Interface analysis
Style
Protein
CartoonLicorice
Surface
RNA
CartoonLicorice
Surface
Color
StructureStructure (with hetatm)
Chain
Chainbow
View
Focus on
InterfaceRNA
Protein
All
Show chains
Interface
show interface as licoriceCommon contacts -
4Y4O_1Q
|
4Y4O_1A
|
4YBB_DN
|
4YBB_DA
|
Conserved?
|
---|---|---|---|---|
1Q:20 [ALA] | 1A:910 [A] | DN:20 [LEU] | DA:863 [A] | ✔ |
1Q:9 [TYR] | 1A:957 [A] | DN:9 [PHE] | DA:911 [A] | ✔ |
1Q:9 [TYR] | 1A:958 [C] | DN:9 [PHE] | DA:912 [C] | ✔ |
1Q:9 [TYR] | 1A:2290 [A] | DN:9 [PHE] | DA:2278 [A] | ✔ |
1Q:71 [ASP] | 1A:917 [A] | DN:70 [ASP] | DA:870 [U] | ✔ |
1Q:71 [ASP] | 1A:954 [C] | DN:70 [ASP] | DA:908 [C] | ✔ |
1Q:12 [GLN] | 1A:956 [A] | DN:12 [MET] | DA:910 [A] | ✔ |
1Q:12 [GLN] | 1A:957 [A] | DN:12 [MET] | DA:911 [A] | ✔ |
1Q:12 [GLN] | 1A:1000 [C] | DN:12 [MET] | DA:955 [PSU] | ✔ |
1Q:67 [ARG] | 1A:952 [G] | DN:66 [ARG] | DA:906 [U] | ✔ |
1Q:67 [ARG] | 1A:953 [U] | DN:66 [ARG] | DA:907 [G] | ✔ |
1Q:24 [GLY] | 1A:952 [G] | DN:23 [GLY] | DA:906 [U] | ✔ |
1Q:24 [GLY] | 1A:953 [U] | DN:23 [GLY] | DA:907 [G] | ✔ |
1Q:65 [PHE] | 1A:920 [G] | DN:64 [TRP] | DA:873 [C] | ✔ |
1Q:125 [LEU] | 1A:2496 [G] | DN:124 [LEU] | DA:2484 [G] | ✔ |
1Q:125 [LEU] | 1A:2497 [G] | DN:124 [LEU] | DA:2485 [G] | ✔ |
1Q:88 [GLY] | 1A:1000 [C] | DN:87 [GLY] | DA:955 [PSU] | ✔ |
1Q:88 [GLY] | 1A:1001 [G] | DN:87 [GLY] | DA:956 [G] | ✔ |
1Q:17 [LEU] | 1A:1003 [U] | DN:17 [ASN] | DA:958 [U] | ✔ |
1Q:16 [ARG] | 1A:998 [A] | DN:16 [ARG] | DA:953 [G] | ✔ |
1Q:85 [LYS] | 1A:2262 [G] | DN:84 [LYS] | DA:2250 [G] | ✔ |
1Q:85 [LYS] | 1A:2267 [G] | DN:84 [LYS] | DA:2255 [G] | ✔ |
1Q:85 [LYS] | 1A:2287 [C] | DN:84 [LYS] | DA:2275 [C] | ✔ |
1Q:85 [LYS] | 1A:2288 [G] | DN:84 [LYS] | DA:2276 [G] | ✔ |
1Q:56 [ARG] | 1A:2481 [A] | DN:55 [ARG] | DA:2469 [A] | ✔ |
1Q:56 [ARG] | 1A:2482 [G] | DN:55 [ARG] | DA:2470 [G] | ✔ |
1Q:43 [THR] | 1A:2497 [G] | DN:42 [THR] | DA:2485 [G] | ✔ |
1Q:10 [ARG] | 1A:2290 [A] | DN:10 [ARG] | DA:2278 [A] | ✔ |
1Q:14 [ARG] | 1A:999 [G] | DN:14 [LYS] | DA:954 [G] | ✔ |
1Q:14 [ARG] | 1A:1000 [C] | DN:14 [LYS] | DA:955 [PSU] | ✔ |
1Q:14 [ARG] | 1A:1001 [G] | DN:14 [LYS] | DA:956 [G] | ✔ |
1Q:14 [ARG] | 1A:1002 [A] | DN:14 [LYS] | DA:957 [C] | ✔ |
1Q:14 [ARG] | 1A:1003 [U] | DN:14 [LYS] | DA:958 [U] | ✔ |
1Q:49 [ALA] | 1A:2495 [C] | DN:48 [ALA] | DA:2483 [C] | ✔ |
1Q:49 [ALA] | 1A:2496 [G] | DN:48 [ALA] | DA:2484 [G] | ✔ |
1Q:79 [LEU] | 1A:2471 [A] | DN:78 [LEU] | DA:2459 [A] | ✔ |
1Q:79 [LEU] | 1A:2472 [U] | DN:78 [LEU] | DA:2460 [U] | ✔ |
1Q:63 [LYS] | 1A:920 [G] | DN:62 [LYS] | DA:873 [C] | ✔ |
1Q:63 [LYS] | 1A:921 [G] | DN:62 [LYS] | DA:874 [G] | ✔ |
1Q:128 [LYS] | 1A:1074 [A] | DN:127 [LYS] | DA:1028 [A] | ✔ |
1Q:128 [LYS] | 1A:1075 [A] | DN:127 [LYS] | DA:1029 [A] | ✔ |
1Q:128 [LYS] | 1A:1076 [G] | DN:127 [LYS] | DA:1030 [C] | ✔ |
1Q:101 [ARG] | 1A:953 [U] | DN:100 [LYS] | DA:907 [G] | ✔ |
1Q:101 [ARG] | 1A:954 [C] | DN:100 [LYS] | DA:908 [C] | ✔ |
1Q:87 [LYS] | 1A:1000 [C] | DN:86 [LYS] | DA:955 [PSU] | ✔ |
1Q:87 [LYS] | 1A:1001 [G] | DN:86 [LYS] | DA:956 [G] | ✔ |
1Q:87 [LYS] | 1A:2288 [G] | DN:86 [LYS] | DA:2276 [G] | ✔ |
1Q:87 [LYS] | 1A:2289 [G] | DN:86 [LYS] | DA:2277 [G] | ✔ |
1Q:11 [LYS] | 1A:956 [A] | DN:11 [LYS] | DA:910 [A] | ✔ |
1Q:11 [LYS] | 1A:957 [A] | DN:11 [LYS] | DA:911 [A] | ✔ |
1Q:11 [LYS] | 1A:2289 [G] | DN:11 [LYS] | DA:2277 [G] | ✔ |
1Q:11 [LYS] | 1A:2290 [A] | DN:11 [LYS] | DA:2278 [A] | ✔ |
1Q:48 [GLU] | 1A:2495 [C] | DN:47 [GLU] | DA:2483 [C] | ✔ |
1Q:41 [TRP] | 1A:1003 [U] | DN:40 [ARG] | DA:958 [U] | ✔ |
1Q:29 [PHE] | 1A:919 [A] | DN:28 [PHE] | DA:872 [U] | ✔ |
1Q:29 [PHE] | 1A:951 [U] | DN:28 [PHE] | DA:905 [A] | ✔ |
1Q:29 [PHE] | 1A:952 [G] | DN:28 [PHE] | DA:906 [U] | ✔ |
1Q:28 [ALA] | 1A:951 [U] | DN:27 [SER] | DA:905 [A] | ✔ |
1Q:28 [ALA] | 1A:952 [G] | DN:27 [SER] | DA:906 [U] | ✔ |
1Q:8 [LYS] | 1A:915 [U] | DN:8 [LYS] | DA:868 [U] | ✔ |
1Q:8 [LYS] | 1A:916 [G] | DN:8 [LYS] | DA:869 [G] | ✔ |
1Q:8 [LYS] | 1A:958 [C] | DN:8 [LYS] | DA:912 [C] | ✔ |
1Q:5 [ARG] | 1A:917 [A] | DN:5 [LYS] | DA:870 [U] | ✔ |
1Q:5 [ARG] | 1A:918 [U] | DN:5 [LYS] | DA:871 [U] | ✔ |
1Q:5 [ARG] | 1A:919 [A] | DN:5 [LYS] | DA:872 [U] | ✔ |
1Q:124 [LYS] | 1A:2479 [C] | DN:123 [LYS] | DA:2467 [C] | ✔ |
1Q:124 [LYS] | 1A:2494 [G] | DN:123 [LYS] | DA:2482 [A] | ✔ |
1Q:124 [LYS] | 1A:2495 [C] | DN:123 [LYS] | DA:2483 [C] | ✔ |
1Q:124 [LYS] | 1A:2496 [G] | DN:123 [LYS] | DA:2484 [G] | ✔ |
1Q:124 [LYS] | 1A:2497 [G] | DN:123 [LYS] | DA:2485 [G] | ✔ |
1Q:69 [PHE] | 1A:917 [A] | DN:68 [PHE] | DA:870 [U] | ✔ |
1Q:69 [PHE] | 1A:918 [U] | DN:68 [PHE] | DA:871 [U] | ✔ |
1Q:69 [PHE] | 1A:919 [A] | DN:68 [PHE] | DA:872 [U] | ✔ |
1Q:45 [GLN] | 1A:2495 [C] | DN:44 [ARG] | DA:2483 [C] | ✔ |
1Q:45 [GLN] | 1A:2496 [G] | DN:44 [ARG] | DA:2484 [G] | ✔ |
1Q:6 [ARG] | 1A:916 [G] | DN:6 [ARG] | DA:869 [G] | ✔ |
1Q:6 [ARG] | 1A:917 [A] | DN:6 [ARG] | DA:870 [U] | ✔ |
1Q:6 [ARG] | 1A:918 [U] | DN:6 [ARG] | DA:871 [U] | ✔ |
1Q:83 [MET] | 1A:1001 [G] | DN:82 [MET] | DA:956 [G] | ✔ |
1Q:83 [MET] | 1A:1004 [A] | DN:82 [MET] | DA:959 [A] | ✔ |
1Q:83 [MET] | 1A:1005 [A] | DN:82 [MET] | DA:960 [A] | ✔ |
1Q:83 [MET] | 1A:1007 [G] | DN:82 [MET] | DA:962 [G] | ✔ |
1Q:83 [MET] | 1A:2262 [G] | DN:82 [MET] | DA:2250 [G] | ✔ |
1Q:83 [MET] | 1A:2507 [G] | DN:82 [MET] | DA:2495 [G] | ✔ |
1Q:83 [MET] | 1A:2508 [C] | DN:82 [MET] | DA:2496 [C] | ✔ |
1Q:15 [GLY] | 1A:998 [A] | DN:15 [GLY] | DA:953 [G] | ✔ |
1Q:15 [GLY] | 1A:999 [G] | DN:15 [GLY] | DA:954 [G] | ✔ |
1Q:82 [ARG] | 1A:2262 [G] | DN:81 [4D4] | DA:2250 [G] | ✔ |
1Q:82 [ARG] | 1A:2263 [OMG] | DN:81 [4D4] | DA:2251 [OMG] | ✔ |
1Q:82 [ARG] | 1A:2264 [G] | DN:81 [4D4] | DA:2252 [G] | ✔ |
1Q:82 [ARG] | 1A:2507 [G] | DN:81 [4D4] | DA:2495 [G] | ✔ |
1Q:82 [ARG] | 1A:2508 [C] | DN:81 [4D4] | DA:2496 [C] | ✔ |
1Q:23 [GLY] | 1A:953 [U] | DN:22 [GLN] | DA:907 [G] | ✔ |
1Q:23 [GLY] | 1A:954 [C] | DN:22 [GLN] | DA:908 [C] | ✔ |
1Q:77 [LYS] | 1A:1001 [G] | DN:76 [LYS] | DA:956 [G] | ✔ |
1Q:77 [LYS] | 1A:1002 [A] | DN:76 [LYS] | DA:957 [C] | ✔ |
1Q:76 [LYS] | 1A:1002 [A] | DN:75 [GLU] | DA:957 [C] | ✔ |
1Q:126 [PRO] | 1A:2497 [G] | DN:125 [PRO] | DA:2485 [G] | ✔ |
1Q:126 [PRO] | 1A:2498 [G] | DN:125 [PRO] | DA:2486 [C] | ✔ |
1Q:80 [GLU] | 1A:2506 [G] | DN:79 [ALA] | DA:2494 [G] | ✔ |
1Q:80 [GLU] | 1A:2507 [G] | DN:79 [ALA] | DA:2495 [G] | ✔ |
1Q:4 [PRO] | 1A:917 [A] | DN:4 [PRO] | DA:870 [U] | ✔ |
1Q:4 [PRO] | 1A:918 [U] | DN:4 [PRO] | DA:871 [U] | ✔ |
1Q:120 [ILE] | 1A:2479 [C] | DN:119 [LEU] | DA:2467 [C] | ✔ |
1Q:120 [ILE] | 1A:2480 [G] | DN:119 [LEU] | DA:2468 [A] | ✔ |
1Q:3 [MET] | 1A:918 [U] | DN:3 [GLN] | DA:871 [U] | ✔ |
1Q:7 [MET] | 1A:916 [G] | DN:7 [THR] | DA:869 [G] | ✔ |
1Q:7 [MET] | 1A:917 [A] | DN:7 [THR] | DA:870 [U] | ✔ |
1Q:66 [ILE] | 1A:919 [A] | DN:65 [ILE] | DA:872 [U] | ✔ |
1Q:46 [GLN] | 1A:2496 [G] | DN:45 [GLN] | DA:2484 [G] | ✔ |
1Q:46 [GLN] | 1A:2497 [G] | DN:45 [GLN] | DA:2485 [G] | ✔ |
1Q:75 [THR] | 1A:1001 [G] | DN:74 [THR] | DA:956 [G] | ✔ |
1Q:75 [THR] | 1A:1002 [A] | DN:74 [THR] | DA:957 [C] | ✔ |
1Q:13 [GLN] | 1A:956 [A] | DN:13 [HIS] | DA:910 [A] | ✔ |
1Q:13 [GLN] | 1A:999 [G] | DN:13 [HIS] | DA:954 [G] | ✔ |
1Q:13 [GLN] | 1A:1000 [C] | DN:13 [HIS] | DA:955 [PSU] | ✔ |
1Q:13 [GLN] | 1A:2276 [C] | DN:13 [HIS] | DA:2264 [C] | ✔ |
1Q:13 [GLN] | 1A:2277 [U] | DN:13 [HIS] | DA:2265 [U] | ✔ |
1Q:13 [GLN] | 1A:2288 [G] | DN:13 [HIS] | DA:2276 [G] | ✔ |
1Q:81 [VAL] | 1A:2506 [G] | DN:80 [VAL] | DA:2494 [G] | ✔ |
1Q:81 [VAL] | 1A:2507 [G] | DN:80 [VAL] | DA:2495 [G] | ✔ |
1Q:86 [GLY] | 1A:1001 [G] | DN:85 [GLY] | DA:956 [G] | ✔ |
1Q:86 [GLY] | 1A:2287 [C] | DN:85 [GLY] | DA:2275 [C] | ✔ |
1Q:86 [GLY] | 1A:2288 [G] | DN:85 [GLY] | DA:2276 [G] | ✔ |
1Q:86 [GLY] | 1A:2289 [G] | DN:85 [GLY] | DA:2277 [G] | ✔ |
1Q:84 [GLY] | 1A:2262 [G] | DN:83 [GLY] | DA:2250 [G] | ✔ |
1Q:84 [GLY] | 1A:2287 [C] | DN:83 [GLY] | DA:2275 [C] | ✔ |
1Q:84 [GLY] | 1A:2288 [G] | DN:83 [GLY] | DA:2276 [G] | ✔ |
1Q:123 [HIS] | 1A:2478 [C] | DN:122 [ALA] | DA:2466 [C] | ✔ |
1Q:123 [HIS] | 1A:2479 [C] | DN:122 [ALA] | DA:2467 [C] | ✔ |
1Q:123 [HIS] | 1A:2496 [G] | DN:122 [ALA] | DA:2484 [G] | ✔ |
1Q:123 [HIS] | 1A:2497 [G] | DN:122 [ALA] | DA:2485 [G] | ✔ |
1Q:71 [ASP] | 1A:955 [A] | DN:70 [ASP] | DA:909 [A] | ❌ 4YBB_DN_DA |
1Q:12 [GLN] | 1A:955 [A] | DN:12 [MET] | DA:909 [A] | ❌ 4YBB_DN_DA |
1Q:52 [VAL] | 1A:2494 [G] | DN:51 [ARG] | DA:2482 [A] | ❌ 4YBB_DN_DA |
1Q:88 [GLY] | 1A:1002 [A] | DN:87 [GLY] | DA:957 [C] | ❌ 4YBB_DN_DA |
1Q:16 [ARG] | 1A:997 [G] | DN:16 [ARG] | DA:952 [G] | ❌ 4YBB_DN_DA |
1Q:56 [ARG] | 1A:2494 [G] | DN:55 [ARG] | DA:2482 [A] | ❌ 4YBB_DN_DA |
1Q:18 [LYS] | 1A:998 [A] | DN:18 [ARG] | DA:953 [G] | ❌ 4YBB_DN_DA |
1Q:76 [LYS] | 1A:2471 [A] | DN:75 [GLU] | DA:2459 [A] | ❌ 4YBB_DN_DA |
1Q:76 [LYS] | 1A:2472 [U] | DN:75 [GLU] | DA:2460 [U] | ❌ 4YBB_DN_DA |
1Q:80 [GLU] | 1A:2505 [U] | DN:79 [ALA] | DA:2493 [U] | ❌ 4YBB_DN_DA |
1Q:120 [ILE] | 1A:2481 [A] | DN:119 [LEU] | DA:2469 [A] | ❌ 4YBB_DN_DA |
1Q:75 [THR] | 1A:1003 [U] | DN:74 [THR] | DA:958 [U] | ❌ 4YBB_DN_DA |
1Q:86 [GLY] | 1A:1000 [C] | DN:85 [GLY] | DA:955 [PSU] | ❌ 4YBB_DN_DA |
1Q:123 [HIS] | 1A:1076 [G] | DN:122 [ALA] | DA:1030 [C] | ❌ 4YBB_DN_DA |
1Q:10 [ARG] | 1A:2289 [G] | DN:10 [ARG] | DA:2277 [G] | ❌ 4Y4O_1Q_1A |
1Q:15 [GLY] | 1A:1003 [U] | DN:15 [GLY] | DA:958 [U] | ❌ 4Y4O_1Q_1A |
1Q:16 [ARG] | 1A:1003 [U] | DN:16 [ARG] | DA:958 [U] | ❌ 4Y4O_1Q_1A |
1Q:16 [ARG] | 1A:999 [G] | DN:16 [ARG] | DA:954 [G] | ❌ 4Y4O_1Q_1A |
1Q:18 [LYS] | 1A:997 [G] | DN:18 [ARG] | DA:952 [G] | ❌ 4Y4O_1Q_1A |
1Q:23 [GLY] | 1A:910 [A] | DN:22 [GLN] | DA:863 [A] | ❌ 4Y4O_1Q_1A |
1Q:23 [GLY] | 1A:911 [G] | DN:22 [GLN] | DA:864 [G] | ❌ 4Y4O_1Q_1A |
1Q:29 [PHE] | 1A:920 [G] | DN:28 [PHE] | DA:873 [C] | ❌ 4Y4O_1Q_1A |
1Q:52 [VAL] | 1A:2495 [C] | DN:51 [ARG] | DA:2483 [C] | ❌ 4Y4O_1Q_1A |
1Q:65 [PHE] | 1A:919 [A] | DN:64 [TRP] | DA:872 [U] | ❌ 4Y4O_1Q_1A |
1Q:69 [PHE] | 1A:953 [U] | DN:68 [PHE] | DA:907 [G] | ❌ 4Y4O_1Q_1A |
1Q:71 [ASP] | 1A:953 [U] | DN:70 [ASP] | DA:907 [G] | ❌ 4Y4O_1Q_1A |
1Q:79 [LEU] | 1A:2506 [G] | DN:78 [LEU] | DA:2494 [G] | ❌ 4Y4O_1Q_1A |
1Q:79 [LEU] | 1A:2505 [U] | DN:78 [LEU] | DA:2493 [U] | ❌ 4Y4O_1Q_1A |
1Q:8 [LYS] | 1A:957 [A] | DN:8 [LYS] | DA:911 [A] | ❌ 4Y4O_1Q_1A |
1Q:8 [LYS] | 1A:955 [A] | DN:8 [LYS] | DA:909 [A] | ❌ 4Y4O_1Q_1A |
1Q:84 [GLY] | 1A:1000 [C] | DN:83 [GLY] | DA:955 [PSU] | ❌ 4Y4O_1Q_1A |
1Q:60 [ARG] | 1A:1121 [C] | DN:59 [ARG] | DA:1075 [C] | ❌ 4YBB_DN:59, 4YBB_DA:1075 no longer at interface |
1Q:60 [ARG] | 1A:1122 [C] | DN:59 [ARG] | DA:1076 [C] | ❌ 4YBB_DN:59, 4YBB_DA:1076 no longer at interface |
1Q:16 [ARG] | 1A:996 [C] | DN:16 [ARG] | DA:951 [C] | ❌ 4YBB_DA:951 no longer at interface |
1Q:130 [LYS] | 1A:1164 [C] | DN:129 [THR] | DA:1118 [C] | ❌ 4YBB_DN:129, 4YBB_DA:1118 no longer at interface |
1Q:5 [ARG] | 1A:945 [A] | DN:5 [LYS] | DA:899 [A] | ❌ 4YBB_DA:899 no longer at interface |
1Q:59 [ARG] | 1A:1120 [G] | DN:58 [LYS] | DA:1074 [G] | ❌ 4YBB_DN:58, 4YBB_DA:1074 no longer at interface |
1Q:59 [ARG] | 1A:1121 [C] | DN:58 [LYS] | DA:1075 [C] | ❌ 4YBB_DN:58, 4YBB_DA:1075 no longer at interface |
1Q:18 [LYS] | 1A:908 [A] | DN:18 [ARG] | DA:861 [A] | ❌ 4YBB_DA:861 no longer at interface |
1Q:18 [LYS] | 1A:909 [G] | DN:18 [ARG] | DA:862 [G] | ❌ 4YBB_DA:862 no longer at interface |
1Q:61 [GLY] | 1A:1122 [C] | DN:60 [GLN] | DA:1076 [C] | ❌ 4YBB_DN:60, 4YBB_DA:1076 no longer at interface |
1Q:82 [ARG] | 1A:2462 [A] | DN:81 [4D4] | DA:2450 [A] | ❌ 4YBB_DA:2450 no longer at interface |
1Q:82 [ARG] | 1A:2463 [A] | DN:81 [4D4] | DA:2451 [A] | ❌ 4YBB_DA:2451 no longer at interface |
1Q:119 [ARG] | 1A:1077 [G] | DN:118 [LYS] | DA:1031 [G] | ❌ 4YBB_DN:118, 4YBB_DA:1031 no longer at interface |
1Q:123 [HIS] | 1A:1077 [G] | DN:122 [ALA] | DA:1031 [G] | ❌ 4YBB_DA:1031 no longer at interface |
1Q:82 [ARG] | 1A:2265 [G] | DN:81 [4D4] | DA:2253 [G] | ❌ 4Y4O_1A:2265 no longer at interface |
1Q:85 [LYS] | 1A:2261 [U] | DN:84 [LYS] | DA:2249 [U] | ❌ 4Y4O_1A:2261 no longer at interface |
1Q:127 [ILE] | 1A:1076 [G] | DN:126 [ILE] | DA:1030 [C] | ❌ 4YBB_DN:126 no longer at interface |
1Q:59 [ARG] | 1A:2482 [G] | DN:58 [LYS] | DA:2470 [G] | ❌ 4YBB_DN:58 no longer at interface |
1Q:74 [TYR] | 1A:1002 [A] | DN:73 [ILE] | DA:957 [C] | ❌ 4YBB_DN:73 no longer at interface |
1Q:74 [TYR] | 1A:1003 [U] | DN:73 [ILE] | DA:958 [U] | ❌ 4YBB_DN:73 no longer at interface |
1Q:25 [ASP] | 1A:953 [U] | DN:24 [THR] | DA:907 [G] | ❌ 4YBB_DN:24 no longer at interface |
1Q:21 [THR] | 1A:910 [A] | DN:21 [ALA] | DA:863 [A] | ❌ 4YBB_DN:21 no longer at interface |
1Q:40 [ALA] | 1A:1003 [U] | DN:39 [GLY] | DA:958 [U] | ❌ 4YBB_DN:39 no longer at interface |
1Q:119 [ARG] | 1A:2479 [C] | DN:118 [LYS] | DA:2467 [C] | ❌ 4YBB_DN:118 no longer at interface |
1Q:119 [ARG] | 1A:2480 [G] | DN:118 [LYS] | DA:2468 [A] | ❌ 4YBB_DN:118 no longer at interface |
1Q:26 [TYR] | 1A:952 [G] | DN:25 [ASP] | DA:906 [U] | ❌ 4YBB_DN:25 no longer at interface |
1Q:26 [TYR] | 1A:953 [U] | DN:25 [ASP] | DA:907 [G] | ❌ 4YBB_DN:25 no longer at interface |
1Q:2 [LEU] | 1A:919 [A] | DN:2 [LEU] | DA:872 [U] | ❌ 4Y4O_1Q:2 no longer at interface |
1Q:98 [LYS] | 1A:954 [C] | DN:97 [GLN] | DA:908 [C] | ❌ 4Y4O_1Q:98 no longer at interface |
Properties of this pair
Common ECOD label(s) |
Common RFAM label(s) |
Interface TM-score |
Interface RMSD |
Percentage identity |
Protein TM-score |
RNA TM-score |
Protein coverage |
RNA coverage |
Percentage conservation |
Apolar conservation |
H-bond conservation |
Percentage switching out |
---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
Ribosomal protein L10e | Bacterial large subunit ribosomal RNA | 0.97 | 0.96 | 0.58 | 0.97 | 0.97 | 0.96 | 0.97 | 0.82 | 0.83 | 0.54 | 0.48 |
Other pairs involving 4Y4O_1Q_1A or 4YBB_DN_DA
Total number of entries: 25