Interface analysis
Style
Protein
CartoonLicorice
Surface
RNA
CartoonLicorice
Surface
Color
StructureStructure (with hetatm)
Chain
Chainbow
View
Focus on
InterfaceRNA
Protein
All
Show chains
Interface
show interface as licoriceCommon contacts -
7OF0_N
|
7OF0_A
|
7PJS_M
|
7PJS_A
|
Conserved?
|
---|---|---|---|---|
N:183 [LEU] | A:2971 [A] | M:124 [LEU] | A:2484 [G] | ✔ |
N:183 [LEU] | A:2972 [A] | M:124 [LEU] | A:2485 [G] | ✔ |
N:104 [MET] | A:2970 [C] | M:48 [ALA] | A:2483 [C] | ✔ |
N:104 [MET] | A:2971 [A] | M:48 [ALA] | A:2484 [G] | ✔ |
N:178 [GLN] | A:2954 [C] | M:119 [LEU] | A:2467 [C] | ✔ |
N:181 [HIS] | A:2972 [A] | M:122 [ALA] | A:2485 [G] | ✔ |
N:100 [GLY] | A:2970 [C] | M:44 [ARG] | A:2483 [C] | ✔ |
N:100 [GLY] | A:2971 [A] | M:44 [ARG] | A:2484 [G] | ✔ |
N:111 [ARG] | A:2956 [A] | M:55 [ARG] | A:2469 [A] | ✔ |
N:96 [TYR] | A:2111 [C] | M:40 [ARG] | A:958 [U] | ✔ |
N:101 [HIS] | A:2971 [A] | M:45 [GLN] | A:2484 [G] | ✔ |
N:101 [HIS] | A:2972 [A] | M:45 [GLN] | A:2485 [G] | ✔ |
N:73 [ARG] | A:2104 [A] | M:18 [ARG] | A:952 [G] | ✔ |
N:182 [LYS] | A:2954 [C] | M:123 [LYS] | A:2467 [C] | ✔ |
N:182 [LYS] | A:2969 [A] | M:123 [LYS] | A:2482 [A] | ✔ |
N:182 [LYS] | A:2970 [C] | M:123 [LYS] | A:2483 [C] | ✔ |
N:182 [LYS] | A:2971 [A] | M:123 [LYS] | A:2484 [G] | ✔ |
N:182 [LYS] | A:2972 [A] | M:123 [LYS] | A:2485 [G] | ✔ |
N:184 [PRO] | A:2972 [A] | M:125 [PRO] | A:2485 [G] | ✔ |
N:184 [PRO] | A:2973 [U] | M:125 [PRO] | A:2486 [C] | ✔ |
N:107 [LEU] | A:2956 [A] | M:51 [ARG] | A:2469 [A] | ❌ 7PJS_M_A |
N:104 [MET] | A:2969 [A] | M:48 [ALA] | A:2482 [A] | ❌ 7PJS_M_A |
N:98 [HIS] | A:2946 [A] | M:42 [THR] | A:2459 [A] | ❌ 7PJS_M_A |
N:111 [ARG] | A:2955 [U] | M:55 [ARG] | A:2468 [A] | ❌ 7PJS_M_A |
N:73 [ARG] | A:2105 [G] | M:18 [ARG] | A:953 [G] | ❌ 7PJS_M_A |
N:178 [GLN] | A:2956 [A] | M:119 [LEU] | A:2469 [A] | ❌ 7OF0_N_A |
N:178 [GLN] | A:2955 [U] | M:119 [LEU] | A:2468 [A] | ❌ 7OF0_N_A |
N:181 [HIS] | A:2954 [C] | M:122 [ALA] | A:2467 [C] | ❌ 7OF0_N_A |
N:181 [HIS] | A:2971 [A] | M:122 [ALA] | A:2484 [G] | ❌ 7OF0_N_A |
N:182 [LYS] | A:2955 [U] | M:123 [LYS] | A:2468 [A] | ❌ 7OF0_N_A |
N:71 [ASP] | A:2111 [C] | M:16 [ARG] | A:958 [U] | ❌ 7OF0_N_A |
N:71 [ASP] | A:2105 [G] | M:16 [ARG] | A:953 [G] | ❌ 7OF0_N_A |
N:98 [HIS] | A:2972 [A] | M:42 [THR] | A:2485 [G] | ❌ 7OF0_N_A |
N:107 [LEU] | A:2970 [C] | M:51 [ARG] | A:2483 [C] | ❌ 7OF0_N_A |
N:111 [ARG] | A:2969 [A] | M:55 [ARG] | A:2482 [A] | ❌ 7OF0_N_A |
N:181 [HIS] | A:2953 [U] | M:122 [ALA] | A:2466 [C] | ❌ 7OF0_A:2953 no longer at interface |
N:70 [SER] | A:2106 [A] | M:15 [GLY] | A:954 [G] | ❌ 7OF0_N:70, 7OF0_A:2106 no longer at interface |
N:71 [ASP] | A:2106 [A] | M:16 [ARG] | A:954 [G] | ❌ 7OF0_A:2106 no longer at interface |
N:63 [ARG] | A:2842 [C] | M:9 [PHE] | A:2278 [A] | ❌ 7OF0_A:2842 no longer at interface |
N:131 [ILE] | A:2110 [A] | M:73 [ILE] | A:957 [C] | ❌ 7PJS_M:73 no longer at interface |
N:131 [ILE] | A:2946 [A] | M:73 [ILE] | A:2459 [A] | ❌ 7PJS_M:73 no longer at interface |
N:149 [HIS] | A:2947 [U] | M:91 [TYR] | A:2460 [U] | ❌ 7PJS_M:91 no longer at interface |
N:95 [GLY] | A:2111 [C] | M:39 [GLY] | A:958 [U] | ❌ 7PJS_M:39 no longer at interface |
N:129 [LYS] | A:2110 [A] | M:71 [LYS] | A:957 [C] | ❌ 7PJS_M:71 no longer at interface |
N:129 [LYS] | A:2111 [C] | M:71 [LYS] | A:958 [U] | ❌ 7PJS_M:71 no longer at interface |
N:130 [PRO] | A:2110 [A] | M:72 [PRO] | A:957 [C] | ❌ 7PJS_M:72 no longer at interface |
N:70 [SER] | A:2111 [C] | M:15 [GLY] | A:958 [U] | ❌ 7OF0_N:70 no longer at interface |
N:70 [SER] | A:2105 [G] | M:15 [GLY] | A:953 [G] | ❌ 7OF0_N:70 no longer at interface |
N:72 [ILE] | A:2111 [C] | M:17 [ASN] | A:958 [U] | ❌ 7OF0_N:72 no longer at interface |
N:153 [PRO] | A:2111 [C] | M:95 [LEU] | A:958 [U] | ❌ 7OF0_N:153 no longer at interface |
Properties of this pair
Common ECOD label(s) |
Common RFAM label(s) |
Interface TM-score |
Interface RMSD |
Percentage identity |
Protein TM-score |
RNA TM-score |
Protein coverage |
RNA coverage |
Percentage conservation |
Apolar conservation |
H-bond conservation |
Percentage switching out |
---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
Ribosomal protein L10e | Bacterial large subunit ribosomal RNA | 0.92 | 3.28 | 0.15 | 0.72 | 0.96 | 0.55 | 0.61 | 0.63 | 0.46 | 0.20 | 0.50 |
Other pairs involving 7OF0_N_A or 7PJS_M_A
Total number of entries: 12