RNAprotDB

All interfaces > All interologs > Interface groups > group135 > 3I5Y_A_B vs 3I62_A_B

Interface analysis


mouse controls

Style

Protein

Cartoon
Licorice
Surface

RNA

Cartoon
Licorice
Surface

Color

Structure
Structure (with hetatm)
Chain
Chainbow

View

Focus on

Interface
RNA
Protein
All

Show chains

Interface

show interface as licorice

Common contacts -

3I5Y_A
3I5Y_B
3I62_A
3I62_B
Conserved?
A:528 [ASP] B:1 [U] A:528 [ASP] B:1 [U] ✔
A:528 [ASP] B:3 [U] A:528 [ASP] B:3 [U] ✔
A:407 [HIS] B:5 [U] A:407 [HIS] B:5 [U] ✔
A:221 [GLY] B:7 [U] A:221 [GLY] B:7 [U] ✔
A:221 [GLY] B:8 [U] A:221 [GLY] B:8 [U] ✔
A:221 [GLY] B:9 [U] A:221 [GLY] B:9 [U] ✔
A:535 [SER] B:3 [U] A:535 [SER] B:3 [U] ✔
A:225 [ARG] B:9 [U] A:225 [ARG] B:9 [U] ✔
A:225 [ARG] B:10 [U] A:225 [ARG] B:10 [U] ✔
A:384 [LYS] B:1 [U] A:384 [LYS] B:1 [U] ✔
A:384 [LYS] B:2 [U] A:384 [LYS] B:2 [U] ✔
A:384 [LYS] B:3 [U] A:384 [LYS] B:3 [U] ✔
A:384 [LYS] B:4 [5BU] A:384 [LYS] B:4 [U] ✔
A:242 [THR] B:6 [U] A:242 [THR] B:6 [U] ✔
A:242 [THR] B:7 [U] A:242 [THR] B:7 [U] ✔
A:219 [VAL] B:7 [U] A:219 [VAL] B:7 [U] ✔
A:191 [ASP] B:6 [U] A:191 [ASP] B:6 [U] ✔
A:435 [VAL] B:4 [5BU] A:435 [VAL] B:4 [U] ✔
A:435 [VAL] B:5 [U] A:435 [VAL] B:5 [U] ✔
A:435 [VAL] B:6 [U] A:435 [VAL] B:6 [U] ✔
A:381 [PRO] B:3 [U] A:381 [PRO] B:3 [U] ✔
A:381 [PRO] B:4 [5BU] A:381 [PRO] B:4 [U] ✔
A:408 [GLY] B:5 [U] A:408 [GLY] B:5 [U] ✔
A:408 [GLY] B:6 [U] A:408 [GLY] B:6 [U] ✔
A:188 [PRO] B:5 [U] A:188 [PRO] B:5 [U] ✔
A:188 [PRO] B:6 [U] A:188 [PRO] B:6 [U] ✔
A:383 [VAL] B:3 [U] A:383 [VAL] B:3 [U] ✔
A:383 [VAL] B:4 [5BU] A:383 [VAL] B:4 [U] ✔
A:383 [VAL] B:5 [U] A:383 [VAL] B:5 [U] ✔
A:280 [ASP] B:6 [U] A:280 [ASP] B:6 [U] ✔
A:527 [SER] B:1 [U] A:527 [SER] B:1 [U] ✔
A:277 [PHE] B:5 [U] A:277 [PHE] B:5 [U] ✔
A:277 [PHE] B:6 [U] A:277 [PHE] B:6 [U] ✔
A:576 [PHE] B:1 [U] A:576 [PHE] B:1 [U] ✔
A:189 [THR] B:5 [U] A:189 [THR] B:5 [U] ✔
A:189 [THR] B:6 [U] A:189 [THR] B:6 [U] ✔
A:220 [GLY] B:7 [U] A:220 [GLY] B:7 [U] ✔
A:220 [GLY] B:8 [U] A:220 [GLY] B:8 [U] ✔
A:571 [PRO] B:1 [U] A:571 [PRO] B:1 [U] ✔
A:573 [SER] B:1 [U] A:573 [SER] B:1 [U] ✔
A:382 [THR] B:3 [U] A:382 [THR] B:3 [U] ✔
A:382 [THR] B:4 [5BU] A:382 [THR] B:4 [U] ✔
A:245 [ARG] B:6 [U] A:245 [ARG] B:6 [U] ✔
A:245 [ARG] B:7 [U] A:245 [ARG] B:7 [U] ✔
A:245 [ARG] B:8 [U] A:245 [ARG] B:8 [U] ✔
A:245 [ARG] B:9 [U] A:245 [ARG] B:9 [U] ✔
A:224 [PHE] B:7 [U] A:224 [PHE] B:7 [U] ✔
A:224 [PHE] B:9 [U] A:224 [PHE] B:9 [U] ✔
A:224 [PHE] B:10 [U] A:224 [PHE] B:10 [U] ✔
A:539 [SER] B:3 [U] A:539 [SER] B:3 [U] ✔
A:572 [VAL] B:1 [U] A:572 [VAL] B:1 [U] ✔
A:190 [ARG] B:5 [U] A:190 [ARG] B:5 [U] ✔
A:190 [ARG] B:6 [U] A:190 [ARG] B:6 [U] ✔
A:190 [ARG] B:7 [U] A:190 [ARG] B:7 [U] ✔
A:190 [ARG] B:8 [U] A:190 [ARG] B:8 [U] ✔
A:532 [SER] B:3 [U] A:532 [SER] B:3 [U] ✔
A:415 [ARG] B:5 [U] A:415 [ARG] B:5 [U] ✔
A:415 [ARG] B:6 [U] A:415 [ARG] B:6 [U] ✔
A:253 [TYR] B:10 [U] A:253 [TYR] B:10 [U] ✔
A:243 [PRO] B:6 [U] A:243 [PRO] B:6 [U] ✔
A:243 [PRO] B:7 [U] A:243 [PRO] B:7 [U] ✔
A:248 [ASP] B:7 [U] A:248 [ASP] B:7 [U] ✔
A:248 [ASP] B:8 [U] A:248 [ASP] B:8 [U] ✔
A:248 [ASP] B:10 [U] A:248 [ASP] B:10 [U] ✔
A:433 [THR] B:4 [5BU] A:433 [THR] B:4 [U] ✔
A:433 [THR] B:5 [U] A:433 [THR] B:5 [U] ✔
A:531 [ILE] B:1 [U] A:531 [ILE] B:1 [U] ✔
A:531 [ILE] B:3 [U] A:531 [ILE] B:3 [U] ✔
A:252 [LYS] B:10 [U] A:252 [LYS] B:10 [U] ✔
A:455 [SER] B:4 [5BU] A:455 [SER] B:4 [U] ✔
A:244 [GLY] B:6 [U] A:244 [GLY] B:6 [U] ✔
A:244 [GLY] B:7 [U] A:244 [GLY] B:7 [U] ✔
A:434 [ASP] B:4 [5BU] A:434 [ASP] B:4 [U] ✔
A:536 [SER] B:3 [U] A:536 [SER] B:3 [U] ✔
A:271 [ARG] B:4 [5BU] A:271 [ARG] B:4 [U] ✔
A:271 [ARG] B:5 [U] A:271 [ARG] B:5 [U] ✔
A:222 [THR] B:8 [U] A:222 [THR] B:8 [U] ✔
A:222 [THR] B:9 [U] A:222 [THR] B:9 [U] ✔
A:223 [ASP] B:9 [U] A:223 [ASP] B:9 [U] ✔
A:532 [SER] B:1 [U] A:532 [SER] B:1 [U] ❌ 3I62_A_B
A:434 [ASP] B:5 [U] A:434 [ASP] B:5 [U] ❌ 3I5Y_A_B
A:228 [MET] B:10 [U] A:228 [MET] B:10 [U] ❌ 3I62_A:228 no longer at interface
A:276 [GLY] B:6 [U] A:276 [GLY] B:6 [U] ❌ 3I5Y_A:276 no longer at interface
A:413 [ASN] B:9 [U] A:413 [ASN] B:9 [U] ❌ 3I5Y_A:413 no longer at interface

logo_download Export the table of contacts

Properties of this pair

Common ECOD label(s)
 Common RFAM label(s)
 Interface TM-score
 Interface RMSD
 Percentage identity
 Protein TM-score
 RNA TM-score
 Protein coverage
 RNA coverage
 Percentage conservation
 Apolar conservation
 H-bond conservation
 Percentage switching out
P-loop containing nucleoside triphosphate hydrolases 1.0 0.15 0.90 1.0 0.77 0.98 1.0 0.99 0.99 0.91 0.60


Other pairs involving 3I5Y_A_B or 3I62_A_B

Total number of entries: 7

Interface 1 Interface 2 Percentage conservation
 		Interface TM-score
 		Interface RMSD
 		Percentage identity
 		Common ECOD label(s)
 		Common RFAM label(s)
 		Explore both interfaces
3I62_A_B 5JB2_A_X,Y 0.80 0.61 2.0 0.1 P-loop containing nucleoside triphosphate hydrolases compare
3I61_A_B 3I62_A_B 0.99 1.0 0.16 0.98 P-loop containing nucleoside triphosphate hydrolases compare
3I5X_A_B 3I62_A_B 1.00 1.0 0.1 1.0 P-loop containing nucleoside triphosphate hydrolases compare
3I5X_A_B 3I5Y_A_B 0.99 1.0 0.16 0.9 P-loop containing nucleoside triphosphate hydrolases compare
3I5Y_A_B 3I61_A_B 0.99 1.0 0.2 0.9 P-loop containing nucleoside triphosphate hydrolases compare
3I5Y_A_B 5JB2_A_X,Y 0.80 0.61 1.92 0.1 P-loop containing nucleoside triphosphate hydrolases compare
3I5Y_A_B 3I62_A_B 0.99 1.0 0.15 0.9 P-loop containing nucleoside triphosphate hydrolases compare