Interface analysis
Style
Protein
CartoonLicorice
Surface
RNA
CartoonLicorice
Surface
Color
StructureStructure (with hetatm)
Chain
Chainbow
View
Focus on
InterfaceRNA
Protein
All
Show chains
Interface
show interface as licoriceCommon contacts -
| 7ASM_Q
|
7ASM_A
|
7RYG_R
|
7RYG_A
|
Conserved?
|
|---|---|---|---|---|
| Q:77 [ASN] | A:23 [G] | R:77 [ASP] | A:30 [G] | ✔ |
| Q:77 [ASN] | A:24 [G] | R:77 [ASP] | A:31 [G] | ✔ |
| Q:77 [ASN] | A:563 [G] | R:77 [ASP] | A:517 [G] | ✔ |
| Q:6 [VAL] | A:538 [G] | R:6 [LYS] | A:492 [G] | ✔ |
| Q:6 [VAL] | A:539 [G] | R:6 [LYS] | A:493 [G] | ✔ |
| Q:6 [VAL] | A:540 [G] | R:6 [LYS] | A:494 [G] | ✔ |
| Q:75 [TYR] | A:23 [G] | R:75 [TYR] | A:30 [G] | ✔ |
| Q:75 [TYR] | A:563 [G] | R:75 [TYR] | A:517 [G] | ✔ |
| Q:75 [TYR] | A:564 [U] | R:75 [TYR] | A:518 [C] | ✔ |
| Q:56 [ALA] | A:532 [C] | R:56 [ALA] | A:485 [C] | ✔ |
| Q:56 [ALA] | A:533 [C] | R:56 [ALA] | A:486 [C] | ✔ |
| Q:88 [ARG] | A:792 [5MU] | R:88 [ARG] | A:745 [U] | ✔ |
| Q:88 [ARG] | A:793 [G] | R:88 [ARG] | A:746 [G] | ✔ |
| Q:88 [ARG] | A:795 [A] | R:88 [ARG] | A:748 [A] | ✔ |
| Q:88 [ARG] | A:796 [A] | R:88 [ARG] | A:749 [A] | ✔ |
| Q:88 [ARG] | A:1306 [A] | R:88 [ARG] | A:1263 [A] | ✔ |
| Q:88 [ARG] | A:1658 [A] | R:88 [ARG] | A:1612 [A] | ✔ |
| Q:88 [ARG] | A:1659 [C] | R:88 [ARG] | A:1613 [C] | ✔ |
| Q:88 [ARG] | A:2040 [A] | R:88 [ARG] | A:2009 [A] | ✔ |
| Q:88 [ARG] | A:2640 [U] | R:88 [ARG] | A:2609 [U] | ✔ |
| Q:81 [THR] | A:26 [G] | R:81 [SER] | A:33 [G] | ✔ |
| Q:16 [LYS] | A:1304 [G] | R:16 [LYS] | A:1261 [G] | ✔ |
| Q:16 [LYS] | A:2038 [U] | R:16 [LYS] | A:2007 [U] | ✔ |
| Q:16 [LYS] | A:2039 [G] | R:16 [LYS] | A:2008 [G] | ✔ |
| Q:61 [ASN] | A:540 [G] | R:61 [ASN] | A:494 [G] | ✔ |
| Q:61 [ASN] | A:541 [G] | R:61 [ASN] | A:495 [G] | ✔ |
| Q:22 [ASP] | A:564 [U] | R:22 [ASP] | A:518 [C] | ✔ |
| Q:96 [ILE] | A:2039 [G] | R:96 [ILE] | A:2008 [G] | ✔ |
| Q:96 [ILE] | A:2040 [A] | R:96 [ILE] | A:2009 [A] | ✔ |
| Q:57 [ASN] | A:532 [C] | R:57 [ASN] | A:485 [C] | ✔ |
| Q:57 [ASN] | A:539 [G] | R:57 [ASN] | A:493 [G] | ✔ |
| Q:57 [ASN] | A:540 [G] | R:57 [ASN] | A:494 [G] | ✔ |
| Q:52 [MET] | A:533 [C] | R:52 [GLU] | A:486 [C] | ✔ |
| Q:60 [HIS] | A:531 [C] | R:60 [HIS] | A:484 [C] | ✔ |
| Q:60 [HIS] | A:532 [C] | R:60 [HIS] | A:485 [C] | ✔ |
| Q:60 [HIS] | A:540 [G] | R:60 [HIS] | A:494 [G] | ✔ |
| Q:99 [ARG] | A:1300 [G] | R:99 [ARG] | A:1257 [G] | ✔ |
| Q:99 [ARG] | A:2039 [G] | R:99 [ARG] | A:2008 [G] | ✔ |
| Q:80 [PRO] | A:25 [U] | R:80 [MET] | A:32 [U] | ✔ |
| Q:80 [PRO] | A:26 [G] | R:80 [MET] | A:33 [G] | ✔ |
| Q:82 [LEU] | A:1359 [A] | R:82 [LEU] | A:1317 [A] | ✔ |
| Q:102 [HIS] | A:24 [G] | R:102 [HIS] | A:31 [G] | ✔ |
| Q:102 [HIS] | A:25 [U] | R:102 [HIS] | A:32 [U] | ✔ |
| Q:74 [ALA] | A:564 [U] | R:74 [ILE] | A:518 [C] | ✔ |
| Q:94 [SER] | A:2040 [A] | R:94 [ASP] | A:2009 [A] | ✔ |
| Q:94 [SER] | A:2041 [A] | R:94 [ASP] | A:2010 [A] | ✔ |
| Q:5 [ALA] | A:539 [G] | R:5 [ALA] | A:493 [G] | ✔ |
| Q:97 [ASN] | A:2039 [G] | R:97 [THR] | A:2008 [G] | ✔ |
| Q:97 [ASN] | A:2040 [A] | R:97 [THR] | A:2009 [A] | ✔ |
| Q:90 [GLN] | A:793 [G] | R:90 [LYS] | A:746 [G] | ✔ |
| Q:90 [GLN] | A:796 [A] | R:90 [LYS] | A:749 [A] | ✔ |
| Q:18 [ARG] | A:562 [C] | R:18 [ARG] | A:516 [C] | ✔ |
| Q:18 [ARG] | A:563 [G] | R:18 [ARG] | A:517 [G] | ✔ |
| Q:76 [ALA] | A:563 [G] | R:76 [VAL] | A:517 [G] | ✔ |
| Q:11 [ARG] | A:1359 [A] | R:11 [ALA] | A:1317 [A] | ✔ |
| Q:11 [ARG] | A:2038 [U] | R:11 [ALA] | A:2007 [U] | ✔ |
| Q:40 [ASN] | A:2036 [G] | R:40 [ASN] | A:2005 [A] | ✔ |
| Q:40 [ASN] | A:2037 [G] | R:40 [ASN] | A:2006 [G] | ✔ |
| Q:4 [LYS] | A:539 [G] | R:4 [THR] | A:493 [G] | ✔ |
| Q:4 [LYS] | A:540 [G] | R:4 [THR] | A:494 [G] | ✔ |
| Q:53 [SER] | A:533 [C] | R:53 [SER] | A:486 [C] | ✔ |
| Q:53 [SER] | A:538 [G] | R:53 [SER] | A:492 [G] | ✔ |
| Q:53 [SER] | A:539 [G] | R:53 [SER] | A:493 [G] | ✔ |
| Q:8 [ARG] | A:25 [U] | R:8 [ARG] | A:32 [U] | ✔ |
| Q:8 [ARG] | A:538 [G] | R:8 [ARG] | A:492 [G] | ✔ |
| Q:8 [ARG] | A:539 [G] | R:8 [ARG] | A:493 [G] | ✔ |
| Q:42 [ALA] | A:2036 [G] | R:42 [LYS] | A:2005 [A] | ✔ |
| Q:42 [ALA] | A:2037 [G] | R:42 [LYS] | A:2006 [G] | ✔ |
| Q:42 [ALA] | A:2038 [U] | R:42 [LYS] | A:2007 [U] | ✔ |
| Q:12 [ILE] | A:2038 [U] | R:12 [ILE] | A:2007 [U] | ✔ |
| Q:73 [GLU] | A:564 [U] | R:73 [THR] | A:518 [C] | ✔ |
| Q:25 [ARG] | A:564 [U] | R:25 [ARG] | A:518 [C] | ✔ |
| Q:25 [ARG] | A:565 [G] | R:25 [ARG] | A:519 [A] | ✔ |
| Q:89 [ALA] | A:792 [5MU] | R:89 [ALA] | A:745 [U] | ✔ |
| Q:89 [ALA] | A:793 [G] | R:89 [ALA] | A:746 [G] | ✔ |
| Q:89 [ALA] | A:795 [A] | R:89 [ALA] | A:748 [A] | ✔ |
| Q:89 [ALA] | A:796 [A] | R:89 [ALA] | A:749 [A] | ✔ |
| Q:79 [GLY] | A:24 [G] | R:79 [GLY] | A:31 [G] | ✔ |
| Q:79 [GLY] | A:25 [U] | R:79 [GLY] | A:32 [U] | ✔ |
| Q:98 [LYS] | A:1360 [G] | R:98 [LYS] | A:1318 [C] | ✔ |
| Q:98 [LYS] | A:2038 [U] | R:98 [LYS] | A:2007 [U] | ✔ |
| Q:98 [LYS] | A:2039 [G] | R:98 [LYS] | A:2008 [G] | ✔ |
| Q:93 [ALA] | A:1658 [A] | R:93 [ALA] | A:1612 [A] | ✔ |
| Q:95 [ALA] | A:2040 [A] | R:95 [ARG] | A:2009 [A] | ✔ |
| Q:95 [ALA] | A:2041 [A] | R:95 [ARG] | A:2010 [A] | ✔ |
| Q:84 [ARG] | A:1359 [A] | R:84 [ARG] | A:1317 [A] | ✔ |
| Q:84 [ARG] | A:1360 [G] | R:84 [ARG] | A:1318 [C] | ✔ |
| Q:15 [ARG] | A:1304 [G] | R:15 [GLN] | A:1261 [G] | ✔ |
| Q:49 [LYS] | A:534 [G] | R:49 [LYS] | A:487 [U] | ✔ |
| Q:49 [LYS] | A:535 [G] | R:49 [LYS] | A:488 [G] | ✔ |
| Q:49 [LYS] | A:536 [A] | R:49 [LYS] | A:490 [G] | ✔ |
| Q:83 [LYS] | A:1299 [U] | R:83 [LYS] | A:1256 [C] | ✔ |
| Q:87 [PRO] | A:1658 [A] | R:87 [PRO] | A:1612 [A] | ✔ |
| Q:87 [PRO] | A:1659 [C] | R:87 [PRO] | A:1613 [C] | ✔ |
| Q:13 [ALA] | A:1304 [G] | R:13 [SER] | A:1261 [G] | ✔ |
| Q:86 [ARG] | A:1362 [C] | R:86 [MET] | A:1320 [U] | ✔ |
| Q:41 [LYS] | A:2036 [G] | R:41 [LYS] | A:2005 [A] | ✔ |
| Q:41 [LYS] | A:2037 [G] | R:41 [LYS] | A:2006 [G] | ✔ |
| Q:91 [GLY] | A:796 [A] | R:91 [GLY] | A:749 [A] | ✔ |
| Q:91 [GLY] | A:1658 [A] | R:91 [GLY] | A:1612 [A] | ✔ |
| Q:92 [ARG] | A:792 [5MU] | R:92 [ARG] | A:745 [U] | ✔ |
| Q:92 [ARG] | A:1658 [A] | R:92 [ARG] | A:1612 [A] | ✔ |
| Q:78 [GLU] | A:24 [G] | R:78 [GLU] | A:31 [G] | ✔ |
| Q:78 [GLU] | A:25 [U] | R:78 [GLU] | A:32 [U] | ✔ |
| Q:78 [GLU] | A:561 [C] | R:78 [GLU] | A:515 [C] | ✔ |
| Q:78 [GLU] | A:562 [C] | R:78 [GLU] | A:516 [C] | ✔ |
| Q:78 [GLU] | A:1300 [G] | R:78 [GLU] | A:1257 [G] | ✔ |
| Q:7 [ALA] | A:538 [G] | R:7 [LEU] | A:492 [G] | ✔ |
| Q:88 [ARG] | A:2041 [A] | R:88 [ARG] | A:2010 [A] | ❌ 7RYG_R_A |
| Q:81 [THR] | A:1299 [U] | R:81 [SER] | A:1256 [C] | ❌ 7RYG_R_A |
| Q:5 [ALA] | A:540 [G] | R:5 [ALA] | A:494 [G] | ❌ 7RYG_R_A |
| Q:11 [ARG] | A:2039 [G] | R:11 [ALA] | A:2008 [G] | ❌ 7RYG_R_A |
| Q:13 [ALA] | A:2039 [G] | R:13 [SER] | A:2008 [G] | ❌ 7RYG_R_A |
| Q:49 [LYS] | A:537 [A] | R:49 [LYS] | A:491 [A] | ❌ 7ASM_Q_A |
| Q:49 [LYS] | A:533 [C] | R:49 [LYS] | A:486 [C] | ❌ 7ASM_Q_A |
| Q:7 [ALA] | A:537 [A] | R:7 [LEU] | A:491 [A] | ❌ 7ASM_Q_A |
| Q:8 [ARG] | A:24 [G] | R:8 [ARG] | A:31 [G] | ❌ 7ASM_Q_A |
| Q:86 [ARG] | A:2040 [A] | R:86 [MET] | A:2009 [A] | ❌ 7ASM_Q_A |
| Q:90 [GLN] | A:792 [5MU] | R:90 [LYS] | A:745 [U] | ❌ 7ASM_Q_A |
| Q:99 [ARG] | A:1304 [G] | R:99 [ARG] | A:1261 [G] | ❌ 7ASM_Q_A |
| Q:80 [PRO] | A:553 [A] | R:80 [MET] | A:507 [U] | ❌ 7RYG_A:507 no longer at interface |
| Q:98 [LYS] | A:1361 [G] | R:98 [LYS] | A:1319 [G] | ❌ 7RYG_A:1319 no longer at interface |
| Q:15 [ARG] | A:1303 [A] | R:15 [GLN] | A:1260 [A] | ❌ 7RYG_A:1260 no longer at interface |
| Q:86 [ARG] | A:1309 [G] | R:86 [MET] | A:1266 [G] | ❌ 7RYG_A:1266 no longer at interface |
| Q:86 [ARG] | A:1361 [G] | R:86 [MET] | A:1319 [G] | ❌ 7RYG_A:1319 no longer at interface |
| Q:9 [THR] | A:553 [A] | R:9 [GLY] | A:507 [U] | ❌ 7RYG_R:9, 7RYG_A:507 no longer at interface |
| Q:40 [ASN] | A:2035 [C] | R:40 [ASN] | A:2004 [C] | ❌ 7ASM_A:2035 no longer at interface |
| Q:83 [LYS] | A:1298 [G] | R:83 [LYS] | A:1255 [A] | ❌ 7ASM_A:1298 no longer at interface |
| Q:90 [GLN] | A:791 [U] | R:90 [LYS] | A:744 [U] | ❌ 7ASM_A:791 no longer at interface |
| Q:94 [SER] | A:2042 [A] | R:94 [ASP] | A:2011 [A] | ❌ 7ASM_A:2042 no longer at interface |
| Q:62 [TYR] | A:540 [G] | R:62 [ASN] | A:494 [G] | ❌ 7RYG_R:62 no longer at interface |
| Q:62 [TYR] | A:541 [G] | R:62 [ASN] | A:495 [G] | ❌ 7RYG_R:62 no longer at interface |
| Q:10 [ILE] | A:537 [A] | R:10 [ALA] | A:491 [A] | ❌ 7RYG_R:10 no longer at interface |
| Q:43 [SER] | A:2037 [G] | R:43 [ALA] | A:2006 [G] | ❌ 7ASM_Q:43 no longer at interface |
Export the table of contacts
Properties of this pair
|
Common ECOD label(s) |
Common RFAM label(s) |
Interface TM-score |
Interface RMSD |
Percentage identity |
Protein TM-score |
RNA TM-score |
Protein coverage |
RNA coverage |
Percentage conservation |
Apolar conservation |
H-bond conservation |
Percentage switching out |
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| Ribosomal protein L22 | Bacterial large subunit ribosomal RNA | 0.98 | 0.88 | 0.61 | 0.98 | 0.98 | 0.98 | 0.91 | 0.92 | 0.85 | 0.64 | 0.54 |
Other pairs involving 7ASM_Q_A or 7RYG_R_A
Total number of entries: 16