RNAprotDB

All interfaces > All interologs > Interface groups > group138 > 7OF0_N_A vs 7PJS_M_A

Interface analysis


mouse controls

Style

Protein

Cartoon
Licorice
Surface

RNA

Cartoon
Licorice
Surface

Color

Structure
Structure (with hetatm)
Chain
Chainbow

View

Focus on

Interface
RNA
Protein
All

Show chains

Interface

show interface as licorice

Common contacts -

7OF0_N
7OF0_A
7PJS_M
7PJS_A
Conserved?
N:183 [LEU] A:2971 [A] M:124 [LEU] A:2484 [G]
N:183 [LEU] A:2972 [A] M:124 [LEU] A:2485 [G]
N:104 [MET] A:2970 [C] M:48 [ALA] A:2483 [C]
N:104 [MET] A:2971 [A] M:48 [ALA] A:2484 [G]
N:178 [GLN] A:2954 [C] M:119 [LEU] A:2467 [C]
N:181 [HIS] A:2972 [A] M:122 [ALA] A:2485 [G]
N:100 [GLY] A:2970 [C] M:44 [ARG] A:2483 [C]
N:100 [GLY] A:2971 [A] M:44 [ARG] A:2484 [G]
N:111 [ARG] A:2956 [A] M:55 [ARG] A:2469 [A]
N:96 [TYR] A:2111 [C] M:40 [ARG] A:958 [U]
N:101 [HIS] A:2971 [A] M:45 [GLN] A:2484 [G]
N:101 [HIS] A:2972 [A] M:45 [GLN] A:2485 [G]
N:73 [ARG] A:2104 [A] M:18 [ARG] A:952 [G]
N:182 [LYS] A:2954 [C] M:123 [LYS] A:2467 [C]
N:182 [LYS] A:2969 [A] M:123 [LYS] A:2482 [A]
N:182 [LYS] A:2970 [C] M:123 [LYS] A:2483 [C]
N:182 [LYS] A:2971 [A] M:123 [LYS] A:2484 [G]
N:182 [LYS] A:2972 [A] M:123 [LYS] A:2485 [G]
N:184 [PRO] A:2972 [A] M:125 [PRO] A:2485 [G]
N:184 [PRO] A:2973 [U] M:125 [PRO] A:2486 [C]
N:107 [LEU] A:2956 [A] M:51 [ARG] A:2469 [A] ❌ 7PJS_M_A
N:104 [MET] A:2969 [A] M:48 [ALA] A:2482 [A] ❌ 7PJS_M_A
N:98 [HIS] A:2946 [A] M:42 [THR] A:2459 [A] ❌ 7PJS_M_A
N:111 [ARG] A:2955 [U] M:55 [ARG] A:2468 [A] ❌ 7PJS_M_A
N:73 [ARG] A:2105 [G] M:18 [ARG] A:953 [G] ❌ 7PJS_M_A
N:178 [GLN] A:2956 [A] M:119 [LEU] A:2469 [A] ❌ 7OF0_N_A
N:178 [GLN] A:2955 [U] M:119 [LEU] A:2468 [A] ❌ 7OF0_N_A
N:181 [HIS] A:2954 [C] M:122 [ALA] A:2467 [C] ❌ 7OF0_N_A
N:181 [HIS] A:2971 [A] M:122 [ALA] A:2484 [G] ❌ 7OF0_N_A
N:182 [LYS] A:2955 [U] M:123 [LYS] A:2468 [A] ❌ 7OF0_N_A
N:71 [ASP] A:2111 [C] M:16 [ARG] A:958 [U] ❌ 7OF0_N_A
N:71 [ASP] A:2105 [G] M:16 [ARG] A:953 [G] ❌ 7OF0_N_A
N:98 [HIS] A:2972 [A] M:42 [THR] A:2485 [G] ❌ 7OF0_N_A
N:107 [LEU] A:2970 [C] M:51 [ARG] A:2483 [C] ❌ 7OF0_N_A
N:111 [ARG] A:2969 [A] M:55 [ARG] A:2482 [A] ❌ 7OF0_N_A
N:181 [HIS] A:2953 [U] M:122 [ALA] A:2466 [C] ❌ 7OF0_A:2953 no longer at interface
N:70 [SER] A:2106 [A] M:15 [GLY] A:954 [G] ❌ 7OF0_N:70, 7OF0_A:2106 no longer at interface
N:71 [ASP] A:2106 [A] M:16 [ARG] A:954 [G] ❌ 7OF0_A:2106 no longer at interface
N:63 [ARG] A:2842 [C] M:9 [PHE] A:2278 [A] ❌ 7OF0_A:2842 no longer at interface
N:131 [ILE] A:2110 [A] M:73 [ILE] A:957 [C] ❌ 7PJS_M:73 no longer at interface
N:131 [ILE] A:2946 [A] M:73 [ILE] A:2459 [A] ❌ 7PJS_M:73 no longer at interface
N:149 [HIS] A:2947 [U] M:91 [TYR] A:2460 [U] ❌ 7PJS_M:91 no longer at interface
N:95 [GLY] A:2111 [C] M:39 [GLY] A:958 [U] ❌ 7PJS_M:39 no longer at interface
N:129 [LYS] A:2110 [A] M:71 [LYS] A:957 [C] ❌ 7PJS_M:71 no longer at interface
N:129 [LYS] A:2111 [C] M:71 [LYS] A:958 [U] ❌ 7PJS_M:71 no longer at interface
N:130 [PRO] A:2110 [A] M:72 [PRO] A:957 [C] ❌ 7PJS_M:72 no longer at interface
N:70 [SER] A:2111 [C] M:15 [GLY] A:958 [U] ❌ 7OF0_N:70 no longer at interface
N:70 [SER] A:2105 [G] M:15 [GLY] A:953 [G] ❌ 7OF0_N:70 no longer at interface
N:72 [ILE] A:2111 [C] M:17 [ASN] A:958 [U] ❌ 7OF0_N:72 no longer at interface
N:153 [PRO] A:2111 [C] M:95 [LEU] A:958 [U] ❌ 7OF0_N:153 no longer at interface

logo_download Export the table of contacts

Properties of this pair

Common ECOD label(s)
Common RFAM label(s)
Interface TM-score
Interface RMSD
Percentage identity
Protein TM-score
RNA TM-score
Protein coverage
RNA coverage
Percentage conservation
Apolar conservation
H-bond conservation
Percentage switching out
Ribosomal protein L10e Bacterial large subunit ribosomal RNA 0.92 3.28 0.15 0.72 0.96 0.55 0.61 0.63 0.46 0.20 0.50


Other pairs involving 7OF0_N_A or 7PJS_M_A

Total number of entries: 12