Interface analysis
Style
Protein
CartoonLicorice
Surface
RNA
CartoonLicorice
Surface
Color
StructureStructure (with hetatm)
Chain
Chainbow
View
Focus on
InterfaceRNA
Protein
All
Show chains
Interface
show interface as licoriceCommon contacts -
6AZ3_N
|
6AZ3_2
|
7RYG_L
|
7RYG_A
|
Conserved?
|
---|---|---|---|---|
N:114 [GLY] | 2:1046 [G] | L:82 [ARG] | A:2246 [G] | ✔ |
N:114 [GLY] | 2:1303 [A] | L:82 [ARG] | A:2491 [G] | ✔ |
N:114 [GLY] | 2:1304 [U] | L:82 [ARG] | A:2492 [C] | ✔ |
N:75 [TYR] | 2:1277 [A] | L:57 [ARG] | A:2465 [A] | ✔ |
N:160 [PRO] | 2:1293 [U] | L:126 [PRO] | A:2481 [G] | ✔ |
N:160 [PRO] | 2:1294 [C] | L:126 [PRO] | A:2482 [C] | ✔ |
N:61 [ALA] | 2:1293 [U] | L:43 [THR] | A:2481 [G] | ✔ |
N:116 [ARG] | 2:1046 [G] | L:84 [GLY] | A:2246 [G] | ✔ |
N:116 [ARG] | 2:1072 [C] | L:84 [GLY] | A:2271 [C] | ✔ |
N:22 [PHE] | 2:1075 [A] | L:9 [PHE] | A:2274 [A] | ✔ |
N:115 [MET] | 2:1046 [G] | L:83 [MET] | A:2246 [G] | ✔ |
N:115 [MET] | 2:1303 [A] | L:83 [MET] | A:2491 [G] | ✔ |
N:115 [MET] | 2:1304 [U] | L:83 [MET] | A:2492 [C] | ✔ |
N:158 [LYS] | 2:1275 [C] | L:124 [LYS] | A:2463 [C] | ✔ |
N:158 [LYS] | 2:1290 [A] | L:124 [LYS] | A:2478 [A] | ✔ |
N:158 [LYS] | 2:1291 [C] | L:124 [LYS] | A:2479 [C] | ✔ |
N:158 [LYS] | 2:1292 [G] | L:124 [LYS] | A:2480 [G] | ✔ |
N:158 [LYS] | 2:1293 [U] | L:124 [LYS] | A:2481 [G] | ✔ |
N:119 [PHE] | 2:1073 [G] | L:87 [LYS] | A:2272 [G] | ✔ |
N:119 [PHE] | 2:1074 [C] | L:87 [LYS] | A:2273 [G] | ✔ |
N:118 [ALA] | 2:1073 [G] | L:86 [GLY] | A:2272 [G] | ✔ |
N:74 [LYS] | 2:1277 [A] | L:56 [ARG] | A:2465 [A] | ✔ |
N:64 [ALA] | 2:1292 [G] | L:46 [GLN] | A:2480 [G] | ✔ |
N:64 [ALA] | 2:1293 [U] | L:46 [GLN] | A:2481 [G] | ✔ |
N:154 [ARG] | 2:1275 [C] | L:120 [LEU] | A:2463 [C] | ✔ |
N:154 [ARG] | 2:1276 [A] | L:120 [LEU] | A:2464 [A] | ✔ |
N:63 [GLU] | 2:1291 [C] | L:45 [ARG] | A:2479 [C] | ✔ |
N:63 [GLU] | 2:1292 [G] | L:45 [ARG] | A:2480 [G] | ✔ |
N:67 [ALA] | 2:1291 [C] | L:49 [ALA] | A:2479 [C] | ✔ |
N:67 [ALA] | 2:1292 [G] | L:49 [ALA] | A:2480 [G] | ✔ |
N:117 [GLY] | 2:1046 [G] | L:85 [ASN] | A:2246 [G] | ✔ |
N:117 [GLY] | 2:1072 [C] | L:85 [ASN] | A:2271 [C] | ✔ |
N:117 [GLY] | 2:1073 [G] | L:85 [ASN] | A:2272 [G] | ✔ |
N:159 [PHE] | 2:1292 [G] | L:125 [LEU] | A:2480 [G] | ✔ |
N:159 [PHE] | 2:1293 [U] | L:125 [LEU] | A:2481 [G] | ✔ |
N:157 [MET] | 2:1274 [C] | L:123 [ALA] | A:2462 [C] | ✔ |
N:157 [MET] | 2:1275 [C] | L:123 [ALA] | A:2463 [C] | ✔ |
N:157 [MET] | 2:1292 [G] | L:123 [ALA] | A:2480 [G] | ✔ |
N:157 [MET] | 2:1293 [U] | L:123 [ALA] | A:2481 [G] | ✔ |
N:116 [ARG] | 2:1047 [OMG] | L:84 [GLY] | A:2247 [OMG] | ❌ 7RYG_L_A |
N:116 [ARG] | 2:1051 [G] | L:84 [GLY] | A:2251 [G] | ❌ 7RYG_L_A |
N:116 [ARG] | 2:1304 [U] | L:84 [GLY] | A:2492 [C] | ❌ 7RYG_L_A |
N:115 [MET] | 2:1073 [G] | L:83 [MET] | A:2272 [G] | ❌ 7RYG_L_A |
N:119 [PHE] | 2:1075 [A] | L:87 [LYS] | A:2274 [A] | ❌ 7RYG_L_A |
N:154 [ARG] | 2:1277 [A] | L:120 [LEU] | A:2465 [A] | ❌ 7RYG_L_A |
N:114 [GLY] | 2:1047 [OMG] | L:82 [ARG] | A:2247 [OMG] | ❌ 6AZ3_N_2 |
N:116 [ARG] | 2:1073 [G] | L:84 [GLY] | A:2272 [G] | ❌ 6AZ3_N_2 |
N:117 [GLY] | 2:1051 [G] | L:85 [ASN] | A:2251 [G] | ❌ 6AZ3_N_2 |
N:118 [ALA] | 2:1074 [C] | L:86 [GLY] | A:2273 [G] | ❌ 6AZ3_N_2 |
N:118 [ALA] | 2:1072 [C] | L:86 [GLY] | A:2271 [C] | ❌ 6AZ3_N_2 |
N:116 [ARG] | 2:1045 [U] | L:84 [GLY] | A:2245 [U] | ❌ 7RYG_A:2245 no longer at interface |
N:116 [ARG] | 2:1048 [G] | L:84 [GLY] | A:2248 [G] | ❌ 7RYG_A:2248 no longer at interface |
N:116 [ARG] | 2:1050 [C] | L:84 [GLY] | A:2250 [C] | ❌ 7RYG_A:2250 no longer at interface |
N:21 [ARG] | 2:1125 [A] | L:8 [LYS] | A:2324 [A] | ❌ 7RYG_A:2324 no longer at interface |
N:21 [ARG] | 2:1126 [G] | L:8 [LYS] | A:2325 [A] | ❌ 7RYG_A:2325 no longer at interface |
N:71 [GLN] | 2:1276 [A] | L:53 [THR] | A:2464 [A] | ❌ 7RYG_L:53 no longer at interface |
N:71 [GLN] | 2:1277 [A] | L:53 [THR] | A:2465 [A] | ❌ 7RYG_L:53 no longer at interface |
N:153 [ARG] | 2:1275 [C] | L:119 [ALA] | A:2463 [C] | ❌ 7RYG_L:119 no longer at interface |
N:153 [ARG] | 2:1276 [A] | L:119 [ALA] | A:2464 [A] | ❌ 7RYG_L:119 no longer at interface |
N:23 [CYS] | 2:1075 [A] | L:10 [ARG] | A:2274 [A] | ❌ 6AZ3_N:23 no longer at interface |
N:24 [ARG] | 2:1075 [A] | L:11 [LYS] | A:2274 [A] | ❌ 6AZ3_N:24 no longer at interface |
N:24 [ARG] | 2:1074 [C] | L:11 [LYS] | A:2273 [G] | ❌ 6AZ3_N:24 no longer at interface |
Properties of this pair
Common ECOD label(s) |
Common RFAM label(s) |
Interface TM-score |
Interface RMSD |
Percentage identity |
Protein TM-score |
RNA TM-score |
Protein coverage |
RNA coverage |
Percentage conservation |
Apolar conservation |
H-bond conservation |
Percentage switching out |
---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
Ribosomal protein L10e | 0.78 | 2.39 | 0.16 | 0.73 | 0.81 | 0.61 | 0.65 | 0.76 | 0.63 | 0.23 | 0.52 |
Other pairs involving 6AZ3_N_2 or 7RYG_L_A
Total number of entries: 18