✔ |
T:118 [GLN] | 1:453 [G] | R:75 [TYR] | A:517 [G] | ✔ |
T:118 [GLN] | 1:454 [U] | R:75 [TYR] | A:518 [C] | ✔ |
T:142 [SER] | 1:1539 [G] | R:99 [ARG] | A:1261 [G] | ✔ |
T:30 [PHE] | 1:453 [G] | R:18 [ARG] | A:517 [G] | ✔ |
T:87 [SER] | 2:2381 [G] | R:43 [ALA] | A:2006 [G] | ✔ |
T:120 [ASP] | 1:453 [G] | R:77 [ASP] | A:517 [G] | ✔ |
T:132 [ALA] | 1:930 [U] | R:89 [ALA] | A:745 [U] | ✔ |
T:132 [ALA] | 1:931 [G] | R:89 [ALA] | A:746 [G] | ✔ |
T:132 [ALA] | 1:933 [A] | R:89 [ALA] | A:748 [A] | ✔ |
T:132 [ALA] | 1:934 [A] | R:89 [ALA] | A:749 [A] | ✔ |
T:37 [ASN] | 1:454 [U] | R:25 [ARG] | A:518 [C] | ✔ |
T:37 [ASN] | 1:455 [G] | R:25 [ARG] | A:519 [A] | ✔ |
T:19 [VAL] | 1:428 [A] | R:7 [LEU] | A:492 [G] | ✔ |
T:86 [LYS] | 2:2380 [A] | R:42 [LYS] | A:2005 [A] | ✔ |
T:86 [LYS] | 2:2381 [G] | R:42 [LYS] | A:2006 [G] | ✔ |
T:86 [LYS] | 2:2382 [C] | R:42 [LYS] | A:2007 [U] | ✔ |
T:138 [PRO] | 2:2384 [A] | R:95 [ARG] | A:2009 [A] | ✔ |
T:138 [PRO] | 2:2385 [A] | R:95 [ARG] | A:2010 [A] | ✔ |
T:28 [ASN] | 1:1539 [G] | R:16 [LYS] | A:1261 [G] | ✔ |
T:104 [GLU] | 1:422 [U] | R:60 [HIS] | A:485 [C] | ✔ |
T:140 [MET] | 2:2383 [G] | R:97 [THR] | A:2008 [G] | ✔ |
T:140 [MET] | 2:2384 [A] | R:97 [THR] | A:2009 [A] | ✔ |
T:127 [ARG] | 1:1612 [C] | R:84 [ARG] | A:1318 [C] | ✔ |
T:105 [LYS] | 1:430 [A] | R:61 [ASN] | A:494 [G] | ✔ |
T:131 [ARG] | 1:930 [U] | R:88 [ARG] | A:745 [U] | ✔ |
T:131 [ARG] | 1:931 [G] | R:88 [ARG] | A:746 [G] | ✔ |
T:131 [ARG] | 1:933 [A] | R:88 [ARG] | A:748 [A] | ✔ |
T:131 [ARG] | 1:934 [A] | R:88 [ARG] | A:749 [A] | ✔ |
T:131 [ARG] | 1:1541 [A2M] | R:88 [ARG] | A:1263 [A] | ✔ |
T:131 [ARG] | 2:1812 [A] | R:88 [ARG] | A:1613 [C] | ✔ |
T:131 [ARG] | 2:2384 [A] | R:88 [ARG] | A:2009 [A] | ✔ |
T:34 [ASN] | 1:454 [U] | R:22 [ASP] | A:518 [C] | ✔ |
T:96 [LYS] | 1:423 [U] | R:52 [GLU] | A:486 [C] | ✔ |
T:119 [VAL] | 1:453 [G] | R:76 [VAL] | A:517 [G] | ✔ |
T:16 [LYS] | 1:429 [G] | R:4 [THR] | A:493 [G] | ✔ |
T:16 [LYS] | 1:430 [A] | R:4 [THR] | A:494 [G] | ✔ |
T:136 [ILE] | 2:1811 [C] | R:93 [ALA] | A:1612 [A] | ✔ |
T:130 [TYR] | 2:1811 [C] | R:87 [PRO] | A:1612 [A] | ✔ |
T:130 [TYR] | 2:1812 [A] | R:87 [PRO] | A:1613 [C] | ✔ |
T:125 [MET] | 1:1611 [A] | R:82 [LEU] | A:1317 [A] | ✔ |
T:97 [ASN] | 1:423 [U] | R:53 [SER] | A:486 [C] | ✔ |
T:97 [ASN] | 1:428 [A] | R:53 [SER] | A:492 [G] | ✔ |
T:97 [ASN] | 1:429 [G] | R:53 [SER] | A:493 [G] | ✔ |
T:85 [ARG] | 2:2380 [A] | R:41 [LYS] | A:2005 [A] | ✔ |
T:85 [ARG] | 2:2381 [G] | R:41 [LYS] | A:2006 [G] | ✔ |
T:24 [CYS] | 2:2382 [C] | R:12 [ILE] | A:2007 [U] | ✔ |
T:135 [ARG] | 1:930 [U] | R:92 [ARG] | A:745 [U] | ✔ |
T:135 [ARG] | 2:1811 [C] | R:92 [ARG] | A:1612 [A] | ✔ |
T:139 [TYR] | 2:2383 [G] | R:96 [ILE] | A:2008 [G] | ✔ |
T:139 [TYR] | 2:2384 [A] | R:96 [ILE] | A:2009 [A] | ✔ |
T:133 [HIS] | 1:929 [G] | R:90 [LYS] | A:744 [U] | ✔ |
T:133 [HIS] | 1:930 [U] | R:90 [LYS] | A:745 [U] | ✔ |
T:133 [HIS] | 1:931 [G] | R:90 [LYS] | A:746 [G] | ✔ |
T:133 [HIS] | 1:934 [A] | R:90 [LYS] | A:749 [A] | ✔ |
T:17 [ALA] | 1:429 [G] | R:5 [ALA] | A:493 [G] | ✔ |
T:25 [HIS] | 1:1539 [G] | R:13 [SER] | A:1261 [G] | ✔ |
T:18 [LYS] | 1:428 [A] | R:6 [LYS] | A:492 [G] | ✔ |
T:18 [LYS] | 1:429 [G] | R:6 [LYS] | A:493 [G] | ✔ |
T:18 [LYS] | 1:430 [A] | R:6 [LYS] | A:494 [G] | ✔ |
T:116 [HIS] | 1:454 [U] | R:73 [THR] | A:518 [C] | ✔ |
T:121 [GLN] | 1:452 [C] | R:78 [GLU] | A:516 [C] | ✔ |
T:121 [GLN] | 1:1535 [U] | R:78 [GLU] | A:1257 [G] | ✔ |
T:137 [THR] | 2:2384 [A] | R:94 [ASP] | A:2009 [A] | ✔ |
T:137 [THR] | 2:2385 [A] | R:94 [ASP] | A:2010 [A] | ✔ |
T:100 [ALA] | 1:423 [U] | R:56 [ALA] | A:486 [C] | ✔ |
T:101 [ASN] | 1:429 [G] | R:57 [ASN] | A:493 [G] | ✔ |
T:101 [ASN] | 1:430 [A] | R:57 [ASN] | A:494 [G] | ✔ |
T:141 [CYS] | 1:1539 [G] | R:98 [LYS] | A:1261 [G] | ❌ 7RYG_R_A |
T:141 [CYS] | 2:2384 [A] | R:98 [LYS] | A:2009 [A] | ❌ 7RYG_R_A |
T:23 [ARG] | 1:1612 [C] | R:11 [ALA] | A:1318 [C] | ❌ 7RYG_R_A |
T:30 [PHE] | 1:454 [U] | R:18 [ARG] | A:518 [C] | ❌ 7RYG_R_A |
T:138 [PRO] | 2:2383 [G] | R:95 [ARG] | A:2008 [G] | ❌ 7RYG_R_A |
T:104 [GLU] | 1:423 [U] | R:60 [HIS] | A:486 [C] | ❌ 7RYG_R_A |
T:127 [ARG] | 1:1614 [G] | R:84 [ARG] | A:1320 [U] | ❌ 7RYG_R_A |
T:127 [ARG] | 2:2382 [C] | R:84 [ARG] | A:2007 [U] | ❌ 7RYG_R_A |
T:127 [ARG] | 2:2383 [G] | R:84 [ARG] | A:2008 [G] | ❌ 7RYG_R_A |
T:131 [ARG] | 2:2385 [A] | R:88 [ARG] | A:2010 [A] | ❌ 7RYG_R_A |
T:34 [ASN] | 1:453 [G] | R:22 [ASP] | A:517 [G] | ❌ 7RYG_R_A |
T:16 [LYS] | 1:431 [G] | R:4 [THR] | A:495 [G] | ❌ 7RYG_R_A |
T:130 [TYR] | 1:931 [G] | R:87 [PRO] | A:746 [G] | ❌ 7RYG_R_A |
T:130 [TYR] | 1:933 [A] | R:87 [PRO] | A:748 [A] | ❌ 7RYG_R_A |
T:130 [TYR] | 1:1614 [G] | R:87 [PRO] | A:1320 [U] | ❌ 7RYG_R_A |
T:125 [MET] | 1:1612 [C] | R:82 [LEU] | A:1318 [C] | ❌ 7RYG_R_A |
T:135 [ARG] | 2:2385 [A] | R:92 [ARG] | A:2010 [A] | ❌ 7RYG_R_A |
T:135 [ARG] | 2:2386 [A2M] | R:92 [ARG] | A:2011 [A] | ❌ 7RYG_R_A |
T:139 [TYR] | 1:1614 [G] | R:96 [ILE] | A:1320 [U] | ❌ 7RYG_R_A |
T:139 [TYR] | 2:2382 [C] | R:96 [ILE] | A:2007 [U] | ❌ 7RYG_R_A |
T:17 [ALA] | 1:430 [A] | R:5 [ALA] | A:494 [G] | ❌ 7RYG_R_A |
T:126 [ARG] | 1:1612 [C] | R:83 [LYS] | A:1318 [C] | ❌ 7RYG_R_A |
T:25 [HIS] | 2:2382 [C] | R:13 [SER] | A:2007 [U] | ❌ 7RYG_R_A |
T:25 [HIS] | 2:2383 [G] | R:13 [SER] | A:2008 [G] | ❌ 7RYG_R_A |
T:124 [ARG] | 1:1534 [U] | R:81 [SER] | A:1256 [C] | ❌ 7RYG_R_A |
T:124 [ARG] | 1:1535 [U] | R:81 [SER] | A:1257 [G] | ❌ 7RYG_R_A |
T:28 [ASN] | 2:2382 [C] | R:16 [LYS] | A:2007 [U] | ❌ 6AZ3_T_1,2 |
T:28 [ASN] | 2:2383 [G] | R:16 [LYS] | A:2008 [G] | ❌ 6AZ3_T_1,2 |
T:30 [PHE] | 1:452 [C] | R:18 [ARG] | A:516 [C] | ❌ 6AZ3_T_1,2 |
T:52 [LEU] | 2:2380 [A] | R:40 [ASN] | A:2005 [A] | ❌ 6AZ3_T_1,2 |
T:52 [LEU] | 2:2379 [U] | R:40 [ASN] | A:2004 [C] | ❌ 6AZ3_T_1,2 |
T:52 [LEU] | 2:2381 [G] | R:40 [ASN] | A:2006 [G] | ❌ 6AZ3_T_1,2 |
T:100 [ALA] | 1:422 [U] | R:56 [ALA] | A:485 [C] | ❌ 6AZ3_T_1,2 |
T:101 [ASN] | 1:422 [U] | R:57 [ASN] | A:485 [C] | ❌ 6AZ3_T_1,2 |
T:104 [GLU] | 1:430 [A] | R:60 [HIS] | A:494 [G] | ❌ 6AZ3_T_1,2 |
T:105 [LYS] | 1:431 [G] | R:61 [ASN] | A:495 [G] | ❌ 6AZ3_T_1,2 |
T:126 [ARG] | 1:1534 [U] | R:83 [LYS] | A:1256 [C] | ❌ 6AZ3_T_1,2 |
T:127 [ARG] | 1:1611 [A] | R:84 [ARG] | A:1317 [A] | ❌ 6AZ3_T_1,2 |
T:131 [ARG] | 2:1811 [C] | R:88 [ARG] | A:1612 [A] | ❌ 6AZ3_T_1,2 |
T:137 [THR] | 2:2386 [A2M] | R:94 [ASP] | A:2011 [A] | ❌ 6AZ3_T_1,2 |
T:141 [CYS] | 2:2382 [C] | R:98 [LYS] | A:2007 [U] | ❌ 6AZ3_T_1,2 |
T:141 [CYS] | 1:1612 [C] | R:98 [LYS] | A:1318 [C] | ❌ 6AZ3_T_1,2 |
T:142 [SER] | 1:1535 [U] | R:99 [ARG] | A:1257 [G] | ❌ 6AZ3_T_1,2 |
T:142 [SER] | 2:2383 [G] | R:99 [ARG] | A:2008 [G] | ❌ 6AZ3_T_1,2 |
T:27 [LYS] | 1:1538 [C] | R:15 [GLN] | A:1260 [A] | ❌ 7RYG_A:1260 no longer at interface |
T:127 [ARG] | 1:1613 [G] | R:84 [ARG] | A:1319 [G] | ❌ 7RYG_A:1319 no longer at interface |
T:127 [ARG] | 1:1615 [C] | R:84 [ARG] | A:1321 [U] | ❌ 7RYG_A:1321 no longer at interface |
T:85 [ARG] | 1:1574 [A] | R:41 [LYS] | A:1281 [A] | ❌ 7RYG_A:1281 no longer at interface |
T:139 [TYR] | 1:1542 [OMG] | R:96 [ILE] | A:1264 [A] | ❌ 7RYG_A:1264 no longer at interface |
T:139 [TYR] | 1:1615 [C] | R:96 [ILE] | A:1321 [U] | ❌ 7RYG_A:1321 no longer at interface |
T:93 [SER] | 1:425 [G] | R:49 [LYS] | A:488 [G] | ❌ 6AZ3_T:93, 6AZ3_1:425 no longer at interface |
T:93 [SER] | 1:424 [G] | R:49 [LYS] | A:487 [U] | ❌ 6AZ3_T:93, 6AZ3_1:424 no longer at interface |
T:93 [SER] | 1:427 [A] | R:49 [LYS] | A:491 [A] | ❌ 6AZ3_T:93, 6AZ3_1:427 no longer at interface |
T:93 [SER] | 1:426 [A] | R:49 [LYS] | A:490 [G] | ❌ 6AZ3_T:93, 6AZ3_1:426 no longer at interface |
T:104 [GLU] | 1:421 [U] | R:60 [HIS] | A:484 [C] | ❌ 6AZ3_1:421 no longer at interface |
T:19 [VAL] | 1:427 [A] | R:7 [LEU] | A:491 [A] | ❌ 6AZ3_1:427 no longer at interface |
T:121 [GLN] | 1:451 [U] | R:78 [GLU] | A:515 [C] | ❌ 6AZ3_1:451 no longer at interface |
T:126 [ARG] | 1:1533 [G] | R:83 [LYS] | A:1255 [A] | ❌ 6AZ3_1:1533 no longer at interface |
T:131 [ARG] | 2:3203 [A] | R:88 [ARG] | A:2609 [U] | ❌ 6AZ3_2:3203 no longer at interface |
T:26 [TYR] | 1:452 [C] | R:14 [ALA] | A:516 [C] | ❌ 7RYG_R:14 no longer at interface |
T:26 [TYR] | 1:453 [G] | R:14 [ALA] | A:517 [G] | ❌ 7RYG_R:14 no longer at interface |
T:26 [TYR] | 1:1539 [G] | R:14 [ALA] | A:1261 [G] | ❌ 7RYG_R:14 no longer at interface |
T:128 [ARG] | 1:1614 [G] | R:85 [ILE] | A:1320 [U] | ❌ 7RYG_R:85 no longer at interface |
T:93 [SER] | 1:423 [U] | R:49 [LYS] | A:486 [C] | ❌ 6AZ3_T:93 no longer at interface |
Properties of this pair
Common ECOD label(s) |
Common RFAM label(s) |
Interface TM-score |
Interface RMSD |
Percentage identity |
Protein TM-score |
RNA TM-score |
Protein coverage |
RNA coverage |
Percentage conservation |
Apolar conservation |
H-bond conservation |
Percentage switching out |
---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
Ribosomal protein L22 | 0.76 | 1.76 | 0.24 | 0.91 | 0.75 | 0.92 | 0.73 | 0.67 | 0.63 | 0.19 | 0.31 |
Other pairs involving 6AZ3_T_1,2 or 7RYG_R_A
Total number of entries: 16