Interface analysis
Style
Protein
CartoonLicorice
Surface
RNA
CartoonLicorice
Surface
Color
StructureStructure (with hetatm)
Chain
Chainbow
View
Focus on
InterfaceRNA
Protein
All
Show chains
Interface
show interface as licoriceCommon contacts -
1VQ8_J
|
1VQ8_0
|
7O7Y_BO
|
7O7Y_B5
|
Conserved?
|
---|---|---|---|---|
J:31 [LEU] | 0:1103 [C] | BO:28 [LEU] | B5:1852 [C] | ✔ |
J:31 [LEU] | 0:1104 [C] | BO:28 [LEU] | B5:1853 [C] | ✔ |
J:66 [ASP] | 0:2654 [C] | BO:65 [ASN] | B5:4311 [C] | ✔ |
J:83 [ILE] | 0:1241 [G] | BO:84 [VAL] | B5:1990 [C] | ✔ |
J:20 [GLY] | 0:1242 [A] | BO:17 [GLY] | B5:1991 [G] | ✔ |
J:20 [GLY] | 0:1243 [C] | BO:17 [GLY] | B5:1992 [C] | ✔ |
J:20 [GLY] | 0:1247 [A] | BO:17 [GLY] | B5:1996 [A] | ✔ |
J:47 [THR] | 0:1244 [U] | BO:44 [SER] | B5:1993 [U] | ✔ |
J:85 [GLY] | 0:1103 [C] | BO:86 [GLY] | B5:1852 [C] | ✔ |
J:85 [GLY] | 0:1104 [C] | BO:86 [GLY] | B5:1853 [C] | ✔ |
J:85 [GLY] | 0:1240 [G] | BO:86 [GLY] | B5:1989 [G] | ✔ |
J:85 [GLY] | 0:1241 [G] | BO:86 [GLY] | B5:1990 [C] | ✔ |
J:69 [TYR] | 0:1235 [G] | BO:70 [PRO] | B5:1984 [G] | ✔ |
J:69 [TYR] | 0:1236 [A] | BO:70 [PRO] | B5:1985 [G] | ✔ |
J:69 [TYR] | 0:2081 [A] | BO:70 [PRO] | B5:3618 [G] | ✔ |
J:69 [TYR] | 0:2082 [G] | BO:70 [PRO] | B5:3619 [OMC] | ✔ |
J:69 [TYR] | 0:2677 [A] | BO:70 [PRO] | B5:4332 [G] | ✔ |
J:67 [ASN] | 0:2064 [U] | BO:68 [ARG] | B5:3601 [OMC] | ✔ |
J:67 [ASN] | 0:2082 [G] | BO:68 [ARG] | B5:3619 [OMC] | ✔ |
J:67 [ASN] | 0:2654 [C] | BO:68 [ARG] | B5:4311 [C] | ✔ |
J:19 [MET] | 0:1242 [A] | BO:16 [LEU] | B5:1991 [G] | ✔ |
J:19 [MET] | 0:1243 [C] | BO:16 [LEU] | B5:1992 [C] | ✔ |
J:140 [GLY] | 0:2803 [C] | BO:146 [GLY] | B5:4457 [C] | ✔ |
J:140 [GLY] | 0:2804 [C] | BO:146 [GLY] | B5:4458 [C] | ✔ |
J:139 [LEU] | 0:2803 [C] | BO:145 [VAL] | B5:4457 [C] | ✔ |
J:139 [LEU] | 0:2804 [C] | BO:145 [VAL] | B5:4458 [C] | ✔ |
J:89 [HIS] | 0:2081 [A] | BO:90 [HIS] | B5:3618 [G] | ✔ |
J:58 [GLU] | 0:2802 [C] | BO:55 [LEU] | B5:4456 [C] | ✔ |
J:87 [LEU] | 0:1103 [C] | BO:88 [LEU] | B5:1852 [C] | ✔ |
J:87 [LEU] | 0:1104 [C] | BO:88 [LEU] | B5:1853 [C] | ✔ |
J:91 [LYS] | 0:615 [G] | BO:92 [THR] | B5:1253 [C] | ✔ |
J:91 [LYS] | 0:616 [U] | BO:92 [THR] | B5:1254 [C] | ✔ |
J:18 [ILE] | 0:1243 [C] | BO:15 [LEU] | B5:1992 [C] | ✔ |
J:18 [ILE] | 0:1244 [U] | BO:15 [LEU] | B5:1993 [U] | ✔ |
J:28 [GLU] | 0:1103 [C] | BO:25 [LYS] | B5:1852 [C] | ✔ |
J:28 [GLU] | 0:1104 [C] | BO:25 [LYS] | B5:1853 [C] | ✔ |
J:52 [GLN] | 0:1119 [G] | BO:49 [ARG] | B5:1869 [U] | ✔ |
J:52 [GLN] | 0:1244 [U] | BO:49 [ARG] | B5:1993 [U] | ✔ |
J:73 [LYS] | 0:2675 [A] | BO:74 [ARG] | B5:4330 [A] | ✔ |
J:73 [LYS] | 0:2676 [C] | BO:74 [ARG] | B5:4331 [U] | ✔ |
J:73 [LYS] | 0:2677 [A] | BO:74 [ARG] | B5:4332 [G] | ✔ |
J:73 [LYS] | 0:2804 [C] | BO:74 [ARG] | B5:4458 [C] | ✔ |
J:81 [ARG] | 0:1241 [G] | BO:82 [ARG] | B5:1990 [C] | ✔ |
J:81 [ARG] | 0:2081 [A] | BO:82 [ARG] | B5:3618 [G] | ✔ |
J:81 [ARG] | 0:2082 [G] | BO:82 [ARG] | B5:3619 [OMC] | ✔ |
J:93 [ARG] | 0:1105 [C] | BO:94 [ARG] | B5:1854 [C] | ✔ |
J:48 [GLY] | 0:1244 [U] | BO:45 [GLY] | B5:1993 [U] | ✔ |
J:68 [GLY] | 0:2081 [A] | BO:69 [GLY] | B5:3618 [G] | ✔ |
J:68 [GLY] | 0:2082 [G] | BO:69 [GLY] | B5:3619 [OMC] | ✔ |
J:122 [ASP] | 0:1245 [C] | BO:126 [VAL] | B5:1994 [G] | ✔ |
J:90 [LYS] | 0:535 [G] | BO:91 [LYS] | B5:432 [U] | ✔ |
J:90 [LYS] | 0:2081 [A] | BO:91 [LYS] | B5:3618 [G] | ✔ |
J:90 [LYS] | 0:2082 [G] | BO:91 [LYS] | B5:3619 [OMC] | ✔ |
J:88 [PRO] | 0:1104 [C] | BO:89 [PRO] | B5:1853 [C] | ✔ |
J:88 [PRO] | 0:1105 [C] | BO:89 [PRO] | B5:1854 [C] | ✔ |
J:72 [PRO] | 0:2676 [C] | BO:73 [PHE] | B5:4331 [U] | ✔ |
J:92 [GLN] | 0:614 [U] | BO:93 [LYS] | B5:1252 [C] | ✔ |
J:70 [PHE] | 0:2081 [A] | BO:71 [TYR] | B5:3618 [G] | ✔ |
J:70 [PHE] | 0:2082 [G] | BO:71 [TYR] | B5:3619 [OMC] | ✔ |
J:70 [PHE] | 0:2676 [C] | BO:71 [TYR] | B5:4331 [U] | ✔ |
J:70 [PHE] | 0:2677 [A] | BO:71 [TYR] | B5:4332 [G] | ✔ |
J:64 [GLY] | 0:1235 [G] | BO:61 [ARG] | B5:1984 [G] | ✔ |
J:27 [ALA] | 0:1103 [C] | BO:24 [ALA] | B5:1852 [C] | ✔ |
J:24 [SER] | 0:1102 [C] | BO:21 [ALA] | B5:1851 [G] | ✔ |
J:24 [SER] | 0:1103 [C] | BO:21 [ALA] | B5:1852 [C] | ✔ |
J:24 [SER] | 0:1247 [A] | BO:21 [ALA] | B5:1996 [A] | ✔ |
J:74 [ARG] | 0:2676 [C] | BO:75 [ALA] | B5:4331 [U] | ✔ |
J:142 [ASN] | 0:2675 [A] | BO:148 [LYS] | B5:4330 [A] | ✔ |
J:21 [ARG] | 0:1242 [A] | BO:18 [ARG] | B5:1991 [G] | ✔ |
J:21 [ARG] | 0:1243 [C] | BO:18 [ARG] | B5:1992 [C] | ✔ |
J:21 [ARG] | 0:1244 [U] | BO:18 [ARG] | B5:1993 [U] | ✔ |
J:21 [ARG] | 0:1246 [A] | BO:18 [ARG] | B5:1995 [G] | ✔ |
J:21 [ARG] | 0:1247 [A] | BO:18 [ARG] | B5:1996 [A] | ✔ |
J:125 [SER] | 0:1245 [C] | BO:131 [PRO] | B5:1994 [G] | ✔ |
J:84 [ARG] | 0:2081 [A] | BO:85 [ARG] | B5:3618 [G] | ✔ |
J:84 [ARG] | 0:2082 [G] | BO:85 [ARG] | B5:3619 [OMC] | ✔ |
J:59 [LYS] | 0:1236 [A] | BO:56 [ALA] | B5:1985 [G] | ✔ |
J:65 [ASN] | 0:1235 [G] | BO:62 [MET] | B5:1984 [G] | ✔ |
J:65 [ASN] | 0:2065 [C] | BO:62 [MET] | B5:3602 [C] | ✔ |
J:82 [THR] | 0:1241 [G] | BO:83 [THR] | B5:1990 [C] | ✔ |
J:82 [THR] | 0:1242 [A] | BO:83 [THR] | B5:1991 [G] | ✔ |
J:49 [ARG] | 0:1119 [G] | BO:46 [ASN] | B5:1869 [U] | ✔ |
J:71 [TYR] | 0:2676 [C] | BO:72 [HIS] | B5:4331 [U] | ✔ |
J:71 [TYR] | 0:2677 [A] | BO:72 [HIS] | B5:4332 [G] | ✔ |
J:46 [ILE] | 0:1243 [C] | BO:43 [ILE] | B5:1992 [C] | ✔ |
J:45 [VAL] | 0:1243 [C] | BO:42 [ASN] | B5:1992 [C] | ✔ |
J:86 [MET] | 0:1103 [C] | BO:87 [MET] | B5:1852 [C] | ✔ |
J:86 [MET] | 0:1104 [C] | BO:87 [MET] | B5:1853 [C] | ✔ |
J:86 [MET] | 0:1240 [G] | BO:87 [MET] | B5:1989 [G] | ✔ |
J:86 [MET] | 0:1241 [G] | BO:87 [MET] | B5:1990 [C] | ✔ |
J:86 [MET] | 0:1242 [A] | BO:87 [MET] | B5:1991 [G] | ✔ |
J:86 [MET] | 0:1247 [A] | BO:87 [MET] | B5:1996 [A] | ✔ |
J:63 [ILE] | 0:1235 [G] | BO:60 [LYS] | B5:1984 [G] | ✔ |
J:63 [ILE] | 0:1236 [A] | BO:60 [LYS] | B5:1985 [G] | ✔ |
J:138 [THR] | 0:2803 [C] | BO:144 [GLU] | B5:4457 [C] | ✔ |
J:20 [GLY] | 0:1109 [U] | BO:17 [GLY] | B5:1858 [G] | ❌ 7O7Y_BO_B5 |
J:47 [THR] | 0:1117 [A] | BO:44 [SER] | B5:1867 [C] | ❌ 7O7Y_BO_B5 |
J:47 [THR] | 0:1119 [G] | BO:44 [SER] | B5:1869 [U] | ❌ 7O7Y_BO_B5 |
J:69 [TYR] | 0:2080 [G] | BO:70 [PRO] | B5:3617 [G] | ❌ 7O7Y_BO_B5 |
J:67 [ASN] | 0:2065 [C] | BO:68 [ARG] | B5:3602 [C] | ❌ 7O7Y_BO_B5 |
J:67 [ASN] | 0:2081 [A] | BO:68 [ARG] | B5:3618 [G] | ❌ 7O7Y_BO_B5 |
J:91 [LYS] | 0:1105 [C] | BO:92 [THR] | B5:1854 [C] | ❌ 7O7Y_BO_B5 |
J:128 [LYS] | 0:1117 [A] | BO:134 [LYS] | B5:1867 [C] | ❌ 7O7Y_BO_B5 |
J:128 [LYS] | 0:1118 [A] | BO:134 [LYS] | B5:1868 [A] | ❌ 7O7Y_BO_B5 |
J:56 [LYS] | 0:1236 [A] | BO:53 [LYS] | B5:1985 [G] | ❌ 7O7Y_BO_B5 |
J:56 [LYS] | 0:1242 [A] | BO:53 [LYS] | B5:1991 [G] | ❌ 7O7Y_BO_B5 |
J:127 [ILE] | 0:2793 [A] | BO:133 [ARG] | B5:4447 [A] | ❌ 7O7Y_BO_B5 |
J:137 [GLU] | 0:2803 [C] | BO:143 [HIS] | B5:4457 [C] | ❌ 7O7Y_BO_B5 |
J:90 [LYS] | 0:2083 [A] | BO:91 [LYS] | B5:3620 [G] | ❌ 7O7Y_BO_B5 |
J:70 [PHE] | 0:2675 [A] | BO:71 [TYR] | B5:4330 [A] | ❌ 7O7Y_BO_B5 |
J:61 [VAL] | 0:2677 [A] | BO:58 [LEU] | B5:4332 [G] | ❌ 7O7Y_BO_B5 |
J:24 [SER] | 0:1109 [U] | BO:21 [ALA] | B5:1858 [G] | ❌ 7O7Y_BO_B5 |
J:24 [SER] | 0:1241 [G] | BO:21 [ALA] | B5:1990 [C] | ❌ 7O7Y_BO_B5 |
J:74 [ARG] | 0:2675 [A] | BO:75 [ALA] | B5:4330 [A] | ❌ 7O7Y_BO_B5 |
J:21 [ARG] | 0:1109 [U] | BO:18 [ARG] | B5:1858 [G] | ❌ 7O7Y_BO_B5 |
J:84 [ARG] | 0:2080 [G] | BO:85 [ARG] | B5:3617 [G] | ❌ 7O7Y_BO_B5 |
J:59 [LYS] | 0:1235 [G] | BO:56 [ALA] | B5:1984 [G] | ❌ 7O7Y_BO_B5 |
J:49 [ARG] | 0:1118 [A] | BO:46 [ASN] | B5:1868 [A] | ❌ 7O7Y_BO_B5 |
J:49 [ARG] | 0:1244 [U] | BO:46 [ASN] | B5:1993 [U] | ❌ 7O7Y_BO_B5 |
J:71 [TYR] | 0:1242 [A] | BO:72 [HIS] | B5:1991 [G] | ❌ 7O7Y_BO_B5 |
J:62 [ASP] | 0:2803 [C] | BO:59 [ARG] | B5:4457 [C] | ❌ 7O7Y_BO_B5 |
J:95 [ARG] | 0:534 [C] | BO:96 [GLN] | B5:431 [G] | ❌ 7O7Y_BO_B5 |
J:127 [ILE] | 0:1117 [A] | BO:133 [ARG] | B5:1867 [C] | ❌ 1VQ8_J_0 |
J:127 [ILE] | 0:1245 [C] | BO:133 [ARG] | B5:1994 [G] | ❌ 1VQ8_J_0 |
J:127 [ILE] | 0:1244 [U] | BO:133 [ARG] | B5:1993 [U] | ❌ 1VQ8_J_0 |
J:127 [ILE] | 0:1246 [A] | BO:133 [ARG] | B5:1995 [G] | ❌ 1VQ8_J_0 |
J:128 [LYS] | 0:2793 [A] | BO:134 [LYS] | B5:4447 [A] | ❌ 1VQ8_J_0 |
J:142 [ASN] | 0:2804 [C] | BO:148 [LYS] | B5:4458 [C] | ❌ 1VQ8_J_0 |
J:28 [GLU] | 0:1105 [C] | BO:25 [LYS] | B5:1854 [C] | ❌ 1VQ8_J_0 |
J:47 [THR] | 0:1243 [C] | BO:44 [SER] | B5:1992 [C] | ❌ 1VQ8_J_0 |
J:52 [GLN] | 0:1118 [A] | BO:49 [ARG] | B5:1868 [A] | ❌ 1VQ8_J_0 |
J:56 [LYS] | 0:1243 [C] | BO:53 [LYS] | B5:1992 [C] | ❌ 1VQ8_J_0 |
J:56 [LYS] | 0:1244 [U] | BO:53 [LYS] | B5:1993 [U] | ❌ 1VQ8_J_0 |
J:58 [GLU] | 0:2803 [C] | BO:55 [LEU] | B5:4457 [C] | ❌ 1VQ8_J_0 |
J:61 [VAL] | 0:2803 [C] | BO:58 [LEU] | B5:4457 [C] | ❌ 1VQ8_J_0 |
J:62 [ASP] | 0:1235 [G] | BO:59 [ARG] | B5:1984 [G] | ❌ 1VQ8_J_0 |
J:62 [ASP] | 0:1236 [A] | BO:59 [ARG] | B5:1985 [G] | ❌ 1VQ8_J_0 |
J:64 [GLY] | 0:2677 [A] | BO:61 [ARG] | B5:4332 [G] | ❌ 1VQ8_J_0 |
J:65 [ASN] | 0:2064 [U] | BO:62 [MET] | B5:3601 [OMC] | ❌ 1VQ8_J_0 |
J:65 [ASN] | 0:2081 [A] | BO:62 [MET] | B5:3618 [G] | ❌ 1VQ8_J_0 |
J:67 [ASN] | 0:2083 [A] | BO:68 [ARG] | B5:3620 [G] | ❌ 1VQ8_J_0 |
J:70 [PHE] | 0:2083 [A] | BO:71 [TYR] | B5:3620 [G] | ❌ 1VQ8_J_0 |
J:72 [PRO] | 0:2675 [A] | BO:73 [PHE] | B5:4330 [A] | ❌ 1VQ8_J_0 |
J:73 [LYS] | 0:2803 [C] | BO:74 [ARG] | B5:4457 [C] | ❌ 1VQ8_J_0 |
J:86 [MET] | 0:1102 [C] | BO:87 [MET] | B5:1851 [G] | ❌ 1VQ8_J_0 |
J:89 [HIS] | 0:2082 [G] | BO:90 [HIS] | B5:3619 [OMC] | ❌ 1VQ8_J_0 |
J:89 [HIS] | 0:535 [G] | BO:90 [HIS] | B5:432 [U] | ❌ 1VQ8_J_0 |
J:90 [LYS] | 0:2080 [G] | BO:91 [LYS] | B5:3617 [G] | ❌ 1VQ8_J_0 |
J:91 [LYS] | 0:535 [G] | BO:92 [THR] | B5:432 [U] | ❌ 1VQ8_J_0 |
J:92 [GLN] | 0:615 [G] | BO:93 [LYS] | B5:1253 [C] | ❌ 1VQ8_J_0 |
J:92 [GLN] | 0:534 [C] | BO:93 [LYS] | B5:431 [G] | ❌ 1VQ8_J_0 |
J:93 [ARG] | 0:1104 [C] | BO:94 [ARG] | B5:1853 [C] | ❌ 1VQ8_J_0 |
J:93 [ARG] | 0:615 [G] | BO:94 [ARG] | B5:1253 [C] | ❌ 1VQ8_J_0 |
J:93 [ARG] | 0:614 [U] | BO:94 [ARG] | B5:1252 [C] | ❌ 1VQ8_J_0 |
J:95 [ARG] | 0:2082 [G] | BO:96 [GLN] | B5:3619 [OMC] | ❌ 1VQ8_J_0 |
J:95 [ARG] | 0:2083 [A] | BO:96 [GLN] | B5:3620 [G] | ❌ 1VQ8_J_0 |
J:95 [ARG] | 0:535 [G] | BO:96 [GLN] | B5:432 [U] | ❌ 1VQ8_J_0 |
J:60 [ARG] | 0:1237 [U] | BO:57 [PHE] | B5:1986 [A] | ❌ 7O7Y_BO:57, 7O7Y_B5:1986 no longer at interface |
J:69 [TYR] | 0:1237 [U] | BO:70 [PRO] | B5:1986 [A] | ❌ 7O7Y_B5:1986 no longer at interface |
J:56 [LYS] | 0:1237 [U] | BO:53 [LYS] | B5:1986 [A] | ❌ 7O7Y_B5:1986 no longer at interface |
J:65 [ASN] | 0:2066 [C] | BO:62 [MET] | B5:3603 [A] | ❌ 7O7Y_B5:3603 no longer at interface |
J:124 [LEU] | 0:1116 [U] | BO:130 [LYS] | B5:1866 [U] | ❌ 1VQ8_J:124, 1VQ8_0:1116 no longer at interface |
J:127 [ILE] | 0:1116 [U] | BO:133 [ARG] | B5:1866 [U] | ❌ 1VQ8_0:1116 no longer at interface |
J:128 [LYS] | 0:2794 [G] | BO:134 [LYS] | B5:4448 [G] | ❌ 1VQ8_0:2794 no longer at interface |
J:134 [GLU] | 0:2773 [G] | BO:140 [ARG] | B5:4427 [A] | ❌ 1VQ8_J:134, 1VQ8_0:2773 no longer at interface |
J:134 [GLU] | 0:2774 [U] | BO:140 [ARG] | B5:4428 [U] | ❌ 1VQ8_J:134, 1VQ8_0:2774 no longer at interface |
J:137 [GLU] | 0:2772 [G] | BO:143 [HIS] | B5:4426 [G] | ❌ 1VQ8_0:2772 no longer at interface |
J:138 [THR] | 0:2773 [G] | BO:144 [GLU] | B5:4427 [A] | ❌ 1VQ8_0:2773 no longer at interface |
J:138 [THR] | 0:2772 [G] | BO:144 [GLU] | B5:4426 [G] | ❌ 1VQ8_0:2772 no longer at interface |
J:142 [ASN] | 0:2674 [G] | BO:148 [LYS] | B5:4329 [C] | ❌ 1VQ8_0:2674 no longer at interface |
J:142 [ASN] | 0:2805 [A] | BO:148 [LYS] | B5:4459 [G] | ❌ 1VQ8_0:2805 no longer at interface |
J:28 [GLU] | 0:1106 [A] | BO:25 [LYS] | B5:1855 [G] | ❌ 1VQ8_0:1106 no longer at interface |
J:50 [GLU] | 0:2773 [G] | BO:47 [PHE] | B5:4427 [A] | ❌ 1VQ8_J:50, 1VQ8_0:2773 no longer at interface |
J:51 [GLU] | 0:2775 [A] | BO:48 [TYR] | B5:4429 [U] | ❌ 1VQ8_J:51, 1VQ8_0:2775 no longer at interface |
J:51 [GLU] | 0:2774 [U] | BO:48 [TYR] | B5:4428 [U] | ❌ 1VQ8_J:51, 1VQ8_0:2774 no longer at interface |
J:52 [GLN] | 0:1121 [G] | BO:49 [ARG] | B5:1871 [A] | ❌ 1VQ8_0:1121 no longer at interface |
J:54 [VAL] | 0:2773 [G] | BO:51 [LYS] | B5:4427 [A] | ❌ 1VQ8_J:54, 1VQ8_0:2773 no longer at interface |
J:54 [VAL] | 0:2772 [G] | BO:51 [LYS] | B5:4426 [G] | ❌ 1VQ8_J:54, 1VQ8_0:2772 no longer at interface |
J:64 [GLY] | 0:2679 [G] | BO:61 [ARG] | B5:4334 [U] | ❌ 1VQ8_0:2679 no longer at interface |
J:64 [GLY] | 0:2678 [A] | BO:61 [ARG] | B5:4333 [G] | ❌ 1VQ8_0:2678 no longer at interface |
J:66 [ASP] | 0:2655 [U] | BO:65 [ASN] | B5:4312 [U] | ❌ 1VQ8_0:2655 no longer at interface |
J:67 [ASN] | 0:2653 [A] | BO:68 [ARG] | B5:4310 [A] | ❌ 1VQ8_0:2653 no longer at interface |
J:60 [ARG] | 0:1236 [A] | BO:57 [PHE] | B5:1985 [G] | ❌ 7O7Y_BO:57 no longer at interface |
J:60 [ARG] | 0:1241 [G] | BO:57 [PHE] | B5:1990 [C] | ❌ 7O7Y_BO:57 no longer at interface |
J:60 [ARG] | 0:1242 [A] | BO:57 [PHE] | B5:1991 [G] | ❌ 7O7Y_BO:57 no longer at interface |
J:57 [TYR] | 0:1242 [A] | BO:54 [TYR] | B5:1991 [G] | ❌ 7O7Y_BO:54 no longer at interface |
J:78 [ILE] | 0:1242 [A] | BO:79 [ILE] | B5:1991 [G] | ❌ 7O7Y_BO:79 no longer at interface |
J:25 [GLN] | 0:1109 [U] | BO:22 [ILE] | B5:1858 [G] | ❌ 7O7Y_BO:22 no longer at interface |
J:126 [ASN] | 0:1244 [U] | BO:132 [THR] | B5:1993 [U] | ❌ 7O7Y_BO:132 no longer at interface |
J:126 [ASN] | 0:1245 [C] | BO:132 [THR] | B5:1994 [G] | ❌ 7O7Y_BO:132 no longer at interface |
J:123 [ARG] | 0:1245 [C] | BO:129 [LEU] | B5:1994 [G] | ❌ 1VQ8_J:123 no longer at interface |
J:123 [ARG] | 0:1244 [U] | BO:129 [LEU] | B5:1993 [U] | ❌ 1VQ8_J:123 no longer at interface |
J:124 [LEU] | 0:1245 [C] | BO:130 [LYS] | B5:1994 [G] | ❌ 1VQ8_J:124 no longer at interface |
J:124 [LEU] | 0:1246 [A] | BO:130 [LYS] | B5:1995 [G] | ❌ 1VQ8_J:124 no longer at interface |
J:29 [GLN] | 0:1109 [U] | BO:26 [GLN] | B5:1858 [G] | ❌ 1VQ8_J:29 no longer at interface |
J:51 [GLU] | 0:1119 [G] | BO:48 [TYR] | B5:1869 [U] | ❌ 1VQ8_J:51 no longer at interface |
J:55 [GLU] | 0:1119 [G] | BO:52 [LEU] | B5:1869 [U] | ❌ 1VQ8_J:55 no longer at interface |
Properties of this pair
Common ECOD label(s) |
Common RFAM label(s) |
Interface TM-score |
Interface RMSD |
Percentage identity |
Protein TM-score |
RNA TM-score |
Protein coverage |
RNA coverage |
Percentage conservation |
Apolar conservation |
H-bond conservation |
Percentage switching out |
---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
Ribosomal protein L13 and L16-A | 0.94 | 1.64 | 0.30 | 0.9 | 0.94 | 0.83 | 0.88 | 0.55 | 0.47 | 0.22 | 0.39 |
Other pairs involving 1VQ8_J_0 or 7O7Y_BO_B5
Total number of entries: 18