Interface analysis
Style
Protein
CartoonLicorice
Surface
RNA
CartoonLicorice
Surface
Color
StructureStructure (with hetatm)
Chain
Chainbow
View
Focus on
InterfaceRNA
Protein
All
Show chains
Interface
show interface as licoriceCommon contacts -
| 2PXT_A
|
2PXT_B
|
2PXU_A
|
2PXU_B
|
Conserved?
|
|---|---|---|---|---|
| A:50 [ARG] | B:140 [A] | A:50 [ARG] | B:140 [A] | ✔ |
| A:26 [VAL] | B:149 [G] | A:26 [VAL] | B:149 [G] | ✔ |
| A:26 [VAL] | B:150 [G] | A:26 [VAL] | B:150 [G] | ✔ |
| A:56 [ALA] | B:150 [G] | A:56 [ALA] | B:150 [G] | ✔ |
| A:30 [ALA] | B:149 [G] | A:30 [ALA] | B:149 [G] | ✔ |
| A:30 [ALA] | B:150 [G] | A:30 [ALA] | B:150 [G] | ✔ |
| A:40 [ARG] | B:164 [A] | A:40 [ARG] | B:164 [A] | ✔ |
| A:39 [GLU] | B:140 [A] | A:39 [GLU] | B:140 [A] | ✔ |
| A:59 [GLY] | B:150 [G] | A:59 [GLY] | B:150 [G] | ✔ |
| A:59 [GLY] | B:151 [U] | A:59 [GLY] | B:151 [U] | ✔ |
| A:53 [ARG] | B:140 [A] | A:53 [ARG] | B:140 [A] | ✔ |
| A:53 [ARG] | B:141 [C] | A:53 [ARG] | B:141 [C] | ✔ |
| A:53 [ARG] | B:163 [C] | A:53 [ARG] | B:163 [C] | ✔ |
| A:53 [ARG] | B:164 [A] | A:53 [ARG] | B:164 [A] | ✔ |
| A:54 [ILE] | B:163 [C] | A:54 [ILE] | B:163 [C] | ✔ |
| A:37 [MSE] | B:164 [A] | A:37 [MSE] | B:164 [A] | ✔ |
| A:49 [SER] | B:140 [A] | A:49 [SER] | B:140 [A] | ✔ |
| A:49 [SER] | B:141 [C] | A:49 [SER] | B:141 [C] | ✔ |
| A:57 [GLY] | B:149 [G] | A:57 [GLY] | B:149 [G] | ✔ |
| A:57 [GLY] | B:150 [G] | A:57 [GLY] | B:150 [G] | ✔ |
| A:57 [GLY] | B:162 [G] | A:57 [GLY] | B:162 [G] | ✔ |
| A:57 [GLY] | B:163 [C] | A:57 [GLY] | B:163 [C] | ✔ |
| A:34 [SER] | B:148 [A] | A:34 [SER] | B:148 [A] | ✔ |
| A:34 [SER] | B:149 [G] | A:34 [SER] | B:149 [G] | ✔ |
| A:34 [SER] | B:163 [C] | A:34 [SER] | B:163 [C] | ✔ |
| A:34 [SER] | B:164 [A] | A:34 [SER] | B:164 [A] | ✔ |
| A:58 [SER] | B:149 [G] | A:58 [SER] | B:149 [G] | ✔ |
| A:58 [SER] | B:150 [G] | A:58 [SER] | B:150 [G] | ✔ |
| A:58 [SER] | B:151 [U] | A:58 [SER] | B:151 [U] | ✔ |
| A:35 [MSE] | B:163 [C] | A:35 [MSE] | B:163 [C] | ✔ |
| A:35 [MSE] | B:164 [A] | A:35 [MSE] | B:164 [A] | ✔ |
| A:38 [LYS] | B:139 [U] | A:38 [LYS] | B:139 [U] | ✔ |
| A:38 [LYS] | B:140 [A] | A:38 [LYS] | B:140 [A] | ✔ |
| A:33 [ASN] | B:148 [A] | A:33 [ASN] | B:148 [A] | ✔ |
| A:33 [ASN] | B:149 [G] | A:33 [ASN] | B:149 [G] | ✔ |
| A:33 [ASN] | B:163 [C] | A:33 [ASN] | B:163 [C] | ✔ |
| A:33 [ASN] | B:164 [A] | A:33 [ASN] | B:164 [A] | ✔ |
| A:52 [ARG] | B:141 [C] | A:52 [ARG] | B:141 [C] | ✔ |
| A:29 [GLU] | B:149 [G] | A:29 [GLU] | B:149 [G] | ✔ |
| A:31 [ILE] | B:149 [G] | A:31 [ILE] | B:149 [G] | ✔ |
| A:60 [MSE] | B:150 [G] | A:60 [MSE] | B:150 [G] | ✔ |
| A:60 [MSE] | B:151 [U] | A:60 [MSE] | B:151 [U] | ✔ |
| A:36 [THR] | B:140 [A] | A:36 [THR] | B:140 [A] | ✔ |
| A:36 [THR] | B:164 [A] | A:36 [THR] | B:164 [A] | ✔ |
| A:36 [THR] | B:165 [G] | A:36 [THR] | B:165 [G] | ✔ |
| A:37 [MSE] | B:165 [G] | A:37 [MSE] | B:165 [G] | ❌ 2PXU_A_B |
| A:56 [ALA] | B:162 [G] | A:56 [ALA] | B:162 [G] | ❌ 2PXT_A_B |
| A:58 [SER] | B:163 [C] | A:58 [SER] | B:163 [C] | ❌ 2PXT_A_B |
Export the table of contacts
Properties of this pair
|
Common ECOD label(s) |
Common RFAM label(s) |
Interface TM-score |
Interface RMSD |
Percentage identity |
Protein TM-score |
RNA TM-score |
Protein coverage |
RNA coverage |
Percentage conservation |
Apolar conservation |
H-bond conservation |
Percentage switching out |
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| tri-helical | 0.99 | 0.19 | 1.00 | 0.99 | 0.98 | 1.0 | 1.0 | 0.99 | 1.00 | 0.93 | 0.00 |
Other pairs involving 2PXT_A_B or 2PXU_A_B
Total number of entries: 22